单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2024-08-09 |
Endocrine Pancreas Development and Dysfunction Through the Lens of Single-Cell RNA-Sequencing
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.629212
PMID:33996792
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研究论文 | 本文综述了通过单细胞RNA测序技术在内分泌胰腺发育和功能方面的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术，能够捕捉数千个单个细胞的转录组，包括稀有细胞类型、亚型和短暂状态，从而推断细胞转换的发育轨迹和基因调控途径 | NA | 探讨内分泌胰腺发育和功能，以及其在糖尿病病理学中的应用 | 内分泌胰腺的发育和功能，以及糖尿病中的病理胰腺 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个单个细胞 |
| 502 | 2024-08-09 |
Gene Families With Stochastic Exclusive Gene Choice Underlie Cell Adhesion in Mammalian Cells
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.642212
PMID:33996799
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研究论文 | 本文探讨了基因家族中通过随机独占基因选择机制在哺乳动物细胞中实现细胞粘附的现象 | 本文提出了一种简单的度量方法，通过单细胞RNA测序数据检测基因表达的独占性，发现独占基因选择不仅限于典型家族，还扩展到其他细胞类型中的膜蛋白 | 本文主要依赖于单细胞RNA测序数据进行分析，可能存在数据解读的局限性 | 研究基因家族中随机独占基因选择机制在细胞粘附中的作用 | 研究对象包括T细胞受体、气味受体和原钙粘蛋白等基因家族 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个细胞类型 |
| 503 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Tissue Compartment-Specific Plasticity of Mycosis Fungoides Tumor Cells
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.666935
PMID:33968070
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了晚期蕈样霉菌病（MF）患者皮肤、血液和淋巴结中的肿瘤微环境，揭示了MF肿瘤细胞在不同组织隔室中的表型和功能可塑性。 | 首次通过单细胞RNA测序技术，结合V-D-J T细胞受体测序，详细描述了MF肿瘤细胞在不同组织环境中的表型和功能变化。 | 研究仅基于单一患者的数据，可能限制了结果的普遍性和广泛适用性。 | 探讨蕈样霉菌病肿瘤细胞在疾病进展过程中与组织环境相关的表型和功能特性。 | 蕈样霉菌病患者的皮肤、血液和淋巴结中的肿瘤细胞及其微环境。 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单一患者 |
| 504 | 2024-08-09 |
Cryopreservation Preserves Cell-Type Composition and Gene Expression Profiles in Bone Marrow Aspirates From Multiple Myeloma Patients
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.663487
PMID:33968139
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了新鲜和冷冻的骨髓抽吸物中细胞类型组成和基因表达谱，以评估冷冻保存对多发性骨髓瘤患者样本的影响 | 首次详细研究了冷冻保存对多发性骨髓瘤患者骨髓抽吸物中单细胞基因表达谱和细胞类型比例的影响 | 研究样本仅限于六名多发性骨髓瘤患者，可能需要更多样本以验证结果的普遍性 | 探讨冷冻保存是否会影响多发性骨髓瘤患者骨髓抽吸物中的细胞类型组成和基因表达谱 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓抽吸物中的细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 六名多发性骨髓瘤患者的骨髓抽吸物 |
| 505 | 2024-08-09 |
Irradiation-Induced Changes in the Immunogenicity of Lung Cancer Cell Lines: Based on Comparison of X-rays and Carbon Ions
2021, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2021.666282
PMID:33968889
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研究论文 | 本研究通过比较碳离子和X射线在不同时间和剂量窗口下对肺癌细胞系免疫原性变化的影响，探讨了两者在诱导免疫效应方面的差异 | 首次全面比较了碳离子和X射线在不同时间和剂量窗口下对肺癌细胞系免疫原性变化的影响，并推测碳离子在诱导免疫效应方面可能比传统X射线更具优势 | 研究主要集中在特定肺癌细胞系和特定免疫标志物上，可能需要进一步扩大样本和标志物范围以验证结果的普遍性 | 探讨碳离子和X射线在不同时间和剂量窗口下对肺癌细胞系免疫原性变化的影响，以及其在诱导免疫效应方面的差异 | 肺癌细胞系A549、H520和Lewis Lung Carcinoma (LLC) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、ELISA | NA | 基因表达数据 | 涉及A549、H520和Lewis Lung Carcinoma (LLC)三种肺癌细胞系 |
| 506 | 2024-08-09 |
Single-Cell Atlas Reveals Fatty Acid Metabolites Regulate the Functional Heterogeneity of Mesenchymal Stem Cells
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.653308
PMID:33912565
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了脂肪酸代谢物在调节间充质干细胞功能异质性中的作用 | 首次发现脂肪酸代谢物通过调节间充质干细胞的谱系承诺和功能异质性，影响其自我更新和分化潜能 | 研究主要集中在体外实验，未来需要进一步的临床研究验证其治疗潜力 | 探讨代谢物如何调节间充质干细胞的功能异质性 | 骨髓间充质干细胞及其代谢物 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 507 | 2024-08-09 |
CBA: Cluster-Guided Batch Alignment for Single Cell RNA-seq
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.644211
PMID:33927748
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研究论文 | 本文提出了一种基于聚类的批量对齐方法（CBA），用于单细胞RNA测序数据，通过自动编码器将两个批次的数据嵌入同一空间，并使用特定的损失函数保持细胞间距离，以实现细胞类型的匹配 | CBA方法考虑了细胞类型的身份，通过无监督的方式定义细胞类型为原始批次中的聚类，从而进一步约束了不同批次间的细胞匹配 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中的批次效应问题，提高数据整合的准确性和生物学意义 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 基因表达数据 | 使用了胰腺和鼠细胞图谱数据集 |
| 508 | 2024-08-09 |
Gene Expression Analysis of T-Cells by Single-Cell RNA-Seq
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1311-5_22
PMID:33928560
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研究论文 | 本文提供了一种优化的单细胞RNA测序技术用于T细胞基因表达分析的实验方案 | 采用滴液数字技术（ddSEQ）进行T细胞的分离和RNA测序文库的制备 | 该技术需要专业设备和专业知识 | 提供一个从样本制备到数据解释的单细胞实验框架 | T细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 509 | 2024-08-09 |
A Partial Picture of the Single-Cell Transcriptomics of Human IgA Nephropathy
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.645988
PMID:33936064
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了IgA肾病患者的肾活检样本，揭示了IgA肾病中细胞表达谱的变化 | 首次展示了IgA肾病系膜细胞中多个新基因的高表达，这些基因与细胞增殖和基质积累相关 | 研究结果基于有限数量的细胞和患者样本，需要在未来研究中通过更大规模的细胞和患者样本进行验证 | 旨在揭示IgA肾病的分子机制并识别新的治疗靶点 | IgA肾病患者的肾活检样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 4名IgA肾病患者和3名健康供体的肾组织 |
| 510 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Immunometabolic Rewiring and Immunopathogenesis of Coronavirus Disease 2019
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.651656
PMID:33936072
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研究论文 | 本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据，揭示了外周血单个核细胞（PBMCs）中的代谢重编程，以阐明可能导致严重COVID-19进展的代谢机制。 | 研究发现严重COVID-19患者中的单核细胞表达更高水平的糖酵解相关基因和PPP相关基因，可能导致超炎症反应，并且增强的糖酵解或OXPHOS与记忆B细胞向浆母细胞或浆细胞的分化正相关。 | NA | 研究COVID-19中的免疫代谢重编程和免疫病理发生机制。 | COVID-19患者的外周血单个核细胞（PBMCs）。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 511 | 2024-08-09 |
Non-linear Normalization for Non-UMI Single Cell RNA-Seq
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.612670
PMID:33897755
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研究论文 | 本文介绍了一种非线性归一化方法，用于处理非UMI单细胞RNA测序数据中的技术噪声 | 提出了一种细胞和基因特异性的非线性归一化方法，能够更有效地减少技术变异而不影响生物变异 | NA | 开发一种新的归一化方法，以减少单细胞RNA测序数据中的技术噪声 | 单细胞RNA测序数据中的技术噪声 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非线性归一化方法 | 基因表达数据 | NA |
| 512 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics and In Situ Morphological Analyses Reveal Microglia Heterogeneity Across the Nigrostriatal Pathway
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.639613
PMID:33854507
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和免疫荧光分析，揭示了黑质纹状体通路中微胶质细胞的异质性 | 发现了在黑质中主要存在的一种微胶质细胞亚群，显示出内在的转录免疫警戒特征，并与炎症诱导的微胶质细胞共享特征 | NA | 旨在研究帕金森病易感脑区黑质纹状体通路中微胶质细胞的异质性 | 微胶质细胞在黑质纹状体通路中的异质性 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用小鼠黑质纹状体通路样本 |
| 513 | 2024-08-09 |
Unraveling Heterogeneity of Tumor Cells and Microenvironment and Its Clinical Implications for Triple Negative Breast Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.557477
PMID:33854958
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研究论文 | 本研究旨在系统地表征三阴性乳腺癌（TNBC）的肿瘤异质性，通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析肿瘤细胞及其微环境的异质性，并探讨其临床意义。 | 本研究通过整合两个数据集并使用Seurat包进行细胞聚类分析，揭示了TNBC中五种细胞类型的功能异质性及其在细胞间通讯网络中的作用，特别是免疫细胞在TNBC中的异质性及其与临床特征的相关性。 | NA | 系统表征三阴性乳腺癌的肿瘤异质性及其临床意义 | 三阴性乳腺癌（TNBC）的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Seurat包 | RNA-seq数据 | 58个正常邻近组织和101个TNBC组织 |
| 514 | 2024-08-09 |
Transcriptome Profiling of the Ovarian Cells at the Single-Cell Resolution in Adult Asian Seabass
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.647892
PMID:33855024
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了成年亚洲海鲈卵巢中几种不同细胞群体的分子特征 | 首次在性逆转鱼类物种中对卵巢细胞进行单细胞RNA测序分析，并比较了果蝇、哺乳动物和鱼类的转录组特征，揭示了卵巢发育中分子机制的保守性和差异性 | NA | 研究鱼类配子发生和性腺发育的分子机制 | 亚洲海鲈成年卵巢细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 几种不同细胞群体的成年亚洲海鲈卵巢细胞 |
| 515 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic profiling provides insights into the toxic effects of Zearalenone exposure on primordial follicle assembly
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.58433
PMID:33859742
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，探讨了玉米赤霉烯酮（ZEN）暴露对小鼠原始卵泡组装的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了ZEN暴露对原始卵泡形成过程中细胞发育轨迹和细胞间通信网络的扰动，特别是Hippo信号通路的影响 | NA | 研究ZEN暴露对小鼠原始卵泡组装的影响及其分子机制 | 小鼠的原始卵泡组装 | 数字病理学 | 生殖健康 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 从16.5天交配后（dpc）到出生后第3天（PD3）的小鼠卵巢组织 |
| 516 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Transcriptome and TCR Characteristics of pTregs and in vitro Expanded iTregs
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.619932
PMID:33868236
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了pTregs和体外扩增的iTregs的转录组和TCR特征 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了pTregs和iTregs的转录组和TCR特征，并揭示了它们在功能和表型上的差异 | 研究主要集中在体外扩增的Tregs，未来需要进一步验证这些发现在体内的有效性和安全性 | 探索调节性T细胞（Tregs）的转录组和TCR特征，以及它们在免疫耐受和肿瘤逃避中的作用 | 调节性T细胞（Tregs），包括pTregs和iTregs | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 从结直肠癌患者中扩增的CD4+CD25+CD127细胞 |
| 517 | 2024-08-09 |
Cells of the Immune System in Cardiac Remodeling: Main Players in Resolution of Inflammation and Repair After Myocardial Infarction
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.664457
PMID:33868315
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综述 | 本文综述了免疫系统细胞在心肌梗死后心脏修复和炎症消退过程中的作用 | 介绍了基于单细胞RNA测序的新型细胞表型分类方法，有助于更好地理解参与炎症消退的细胞表型 | 文章提出了一些未解决的问题，需要进一步研究以将免疫细胞在心肌梗死后组织修复中的作用知识应用于实践 | 总结不同免疫系统细胞在心肌梗死后心脏修复过程中的作用，并讨论免疫介导疗法在急性心肌梗死患者中的可能前景 | 免疫系统细胞在心肌梗死后心脏修复和炎症消退中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 518 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-seq Reveals Characteristics of Malignant Cells and Immune Microenvironment in Subcutaneous Panniculitis-Like T-Cell Lymphoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.611580
PMID:33816243
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤（SPTCL）的恶性细胞和免疫微环境特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了SPTCL恶性细胞的独特基因表达特征，并发现了潜在的新型标记物 | NA | 深入理解皮下脂膜炎样T细胞淋巴瘤的转录特征和免疫微环境 | SPTCL患者的皮下病变组织、外周血和骨髓，以及健康供者的外周血、骨髓、淋巴结和肺组织 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括一名SPTCL患者和健康供者的多种组织样本 |
| 519 | 2024-08-09 |
Novel Molecular Hallmarks of Group 3 Medulloblastoma by Single-Cell Transcriptomics
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.622430
PMID:33816256
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研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序技术，揭示了3组髓母细胞瘤的新分子特征 | 发现了3组髓母细胞瘤中的两个关键标记基因GRM8和AP1S2，并绘制了MYC癌基因下游的分子级联图 | NA | 深入了解3组髓母细胞瘤的分子特性，并为这种难以治疗的疾病提供新的治疗靶点 | 3组髓母细胞瘤的分子和细胞机制 | 数字病理学 | 儿童脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 33个临床病例 |
| 520 | 2024-08-09 |
Differences in Tumor Immune Microenvironment in Metastatic Sites of Breast Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.649004
PMID:33816302
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研究论文 | 本文分析了转移性乳腺癌的转录组数据，以了解肿瘤免疫微环境（TIME）如何根据肿瘤部位变化 | 首次详细研究了不同转移部位的肿瘤免疫微环境的异质性 | 仅限于分析转录组数据和单细胞RNA测序数据，可能未能全面反映所有免疫细胞类型的变化 | 探讨肿瘤免疫微环境在不同转移部位的差异 | 转移性乳腺癌的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个转移性乳腺癌的基因表达数据集和一个原发性乳腺癌及转移淋巴结的单细胞RNA测序数据集 |