单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2024-08-09 |
A Cancer-Specific Qualitative Method for Estimating the Proportion of Tumor-Infiltrating Immune Cells
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.672031
PMID:34054849
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Tumor-infiltrating Immune Cell Proportion Estimator (TICPE)的癌症特异性定性方法，用于估计肿瘤浸润免疫细胞的比例 | TICPE方法基于基因对的相对表达顺序（REOs），对批次效应不敏感，且在估计免疫细胞比例的准确性上明显优于其他方法 | NA | 开发一种新的方法来估计特定类型癌症中肿瘤浸润免疫细胞的比例，并探讨免疫细胞浸润对免疫治疗效果和癌症预后的影响 | 结直肠癌（CRC）和黑色素瘤 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | mRNA混合物数据、免疫组织化学数据和模拟的批量RNA测序样本 | 使用了公共表达数据和模拟样本 | NA | NA | NA | NA |
| 502 | 2024-08-09 |
GPCRomics of Homeostatic and Disease-Associated Human Microglia
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.674189
PMID:34054860
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研究论文 | 本文通过分析公开的RNA测序数据，研究了人类和小鼠大脑中微胶质细胞的G蛋白偶联受体（GPCRs）表达情况 | 首次系统性地揭示了微胶质细胞中GPCRs的表达模式，并探讨了其在脑疾病中的潜在作用 | 研究主要基于公开的RNA测序数据，可能存在样本选择偏差 | 探讨GPCRs在人类微胶质细胞中的表达及其在脑生理和病理过程中的作用 | 人类和小鼠大脑中的微胶质细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类和小鼠大脑的批量和单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 503 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Human Adipose-Derived Stromal Cells Identifies a Contractile Cell Subpopulation
2021, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2021/5595172
PMID:34007285
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探索了人脂肪源性间充质细胞（hASCs）在两次细胞分裂后的异质性，并识别出一种收缩细胞亚群 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了hASCs中的收缩细胞亚群，这些细胞可能为周细胞和/或血管平滑肌细胞 | 研究仅限于两次细胞分裂后的hASCs，未涉及更深入的功能验证和临床应用 | 探索hASCs的异质性，为其临床应用提供更多理解 | 人脂肪源性间充质细胞（hASCs） | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 至少两个亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 504 | 2024-08-09 |
Transcriptomic Profiling of Human Placenta in Gestational Diabetes Mellitus at the Single-Cell Level
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.679582
PMID:34025588
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对妊娠糖尿病患者的人类胎盘进行了全面的转录组分析，构建了细胞图谱，并识别了细胞亚型及其特异性标记基因 | 首次在单细胞水平上对妊娠糖尿病患者的人类胎盘进行转录组分析，揭示了胎盘细胞功能和细胞间相互作用 | NA | 阐明妊娠糖尿病的分子机制，并促进新的治疗方法和预防措施的开发 | 人类胎盘在妊娠糖尿病中的转录组特征 | 数字病理学 | 妊娠糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 505 | 2024-08-09 |
Pharmacological Inhibition and Genetic Knockdown of BCL9 Modulate the Cellular Landscape of Cancer-Associated Fibroblasts in the Tumor-Immune Microenvironment of Colorectal Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.603556
PMID:34026600
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研究论文 | 研究通过单细胞测序分析结直肠癌肿瘤微环境中BCL9抑制对癌症相关成纤维细胞（CAFs）的影响 | 首次揭示了BCL9抑制在CAFs中的细胞类型景观和转录差异，以及其如何通过抑制Wnt信号影响癌症相关的免疫监视 | 未详细说明BCL9抑制对CAFs的具体分子机制 | 探讨BCL9抑制对结直肠癌肿瘤微环境中CAFs的影响及其对免疫反应的作用 | 结直肠癌中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 涉及结直肠癌中的四种不同类型的CAFs | NA | NA | NA | NA |
| 506 | 2024-08-09 |
Fibroblast and Myofibroblast Subtypes: Single Cell Sequencing
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1382-5_4
PMID:34028734
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研究论文 | 本文描述了从心脏组织样本中制备单细胞悬液进行单细胞RNA测序的方法，并介绍了单细胞RNA测序和空间转录组学数据的计算分析流程，以探索纤维母细胞/肌纤维母细胞的异质性并识别其在心脏中的不同亚型和位置 | 利用新的单细胞'omics'技术，全面分析转录程序，揭示了间质细胞在转录、功能、表观遗传和空间上的异质性 | 需要进一步明确新识别的细胞簇是否代表不同的亚群或同一群体的不同状态 | 探索纤维母细胞/肌纤维母细胞的异质性并识别其在心脏中的不同亚型和位置 | 纤维母细胞和肌纤维母细胞的亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 心脏组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 507 | 2024-08-09 |
Inferring Cell Subtypes and LncRNA Function by a Cell-Specific CeRNA Network in Breast Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.656675
PMID:33987091
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研究论文 | 本文提出了一种基于细胞特异性ceRNA网络（CCN）的新策略，用于推断乳腺癌中的细胞亚型和长非编码RNA（lncRNA）功能 | 本文创新性地构建了细胞特异性ceRNA网络（CCN），通过整合细胞特异性RNA-RNA共表达网络（RCN）和现有的ceRNA网络，用于推断细胞亚型和lncRNA功能 | NA | 研究旨在探索乳腺癌中单细胞水平的细胞亚型和lncRNA功能 | 乳腺癌中的细胞亚型和lncRNA功能 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 表达谱 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 508 | 2024-08-09 |
Identification of Silkworm Hemocyte Subsets and Analysis of Their Response to Baculovirus Infection Based on Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.645359
PMID:33995363
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，全面鉴定了家蚕血细胞亚群，并分析了它们对杆状病毒感染的响应 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分类了家蚕血细胞，并揭示了杆状病毒感染对血细胞类型分布的显著影响 | 研究主要集中在血细胞的分子和细胞特性分析，未涉及更广泛的生理或生态影响 | 揭示家蚕血细胞的多样性及其对杆状病毒感染的响应 | 家蚕血细胞及其对杆状病毒感染的响应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括20个细胞集群及其潜在标记基因 | NA | NA | NA | NA |
| 509 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome profiling reveals vascular endothelial cell heterogeneity in human skin
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.54917
PMID:33995668
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了人皮肤中血管内皮细胞的异质性 | 首次在单细胞水平上详细描述了皮肤中血管内皮细胞的组织特异性特征和内部异质性 | NA | 探究人皮肤中血管内皮细胞的功能角色和异质性 | 人皮肤中的血管内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 10名供体的皮肤组织 | NA | NA | NA | NA |
| 510 | 2024-08-09 |
Endocrine Pancreas Development and Dysfunction Through the Lens of Single-Cell RNA-Sequencing
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.629212
PMID:33996792
|
研究论文 | 本文综述了通过单细胞RNA测序技术在内分泌胰腺发育和功能方面的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术，能够捕捉数千个单个细胞的转录组，包括稀有细胞类型、亚型和短暂状态，从而推断细胞转换的发育轨迹和基因调控途径 | NA | 探讨内分泌胰腺发育和功能，以及其在糖尿病病理学中的应用 | 内分泌胰腺的发育和功能，以及糖尿病中的病理胰腺 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 511 | 2024-08-09 |
Gene Families With Stochastic Exclusive Gene Choice Underlie Cell Adhesion in Mammalian Cells
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.642212
PMID:33996799
|
研究论文 | 本文探讨了基因家族中通过随机独占基因选择机制在哺乳动物细胞中实现细胞粘附的现象 | 本文提出了一种简单的度量方法，通过单细胞RNA测序数据检测基因表达的独占性，发现独占基因选择不仅限于典型家族，还扩展到其他细胞类型中的膜蛋白 | 本文主要依赖于单细胞RNA测序数据进行分析，可能存在数据解读的局限性 | 研究基因家族中随机独占基因选择机制在细胞粘附中的作用 | 研究对象包括T细胞受体、气味受体和原钙粘蛋白等基因家族 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 512 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Tissue Compartment-Specific Plasticity of Mycosis Fungoides Tumor Cells
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.666935
PMID:33968070
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了晚期蕈样霉菌病（MF）患者皮肤、血液和淋巴结中的肿瘤微环境，揭示了MF肿瘤细胞在不同组织隔室中的表型和功能可塑性。 | 首次通过单细胞RNA测序技术，结合V-D-J T细胞受体测序，详细描述了MF肿瘤细胞在不同组织环境中的表型和功能变化。 | 研究仅基于单一患者的数据，可能限制了结果的普遍性和广泛适用性。 | 探讨蕈样霉菌病肿瘤细胞在疾病进展过程中与组织环境相关的表型和功能特性。 | 蕈样霉菌病患者的皮肤、血液和淋巴结中的肿瘤细胞及其微环境。 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单一患者 | NA | NA | NA | NA |
| 513 | 2024-08-09 |
Cryopreservation Preserves Cell-Type Composition and Gene Expression Profiles in Bone Marrow Aspirates From Multiple Myeloma Patients
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.663487
PMID:33968139
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了新鲜和冷冻的骨髓抽吸物中细胞类型组成和基因表达谱，以评估冷冻保存对多发性骨髓瘤患者样本的影响 | 首次详细研究了冷冻保存对多发性骨髓瘤患者骨髓抽吸物中单细胞基因表达谱和细胞类型比例的影响 | 研究样本仅限于六名多发性骨髓瘤患者，可能需要更多样本以验证结果的普遍性 | 探讨冷冻保存是否会影响多发性骨髓瘤患者骨髓抽吸物中的细胞类型组成和基因表达谱 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓抽吸物中的细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 六名多发性骨髓瘤患者的骨髓抽吸物 | NA | NA | NA | NA |
| 514 | 2024-08-09 |
Irradiation-Induced Changes in the Immunogenicity of Lung Cancer Cell Lines: Based on Comparison of X-rays and Carbon Ions
2021, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2021.666282
PMID:33968889
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研究论文 | 本研究通过比较碳离子和X射线在不同时间和剂量窗口下对肺癌细胞系免疫原性变化的影响，探讨了两者在诱导免疫效应方面的差异 | 首次全面比较了碳离子和X射线在不同时间和剂量窗口下对肺癌细胞系免疫原性变化的影响，并推测碳离子在诱导免疫效应方面可能比传统X射线更具优势 | 研究主要集中在特定肺癌细胞系和特定免疫标志物上，可能需要进一步扩大样本和标志物范围以验证结果的普遍性 | 探讨碳离子和X射线在不同时间和剂量窗口下对肺癌细胞系免疫原性变化的影响，以及其在诱导免疫效应方面的差异 | 肺癌细胞系A549、H520和Lewis Lung Carcinoma (LLC) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、ELISA | NA | 基因表达数据 | 涉及A549、H520和Lewis Lung Carcinoma (LLC)三种肺癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 515 | 2024-08-09 |
Single-Cell Atlas Reveals Fatty Acid Metabolites Regulate the Functional Heterogeneity of Mesenchymal Stem Cells
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.653308
PMID:33912565
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了脂肪酸代谢物在调节间充质干细胞功能异质性中的作用 | 首次发现脂肪酸代谢物通过调节间充质干细胞的谱系承诺和功能异质性，影响其自我更新和分化潜能 | 研究主要集中在体外实验，未来需要进一步的临床研究验证其治疗潜力 | 探讨代谢物如何调节间充质干细胞的功能异质性 | 骨髓间充质干细胞及其代谢物 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 516 | 2024-08-09 |
CBA: Cluster-Guided Batch Alignment for Single Cell RNA-seq
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.644211
PMID:33927748
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研究论文 | 本文提出了一种基于聚类的批量对齐方法（CBA），用于单细胞RNA测序数据，通过自动编码器将两个批次的数据嵌入同一空间，并使用特定的损失函数保持细胞间距离，以实现细胞类型的匹配 | CBA方法考虑了细胞类型的身份，通过无监督的方式定义细胞类型为原始批次中的聚类，从而进一步约束了不同批次间的细胞匹配 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中的批次效应问题，提高数据整合的准确性和生物学意义 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 基因表达数据 | 使用了胰腺和鼠细胞图谱数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 517 | 2024-08-09 |
Gene Expression Analysis of T-Cells by Single-Cell RNA-Seq
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1311-5_22
PMID:33928560
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研究论文 | 本文提供了一种优化的单细胞RNA测序技术用于T细胞基因表达分析的实验方案 | 采用滴液数字技术（ddSEQ）进行T细胞的分离和RNA测序文库的制备 | 该技术需要专业设备和专业知识 | 提供一个从样本制备到数据解释的单细胞实验框架 | T细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 518 | 2024-08-09 |
A Partial Picture of the Single-Cell Transcriptomics of Human IgA Nephropathy
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.645988
PMID:33936064
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了IgA肾病患者的肾活检样本，揭示了IgA肾病中细胞表达谱的变化 | 首次展示了IgA肾病系膜细胞中多个新基因的高表达，这些基因与细胞增殖和基质积累相关 | 研究结果基于有限数量的细胞和患者样本，需要在未来研究中通过更大规模的细胞和患者样本进行验证 | 旨在揭示IgA肾病的分子机制并识别新的治疗靶点 | IgA肾病患者的肾活检样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 4名IgA肾病患者和3名健康供体的肾组织 | NA | NA | NA | NA |
| 519 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Immunometabolic Rewiring and Immunopathogenesis of Coronavirus Disease 2019
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.651656
PMID:33936072
|
研究论文 | 本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据，揭示了外周血单个核细胞（PBMCs）中的代谢重编程，以阐明可能导致严重COVID-19进展的代谢机制。 | 研究发现严重COVID-19患者中的单核细胞表达更高水平的糖酵解相关基因和PPP相关基因，可能导致超炎症反应，并且增强的糖酵解或OXPHOS与记忆B细胞向浆母细胞或浆细胞的分化正相关。 | NA | 研究COVID-19中的免疫代谢重编程和免疫病理发生机制。 | COVID-19患者的外周血单个核细胞（PBMCs）。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 520 | 2024-08-09 |
Non-linear Normalization for Non-UMI Single Cell RNA-Seq
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.612670
PMID:33897755
|
研究论文 | 本文介绍了一种非线性归一化方法，用于处理非UMI单细胞RNA测序数据中的技术噪声 | 提出了一种细胞和基因特异性的非线性归一化方法，能够更有效地减少技术变异而不影响生物变异 | NA | 开发一种新的归一化方法，以减少单细胞RNA测序数据中的技术噪声 | 单细胞RNA测序数据中的技术噪声 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非线性归一化方法 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |