单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-29 |
Machine Intelligence in Single-Cell Data Analysis: Advances and New Challenges
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.655536
PMID:34135939
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综述 | 本文综述了机器学习方法在单细胞多组学数据分析中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序数据的预处理方法和高级数据分析工具，以及多组学整合和单细胞RNA测序数据的综合分析 | NA | 探讨机器学习方法在单细胞多组学数据分析中的应用，以促进对复杂生物系统或过程的理解 | 单细胞多组学数据分析 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | NA |
| 22 | 2024-08-27 |
Regulation of cancer stem cells in triple negative breast cancer
2021, Cancer drug resistance (Alhambra, Calif.)
DOI:10.20517/cdr.2020.106
PMID:35582030
|
综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌中癌症干细胞的调控机制 | 聚焦于三阴性乳腺癌特有的机制，这些机制促进了自我更新癌症干细胞的扩张和活性 | NA | 探讨三阴性乳腺癌中癌症干细胞的特定机制及其对临床结果的影响 | 三阴性乳腺癌中的癌症干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 23 | 2024-08-27 |
The need to reassess single-cell RNA sequencing datasets: the importance of biological sample processing
2021, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.54864.2
PMID:35399227
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研究论文 | 本文重新分析了迄今为止最大的单细胞RNA测序数据集，探讨了细胞数量增加对分析结果的影响 | 提出了对当前科学界普遍认为的“越多越好”方法的质疑，指出大规模数据集可能导致分析结果的偏差 | 文章指出大规模数据集可能由于长时间的计算处理时间而影响分析的深度 | 旨在通过分析大规模单细胞RNA测序数据集，识别健康成人皮肤中先前描述的成纤维细胞亚群 | 健康成人皮肤中的成纤维细胞亚群 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 无监督群体匹配算法 | 转录组数据 | 528,253个测序细胞 |
| 24 | 2024-08-23 |
Long-Term Storage Does Not Affect the Expression Profiles of mRNA and Long Non-Coding RNA in Vitrified-Warmed Human Embryos
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.751467
PMID:35178066
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研究论文 | 本研究探讨了长期存储对人类胚胎中mRNA和长非编码RNA表达谱的影响 | 首次揭示了长期存储后的人类胚胎中mRNA和长非编码RNA表达谱的稳定性 | 研究样本量较小，且仅限于特定年龄段的女性 | 探究长期存储对人类胚胎中mRNA和长非编码RNA表达的影响 | 人类胚胎中的mRNA和长非编码RNA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 11名女性，包括3个新鲜八细胞胚胎和8个存活下来的冷冻解冻八细胞胚胎 |
| 25 | 2024-08-23 |
Building vs. Rebuilding Epidermis: Comparison Embryonic Development and Adult Wound Repair
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.796080
PMID:35145968
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综述 | 本文比较了胚胎发育与成人伤口修复过程中表皮重建的相似性与差异性 | 利用单细胞转录组学、谱系追踪和活体成像技术揭示了以往无法检测到的亚群、长期细胞命运和动态细胞行为 | NA | 探讨成人伤口修复与胚胎组织发育在表皮方面的异同 | 表皮组织 | NA | NA | 单细胞转录组学、谱系追踪、活体成像 | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-08-23 |
Analysis and Visualization of Spatial Transcriptomic Data
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.785290
PMID:35154244
|
综述 | 本文综述了空间转录组技术的核心概念及其分析和可视化方法 | 空间转录组技术能够在保留空间信息的同时测量转录组信息，扩展了分析和可视化的可能性 | NA | 总结空间基因组技术的核心概念并全面回顾当前的空间转录组分析和可视化方法 | 人类和动物组织的异质细胞类型及其空间结构 | 基因组学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 27 | 2024-08-22 |
Loss of ESRP1 blocks mouse oocyte development and leads to female infertility
2021-01-18, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.196931
PMID:33318146
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研究论文 | 研究通过干扰ESRP1控制的pre-mRNA剪接事件，发现ESRP1的缺失导致小鼠卵母细胞发育受阻和雌性不育 | 首次阐明了ESRP1介导的母源mRNA转录本的AS程序，揭示了其在卵母细胞减数分裂和雌性生育中的作用 | NA | 探究ESRP1在卵母细胞发育和雌性生育中的作用 | 小鼠卵母细胞和雌性生育能力 | NA | 雌性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及六个月大的ESRP1敲除小鼠 |
| 28 | 2024-08-21 |
Leukotriene B4 Is a Major Determinant of Leukocyte Recruitment During Otitis Media
2021, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2021.768815
PMID:35004347
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研究论文 | 本研究探讨了白三烯B4（LTB4）在急性中耳炎（OM）中的作用，通过基因表达分析和LTB4受体抑制剂的使用，观察了LTB4在炎症细胞招募中的关键作用。 | 首次详细研究了LTB4在急性中耳炎中的作用，并证明了LTB4受体拮抗剂在治疗OM中的潜在价值。 | 研究主要集中在LTB4的作用上，未全面探讨其他趋化因子在中耳炎中的作用。 | 研究LTB4在急性中耳炎中的作用及其对炎症反应的影响。 | 中耳感染非类型化流感嗜血杆菌（NTHi）的LTB4相关基因表达和中耳炎症反应。 | NA | 中耳炎 | 基因阵列分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 中耳感染NTHi的样本 |
| 29 | 2024-08-20 |
Roles of Macrophages in Atherogenesis
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.785220
PMID:34899348
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在动脉粥样硬化不同阶段中的作用，并描述了基于巨噬细胞的治疗方法 | 利用单细胞测序技术探讨了病变中巨噬细胞的异质性 | NA | 探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用及潜在治疗策略 | 巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用及其治疗潜力 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-20 |
Aging of the Hematopoietic Stem Cell Niche: New Tools to Answer an Old Question
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.738204
PMID:34858399
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综述 | 本文综述了骨髓微环境老化对造血干细胞（HSC）功能的影响，并介绍了用于研究老化过程中骨髓微环境特定改变的新工具 | 文章介绍了跨学科方法开发的新技术工具，如特定的小鼠模型、共培养系统、新的三维成像工具、骨化小体和模拟骨髓系统，以及单细胞测序技术、空间转录组学和人工智能深度学习方法在数据分析和整合中的应用 | NA | 探讨骨髓微环境老化对造血干细胞功能的影响，并介绍用于研究老化过程中骨髓微环境特定改变的新工具 | 造血干细胞（HSC）及其微环境 | NA | NA | 单细胞测序技术、空间转录组学、人工智能和深度学习 | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-20 |
Single-Cell Sequencing Reveals Differential Cell Types in Skin Tissues of Liaoning Cashmere Goats and Key Genes Related Potentially to the Fineness of Cashmere Fiber
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.726670
PMID:34858469
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和计算模型，在辽宁绒山羊的皮肤组织中鉴定了13种皮肤细胞类型，并分析了与绒毛形成相关的细胞簇中的枢纽基因 | 首次在单细胞水平上揭示了辽宁绒山羊皮肤组织中与绒毛细度相关的细胞类型和关键基因 | NA | 探究绒毛细度在细胞水平的调控机制 | 辽宁绒山羊的皮肤组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 计算模型 | 基因表达数据 | NA |
| 32 | 2024-08-20 |
The Potential Prognostic Role of Oligosaccharide-Binding Fold-Containing Protein 2A (OBFC2A) in Triple-Negative Breast Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.751430
PMID:34868954
|
研究论文 | 本研究旨在通过分析乳腺癌蛋白质组和转录组数据集，探讨三阴性乳腺癌（TNBC）的潜在预后标志物 | 发现OBFC2A蛋白在三阴性乳腺癌中具有独立的预后标志物作用，并与其免疫功能相关 | NA | 探讨三阴性乳腺癌的潜在预后标志物 | 三阴性乳腺癌患者的预后 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 蛋白质组和转录组数据 | 来自CPTAC的六种候选蛋白质，以及来自METABRIC的数据集 |
| 33 | 2024-08-19 |
The Single-Cell Transcriptomic Analysis of Prefrontal Pyramidal Cells and Interneurons Reveals the Neuronal Expression of Genes Encoding Antimicrobial Peptides and Immune Proteins
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.749433
PMID:34759929
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了前额叶锥体细胞和中间神经元中编码抗菌肽和免疫蛋白的基因表达 | 首次报道了皮质神经元中某些抗菌和免疫相关蛋白的转录表达 | 研究样本量较小，且仅限于小鼠前额叶皮质细胞 | 探讨神经元与免疫细胞之间直接通讯的分子基础 | 前额叶锥体细胞和中间神经元的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 84个细胞 |
| 34 | 2024-08-19 |
BPI overexpression suppresses Treg differentiation and induces exosome-mediated inflammation in systemic lupus erythematosus
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.63743
PMID:34815797
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析了系统性红斑狼疮（SLE）患者和健康对照者的T细胞衍生外泌体中的蛋白质，并利用转基因小鼠模型探讨了细菌通透性增加蛋白（BPI）在SLE中的潜在致病作用。 | 首次揭示了BPI在SLE中的过度表达抑制Treg分化并诱导外泌体介导的炎症反应，为SLE的病理机制提供了新的见解。 | 研究主要基于转基因小鼠模型，可能与人类SLE的实际情况存在差异。 | 探讨BPI在系统性红斑狼疮中的致病作用及其对Treg分化的影响。 | SLE患者和健康对照者的T细胞衍生外泌体中的蛋白质。 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 蛋白质组学、免疫组织化学、免疫印迹、单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 蛋白质、RNA | SLE患者和健康对照者的T细胞衍生外泌体，转基因小鼠模型 |
| 35 | 2024-08-18 |
The Advances of Single-Cell RNA-Seq in Kidney Immunology
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.752679
PMID:34721077
|
研究论文 | 本文讨论了利用单细胞RNA测序技术在肾脏免疫学中的应用，特别是针对几种特定的肾脏疾病 | 应用单细胞RNA测序技术成功定义了常驻和浸润免疫细胞的转录组特征，以及免疫细胞与邻近细胞之间的细胞内通信网络 | NA | 增加对肾脏免疫学的理解，并为肾脏疾病患者开发新的治疗方法 | 肾脏疾病的免疫细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 血液、次级淋巴组织、肾活检和尿液样本中的免疫细胞 |
| 36 | 2024-08-18 |
Discovering Myeloid Cell Heterogeneity in Mandibular Bone - Cell by Cell Analysis
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.731549
PMID:34658914
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和高通量单细胞RNA测序技术，探讨了下颌骨与长骨（股骨）中髓系前体细胞群体的差异 | 本研究首次揭示了下颌骨骨髓细胞在髓系分化方面的持续缺陷，并发现了下颌骨髓系细胞在转录组层面的独特特征 | NA | 探索不同解剖位置骨髓中髓系前体细胞群体的差异 | 下颌骨与长骨（股骨）中的髓系前体细胞 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 37 | 2024-08-17 |
Spatial Transcriptomics of Nematodes Identifies Sperm Cells as a Source of Genomic Novelty and Rapid Evolution
2021-01-04, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaa207
PMID:32785688
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研究论文 | 本文通过比较两种远缘线虫的空间转录组，揭示了精子细胞中新基因的富集及其在快速进化中的作用 | 首次在线虫中发现“睾丸外”假说，表明精子相关区域中新基因的富集 | NA | 探究基因表达的进化和新基因在空间分辨率下的作用 | 两种远缘线虫Caenorhabditis elegans和Pristionchus pacificus的空间转录组 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 两种线虫的成年虫体 |
| 38 | 2024-08-16 |
3D Atlas of the Pituitary Gland of the Model Fish Medaka (Oryzias latipes)
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.719843
PMID:34497587
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研究论文 | 本研究使用多色荧光杂交技术，首次展示了模式鱼（Medaka）垂体前叶中七种内分泌细胞类型的三维分布图谱 | 首次在模式鱼Medaka中构建了垂体前叶内分泌细胞的三维分布图谱，并揭示了性二态性和双激素细胞的存在 | NA | 旨在通过比较和综合了解内分泌细胞类型的空间分布，以更好地理解其生理功能 | 模式鱼Medaka的垂体前叶内分泌细胞 | 数字病理学 | NA | 多色荧光杂交技术，免疫荧光技术，单细胞转录组学分析 | NA | 图像 | 成年Medaka鱼 |
| 39 | 2024-08-16 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies New Inflammation-Promoting Cell Subsets in Asian Patients With Chronic Periodontitis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.711337
PMID:34566966
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了慢性牙周炎患者和健康志愿者的牙龈组织，识别出与炎症促进相关的新细胞亚群 | 本研究首次识别出HLA-DR表达的血管内皮细胞和CXCL13成纤维细胞，这些细胞与免疫调节高度相关，并揭示了促炎性NLRP3巨噬细胞在牙周炎中的作用 | 研究样本量较小，仅包括10名牙周炎患者和10名健康志愿者，可能影响结果的普遍性 | 旨在探究慢性牙周炎中炎症反应的局部微环境，并识别新的炎症促进细胞亚群 | 慢性牙周炎患者和健康志愿者的牙龈组织 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 10名牙周炎患者和10名健康志愿者 |
| 40 | 2024-08-16 |
A Novel Oral Arginase 1/2 Inhibitor Enhances the Antitumor Effect of PD-1 Inhibition in Murine Experimental Gliomas by Altering the Immunosuppressive Environment
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.703465
PMID:34504786
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研究论文 | 本文研究了一种新型口服精氨酸酶1/2抑制剂OAT-1746，通过改变免疫抑制环境增强PD-1抑制在小鼠实验性胶质瘤中的抗肿瘤效果。 | 发现OAT-1746能有效穿过血脑屏障，增加脑内精氨酸水平，并与PD-1抑制剂联合使用，显著减少胶质瘤生长并增强抗肿瘤效果。 | NA | 探索精氨酸酶1/2抑制剂在胶质母细胞瘤中的抗肿瘤潜力及其与PD-1抑制剂联合使用的疗效。 | 人及小鼠的胶质瘤细胞、肿瘤浸润性小胶质细胞和单核/巨噬细胞。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及人及小鼠的胶质瘤样本 |