单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-21 |
Leukotriene B4 Is a Major Determinant of Leukocyte Recruitment During Otitis Media
2021, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2021.768815
PMID:35004347
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研究论文 | 本研究探讨了白三烯B4（LTB4）在急性中耳炎（OM）中的作用，通过基因表达分析和LTB4受体抑制剂的使用，观察了LTB4在炎症细胞招募中的关键作用。 | 首次详细研究了LTB4在急性中耳炎中的作用，并证明了LTB4受体拮抗剂在治疗OM中的潜在价值。 | 研究主要集中在LTB4的作用上，未全面探讨其他趋化因子在中耳炎中的作用。 | 研究LTB4在急性中耳炎中的作用及其对炎症反应的影响。 | 中耳感染非类型化流感嗜血杆菌（NTHi）的LTB4相关基因表达和中耳炎症反应。 | NA | 中耳炎 | 基因阵列分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 中耳感染NTHi的样本 |
| 22 | 2024-08-20 |
Roles of Macrophages in Atherogenesis
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.785220
PMID:34899348
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在动脉粥样硬化不同阶段中的作用，并描述了基于巨噬细胞的治疗方法 | 利用单细胞测序技术探讨了病变中巨噬细胞的异质性 | NA | 探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用及潜在治疗策略 | 巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用及其治疗潜力 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-08-20 |
Aging of the Hematopoietic Stem Cell Niche: New Tools to Answer an Old Question
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.738204
PMID:34858399
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综述 | 本文综述了骨髓微环境老化对造血干细胞（HSC）功能的影响，并介绍了用于研究老化过程中骨髓微环境特定改变的新工具 | 文章介绍了跨学科方法开发的新技术工具，如特定的小鼠模型、共培养系统、新的三维成像工具、骨化小体和模拟骨髓系统，以及单细胞测序技术、空间转录组学和人工智能深度学习方法在数据分析和整合中的应用 | NA | 探讨骨髓微环境老化对造血干细胞功能的影响，并介绍用于研究老化过程中骨髓微环境特定改变的新工具 | 造血干细胞（HSC）及其微环境 | NA | NA | 单细胞测序技术、空间转录组学、人工智能和深度学习 | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-08-20 |
Single-Cell Sequencing Reveals Differential Cell Types in Skin Tissues of Liaoning Cashmere Goats and Key Genes Related Potentially to the Fineness of Cashmere Fiber
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.726670
PMID:34858469
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和计算模型，在辽宁绒山羊的皮肤组织中鉴定了13种皮肤细胞类型，并分析了与绒毛形成相关的细胞簇中的枢纽基因 | 首次在单细胞水平上揭示了辽宁绒山羊皮肤组织中与绒毛细度相关的细胞类型和关键基因 | NA | 探究绒毛细度在细胞水平的调控机制 | 辽宁绒山羊的皮肤组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 计算模型 | 基因表达数据 | NA |
| 25 | 2024-08-20 |
The Potential Prognostic Role of Oligosaccharide-Binding Fold-Containing Protein 2A (OBFC2A) in Triple-Negative Breast Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.751430
PMID:34868954
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研究论文 | 本研究旨在通过分析乳腺癌蛋白质组和转录组数据集，探讨三阴性乳腺癌（TNBC）的潜在预后标志物 | 发现OBFC2A蛋白在三阴性乳腺癌中具有独立的预后标志物作用，并与其免疫功能相关 | NA | 探讨三阴性乳腺癌的潜在预后标志物 | 三阴性乳腺癌患者的预后 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 蛋白质组和转录组数据 | 来自CPTAC的六种候选蛋白质，以及来自METABRIC的数据集 |
| 26 | 2024-08-19 |
The Single-Cell Transcriptomic Analysis of Prefrontal Pyramidal Cells and Interneurons Reveals the Neuronal Expression of Genes Encoding Antimicrobial Peptides and Immune Proteins
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.749433
PMID:34759929
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了前额叶锥体细胞和中间神经元中编码抗菌肽和免疫蛋白的基因表达 | 首次报道了皮质神经元中某些抗菌和免疫相关蛋白的转录表达 | 研究样本量较小，且仅限于小鼠前额叶皮质细胞 | 探讨神经元与免疫细胞之间直接通讯的分子基础 | 前额叶锥体细胞和中间神经元的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 84个细胞 |
| 27 | 2024-08-19 |
BPI overexpression suppresses Treg differentiation and induces exosome-mediated inflammation in systemic lupus erythematosus
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.63743
PMID:34815797
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析了系统性红斑狼疮（SLE）患者和健康对照者的T细胞衍生外泌体中的蛋白质，并利用转基因小鼠模型探讨了细菌通透性增加蛋白（BPI）在SLE中的潜在致病作用。 | 首次揭示了BPI在SLE中的过度表达抑制Treg分化并诱导外泌体介导的炎症反应，为SLE的病理机制提供了新的见解。 | 研究主要基于转基因小鼠模型，可能与人类SLE的实际情况存在差异。 | 探讨BPI在系统性红斑狼疮中的致病作用及其对Treg分化的影响。 | SLE患者和健康对照者的T细胞衍生外泌体中的蛋白质。 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 蛋白质组学、免疫组织化学、免疫印迹、单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 蛋白质、RNA | SLE患者和健康对照者的T细胞衍生外泌体，转基因小鼠模型 |
| 28 | 2024-08-18 |
The Advances of Single-Cell RNA-Seq in Kidney Immunology
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.752679
PMID:34721077
|
研究论文 | 本文讨论了利用单细胞RNA测序技术在肾脏免疫学中的应用，特别是针对几种特定的肾脏疾病 | 应用单细胞RNA测序技术成功定义了常驻和浸润免疫细胞的转录组特征，以及免疫细胞与邻近细胞之间的细胞内通信网络 | NA | 增加对肾脏免疫学的理解，并为肾脏疾病患者开发新的治疗方法 | 肾脏疾病的免疫细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 血液、次级淋巴组织、肾活检和尿液样本中的免疫细胞 |
| 29 | 2024-08-18 |
Discovering Myeloid Cell Heterogeneity in Mandibular Bone - Cell by Cell Analysis
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.731549
PMID:34658914
|
研究论文 | 本研究通过流式细胞术和高通量单细胞RNA测序技术，探讨了下颌骨与长骨（股骨）中髓系前体细胞群体的差异 | 本研究首次揭示了下颌骨骨髓细胞在髓系分化方面的持续缺陷，并发现了下颌骨髓系细胞在转录组层面的独特特征 | NA | 探索不同解剖位置骨髓中髓系前体细胞群体的差异 | 下颌骨与长骨（股骨）中的髓系前体细胞 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 30 | 2024-08-17 |
Spatial Transcriptomics of Nematodes Identifies Sperm Cells as a Source of Genomic Novelty and Rapid Evolution
2021-01-04, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaa207
PMID:32785688
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研究论文 | 本文通过比较两种远缘线虫的空间转录组，揭示了精子细胞中新基因的富集及其在快速进化中的作用 | 首次在线虫中发现“睾丸外”假说，表明精子相关区域中新基因的富集 | NA | 探究基因表达的进化和新基因在空间分辨率下的作用 | 两种远缘线虫Caenorhabditis elegans和Pristionchus pacificus的空间转录组 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 两种线虫的成年虫体 |
| 31 | 2024-08-16 |
3D Atlas of the Pituitary Gland of the Model Fish Medaka (Oryzias latipes)
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.719843
PMID:34497587
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研究论文 | 本研究使用多色荧光杂交技术，首次展示了模式鱼（Medaka）垂体前叶中七种内分泌细胞类型的三维分布图谱 | 首次在模式鱼Medaka中构建了垂体前叶内分泌细胞的三维分布图谱，并揭示了性二态性和双激素细胞的存在 | NA | 旨在通过比较和综合了解内分泌细胞类型的空间分布，以更好地理解其生理功能 | 模式鱼Medaka的垂体前叶内分泌细胞 | 数字病理学 | NA | 多色荧光杂交技术，免疫荧光技术，单细胞转录组学分析 | NA | 图像 | 成年Medaka鱼 |
| 32 | 2024-08-16 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies New Inflammation-Promoting Cell Subsets in Asian Patients With Chronic Periodontitis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.711337
PMID:34566966
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了慢性牙周炎患者和健康志愿者的牙龈组织，识别出与炎症促进相关的新细胞亚群 | 本研究首次识别出HLA-DR表达的血管内皮细胞和CXCL13成纤维细胞，这些细胞与免疫调节高度相关，并揭示了促炎性NLRP3巨噬细胞在牙周炎中的作用 | 研究样本量较小，仅包括10名牙周炎患者和10名健康志愿者，可能影响结果的普遍性 | 旨在探究慢性牙周炎中炎症反应的局部微环境，并识别新的炎症促进细胞亚群 | 慢性牙周炎患者和健康志愿者的牙龈组织 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 10名牙周炎患者和10名健康志愿者 |
| 33 | 2024-08-16 |
A Novel Oral Arginase 1/2 Inhibitor Enhances the Antitumor Effect of PD-1 Inhibition in Murine Experimental Gliomas by Altering the Immunosuppressive Environment
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.703465
PMID:34504786
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研究论文 | 本文研究了一种新型口服精氨酸酶1/2抑制剂OAT-1746，通过改变免疫抑制环境增强PD-1抑制在小鼠实验性胶质瘤中的抗肿瘤效果。 | 发现OAT-1746能有效穿过血脑屏障，增加脑内精氨酸水平，并与PD-1抑制剂联合使用，显著减少胶质瘤生长并增强抗肿瘤效果。 | NA | 探索精氨酸酶1/2抑制剂在胶质母细胞瘤中的抗肿瘤潜力及其与PD-1抑制剂联合使用的疗效。 | 人及小鼠的胶质瘤细胞、肿瘤浸润性小胶质细胞和单核/巨噬细胞。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及人及小鼠的胶质瘤样本 |
| 34 | 2024-08-16 |
Single Cell Transcriptome Helps Better Understanding Crosstalk in Diabetic Kidney Disease
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.657614
PMID:34485320
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在糖尿病肾病（DKD）中细胞间对话方面的最新进展 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术深入理解DKD在细胞水平上的异质性和遗传易感性 | NA | 旨在回顾单细胞转录组分析在DKD中的最新进展，特别是肾内或肾外细胞间的对话 | 糖尿病肾病（DKD）中的细胞间对话、细胞靶点和潜在治疗策略 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 35 | 2024-08-15 |
N6-Methyladenosine Regulators and Related LncRNAs Are Potential to be Prognostic Markers for Uveal Melanoma and Indicators of Tumor Microenvironment Remodeling
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.704543
PMID:34395276
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研究论文 | 本研究探讨了N6-甲基腺苷（mA）调节因子和相关长链非编码RNA（lncRNA）在葡萄膜黑色素瘤（UM）中的预后标志物作用及其对肿瘤微环境（TME）重塑的影响 | 首次系统地识别了mA调节因子，并构建了基于mA调节因子的预后风险签名，通过单细胞测序数据验证了其在UM中的表达分布 | NA | 探索mA调节因子和相关lncRNA在UM中的预后标志物作用及对TME的影响 | 葡萄膜黑色素瘤患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞测序 | LASSO Cox分析 | 转录组数据 | 基于The Cancer Genome Atlas的转录组和临床数据，以及GSE139829数据集的单细胞测序数据 |
| 36 | 2024-08-13 |
Therapeutic Targeting of Transcription Factors to Control the Cytokine Release Syndrome in COVID-19
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.673485
PMID:34163359
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研究论文 | 本文系统探索了COVID-19中细胞因子释放综合征（CRS）相关的炎症细胞因子的转录调控因子，以识别可用于治疗靶点的转录因子（TFs）及其已批准的药物 | 本文通过整合TF-细胞因子基因相互作用资源与单细胞RNA-seq表达数据，发现了与COVID-19患者中上调的16种细胞因子相关的95个TFs，并识别出19个可作为FDA批准药物靶点的TFs | 需要进一步研究这些候选药物的重新定位，以确定治疗COVID-19患者CRS的有效疗法 | 探索COVID-19中CRS的治疗方法 | COVID-19患者的细胞因子释放综合征 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA | 来自COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液细胞 |
| 37 | 2024-08-12 |
An integrative microenvironment approach for laryngeal carcinoma: the role of immune/methylation/autophagy signatures on disease clinical prognosis and single-cell genotypes
2021, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.58076
PMID:34093817
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研究论文 | 本研究全面探讨了甲基化/自噬相关基因（MARGs）和免疫浸润在肿瘤微环境中对喉癌预后的影响 | 本研究结合单细胞和转录组学分析，探索了肿瘤微环境与预后特征之间的联系，并建立了基于神经网络的深度学习模型 | NA | 探讨甲基化/自噬相关基因和免疫浸润在肿瘤微环境中对喉癌预后的影响 | 喉癌的预后和单细胞基因型 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 基因数据 | 126个MARGs和10种免疫细胞，以及临床样本和GEO数据集 |
| 38 | 2024-08-11 |
Single-cell transcriptome analysis of the heterogeneous effects of differential expression of tumor PD-L1 on responding TCR-T cells
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.55075
PMID:33754038
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研究论文 | 研究分析了肿瘤PD-L1表达差异对TCR-T细胞功能的影响 | 首次深入评估了肿瘤PD-L1表达差异如何影响T细胞功能，并揭示了PD-L1表达增加对不同抑制检查点分子的不同影响 | 研究中肿瘤细胞和T细胞死亡信号富集与肿瘤PD-L1表达增加之间的相关性有限 | 探究肿瘤PD-L1表达差异对TCR-T细胞功能的影响 | TCR-T细胞在不同PD-L1表达水平的肿瘤环境中的反应 | 数字病理学 | 恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用MART-1特异性TCR-T细胞与表达不同比例PD-L1的MEL-526肿瘤细胞进行实验 |
| 39 | 2024-08-11 |
A Cancer Cell Cluster Marked by LincRNA MEG3 Leads Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Metastasis
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.656564
PMID:34055623
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了胰腺导管腺癌（PDAC）原发和转移组织的基因表达差异，发现了一个由长链非编码RNA MEG3标记的癌症细胞亚群，该亚群与PDAC的转移密切相关 | 首次揭示了由LincRNA MEG3标记的PDAC癌症细胞亚群在肿瘤转移中的关键作用 | NA | 探索驱动胰腺导管腺癌细胞转移的基因程序和核心调控因子 | 胰腺导管腺癌的原发和转移组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 40 | 2024-08-09 |
Cell type prioritization in single-cell data
2021-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0605-1
PMID:32690972
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Augur的方法，用于在单细胞数据中优先考虑对生物扰动最敏感的细胞类型 | Augur采用机器学习框架量化高维空间中扰动和未扰动细胞的可分离性，并在单细胞RNA测序、染色质可及性和成像转录组学数据集上验证了其方法，显示出优于基于差异基因表达的现有方法 | NA | 开发和验证一种新的方法来优先考虑单细胞数据中对生物扰动最敏感的细胞类型 | 单细胞RNA测序、染色质可及性和成像转录组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习框架 | 单细胞数据 | 涉及小鼠脊髓神经刺激后的神经回路样本 |