单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-08 |
Stromal infiltrating mast cells identify immunoevasive subtype high-grade serous ovarian cancer with poor prognosis and inferior immunotherapeutic response
2021, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2021.1969075
PMID:34527431
|
研究论文 | 研究探讨了肿瘤浸润肥大细胞（TIMs）在高度浆液性卵巢癌（HGSOC）中的预后、免疫环境和免疫治疗反应的相关性 | 首次揭示了基质TIMs（sTIMs）在HGSOC中的预后价值和与免疫逃逸亚型的关联，并构建了一个基于sTIMs和PD-L1的诺模图来预测患者的5年总生存率 | 研究样本量有限，且仅限于高级别浆液性卵巢癌患者，可能限制了结果的普遍性 | 旨在确定TIMs在HGSOC中的预后、免疫环境和免疫治疗反应的相关性 | 高级别浆液性卵巢癌患者及其肿瘤浸润肥大细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 免疫组织化学（IHC），单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 组织样本 | 197名高级别浆液性卵巢癌患者 |
| 382 | 2024-08-08 |
HCG18 Participates in Vascular Invasion of Hepatocellular Carcinoma by Regulating Macrophages and Tumor Stem Cells
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.707073
PMID:34527669
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研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌（HCC）的基因组、转录组和免疫微环境数据，探讨了HCG18在HCC血管侵袭中的作用及其调控机制 | 本研究首次揭示了HCG18通过调控巨噬细胞和肿瘤干细胞参与HCC血管侵袭的机制，并发现了三个关键转录因子YBX1、ILF2和HMGA1 | 研究主要基于公共数据库数据，未进行体内外实验验证 | 旨在识别肝细胞癌中参与血管侵袭的关键基因及其调控机制，并探索HCC的免疫微环境 | 肝细胞癌（HCC）的基因组、转录组和免疫微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 基因组学、转录组学、免疫微环境分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、免疫细胞数据 | 373例HCC样本 |
| 383 | 2024-08-08 |
The Many Faces of Astrocytes in Alzheimer's Disease
2021, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2021.619626
PMID:34531807
|
综述 | 本文综述了星形胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用及其在正常和病理条件下的发展 | 利用单细胞测序技术来描绘与阿尔茨海默病中反应性星形胶质细胞相关的特定生物标志物 | NA | 深入理解星形胶质细胞在阿尔茨海默病中的贡献及其表型变化，以寻找更有效的治疗靶点 | 星形胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用及其表型变化 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 384 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals Greater Epithelial Ridge Cells Degeneration During Postnatal Development of Cochlea in Rats
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.719491
PMID:34540839
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了在幼鼠耳蜗发育过程中，大上皮嵴细胞的退化情况及其分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细分析了幼鼠耳蜗发育过程中大上皮嵴细胞的亚型及其退化机制 | 研究仅限于幼鼠耳蜗发育的两个时间点（P1和P7），可能需要更多时间点的数据以全面理解细胞退化过程 | 探讨幼鼠耳蜗发育过程中大上皮嵴细胞的退化机制 | 幼鼠耳蜗中的大上皮嵴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 幼鼠耳蜗在出生后第1天和第7天的样本 |
| 385 | 2024-08-08 |
Transcriptional, Epigenetic, and Functional Reprogramming of Monocytes From Non-Human Primates Following Chronic Alcohol Drinking
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.724015
PMID:34489976
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研究论文 | 本研究探讨了非人灵长类动物在慢性酒精饮用后单核细胞的转录、表观遗传和功能重编程 | 首次在非人灵长类动物模型中详细分析了慢性酒精饮用对单核细胞亚群的影响及其表观遗传变化 | 研究仅限于女性猕猴，且样本量未明确提及 | 探究慢性酒精饮用对单核细胞的转录、表观遗传和功能重编程的影响 | 非人灵长类动物的单核细胞 | NA | NA | scRNA-Seq | NA | 细胞 | NA |
| 386 | 2024-08-08 |
Stem Cells in Myelodysplastic Syndromes and Acute Myeloid Leukemia: First Cousins or Unrelated Entities?
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.730899
PMID:34490124
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综述 | 本文综述了骨髓增生异常综合征（MDS）向急性髓系白血病（AML）转化的代谢、表型和遗传特征，以及从MDS干细胞（MDS-SCs）到白血病干细胞（LSCs）的动态演变 | 探讨了MDS-SCs和LSCs的分子标记物CD123和CLL1的过度表达及其在治疗上的应用潜力，以及单细胞测序揭示的MDS向AML进展中的非线性克隆进化 | NA | 探讨MDS和AML中干细胞的特性及其在疾病进展中的作用 | MDS干细胞（MDS-SCs）和白血病干细胞（LSCs） | NA | 血液病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 387 | 2024-08-08 |
Reduced CCR6+IL-17A+Treg Cells in Blood and CCR6-Dependent Accumulation of IL-17A+Treg Cells in Lungs of Patients With Allergic Asthma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.710750
PMID:34497608
|
研究论文 | 本研究探讨了过敏性哮喘患者中调节性T细胞（Treg）亚群的特征及其在疾病发病机制中的作用 | 首次揭示了CCR6+IL-17A+Treg细胞在过敏性哮喘患者肺部积累的机制，并探讨了这些细胞在疾病病理中的潜在作用 | 研究主要基于流式细胞术和单细胞RNA测序，未涉及更广泛的临床试验或长期随访 | 探究过敏性哮喘中特定Treg细胞亚群的作用及其机制 | 过敏性哮喘患者和健康个体的Treg细胞亚群 | 免疫学 | 过敏性哮喘 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 包括过敏性哮喘患者和健康个体的血液及肺组织样本 |
| 388 | 2024-08-08 |
A Novel Intercellular Communication-Associated Gene Signature for Prognostic Prediction and Clinical Value in Patients With Lung Adenocarcinoma
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.702424
PMID:34497634
|
研究论文 | 本研究旨在识别肺腺癌中的关键细胞间通讯相关基因（ICAGs），并开发基于这些基因的风险评分和机器学习模型以预测肺腺癌的复发 | 本研究首次识别了八个具有预后潜力的ICAGs，并基于这些基因和临床信息开发了预测肺腺癌复发的最佳机器学习模型 | NA | 识别肺腺癌中的关键细胞间通讯相关基因，并开发预后预测模型 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 八个公开可用的数据集 |
| 389 | 2024-08-08 |
LR Hunting: A Random Forest Based Cell-Cell Interaction Discovery Method for Single-Cell Gene Expression Data
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.708835
PMID:34497635
|
研究论文 | 本文提出了一种基于随机森林的细胞间相互作用发现方法LR Hunting，用于单细胞基因表达数据 | LR Hunting方法首先使用随机森林数据插补技术连接不同细胞类型的数据，并通过多次计算生成聚合的插补最小深度指数，以识别所有LR配对组合中的显著相互作用 | NA | 解析细胞间相互作用和细胞间通讯 | 单细胞RNA测序数据中的配体-受体基因相互作用 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | 使用小鼠细胞转录组和表位测序数据集以及三阴性乳腺癌单细胞RNA测序数据集进行验证 |
| 390 | 2024-08-08 |
Ribosome Proteins Represented by RPL27A Mark the Development and Metastasis of Triple-Negative Breast Cancer in Mouse and Human
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.716730
PMID:34497807
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据，分析了正常小鼠乳腺组织和乳腺癌组织的基因表达模式，发现RPL27A和RPL15基因在三阴性乳腺癌细胞中显著上调，并探讨了其在乳腺癌发展和转移中的作用。 | 首次揭示了RPL27A和RPL15基因在三阴性乳腺癌中的关键作用，并提出了这些基因作为潜在治疗靶点的可能性。 | 研究主要基于小鼠和人类样本的单细胞RNA测序数据，可能需要进一步的临床试验验证这些发现。 | 探索三阴性乳腺癌的新诊断和治疗靶点。 | 三阴性乳腺癌的发展和转移机制。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四组正常小鼠乳腺组织和四组小鼠乳腺癌组织，以及人类原发性和转移性三阴性乳腺癌组织 |
| 391 | 2024-08-08 |
The Role of Hemoglobin Subunit Delta in the Immunopathy of Multiple Sclerosis: Mitochondria Matters
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.709173
PMID:34504491
|
研究论文 | 本文通过微阵列分析、单细胞测序分析和体外研究，探讨了线粒体应激在多发性硬化症患者外周血单个核细胞中的作用，特别是血红蛋白δ亚基（HBD）的表达及其在免疫调节治疗中的变化。 | 首次详细研究了HBD在多发性硬化症中的表达及其在免疫调节治疗中的调控作用，揭示了HBD在氧化应激中的细胞保护作用。 | 需要进一步研究以阐明HBD在多发性硬化症患者氧化应激中的分子机制。 | 探讨线粒体应激在多发性硬化症发病机制中的作用，特别是血红蛋白δ亚基（HBD）的表达及其调控。 | 多发性硬化症患者的外周血单个核细胞（PBMCs）。 | NA | 多发性硬化症 | 微阵列分析、单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | 包括健康捐赠者、未治疗的多发性硬化症患者以及接受不同免疫调节治疗的多发性硬化症患者的外周血单个核细胞。 |
| 392 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Migration of Osteoclasts in Giant Cell Tumor of Bone
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.715552
PMID:34504794
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了骨巨细胞瘤中破骨细胞的迁移情况 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了骨巨细胞瘤中破骨细胞迁移的相关基因和信号通路 | 研究仅基于一名患者的样本，可能存在样本量不足的问题 | 深入理解骨巨细胞瘤的肿瘤微环境，特别是破骨细胞的迁移机制 | 骨巨细胞瘤中的破骨细胞迁移 | 数字病理学 | 骨肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一名骨巨细胞瘤患者的8,033个细胞 |
| 393 | 2024-08-08 |
Editorial: Integrative Analysis of Genome-Wide Association Studies and Single-Cell Sequencing Studies
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.752057
PMID:34512737
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of infiltrating B cells and tertiary lymphoid structures in the TME of gastric adenocarcinomas
2021, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2021.1969767
PMID:34513317
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、10× Genomics V(D)J分析、多重免疫荧光技术和OSCmap分析，对胃腺癌（gADC）肿瘤微环境（TME）中的免疫细胞进行了综合分析 | 首次在gADC组织中发现大量黏膜相关淋巴组织（MALT）-B细胞，并发现这些细胞具有成熟的淋巴结构（mTLSs），且在mTLSs中的免疫细胞类型和密度均高于正常淋巴结构 | NA | 旨在表征胃腺癌肿瘤微环境中免疫细胞的谱系 | 胃腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 10× Genomics V(D)J分析, 多重免疫荧光技术, OSCmap分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 49,765个单细胞，来自4名胃腺癌患者 |
| 395 | 2024-08-08 |
Integrative Analysis Identified MCT4 as an Independent Prognostic Factor for Bladder Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.704857
PMID:34513685
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研究论文 | 本文通过综合分析确定了MCT4作为膀胱癌独立预后因子的地位 | 首次研究了MCT4表达与膀胱癌患者总体生存率之间的关联，并构建了基于多变量Cox分析的列线图 | 研究样本量相对较小，可能需要更大规模的研究来验证结果 | 研究MCT4表达与膀胱癌患者总体生存率之间的关系 | 膀胱癌患者及MCT4表达 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学染色 | Cox回归模型 | mRNA表达数据, 蛋白质表达数据 | 49,869个膀胱癌细胞和15,827个正常膀胱黏膜细胞，以及89名接受根治性膀胱切除术的膀胱癌患者 |
| 396 | 2024-08-08 |
SCSit: A high-efficiency preprocessing tool for single-cell sequencing data from SPLiT-seq
2021, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2021.08.021
PMID:34471500
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research paper | 本文介绍了一种名为SCSit的高效预处理工具，用于SPLiT-seq单细胞测序数据的预处理和分类 | SCSit工具能够直接识别组合条形码和细胞类型的UMI，获取更多标记读取，并通过精确的插入和删除对齐显著增强保留的数据 | NA | 开发一种高效的预处理工具，用于SPLiT-seq单细胞测序数据的预处理和分类 | SPLiT-seq单细胞测序数据 | digital pathology | NA | SPLiT-seq | NA | single-cell sequencing data | NA |
| 397 | 2024-08-08 |
Upregulation of THBS1 is Related to Immunity and Chemotherapy Resistance in Gastric Cancer
2021, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S329208
PMID:34475782
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研究论文 | 本文研究了血栓调节蛋白1（THBS1）在胃癌（GC）中的表达及其与免疫浸润和化疗抵抗的关系 | 首次详细探讨了THBS1表达与胃癌中免疫浸润的关系，并分析了其与药物敏感性的关联 | 研究主要基于数据库分析和免疫组化染色，可能缺乏直接的实验验证 | 探讨THBS1在胃癌中的表达及其对预后和化疗抵抗的影响 | 胃癌患者的THBS1表达及其与免疫浸润和药物敏感性的关系 | 数字病理学 | 胃癌 | Oncomine, TIMER, TGCA, GEO, IHC染色, GSEA, ESTIMATE算法, 单细胞转录组分析, TIMER2数据库, CIBERSORT算法, CellMiner数据库 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 398 | 2024-08-08 |
Expression Characteristics and Clinical Correlations of BRD1 in Colorectal Cancer Samples
2021 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338211039678
PMID:34482774
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研究论文 | 本研究探讨了BRD1基因在结直肠癌中的表达特征及其与临床的相关性 | 首次详细研究了BRD1基因在结直肠癌细胞中的表达及其作为治疗靶点的潜力 | 研究样本量有限，且仅基于单细胞转录组测序数据和免疫组化分析 | 探讨BRD1基因在结直肠癌中的表达及其作为生物标志物的潜力 | BRD1基因在结直肠癌中的表达及其临床相关性 | NA | 结直肠癌 | 免疫组化 | NA | 转录组数据 | 临床标本及GSE17536数据集 |
| 399 | 2024-08-08 |
A Novel Single Cell RNA-seq Analysis of Non-Myeloid Circulating Cells in Late Sepsis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.696536
PMID:34484194
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了晚期脓毒症患者非髓系循环细胞的转录组特征 | 首次详细分析了晚期脓毒症患者淋巴系来源的白细胞的转录组，并识别了多种循环免疫细胞亚型的独特转录组模式 | 样本量较小，仅包括四名晚期脓毒症患者和五名健康受试者 | 通过单细胞RNA测序技术深入理解晚期脓毒症的病理机制 | 晚期脓毒症患者的非髓系循环细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 四名晚期脓毒症患者和五名健康受试者的外周血单个核细胞 |
| 400 | 2024-08-08 |
Transcriptome Profiling Reveals B-Lineage Cells Contribute to the Poor Prognosis and Metastasis of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.731896
PMID:34485161
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术鉴定了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的B细胞，并发现这些B细胞与ccRCC的不良预后和转移有关 | 首次识别出ccRCC中促进转移的B细胞亚群，并发现这些亚群与特定基因的上调有关，为治疗ccRCC的远处转移提供了新的潜在治疗靶点 | NA | 探索ccRCC中B细胞的作用及其与疾病预后和转移的关系 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的B细胞 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | NA |