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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-08 |
Meta-Analysis Reveals Transcription Factor Upregulation in Cells of Injured Mouse Sciatic Nerve
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.688243
PMID:34744629
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meta-analysis | 本研究通过分析四个微阵列数据集和一个批量mRNA测序数据集,识别并验证了在小鼠坐骨神经损伤后远端神经节中至少两倍上调的55个转录因子 | 首次系统地分析了小鼠坐骨神经损伤后远端神经节中转录因子的上调情况,并通过单细胞RNA测序数据进行了验证 | NA | 旨在理解关键转录因子在外周神经再生中的功能,并为未来研究设计提供实验依据 | 小鼠坐骨神经损伤后的转录因子上调情况 | NA | NA | 微阵列数据分析,mRNA测序,单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 涉及四个微阵列数据集和一个批量mRNA测序数据集,以及单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 342 | 2024-08-08 |
A Dynamic Transcriptome Map of Different Tissue Microenvironment Cells Identified During Gastric Cancer Development Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.728169
PMID:34745098
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,生成了胃癌发展过程中不同组织微环境细胞的动态转录图谱 | 本研究首次揭示了组织微环境细胞在胃癌发展过程中的关键转变标志物和动态致癌轨迹 | NA | 揭示胃癌发展过程中组织微环境细胞的关键病理机制 | 胃癌发展过程中的组织微环境细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 343 | 2024-08-08 |
Ductal Macrophages Predominate in the Immune Landscape of the Lactating Mammary Gland
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.754661
PMID:34745127
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序、流式细胞术和三维共聚焦显微镜技术,研究了哺乳期小鼠乳腺组织的免疫景观,发现巨噬细胞在免疫细胞中占主导地位,并可分为至少两种亚型:导管和基质巨噬细胞 | 首次精确描述了哺乳期乳腺组织的免疫组成,特别是导管巨噬细胞的高比例及其在乳腺免疫中的作用 | 研究仅限于小鼠模型,可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 研究哺乳期乳腺组织的免疫组成,以改进乳腺炎的预防和治疗策略 | 哺乳期小鼠乳腺组织的免疫细胞组成 | 数字病理学 | 乳腺炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、三维共聚焦显微镜 | NA | 细胞 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 344 | 2024-08-08 |
The Single-Cell Sequencing: A Dazzling Light Shining on the Dark Corner of Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.759894
PMID:34745998
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研究论文 | 本文讨论了单细胞测序(SCS)在肿瘤研究中的应用及其对肿瘤内异质性(ITH)的理解 | SCS能够测量单个细胞中的基因组序列分布和肿瘤细胞间的遗传变异性,从而提高对ITH的理解 | NA | 探讨SCS的进展及其在肿瘤中的应用 | 肿瘤细胞及其遗传变异性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序(SCS) | NA | 基因组序列 | 单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 345 | 2024-08-08 |
Data-Driven Modeling of Breast Cancer Tumors Using Boolean Networks
2021, Frontiers in big data
IF:2.4Q2
DOI:10.3389/fdata.2021.656395
PMID:34746770
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研究论文 | 本文提出了一种基于布尔网络的数据驱动模型,用于模拟乳腺癌肿瘤 | 结合单细胞RNA测序和相互作用组数据,研究上调基因的恶性子网络动态 | NA | 开发一种方法来检测与恶性吸引子稳定性相关的关键基因,这些基因的抑制可能应用于癌症治疗 | 乳腺癌肿瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq | 布尔网络 | 基因表达数据 | 来自癌症基因组图谱的单细胞乳腺癌数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 346 | 2024-08-08 |
Identification of Key eRNAs for Spinal Cord Injury by Integrated Multinomial Bioinformatics Analysis
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.728242
PMID:34708039
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研究论文 | 本研究通过多组学生物信息学分析,探讨了脊髓损伤(SCI)中关键增强子RNA(eRNAs)、转录因子(TFs)、信号通路和小分子抑制剂的作用。 | 构建了13个差异表达转录因子、6个差异表达增强子RNA、7个差异表达目标基因的调控网络,并发现了与SCI相关的潜在药物Trichostatin A。 | NA | 研究脊髓损伤中关键增强子RNA的作用及其调控机制。 | 脊髓损伤中的关键增强子RNA、转录因子、信号通路和小分子抑制剂。 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 微阵列数据分析、CIBERSORT算法、基因集变异分析(GSVA)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)、转座酶可及染色质测序(ATAC-seq) | NA | 微阵列数据、scRNA-seq数据、ChIP-seq数据、ATAC-seq数据 | 27名健康志愿者和25名慢性期脊髓损伤患者的周围血单核细胞(PBMC)样本 | NA | NA | NA | NA |
| 347 | 2024-08-08 |
Blood Immune Cell Composition Associated with Obesity and Drug Repositioning Revealed by Epigenetic and Transcriptomic Conjoint Analysis
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.714643
PMID:34712134
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研究论文 | 本研究通过表观遗传学和转录组联合分析,探讨了肥胖相关的血液免疫细胞组成,并识别了用于肥胖管理的新型潜在药物。 | 本研究首次通过表观遗传学和转录组联合分析,揭示了肥胖患者中CD8+ T细胞和NK细胞的显著降低,并发现了11种具有肥胖控制潜力的药物。 | 研究样本量较小,仅包括35个肥胖样本和37个对照样本,可能影响结果的普遍性。 | 分析肥胖中的免疫细胞组成,并识别新型有效药物用于肥胖管理。 | 肥胖患者和健康对照的血液免疫细胞组成及药物靶点表达。 | 表观遗传学 | 肥胖 | DNA甲基化分析,mRNA表达微阵列,单细胞RNA测序,qPCR | NA | DNA甲基化数据,mRNA表达数据 | 72个样本(35个肥胖样本和37个对照样本) | NA | NA | NA | NA |
| 348 | 2024-08-08 |
TNFSF13 Is a Novel Onco-Inflammatory Marker and Correlates With Immune Infiltration in Gliomas
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.713757
PMID:34712225
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了TNFSF13(APRIL)在胶质瘤中的表达及其与患者预后和靶向治疗的关系 | 首次证实TNFSF13与胶质瘤中的免疫浸润和炎症反应相关,并可能作为新的诊断标志物和免疫治疗靶点 | NA | 探索TNFSF13作为胶质瘤的新诊断标志物和治疗靶点的潜力 | TNFSF13在胶质瘤中的表达及其与免疫浸润和炎症反应的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 349 | 2024-08-08 |
Immune Response in Severe and Non-Severe Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Infection: A Mechanistic Landscape
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.738073
PMID:34721400
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞RNA测序数据,探讨了COVID-19感染中免疫重塑和严重反应的机制 | 揭示了低密度中性粒细胞和巨核细胞在淋巴细胞和髓系细胞间对话中的关键作用,并提供了淋巴细胞和髓系细胞相互作用的详细机制见解 | NA | 阐明COVID-19感染中免疫重塑和严重反应的机制 | COVID-19患者的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自四个已发表研究的数据,包括轻度/中度和重度感染的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 350 | 2024-08-08 |
Phased differentiation of γδ T and T CD8 tumor-infiltrating lymphocytes revealed by single-cell transcriptomics of human cancers
2021, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2021.1939518
PMID:34721945
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术,首次揭示了人类癌症中γδ T细胞与T CD8细胞的分化差异 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析,展示了γδ T细胞在癌症中的分化情况,并发现其在肿瘤微环境中的分化与健康血液中的情况不同 | NA | 探讨γδ T细胞在人类癌症中的分化情况及其与免疫检查点疗法的关联 | γδ T细胞和T CD8细胞在人类癌症中的分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约150个已发表的单细胞RNA测序数据集及人类肿瘤和小鼠模型的表型验证数据 | NA | NA | NA | NA |
| 351 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing in Multiple Pathologic Types of Renal Cell Carcinoma Revealed Novel Potential Tumor-Specific Markers
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.719564
PMID:34722263
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,在多种病理类型的肾细胞癌中发现了新的潜在肿瘤特异性标记物 | 本研究首次在不同病理类型的肾细胞癌中识别出多种新的肿瘤特异性标记物,并验证了其在肿瘤细胞中的高表达 | 研究样本量较小,仅包括三种病理类型的肾细胞癌 | 研究旨在通过单细胞RNA测序技术揭示肾细胞癌的潜在肿瘤特异性标记物,以指导临床治疗 | 研究对象包括三种病理类型的肾细胞癌及正常肾脏组织 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 共30,263个高质量单细胞转录组信息 | NA | NA | NA | NA |
| 352 | 2024-08-08 |
A Comprehensive Characterization of Monoallelic Expression During Hematopoiesis and Leukemogenesis via Single-Cell RNA-Sequencing
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.702897
PMID:34722498
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,系统地研究了骨髓单个核细胞中的单等位基因表达(MAE),构建了MAE图谱,并探讨了其在造血和白血病发生中的作用 | 首次系统地研究了造血和白血病发生过程中的常染色体MAE、细胞类型特异性MAE和随机MAE,增加了对MAE特征和功能的认识 | NA | 探讨单等位基因表达在造血和白血病发生中的作用和机制 | 骨髓单个核细胞中的单等位基因表达 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 1,020个常染色体MAE,74个细胞类型特异性MAE,114个随机MAE | NA | NA | NA | NA |
| 353 | 2024-08-08 |
Classical Dichotomy of Macrophages and Alternative Activation Models Proposed with Technological Progress
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/9910596
PMID:34722776
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研究论文 | 本文探讨了巨噬细胞在种植牙科中的炎症调节作用及其激活/极化状态的基础,并提出了基于先进技术的替代激活模型。 | 通过应用CyTOF、scRNA-seq和HSI等先进技术,提出了替代激活模型,有助于巨噬细胞的分型和功能基因的划分。 | NA | 探索巨噬细胞的激活模型及其在种植牙科中的应用。 | 巨噬细胞及其在种植牙科中的作用。 | 数字病理学 | NA | CyTOF, scRNA-seq, HSI | NA | 图像, 基因序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 354 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals spatiotemporal heterogeneity and malignant progression in pancreatic neuroendocrine tumor
2021, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.61717
PMID:34671197
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术探索胰腺神经内分泌肿瘤的空间时间异质性和恶性进展机制 | 揭示了肿瘤细胞、免疫细胞和成纤维细胞的功能异质性子群,以及肿瘤进展不同阶段的致癌特征,并开发了定义肿瘤转移潜能的基因签名 | NA | 研究胰腺神经内分泌肿瘤的异质性和恶性进展机制 | 胰腺神经内分泌肿瘤的细胞异质性和转录状态 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 24,544个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 355 | 2024-08-08 |
Analysis of Cellular Heterogeneity in Immune Microenvironment of Primary Central Nervous System Lymphoma by Single-Cell Sequencing
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.683007
PMID:34671548
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了原发性中枢神经系统淋巴瘤(PCNSL)的免疫微环境中的细胞异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了PCNSL中六种主要细胞群体的异质性及其基因表达特征 | 研究仅限于PCNSL细胞与正常人胎儿脑细胞的比较,未涉及其他类型的脑部肿瘤 | 深入理解PCNSL的肿瘤异质性和分子表型,以改善该疾病的诊断和治疗 | PCNSL细胞及其与正常人胎儿脑细胞的比较 | 数字病理学 | 中枢神经系统淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 34,851个PCNSL细胞和21,250个正常人胎儿脑细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 356 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Revealed CD14+ Monocytes Increased in Patients With Takayasu's Arteritis Requiring Surgical Management
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.761300
PMID:34671607
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了需要手术管理的Takayasu动脉炎患者外周血单个核细胞的转录组多样性和功能 | 首次揭示了Takayasu动脉炎患者中CD14+单核细胞的增加及其相关基因表达的变化 | 样本量较小,仅包括四名患者和四名健康对照 | 旨在解析Takayasu动脉炎患者外周血单个核细胞的转录组,并探索潜在的临床标志物 | Takayasu动脉炎患者和健康对照的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共29918个合格细胞,包括四名Takayasu动脉炎患者和四名年龄性别匹配的健康捐赠者 | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2024-08-08 |
Multi-Omics Data Analyses Identify B7-H3 as a Novel Prognostic Biomarker and Predict Response to Immune Checkpoint Blockade in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.757047
PMID:34675936
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析,确定B7-H3作为头颈鳞状细胞癌(HNSCC)的新型预后生物标志物,并预测其对免疫检查点阻断的反应 | 首次揭示B7-H3表达与HNSCC肿瘤微环境、免疫治疗反应及预后的关系 | NA | 研究B7-H3在HNSCC中的预后价值及其在促进免疫抑制微环境中的作用 | B7-H3在HNSCC中的表达及其与预后和免疫治疗反应的关系 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 358 | 2024-08-08 |
Characterizing Intercellular Communication of Pan-Cancer Reveals SPP1+ Tumor-Associated Macrophage Expanded in Hypoxia and Promoting Cancer Malignancy Through Single-Cell RNA-Seq Data
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.749210
PMID:34676217
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了六种癌症类型中的细胞间通讯,特别是缺氧环境下SPP1+肿瘤相关巨噬细胞的作用 | 首次在单细胞分辨率下识别并分析了缺氧肿瘤微环境中肿瘤相关非恶性细胞的亚型及其对癌症进展的影响 | 研究仅限于六种癌症类型,且样本量相对有限 | 揭示缺氧肿瘤微环境中不同细胞亚型间的复杂交互机制,并为高比例SPP1+ TAMs患者开发治疗靶点提供指导 | 肿瘤细胞、基质细胞和免疫细胞在缺氧肿瘤微环境中的亚型及其相互作用 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 424,194个单细胞来自108名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 359 | 2024-08-08 |
Pan-Cancer Analysis of Glycolytic and Ketone Bodies Metabolic Genes: Implications for Response to Ketogenic Dietary Therapy
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.689068
PMID:34692477
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研究论文 | 本研究通过分析TCGA、GEO和CCLE数据库中的RNA-seq和微阵列数据,探讨了33种癌症类型中糖酵解和酮体代谢途径基因的表达模式,并识别出可能预测酮饮食疗法反应的代谢亚型。 | 首次系统性地分析了糖酵解和酮体代谢途径基因在多种癌症类型中的表达模式,并识别出与临床结果相关的代谢亚型,这些亚型可能作为预测酮饮食疗法反应的生物标志物。 | 研究主要基于数据库中的现有数据,需要在更多实验中验证这些代谢亚型的预测价值。 | 旨在识别和验证基于糖酵解和酮体代谢的代谢亚型,作为预测癌症对酮饮食疗法反应的生物标志物。 | 33种癌症类型的糖酵解和酮体代谢途径基因表达模式及代谢亚型。 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过10,000个肿瘤样本和近1,000个癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 360 | 2024-08-08 |
[Research progress in the identification and lineage differentiation of skeletal stem cell]
2021-Jan-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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综述 | 本文综述了骨骼干细胞(SSC)的鉴定、时空分布和功能特性的研究进展 | 讨论了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在骨骼干细胞鉴定和功能研究中的应用 | NA | 阐明骨骼干细胞的特性,为干细胞治疗提供新的见解 | 骨骼干细胞的鉴定、时空分布和功能特性 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |