单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-09-07 |
Lymph nodes are innervated by a unique population of sensory neurons with immunomodulatory potential
2021-01-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.11.028
PMID:33333021
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研究论文 | 研究揭示了淋巴结中存在一种独特的具有免疫调节潜力的感觉神经元群体，并探讨了其功能和机制 | 首次发现并验证了淋巴结中存在一种独特的感觉神经元群体，这些神经元能够响应淋巴中的炎症信号，并通过神经-免疫回路调节淋巴结功能 | 研究主要集中在体外实验和单细胞转录组分析，缺乏体内功能验证和长期效应的研究 | 探讨感觉神经元在淋巴结功能调节中的机制和重要性 | 淋巴结中的感觉神经元及其与免疫细胞的相互作用 | NA | NA | 高分辨率成像、病毒示踪、单细胞转录组学、光遗传学 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个感觉神经元亚群和淋巴结中的多种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-09-07 |
Intracellular and Intercellular Gene Regulatory Network Inference From Time-Course Individual RNA-Seq
2021, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2021.777299
PMID:36303726
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研究论文 | 本文研究了从时间序列单个RNA-Seq数据中推断细胞内和细胞间基因调控网络的方法 | 本文提出了一种基于时间序列批量RNA-Seq数据推断基因调控网络的方法，能够揭示多细胞生物中的细胞间调控关系 | 本文仅使用了小鼠早期发育阶段的RNA-Seq数据，未来研究可以扩展到其他物种和发育阶段 | 研究多细胞生物中细胞内和细胞间基因调控网络的推断方法 | 小鼠早期发育阶段的基因调控网络 | 基因组学 | NA | RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-31 |
Computational methods for the integrative analysis of single-cell data
2021-01-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaa042
PMID:32363378
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研究论文 | 本文描述了用于单细胞基因组数据整合分析的计算方法，重点在于单细胞RNA测序数据集的整合以及来自单个细胞的多模态信号的联合分析 | 本文介绍了处理单细胞基因组数据的新计算方法，这些方法能够解决数据在实验、技术和生物学上的内在异质性问题 | NA | 旨在解决生物系统的全面复杂性问题，通过整合来自不同分子层和多种细胞群体的基因组数据 | 单细胞基因组数据，特别是单细胞RNA测序数据和多模态信号 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-31 |
Doublet identification in single-cell sequencing data using scDblFinder
2021, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.73600.2
PMID:35814628
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research paper | 本文介绍了一种基于Bioconductor的快速、灵活且准确的单细胞测序数据双胞体检测方法scDblFinder | scDblFinder在复杂数据集中能准确识别大多数异型双胞体，并已被独立基准测试证明优于其他方法 | NA | 开发一种新的双胞体检测方法以避免单细胞测序数据中的伪发现 | 单细胞RNA和可及性测序数据中的双胞体 | digital pathology | NA | single-cell sequencing | NA | single-cell RNA and accessibility sequencing data | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-29 |
Machine Intelligence in Single-Cell Data Analysis: Advances and New Challenges
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.655536
PMID:34135939
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综述 | 本文综述了机器学习方法在单细胞多组学数据分析中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序数据的预处理方法和高级数据分析工具，以及多组学整合和单细胞RNA测序数据的综合分析 | NA | 探讨机器学习方法在单细胞多组学数据分析中的应用，以促进对复杂生物系统或过程的理解 | 单细胞多组学数据分析 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-27 |
Regulation of cancer stem cells in triple negative breast cancer
2021, Cancer drug resistance (Alhambra, Calif.)
DOI:10.20517/cdr.2020.106
PMID:35582030
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综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌中癌症干细胞的调控机制 | 聚焦于三阴性乳腺癌特有的机制，这些机制促进了自我更新癌症干细胞的扩张和活性 | NA | 探讨三阴性乳腺癌中癌症干细胞的特定机制及其对临床结果的影响 | 三阴性乳腺癌中的癌症干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-27 |
The need to reassess single-cell RNA sequencing datasets: the importance of biological sample processing
2021, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.54864.2
PMID:35399227
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研究论文 | 本文重新分析了迄今为止最大的单细胞RNA测序数据集，探讨了细胞数量增加对分析结果的影响 | 提出了对当前科学界普遍认为的“越多越好”方法的质疑，指出大规模数据集可能导致分析结果的偏差 | 文章指出大规模数据集可能由于长时间的计算处理时间而影响分析的深度 | 旨在通过分析大规模单细胞RNA测序数据集，识别健康成人皮肤中先前描述的成纤维细胞亚群 | 健康成人皮肤中的成纤维细胞亚群 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 无监督群体匹配算法 | 转录组数据 | 528,253个测序细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-23 |
Long-Term Storage Does Not Affect the Expression Profiles of mRNA and Long Non-Coding RNA in Vitrified-Warmed Human Embryos
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.751467
PMID:35178066
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研究论文 | 本研究探讨了长期存储对人类胚胎中mRNA和长非编码RNA表达谱的影响 | 首次揭示了长期存储后的人类胚胎中mRNA和长非编码RNA表达谱的稳定性 | 研究样本量较小，且仅限于特定年龄段的女性 | 探究长期存储对人类胚胎中mRNA和长非编码RNA表达的影响 | 人类胚胎中的mRNA和长非编码RNA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 11名女性，包括3个新鲜八细胞胚胎和8个存活下来的冷冻解冻八细胞胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-23 |
Building vs. Rebuilding Epidermis: Comparison Embryonic Development and Adult Wound Repair
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.796080
PMID:35145968
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综述 | 本文比较了胚胎发育与成人伤口修复过程中表皮重建的相似性与差异性 | 利用单细胞转录组学、谱系追踪和活体成像技术揭示了以往无法检测到的亚群、长期细胞命运和动态细胞行为 | NA | 探讨成人伤口修复与胚胎组织发育在表皮方面的异同 | 表皮组织 | NA | NA | 单细胞转录组学、谱系追踪、活体成像 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-23 |
Analysis and Visualization of Spatial Transcriptomic Data
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.785290
PMID:35154244
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综述 | 本文综述了空间转录组技术的核心概念及其分析和可视化方法 | 空间转录组技术能够在保留空间信息的同时测量转录组信息，扩展了分析和可视化的可能性 | NA | 总结空间基因组技术的核心概念并全面回顾当前的空间转录组分析和可视化方法 | 人类和动物组织的异质细胞类型及其空间结构 | 基因组学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-22 |
Loss of ESRP1 blocks mouse oocyte development and leads to female infertility
2021-01-18, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.196931
PMID:33318146
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研究论文 | 研究通过干扰ESRP1控制的pre-mRNA剪接事件，发现ESRP1的缺失导致小鼠卵母细胞发育受阻和雌性不育 | 首次阐明了ESRP1介导的母源mRNA转录本的AS程序，揭示了其在卵母细胞减数分裂和雌性生育中的作用 | NA | 探究ESRP1在卵母细胞发育和雌性生育中的作用 | 小鼠卵母细胞和雌性生育能力 | NA | 雌性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及六个月大的ESRP1敲除小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-21 |
Leukotriene B4 Is a Major Determinant of Leukocyte Recruitment During Otitis Media
2021, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2021.768815
PMID:35004347
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研究论文 | 本研究探讨了白三烯B4（LTB4）在急性中耳炎（OM）中的作用，通过基因表达分析和LTB4受体抑制剂的使用，观察了LTB4在炎症细胞招募中的关键作用。 | 首次详细研究了LTB4在急性中耳炎中的作用，并证明了LTB4受体拮抗剂在治疗OM中的潜在价值。 | 研究主要集中在LTB4的作用上，未全面探讨其他趋化因子在中耳炎中的作用。 | 研究LTB4在急性中耳炎中的作用及其对炎症反应的影响。 | 中耳感染非类型化流感嗜血杆菌（NTHi）的LTB4相关基因表达和中耳炎症反应。 | NA | 中耳炎 | 基因阵列分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 中耳感染NTHi的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-20 |
Roles of Macrophages in Atherogenesis
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.785220
PMID:34899348
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在动脉粥样硬化不同阶段中的作用，并描述了基于巨噬细胞的治疗方法 | 利用单细胞测序技术探讨了病变中巨噬细胞的异质性 | NA | 探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用及潜在治疗策略 | 巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用及其治疗潜力 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-20 |
Aging of the Hematopoietic Stem Cell Niche: New Tools to Answer an Old Question
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.738204
PMID:34858399
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综述 | 本文综述了骨髓微环境老化对造血干细胞（HSC）功能的影响，并介绍了用于研究老化过程中骨髓微环境特定改变的新工具 | 文章介绍了跨学科方法开发的新技术工具，如特定的小鼠模型、共培养系统、新的三维成像工具、骨化小体和模拟骨髓系统，以及单细胞测序技术、空间转录组学和人工智能深度学习方法在数据分析和整合中的应用 | NA | 探讨骨髓微环境老化对造血干细胞功能的影响，并介绍用于研究老化过程中骨髓微环境特定改变的新工具 | 造血干细胞（HSC）及其微环境 | NA | NA | 单细胞测序技术、空间转录组学、人工智能和深度学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-20 |
Single-Cell Sequencing Reveals Differential Cell Types in Skin Tissues of Liaoning Cashmere Goats and Key Genes Related Potentially to the Fineness of Cashmere Fiber
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.726670
PMID:34858469
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和计算模型，在辽宁绒山羊的皮肤组织中鉴定了13种皮肤细胞类型，并分析了与绒毛形成相关的细胞簇中的枢纽基因 | 首次在单细胞水平上揭示了辽宁绒山羊皮肤组织中与绒毛细度相关的细胞类型和关键基因 | NA | 探究绒毛细度在细胞水平的调控机制 | 辽宁绒山羊的皮肤组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 计算模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-20 |
The Potential Prognostic Role of Oligosaccharide-Binding Fold-Containing Protein 2A (OBFC2A) in Triple-Negative Breast Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.751430
PMID:34868954
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研究论文 | 本研究旨在通过分析乳腺癌蛋白质组和转录组数据集，探讨三阴性乳腺癌（TNBC）的潜在预后标志物 | 发现OBFC2A蛋白在三阴性乳腺癌中具有独立的预后标志物作用，并与其免疫功能相关 | NA | 探讨三阴性乳腺癌的潜在预后标志物 | 三阴性乳腺癌患者的预后 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 蛋白质组和转录组数据 | 来自CPTAC的六种候选蛋白质，以及来自METABRIC的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-19 |
The Single-Cell Transcriptomic Analysis of Prefrontal Pyramidal Cells and Interneurons Reveals the Neuronal Expression of Genes Encoding Antimicrobial Peptides and Immune Proteins
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.749433
PMID:34759929
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了前额叶锥体细胞和中间神经元中编码抗菌肽和免疫蛋白的基因表达 | 首次报道了皮质神经元中某些抗菌和免疫相关蛋白的转录表达 | 研究样本量较小，且仅限于小鼠前额叶皮质细胞 | 探讨神经元与免疫细胞之间直接通讯的分子基础 | 前额叶锥体细胞和中间神经元的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 84个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-19 |
BPI overexpression suppresses Treg differentiation and induces exosome-mediated inflammation in systemic lupus erythematosus
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.63743
PMID:34815797
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析了系统性红斑狼疮（SLE）患者和健康对照者的T细胞衍生外泌体中的蛋白质，并利用转基因小鼠模型探讨了细菌通透性增加蛋白（BPI）在SLE中的潜在致病作用。 | 首次揭示了BPI在SLE中的过度表达抑制Treg分化并诱导外泌体介导的炎症反应，为SLE的病理机制提供了新的见解。 | 研究主要基于转基因小鼠模型，可能与人类SLE的实际情况存在差异。 | 探讨BPI在系统性红斑狼疮中的致病作用及其对Treg分化的影响。 | SLE患者和健康对照者的T细胞衍生外泌体中的蛋白质。 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 蛋白质组学、免疫组织化学、免疫印迹、单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 蛋白质、RNA | SLE患者和健康对照者的T细胞衍生外泌体，转基因小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-18 |
The Advances of Single-Cell RNA-Seq in Kidney Immunology
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.752679
PMID:34721077
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研究论文 | 本文讨论了利用单细胞RNA测序技术在肾脏免疫学中的应用，特别是针对几种特定的肾脏疾病 | 应用单细胞RNA测序技术成功定义了常驻和浸润免疫细胞的转录组特征，以及免疫细胞与邻近细胞之间的细胞内通信网络 | NA | 增加对肾脏免疫学的理解，并为肾脏疾病患者开发新的治疗方法 | 肾脏疾病的免疫细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 血液、次级淋巴组织、肾活检和尿液样本中的免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-18 |
Discovering Myeloid Cell Heterogeneity in Mandibular Bone - Cell by Cell Analysis
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.731549
PMID:34658914
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和高通量单细胞RNA测序技术，探讨了下颌骨与长骨（股骨）中髓系前体细胞群体的差异 | 本研究首次揭示了下颌骨骨髓细胞在髓系分化方面的持续缺陷，并发现了下颌骨髓系细胞在转录组层面的独特特征 | NA | 探索不同解剖位置骨髓中髓系前体细胞群体的差异 | 下颌骨与长骨（股骨）中的髓系前体细胞 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |