单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-08 |
Differential expression profile of gluten-specific T cells identified by single-cell RNA-seq
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0258029
PMID:34618841
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了未治疗乳糜泻患者血液中通过四聚体染色法分离的麸质特异性T细胞的表达谱 | 首次使用单细胞RNA测序研究四聚体染色法分离的T细胞，揭示了麸质特异性T细胞独特的转录组特征 | NA | 探究麸质特异性T细胞在乳糜泻发病机制中的作用 | 未治疗乳糜泻患者血液中的麸质特异性CD4+ T细胞 | NA | 乳糜泻 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 362 | 2024-08-08 |
Integration of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq to Analyse the Heterogeneity of Ovarian Cancer Immune Cells and Establish a Molecular Risk Model
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.711020
PMID:34621670
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序数据，分析了卵巢癌免疫细胞的异质性，并建立了一个分子风险模型。 | 利用scRNA-seq和批量RNA-seq数据整合分析，首次建立了基于卵巢癌免疫细胞异质性的双基因风险模型。 | 研究主要基于公共数据库中的数据，未提及临床样本的验证。 | 旨在通过分析卵巢癌免疫细胞的异质性，建立一个准确的预后风险评估模型。 | 卵巢癌免疫细胞及其分子特征。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 整合了两个scRNA-seq数据集（GSE154600和GES158937），共20个细胞集群。 |
| 363 | 2024-08-08 |
Case Report: Multi-Omics Analysis and CAR-T Treatment of a Chronic Myeloid Leukemia Blast Crisis Case 5 Years After the Discontinuation of TKI
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.739871
PMID:34621680
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病例报告 | 报道了一例在酪氨酸激酶抑制剂停用5年后突然发生慢性髓性白血病淋巴母细胞危象的病例，并通过多组学分析和CAR-T细胞治疗进行了研究 | 首次报道了在长期无治疗缓解后突然发生淋巴母细胞危象的慢性髓性白血病病例，并发现除了BCR-ABL1外的其他基因异常可能参与疾病进展 | 病例报告仅基于单一病例，可能缺乏广泛的代表性 | 探讨慢性髓性白血病在酪氨酸激酶抑制剂停用后突然发生淋巴母细胞危象的分子特征及治疗策略 | 慢性髓性白血病病例及其分子特征和治疗反应 | NA | 慢性髓性白血病 | DNA测序、RNA测序、单细胞转录组测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 单一病例 |
| 364 | 2024-08-08 |
Fluorescent Multiplex Immunohistochemistry Coupled With Other State-Of-The-Art Techniques to Systematically Characterize the Tumor Immune Microenvironment
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.673042
PMID:34621785
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研究论文 | 本文综述了利用荧光多重免疫组织化学与其他先进技术系统地表征肿瘤免疫微环境的方法 | 介绍了空间转录组学分析和多重免疫组织化学面板的开发，以识别肿瘤微环境中的特定细胞类型 | 文章未明确提及具体的技术限制 | 探讨肿瘤免疫微环境的研究方法及其在临床应用中的潜力 | 肿瘤免疫微环境中的免疫细胞及其在肿瘤进展和治疗反应中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 荧光多重免疫组织化学, 空间转录组学 | NA | 组织切片 | HER2+ 乳腺癌样本, 管腔B型乳腺癌肿瘤样本 |
| 365 | 2024-08-08 |
NMDARs Drive the Expression of Neuropsychiatric Disorder Risk Genes Within GABAergic Interneuron Subtypes in the Juvenile Brain
2021, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2021.712609
PMID:34630033
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，探讨了NMDA型谷氨酸受体亚基基因在MGE来源的特定类型中间神经元中的转录调控作用及其对神经发育障碍的影响 | 首次揭示了NMDAR在特定类型中间神经元中的转录调控作用，并关联到神经精神障碍的风险基因表达 | 对分子机制的调控细节理解尚不充分 | 探究NMDAR信号在中间神经元亚型中的系统性作用，寻找可能的MGE特异性遗传靶点 | MGE来源的PV+、SST+和NGFC型皮层及海马中间神经元 | 神经科学 | 神经精神障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 366 | 2024-08-08 |
Connexin 43-Mediated Gap Junction Communication Regulates Ameloblast Differentiation via ERK1/2 Phosphorylation
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.748574
PMID:34630166
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研究论文 | 本文研究了连接蛋白43（Cx43）通过间隙连接通信调节成釉细胞分化的机制，特别是通过ERK1/2磷酸化途径。 | 本文首次揭示了Cx43通过间隙连接活动调节TGF-β1介导的ERK信号传导和牙釉质形成的作用，并探讨了Cx43作为钙通道在慢钙内流和ERK1/2磷酸化中的功能。 | NA | 阐明Cx43在牙釉质形成中的作用及其分子机制。 | Cx43在牙齿发育中的表达和功能，以及其在oculodentodigital dysplasia（ODDD）病理性机制中的作用。 | NA | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序分析，免疫染色 | NA | RNA序列，蛋白质表达 | 包括Cx43突变的小鼠模型和不同细胞密度的细胞培养实验。 |
| 367 | 2024-08-08 |
Inferring Copy Number from Triple-Negative Breast Cancer Patient Derived Xenograft scRNAseq Data Using scCNA
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1740-3_16
PMID:34590283
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研究论文 | 本文描述了一种从三阴性乳腺癌患者来源的异种移植模型中分离单细胞悬液，并使用scRNAseq技术进行单细胞RNA测序，以获取推断的拷贝数变异轮廓的方法 | 本文采用scCNA技术从单细胞RNA测序数据中推断拷贝数变异，有助于深入理解肿瘤内异质性 | NA | 研究旨在通过单细胞分辨率的数据分析，增强对肿瘤内异质性的理解，并识别遗传脆弱性，开发有效疗法 | 三阴性乳腺癌患者来源的异种移植模型的单细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNAseq | NA | 转录组数据 | 从TNBC患者来源的异种移植模型中分离的单细胞悬液 |
| 368 | 2024-08-08 |
Immune Cell Landscape of Patients With Diabetic Macular Edema by Single-Cell RNA Analysis
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.754933
PMID:34594230
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了糖尿病黄斑水肿患者的免疫细胞图谱 | 首次构建了糖尿病黄斑水肿患者的免疫细胞图谱，并证实了外周血中先天免疫失调的存在 | NA | 确定糖尿病黄斑水肿患者外周免疫细胞的表型和功能 | 糖尿病黄斑水肿患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | 57,650个外周血单个核细胞（24,919个健康对照，32,731个糖尿病黄斑水肿患者） |
| 369 | 2024-08-08 |
Characterization of Organ-Specific Regulatory B Cells Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.711980
PMID:34594327
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞B细胞受体测序（scBCR-seq）技术，对小鼠不同器官（脾脏、肝脏、肠系膜淋巴结、骨髓和腹腔）的B细胞进行分析，以更好地定义这些细胞的表型 | 本研究首次鉴定了19个在调节性B细胞（Breg）中显著表达的共同基因，并分析了这些细胞中的转录因子活性，揭示了七个器官特异性的Breg细胞亚群 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 旨在深入了解调节性B细胞（Breg）在不同器官中的异质性及其功能 | 小鼠不同器官（脾脏、肝脏、肠系膜淋巴结、骨髓和腹腔）的B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞B细胞受体测序（scBCR-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠器官的B细胞样本 |
| 370 | 2024-08-08 |
A Systematic Review of the Tumor-Infiltrating CD8+ T-Cells/PD-L1 Axis in High-Grade Glial Tumors: Toward Personalized Immuno-Oncology
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.734956
PMID:34603316
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综述 | 本文通过系统综述探讨了高级别胶质瘤中肿瘤浸润性CD8+ T细胞/PD-L1轴的临床意义及其对患者抗癌治疗反应率的影响 | 通过单细胞测序技术分析肿瘤微环境中细胞的抑制性免疫检查点表达模式，为基于数据的免疫检查点抑制剂治疗提供新策略 | 综述主要基于已发表的研究，可能存在样本选择偏倚和研究质量不一的问题 | 旨在阐明肿瘤浸润性CD8+ T细胞/PD-L1轴在高级别胶质瘤中的临床意义及其对患者治疗反应的影响 | 高级别胶质瘤患者及其肿瘤浸润性CD8+ T细胞和PD-L1表达 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 371 | 2024-08-08 |
Multiomics Analysis Reveals the Prognostic Non-tumor Cell Landscape in Glioblastoma Niches
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.741325
PMID:34603399
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研究论文 | 本研究旨在全面描述原发性胶质母细胞瘤微环境中非肿瘤细胞的特征及其预后影响 | 研究首次详细描述了胶质母细胞瘤微环境中非恶性细胞的预后效应，并发现了不同细胞类型在免疫反应中的作用 | NA | 揭示胶质母细胞瘤微环境中非肿瘤细胞的预后效应 | 胶质母细胞瘤微环境中的非肿瘤细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 基因表达谱分析 | NA | 基因表达数据 | 967例胶质母细胞瘤样本 |
| 372 | 2024-08-08 |
Tumor-Infiltrating PD-1hiCD8+-T-Cell Signature as an Effective Biomarker for Immune Checkpoint Inhibitor Therapy Response Across Multiple Cancers
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.695006
PMID:34604032
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研究论文 | 本文构建了一种基于PD-1hiCD8+ T细胞转录组特征的生物标志物，用于预测多种癌症对免疫检查点抑制剂治疗的反应 | 首次利用RNA测序数据量化PD-1hiCD8+ T细胞，并验证其在多种癌症类型中的应用 | NA | 开发一种有效的生物标志物，用于预测患者对免疫检查点抑制剂治疗的反应 | PD-1hiCD8+ T细胞在肿瘤浸润免疫细胞中的作用 | 数字病理学 | 多种癌症 | RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 581个临床样本和204个鼠模型 |
| 373 | 2024-08-08 |
The Dynamic Changes of Transcription Factors During the Development Processes of Human Biparental and Uniparental Embryos
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.709498
PMID:34604214
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术系统地研究了早期胚胎发育过程中转录因子的表达谱，揭示了人类双亲和单亲胚胎发育过程中转录因子的动态变化 | 首次系统地研究了单亲胚胎发育过程中转录因子的作用，并发现了多种特定类型的转录因子 | NA | 研究转录因子在人类双亲和单亲胚胎发育过程中的作用 | 转录因子在早期胚胎发育中的表达和功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多种类型的胚胎样本 |
| 374 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq of Cisplatin-Treated Adult Stria Vascularis Identifies Cell Type-Specific Regulatory Networks and Novel Therapeutic Gene Targets
2021, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2021.718241
PMID:34566577
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究顺铂处理后的成年鼠血管纹细胞，识别细胞类型特异性的调控网络和新的治疗基因靶点。 | 本文首次结合顺铂处理和单细胞RNA测序技术，揭示了血管纹细胞在顺铂暴露下的转录变化，并识别了独特的基因调控网络和可药物干预的基因靶点。 | NA | 旨在建立内耳电位功能障碍模型，进行转录分析和治疗测试。 | 成年鼠血管纹细胞在顺铂处理后的转录变化和治疗基因靶点。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年鼠 |
| 375 | 2024-08-08 |
Inhibition of BCL9 Modulates the Cellular Landscape of Tumor-Associated Macrophages in the Tumor Immune Microenvironment of Colorectal Cancer
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.713331
PMID:34566638
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研究论文 | 研究通过单细胞测序探讨BCL9抑制对结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）细胞景观的影响 | 首次提出TAM-to-NK评分，评估肿瘤微环境中单核细胞/TAM细胞与NK样非功能细胞的动态平衡 | NA | 探讨BCL9抑制对结直肠癌肿瘤微环境中TAMs细胞类型平衡和转录差异的影响 | 结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 376 | 2024-08-08 |
Gene Signatures of NEUROGENIN3+ Endocrine Progenitor Cells in the Human Pancreas
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.736286
PMID:34566896
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术深入探索人类胰腺中NEUROGENIN3+（NEUROG3+）内分泌前体细胞的分子程序 | 首次在人类中直接利用单细胞RNA测序技术研究NEUROG3+细胞，并揭示了其独特的基因特征和调控网络 | NA | 探索人类胰腺中NEUROG3+细胞的分子程序，以促进糖尿病治疗中β细胞再生的疗法开发 | 人类胰腺中的NEUROG3+内分泌前体细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,174个胰腺细胞中的10个NEUROG3+上皮细胞 |
| 377 | 2024-08-08 |
Unraveling the Heterogeneity and Ontogeny of Dendritic Cells Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.711329
PMID:34566965
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术揭示树突状细胞（DCs）的异质性和发育过程的最新进展 | 利用scRNA-seq技术深入探讨了DCs的重新分类和发育，以及在疾病中DCs的异质性和多功能性 | NA | 探讨树突状细胞的异质性和发育过程 | 树突状细胞（DCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | NA |
| 378 | 2024-08-08 |
AdImpute: An Imputation Method for Single-Cell RNA-Seq Data Based on Semi-Supervised Autoencoders
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.739677
PMID:34567089
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研究论文 | 本文介绍了一种基于半监督自编码器的单细胞RNA测序数据插补方法AdImpute | AdImpute方法使用另一种插补方法的结果作为自编码器的插补权重，并通过带有插补权重的成本函数学习数据的潜在信息，实现更准确的插补 | NA | 开发一种更准确的单细胞RNA测序数据插补方法 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | RNA测序数据 | 模拟数据集和真实数据集 |
| 379 | 2024-08-08 |
The Stromal and Immune Landscape of Nasopharyngeal Carcinoma and Its Implications for Precision Medicine Targeting the Tumor Microenvironment
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.744889
PMID:34568077
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综述 | 本文综述了鼻咽癌（NPC）的基质和免疫景观，并探讨了针对肿瘤微环境（TME）的精准医疗方法 | 利用单细胞测序技术解析了NPC浸润细胞的基质组成和功能动态，为精准治疗提供了新的视角 | 缺乏对TME的深入理解，限制了治疗的发展和优化 | 详细描绘NPC的基质景观，并提出基于微环境的精准治疗方法 | 鼻咽癌的肿瘤微环境及其对治疗的影响 | NA | 鼻咽癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 380 | 2024-08-08 |
Identify differential genes and cell subclusters from time-series scRNA-seq data using scTITANS
2021, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2021.07.016
PMID:34527187
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研究论文 | 本文提出了一种名为scTITANS的方法，用于从时间序列单细胞RNA测序数据中识别差异基因和细胞亚群 | scTITANS通过使用轨迹推断分析的伪时间来校正细胞异步性，并引入基于时间序列分析方法的时间依赖协变量，从而更准确、定量地处理细胞间的异质性并充分利用生物过程中的时间信息 | NA | 开发一种有效工具，用于从时间序列单细胞RNA测序数据中识别差异基因和细胞亚群 | 时间序列单细胞RNA测序数据中的差异基因和细胞亚群 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 时间序列数据 | 多个时间点的单细胞样本 |