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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-08 |
Multiomics Analysis Reveals the Prognostic Non-tumor Cell Landscape in Glioblastoma Niches
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.741325
PMID:34603399
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研究论文 | 本研究旨在全面描述原发性胶质母细胞瘤微环境中非肿瘤细胞的特征及其预后影响 | 研究首次详细描述了胶质母细胞瘤微环境中非恶性细胞的预后效应,并发现了不同细胞类型在免疫反应中的作用 | NA | 揭示胶质母细胞瘤微环境中非肿瘤细胞的预后效应 | 胶质母细胞瘤微环境中的非肿瘤细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 基因表达谱分析 | NA | 基因表达数据 | 967例胶质母细胞瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2024-08-08 |
Tumor-Infiltrating PD-1hiCD8+-T-Cell Signature as an Effective Biomarker for Immune Checkpoint Inhibitor Therapy Response Across Multiple Cancers
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.695006
PMID:34604032
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研究论文 | 本文构建了一种基于PD-1hiCD8+ T细胞转录组特征的生物标志物,用于预测多种癌症对免疫检查点抑制剂治疗的反应 | 首次利用RNA测序数据量化PD-1hiCD8+ T细胞,并验证其在多种癌症类型中的应用 | NA | 开发一种有效的生物标志物,用于预测患者对免疫检查点抑制剂治疗的反应 | PD-1hiCD8+ T细胞在肿瘤浸润免疫细胞中的作用 | 数字病理学 | 多种癌症 | RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 581个临床样本和204个鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 383 | 2024-08-08 |
The Dynamic Changes of Transcription Factors During the Development Processes of Human Biparental and Uniparental Embryos
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.709498
PMID:34604214
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术系统地研究了早期胚胎发育过程中转录因子的表达谱,揭示了人类双亲和单亲胚胎发育过程中转录因子的动态变化 | 首次系统地研究了单亲胚胎发育过程中转录因子的作用,并发现了多种特定类型的转录因子 | NA | 研究转录因子在人类双亲和单亲胚胎发育过程中的作用 | 转录因子在早期胚胎发育中的表达和功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多种类型的胚胎样本 | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq of Cisplatin-Treated Adult Stria Vascularis Identifies Cell Type-Specific Regulatory Networks and Novel Therapeutic Gene Targets
2021, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2021.718241
PMID:34566577
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究顺铂处理后的成年鼠血管纹细胞,识别细胞类型特异性的调控网络和新的治疗基因靶点。 | 本文首次结合顺铂处理和单细胞RNA测序技术,揭示了血管纹细胞在顺铂暴露下的转录变化,并识别了独特的基因调控网络和可药物干预的基因靶点。 | NA | 旨在建立内耳电位功能障碍模型,进行转录分析和治疗测试。 | 成年鼠血管纹细胞在顺铂处理后的转录变化和治疗基因靶点。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 385 | 2024-08-08 |
Inhibition of BCL9 Modulates the Cellular Landscape of Tumor-Associated Macrophages in the Tumor Immune Microenvironment of Colorectal Cancer
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.713331
PMID:34566638
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研究论文 | 研究通过单细胞测序探讨BCL9抑制对结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)细胞景观的影响 | 首次提出TAM-to-NK评分,评估肿瘤微环境中单核细胞/TAM细胞与NK样非功能细胞的动态平衡 | NA | 探讨BCL9抑制对结直肠癌肿瘤微环境中TAMs细胞类型平衡和转录差异的影响 | 结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2024-08-08 |
Gene Signatures of NEUROGENIN3+ Endocrine Progenitor Cells in the Human Pancreas
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.736286
PMID:34566896
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术深入探索人类胰腺中NEUROGENIN3+(NEUROG3+)内分泌前体细胞的分子程序 | 首次在人类中直接利用单细胞RNA测序技术研究NEUROG3+细胞,并揭示了其独特的基因特征和调控网络 | NA | 探索人类胰腺中NEUROG3+细胞的分子程序,以促进糖尿病治疗中β细胞再生的疗法开发 | 人类胰腺中的NEUROG3+内分泌前体细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,174个胰腺细胞中的10个NEUROG3+上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 387 | 2024-08-08 |
Unraveling the Heterogeneity and Ontogeny of Dendritic Cells Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.711329
PMID:34566965
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术揭示树突状细胞(DCs)的异质性和发育过程的最新进展 | 利用scRNA-seq技术深入探讨了DCs的重新分类和发育,以及在疾病中DCs的异质性和多功能性 | NA | 探讨树突状细胞的异质性和发育过程 | 树突状细胞(DCs) | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 388 | 2024-08-08 |
AdImpute: An Imputation Method for Single-Cell RNA-Seq Data Based on Semi-Supervised Autoencoders
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.739677
PMID:34567089
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研究论文 | 本文介绍了一种基于半监督自编码器的单细胞RNA测序数据插补方法AdImpute | AdImpute方法使用另一种插补方法的结果作为自编码器的插补权重,并通过带有插补权重的成本函数学习数据的潜在信息,实现更准确的插补 | NA | 开发一种更准确的单细胞RNA测序数据插补方法 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | RNA测序数据 | 模拟数据集和真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2024-08-08 |
The Stromal and Immune Landscape of Nasopharyngeal Carcinoma and Its Implications for Precision Medicine Targeting the Tumor Microenvironment
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.744889
PMID:34568077
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综述 | 本文综述了鼻咽癌(NPC)的基质和免疫景观,并探讨了针对肿瘤微环境(TME)的精准医疗方法 | 利用单细胞测序技术解析了NPC浸润细胞的基质组成和功能动态,为精准治疗提供了新的视角 | 缺乏对TME的深入理解,限制了治疗的发展和优化 | 详细描绘NPC的基质景观,并提出基于微环境的精准治疗方法 | 鼻咽癌的肿瘤微环境及其对治疗的影响 | NA | 鼻咽癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2024-08-08 |
Identify differential genes and cell subclusters from time-series scRNA-seq data using scTITANS
2021, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2021.07.016
PMID:34527187
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研究论文 | 本文提出了一种名为scTITANS的方法,用于从时间序列单细胞RNA测序数据中识别差异基因和细胞亚群 | scTITANS通过使用轨迹推断分析的伪时间来校正细胞异步性,并引入基于时间序列分析方法的时间依赖协变量,从而更准确、定量地处理细胞间的异质性并充分利用生物过程中的时间信息 | NA | 开发一种有效工具,用于从时间序列单细胞RNA测序数据中识别差异基因和细胞亚群 | 时间序列单细胞RNA测序数据中的差异基因和细胞亚群 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 时间序列数据 | 多个时间点的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2024-08-08 |
Stromal infiltrating mast cells identify immunoevasive subtype high-grade serous ovarian cancer with poor prognosis and inferior immunotherapeutic response
2021, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2021.1969075
PMID:34527431
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研究论文 | 研究探讨了肿瘤浸润肥大细胞(TIMs)在高度浆液性卵巢癌(HGSOC)中的预后、免疫环境和免疫治疗反应的相关性 | 首次揭示了基质TIMs(sTIMs)在HGSOC中的预后价值和与免疫逃逸亚型的关联,并构建了一个基于sTIMs和PD-L1的诺模图来预测患者的5年总生存率 | 研究样本量有限,且仅限于高级别浆液性卵巢癌患者,可能限制了结果的普遍性 | 旨在确定TIMs在HGSOC中的预后、免疫环境和免疫治疗反应的相关性 | 高级别浆液性卵巢癌患者及其肿瘤浸润肥大细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 免疫组织化学(IHC),单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 组织样本 | 197名高级别浆液性卵巢癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2024-08-08 |
HCG18 Participates in Vascular Invasion of Hepatocellular Carcinoma by Regulating Macrophages and Tumor Stem Cells
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.707073
PMID:34527669
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研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌(HCC)的基因组、转录组和免疫微环境数据,探讨了HCG18在HCC血管侵袭中的作用及其调控机制 | 本研究首次揭示了HCG18通过调控巨噬细胞和肿瘤干细胞参与HCC血管侵袭的机制,并发现了三个关键转录因子YBX1、ILF2和HMGA1 | 研究主要基于公共数据库数据,未进行体内外实验验证 | 旨在识别肝细胞癌中参与血管侵袭的关键基因及其调控机制,并探索HCC的免疫微环境 | 肝细胞癌(HCC)的基因组、转录组和免疫微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 基因组学、转录组学、免疫微环境分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、免疫细胞数据 | 373例HCC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2024-08-08 |
The Many Faces of Astrocytes in Alzheimer's Disease
2021, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2021.619626
PMID:34531807
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用及其在正常和病理条件下的发展 | 利用单细胞测序技术来描绘与阿尔茨海默病中反应性星形胶质细胞相关的特定生物标志物 | NA | 深入理解星形胶质细胞在阿尔茨海默病中的贡献及其表型变化,以寻找更有效的治疗靶点 | 星形胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用及其表型变化 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals Greater Epithelial Ridge Cells Degeneration During Postnatal Development of Cochlea in Rats
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.719491
PMID:34540839
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了在幼鼠耳蜗发育过程中,大上皮嵴细胞的退化情况及其分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术,详细分析了幼鼠耳蜗发育过程中大上皮嵴细胞的亚型及其退化机制 | 研究仅限于幼鼠耳蜗发育的两个时间点(P1和P7),可能需要更多时间点的数据以全面理解细胞退化过程 | 探讨幼鼠耳蜗发育过程中大上皮嵴细胞的退化机制 | 幼鼠耳蜗中的大上皮嵴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 幼鼠耳蜗在出生后第1天和第7天的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-08-08 |
Transcriptional, Epigenetic, and Functional Reprogramming of Monocytes From Non-Human Primates Following Chronic Alcohol Drinking
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.724015
PMID:34489976
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研究论文 | 本研究探讨了非人灵长类动物在慢性酒精饮用后单核细胞的转录、表观遗传和功能重编程 | 首次在非人灵长类动物模型中详细分析了慢性酒精饮用对单核细胞亚群的影响及其表观遗传变化 | 研究仅限于女性猕猴,且样本量未明确提及 | 探究慢性酒精饮用对单核细胞的转录、表观遗传和功能重编程的影响 | 非人灵长类动物的单核细胞 | NA | NA | scRNA-Seq | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2024-08-08 |
Stem Cells in Myelodysplastic Syndromes and Acute Myeloid Leukemia: First Cousins or Unrelated Entities?
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.730899
PMID:34490124
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综述 | 本文综述了骨髓增生异常综合征(MDS)向急性髓系白血病(AML)转化的代谢、表型和遗传特征,以及从MDS干细胞(MDS-SCs)到白血病干细胞(LSCs)的动态演变 | 探讨了MDS-SCs和LSCs的分子标记物CD123和CLL1的过度表达及其在治疗上的应用潜力,以及单细胞测序揭示的MDS向AML进展中的非线性克隆进化 | NA | 探讨MDS和AML中干细胞的特性及其在疾病进展中的作用 | MDS干细胞(MDS-SCs)和白血病干细胞(LSCs) | NA | 血液病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2024-08-08 |
Reduced CCR6+IL-17A+Treg Cells in Blood and CCR6-Dependent Accumulation of IL-17A+Treg Cells in Lungs of Patients With Allergic Asthma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.710750
PMID:34497608
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研究论文 | 本研究探讨了过敏性哮喘患者中调节性T细胞(Treg)亚群的特征及其在疾病发病机制中的作用 | 首次揭示了CCR6+IL-17A+Treg细胞在过敏性哮喘患者肺部积累的机制,并探讨了这些细胞在疾病病理中的潜在作用 | 研究主要基于流式细胞术和单细胞RNA测序,未涉及更广泛的临床试验或长期随访 | 探究过敏性哮喘中特定Treg细胞亚群的作用及其机制 | 过敏性哮喘患者和健康个体的Treg细胞亚群 | 免疫学 | 过敏性哮喘 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 包括过敏性哮喘患者和健康个体的血液及肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 398 | 2024-08-08 |
A Novel Intercellular Communication-Associated Gene Signature for Prognostic Prediction and Clinical Value in Patients With Lung Adenocarcinoma
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.702424
PMID:34497634
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研究论文 | 本研究旨在识别肺腺癌中的关键细胞间通讯相关基因(ICAGs),并开发基于这些基因的风险评分和机器学习模型以预测肺腺癌的复发 | 本研究首次识别了八个具有预后潜力的ICAGs,并基于这些基因和临床信息开发了预测肺腺癌复发的最佳机器学习模型 | NA | 识别肺腺癌中的关键细胞间通讯相关基因,并开发预后预测模型 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 八个公开可用的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 399 | 2024-08-08 |
LR Hunting: A Random Forest Based Cell-Cell Interaction Discovery Method for Single-Cell Gene Expression Data
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.708835
PMID:34497635
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研究论文 | 本文提出了一种基于随机森林的细胞间相互作用发现方法LR Hunting,用于单细胞基因表达数据 | LR Hunting方法首先使用随机森林数据插补技术连接不同细胞类型的数据,并通过多次计算生成聚合的插补最小深度指数,以识别所有LR配对组合中的显著相互作用 | NA | 解析细胞间相互作用和细胞间通讯 | 单细胞RNA测序数据中的配体-受体基因相互作用 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 使用小鼠细胞转录组和表位测序数据集以及三阴性乳腺癌单细胞RNA测序数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2024-08-08 |
Ribosome Proteins Represented by RPL27A Mark the Development and Metastasis of Triple-Negative Breast Cancer in Mouse and Human
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.716730
PMID:34497807
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,分析了正常小鼠乳腺组织和乳腺癌组织的基因表达模式,发现RPL27A和RPL15基因在三阴性乳腺癌细胞中显著上调,并探讨了其在乳腺癌发展和转移中的作用。 | 首次揭示了RPL27A和RPL15基因在三阴性乳腺癌中的关键作用,并提出了这些基因作为潜在治疗靶点的可能性。 | 研究主要基于小鼠和人类样本的单细胞RNA测序数据,可能需要进一步的临床试验验证这些发现。 | 探索三阴性乳腺癌的新诊断和治疗靶点。 | 三阴性乳腺癌的发展和转移机制。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四组正常小鼠乳腺组织和四组小鼠乳腺癌组织,以及人类原发性和转移性三阴性乳腺癌组织 | NA | NA | NA | NA |