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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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541 | 2024-08-09 |
Deciphering Tumor Heterogeneity in Hepatocellular Carcinoma (HCC)-Multi-Omic and Singulomic Approaches
2021-01, Seminars in liver disease
IF:4.3Q1
DOI:10.1055/s-0040-1722261
PMID:33764481
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综述 | 本文综述了多组学和单细胞测序技术在解析肝细胞癌(HCC)肿瘤异质性方面的进展 | 结合多区域靶向采样策略与深度测序技术,揭示了HCC肿瘤起始和进展的新机制,并展示了液体活检在避免组织采样需求方面的潜力 | NA | 探讨多组学和单细胞测序技术如何增进我们对HCC肿瘤异质性的理解 | 肝细胞癌(HCC)的肿瘤异质性 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 下一代测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组和蛋白质组数据 | NA |
542 | 2024-08-09 |
Slowpoke functions in circadian output cells to regulate rest:activity rhythms
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0249215
PMID:33765072
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和细胞特异性RNA干扰技术,探讨了果蝇间脑(PI)细胞中slowpoke钾通道在调节昼夜节律行为中的作用 | 首次揭示了slowpoke钾通道在非中枢时钟细胞中的表达对于昼夜节律行为的重要性,并提出了其在多个昼夜节律回路组件中发挥作用的可能性 | 研究主要集中在果蝇模型上,可能需要进一步的人类或其他动物模型验证 | 探究昼夜节律系统中输出途径的细胞和分子机制 | 果蝇的间脑(PI)细胞和slowpoke钾通道 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | RNA | 约40个候选基因在PI细胞子集中进行RNAi敲降 |
543 | 2024-08-09 |
In vitro and ex vivo functional characterization of human HLA-DRB1∗04 restricted T cell receptors
2021, Journal of translational autoimmunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.jtauto.2021.100087
PMID:33768201
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研究论文 | 本文介绍了一种生成'人工'T细胞的流程,用于研究特定抗原和患者来源的免疫反应 | 开发了一种新的方法来验证和表征患者来源的TCR数据,并建立了相关的模型系统以支持开发诱导抗原特异性耐受的药物 | NA | 验证和表征患者来源的TCR数据,并开发支持抗原特异性耐受诱导药物的模型系统 | 人HLA-DRB1*04限制的T细胞受体 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞测序技术 | NA | TCR序列 | 涉及人类HLA-DRB1*04:01限制的TCR序列,特定于I型糖尿病相关GAD肽和流感衍生HA肽 |
544 | 2024-08-09 |
Deciphering the Prognostic Implications of the Components and Signatures in the Immune Microenvironment of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.648917
PMID:33777046
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和批量测序数据,系统探讨了胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中各组分对预后的影响 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了PDAC肿瘤微环境中不同细胞类型及其分子标志物与患者生存期的关联 | 研究主要基于现有数据集进行分析,未来需要更多的临床试验来验证这些发现 | 探讨胰腺导管腺癌肿瘤微环境中各组分对患者预后的影响 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 基因集变异分析(GSVA)算法 | 基因表达数据 | 883名PDAC患者 |
545 | 2024-08-09 |
NPC2 as a Prognostic Biomarker for Glioblastoma Based on Integrated Bioinformatics Analysis and Cytological Experiments
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.611442
PMID:33777094
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和细胞学实验,探讨了NPC2蛋白作为胶质母细胞瘤(GBM)的预后生物标志物的潜力 | 首次研究了NPC2与GBM的预后价值,并证实了其在GBM进展中的重要作用 | NA | 旨在通过生物信息学分析和细胞学实验,识别具有临床和预后意义的潜在基因 | 胶质母细胞瘤(GBM)及其预后生物标志物NPC2 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 包括H3K27M-胶质瘤细胞、U87-MG和U251细胞系 |
546 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Identifies Ligand-Receptor Pairs Associated With BCP-ALL Prognosis
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.639013
PMID:33777800
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序数据分析,识别了与B细胞前体急性淋巴细胞白血病(BCP-ALL)预后相关的配体-受体对 | 本研究首次整合了单细胞和批量RNA测序数据,发现了影响BCP-ALL患者生存结果的配体-受体对,并构建了一个基于LASSO的评分模型 | 研究样本数量有限,且依赖于公共数据库的数据,可能存在数据偏差 | 旨在识别与BCP-ALL预后相关的配体-受体对,并构建预测模型 | B细胞前体急性淋巴细胞白血病(BCP-ALL)患者的预后 | 数字病理学 | 血液癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO | RNA测序数据 | 7个BCP-ALL样本和4个健康样本 |
547 | 2024-08-09 |
Next-Generation Sequencing Reveals the Progression of COVID-19
2021, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2021.632490
PMID:33777844
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研究论文 | 本文总结了基于下一代测序(NGS)分析的SARS-CoV-2起源和人类传播的当前知识,并探讨了其在COVID-19诊断和治疗目标发现中的应用。 | 本文通过NGS技术分析了SARS-CoV-2的ACE2表达水平、肠道微生物失调和COVID-19患者的免疫遗传学,为寻找新的中间宿主和阻断跨物种传播提供了新的见解。 | NA | 探讨SARS-CoV-2的起源、传播机制及其在COVID-19诊断和治疗中的应用。 | SARS-CoV-2病毒及其在人类中的传播机制。 | 数字病理学 | COVID-19 | 下一代测序(NGS) | NA | 基因组数据 | NA |
548 | 2024-08-09 |
Connecting the Dots: Resolving the Bone Marrow Niche Heterogeneity
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.622519
PMID:33777933
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术研究骨髓微环境异质性的最新进展 | 整合了多个研究报告的数据集,提供了一个全面的骨髓微环境结构概述 | 不同研究之间在代表性和命名法上的不一致性阻碍了对这一研究领域的全面理解 | 深入理解骨髓微环境的异质性 | 骨髓微环境在稳态、化疗后、白血病发作和衰老等不同条件下的结构 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 数据集 | NA |
549 | 2024-08-09 |
CXCL11 Correlates With Antitumor Immunity and an Improved Prognosis in Colon Cancer
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.646252
PMID:33777950
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研究论文 | 本研究评估了CXCL11在结直肠癌(CRC)中的预后价值及其潜在机制 | 发现CXCL11在结直肠癌中表达上调与更好的预后相关,并能促进抗肿瘤免疫 | 研究仅初步评估了CXCL11的预后价值和机制,需要进一步深入研究 | 探讨CXCL11在结直肠癌中的生物学作用及其预后价值 | CXCL11在结直肠癌中的表达及其对患者预后的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | mRNA相关分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | NA | mRNA、单细胞RNA测序数据、免疫组织化学数据 | TCGA数据集451例,GEO单细胞RNA测序数据集GSE146771和GSE132465,Yijishan医院队列108例 |
550 | 2024-08-09 |
Lymphoma Heterogeneity Unraveled by Single-Cell Transcriptomics
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.597651
PMID:33732232
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序技术探讨了淋巴瘤的异质性及其在转化淋巴瘤研究中的应用 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了不同淋巴瘤实体生态系统的内在异质性,并讨论了其在精准医学中的潜在应用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在淋巴瘤研究中的应用及其对精准医学的促进作用 | 淋巴瘤的异质性及其在转化研究中的应用 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 转录组数据 | NA |
551 | 2024-08-09 |
The Novel Key Genes of Non-obstructive Azoospermia Affect Spermatogenesis: Transcriptomic Analysis Based on RNA-Seq and scRNA-Seq Data
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.608629
PMID:33732283
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研究论文 | 本研究利用RNA-Seq和scRNA-Seq数据,通过转录组学分析,鉴定了非阻塞性无精症中影响精子发生的关键基因。 | 发现了三个与精子发生相关的新基因(C22orf23, TSACC, 和 TTC25),并分析了它们在不同精子细胞类型中的表达模式。 | NA | 旨在识别可能影响精子发生标志物的关键基因。 | 非阻塞性无精症(NOA)中的关键基因及其在精子发生中的作用。 | 数字病理学 | 男性不育症 | RNA-Seq, scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | 430个差异表达基因 |
552 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis Identifies Key Genes in Brain Metastasis from Lung Adenocarcinoma
2021, Current gene therapy
IF:3.8Q2
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学方法,分析了肺腺癌脑转移中的关键基因 | 首次通过单细胞RNA测序分析识别出肺腺癌脑转移的关键基因 | 研究样本仅来自两名肺腺癌患者,可能影响结果的普遍性 | 识别肺腺癌脑转移的关键基因,以改善预后和治疗 | 肺腺癌脑转移中的关键基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两名肺腺癌患者的肿瘤细胞 |
553 | 2024-08-09 |
Bioinformatics analysis of the gene expression profile of retinal pigmental epithelial cells based in single-cell RNA sequencing in myopic mice
2021, Archives of medical science : AMS
IF:3.0Q1
DOI:10.5114/aoms/131835
PMID:33747297
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
554 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome dissection of the toxic impact of Di (2-ethylhexyl) phthalate on primordial follicle assembly
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.55006
PMID:33754040
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)对小鼠原始卵泡组装的影响 | 首次揭示了DEHP暴露对小鼠原始卵泡形成过程中基因表达动态的影响,并通过生物化学实验验证了这些发现 | NA | 探讨DEHP对小鼠原始卵泡形成过程中的生殖毒性 | 小鼠卵巢细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
555 | 2024-08-09 |
Deciphering the autophagy regulatory network via single-cell transcriptome analysis reveals a requirement for autophagy homeostasis in spermatogenesis
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.55645
PMID:33754041
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示自噬调节网络在精子发生中的重要性 | 首次全面分析了人类精子发生过程中自噬相关基因的转录特征,并发现Cst3基因在调节精子干细胞维持和后续男性生殖细胞发育中的作用 | 研究样本量较小,且仅限于特定类型的生殖障碍患者 | 探讨自噬在人类精子发生中的作用及其与男性不育的关联 | 人类精子发生过程中的自噬相关基因 | 数字病理学 | 生殖障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 9名生育控制样本(包括2名正常人和7名阻塞性无精子症患者)和1名非阻塞性无精子症患者 |
556 | 2024-08-09 |
Single Cell RNA-Seq and Machine Learning Reveal Novel Subpopulations in Low-Grade Inflammatory Monocytes With Unique Regulatory Circuits
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.627036
PMID:33708217
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法,揭示了低级别炎症单核细胞中的新型亚群及其独特的调控网络 | 开发了一种机器学习方法,结合单细胞RNA测序、ATAC-seq和结合基序,有效识别和表征了细胞亚群的基因调控网络 | NA | 旨在理解低级别炎症激活单核细胞的基因调控网络,并探索潜在的治疗化合物 | 低级别炎症激活的单核细胞及其在炎症疾病中的作用 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 从处理过的鼠单核细胞中生成了单细胞RNA测序数据,并识别出11个新型细胞簇 |
557 | 2024-08-09 |
In silico Analyses of Immune System Protein Interactome Network, Single-Cell RNA Sequencing of Human Tissues, and Artificial Neural Networks Reveal Potential Therapeutic Targets for Drug Repurposing Against COVID-19
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.598925
PMID:33716737
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研究论文 | 本研究通过分析免疫系统蛋白质相互作用网络、单细胞RNA测序以及人工神经网络,揭示了针对COVID-19药物再利用的潜在治疗靶点 | 本研究结合了多种先进技术,包括免疫系统蛋白质相互作用网络分析、单细胞RNA测序和深度神经网络,以发现新的治疗靶点和药物 | 研究结果需要通过临床试验进一步验证,以确定其在实际治疗中的有效性 | 旨在发现和验证针对COVID-19的有效治疗靶点和药物 | 研究对象包括免疫系统蛋白质、单细胞RNA测序数据以及多种药物 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 蛋白质相互作用网络数据、RNA测序数据 | 1,584个高置信度免疫系统蛋白质,10,672种药物 |
558 | 2024-08-09 |
Using Single-Cell RNA-Seq Data to Trace Tissue Cells Responsive to Thyroid Hormones
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.609308
PMID:33716967
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据追踪对甲状腺激素有反应的组织细胞 | 首次利用Tabula Muris Consortium生成的单细胞转录组图谱,通过计算不同细胞类型的Thra和Thrb表达能力,识别对甲状腺激素调节敏感的细胞类型 | 本文的计算预测结果需要通过实验室实验进一步验证 | 理解甲状腺激素在细胞水平上的调节机制 | 追踪对甲状腺激素有反应的组织细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 细胞聚类算法 | 基因表达数据 | 23种组织和器官的数据 |
559 | 2024-08-09 |
Epigenetic Landscapes of Single-Cell Chromatin Accessibility and Transcriptomic Immune Profiles of T Cells in COVID-19 Patients
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.625881
PMID:33717140
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研究论文 | 本研究通过单细胞转座酶可及染色质测序(scATAC-seq)和单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了COVID-19患者外周血单个核细胞(PBMCs)的染色质可及性和转录组免疫特征 | 首次综合利用scATAC-seq和scRNA-seq技术,深入解析了COVID-19患者T细胞的表观遗传状态和转录组免疫特征,提供了比单纯scRNA-seq分析更高分辨率的细胞特征 | NA | 揭示T细胞在COVID-19中的作用机制 | COVID-19重症/危重症患者、中度患者和健康志愿者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转座酶可及染色质测序(scATAC-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞数据 | 76,570和107,862个单细胞分别用于染色质可及性和转录组免疫特征分析 |
560 | 2024-08-09 |
Spontaneously Resolved Atopic Dermatitis Shows Melanocyte and Immune Cell Activation Distinct From Healthy Control Skin
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.630892
PMID:33717163
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研究论文 | 研究探讨了自愈型特应性皮炎(AD)患者皮肤中黑素细胞和免疫细胞的激活情况,并与健康对照皮肤和慢性活动性AD皮肤进行了比较 | 发现自愈型AD皮肤中的黑素细胞和常规T细胞可能贡献了特定的调节环境,其细胞组成和蛋白质组学特征与健康对照皮肤相似,未上调典型的AD活动标志物 | 仅限于对自愈型AD成年患者的皮肤样本进行研究,未涉及其他年龄段或不同病程的患者 | 探究特应性皮炎自然病程中的因素 | 自愈型AD患者的皮肤细胞和组织液 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序和蛋白质组多重检测 | NA | 细胞和组织液 | 成年自愈型AD患者和健康对照的皮肤样本 |