单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2024-08-08 |
Integrating Spatial Transcriptomics and Single-Cell RNA-seq Reveals the Gene Expression Profling of the Human Embryonic Liver
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.652408
PMID:34095116
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，对人类胚胎肝脏在不同发育阶段的基因表达进行无偏分析 | 首次系统地识别了人类胚胎肝脏中的九种细胞类型，并定义了主要细胞类型的发育途径 | NA | 了解胚胎发育过程中肝脏的复杂发展，以促进功能性肝脏替代组织的工程化及肝脏再生 | 人类胚胎肝脏在8周至17周的发育过程中的基因表达 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类胚胎肝脏在8周至17周的发育阶段样本 |
| 482 | 2024-08-08 |
The Intestinal Epithelium - Fluid Fate and Rigid Structure From Crypt Bottom to Villus Tip
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.661931
PMID:34095127
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综述 | 本文综述了肠道上皮从隐窝底部到绒毛顶端的流体命运和刚性结构，以及其与肠道功能的相互作用 | 介绍了单细胞测序、时空分析和类器官技术在揭示肠道上皮复杂微观结构和维持机制中的新发现 | 讨论了每种方法的优势和局限性，并考虑了这些结果对健康和疾病中肠道理解的影响 | 探讨近期关于肠道上皮和基质结构的新发现，并强调导致这些发现的技术 | 肠道上皮及其基质结构 | NA | NA | 单细胞测序、时空分析、类器官技术 | NA | 细胞 | NA |
| 483 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Endothelial Plasticity During Diabetic Atherogenesis
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.689469
PMID:34095155
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了糖尿病诱导的动脉粥样硬化中内皮细胞的转录组变化 | 首次在单细胞水平上揭示了糖尿病相关动脉粥样硬化中内皮细胞的表型和代谢异质性 | NA | 探究糖尿病相关动脉粥样硬化中内皮细胞的生物学特性 | 小鼠心脏和主动脉中的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 来自小鼠心脏和主动脉的富含内皮细胞的单细胞样本 |
| 484 | 2024-08-08 |
Cell Heterogeneity Analysis in Single-Cell RNA-seq Data Using Mixture Exponential Graph and Markov Random Field Model
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/9919080
PMID:34095314
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研究论文 | 本文介绍了一种新的方案，用于检测单细胞异质性的基因型特征，并将其应用于循环肿瘤细胞（CTCs）和三阴性乳腺癌（TNBC）的单细胞RNA测序数据中 | 本文引入了混合指数族图模型和马尔可夫随机场模型，用于更灵活地重构细胞网络，并发现不同细胞亚群中的高共表达基因模块 | NA | 探索细胞异质性，特别是循环肿瘤细胞（CTCs）和三阴性乳腺癌（TNBC）的异质性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞异质性和基因网络关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 混合指数族图模型和马尔可夫随机场模型 | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 485 | 2024-08-08 |
Single Cell RNA-Seq Analysis Identifies Differentially Expressed Genes of Treg Cell in Early Treatment-Naive Rheumatoid Arthritis By Arsenic Trioxide
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.656124
PMID:34108876
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了三氧化二砷（AsO）对早期未治疗类风湿关节炎（RA）中调节性T细胞（Treg细胞）基因表达的影响 | 这是首个研究AsO对未治疗Treg细胞基因表达全基因组效应的研究，除了明显的抗炎和免疫调节作用外，AsO还影响Treg细胞中的氨基酸和葡萄糖代谢 | NA | 阐明早期类风湿关节炎中三氧化二砷对Treg细胞在发病机制中的调节作用 | 早期未治疗的类风湿关节炎中的Treg细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 从外周血单个核细胞（PBMCs）中分离并纯化的Treg细胞 |
| 486 | 2024-08-08 |
The Presence of Circulating Nucleated Red Blood Cells Is Associated With Disease Severity in Patients of Hemorrhagic Fever With Renal Syndrome
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.665410
PMID:34113638
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研究论文 | 本研究探讨了在汉坦病毒感染引起的肾综合征出血热患者中，外周血红细胞的变化及其与疾病严重程度的关系 | 首次发现肾综合征出血热患者外周血中存在有核红细胞（NRBC），并与其疾病严重程度相关；首次表明汉坦病毒感染阻碍红细胞成熟 | NA | 探索肾综合征出血热患者外周血红细胞的变化及其与疾病严重程度的关系 | 肾综合征出血热患者的外周血红细胞 | NA | 肾综合征出血热 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 肾综合征出血热患者的PBMCs |
| 487 | 2024-08-08 |
Expression of Urea Transporter B in Normal and Injured Brain
2021, Frontiers in neuroanatomy
IF:2.1Q3
DOI:10.3389/fnana.2021.591726
PMID:34122018
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研究论文 | 研究探讨了尿素转运蛋白B（UT-B）在大脑正常和损伤状态下的表达特征 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫组织化学方法，详细描述了UT-B在大脑不同细胞类型中的分布和表达变化 | 研究主要集中在UT-B的表达变化，未深入探讨其具体功能和机制 | 确定UT-B在大脑中的表达特性及其在创伤性脑损伤（TBI）后的变化 | UT-B在大脑中的表达及其在TBI后的变化 | NA | 神经疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 细胞 | 涉及多种大脑细胞类型，具体数量未详细说明 |
| 488 | 2024-08-08 |
Revealing the Immune Infiltration Landscape and Identifying Diagnostic Biomarkers for Lumbar Disc Herniation
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.666355
PMID:34122424
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析，识别了腰椎间盘突出症（LDH）中核软骨（NP）组织免疫浸润的关键基因，并探讨了其作为诊断生物标志物的潜力 | 首次通过CIBERSORT算法和WGCNA R包分析了LDH与对照组间NP组织的免疫浸润差异，并结合单细胞测序数据进行了深入分析 | NA | 揭示腰椎间盘突出症的免疫浸润景观并识别诊断生物标志物 | 腰椎间盘突出症中的核软骨组织 | 数字病理学 | 腰椎间盘突出症 | CIBERSORT算法, WGCNA R包, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 489 | 2024-08-08 |
Cell Type-Specific Differentiation Between Indica and Japonica Rice Root Tip Responses to Different Environments Based on Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.659500
PMID:34079581
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，探讨了籼稻和粳稻在不同环境下的细胞类型特异性差异表达基因 | 首次详细分析了籼稻和粳稻在不同环境下的细胞类型特异性差异表达基因，并探讨了这些基因与非生物胁迫响应的关系 | 研究主要基于已发表的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据，未进行新的实验验证 | 旨在理解籼稻和粳稻在细胞水平上的分化和环境适应性的遗传基础 | 籼稻和粳稻的根尖细胞在不同环境下的响应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及籼稻和粳稻的多个细胞类型 |
| 490 | 2024-08-08 |
The Chromatin Accessibility Landscape of Peripheral Blood Mononuclear Cells in Patients With Systemic Lupus Erythematosus at Single-Cell Resolution
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.641886
PMID:34084162
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研究论文 | 本研究旨在揭示系统性红斑狼疮（SLE）患者外周血单个核细胞（PBMCs）的染色质可及性图谱，并识别可能驱动异常免疫反应的转录因子（TFs） | 本研究首次在单细胞分辨率下分析了SLE患者PBMCs的染色质可及性图谱，并鉴定了20种TF激活模式，这些模式驱动SLE患者的异常免疫反应 | NA | 揭示SLE患者PBMCs的染色质可及性图谱，并识别可能驱动异常免疫反应的转录因子 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞数据 | NA |
| 491 | 2024-08-09 |
Methods for Characterization of Senescent Circulating and Tumor-Infiltrating T-Cells: An Overview from Multicolor Flow Cytometry to Single-Cell RNA Sequencing
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1507-2_6
PMID:34053052
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综述 | 本文综述了从多色流式细胞术到单细胞RNA测序等多种方法在衰老循环和肿瘤浸润T细胞表征中的应用 | 提出结合多色流式细胞术、基因表达阵列和单细胞RNA测序的综合分析方法，以揭示衰老CD8+ T细胞的确切分子标志，并探讨免疫衰老与人类衰老的关联 | 现有表征方法可能不足以区分真正的衰老细胞和耗竭T细胞，且衰老个体或肿瘤微环境中T细胞亚群的高度异质性增加了复杂性 | 开发针对特定T细胞亚群的治疗性调节干预措施 | 衰老的循环和肿瘤浸润T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 492 | 2024-08-09 |
A Cancer-Specific Qualitative Method for Estimating the Proportion of Tumor-Infiltrating Immune Cells
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.672031
PMID:34054849
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Tumor-infiltrating Immune Cell Proportion Estimator (TICPE)的癌症特异性定性方法，用于估计肿瘤浸润免疫细胞的比例 | TICPE方法基于基因对的相对表达顺序（REOs），对批次效应不敏感，且在估计免疫细胞比例的准确性上明显优于其他方法 | NA | 开发一种新的方法来估计特定类型癌症中肿瘤浸润免疫细胞的比例，并探讨免疫细胞浸润对免疫治疗效果和癌症预后的影响 | 结直肠癌（CRC）和黑色素瘤 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | mRNA混合物数据、免疫组织化学数据和模拟的批量RNA测序样本 | 使用了公共表达数据和模拟样本 |
| 493 | 2024-08-09 |
GPCRomics of Homeostatic and Disease-Associated Human Microglia
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.674189
PMID:34054860
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研究论文 | 本文通过分析公开的RNA测序数据，研究了人类和小鼠大脑中微胶质细胞的G蛋白偶联受体（GPCRs）表达情况 | 首次系统性地揭示了微胶质细胞中GPCRs的表达模式，并探讨了其在脑疾病中的潜在作用 | 研究主要基于公开的RNA测序数据，可能存在样本选择偏差 | 探讨GPCRs在人类微胶质细胞中的表达及其在脑生理和病理过程中的作用 | 人类和小鼠大脑中的微胶质细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类和小鼠大脑的批量和单细胞样本 |
| 494 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Human Adipose-Derived Stromal Cells Identifies a Contractile Cell Subpopulation
2021, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2021/5595172
PMID:34007285
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探索了人脂肪源性间充质细胞（hASCs）在两次细胞分裂后的异质性，并识别出一种收缩细胞亚群 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了hASCs中的收缩细胞亚群，这些细胞可能为周细胞和/或血管平滑肌细胞 | 研究仅限于两次细胞分裂后的hASCs，未涉及更深入的功能验证和临床应用 | 探索hASCs的异质性，为其临床应用提供更多理解 | 人脂肪源性间充质细胞（hASCs） | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 至少两个亚群 |
| 495 | 2024-08-09 |
Transcriptomic Profiling of Human Placenta in Gestational Diabetes Mellitus at the Single-Cell Level
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.679582
PMID:34025588
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对妊娠糖尿病患者的人类胎盘进行了全面的转录组分析，构建了细胞图谱，并识别了细胞亚型及其特异性标记基因 | 首次在单细胞水平上对妊娠糖尿病患者的人类胎盘进行转录组分析，揭示了胎盘细胞功能和细胞间相互作用 | NA | 阐明妊娠糖尿病的分子机制，并促进新的治疗方法和预防措施的开发 | 人类胎盘在妊娠糖尿病中的转录组特征 | 数字病理学 | 妊娠糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 496 | 2024-08-09 |
Pharmacological Inhibition and Genetic Knockdown of BCL9 Modulate the Cellular Landscape of Cancer-Associated Fibroblasts in the Tumor-Immune Microenvironment of Colorectal Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.603556
PMID:34026600
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研究论文 | 研究通过单细胞测序分析结直肠癌肿瘤微环境中BCL9抑制对癌症相关成纤维细胞（CAFs）的影响 | 首次揭示了BCL9抑制在CAFs中的细胞类型景观和转录差异，以及其如何通过抑制Wnt信号影响癌症相关的免疫监视 | 未详细说明BCL9抑制对CAFs的具体分子机制 | 探讨BCL9抑制对结直肠癌肿瘤微环境中CAFs的影响及其对免疫反应的作用 | 结直肠癌中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 涉及结直肠癌中的四种不同类型的CAFs |
| 497 | 2024-08-09 |
Fibroblast and Myofibroblast Subtypes: Single Cell Sequencing
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1382-5_4
PMID:34028734
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研究论文 | 本文描述了从心脏组织样本中制备单细胞悬液进行单细胞RNA测序的方法，并介绍了单细胞RNA测序和空间转录组学数据的计算分析流程，以探索纤维母细胞/肌纤维母细胞的异质性并识别其在心脏中的不同亚型和位置 | 利用新的单细胞'omics'技术，全面分析转录程序，揭示了间质细胞在转录、功能、表观遗传和空间上的异质性 | 需要进一步明确新识别的细胞簇是否代表不同的亚群或同一群体的不同状态 | 探索纤维母细胞/肌纤维母细胞的异质性并识别其在心脏中的不同亚型和位置 | 纤维母细胞和肌纤维母细胞的亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 心脏组织样本 |
| 498 | 2024-08-09 |
Inferring Cell Subtypes and LncRNA Function by a Cell-Specific CeRNA Network in Breast Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.656675
PMID:33987091
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研究论文 | 本文提出了一种基于细胞特异性ceRNA网络（CCN）的新策略，用于推断乳腺癌中的细胞亚型和长非编码RNA（lncRNA）功能 | 本文创新性地构建了细胞特异性ceRNA网络（CCN），通过整合细胞特异性RNA-RNA共表达网络（RCN）和现有的ceRNA网络，用于推断细胞亚型和lncRNA功能 | NA | 研究旨在探索乳腺癌中单细胞水平的细胞亚型和lncRNA功能 | 乳腺癌中的细胞亚型和lncRNA功能 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 表达谱 | NA |
| 499 | 2024-08-09 |
Identification of Silkworm Hemocyte Subsets and Analysis of Their Response to Baculovirus Infection Based on Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.645359
PMID:33995363
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，全面鉴定了家蚕血细胞亚群，并分析了它们对杆状病毒感染的响应 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分类了家蚕血细胞，并揭示了杆状病毒感染对血细胞类型分布的显著影响 | 研究主要集中在血细胞的分子和细胞特性分析，未涉及更广泛的生理或生态影响 | 揭示家蚕血细胞的多样性及其对杆状病毒感染的响应 | 家蚕血细胞及其对杆状病毒感染的响应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括20个细胞集群及其潜在标记基因 |
| 500 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome profiling reveals vascular endothelial cell heterogeneity in human skin
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.54917
PMID:33995668
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了人皮肤中血管内皮细胞的异质性 | 首次在单细胞水平上详细描述了皮肤中血管内皮细胞的组织特异性特征和内部异质性 | NA | 探究人皮肤中血管内皮细胞的功能角色和异质性 | 人皮肤中的血管内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 10名供体的皮肤组织 |