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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-08-08 |
Microglia-Specific Expression of HEXA and HEXB Leads to Poor Prognosis in Glioblastoma Patients
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.685893
PMID:34422641
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研究论文 | 本研究探讨了HEXA和HEXB基因在胶质母细胞瘤中的表达及其对患者预后的影响 | 首次揭示了HEXA和HEXB在胶质母细胞瘤患者中的微胶质细胞特异性表达及其对肿瘤进展的作用 | NA | 研究HEXA和HEXB基因在胶质母细胞瘤中的表达及其对患者预后的影响 | 胶质母细胞瘤患者的HEXA和HEXB基因表达 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA和蛋白质 | 胶质母细胞瘤患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 422 | 2024-08-08 |
HiPS-Endothelial Cells Acquire Cardiac Endothelial Phenotype in Co-culture With hiPS-Cardiomyocytes
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.715093
PMID:34422835
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research paper | 研究了人诱导多能干细胞(hiPSC)衍生的心肌细胞(hiPS-CMs)和内皮细胞(hiPS-ECs)在单培养和共培养条件下的相互作用 | 首次在人类内皮细胞中展示了EC-CM相互作用的重要性,并通过单细胞RNA测序揭示了共培养条件下基因表达的变化 | NA | 阐明心脏内皮细胞和心肌细胞的器官型发育及细胞间对话 | 人诱导多能干细胞衍生的心肌细胞和内皮细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 423 | 2024-08-08 |
DeepHistoClass: A Novel Strategy for Confident Classification of Immunohistochemistry Images Using Deep Learning
2021, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2021.100140
PMID:34425263
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepHistoClass的新策略,用于使用深度学习对免疫组织化学图像进行可信分类 | 开发了一种多标签分类框架,结合了深度学习模型与新的不确定性度量DeepHistoClass(DHC)置信分数,显著提高了诊断性能 | NA | 提出一种可靠且全面的框架,用于免疫组织化学图像的自动化注释 | 7848张复杂的人类睾丸免疫组织化学图像,对应2794种独特蛋白质 | 数字病理学 | NA | 免疫组织化学 | 混合贝叶斯神经网络 | 图像 | 7848张图像,对应2794种独特蛋白质 | NA | NA | NA | NA |
| 424 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Elucidates the Structure and Organization of Microbial Communities
2021, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2021.713128
PMID:34367118
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在揭示微生物群落结构和组织中的应用 | 介绍了针对细菌特性的scRNA-seq新技术,克服了细菌细胞壁、mRNA半衰期短和低拷贝数等技术难题 | 目前scRNA-seq技术主要应用于真核细胞,对细菌的应用存在挑战 | 旨在更好地理解细胞群体异质性,特别是在工业发酵和传染病中的影响 | 研究对象包括细菌细胞的形态特征、生化性质和基因表达谱的异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 425 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Complexity of the Tumor Microenvironment of Treatment-Naive Osteosarcoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.709210
PMID:34367994
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了未经治疗的骨肉瘤肿瘤微环境的复杂性 | 首次揭示了骨肉瘤中单细胞转录图谱,并识别了与生存预后相关的关键转录因子 | 研究样本仅来自六名患者,可能影响结果的普遍性 | 深入理解骨肉瘤的复杂肿瘤微环境,以开发更精确的治疗方法 | 骨肉瘤患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 29,278个细胞,来自六名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 426 | 2024-08-08 |
Evidence for AJUBA-catenin-CDH4-linked differentiation resistance of mesenchymal stem cells implies tumorigenesis and progression of head and neck squamous cell carcinoma: a single-cell transcriptome approach
2021, Blood and genomics
DOI:10.46701/BG.2021012021106
PMID:34368804
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了间充质干细胞(MSCs)在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)发生和发展中的分子机制 | 首次揭示了AJUBA、β-catenin和CDH4在分化抵抗的MSCs中的上调表达,及其在HNSCC发展中的作用 | 研究仅限于细胞模型和临床队列的初步分析,需要进一步的体内实验验证 | 阐明MSCs在HNSCC中的分子机制,探索基于MSCs的治疗策略 | 间充质干细胞(MSCs)及其在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的作用 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 1780个差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 427 | 2024-08-08 |
PD-L2 based immune signature confers poor prognosis in HNSCC
2021, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2021.1947569
PMID:34377590
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研究论文 | 本文研究了PD-L2在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达及其作为预后生物标志物的潜力 | 首次揭示了PD-L2作为独立预测因子对HNSCC患者总体生存率的影响,并提出了基于PD-L2的免疫特征作为抗PD-1治疗的有效生物标志物 | NA | 探讨PD-L2在HNSCC中的表达及其作为预后生物标志物的可能性 | HNSCC患者的PD-L2表达及其对生存率的影响 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 生存树分析 | RNA | 62.7%的肿瘤样本和61.4%的PD-L1阴性患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 428 | 2024-08-08 |
Retention of Prey Genetic Material by the Kleptoplastidic Ciliate Strombidium cf. basimorphum
2021, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2021.694508
PMID:34394035
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研究论文 | 研究 Kleptoplastidic Ciliate Strombidium cf. basimorphum 是否保留捕食猎物的遗传物质 | 首次证明某些物种中捕获的叶绿体功能与猎物核的同时保留有关,并揭示了猎物核、核形态和核糖体的遗传物质在纤毛虫内可检测到至少5天 | NA | 探讨纤毛虫中猎物遗传物质的潜在保留 | Kleptoplastidic Ciliate Strombidium cf. basimorphum 及其捕食的隐藻 | NA | NA | 分子标记、单细胞转录组学 | NA | 遗传物质、转录本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 429 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling of MAIT Cells in Patients With COVID-19
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.700152
PMID:34394094
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了COVID-19患者和健康捐赠者外周MAIT细胞的转录组特征 | 首次探索了COVID-19患者中MAIT细胞的单细胞转录组特征,并揭示了其在SARS-CoV-2感染中的免疫作用 | 研究样本量较小,仅包括13名COVID-19患者和5名健康捐赠者 | 探究MAIT细胞在COVID-19患者中的免疫反应和转录组特征 | COVID-19患者和健康捐赠者的外周MAIT细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13名COVID-19患者和5名健康捐赠者 | NA | NA | NA | NA |
| 430 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Retina:New Looks for Gene Marker and Old Diseases
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.699906
PMID:34395530
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review | 本文系统回顾了单细胞RNA测序技术的发展历程,并总结了该技术发现的新型视网膜细胞亚型及一些特定基因标记,同时讨论了其在视网膜相关疾病诊断方面的进展。 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了视网膜的新细胞亚型和特定基因标记,有助于深入理解疾病的发生和发展。 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在揭示视网膜复杂性和相关疾病诊断中的应用。 | 视网膜细胞及其相关疾病。 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序(sRNA-seq) | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 431 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics-Based Study of Transcriptional Regulatory Features in the Mouse Brain Vasculature
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/7643209
PMID:34337051
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研究论文 | 本研究基于单细胞转录组数据构建了小鼠脑血管细胞的转录调控网络 | 利用改进的SCENIC方法构建基因调控网络,并通过单细胞RNA测序数据分析小鼠脑血管细胞的异质性 | NA | 研究小鼠脑部血管健康与功能的关系,并探索脑血管细胞的发育过程 | 小鼠脑部血管细胞的转录调控特征 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | SCENIC方法 | 转录组数据 | 小鼠脑部血管细胞的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 432 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Ovarian Cancer: Promises and Challenges
2021, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-030-73359-9_7
PMID:34339033
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review | 本文综述了单细胞RNA测序技术在卵巢癌研究中的进展、方法、数据分析及其潜在应用 | 利用单细胞RNA测序技术来表征罕见亚群的基因表达,可能为卵巢癌识别新的治疗靶点和途径 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在卵巢癌中的应用潜力 | 卵巢癌中的癌细胞、免疫细胞和基质细胞亚群 | digital pathology | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 433 | 2024-08-08 |
Mapping Angiopoietin1 Expression in the Developing and Adult Brain
2021, Developmental neuroscience
IF:2.3Q3
DOI:10.1159/000518351
PMID:34348288
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研究论文 | 本文通过使用Angpt1-GFP敲入报告小鼠和多个单细胞RNA测序数据集的系统分析,描绘了Angiopoietin1(Angpt1)在发育中和成年大脑中的表达模式 | 首次详细描述了Angpt1在发育中和成年大脑中的细胞类型特异性表达模式 | NA | 阐明Angpt1在发育中和成年大脑中的细胞类型特异性表达,并为未来研究其在脑发育、稳态和病理条件中的功能提供指导 | Angiopoietin1在发育中和成年大脑中的表达 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Angpt1-GFP敲入报告小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 434 | 2024-08-08 |
New Insights From Single-Cell Sequencing Data: Synovial Fibroblasts and Synovial Macrophages in Rheumatoid Arthritis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.709178
PMID:34349767
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞和滑膜巨噬细胞的转录组表达水平 | 通过scRNA-seq技术揭示了滑膜细胞的异质性,并为类风湿性关节炎的治疗提供了新的治疗靶点 | NA | 研究类风湿性关节炎中滑膜细胞的异质性及其在疾病发展中的作用 | 滑膜成纤维细胞和滑膜巨噬细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 435 | 2024-08-08 |
Camk2a-Cre and Tshz3 Expression in Mouse Striatal Cholinergic Interneurons: Implications for Autism Spectrum Disorder
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.683959
PMID:34349780
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研究论文 | 本文研究了Camk2a-Cre和Tshz3在老鼠纹状体胆碱能中间神经元中的表达,及其对自闭症谱系障碍的影响 | 首次展示了Camk2a-Cre表达细胞主要是纹状体胆碱能中间神经元,并且所有这些神经元都表达Tshz3 | NA | 探讨Camk2a-Cre和Tshz3在纹状体胆碱能中间神经元中的功能及其对自闭症谱系障碍的影响 | 老鼠纹状体胆碱能中间神经元中的Camk2a-Cre和Tshz3表达 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 成年老鼠纹状体中的多个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 436 | 2024-08-08 |
Striatal Control of Movement: A Role for New Neuronal (Sub-) Populations?
2021, Frontiers in human neuroscience
IF:2.4Q2
DOI:10.3389/fnhum.2021.697284
PMID:34354577
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序研究纹状体神经元转录组特征的最新进展,揭示了纹状体神经元的细胞复杂性和其在运动控制中的作用 | 发现纹状体投射神经元具有指示其解剖位置和分区的转录特征,并揭示了额外的独特神经元群体和先前未知的纹状体投射神经元亚群 | NA | 探讨纹状体在运动控制中的作用及其在运动障碍中的功能障碍 | 纹状体神经元及其在运动控制中的作用 | 神经科学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 437 | 2024-08-08 |
A Single-Cell Atlas of Lymphocyte Adaptive Immune Repertoires and Transcriptomes Reveals Age-Related Differences in Convalescent COVID-19 Patients
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.701085
PMID:34322127
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术分析了康复期COVID-19患者不同年龄组的淋巴细胞适应性免疫库和转录组 | 首次详细描述了不同年龄康复期COVID-19患者T细胞和B细胞的免疫受体库和转录组的组成差异 | NA | 研究康复期COVID-19患者适应性免疫反应的年龄相关差异 | 康复期COVID-19患者的T细胞和B细胞免疫库及转录组 | NA | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 多个康复期COVID-19患者样本,包括年轻组(平均年龄31岁)和老年组(平均年龄66.8岁) | NA | NA | NA | NA |
| 438 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing to Identify Six Heat Shock Protein (HSP) Genes-Mediated Progression Subtypes of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2021, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S318271
PMID:34326662
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序数据,通过Cytoscape软件识别了与透明细胞肾细胞癌(ccRCC)进展相关的六个热休克蛋白(HSP)基因,并基于这些基因的表达对TCGA患者进行了亚型分类。 | 首次基于六个HSP基因揭示了ccRCC的两个分子亚型,并发现了这两个亚型在临床预后、免疫浸润和药物敏感性方面的显著差异。 | NA | 揭示透明细胞肾细胞癌基于热休克蛋白基因的分子亚型及其临床和免疫学特征。 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)及其分子亚型。 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus(GEO)数据仓库的ccRCC单细胞测序数据集,以及The Cancer Genome Atlas(TCGA)的患者数据。 | NA | NA | NA | NA |
| 439 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneous progression and EGFR activation in pancreatic adenosquamous carcinoma
2021, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.58886
PMID:34326696
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胰腺腺鳞癌的异质性进展和EGFR激活 | 首次揭示了胰腺腺鳞癌中细胞亚群的异质性,并定义了癌症相关信号通路和细胞间相互作用 | NA | 探究胰腺腺鳞癌的异质性及其分子机制 | 胰腺腺鳞癌的细胞亚群及其分子特征 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9,887个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 440 | 2024-08-08 |
Single Cell Transcriptomics of Ependymal Cells Across Age, Region and Species Reveals Cilia-Related and Metal Ion Regulatory Roles as Major Conserved Ependymal Cell Functions
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.703951
PMID:34335193
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据,探讨了不同年龄、区域和物种中室管膜细胞的基因特征及其保守功能 | 发现室管膜细胞在金属离子稳态中的未被充分研究的角色,并揭示了其在神经系统不同区域和年龄段的基因表达差异 | NA | 揭示室管膜细胞在不同条件下的基因表达特征及其保守功能 | 室管膜细胞 | 数字病理学 | 发育障碍, 癌症, 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自公开数据库的多个样本 | NA | NA | NA | NA |