单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 709 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-08 |
The Role of Hemoglobin Subunit Delta in the Immunopathy of Multiple Sclerosis: Mitochondria Matters
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.709173
PMID:34504491
|
研究论文 | 本文通过微阵列分析、单细胞测序分析和体外研究，探讨了线粒体应激在多发性硬化症患者外周血单个核细胞中的作用，特别是血红蛋白δ亚基（HBD）的表达及其在免疫调节治疗中的变化。 | 首次详细研究了HBD在多发性硬化症中的表达及其在免疫调节治疗中的调控作用，揭示了HBD在氧化应激中的细胞保护作用。 | 需要进一步研究以阐明HBD在多发性硬化症患者氧化应激中的分子机制。 | 探讨线粒体应激在多发性硬化症发病机制中的作用，特别是血红蛋白δ亚基（HBD）的表达及其调控。 | 多发性硬化症患者的外周血单个核细胞（PBMCs）。 | NA | 多发性硬化症 | 微阵列分析、单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | 包括健康捐赠者、未治疗的多发性硬化症患者以及接受不同免疫调节治疗的多发性硬化症患者的外周血单个核细胞。 | NA | NA | NA | NA |
| 402 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Migration of Osteoclasts in Giant Cell Tumor of Bone
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.715552
PMID:34504794
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了骨巨细胞瘤中破骨细胞的迁移情况 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了骨巨细胞瘤中破骨细胞迁移的相关基因和信号通路 | 研究仅基于一名患者的样本，可能存在样本量不足的问题 | 深入理解骨巨细胞瘤的肿瘤微环境，特别是破骨细胞的迁移机制 | 骨巨细胞瘤中的破骨细胞迁移 | 数字病理学 | 骨肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一名骨巨细胞瘤患者的8,033个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 403 | 2024-08-08 |
Editorial: Integrative Analysis of Genome-Wide Association Studies and Single-Cell Sequencing Studies
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.752057
PMID:34512737
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 404 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of infiltrating B cells and tertiary lymphoid structures in the TME of gastric adenocarcinomas
2021, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2021.1969767
PMID:34513317
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、10× Genomics V(D)J分析、多重免疫荧光技术和OSCmap分析，对胃腺癌（gADC）肿瘤微环境（TME）中的免疫细胞进行了综合分析 | 首次在gADC组织中发现大量黏膜相关淋巴组织（MALT）-B细胞，并发现这些细胞具有成熟的淋巴结构（mTLSs），且在mTLSs中的免疫细胞类型和密度均高于正常淋巴结构 | NA | 旨在表征胃腺癌肿瘤微环境中免疫细胞的谱系 | 胃腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 10× Genomics V(D)J分析, 多重免疫荧光技术, OSCmap分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 49,765个单细胞，来自4名胃腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 405 | 2024-08-08 |
Integrative Analysis Identified MCT4 as an Independent Prognostic Factor for Bladder Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.704857
PMID:34513685
|
研究论文 | 本文通过综合分析确定了MCT4作为膀胱癌独立预后因子的地位 | 首次研究了MCT4表达与膀胱癌患者总体生存率之间的关联，并构建了基于多变量Cox分析的列线图 | 研究样本量相对较小，可能需要更大规模的研究来验证结果 | 研究MCT4表达与膀胱癌患者总体生存率之间的关系 | 膀胱癌患者及MCT4表达 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学染色 | Cox回归模型 | mRNA表达数据, 蛋白质表达数据 | 49,869个膀胱癌细胞和15,827个正常膀胱黏膜细胞，以及89名接受根治性膀胱切除术的膀胱癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 406 | 2024-08-08 |
SCSit: A high-efficiency preprocessing tool for single-cell sequencing data from SPLiT-seq
2021, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2021.08.021
PMID:34471500
|
research paper | 本文介绍了一种名为SCSit的高效预处理工具，用于SPLiT-seq单细胞测序数据的预处理和分类 | SCSit工具能够直接识别组合条形码和细胞类型的UMI，获取更多标记读取，并通过精确的插入和删除对齐显著增强保留的数据 | NA | 开发一种高效的预处理工具，用于SPLiT-seq单细胞测序数据的预处理和分类 | SPLiT-seq单细胞测序数据 | digital pathology | NA | SPLiT-seq | NA | single-cell sequencing data | NA | NA | NA | NA | NA |
| 407 | 2024-08-08 |
Upregulation of THBS1 is Related to Immunity and Chemotherapy Resistance in Gastric Cancer
2021, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S329208
PMID:34475782
|
研究论文 | 本文研究了血栓调节蛋白1（THBS1）在胃癌（GC）中的表达及其与免疫浸润和化疗抵抗的关系 | 首次详细探讨了THBS1表达与胃癌中免疫浸润的关系，并分析了其与药物敏感性的关联 | 研究主要基于数据库分析和免疫组化染色，可能缺乏直接的实验验证 | 探讨THBS1在胃癌中的表达及其对预后和化疗抵抗的影响 | 胃癌患者的THBS1表达及其与免疫浸润和药物敏感性的关系 | 数字病理学 | 胃癌 | Oncomine, TIMER, TGCA, GEO, IHC染色, GSEA, ESTIMATE算法, 单细胞转录组分析, TIMER2数据库, CIBERSORT算法, CellMiner数据库 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 408 | 2024-08-08 |
Expression Characteristics and Clinical Correlations of BRD1 in Colorectal Cancer Samples
2021 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338211039678
PMID:34482774
|
研究论文 | 本研究探讨了BRD1基因在结直肠癌中的表达特征及其与临床的相关性 | 首次详细研究了BRD1基因在结直肠癌细胞中的表达及其作为治疗靶点的潜力 | 研究样本量有限，且仅基于单细胞转录组测序数据和免疫组化分析 | 探讨BRD1基因在结直肠癌中的表达及其作为生物标志物的潜力 | BRD1基因在结直肠癌中的表达及其临床相关性 | NA | 结直肠癌 | 免疫组化 | NA | 转录组数据 | 临床标本及GSE17536数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 409 | 2024-08-08 |
A Novel Single Cell RNA-seq Analysis of Non-Myeloid Circulating Cells in Late Sepsis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.696536
PMID:34484194
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了晚期脓毒症患者非髓系循环细胞的转录组特征 | 首次详细分析了晚期脓毒症患者淋巴系来源的白细胞的转录组，并识别了多种循环免疫细胞亚型的独特转录组模式 | 样本量较小，仅包括四名晚期脓毒症患者和五名健康受试者 | 通过单细胞RNA测序技术深入理解晚期脓毒症的病理机制 | 晚期脓毒症患者的非髓系循环细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 四名晚期脓毒症患者和五名健康受试者的外周血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 410 | 2024-08-08 |
Transcriptome Profiling Reveals B-Lineage Cells Contribute to the Poor Prognosis and Metastasis of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.731896
PMID:34485161
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术鉴定了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的B细胞，并发现这些B细胞与ccRCC的不良预后和转移有关 | 首次识别出ccRCC中促进转移的B细胞亚群，并发现这些亚群与特定基因的上调有关，为治疗ccRCC的远处转移提供了新的潜在治疗靶点 | NA | 探索ccRCC中B细胞的作用及其与疾病预后和转移的关系 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的B细胞 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 411 | 2024-08-08 |
The Application of Single-Cell RNA Sequencing in Mammalian Meiosis Studies
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.673642
PMID:34485276
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在哺乳动物减数分裂研究中的应用 | scRNA-seq技术能够更有效地检测转录变异，特别是识别具有细微差异的细胞类型和阶段 | scRNA-seq技术存在挑战和局限性，如数据分析的复杂性和成本问题 | 探讨scRNA-seq在减数分裂研究中的优势及其在未来的应用前景 | 哺乳动物的减数分裂过程及其分子机制 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 412 | 2024-08-08 |
Dynamic Network Biomarker of Pre-Exhausted CD8+ T Cells Contributed to T Cell Exhaustion in Colorectal Cancer
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.691142
PMID:34434188
|
研究论文 | 本研究通过动态网络生物标志物（DNB）分析了结直肠癌（CRC）患者中单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集中的CD8+ T细胞发育轨迹和前耗竭T细胞特征 | 首次使用DNB方法识别出结直肠癌中前耗竭T细胞亚群的生物标志物，并揭示了这些标志物与患者总体生存率的关联 | NA | 探究结直肠癌中T细胞耗竭的机制，并为靶向免疫治疗提供线索 | 结直肠癌患者的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | 动态网络生物标志物（DNB） | RNA | 来自结直肠癌患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 413 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics of Glioblastoma Reveals a Unique Tumor Microenvironment and Potential Immunotherapeutic Target Against Tumor-Associated Macrophage
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.710695
PMID:34434898
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序分析，揭示了胶质母细胞瘤中独特的肿瘤微环境及针对肿瘤相关巨噬细胞的潜在免疫治疗靶点。 | 首次在单细胞水平上描述了人胶质母细胞瘤的免疫景观，并定义了胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞的新分类方案。 | 研究主要集中在肿瘤相关巨噬细胞的激活状态和转录特征，未涉及其他免疫细胞类型。 | 阐明胶质母细胞瘤中免疫细胞的相对比例及其来源和状态，并识别潜在的免疫治疗靶点。 | 胶质母细胞瘤中的肿瘤相关巨噬细胞及其在不同亚型中的特征。 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共分析了16,201个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 414 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals the Suppressive Role of Retinal Neurons in Microglia Activation Under Diabetes Mellitus
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.680947
PMID:34434927
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了糖尿病视网膜病变中视网膜神经元对小胶质细胞激活的抑制作用 | 首次通过单细胞转录组测序分析了糖尿病视网膜病变早期细胞特异性分子变化及细胞间相互作用网络 | NA | 解析糖尿病视网膜病变早期阶段的细胞和分子机制 | 非人灵长类糖尿病视网膜的六种主要细胞类型 | NA | 糖尿病视网膜病变 | scRNA-seq | NA | 转录组 | 非人灵长类糖尿病视网膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 415 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Reveals Immune Cell Signatures in Alzheimer's Disease
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.645666
PMID:34447367
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了阿尔茨海默病（AD）患者和正常对照组的外周血单个核细胞，揭示了AD中免疫细胞亚群的特征性改变 | 首次在单细胞水平上揭示了AD患者外周免疫细胞的分子基础和适应性免疫组库特征 | NA | 探索阿尔茨海默病中外周免疫细胞的分子基础和适应性免疫组库特征 | 阿尔茨海默病患者和正常对照组的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组和免疫组库测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 36,849个外周血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 416 | 2024-08-08 |
deepMNN: Deep Learning-Based Single-Cell RNA Sequencing Data Batch Correction Using Mutual Nearest Neighbors
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.708981
PMID:34447413
|
研究论文 | 提出了一种基于深度学习的单细胞RNA测序数据批次校正方法deepMNN | deepMNN通过在主成分分析子空间中搜索互最近邻对，并构建批次校正网络来去除批次效应，具有更好的性能和更快的运行速度 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的批次效应问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | CNN | 基因表达数据 | 多个批次的大规模数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 417 | 2024-08-08 |
Roles of the Immune/Methylation/Autophagy Landscape on Single-Cell Genotypes and Stroke Risk in Breast Cancer Microenvironment
2021, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2021/5633514
PMID:34457116
|
研究论文 | 本研究旨在通过综合分析免疫/甲基化/自噬景观对乳腺癌预后和单细胞基因型的影响 | 本研究构建了基于BCRRS和BCPRS的风险预测模型，并利用临床数据评估其预测能力，同时通过scRNA-seq分析单细胞基因型，揭示了IMAAGs对乳腺癌肿瘤微环境的潜在调控作用 | NA | 研究免疫/甲基化/自噬景观对乳腺癌预后和单细胞基因型的影响 | 乳腺癌的复发风险评分（BCRRS）和预后风险评分（BCPRS），以及单细胞基因型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | 神经网络 | 基因数据 | 基于TCGA-BRCA队列的6个预后IMAAGs，以及TNBC样本的单细胞基因型 | NA | NA | NA | NA |
| 418 | 2024-08-08 |
Sclerosing Sialadenitis Is Associated With Salivary Gland Hypofunction and a Unique Gene Expression Profile in Sjögren's Syndrome
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.699722
PMID:34400910
|
研究论文 | 本文开发了一种新方法来量化唾液腺中的纤维化程度，并探讨了纤维化与干燥综合征相关特定症状之间的关系 | 提出了相对间质纤维化面积（RIFA）量化方法，并发现与RIFA显著相关的基因表达模式 | NA | 研究纤维化与干燥综合征症状之间的关系 | 唾液腺纤维化及其对干燥综合征症状的影响 | NA | 干燥综合征 | 微阵列分析，DNase I超敏感位点测序分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 20名女性干燥综合征患者 | NA | NA | NA | NA |
| 419 | 2024-08-08 |
Isoform Age - Splice Isoform Profiling Using Long-Read Technologies
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.711733
PMID:34409069
|
综述 | 本文综述了长读长测序技术在解析复杂剪接异构体中的应用及其对RNA调控和蛋白质功能的影响 | 结合长读长测序技术与其他技术如单细胞测序、靶向测序和空间转录组学，能够以前所未有的细节水平分析剪接异构体，并能确定遗传变异对异构体表达的影响 | NA | 探讨长读长测序技术如何解决现有短读长测序技术在解析复杂异构体方面的局限性 | RNA的替代剪接机制及其在疾病中的作用 | 基因组学 | NA | 长读长测序技术 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 420 | 2024-08-08 |
Interleukin 32 Promotes Foxp3+ Treg Cell Development and CD8+ T Cell Function in Human Esophageal Squamous Cell Carcinoma Microenvironment
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.704853
PMID:34414188
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析食管鳞状细胞癌（ESCC）肿瘤微环境（TME）中的肿瘤浸润免疫细胞的单细胞RNA测序数据，探讨了白细胞介素32（IL-32）在不同免疫细胞类型中的表达及其作用。 | 首次详细探讨了IL-32在肿瘤微环境中不同免疫细胞亚型中的表达及其对Treg细胞和CD8+ T细胞功能的影响。 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能需要进一步的实验验证。 | 探讨IL-32在食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中对免疫细胞功能的影响及其潜在的临床应用。 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）肿瘤微环境中的免疫细胞。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |