单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2024-08-08 |
Corrigendum: Characterizing Adult Cochlear Supporting Cell Transcriptional Diversity Using Single-Cell RNA-Seq: Validation in the Adult Mouse and Translational Implications for the Adult Human Cochlea
2021, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2021.699859
PMID:34149357
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 482 | 2024-08-08 |
GRMT: Generative Reconstruction of Mutation Tree From Scratch Using Single-Cell Sequencing Data
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.692964
PMID:34149820
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GRMT的方法，用于从单细胞测序数据中从头开始生成突变树，以推断肿瘤的突变历史 | GRMT利用-Dollo简约模型，允许每个突变只发生一次且最多丢失一次，通过从零开始生成树结构的方式，逐步增加树的大小，直到包含所有突变，从而有效地恢复突变的时序并适用于大型数据集 | NA | 开发一种高效且准确的方法来重建肿瘤树 | 单细胞测序数据中的肿瘤突变树 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 483 | 2024-08-08 |
Expression of SARS-CoV-2 entry genes ACE2 and TMPRSS2 at single cell resolution in the peripartum decidua
2021, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:34150021
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，探讨了分娩期间蜕膜组织中SARS-CoV-2进入基因ACE2和TMPRSS2的表达情况 | 首次在单细胞分辨率下研究了分娩期间蜕膜组织中ACE2的表达异质性及其对SARS-CoV-2感染敏感性的影响 | NA | 研究分娩期间蜕膜组织中ACE2及相关基因的表达情况，探讨其对垂直传播的影响 | 蜕膜组织中的ACE2和TMPRSS2基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 484 | 2024-08-08 |
The Epithelial to Mesenchymal Transition Related Gene Calumenin Is an Adverse Prognostic Factor of Bladder Cancer Correlated With Tumor Microenvironment Remodeling, Gene Mutation, and Ferroptosis
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.683951
PMID:34150647
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研究论文 | 本研究通过多组学生物信息学分析，探讨了膀胱癌中与上皮间质转化相关的基因calumenin（CALU）的作用及其分子机制 | 首次揭示了CALU在膀胱癌中的独立风险因子作用，及其与肿瘤微环境重塑、基因突变和铁死亡的关联 | 研究主要基于生物信息学分析和实验室验证，未来需更多临床试验验证CALU在膀胱癌治疗中的实际应用 | 探讨CALU在膀胱癌中的作用及其对患者预后的影响 | 膀胱癌患者样本及CALU基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 多组学生物信息学分析、单细胞RNA测序、PCR和免疫组织化学 | NA | 基因表达数据 | 408名TCGA膀胱癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 485 | 2024-08-08 |
S100A9 Derived From Myeloma Associated Myeloid Cells Promotes TNFSF13B/TNFRSF13B-Dependent Proliferation and Survival of Myeloma Cells
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.691705
PMID:34150664
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研究论文 | 研究探讨了多发性骨髓瘤（MM）中髓系细胞来源的S100A9如何通过TNFSF13B/TNFRSF13B依赖性途径促进骨髓瘤细胞的增殖和生存 | 揭示了髓系细胞通过S100A9促进骨髓瘤细胞增殖和生存的新机制 | NA | 探究髓系细胞在多发性骨髓瘤中的作用机制 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓细胞及髓系细胞 | NA | 多发性骨髓瘤 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | RNA | 来自多发性骨髓瘤患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 486 | 2024-08-08 |
TBX20 Contributes to Balancing the Differentiation of Perivascular Adipose-Derived Stem Cells to Vascular Lineages and Neointimal Hyperplasia
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.662704
PMID:34150759
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研究论文 | 本研究探讨了周围血管脂肪源性干细胞（PVASCs）向平滑肌细胞（SMCs）和内皮细胞（ECs）分化的机制及其在新生内膜增生中的功能 | 发现TBX20在PVASCs中的独特表达，并揭示了TBX20在调控PVASCs向SMCs和ECs分化中的作用 | NA | 研究PVASC分化为SMCs和ECs的机制及其在新生内膜增生中的功能 | 周围血管脂肪源性干细胞（PVASCs） | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序、批量mRNA测序、免疫荧光、定量实时PCR（QPCR）、Western blot | NA | mRNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 487 | 2024-08-08 |
Exposure to Copper Compromises the Maturational Competency of Porcine Oocytes by Impairing Mitochondrial Function
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.678665
PMID:34150773
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研究论文 | 研究了过量铜对猪卵母细胞成熟和细胞器功能的影响 | 首次探讨了过量铜对母猪生殖性能的影响，并揭示了其对卵母细胞成熟和线粒体功能的损害机制 | NA | 探讨过量铜对猪卵母细胞成熟和细胞器功能的影响 | 猪卵母细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 488 | 2024-08-08 |
A Subpopulation of Schwann Cell-Like Cells With Nerve Regeneration Signatures Is Identified Through Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.637924
PMID:34093220
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究了人羊膜间充质干细胞衍生的类施万细胞在促进周围神经再生中的异质性和潜在分子机制 | 首次鉴定出一亚群高度表达与施万细胞增殖、迁移和生存相关基因的类施万细胞，这些细胞可能是在神经再生中的关键群体 | NA | 探究类施万细胞在治疗周围神经再生中的异质性和潜在分子机制 | 人羊膜间充质干细胞衍生的类施万细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6,008个人羊膜间充质干细胞单细胞和5,140个类施万细胞单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 489 | 2024-08-08 |
A Sight on Single-Cell Transcriptomics in Plants Through the Prism of Cell-Based Computational Modeling Approaches: Benefits and Challenges for Data Analysis
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.652974
PMID:34093652
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综述 | 本文综述了单细胞转录组技术在植物研究中的应用及其通过基于细胞的计算模型在数据分析中的优势和挑战 | 探讨了单细胞转录组数据与植物形态发生模型结合的新机会，以及显微镜和细胞分辨率成像技术在解决单细胞转录组数据空间问题中的前景 | 集成转录组到形态发生水平的数据在一个统一系统中仍存在困难 | 探讨单细胞转录组技术在植物组织结构形成研究中的应用及其计算模型分析方法 | 植物组织的单细胞转录组数据及其在形态发生中的应用 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组技术 | 基于细胞的计算模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 490 | 2024-08-08 |
Integrating Spatial Transcriptomics and Single-Cell RNA-seq Reveals the Gene Expression Profling of the Human Embryonic Liver
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.652408
PMID:34095116
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，对人类胚胎肝脏在不同发育阶段的基因表达进行无偏分析 | 首次系统地识别了人类胚胎肝脏中的九种细胞类型，并定义了主要细胞类型的发育途径 | NA | 了解胚胎发育过程中肝脏的复杂发展，以促进功能性肝脏替代组织的工程化及肝脏再生 | 人类胚胎肝脏在8周至17周的发育过程中的基因表达 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类胚胎肝脏在8周至17周的发育阶段样本 | NA | NA | NA | NA |
| 491 | 2024-08-08 |
The Intestinal Epithelium - Fluid Fate and Rigid Structure From Crypt Bottom to Villus Tip
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.661931
PMID:34095127
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综述 | 本文综述了肠道上皮从隐窝底部到绒毛顶端的流体命运和刚性结构，以及其与肠道功能的相互作用 | 介绍了单细胞测序、时空分析和类器官技术在揭示肠道上皮复杂微观结构和维持机制中的新发现 | 讨论了每种方法的优势和局限性，并考虑了这些结果对健康和疾病中肠道理解的影响 | 探讨近期关于肠道上皮和基质结构的新发现，并强调导致这些发现的技术 | 肠道上皮及其基质结构 | NA | NA | 单细胞测序、时空分析、类器官技术 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 492 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Endothelial Plasticity During Diabetic Atherogenesis
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.689469
PMID:34095155
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了糖尿病诱导的动脉粥样硬化中内皮细胞的转录组变化 | 首次在单细胞水平上揭示了糖尿病相关动脉粥样硬化中内皮细胞的表型和代谢异质性 | NA | 探究糖尿病相关动脉粥样硬化中内皮细胞的生物学特性 | 小鼠心脏和主动脉中的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 来自小鼠心脏和主动脉的富含内皮细胞的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 493 | 2024-08-08 |
Cell Heterogeneity Analysis in Single-Cell RNA-seq Data Using Mixture Exponential Graph and Markov Random Field Model
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/9919080
PMID:34095314
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研究论文 | 本文介绍了一种新的方案，用于检测单细胞异质性的基因型特征，并将其应用于循环肿瘤细胞（CTCs）和三阴性乳腺癌（TNBC）的单细胞RNA测序数据中 | 本文引入了混合指数族图模型和马尔可夫随机场模型，用于更灵活地重构细胞网络，并发现不同细胞亚群中的高共表达基因模块 | NA | 探索细胞异质性，特别是循环肿瘤细胞（CTCs）和三阴性乳腺癌（TNBC）的异质性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞异质性和基因网络关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 混合指数族图模型和马尔可夫随机场模型 | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 494 | 2024-08-08 |
Single Cell RNA-Seq Analysis Identifies Differentially Expressed Genes of Treg Cell in Early Treatment-Naive Rheumatoid Arthritis By Arsenic Trioxide
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.656124
PMID:34108876
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了三氧化二砷（AsO）对早期未治疗类风湿关节炎（RA）中调节性T细胞（Treg细胞）基因表达的影响 | 这是首个研究AsO对未治疗Treg细胞基因表达全基因组效应的研究，除了明显的抗炎和免疫调节作用外，AsO还影响Treg细胞中的氨基酸和葡萄糖代谢 | NA | 阐明早期类风湿关节炎中三氧化二砷对Treg细胞在发病机制中的调节作用 | 早期未治疗的类风湿关节炎中的Treg细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 从外周血单个核细胞（PBMCs）中分离并纯化的Treg细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 495 | 2024-08-08 |
The Presence of Circulating Nucleated Red Blood Cells Is Associated With Disease Severity in Patients of Hemorrhagic Fever With Renal Syndrome
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.665410
PMID:34113638
|
研究论文 | 本研究探讨了在汉坦病毒感染引起的肾综合征出血热患者中，外周血红细胞的变化及其与疾病严重程度的关系 | 首次发现肾综合征出血热患者外周血中存在有核红细胞（NRBC），并与其疾病严重程度相关；首次表明汉坦病毒感染阻碍红细胞成熟 | NA | 探索肾综合征出血热患者外周血红细胞的变化及其与疾病严重程度的关系 | 肾综合征出血热患者的外周血红细胞 | NA | 肾综合征出血热 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 肾综合征出血热患者的PBMCs | NA | NA | NA | NA |
| 496 | 2024-08-08 |
Expression of Urea Transporter B in Normal and Injured Brain
2021, Frontiers in neuroanatomy
IF:2.1Q3
DOI:10.3389/fnana.2021.591726
PMID:34122018
|
研究论文 | 研究探讨了尿素转运蛋白B（UT-B）在大脑正常和损伤状态下的表达特征 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫组织化学方法，详细描述了UT-B在大脑不同细胞类型中的分布和表达变化 | 研究主要集中在UT-B的表达变化，未深入探讨其具体功能和机制 | 确定UT-B在大脑中的表达特性及其在创伤性脑损伤（TBI）后的变化 | UT-B在大脑中的表达及其在TBI后的变化 | NA | 神经疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 细胞 | 涉及多种大脑细胞类型，具体数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 497 | 2024-08-08 |
Revealing the Immune Infiltration Landscape and Identifying Diagnostic Biomarkers for Lumbar Disc Herniation
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.666355
PMID:34122424
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析，识别了腰椎间盘突出症（LDH）中核软骨（NP）组织免疫浸润的关键基因，并探讨了其作为诊断生物标志物的潜力 | 首次通过CIBERSORT算法和WGCNA R包分析了LDH与对照组间NP组织的免疫浸润差异，并结合单细胞测序数据进行了深入分析 | NA | 揭示腰椎间盘突出症的免疫浸润景观并识别诊断生物标志物 | 腰椎间盘突出症中的核软骨组织 | 数字病理学 | 腰椎间盘突出症 | CIBERSORT算法, WGCNA R包, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 498 | 2024-08-08 |
Cell Type-Specific Differentiation Between Indica and Japonica Rice Root Tip Responses to Different Environments Based on Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.659500
PMID:34079581
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，探讨了籼稻和粳稻在不同环境下的细胞类型特异性差异表达基因 | 首次详细分析了籼稻和粳稻在不同环境下的细胞类型特异性差异表达基因，并探讨了这些基因与非生物胁迫响应的关系 | 研究主要基于已发表的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据，未进行新的实验验证 | 旨在理解籼稻和粳稻在细胞水平上的分化和环境适应性的遗传基础 | 籼稻和粳稻的根尖细胞在不同环境下的响应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及籼稻和粳稻的多个细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 499 | 2024-08-08 |
The Chromatin Accessibility Landscape of Peripheral Blood Mononuclear Cells in Patients With Systemic Lupus Erythematosus at Single-Cell Resolution
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.641886
PMID:34084162
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研究论文 | 本研究旨在揭示系统性红斑狼疮（SLE）患者外周血单个核细胞（PBMCs）的染色质可及性图谱，并识别可能驱动异常免疫反应的转录因子（TFs） | 本研究首次在单细胞分辨率下分析了SLE患者PBMCs的染色质可及性图谱，并鉴定了20种TF激活模式，这些模式驱动SLE患者的异常免疫反应 | NA | 揭示SLE患者PBMCs的染色质可及性图谱，并识别可能驱动异常免疫反应的转录因子 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 500 | 2024-08-09 |
Methods for Characterization of Senescent Circulating and Tumor-Infiltrating T-Cells: An Overview from Multicolor Flow Cytometry to Single-Cell RNA Sequencing
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1507-2_6
PMID:34053052
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综述 | 本文综述了从多色流式细胞术到单细胞RNA测序等多种方法在衰老循环和肿瘤浸润T细胞表征中的应用 | 提出结合多色流式细胞术、基因表达阵列和单细胞RNA测序的综合分析方法，以揭示衰老CD8+ T细胞的确切分子标志，并探讨免疫衰老与人类衰老的关联 | 现有表征方法可能不足以区分真正的衰老细胞和耗竭T细胞，且衰老个体或肿瘤微环境中T细胞亚群的高度异质性增加了复杂性 | 开发针对特定T细胞亚群的治疗性调节干预措施 | 衰老的循环和肿瘤浸润T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |