单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 709 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-08 |
A Comprehensive Characterization of Monoallelic Expression During Hematopoiesis and Leukemogenesis via Single-Cell RNA-Sequencing
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.702897
PMID:34722498
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，系统地研究了骨髓单个核细胞中的单等位基因表达（MAE），构建了MAE图谱，并探讨了其在造血和白血病发生中的作用 | 首次系统地研究了造血和白血病发生过程中的常染色体MAE、细胞类型特异性MAE和随机MAE，增加了对MAE特征和功能的认识 | NA | 探讨单等位基因表达在造血和白血病发生中的作用和机制 | 骨髓单个核细胞中的单等位基因表达 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 1,020个常染色体MAE，74个细胞类型特异性MAE，114个随机MAE |
| 342 | 2024-08-08 |
Classical Dichotomy of Macrophages and Alternative Activation Models Proposed with Technological Progress
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/9910596
PMID:34722776
|
研究论文 | 本文探讨了巨噬细胞在种植牙科中的炎症调节作用及其激活/极化状态的基础，并提出了基于先进技术的替代激活模型。 | 通过应用CyTOF、scRNA-seq和HSI等先进技术，提出了替代激活模型，有助于巨噬细胞的分型和功能基因的划分。 | NA | 探索巨噬细胞的激活模型及其在种植牙科中的应用。 | 巨噬细胞及其在种植牙科中的作用。 | 数字病理学 | NA | CyTOF, scRNA-seq, HSI | NA | 图像, 基因序列 | NA |
| 343 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals spatiotemporal heterogeneity and malignant progression in pancreatic neuroendocrine tumor
2021, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.61717
PMID:34671197
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术探索胰腺神经内分泌肿瘤的空间时间异质性和恶性进展机制 | 揭示了肿瘤细胞、免疫细胞和成纤维细胞的功能异质性子群，以及肿瘤进展不同阶段的致癌特征，并开发了定义肿瘤转移潜能的基因签名 | NA | 研究胰腺神经内分泌肿瘤的异质性和恶性进展机制 | 胰腺神经内分泌肿瘤的细胞异质性和转录状态 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 24,544个细胞 |
| 344 | 2024-08-08 |
Analysis of Cellular Heterogeneity in Immune Microenvironment of Primary Central Nervous System Lymphoma by Single-Cell Sequencing
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.683007
PMID:34671548
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了原发性中枢神经系统淋巴瘤（PCNSL）的免疫微环境中的细胞异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了PCNSL中六种主要细胞群体的异质性及其基因表达特征 | 研究仅限于PCNSL细胞与正常人胎儿脑细胞的比较，未涉及其他类型的脑部肿瘤 | 深入理解PCNSL的肿瘤异质性和分子表型，以改善该疾病的诊断和治疗 | PCNSL细胞及其与正常人胎儿脑细胞的比较 | 数字病理学 | 中枢神经系统淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 34,851个PCNSL细胞和21,250个正常人胎儿脑细胞 |
| 345 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Revealed CD14+ Monocytes Increased in Patients With Takayasu's Arteritis Requiring Surgical Management
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.761300
PMID:34671607
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了需要手术管理的Takayasu动脉炎患者外周血单个核细胞的转录组多样性和功能 | 首次揭示了Takayasu动脉炎患者中CD14+单核细胞的增加及其相关基因表达的变化 | 样本量较小，仅包括四名患者和四名健康对照 | 旨在解析Takayasu动脉炎患者外周血单个核细胞的转录组，并探索潜在的临床标志物 | Takayasu动脉炎患者和健康对照的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共29918个合格细胞，包括四名Takayasu动脉炎患者和四名年龄性别匹配的健康捐赠者 |
| 346 | 2024-08-08 |
Multi-Omics Data Analyses Identify B7-H3 as a Novel Prognostic Biomarker and Predict Response to Immune Checkpoint Blockade in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.757047
PMID:34675936
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析，确定B7-H3作为头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的新型预后生物标志物，并预测其对免疫检查点阻断的反应 | 首次揭示B7-H3表达与HNSCC肿瘤微环境、免疫治疗反应及预后的关系 | NA | 研究B7-H3在HNSCC中的预后价值及其在促进免疫抑制微环境中的作用 | B7-H3在HNSCC中的表达及其与预后和免疫治疗反应的关系 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | NA |
| 347 | 2024-08-08 |
Characterizing Intercellular Communication of Pan-Cancer Reveals SPP1+ Tumor-Associated Macrophage Expanded in Hypoxia and Promoting Cancer Malignancy Through Single-Cell RNA-Seq Data
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.749210
PMID:34676217
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了六种癌症类型中的细胞间通讯，特别是缺氧环境下SPP1+肿瘤相关巨噬细胞的作用 | 首次在单细胞分辨率下识别并分析了缺氧肿瘤微环境中肿瘤相关非恶性细胞的亚型及其对癌症进展的影响 | 研究仅限于六种癌症类型，且样本量相对有限 | 揭示缺氧肿瘤微环境中不同细胞亚型间的复杂交互机制，并为高比例SPP1+ TAMs患者开发治疗靶点提供指导 | 肿瘤细胞、基质细胞和免疫细胞在缺氧肿瘤微环境中的亚型及其相互作用 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 424,194个单细胞来自108名患者 |
| 348 | 2024-08-08 |
Pan-Cancer Analysis of Glycolytic and Ketone Bodies Metabolic Genes: Implications for Response to Ketogenic Dietary Therapy
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.689068
PMID:34692477
|
研究论文 | 本研究通过分析TCGA、GEO和CCLE数据库中的RNA-seq和微阵列数据，探讨了33种癌症类型中糖酵解和酮体代谢途径基因的表达模式，并识别出可能预测酮饮食疗法反应的代谢亚型。 | 首次系统性地分析了糖酵解和酮体代谢途径基因在多种癌症类型中的表达模式，并识别出与临床结果相关的代谢亚型，这些亚型可能作为预测酮饮食疗法反应的生物标志物。 | 研究主要基于数据库中的现有数据，需要在更多实验中验证这些代谢亚型的预测价值。 | 旨在识别和验证基于糖酵解和酮体代谢的代谢亚型，作为预测癌症对酮饮食疗法反应的生物标志物。 | 33种癌症类型的糖酵解和酮体代谢途径基因表达模式及代谢亚型。 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过10,000个肿瘤样本和近1,000个癌细胞系 |
| 349 | 2024-08-08 |
[Research progress in the identification and lineage differentiation of skeletal stem cell]
2021-Jan-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
综述 | 本文综述了骨骼干细胞（SSC）的鉴定、时空分布和功能特性的研究进展 | 讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在骨骼干细胞鉴定和功能研究中的应用 | NA | 阐明骨骼干细胞的特性，为干细胞治疗提供新的见解 | 骨骼干细胞的鉴定、时空分布和功能特性 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 350 | 2024-08-08 |
Full-Length Transcriptome: A Reliable Alternative for Single-Cell RNA-Seq Analysis in the Spleen of Teleost Without Reference Genome
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.737332
PMID:34646272
|
研究论文 | 本文提出了一种使用全长转录组作为参考的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析方法，并在没有已知基因组的硬骨鱼样本中进行了评估 | 本文提出的方法不依赖于参考基因组，适用于没有参考基因组的鱼类研究，为scRNA-seq数据分析提供了一种可靠的替代方案 | NA | 旨在开发和评估一种新的scRNA-seq数据分析方法，以在没有参考基因组的硬骨鱼中识别和表征免疫细胞亚群 | 硬骨鱼的脾脏中的免疫细胞亚群 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 351 | 2024-08-08 |
SCMAG: A Semisupervised Single-Cell Clustering Method Based on Matrix Aggregation Graph Convolutional Neural Network
2021, Computational and mathematical methods in medicine
DOI:10.1155/2021/6842752
PMID:34646337
|
研究论文 | 本文提出了一种基于矩阵聚合图卷积神经网络的半监督单细胞聚类方法SCMAG | SCMAG充分利用了单细胞数据的先验信息，提高了聚类算法的准确性 | NA | 旨在提高单细胞数据聚类分析的准确性 | 单细胞数据 | 机器学习 | NA | 图卷积神经网络 | 图卷积神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 不同单细胞数据集 |
| 352 | 2024-08-08 |
Tryptophan metabolism is inversely regulated in the tumor and blood of patients with glioblastoma
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.60679
PMID:34646367
|
研究论文 | 本文研究了胶质母细胞瘤患者肿瘤和血液中色氨酸代谢的反向调控，并开发了新的技术来支持针对色氨酸分解酶或芳香烃受体激活的治疗 | 开发了结合LC-MS/MS与化学同位素标记的方法，用于同时定量比较色氨酸及其代谢物，并应用MALDI MSI和scRNA-seq技术分析色氨酸代谢和芳香烃受体活性 | NA | 更好地理解色氨酸代谢，支持针对色氨酸分解酶或芳香烃受体的治疗 | 胶质母细胞瘤患者的色氨酸代谢 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | LC-MS/MS, MALDI MSI, scRNA-seq | 人工神经网络 | 血液样本, 肿瘤组织 | 43名复发性胶质母细胞瘤患者和43名年龄性别匹配的健康对照 |
| 353 | 2024-08-08 |
Tumor microenvironment-based screening repurposes drugs targeting cancer stem cells and cancer-associated fibroblasts
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.62676
PMID:34646392
|
研究论文 | 本研究旨在建立基于肿瘤微环境（TME）的筛选方法，以识别能够特异性靶向癌症干细胞（CSCs）和癌症相关成纤维细胞（CAFs）的药物 | 开发了一种基于肿瘤微环境的高通量药物筛选平台，并利用单细胞RNA测序技术评估药物在CSCs和CAFs中的作用机制 | NA | 建立基于肿瘤微环境的药物筛选平台，以加速药物开发和治疗应用 | 肺癌患者来源的癌细胞和CAFs，以及CSCs和CAFs | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 1,524种化合物 |
| 354 | 2024-08-08 |
Single Cell RNA-Sequencing Reveals a Murine Gallbladder Cell Transcriptome Atlas During the Process of Cholesterol Gallstone Formation
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.714271
PMID:34650971
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了胆固醇结石形成过程中小鼠胆囊细胞的转录组图谱 | 首次展示了胆固醇结石形成过程中小鼠胆囊细胞的细胞异质性和转录组动态变化 | NA | 揭示胆固醇结石形成过程中胆囊细胞的变化，增进对疾病发病机制和治疗的理解 | 小鼠胆囊细胞在胆固醇结石形成过程中的转录组变化 | 数字病理学 | 胆石症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 355 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Peripheral Blood Reveals a Novel B-Cell Subset in Renal Allograft Recipients With Accommodation
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.706580
PMID:34658852
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析肾移植受者的外周血细胞，揭示了免疫抑制剂对免疫细胞亚群的新机制 | 发现了一个新的B细胞亚群（CD19IGLC3IGKCTCL1ACD127），该亚群在肾移植受者中显著减少，并显示出激活潜力 | 样本量较小，仅包括三名个体 | 描述肾移植受者免疫耐受的细节，并揭示免疫抑制剂对免疫细胞亚群的影响机制 | 肾移植受者的外周T细胞、B细胞、髓系细胞和NK细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 总共8,272个细胞，来自三名个体，包括2,758个健康对照细胞，2,550个ESRD患者细胞和2,964个肾移植患者细胞 |
| 356 | 2024-08-08 |
Expansion of Human Papillomavirus-Specific T Cells in Periphery and Cervix in a Therapeutic Vaccine Recipient Whose Cervical High-Grade Squamous Intraepithelial Lesion Regressed
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.645299
PMID:34659195
|
研究论文 | 本文描述了一位接受HPV治疗性疫苗PepCan的女性，其宫颈高级别鳞状上皮内病变完全消退，并通过T细胞受体β深度测序分析了疫苗接种前后的T细胞反应。 | 结合传统和前沿的免疫监测技术，首次展示了HPV抗原特异性T细胞不仅在外周血中，而且在宫颈中的扩增。 | NA | 研究HPV治疗性疫苗对T细胞反应的影响，并验证疫苗特异性T细胞的存在。 | HPV治疗性疫苗PepCan接种者的T细胞反应及宫颈病变消退情况。 | 免疫学 | 宫颈疾病 | T细胞受体β深度测序 | NA | 单细胞RNA测序和TCR测序数据 | 70个可能的疫苗特异性克隆型 |
| 357 | 2024-08-08 |
Phytohormone-Based Regulation of Trichome Development
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.734776
PMID:34659303
|
综述 | 本文综述了植物激素对毛状体发育的调控作用 | 介绍了CRISPR-Cas9系统和单细胞转录组学等新技术在研究毛状体细胞系调控网络中的应用 | NA | 探讨植物激素对毛状体发育的调控机制 | 植物毛状体的发育 | NA | NA | CRISPR-Cas9系统, 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 358 | 2024-08-08 |
From GWAS to Gene: Transcriptome-Wide Association Studies and Other Methods to Functionally Understand GWAS Discoveries
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.713230
PMID:34659337
|
综述 | 本文综述了结合功能基因组学知识与全基因组关联研究（GWAS）的数据整合生物信息学方法，以识别遗传调控基因 | 介绍了转录组广泛关联研究（TWAS）作为一种基因基础的关联方法，能够减少多重检验负担，并讨论了不同TWAS方法的设计和生物学假设 | 文章未明确提及具体限制 | 探讨如何通过数据整合方法更好地理解GWAS发现与复杂疾病机制之间的关系 | 全基因组关联研究（GWAS）发现的非编码区域及其在复杂人类疾病和性状中的功能 | 基因组学 | NA | 全基因组关联研究（GWAS），转录组广泛关联研究（TWAS） | NA | 基因组数据 | NA |
| 359 | 2024-08-08 |
Identification of Specific Cell Subpopulations and Marker Genes in Ovarian Cancer Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/1005793
PMID:34660776
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析卵巢癌细胞中的特定细胞亚群和标记基因 | 揭示了卵巢癌中的特定细胞亚群和标记基因，为卵巢癌的异质性提供了新的见解 | NA | 分析卵巢癌细胞中的特定细胞亚群和标记基因 | 卵巢癌细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 66个高级别浆液性卵巢癌细胞样本和568个卵巢癌样本及8个正常卵巢样本 |
| 360 | 2024-08-08 |
Smooth muscle cells in atherosclerosis: clones but not carbon copies
2021, JVS-vascular science
DOI:10.1016/j.jvssci.2021.02.002
PMID:34617064
|
综述 | 本文综述了血管平滑肌细胞（SMCs）在动脉粥样硬化中的作用及其表型多样性和命运调控机制 | 通过命运图谱和单细胞转录组学研究，揭示了SMCs在动脉粥样硬化病变中的选择性扩张和投资，以及其表型和功能的深刻多样性变化 | 仍需探讨SMCs寡克隆扩张的调控机制，单细胞转录组学在确定SMCs功能和贡献中的可靠性，以及SMCs克隆性和表型可塑性对治疗策略的影响 | 总结近期在SMCs投资和表型多样性及分子机制方面的进展，并讨论相关未解问题 | 血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化中的作用和机制 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |