单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-08 |
The Application of Single-Cell RNA Sequencing in Mammalian Meiosis Studies
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.673642
PMID:34485276
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在哺乳动物减数分裂研究中的应用 | scRNA-seq技术能够更有效地检测转录变异，特别是识别具有细微差异的细胞类型和阶段 | scRNA-seq技术存在挑战和局限性，如数据分析的复杂性和成本问题 | 探讨scRNA-seq在减数分裂研究中的优势及其在未来的应用前景 | 哺乳动物的减数分裂过程及其分子机制 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 402 | 2024-08-08 |
Dynamic Network Biomarker of Pre-Exhausted CD8+ T Cells Contributed to T Cell Exhaustion in Colorectal Cancer
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.691142
PMID:34434188
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研究论文 | 本研究通过动态网络生物标志物（DNB）分析了结直肠癌（CRC）患者中单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集中的CD8+ T细胞发育轨迹和前耗竭T细胞特征 | 首次使用DNB方法识别出结直肠癌中前耗竭T细胞亚群的生物标志物，并揭示了这些标志物与患者总体生存率的关联 | NA | 探究结直肠癌中T细胞耗竭的机制，并为靶向免疫治疗提供线索 | 结直肠癌患者的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | 动态网络生物标志物（DNB） | RNA | 来自结直肠癌患者的样本 |
| 403 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics of Glioblastoma Reveals a Unique Tumor Microenvironment and Potential Immunotherapeutic Target Against Tumor-Associated Macrophage
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.710695
PMID:34434898
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序分析，揭示了胶质母细胞瘤中独特的肿瘤微环境及针对肿瘤相关巨噬细胞的潜在免疫治疗靶点。 | 首次在单细胞水平上描述了人胶质母细胞瘤的免疫景观，并定义了胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞的新分类方案。 | 研究主要集中在肿瘤相关巨噬细胞的激活状态和转录特征，未涉及其他免疫细胞类型。 | 阐明胶质母细胞瘤中免疫细胞的相对比例及其来源和状态，并识别潜在的免疫治疗靶点。 | 胶质母细胞瘤中的肿瘤相关巨噬细胞及其在不同亚型中的特征。 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共分析了16,201个细胞 |
| 404 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals the Suppressive Role of Retinal Neurons in Microglia Activation Under Diabetes Mellitus
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.680947
PMID:34434927
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了糖尿病视网膜病变中视网膜神经元对小胶质细胞激活的抑制作用 | 首次通过单细胞转录组测序分析了糖尿病视网膜病变早期细胞特异性分子变化及细胞间相互作用网络 | NA | 解析糖尿病视网膜病变早期阶段的细胞和分子机制 | 非人灵长类糖尿病视网膜的六种主要细胞类型 | NA | 糖尿病视网膜病变 | scRNA-seq | NA | 转录组 | 非人灵长类糖尿病视网膜样本 |
| 405 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Reveals Immune Cell Signatures in Alzheimer's Disease
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.645666
PMID:34447367
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了阿尔茨海默病（AD）患者和正常对照组的外周血单个核细胞，揭示了AD中免疫细胞亚群的特征性改变 | 首次在单细胞水平上揭示了AD患者外周免疫细胞的分子基础和适应性免疫组库特征 | NA | 探索阿尔茨海默病中外周免疫细胞的分子基础和适应性免疫组库特征 | 阿尔茨海默病患者和正常对照组的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组和免疫组库测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 36,849个外周血单个核细胞 |
| 406 | 2024-08-08 |
deepMNN: Deep Learning-Based Single-Cell RNA Sequencing Data Batch Correction Using Mutual Nearest Neighbors
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.708981
PMID:34447413
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研究论文 | 提出了一种基于深度学习的单细胞RNA测序数据批次校正方法deepMNN | deepMNN通过在主成分分析子空间中搜索互最近邻对，并构建批次校正网络来去除批次效应，具有更好的性能和更快的运行速度 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的批次效应问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | CNN | 基因表达数据 | 多个批次的大规模数据集 |
| 407 | 2024-08-08 |
Roles of the Immune/Methylation/Autophagy Landscape on Single-Cell Genotypes and Stroke Risk in Breast Cancer Microenvironment
2021, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2021/5633514
PMID:34457116
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研究论文 | 本研究旨在通过综合分析免疫/甲基化/自噬景观对乳腺癌预后和单细胞基因型的影响 | 本研究构建了基于BCRRS和BCPRS的风险预测模型，并利用临床数据评估其预测能力，同时通过scRNA-seq分析单细胞基因型，揭示了IMAAGs对乳腺癌肿瘤微环境的潜在调控作用 | NA | 研究免疫/甲基化/自噬景观对乳腺癌预后和单细胞基因型的影响 | 乳腺癌的复发风险评分（BCRRS）和预后风险评分（BCPRS），以及单细胞基因型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | 神经网络 | 基因数据 | 基于TCGA-BRCA队列的6个预后IMAAGs，以及TNBC样本的单细胞基因型 |
| 408 | 2024-08-08 |
Sclerosing Sialadenitis Is Associated With Salivary Gland Hypofunction and a Unique Gene Expression Profile in Sjögren's Syndrome
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.699722
PMID:34400910
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研究论文 | 本文开发了一种新方法来量化唾液腺中的纤维化程度，并探讨了纤维化与干燥综合征相关特定症状之间的关系 | 提出了相对间质纤维化面积（RIFA）量化方法，并发现与RIFA显著相关的基因表达模式 | NA | 研究纤维化与干燥综合征症状之间的关系 | 唾液腺纤维化及其对干燥综合征症状的影响 | NA | 干燥综合征 | 微阵列分析，DNase I超敏感位点测序分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 20名女性干燥综合征患者 |
| 409 | 2024-08-08 |
Isoform Age - Splice Isoform Profiling Using Long-Read Technologies
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.711733
PMID:34409069
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综述 | 本文综述了长读长测序技术在解析复杂剪接异构体中的应用及其对RNA调控和蛋白质功能的影响 | 结合长读长测序技术与其他技术如单细胞测序、靶向测序和空间转录组学，能够以前所未有的细节水平分析剪接异构体，并能确定遗传变异对异构体表达的影响 | NA | 探讨长读长测序技术如何解决现有短读长测序技术在解析复杂异构体方面的局限性 | RNA的替代剪接机制及其在疾病中的作用 | 基因组学 | NA | 长读长测序技术 | NA | RNA序列 | NA |
| 410 | 2024-08-08 |
Interleukin 32 Promotes Foxp3+ Treg Cell Development and CD8+ T Cell Function in Human Esophageal Squamous Cell Carcinoma Microenvironment
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.704853
PMID:34414188
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析食管鳞状细胞癌（ESCC）肿瘤微环境（TME）中的肿瘤浸润免疫细胞的单细胞RNA测序数据，探讨了白细胞介素32（IL-32）在不同免疫细胞类型中的表达及其作用。 | 首次详细探讨了IL-32在肿瘤微环境中不同免疫细胞亚型中的表达及其对Treg细胞和CD8+ T细胞功能的影响。 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能需要进一步的实验验证。 | 探讨IL-32在食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中对免疫细胞功能的影响及其潜在的临床应用。 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）肿瘤微环境中的免疫细胞。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 411 | 2024-08-08 |
Microglia-Specific Expression of HEXA and HEXB Leads to Poor Prognosis in Glioblastoma Patients
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.685893
PMID:34422641
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研究论文 | 本研究探讨了HEXA和HEXB基因在胶质母细胞瘤中的表达及其对患者预后的影响 | 首次揭示了HEXA和HEXB在胶质母细胞瘤患者中的微胶质细胞特异性表达及其对肿瘤进展的作用 | NA | 研究HEXA和HEXB基因在胶质母细胞瘤中的表达及其对患者预后的影响 | 胶质母细胞瘤患者的HEXA和HEXB基因表达 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA和蛋白质 | 胶质母细胞瘤患者样本 |
| 412 | 2024-08-08 |
HiPS-Endothelial Cells Acquire Cardiac Endothelial Phenotype in Co-culture With hiPS-Cardiomyocytes
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.715093
PMID:34422835
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research paper | 研究了人诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的心肌细胞（hiPS-CMs）和内皮细胞（hiPS-ECs）在单培养和共培养条件下的相互作用 | 首次在人类内皮细胞中展示了EC-CM相互作用的重要性，并通过单细胞RNA测序揭示了共培养条件下基因表达的变化 | NA | 阐明心脏内皮细胞和心肌细胞的器官型发育及细胞间对话 | 人诱导多能干细胞衍生的心肌细胞和内皮细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 413 | 2024-08-08 |
DeepHistoClass: A Novel Strategy for Confident Classification of Immunohistochemistry Images Using Deep Learning
2021, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2021.100140
PMID:34425263
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepHistoClass的新策略，用于使用深度学习对免疫组织化学图像进行可信分类 | 开发了一种多标签分类框架，结合了深度学习模型与新的不确定性度量DeepHistoClass（DHC）置信分数，显著提高了诊断性能 | NA | 提出一种可靠且全面的框架，用于免疫组织化学图像的自动化注释 | 7848张复杂的人类睾丸免疫组织化学图像，对应2794种独特蛋白质 | 数字病理学 | NA | 免疫组织化学 | 混合贝叶斯神经网络 | 图像 | 7848张图像，对应2794种独特蛋白质 |
| 414 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Elucidates the Structure and Organization of Microbial Communities
2021, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2021.713128
PMID:34367118
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在揭示微生物群落结构和组织中的应用 | 介绍了针对细菌特性的scRNA-seq新技术，克服了细菌细胞壁、mRNA半衰期短和低拷贝数等技术难题 | 目前scRNA-seq技术主要应用于真核细胞，对细菌的应用存在挑战 | 旨在更好地理解细胞群体异质性，特别是在工业发酵和传染病中的影响 | 研究对象包括细菌细胞的形态特征、生化性质和基因表达谱的异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 415 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Complexity of the Tumor Microenvironment of Treatment-Naive Osteosarcoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.709210
PMID:34367994
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了未经治疗的骨肉瘤肿瘤微环境的复杂性 | 首次揭示了骨肉瘤中单细胞转录图谱，并识别了与生存预后相关的关键转录因子 | 研究样本仅来自六名患者，可能影响结果的普遍性 | 深入理解骨肉瘤的复杂肿瘤微环境，以开发更精确的治疗方法 | 骨肉瘤患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 29,278个细胞，来自六名患者 |
| 416 | 2024-08-08 |
Evidence for AJUBA-catenin-CDH4-linked differentiation resistance of mesenchymal stem cells implies tumorigenesis and progression of head and neck squamous cell carcinoma: a single-cell transcriptome approach
2021, Blood and genomics
DOI:10.46701/BG.2021012021106
PMID:34368804
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了间充质干细胞（MSCs）在头颈鳞状细胞癌（HNSCC）发生和发展中的分子机制 | 首次揭示了AJUBA、β-catenin和CDH4在分化抵抗的MSCs中的上调表达，及其在HNSCC发展中的作用 | 研究仅限于细胞模型和临床队列的初步分析，需要进一步的体内实验验证 | 阐明MSCs在HNSCC中的分子机制，探索基于MSCs的治疗策略 | 间充质干细胞（MSCs）及其在头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中的作用 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 1780个差异表达基因 |
| 417 | 2024-08-08 |
PD-L2 based immune signature confers poor prognosis in HNSCC
2021, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2021.1947569
PMID:34377590
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研究论文 | 本文研究了PD-L2在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的表达及其作为预后生物标志物的潜力 | 首次揭示了PD-L2作为独立预测因子对HNSCC患者总体生存率的影响，并提出了基于PD-L2的免疫特征作为抗PD-1治疗的有效生物标志物 | NA | 探讨PD-L2在HNSCC中的表达及其作为预后生物标志物的可能性 | HNSCC患者的PD-L2表达及其对生存率的影响 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 生存树分析 | RNA | 62.7%的肿瘤样本和61.4%的PD-L1阴性患者样本 |
| 418 | 2024-08-08 |
Retention of Prey Genetic Material by the Kleptoplastidic Ciliate Strombidium cf. basimorphum
2021, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2021.694508
PMID:34394035
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研究论文 | 研究 Kleptoplastidic Ciliate Strombidium cf. basimorphum 是否保留捕食猎物的遗传物质 | 首次证明某些物种中捕获的叶绿体功能与猎物核的同时保留有关，并揭示了猎物核、核形态和核糖体的遗传物质在纤毛虫内可检测到至少5天 | NA | 探讨纤毛虫中猎物遗传物质的潜在保留 | Kleptoplastidic Ciliate Strombidium cf. basimorphum 及其捕食的隐藻 | NA | NA | 分子标记、单细胞转录组学 | NA | 遗传物质、转录本 | NA |
| 419 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling of MAIT Cells in Patients With COVID-19
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.700152
PMID:34394094
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了COVID-19患者和健康捐赠者外周MAIT细胞的转录组特征 | 首次探索了COVID-19患者中MAIT细胞的单细胞转录组特征，并揭示了其在SARS-CoV-2感染中的免疫作用 | 研究样本量较小，仅包括13名COVID-19患者和5名健康捐赠者 | 探究MAIT细胞在COVID-19患者中的免疫反应和转录组特征 | COVID-19患者和健康捐赠者的外周MAIT细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13名COVID-19患者和5名健康捐赠者 |
| 420 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Retina:New Looks for Gene Marker and Old Diseases
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.699906
PMID:34395530
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review | 本文系统回顾了单细胞RNA测序技术的发展历程，并总结了该技术发现的新型视网膜细胞亚型及一些特定基因标记，同时讨论了其在视网膜相关疾病诊断方面的进展。 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了视网膜的新细胞亚型和特定基因标记，有助于深入理解疾病的发生和发展。 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在揭示视网膜复杂性和相关疾病诊断中的应用。 | 视网膜细胞及其相关疾病。 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（sRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |