单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2024-08-09 |
A Comparison for Dimensionality Reduction Methods of Single-Cell RNA-seq Data
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.646936
PMID:33833778
|
研究论文 | 本文比较了10种降维方法在单细胞RNA测序数据中的稳定性、准确性和计算成本 | 开发了一种策略来评估降维方法的性能，并提供了用户建议 | 需要根据具体情况设置非线性模型和神经网络降维方法的超参数 | 评估不同降维方法在单细胞RNA测序数据分析中的效果 | 单细胞RNA测序数据的降维方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | t-SNE, UMAP | 测序数据 | 30个模拟数据集和5个真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 542 | 2024-08-09 |
Using RNentropy to Detect Significant Variation in Gene Expression Across Multiple RNA-Seq or Single-Cell RNA-Seq Samples
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1307-8_6
PMID:33835439
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于信息论的方法RNentropy，用于检测RNA-Seq数据中跨多个样本和条件的基因表达显著变化 | RNentropy方法能够克服现有方法仅限于成对比较的限制，适用于任意数量样本和条件的基因表达显著变化检测 | NA | 开发一种新的方法来检测跨多个样本和条件的基因表达显著变化 | RNA-Seq数据中的基因表达变化 | 生物信息学 | NA | RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 多个样本和条件 | NA | NA | NA | NA |
| 543 | 2024-08-09 |
Computational Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1307-8_16
PMID:33835449
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研究论文 | 本文介绍了单细胞RNA测序数据集的聚类和标记物检测步骤 | NA | NA | 研究单细胞RNA测序数据的分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 544 | 2024-08-09 |
Normalization of Single-Cell RNA-Seq Data
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1307-8_17
PMID:33835450
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研究论文 | 本文介绍了如何使用R/Bioconductor计算单细胞RNA-seq数据的归一化因子，并比较了几种归一化方法 | 提出了使用数据驱动的方法来评估和选择最佳的归一化方法 | 未提及 | 探讨单细胞RNA-seq数据归一化的方法及其对结果的影响 | 单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 545 | 2024-08-09 |
Dimensionality Reduction of Single-Cell RNA-Seq Data
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1307-8_18
PMID:33835451
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研究论文 | 本文描述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析中典型的降维工作流程，特别强调了主成分分析、t分布随机邻域嵌入和均匀流形近似与投影的作用 | 本文强调了在处理包含数百万细胞的大型数据集时的计算效率 | NA | 探讨单细胞RNA测序数据分析中的降维方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 主成分分析、t分布随机邻域嵌入、均匀流形近似与投影 | 基因表达数据 | 数百万细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 546 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis: A Step-by-Step Overview
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1307-8_19
PMID:33835452
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综述 | 本文提供了一个逐步指南，概述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析的整个标准工作流程，包括读取映射、质量控制、基因表达定量、归一化、特征选择、降维和细胞聚类等步骤 | 本文提出了四个易于新用户使用的scRNA-seq分析流程，并提供了当前可用的单细胞技术概述 | 尽管有大量的分析方法，但缺乏一个通用的标准化流程 | 旨在帮助新手克服进入单细胞RNA测序分析领域的障碍，并扩展单细胞方法在基础科学中的研究潜力 | 单细胞RNA测序数据分析流程和技术 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 数千个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 547 | 2024-08-09 |
A Novel Method to Identify the Differences Between Two Single Cell Groups at Single Gene, Gene Pair, and Gene Module Levels
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.648898
PMID:33790951
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研究论文 | 本文介绍了一种新的方法来比较两个单细胞群在单基因、基因对和基因模块水平上的差异 | 提出了一种新的流程来比较两个单细胞群，包括差异基因表达调用和共表达网络模块等 | NA | 揭示细胞群和细胞类型之间生物学差异的机制，并识别细胞类型特异的分子机制 | 单细胞群在分子水平上的差异 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 622个来自小鼠脑部的细胞和1,600个来自人类胰腺的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 548 | 2024-08-09 |
Study on the Reparative Effect of PEGylated Growth Hormone on Ovarian Parameters and Mitochondrial Function of Oocytes From Rats With Premature Ovarian Insufficiency
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.649005
PMID:33791307
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研究论文 | 研究聚乙二醇化生长激素对化疗诱导的早发性卵巢功能不全大鼠卵母细胞的修复作用及其对卵巢参数和线粒体功能的影响 | 本研究首次揭示了重组人聚乙二醇化生长激素在提高卵母细胞数量、减轻颗粒细胞凋亡和氧化应激反应方面的潜在作用，并通过单细胞转录组分析确定了与修复过程相关的关键基因 | 高剂量的重组人聚乙二醇化生长激素未能完全恢复受干扰的发情周期和性激素水平 | 探讨重组人聚乙二醇化生长激素对早发性卵巢功能不全大鼠卵泡发育和线粒体功能的潜在影响 | 早发性卵巢功能不全大鼠的卵母细胞、卵巢参数和线粒体功能 | NA | 早发性卵巢功能不全 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 549 | 2024-08-09 |
Transcriptional Profiling Reveals Kidney Neutrophil Heterogeneity in Both Healthy People and ccRCC Patients
2021, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2021/5598627
PMID:33791390
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了健康人群和ccRCC患者肾脏中的中性粒细胞异质性 | 首次揭示了ccRCC患者肾脏中中性粒细胞的六个亚群，并探讨了其在肿瘤病理和自身免疫中的作用 | NA | 探讨中性粒细胞在肾脏疾病中的异质性和病理意义 | 健康人群和ccRCC患者的肾脏组织 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康捐赠者和ccRCC患者的肾脏活检组织 | NA | NA | NA | NA |
| 550 | 2024-08-09 |
A Role for Vasoactive Intestinal Peptide Interneurons in Neurodevelopmental Disorders
2021, Developmental neuroscience
IF:2.3Q3
DOI:10.1159/000515264
PMID:33794534
|
综述 | 本文综述了表达血管活性肠肽（VIP-INs）的大脑皮质GABA能抑制性中间神经元在神经发育障碍（NDDs）中的作用 | 强调了VIP-INs在多个大脑皮质区域的重复电路模式，并探讨了它们如何影响感觉输入、发育和行为 | NA | 探讨VIP-INs在神经发育障碍中的作用机制 | VIP-INs及其相关基因在神经发育障碍中的作用 | NA | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 551 | 2024-08-09 |
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing data reveals key cell types and regulators in traumatic brain injury
2021-01-14, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2021065
PMID:33757183
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，揭示了创伤性脑损伤中的关键细胞类型和调控因子 | 首次通过单细胞RNA测序技术，成功鉴定和表征了13种细胞群体，并分析了它们在创伤性脑损伤中的差异表达和相互作用 | NA | 揭示创伤性脑损伤中的特定细胞类型和关键调控因子 | 创伤性脑损伤中的细胞类型和调控因子 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 来自创伤性脑损伤小鼠的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 552 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing, an Advanced Technology in Lung Cancer Research
2021, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S295102
PMID:33758510
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肺癌研究中的应用及其研究成果 | 单细胞测序技术具有前所未有的高分辨率，为癌症研究提供了先进的技术手段 | NA | 进一步理解肺癌的异质性、转移、耐药性、肿瘤微环境等问题 | 肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 553 | 2024-08-09 |
Altered Monocyte Subsets in Kawasaki Disease Revealed by Single-cell RNA-Sequencing
2021, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S293993
PMID:33758528
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了健康婴儿与川崎病婴儿中不同单核细胞亚群的异质性及其在疾病中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面描绘了健康与川崎病婴儿中单核细胞的异质性，并揭示了川崎病中特定单核细胞亚群的变化 | 研究样本量较小，仅包括两名健康婴儿和两名川崎病婴儿 | 旨在全面描绘健康与川崎病婴儿中单核细胞的异质性，并揭示川崎病的潜在机制 | 健康婴儿和川崎病婴儿的外周单核细胞 | 数字病理学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两名健康婴儿和两名川崎病婴儿的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 554 | 2024-08-09 |
Function of Macrophages in Disease: Current Understanding on Molecular Mechanisms
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.620510
PMID:33763066
|
综述 | 本文综述了组织驻留巨噬细胞（TRMs）在疾病中的作用及其分子机制的最新理解 | 探讨了较少为人知的分子及已知分子的新功能，这些分子可能成为新的巨噬细胞介导治疗或诊断方法的潜在标志物 | NA | 旨在理解这些分子在巨噬细胞中的机制，以开发新的巨噬细胞介导的治疗或诊断方法 | 组织驻留巨噬细胞及其在疾病中的作用和分子机制 | NA | NA | 命运图谱和单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 555 | 2024-08-09 |
Leveraging Single-Cell RNA-seq Data to Uncover the Association Between Cell Type and Chronic Liver Diseases
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.637322
PMID:33763117
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研究论文 | 本文通过综合分析慢性肝病（CLD）的GWAS和单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，揭示了与CLD相关的细胞类型 | 利用scRNA-seq技术以高分辨率探索肝脏组织的细胞多样性和功能，并结合GWAS数据进行综合分析 | 在特异性分析中未发现与肝细胞癌（HCC）显著相关的细胞类型，且未发现与肝硬化显著相关的细胞类型 | 揭示慢性肝病的病理机制，特别是与特定细胞类型的关联 | 慢性肝病及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | 约19,002-32,200个细胞，识别出10-17种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 556 | 2024-08-09 |
Deciphering Tumor Heterogeneity in Hepatocellular Carcinoma (HCC)-Multi-Omic and Singulomic Approaches
2021-01, Seminars in liver disease
IF:4.3Q1
DOI:10.1055/s-0040-1722261
PMID:33764481
|
综述 | 本文综述了多组学和单细胞测序技术在解析肝细胞癌（HCC）肿瘤异质性方面的进展 | 结合多区域靶向采样策略与深度测序技术，揭示了HCC肿瘤起始和进展的新机制，并展示了液体活检在避免组织采样需求方面的潜力 | NA | 探讨多组学和单细胞测序技术如何增进我们对HCC肿瘤异质性的理解 | 肝细胞癌（HCC）的肿瘤异质性 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 下一代测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组和蛋白质组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 557 | 2024-08-09 |
Slowpoke functions in circadian output cells to regulate rest:activity rhythms
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0249215
PMID:33765072
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和细胞特异性RNA干扰技术，探讨了果蝇间脑(PI)细胞中slowpoke钾通道在调节昼夜节律行为中的作用 | 首次揭示了slowpoke钾通道在非中枢时钟细胞中的表达对于昼夜节律行为的重要性，并提出了其在多个昼夜节律回路组件中发挥作用的可能性 | 研究主要集中在果蝇模型上，可能需要进一步的人类或其他动物模型验证 | 探究昼夜节律系统中输出途径的细胞和分子机制 | 果蝇的间脑(PI)细胞和slowpoke钾通道 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | RNA | 约40个候选基因在PI细胞子集中进行RNAi敲降 | NA | NA | NA | NA |
| 558 | 2024-08-09 |
In vitro and ex vivo functional characterization of human HLA-DRB1∗04 restricted T cell receptors
2021, Journal of translational autoimmunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.jtauto.2021.100087
PMID:33768201
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研究论文 | 本文介绍了一种生成'人工'T细胞的流程，用于研究特定抗原和患者来源的免疫反应 | 开发了一种新的方法来验证和表征患者来源的TCR数据，并建立了相关的模型系统以支持开发诱导抗原特异性耐受的药物 | NA | 验证和表征患者来源的TCR数据，并开发支持抗原特异性耐受诱导药物的模型系统 | 人HLA-DRB1*04限制的T细胞受体 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞测序技术 | NA | TCR序列 | 涉及人类HLA-DRB1*04:01限制的TCR序列，特定于I型糖尿病相关GAD肽和流感衍生HA肽 | NA | NA | NA | NA |
| 559 | 2024-08-09 |
Deciphering the Prognostic Implications of the Components and Signatures in the Immune Microenvironment of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.648917
PMID:33777046
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和批量测序数据，系统探讨了胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中各组分对预后的影响 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了PDAC肿瘤微环境中不同细胞类型及其分子标志物与患者生存期的关联 | 研究主要基于现有数据集进行分析，未来需要更多的临床试验来验证这些发现 | 探讨胰腺导管腺癌肿瘤微环境中各组分对患者预后的影响 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 基因集变异分析（GSVA）算法 | 基因表达数据 | 883名PDAC患者 | NA | NA | NA | NA |
| 560 | 2024-08-09 |
NPC2 as a Prognostic Biomarker for Glioblastoma Based on Integrated Bioinformatics Analysis and Cytological Experiments
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.611442
PMID:33777094
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和细胞学实验，探讨了NPC2蛋白作为胶质母细胞瘤（GBM）的预后生物标志物的潜力 | 首次研究了NPC2与GBM的预后价值，并证实了其在GBM进展中的重要作用 | NA | 旨在通过生物信息学分析和细胞学实验，识别具有临床和预后意义的潜在基因 | 胶质母细胞瘤（GBM）及其预后生物标志物NPC2 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 包括H3K27M-胶质瘤细胞、U87-MG和U251细胞系 | NA | NA | NA | NA |