单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics-Based Study of Transcriptional Regulatory Features in the Mouse Brain Vasculature
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/7643209
PMID:34337051
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研究论文 | 本研究基于单细胞转录组数据构建了小鼠脑血管细胞的转录调控网络 | 利用改进的SCENIC方法构建基因调控网络，并通过单细胞RNA测序数据分析小鼠脑血管细胞的异质性 | NA | 研究小鼠脑部血管健康与功能的关系，并探索脑血管细胞的发育过程 | 小鼠脑部血管细胞的转录调控特征 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | SCENIC方法 | 转录组数据 | 小鼠脑部血管细胞的单细胞RNA测序数据集 |
| 422 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Ovarian Cancer: Promises and Challenges
2021, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-030-73359-9_7
PMID:34339033
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review | 本文综述了单细胞RNA测序技术在卵巢癌研究中的进展、方法、数据分析及其潜在应用 | 利用单细胞RNA测序技术来表征罕见亚群的基因表达，可能为卵巢癌识别新的治疗靶点和途径 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在卵巢癌中的应用潜力 | 卵巢癌中的癌细胞、免疫细胞和基质细胞亚群 | digital pathology | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 423 | 2024-08-08 |
Mapping Angiopoietin1 Expression in the Developing and Adult Brain
2021, Developmental neuroscience
IF:2.3Q3
DOI:10.1159/000518351
PMID:34348288
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研究论文 | 本文通过使用Angpt1-GFP敲入报告小鼠和多个单细胞RNA测序数据集的系统分析，描绘了Angiopoietin1（Angpt1）在发育中和成年大脑中的表达模式 | 首次详细描述了Angpt1在发育中和成年大脑中的细胞类型特异性表达模式 | NA | 阐明Angpt1在发育中和成年大脑中的细胞类型特异性表达，并为未来研究其在脑发育、稳态和病理条件中的功能提供指导 | Angiopoietin1在发育中和成年大脑中的表达 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Angpt1-GFP敲入报告小鼠 |
| 424 | 2024-08-08 |
New Insights From Single-Cell Sequencing Data: Synovial Fibroblasts and Synovial Macrophages in Rheumatoid Arthritis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.709178
PMID:34349767
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞和滑膜巨噬细胞的转录组表达水平 | 通过scRNA-seq技术揭示了滑膜细胞的异质性，并为类风湿性关节炎的治疗提供了新的治疗靶点 | NA | 研究类风湿性关节炎中滑膜细胞的异质性及其在疾病发展中的作用 | 滑膜成纤维细胞和滑膜巨噬细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 425 | 2024-08-08 |
Camk2a-Cre and Tshz3 Expression in Mouse Striatal Cholinergic Interneurons: Implications for Autism Spectrum Disorder
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.683959
PMID:34349780
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研究论文 | 本文研究了Camk2a-Cre和Tshz3在老鼠纹状体胆碱能中间神经元中的表达，及其对自闭症谱系障碍的影响 | 首次展示了Camk2a-Cre表达细胞主要是纹状体胆碱能中间神经元，并且所有这些神经元都表达Tshz3 | NA | 探讨Camk2a-Cre和Tshz3在纹状体胆碱能中间神经元中的功能及其对自闭症谱系障碍的影响 | 老鼠纹状体胆碱能中间神经元中的Camk2a-Cre和Tshz3表达 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 成年老鼠纹状体中的多个基因 |
| 426 | 2024-08-08 |
Striatal Control of Movement: A Role for New Neuronal (Sub-) Populations?
2021, Frontiers in human neuroscience
IF:2.4Q2
DOI:10.3389/fnhum.2021.697284
PMID:34354577
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序研究纹状体神经元转录组特征的最新进展，揭示了纹状体神经元的细胞复杂性和其在运动控制中的作用 | 发现纹状体投射神经元具有指示其解剖位置和分区的转录特征，并揭示了额外的独特神经元群体和先前未知的纹状体投射神经元亚群 | NA | 探讨纹状体在运动控制中的作用及其在运动障碍中的功能障碍 | 纹状体神经元及其在运动控制中的作用 | 神经科学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 427 | 2024-08-08 |
A Single-Cell Atlas of Lymphocyte Adaptive Immune Repertoires and Transcriptomes Reveals Age-Related Differences in Convalescent COVID-19 Patients
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.701085
PMID:34322127
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术分析了康复期COVID-19患者不同年龄组的淋巴细胞适应性免疫库和转录组 | 首次详细描述了不同年龄康复期COVID-19患者T细胞和B细胞的免疫受体库和转录组的组成差异 | NA | 研究康复期COVID-19患者适应性免疫反应的年龄相关差异 | 康复期COVID-19患者的T细胞和B细胞免疫库及转录组 | NA | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 多个康复期COVID-19患者样本，包括年轻组（平均年龄31岁）和老年组（平均年龄66.8岁） |
| 428 | 2024-08-08 |
Exploiting Single-Cell Tools in Gene and Cell Therapy
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.702636
PMID:34322133
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综述 | 本文综述了单细胞分子工具的最新进展及其在基因和细胞治疗中的应用 | 介绍了单细胞多组学与单细胞功能输出和/或物理位置的整合，以及CRISPR技术在细胞调控中的新应用 | NA | 探讨单细胞分子筛选和单细胞多组学在临床应用中的发展，以及其在细胞和基因治疗中的潜在应用 | 单细胞分子工具、单细胞多组学、空间转录组学和蛋白质组学 | 基因和细胞治疗 | NA | 单细胞测序、CRISPR技术、空间转录组学和蛋白质组学 | NA | 基因组、转录组、表观基因组和蛋白质组数据 | NA |
| 429 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing to Identify Six Heat Shock Protein (HSP) Genes-Mediated Progression Subtypes of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2021, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S318271
PMID:34326662
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序数据，通过Cytoscape软件识别了与透明细胞肾细胞癌（ccRCC）进展相关的六个热休克蛋白（HSP）基因，并基于这些基因的表达对TCGA患者进行了亚型分类。 | 首次基于六个HSP基因揭示了ccRCC的两个分子亚型，并发现了这两个亚型在临床预后、免疫浸润和药物敏感性方面的显著差异。 | NA | 揭示透明细胞肾细胞癌基于热休克蛋白基因的分子亚型及其临床和免疫学特征。 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）及其分子亚型。 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus（GEO）数据仓库的ccRCC单细胞测序数据集，以及The Cancer Genome Atlas（TCGA）的患者数据。 |
| 430 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneous progression and EGFR activation in pancreatic adenosquamous carcinoma
2021, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.58886
PMID:34326696
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胰腺腺鳞癌的异质性进展和EGFR激活 | 首次揭示了胰腺腺鳞癌中细胞亚群的异质性，并定义了癌症相关信号通路和细胞间相互作用 | NA | 探究胰腺腺鳞癌的异质性及其分子机制 | 胰腺腺鳞癌的细胞亚群及其分子特征 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9,887个单细胞 |
| 431 | 2024-08-08 |
Single Cell Transcriptomics of Ependymal Cells Across Age, Region and Species Reveals Cilia-Related and Metal Ion Regulatory Roles as Major Conserved Ependymal Cell Functions
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.703951
PMID:34335193
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，探讨了不同年龄、区域和物种中室管膜细胞的基因特征及其保守功能 | 发现室管膜细胞在金属离子稳态中的未被充分研究的角色，并揭示了其在神经系统不同区域和年龄段的基因表达差异 | NA | 揭示室管膜细胞在不同条件下的基因表达特征及其保守功能 | 室管膜细胞 | 数字病理学 | 发育障碍, 癌症, 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自公开数据库的多个样本 |
| 432 | 2024-08-08 |
Creation of a Single Cell RNASeq Meta-Atlas to Define Human Liver Immune Homeostasis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.679521
PMID:34335581
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研究论文 | 本研究旨在通过整合多个单细胞RNA测序数据集，创建一个人类肝脏免疫稳态的元图谱，以定义健康人肝脏中免疫细胞亚群的主要表型 | 本研究提出了一种新颖的方法，通过元分析单细胞RNA测序数据，广泛定义人类肝脏免疫稳态的特征 | 当不同研究组使用不同的数据模型、标准和处理方法生成单细胞RNA数据时，从聚合数据中得出有意义的结论可能具有挑战性 | 建立一种方法，通过分析不同研究间的异质性并使用元图谱定义免疫细胞亚群的主要表型，来整合人类肝脏的单细胞RNA测序数据集 | 人类肝脏的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA seq） | NA | 转录组数据 | 17名患者的肝脏样本，约32,000个细胞 |
| 433 | 2024-08-08 |
Computational Drug Repurposing for Alzheimer's Disease Using Risk Genes From GWAS and Single-Cell RNA Sequencing Studies
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.617537
PMID:34276354
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研究论文 | 本研究通过富集分析基于全基因组关联研究（GWAS）和单细胞转录组学研究确定的阿尔茨海默病（AD）相关风险基因的药物诱导转录谱，旨在识别潜在的抗AD药物 | 本研究结合GWAS和单细胞转录组学数据，通过路径富集分析和药物再利用工具Gene2Drug，系统地识别了针对AD的新候选药物 | 尽管本研究识别了一些潜在的AD候选药物，但这些药物仍需进一步的实验验证 | 识别针对阿尔茨海默病的新候选药物 | 阿尔茨海默病相关的风险基因和现有药物的再利用潜力 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组关联研究（GWAS），单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 972个风险基因 |
| 434 | 2024-08-08 |
IOBR: Multi-Omics Immuno-Oncology Biological Research to Decode Tumor Microenvironment and Signatures
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.687975
PMID:34276676
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研究论文 | 本文开发了一个名为IOBR的计算工具，用于免疫肿瘤生物学研究，旨在通过多组学数据全面解析肿瘤微环境和特征 | IOBR工具提供了批量分析特征及其与临床表型、长非编码RNA（lncRNA）、基因组特征和单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据生成的特征的相关性，并集成了多种现有的微环境解卷积方法和特征构建工具 | NA | 开发一个有效的工具，用于全面解释多组学数据，揭示肿瘤发生和免疫治疗敏感性的内在机制 | 多组学数据、肿瘤微环境、免疫治疗特征 | 生物信息学 | 肿瘤学 | 下一代测序（NGS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 多组学数据 | NA |
| 435 | 2024-08-08 |
Capillarized Liver Sinusoidal Endothelial Cells Undergo Partial Endothelial-Mesenchymal Transition to Actively Deposit Sinusoidal ECM in Liver Fibrosis
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.671081
PMID:34277612
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、谱系追踪和共定位分析，揭示了肝窦内皮细胞在肝纤维化过程中经历部分内皮间质转化，成为类似肌成纤维细胞的细胞，并主动沉积细胞外基质。 | 首次详细描述了肝窦内皮细胞在肝纤维化中的部分内皮间质转化过程及其对细胞外基质沉积的影响。 | 研究主要基于动物模型和患者样本，尚未在更大规模的人类临床试验中验证。 | 探讨肝窦内皮细胞在肝纤维化中的作用及其机制。 | 肝窦内皮细胞及其在肝纤维化中的转化过程。 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 动物模型和肝纤维化/肝硬化患者样本 |
| 436 | 2024-08-08 |
Endothelial-Myocardial Angiocrine Signaling in Heart Development
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.697130
PMID:34277641
|
综述 | 本文综述了血管内皮细胞在哺乳动物心脏发育中的多种亚群及其通过独特的血管分泌信号通路调控心脏发育的关键细胞和分子过程 | 近年来，通过单细胞测序技术阐明发育中心脏功能细胞类型之间的细胞间通讯得到了加速发展 | NA | 探讨血管内皮细胞在心脏发育中的作用及其通过血管分泌信号通路的调控机制 | 哺乳动物心脏中的血管内皮细胞及其亚群 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 437 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis in Melanoma Using Network Embedding
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.700036
PMID:34290746
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研究论文 | 本文提出了一种新的计算框架，利用网络嵌入技术进行黑色素瘤的单细胞转录组分析 | 首次采用网络嵌入技术（node2vec）学习细胞间相互作用网络中的细胞特征，并通过共识聚类识别细胞标记和与癌症相关的基因 | 未明确提及具体限制 | 探索黑色素瘤的分子机制 | 黑色素瘤的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序技术 | node2vec | 转录组数据 | 两个独立数据集 |
| 438 | 2024-08-08 |
Characterizing the Metabolic and Immune Landscape of Non-small Cell Lung Cancer Reveals Prognostic Biomarkers Through Omics Data Integration
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.702112
PMID:34295900
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研究论文 | 本研究通过整合多层次组学数据，分析和验证了非小细胞肺癌（NSCLC）的单细胞RNA测序数据，以识别关键的代谢特征和预后生物标志物 | 本研究首次在单细胞分辨率下揭示了NSCLC的代谢特征和预后标志物，为癌症的分子生物标志物和特征提供了新的发现 | NA | 识别和验证与特定NSCLC表型相关的分子生物标志物 | 非小细胞肺癌（NSCLC）的代谢和免疫景观 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | t-SNE聚类算法 | 基因表达数据 | 4887个细胞的基因表达谱 |
| 439 | 2024-08-08 |
Single-Cardiomyocyte RNA Sequencing to Dissect the Molecular Pathophysiology of the Heart
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1484-6_18
PMID:34302659
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研究论文 | 本文介绍了从分离到分析的成年小鼠心肌细胞单细胞RNA测序流程 | 建立了适用于心肌细胞的单细胞分析流程 | 心肌细胞相对较大、易受压力影响，难以用于单细胞分析 | 深入理解心力衰竭的发病机制 | 心肌细胞的形态学、生理学和分子特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 文本 | 成年小鼠心肌细胞 |
| 440 | 2024-08-08 |
Epigenetics in the Pathogenesis and Treatment of Cutaneous T-Cell Lymphoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.663961
PMID:34249700
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综述 | 本文综述了表观遗传学在皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）的发病机制和治疗中的最新发现 | 揭示了CTCL恶性T细胞的异质性，并描述了HDACi耐药机制，促进了新HDACi靶点的发现 | CTCL疾病的异质性和发病机制仍不明确 | 探讨表观遗传学在CTCL病理作用和治疗中的具体作用 | 皮肤T细胞淋巴瘤及其表观遗传学机制 | NA | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 组织和外周血 | NA |