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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2024-08-08 |
Creation of a Single Cell RNASeq Meta-Atlas to Define Human Liver Immune Homeostasis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.679521
PMID:34335581
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研究论文 | 本研究旨在通过整合多个单细胞RNA测序数据集，创建一个人类肝脏免疫稳态的元图谱，以定义健康人肝脏中免疫细胞亚群的主要表型 | 本研究提出了一种新颖的方法，通过元分析单细胞RNA测序数据，广泛定义人类肝脏免疫稳态的特征 | 当不同研究组使用不同的数据模型、标准和处理方法生成单细胞RNA数据时，从聚合数据中得出有意义的结论可能具有挑战性 | 建立一种方法，通过分析不同研究间的异质性并使用元图谱定义免疫细胞亚群的主要表型，来整合人类肝脏的单细胞RNA测序数据集 | 人类肝脏的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA seq） | NA | 转录组数据 | 17名患者的肝脏样本，约32,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 442 | 2024-08-08 |
Computational Drug Repurposing for Alzheimer's Disease Using Risk Genes From GWAS and Single-Cell RNA Sequencing Studies
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.617537
PMID:34276354
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研究论文 | 本研究通过富集分析基于全基因组关联研究（GWAS）和单细胞转录组学研究确定的阿尔茨海默病（AD）相关风险基因的药物诱导转录谱，旨在识别潜在的抗AD药物 | 本研究结合GWAS和单细胞转录组学数据，通过路径富集分析和药物再利用工具Gene2Drug，系统地识别了针对AD的新候选药物 | 尽管本研究识别了一些潜在的AD候选药物，但这些药物仍需进一步的实验验证 | 识别针对阿尔茨海默病的新候选药物 | 阿尔茨海默病相关的风险基因和现有药物的再利用潜力 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组关联研究（GWAS），单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 972个风险基因 | NA | NA | NA | NA |
| 443 | 2024-08-08 |
IOBR: Multi-Omics Immuno-Oncology Biological Research to Decode Tumor Microenvironment and Signatures
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.687975
PMID:34276676
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研究论文 | 本文开发了一个名为IOBR的计算工具，用于免疫肿瘤生物学研究，旨在通过多组学数据全面解析肿瘤微环境和特征 | IOBR工具提供了批量分析特征及其与临床表型、长非编码RNA（lncRNA）、基因组特征和单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据生成的特征的相关性，并集成了多种现有的微环境解卷积方法和特征构建工具 | NA | 开发一个有效的工具，用于全面解释多组学数据，揭示肿瘤发生和免疫治疗敏感性的内在机制 | 多组学数据、肿瘤微环境、免疫治疗特征 | 生物信息学 | 肿瘤学 | 下一代测序（NGS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 444 | 2024-08-08 |
Capillarized Liver Sinusoidal Endothelial Cells Undergo Partial Endothelial-Mesenchymal Transition to Actively Deposit Sinusoidal ECM in Liver Fibrosis
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.671081
PMID:34277612
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、谱系追踪和共定位分析，揭示了肝窦内皮细胞在肝纤维化过程中经历部分内皮间质转化，成为类似肌成纤维细胞的细胞，并主动沉积细胞外基质。 | 首次详细描述了肝窦内皮细胞在肝纤维化中的部分内皮间质转化过程及其对细胞外基质沉积的影响。 | 研究主要基于动物模型和患者样本，尚未在更大规模的人类临床试验中验证。 | 探讨肝窦内皮细胞在肝纤维化中的作用及其机制。 | 肝窦内皮细胞及其在肝纤维化中的转化过程。 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 动物模型和肝纤维化/肝硬化患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 445 | 2024-08-08 |
Endothelial-Myocardial Angiocrine Signaling in Heart Development
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.697130
PMID:34277641
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综述 | 本文综述了血管内皮细胞在哺乳动物心脏发育中的多种亚群及其通过独特的血管分泌信号通路调控心脏发育的关键细胞和分子过程 | 近年来，通过单细胞测序技术阐明发育中心脏功能细胞类型之间的细胞间通讯得到了加速发展 | NA | 探讨血管内皮细胞在心脏发育中的作用及其通过血管分泌信号通路的调控机制 | 哺乳动物心脏中的血管内皮细胞及其亚群 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 446 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis in Melanoma Using Network Embedding
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.700036
PMID:34290746
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研究论文 | 本文提出了一种新的计算框架，利用网络嵌入技术进行黑色素瘤的单细胞转录组分析 | 首次采用网络嵌入技术（node2vec）学习细胞间相互作用网络中的细胞特征，并通过共识聚类识别细胞标记和与癌症相关的基因 | 未明确提及具体限制 | 探索黑色素瘤的分子机制 | 黑色素瘤的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序技术 | node2vec | 转录组数据 | 两个独立数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 447 | 2024-08-08 |
Characterizing the Metabolic and Immune Landscape of Non-small Cell Lung Cancer Reveals Prognostic Biomarkers Through Omics Data Integration
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.702112
PMID:34295900
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研究论文 | 本研究通过整合多层次组学数据，分析和验证了非小细胞肺癌（NSCLC）的单细胞RNA测序数据，以识别关键的代谢特征和预后生物标志物 | 本研究首次在单细胞分辨率下揭示了NSCLC的代谢特征和预后标志物，为癌症的分子生物标志物和特征提供了新的发现 | NA | 识别和验证与特定NSCLC表型相关的分子生物标志物 | 非小细胞肺癌（NSCLC）的代谢和免疫景观 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | t-SNE聚类算法 | 基因表达数据 | 4887个细胞的基因表达谱 | NA | NA | NA | NA |
| 448 | 2024-08-08 |
Single-Cardiomyocyte RNA Sequencing to Dissect the Molecular Pathophysiology of the Heart
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1484-6_18
PMID:34302659
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研究论文 | 本文介绍了从分离到分析的成年小鼠心肌细胞单细胞RNA测序流程 | 建立了适用于心肌细胞的单细胞分析流程 | 心肌细胞相对较大、易受压力影响，难以用于单细胞分析 | 深入理解心力衰竭的发病机制 | 心肌细胞的形态学、生理学和分子特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 文本 | 成年小鼠心肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 449 | 2024-08-08 |
Epigenetics in the Pathogenesis and Treatment of Cutaneous T-Cell Lymphoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.663961
PMID:34249700
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综述 | 本文综述了表观遗传学在皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）的发病机制和治疗中的最新发现 | 揭示了CTCL恶性T细胞的异质性，并描述了HDACi耐药机制，促进了新HDACi靶点的发现 | CTCL疾病的异质性和发病机制仍不明确 | 探讨表观遗传学在CTCL病理作用和治疗中的具体作用 | 皮肤T细胞淋巴瘤及其表观遗传学机制 | NA | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 组织和外周血 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 450 | 2024-08-08 |
Identification of Gene Regulatory Networks from Single-Cell Expression Data
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1534-8_9
PMID:34251624
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研究论文 | 本文描述了一种多步骤计算流程，用于整合单细胞RNA测序数据与DAP-seq和ATAC-seq数据，以预测基因调控网络和关键调控基因 | 利用机器学习方法包括特征选择和稳定性选择来识别候选调控基因，并生成基因调控网络 | NA | 预测植物中的基因调控网络和关键调控基因 | 单细胞RNA测序数据、DAP-seq和ATAC-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、DAP-seq、ATAC-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 451 | 2024-08-08 |
Inference of Gene Regulatory Network from Single-Cell Transcriptomic Data Using pySCENIC
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1534-8_10
PMID:34251625
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研究论文 | 本文介绍了基于单细胞转录组数据推断基因调控网络的快速Python实现方法pySCENIC | 提出了pySCENIC这一快速且高效的基因调控网络推断工具，集成了GRNBoost2和GENIE3两种算法 | NA | 旨在利用单细胞RNA测序数据推断细胞特异性的基因调控网络 | 单细胞转录组数据中的基因及其调控因子——转录因子 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 452 | 2024-08-08 |
Single Cell Gene Transcriptome Analysis of Ovarian Mature Teratomas
2021, Pathology oncology research : POR
DOI:10.3389/pore.2021.604228
PMID:34257564
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了卵巢成熟畸胎瘤的基因转录组 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究卵巢成熟畸胎瘤的基因表达谱 | 研究样本数量较少，仅分析了两个卵巢成熟畸胎瘤样本 | 探讨卵巢成熟畸胎瘤组织与正常组织在基因表达上的相似性或差异性 | 卵巢成熟畸胎瘤的基因转录组 | 数字病理学 | 卵巢肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因转录组数据 | 两个卵巢成熟畸胎瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 453 | 2024-08-08 |
Complement C7 is Specifically Expressed in Mesangial Cells and is a Potential Diagnostic Biomarker for Diabetic Nephropathy and is Regulated by miR-494-3p and miR-574-5p
2021, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S311725
PMID:34262312
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析和验证，探索糖尿病肾病的关键调控通路和潜在生物标志物 | 首次揭示C7在系膜细胞中特异性表达，是糖尿病肾病的潜在诊断生物标志物，并受miR-494-3p和miR-574-5p调控 | NA | 探索糖尿病肾病的关键调控通路和潜在生物标志物 | 糖尿病肾病的关键调控通路和潜在生物标志物 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），基因本体（GO）注释，基因集富集分析（GSEA），京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用GSE30528和GSE96804数据集的微阵列数据 | NA | NA | NA | NA |
| 454 | 2024-08-08 |
Visualization and Analysis of Gene Expression in Stanford Type A Aortic Dissection Tissue Section by Spatial Transcriptomics
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.698124
PMID:34262602
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研究论文 | 本文通过空间转录组学技术，对斯坦福A型主动脉夹层组织切片中的基因表达进行了可视化和分析 | 开发了一种针对低细胞和高纤维斯坦福A型主动脉夹层的分子方法，并初步探索和可视化了升主动脉类型的异质性及细胞类型特异性基因表达 | NA | 旨在通过空间转录组学技术深入理解斯坦福A型主动脉夹层的病理发生和异质性 | 斯坦福A型主动脉夹层患者的主动脉样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 15名斯坦福A型主动脉夹层患者和1例升主动脉样本 | NA | NA | NA | NA |
| 455 | 2024-08-08 |
Specific Transcriptomic Signatures and Dual Regulation of Steroidogenesis Between Fetal and Adult Mouse Leydig Cells
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.695546
PMID:34262907
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研究论文 | 本研究通过bulk RNA测序和单细胞RNA测序，比较了胎鼠和成年鼠莱迪细胞的转录组特征，揭示了两者在类固醇生成方面的双重调控机制 | 首次揭示了胎鼠和成年鼠莱迪细胞在类固醇生成方面的双重调控机制，并识别了特定的基因表达模式 | NA | 研究胎鼠和成年鼠莱迪细胞的转录组特征及其在类固醇生成方面的调控机制 | 胎鼠和成年鼠莱迪细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 456 | 2024-08-08 |
Aneuploidy: An Opportunity Within Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2021, Biocell : official journal of the Sociedades Latinoamericanas de Microscopia Electronica ... et. al
IF:0.8Q4
PMID:34267416
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析中染色体非整倍体（aneuploidy）的生物信息学应用 | 提出在scRNA-seq数据分析中利用生物信息学管道推断染色体非整倍体，特别是在肿瘤学领域 | NA | 提高各领域对所研究疾病理解的能力 | 单细胞RNA测序数据中的染色体非整倍体 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因计数表 | 数百个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 457 | 2024-08-08 |
Decreased MEF2A Expression Regulated by Its Enhancer Methylation Inhibits Autophagy and May Play an Important Role in the Progression of Alzheimer's Disease
2021, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2021.682247
PMID:34220439
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法分析多种微阵列和测序数据集，旨在识别与阿尔茨海默病（AD）发病机制相关的自噬相关基因，并探讨其在AD发病中的作用，以发现预防和治疗AD的新策略。 | 研究首次揭示了MEF2A增强子甲基化水平升高与AD发病机制中自噬抑制的关联，为AD的预防和治疗提供了新的分子靶点。 | 研究主要依赖于生物信息学分析和微阵列数据，可能需要进一步的实验验证以确认结果的可靠性。 | 识别与阿尔茨海默病发病机制相关的自噬相关基因，并探讨其在疾病进展中的作用。 | 阿尔茨海默病（AD）及其相关的自噬过程。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 微阵列分析，单细胞测序 | NA | 基因表达数据，甲基化数据 | 多种微阵列和测序数据集，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 458 | 2024-08-08 |
9-Gene Signature Correlated With CD8+ T Cell Infiltration Activated by IFN-γ: A Biomarker of Immune Checkpoint Therapy Response in Melanoma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.622563
PMID:34220795
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研究论文 | 本研究旨在识别与黑色素瘤中CD8+ T细胞浸润相关的因子及其共表达网络，并阐明黑色素瘤肿瘤微环境中CD8+ T细胞相关基因的相互作用 | 本研究首次识别了与CD8+ T细胞浸润相关的九基因标志物，并证实其在免疫检查点抑制剂治疗反应中的重要预测意义 | NA | 识别与CD8+ T细胞浸润相关的基因标志物，并探讨其在黑色素瘤免疫治疗反应中的作用 | 黑色素瘤及其癌旁组织的mRNA表达矩阵，以及CD8+ T细胞的比例和肿瘤微环境纯度 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | CIBERSORT算法，加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞测序，免疫组化 | NA | mRNA表达数据 | 来自TCGA-SKCM和GSE65904的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 459 | 2024-08-08 |
Visual Genomics Analysis Studio as a Tool to Analyze Multiomic Data
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.642012
PMID:34220932
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review | 本文介绍了Visual Genomics Analysis Studio（VGAS）这一先进的多组学单细胞数据分析和可视化工具，旨在帮助研究人员无需高级生物信息学知识即可分析复杂的免疫细胞数据 | VGAS提供了一个用户友好的界面，无需用户编写代码或访问高性能计算机，通过内置的优化代码提供快速直观的分析工具 | NA | 介绍和评估VGAS在多组学单细胞数据分析中的应用 | 多组学单细胞数据，特别是TCR-RNA-CITE-seq数据 | genomics | NA | single-cell sequencing | NA | single-cell data | NA | NA | NA | NA | NA |
| 460 | 2024-08-08 |
No evidence that plasmablasts transdifferentiate into developing neutrophils in severe COVID-19 disease
2021, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.1308
PMID:34221402
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研究论文 | 本文探讨了在严重COVID-19疾病中，浆母细胞是否能转化为'发育中的中性粒细胞'的问题 | 本文通过重新分析原始数据和代码，揭示了浆母细胞与发育中的中性粒细胞之间的谱系关系在未回归关键特征时会崩溃 | 在生物信息学分析和数据解释时应谨慎，并应通过正交技术交叉验证 | 验证浆母细胞在严重COVID-19疾病中是否能转化为发育中的中性粒细胞 | 浆母细胞和发育中的中性粒细胞 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |