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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics and In Situ Morphological Analyses Reveal Microglia Heterogeneity Across the Nigrostriatal Pathway
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.639613
PMID:33854507
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和免疫荧光分析，揭示了黑质纹状体通路中微胶质细胞的异质性 | 发现了在黑质中主要存在的一种微胶质细胞亚群，显示出内在的转录免疫警戒特征，并与炎症诱导的微胶质细胞共享特征 | NA | 旨在研究帕金森病易感脑区黑质纹状体通路中微胶质细胞的异质性 | 微胶质细胞在黑质纹状体通路中的异质性 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用小鼠黑质纹状体通路样本 | NA | NA | NA | NA |
| 522 | 2024-08-09 |
Unraveling Heterogeneity of Tumor Cells and Microenvironment and Its Clinical Implications for Triple Negative Breast Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.557477
PMID:33854958
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研究论文 | 本研究旨在系统地表征三阴性乳腺癌（TNBC）的肿瘤异质性，通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析肿瘤细胞及其微环境的异质性，并探讨其临床意义。 | 本研究通过整合两个数据集并使用Seurat包进行细胞聚类分析，揭示了TNBC中五种细胞类型的功能异质性及其在细胞间通讯网络中的作用，特别是免疫细胞在TNBC中的异质性及其与临床特征的相关性。 | NA | 系统表征三阴性乳腺癌的肿瘤异质性及其临床意义 | 三阴性乳腺癌（TNBC）的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Seurat包 | RNA-seq数据 | 58个正常邻近组织和101个TNBC组织 | NA | NA | NA | NA |
| 523 | 2024-08-09 |
Transcriptome Profiling of the Ovarian Cells at the Single-Cell Resolution in Adult Asian Seabass
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.647892
PMID:33855024
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了成年亚洲海鲈卵巢中几种不同细胞群体的分子特征 | 首次在性逆转鱼类物种中对卵巢细胞进行单细胞RNA测序分析，并比较了果蝇、哺乳动物和鱼类的转录组特征，揭示了卵巢发育中分子机制的保守性和差异性 | NA | 研究鱼类配子发生和性腺发育的分子机制 | 亚洲海鲈成年卵巢细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 几种不同细胞群体的成年亚洲海鲈卵巢细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 524 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic profiling provides insights into the toxic effects of Zearalenone exposure on primordial follicle assembly
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.58433
PMID:33859742
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，探讨了玉米赤霉烯酮（ZEN）暴露对小鼠原始卵泡组装的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了ZEN暴露对原始卵泡形成过程中细胞发育轨迹和细胞间通信网络的扰动，特别是Hippo信号通路的影响 | NA | 研究ZEN暴露对小鼠原始卵泡组装的影响及其分子机制 | 小鼠的原始卵泡组装 | 数字病理学 | 生殖健康 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 从16.5天交配后（dpc）到出生后第3天（PD3）的小鼠卵巢组织 | NA | NA | NA | NA |
| 525 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Transcriptome and TCR Characteristics of pTregs and in vitro Expanded iTregs
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.619932
PMID:33868236
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了pTregs和体外扩增的iTregs的转录组和TCR特征 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了pTregs和iTregs的转录组和TCR特征，并揭示了它们在功能和表型上的差异 | 研究主要集中在体外扩增的Tregs，未来需要进一步验证这些发现在体内的有效性和安全性 | 探索调节性T细胞（Tregs）的转录组和TCR特征，以及它们在免疫耐受和肿瘤逃避中的作用 | 调节性T细胞（Tregs），包括pTregs和iTregs | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 从结直肠癌患者中扩增的CD4+CD25+CD127细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 526 | 2024-08-09 |
Cells of the Immune System in Cardiac Remodeling: Main Players in Resolution of Inflammation and Repair After Myocardial Infarction
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.664457
PMID:33868315
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综述 | 本文综述了免疫系统细胞在心肌梗死后心脏修复和炎症消退过程中的作用 | 介绍了基于单细胞RNA测序的新型细胞表型分类方法，有助于更好地理解参与炎症消退的细胞表型 | 文章提出了一些未解决的问题，需要进一步研究以将免疫细胞在心肌梗死后组织修复中的作用知识应用于实践 | 总结不同免疫系统细胞在心肌梗死后心脏修复过程中的作用，并讨论免疫介导疗法在急性心肌梗死患者中的可能前景 | 免疫系统细胞在心肌梗死后心脏修复和炎症消退中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 527 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-seq Reveals Characteristics of Malignant Cells and Immune Microenvironment in Subcutaneous Panniculitis-Like T-Cell Lymphoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.611580
PMID:33816243
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤（SPTCL）的恶性细胞和免疫微环境特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了SPTCL恶性细胞的独特基因表达特征，并发现了潜在的新型标记物 | NA | 深入理解皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤的转录特征和免疫微环境 | SPTCL患者的皮下病变组织、外周血和骨髓，以及健康供者的外周血、骨髓、淋巴结和肺组织 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括一名SPTCL患者和健康供者的多种组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 528 | 2024-08-09 |
Novel Molecular Hallmarks of Group 3 Medulloblastoma by Single-Cell Transcriptomics
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.622430
PMID:33816256
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研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序技术，揭示了3组髓母细胞瘤的新分子特征 | 发现了3组髓母细胞瘤中的两个关键标记基因GRM8和AP1S2，并绘制了MYC癌基因下游的分子级联图 | NA | 深入了解3组髓母细胞瘤的分子特性，并为这种难以治疗的疾病提供新的治疗靶点 | 3组髓母细胞瘤的分子和细胞机制 | 数字病理学 | 儿童脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 33个临床病例 | NA | NA | NA | NA |
| 529 | 2024-08-09 |
Differences in Tumor Immune Microenvironment in Metastatic Sites of Breast Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.649004
PMID:33816302
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研究论文 | 本文分析了转移性乳腺癌的转录组数据，以了解肿瘤免疫微环境（TIME）如何根据肿瘤部位变化 | 首次详细研究了不同转移部位的肿瘤免疫微环境的异质性 | 仅限于分析转录组数据和单细胞RNA测序数据，可能未能全面反映所有免疫细胞类型的变化 | 探讨肿瘤免疫微环境在不同转移部位的差异 | 转移性乳腺癌的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个转移性乳腺癌的基因表达数据集和一个原发性乳腺癌及转移淋巴结的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 530 | 2024-08-09 |
Uncovering cellular networks in branching morphogenesis using single-cell transcriptomics
2021, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2020.09.004
PMID:33820623
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学技术研究分支形态发生中的细胞网络 | 介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在分支器官研究中的应用进展，特别是在空间转录组学、分化轨迹的计算重建以及与谱系追踪的整合方面的进展 | 讨论了应用这些技术研究分支器官的可能性和局限性 | 探讨单细胞RNA测序在哺乳动物器官分支形态发生和分化研究中的应用 | 重点研究了肺、肾和乳腺等分支器官 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 531 | 2024-08-09 |
Single Cell Transcriptome Data Analysis Defines the Heterogeneity of Peripheral Nerve Cells in Homeostasis and Regeneration
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.624826
PMID:33828460
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研究论文 | 本研究通过重新分析已发表的单细胞RNA测序数据集，重新定义了完整和受伤小鼠周围神经细胞的异质性 | 本研究首次发现并分类了周围神经中的多种细胞类型，包括未被报道的中性粒细胞集群，并揭示了细胞间潜在的通信信号 | NA | 旨在更准确地定义选定组织中细胞类型的异质性 | 完整和受伤的小鼠周围神经细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 532 | 2024-08-09 |
Insights Into Human Intrahepatic NK Cell Function From Single Cell RNA Sequencing Datasets
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.649311
PMID:33828559
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序数据探讨了人肝内NK细胞的新功能 | 利用单细胞RNA测序技术详细分析了肝内NK细胞的转录组特征，并识别了与肝内NK细胞群相关的上调和下调基因 | 需要验证这些受体在肝内NK细胞上的表达及其在人肝脏中的细胞间相互作用 | 探索人肝内NK细胞的多样性和潜在功能 | 人肝内NK细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 533 | 2024-08-09 |
Evaluating the Reproducibility of Single-Cell Gene Regulatory Network Inference Algorithms
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.617282
PMID:33828580
|
研究论文 | 本文评估了六种单细胞基因调控网络推断算法的可重复性 | 首次基于真实数据评估单细胞网络推断算法的可重复性，并考虑了网络中多达100,000个链接 | 研究仅限于三种生物条件下的数据，且依赖于特定的算法和数据集 | 评估单细胞基因调控网络推断算法的可重复性 | 六种单细胞网络推断算法在三种生物条件下的表现 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | 涉及人类视网膜、结直肠癌中的T细胞和人类造血系统三种生物条件的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 534 | 2024-08-09 |
Prognostic Implication of the Expression Level of PECAM-1 in Non-small Cell Lung Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.587744
PMID:33828969
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析非小细胞肺癌中PECAM-1的表达水平及其对预后的影响 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫组织化学实验验证PECAM-1在非小细胞肺癌中的表达与患者生存率的关系 | 样本量较小，仅包括30例术后肺癌患者 | 探讨非小细胞肺癌中PECAM-1表达水平对患者预后的影响 | 非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 30例术后肺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 535 | 2024-08-09 |
A Comparison for Dimensionality Reduction Methods of Single-Cell RNA-seq Data
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.646936
PMID:33833778
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研究论文 | 本文比较了10种降维方法在单细胞RNA测序数据中的稳定性、准确性和计算成本 | 开发了一种策略来评估降维方法的性能，并提供了用户建议 | 需要根据具体情况设置非线性模型和神经网络降维方法的超参数 | 评估不同降维方法在单细胞RNA测序数据分析中的效果 | 单细胞RNA测序数据的降维方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | t-SNE, UMAP | 测序数据 | 30个模拟数据集和5个真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 536 | 2024-08-09 |
Using RNentropy to Detect Significant Variation in Gene Expression Across Multiple RNA-Seq or Single-Cell RNA-Seq Samples
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1307-8_6
PMID:33835439
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于信息论的方法RNentropy，用于检测RNA-Seq数据中跨多个样本和条件的基因表达显著变化 | RNentropy方法能够克服现有方法仅限于成对比较的限制，适用于任意数量样本和条件的基因表达显著变化检测 | NA | 开发一种新的方法来检测跨多个样本和条件的基因表达显著变化 | RNA-Seq数据中的基因表达变化 | 生物信息学 | NA | RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 多个样本和条件 | NA | NA | NA | NA |
| 537 | 2024-08-09 |
Computational Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1307-8_16
PMID:33835449
|
研究论文 | 本文介绍了单细胞RNA测序数据集的聚类和标记物检测步骤 | NA | NA | 研究单细胞RNA测序数据的分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 538 | 2024-08-09 |
Normalization of Single-Cell RNA-Seq Data
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1307-8_17
PMID:33835450
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研究论文 | 本文介绍了如何使用R/Bioconductor计算单细胞RNA-seq数据的归一化因子，并比较了几种归一化方法 | 提出了使用数据驱动的方法来评估和选择最佳的归一化方法 | 未提及 | 探讨单细胞RNA-seq数据归一化的方法及其对结果的影响 | 单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 539 | 2024-08-09 |
Dimensionality Reduction of Single-Cell RNA-Seq Data
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1307-8_18
PMID:33835451
|
研究论文 | 本文描述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析中典型的降维工作流程，特别强调了主成分分析、t分布随机邻域嵌入和均匀流形近似与投影的作用 | 本文强调了在处理包含数百万细胞的大型数据集时的计算效率 | NA | 探讨单细胞RNA测序数据分析中的降维方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 主成分分析、t分布随机邻域嵌入、均匀流形近似与投影 | 基因表达数据 | 数百万细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 540 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis: A Step-by-Step Overview
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1307-8_19
PMID:33835452
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综述 | 本文提供了一个逐步指南，概述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析的整个标准工作流程，包括读取映射、质量控制、基因表达定量、归一化、特征选择、降维和细胞聚类等步骤 | 本文提出了四个易于新用户使用的scRNA-seq分析流程，并提供了当前可用的单细胞技术概述 | 尽管有大量的分析方法，但缺乏一个通用的标准化流程 | 旨在帮助新手克服进入单细胞RNA测序分析领域的障碍，并扩展单细胞方法在基础科学中的研究潜力 | 单细胞RNA测序数据分析流程和技术 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 数千个细胞 | NA | NA | NA | NA |