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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-08 |
Full-Length Transcriptome: A Reliable Alternative for Single-Cell RNA-Seq Analysis in the Spleen of Teleost Without Reference Genome
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.737332
PMID:34646272
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研究论文 | 本文提出了一种使用全长转录组作为参考的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析方法,并在没有已知基因组的硬骨鱼样本中进行了评估 | 本文提出的方法不依赖于参考基因组,适用于没有参考基因组的鱼类研究,为scRNA-seq数据分析提供了一种可靠的替代方案 | NA | 旨在开发和评估一种新的scRNA-seq数据分析方法,以在没有参考基因组的硬骨鱼中识别和表征免疫细胞亚群 | 硬骨鱼的脾脏中的免疫细胞亚群 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-08-08 |
SCMAG: A Semisupervised Single-Cell Clustering Method Based on Matrix Aggregation Graph Convolutional Neural Network
2021, Computational and mathematical methods in medicine
DOI:10.1155/2021/6842752
PMID:34646337
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研究论文 | 本文提出了一种基于矩阵聚合图卷积神经网络的半监督单细胞聚类方法SCMAG | SCMAG充分利用了单细胞数据的先验信息,提高了聚类算法的准确性 | NA | 旨在提高单细胞数据聚类分析的准确性 | 单细胞数据 | 机器学习 | NA | 图卷积神经网络 | 图卷积神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 不同单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 363 | 2024-08-08 |
Tryptophan metabolism is inversely regulated in the tumor and blood of patients with glioblastoma
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.60679
PMID:34646367
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研究论文 | 本文研究了胶质母细胞瘤患者肿瘤和血液中色氨酸代谢的反向调控,并开发了新的技术来支持针对色氨酸分解酶或芳香烃受体激活的治疗 | 开发了结合LC-MS/MS与化学同位素标记的方法,用于同时定量比较色氨酸及其代谢物,并应用MALDI MSI和scRNA-seq技术分析色氨酸代谢和芳香烃受体活性 | NA | 更好地理解色氨酸代谢,支持针对色氨酸分解酶或芳香烃受体的治疗 | 胶质母细胞瘤患者的色氨酸代谢 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | LC-MS/MS, MALDI MSI, scRNA-seq | 人工神经网络 | 血液样本, 肿瘤组织 | 43名复发性胶质母细胞瘤患者和43名年龄性别匹配的健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 364 | 2024-08-08 |
Tumor microenvironment-based screening repurposes drugs targeting cancer stem cells and cancer-associated fibroblasts
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.62676
PMID:34646392
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研究论文 | 本研究旨在建立基于肿瘤微环境(TME)的筛选方法,以识别能够特异性靶向癌症干细胞(CSCs)和癌症相关成纤维细胞(CAFs)的药物 | 开发了一种基于肿瘤微环境的高通量药物筛选平台,并利用单细胞RNA测序技术评估药物在CSCs和CAFs中的作用机制 | NA | 建立基于肿瘤微环境的药物筛选平台,以加速药物开发和治疗应用 | 肺癌患者来源的癌细胞和CAFs,以及CSCs和CAFs | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 1,524种化合物 | NA | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-08-08 |
Single Cell RNA-Sequencing Reveals a Murine Gallbladder Cell Transcriptome Atlas During the Process of Cholesterol Gallstone Formation
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.714271
PMID:34650971
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了胆固醇结石形成过程中小鼠胆囊细胞的转录组图谱 | 首次展示了胆固醇结石形成过程中小鼠胆囊细胞的细胞异质性和转录组动态变化 | NA | 揭示胆固醇结石形成过程中胆囊细胞的变化,增进对疾病发病机制和治疗的理解 | 小鼠胆囊细胞在胆固醇结石形成过程中的转录组变化 | 数字病理学 | 胆石症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Peripheral Blood Reveals a Novel B-Cell Subset in Renal Allograft Recipients With Accommodation
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.706580
PMID:34658852
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析肾移植受者的外周血细胞,揭示了免疫抑制剂对免疫细胞亚群的新机制 | 发现了一个新的B细胞亚群(CD19IGLC3IGKCTCL1ACD127),该亚群在肾移植受者中显著减少,并显示出激活潜力 | 样本量较小,仅包括三名个体 | 描述肾移植受者免疫耐受的细节,并揭示免疫抑制剂对免疫细胞亚群的影响机制 | 肾移植受者的外周T细胞、B细胞、髓系细胞和NK细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 总共8,272个细胞,来自三名个体,包括2,758个健康对照细胞,2,550个ESRD患者细胞和2,964个肾移植患者细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-08-08 |
Expansion of Human Papillomavirus-Specific T Cells in Periphery and Cervix in a Therapeutic Vaccine Recipient Whose Cervical High-Grade Squamous Intraepithelial Lesion Regressed
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.645299
PMID:34659195
|
研究论文 | 本文描述了一位接受HPV治疗性疫苗PepCan的女性,其宫颈高级别鳞状上皮内病变完全消退,并通过T细胞受体β深度测序分析了疫苗接种前后的T细胞反应。 | 结合传统和前沿的免疫监测技术,首次展示了HPV抗原特异性T细胞不仅在外周血中,而且在宫颈中的扩增。 | NA | 研究HPV治疗性疫苗对T细胞反应的影响,并验证疫苗特异性T细胞的存在。 | HPV治疗性疫苗PepCan接种者的T细胞反应及宫颈病变消退情况。 | 免疫学 | 宫颈疾病 | T细胞受体β深度测序 | NA | 单细胞RNA测序和TCR测序数据 | 70个可能的疫苗特异性克隆型 | NA | NA | NA | NA |
| 368 | 2024-08-08 |
Phytohormone-Based Regulation of Trichome Development
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.734776
PMID:34659303
|
综述 | 本文综述了植物激素对毛状体发育的调控作用 | 介绍了CRISPR-Cas9系统和单细胞转录组学等新技术在研究毛状体细胞系调控网络中的应用 | NA | 探讨植物激素对毛状体发育的调控机制 | 植物毛状体的发育 | NA | NA | CRISPR-Cas9系统, 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 369 | 2024-08-08 |
From GWAS to Gene: Transcriptome-Wide Association Studies and Other Methods to Functionally Understand GWAS Discoveries
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.713230
PMID:34659337
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综述 | 本文综述了结合功能基因组学知识与全基因组关联研究(GWAS)的数据整合生物信息学方法,以识别遗传调控基因 | 介绍了转录组广泛关联研究(TWAS)作为一种基因基础的关联方法,能够减少多重检验负担,并讨论了不同TWAS方法的设计和生物学假设 | 文章未明确提及具体限制 | 探讨如何通过数据整合方法更好地理解GWAS发现与复杂疾病机制之间的关系 | 全基因组关联研究(GWAS)发现的非编码区域及其在复杂人类疾病和性状中的功能 | 基因组学 | NA | 全基因组关联研究(GWAS),转录组广泛关联研究(TWAS) | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 370 | 2024-08-08 |
Identification of Specific Cell Subpopulations and Marker Genes in Ovarian Cancer Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/1005793
PMID:34660776
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析卵巢癌细胞中的特定细胞亚群和标记基因 | 揭示了卵巢癌中的特定细胞亚群和标记基因,为卵巢癌的异质性提供了新的见解 | NA | 分析卵巢癌细胞中的特定细胞亚群和标记基因 | 卵巢癌细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 66个高级别浆液性卵巢癌细胞样本和568个卵巢癌样本及8个正常卵巢样本 | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2024-08-08 |
Differential expression profile of gluten-specific T cells identified by single-cell RNA-seq
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0258029
PMID:34618841
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了未治疗乳糜泻患者血液中通过四聚体染色法分离的麸质特异性T细胞的表达谱 | 首次使用单细胞RNA测序研究四聚体染色法分离的T细胞,揭示了麸质特异性T细胞独特的转录组特征 | NA | 探究麸质特异性T细胞在乳糜泻发病机制中的作用 | 未治疗乳糜泻患者血液中的麸质特异性CD4+ T细胞 | NA | 乳糜泻 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-08-08 |
Integration of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq to Analyse the Heterogeneity of Ovarian Cancer Immune Cells and Establish a Molecular Risk Model
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.711020
PMID:34621670
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序数据,分析了卵巢癌免疫细胞的异质性,并建立了一个分子风险模型。 | 利用scRNA-seq和批量RNA-seq数据整合分析,首次建立了基于卵巢癌免疫细胞异质性的双基因风险模型。 | 研究主要基于公共数据库中的数据,未提及临床样本的验证。 | 旨在通过分析卵巢癌免疫细胞的异质性,建立一个准确的预后风险评估模型。 | 卵巢癌免疫细胞及其分子特征。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 整合了两个scRNA-seq数据集(GSE154600和GES158937),共20个细胞集群。 | NA | NA | NA | NA |
| 373 | 2024-08-08 |
Case Report: Multi-Omics Analysis and CAR-T Treatment of a Chronic Myeloid Leukemia Blast Crisis Case 5 Years After the Discontinuation of TKI
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.739871
PMID:34621680
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病例报告 | 报道了一例在酪氨酸激酶抑制剂停用5年后突然发生慢性髓性白血病淋巴母细胞危象的病例,并通过多组学分析和CAR-T细胞治疗进行了研究 | 首次报道了在长期无治疗缓解后突然发生淋巴母细胞危象的慢性髓性白血病病例,并发现除了BCR-ABL1外的其他基因异常可能参与疾病进展 | 病例报告仅基于单一病例,可能缺乏广泛的代表性 | 探讨慢性髓性白血病在酪氨酸激酶抑制剂停用后突然发生淋巴母细胞危象的分子特征及治疗策略 | 慢性髓性白血病病例及其分子特征和治疗反应 | NA | 慢性髓性白血病 | DNA测序、RNA测序、单细胞转录组测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 单一病例 | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2024-08-08 |
Fluorescent Multiplex Immunohistochemistry Coupled With Other State-Of-The-Art Techniques to Systematically Characterize the Tumor Immune Microenvironment
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.673042
PMID:34621785
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研究论文 | 本文综述了利用荧光多重免疫组织化学与其他先进技术系统地表征肿瘤免疫微环境的方法 | 介绍了空间转录组学分析和多重免疫组织化学面板的开发,以识别肿瘤微环境中的特定细胞类型 | 文章未明确提及具体的技术限制 | 探讨肿瘤免疫微环境的研究方法及其在临床应用中的潜力 | 肿瘤免疫微环境中的免疫细胞及其在肿瘤进展和治疗反应中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 荧光多重免疫组织化学, 空间转录组学 | NA | 组织切片 | HER2+ 乳腺癌样本, 管腔B型乳腺癌肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 375 | 2024-08-08 |
NMDARs Drive the Expression of Neuropsychiatric Disorder Risk Genes Within GABAergic Interneuron Subtypes in the Juvenile Brain
2021, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2021.712609
PMID:34630033
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术,探讨了NMDA型谷氨酸受体亚基基因在MGE来源的特定类型中间神经元中的转录调控作用及其对神经发育障碍的影响 | 首次揭示了NMDAR在特定类型中间神经元中的转录调控作用,并关联到神经精神障碍的风险基因表达 | 对分子机制的调控细节理解尚不充分 | 探究NMDAR信号在中间神经元亚型中的系统性作用,寻找可能的MGE特异性遗传靶点 | MGE来源的PV+、SST+和NGFC型皮层及海马中间神经元 | 神经科学 | 神经精神障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2024-08-08 |
Connexin 43-Mediated Gap Junction Communication Regulates Ameloblast Differentiation via ERK1/2 Phosphorylation
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.748574
PMID:34630166
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研究论文 | 本文研究了连接蛋白43(Cx43)通过间隙连接通信调节成釉细胞分化的机制,特别是通过ERK1/2磷酸化途径。 | 本文首次揭示了Cx43通过间隙连接活动调节TGF-β1介导的ERK信号传导和牙釉质形成的作用,并探讨了Cx43作为钙通道在慢钙内流和ERK1/2磷酸化中的功能。 | NA | 阐明Cx43在牙釉质形成中的作用及其分子机制。 | Cx43在牙齿发育中的表达和功能,以及其在oculodentodigital dysplasia(ODDD)病理性机制中的作用。 | NA | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序分析,免疫染色 | NA | RNA序列,蛋白质表达 | 包括Cx43突变的小鼠模型和不同细胞密度的细胞培养实验。 | NA | NA | NA | NA |
| 377 | 2024-08-08 |
Inferring Copy Number from Triple-Negative Breast Cancer Patient Derived Xenograft scRNAseq Data Using scCNA
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1740-3_16
PMID:34590283
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研究论文 | 本文描述了一种从三阴性乳腺癌患者来源的异种移植模型中分离单细胞悬液,并使用scRNAseq技术进行单细胞RNA测序,以获取推断的拷贝数变异轮廓的方法 | 本文采用scCNA技术从单细胞RNA测序数据中推断拷贝数变异,有助于深入理解肿瘤内异质性 | NA | 研究旨在通过单细胞分辨率的数据分析,增强对肿瘤内异质性的理解,并识别遗传脆弱性,开发有效疗法 | 三阴性乳腺癌患者来源的异种移植模型的单细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNAseq | NA | 转录组数据 | 从TNBC患者来源的异种移植模型中分离的单细胞悬液 | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2024-08-08 |
Immune Cell Landscape of Patients With Diabetic Macular Edema by Single-Cell RNA Analysis
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.754933
PMID:34594230
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了糖尿病黄斑水肿患者的免疫细胞图谱 | 首次构建了糖尿病黄斑水肿患者的免疫细胞图谱,并证实了外周血中先天免疫失调的存在 | NA | 确定糖尿病黄斑水肿患者外周免疫细胞的表型和功能 | 糖尿病黄斑水肿患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞数据 | 57,650个外周血单个核细胞(24,919个健康对照,32,731个糖尿病黄斑水肿患者) | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2024-08-08 |
Characterization of Organ-Specific Regulatory B Cells Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.711980
PMID:34594327
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞B细胞受体测序(scBCR-seq)技术,对小鼠不同器官(脾脏、肝脏、肠系膜淋巴结、骨髓和腹腔)的B细胞进行分析,以更好地定义这些细胞的表型 | 本研究首次鉴定了19个在调节性B细胞(Breg)中显著表达的共同基因,并分析了这些细胞中的转录因子活性,揭示了七个器官特异性的Breg细胞亚群 | 研究主要集中在小鼠模型上,未来需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 旨在深入了解调节性B细胞(Breg)在不同器官中的异质性及其功能 | 小鼠不同器官(脾脏、肝脏、肠系膜淋巴结、骨髓和腹腔)的B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞B细胞受体测序(scBCR-seq) | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠器官的B细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 380 | 2024-08-08 |
A Systematic Review of the Tumor-Infiltrating CD8+ T-Cells/PD-L1 Axis in High-Grade Glial Tumors: Toward Personalized Immuno-Oncology
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.734956
PMID:34603316
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综述 | 本文通过系统综述探讨了高级别胶质瘤中肿瘤浸润性CD8+ T细胞/PD-L1轴的临床意义及其对患者抗癌治疗反应率的影响 | 通过单细胞测序技术分析肿瘤微环境中细胞的抑制性免疫检查点表达模式,为基于数据的免疫检查点抑制剂治疗提供新策略 | 综述主要基于已发表的研究,可能存在样本选择偏倚和研究质量不一的问题 | 旨在阐明肿瘤浸润性CD8+ T细胞/PD-L1轴在高级别胶质瘤中的临床意义及其对患者治疗反应的影响 | 高级别胶质瘤患者及其肿瘤浸润性CD8+ T细胞和PD-L1表达 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |