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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-08 |
Papillary Thyroid Carcinoma Landscape and Its Immunological Link With Hashimoto Thyroiditis at Single-Cell Resolution
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.758339
PMID:34805166
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了甲状腺乳头状癌(PTC)及其与桥本甲状腺炎(HT)的免疫学联系 | 首次在单细胞分辨率下揭示了PTC的肿瘤微环境异质性及其与HT的免疫学联系 | 样本量较小,仅包括八名PTC患者,其中三名同时患有HT | 深入理解PTC的肿瘤微环境及其与HT的免疫学联系 | 甲状腺乳头状癌(PTC)及其与桥本甲状腺炎(HT)的关系 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八名PTC患者,其中三名同时患有HT | NA | NA | NA | NA |
| 322 | 2024-08-08 |
Deciphering the Intercellular Communication Network of Peripartum Decidua that Orchestrates Delivery
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.770621
PMID:34805176
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研究论文 | 本研究通过CellCall方法基于围产期蜕膜的scRNA-seq数据重建了蜕膜细胞间的通信网络,并分析了其在分娩和母胎免疫耐受中的作用 | 首次系统地解码了围产期蜕膜中的细胞间通信网络及其内部级联反应,并探讨了其在分娩中的作用 | NA | 旨在理解妊娠维持和分娩过渡中蜕膜细胞间通信的机制 | 围产期蜕膜中的细胞间通信网络及其在分娩和母胎免疫耐受中的作用 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | scRNA-seq, 单细胞BCR/TCR测序 | CellCall方法 | 单细胞RNA测序数据 | 围产期蜕膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 323 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Revealed a Critical Role of SPP1/CD44-Mediated Crosstalk Between Macrophages and Cancer Cells in Glioma
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.779319
PMID:34805184
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析,揭示了高级别胶质瘤中SPP1/CD44介导的巨噬细胞与癌细胞间的交叉对话在肿瘤进展中的关键作用 | 本研究首次揭示了SPP1/CD44信号轴在高级别胶质瘤进展中的重要作用,并提出其作为潜在治疗靶点的可能性 | NA | 旨在识别驱动高级别胶质瘤肿瘤异质性的细胞和分子机制 | 高级别胶质瘤中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一个高级别胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 324 | 2024-08-08 |
Dissecting the heterogeneity and tumorigenesis of BRCA1 deficient mammary tumors via single cell RNA sequencing
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.63995
PMID:34815798
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了BRCA1缺陷型乳腺肿瘤的异质性及其肿瘤发生机制 | 本研究首次将BRCA1缺陷型乳腺肿瘤分为四个亚型,并揭示了肿瘤内异质性的主要原因,包括细胞增殖、DNA损伤反应/修复和上皮-间质转化(EMT)的活性差异 | NA | 全面阐明BRCA1缺陷型乳腺肿瘤的异质性及其肿瘤发生和进展的潜在机制 | BRCA1缺陷型乳腺肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 来自敲除小鼠的乳腺腺体细胞和乳腺肿瘤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 325 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of cell composition and origin identified by single-cell transcriptomics in renal cysts of patients with autosomal dominant polycystic kidney disease
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.57220
PMID:34815804
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了常染色体显性多囊肾病患者的肾囊肿细胞组成和来源 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了多囊肾囊肿可能来源于集合管或同时来源于近端小管和亨利环,并发现不同来源的囊肿上皮细胞具有不同的基因集激活 | 研究样本仅来自一名患者,可能影响结果的普遍性 | 探索常染色体显性多囊肾病肾囊肿的细胞组成和来源 | 常染色体显性多囊肾病患者的肾囊肿 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一名患者的正常肾组织和七个囊肿 | NA | NA | NA | NA |
| 326 | 2024-08-08 |
Characterization of Alzheimer's Disease-Associated Excitatory Neurons via Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2021, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2021.742176
PMID:34819847
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研究论文 | 本研究利用公开的单核RNA测序数据集,在5XFAD转基因模型和野生型小鼠中揭示了与阿尔茨海默病相关的兴奋性神经元群体(C3:Ex.Neuron)的特征 | 首次详细描述了阿尔茨海默病中神经元细胞群体的特征,并识别出一种先前未被发现的兴奋性神经元亚型(C3.1) | NA | 探索阿尔茨海默病中神经元细胞群体的特征 | 阿尔茨海默病中的兴奋性神经元群体 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 5XFAD转基因模型和野生型小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 327 | 2024-08-08 |
Development of an Autophagy-Based and Stemness-Correlated Prognostic Model for Hepatocellular Carcinoma Using Bulk and Single-Cell RNA-Sequencing
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.743910
PMID:34820373
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研究论文 | 本研究开发了一种基于自噬和干细胞相关性的肝细胞癌预后模型,使用批量和单细胞RNA测序数据 | 首次结合批量和单细胞RNA测序数据,构建了基于自噬相关基因的肝细胞癌预后模型,并验证了其预测效能 | 研究仅在ICGC和TCGA数据库中验证了预后模型的效能,未来需在更多独立数据集中进行验证 | 开发和验证一种新的肝细胞癌预后模型,以提高患者生存预测的准确性 | 肝细胞癌(HCC)及其自噬相关基因和干细胞特性 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | LASSO回归分析 | RNA测序数据 | 使用了ICGC和TCGA数据库中的数据,具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 328 | 2024-08-08 |
Prediction of Non-canonical Routes for SARS-CoV-2 Infection in Human Placenta Cells
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.614728
PMID:34820418
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研究论文 | 研究分析了SARS-CoV-2在人类胎盘细胞中的非经典感染途径 | 发现了胎盘细胞中可能作为SARS-CoV-2非经典感染途径的蛋白质 | NA | 探讨SARS-CoV-2在胎盘细胞中的感染和复制机制 | 人类胎盘细胞中的SARS-CoV-2感染途径 | NA | COVID-19 | 微阵列和单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 329 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Novel Role of Ezh2 in NK Cell Maturation and Function
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.724276
PMID:34764950
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索Ezh2在NK细胞成熟和功能中的新作用 | 发现Ezh2通过激活AP-1家族基因表达在NK细胞发育中起关键作用,并揭示了Ezh2-AP-1-Klrg1轴在改变NK细胞成熟轨迹和细胞毒性中的新角色 | NA | 探索Ezh2在NK细胞成熟过程中的作用 | NK细胞的成熟和功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及六个不同阶段的NK细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 330 | 2024-08-08 |
GeneMarkeR: A Database and User Interface for scRNA-seq Marker Genes
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.763431
PMID:34764987
|
research paper | 本文介绍了一个名为GeneMarkeR的数据库和用户界面,用于scRNA-seq标记基因的检索 | GeneMarkeR采用了一种新算法,能够跨物种、方法和样本类型检索显示细胞类型特异性的标记基因,并支持在线提交和更新 | NA | 开发一个标准化的数据库和用户界面,以支持scRNA-seq分析中的细胞类型识别 | scRNA-seq标记基因 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | text | 261,000行标准化标记基因结果,来自25项研究,涉及21,012个独特的基因组实体和99种独特的细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 331 | 2024-08-08 |
6-Phosphogluconolactonase Promotes Hepatocellular Carcinogenesis by Activating Pentose Phosphate Pathway
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.753196
PMID:34765603
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研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌患者和健康个体的肝细胞单细胞测序数据,发现6-磷酸葡萄糖酸内酯酶(PGLS)与未分化型肝细胞癌亚型相关,并揭示了PGLS通过激活戊糖磷酸途径促进肝细胞癌发生发展的机制。 | 首次揭示PGLS在肝细胞癌中的作用及其通过调节戊糖磷酸途径影响癌细胞代谢的机制。 | NA | 探讨6-磷酸葡萄糖酸内酯酶在肝细胞癌中的作用及其机制。 | 肝细胞癌(HCC)细胞及其代谢途径。 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | 肝细胞癌患者和健康个体的肝细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 332 | 2024-08-08 |
Plasma Gradient of Soluble Urokinase-Type Plasminogen Activator Receptor Is Linked to Pathogenic Plasma Proteome and Immune Transcriptome and Stratifies Outcomes in Severe COVID-19
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.738093
PMID:34777349
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研究论文 | 研究探讨了可溶性尿激酶型纤溶酶原激活物受体(suPAR)在严重COVID-19患者中的水平及其与疾病结果的关系 | 首次报道了suPAR在严重COVID-19患者中的高水平与特定的血浆蛋白质组和免疫转录组相关,并能有效预测患者死亡率 | 研究基于印度COVID-19患者群体,结果的普遍性可能受限 | 研究suPAR在严重COVID-19患者中的作用及其对疾病结果的影响 | 严重COVID-19患者,特别是伴有急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的患者 | 数字病理学 | COVID-19 | 流式细胞术、下一代测序、基于质谱的蛋白质组学 | NA | 血浆样本、单细胞RNA测序数据 | 印度COVID-19患者群体 | NA | NA | NA | NA |
| 333 | 2024-08-08 |
Maximizing the Utility of Transcriptomics Data in Inflammatory Skin Diseases
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.761890
PMID:34777377
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综述 | 本文综述了转录组学数据在炎症性皮肤病中的应用,并讨论了如何最大化这些数据以推动诊断生物标志物和治疗靶点的发展 | 介绍了单细胞RNA测序和空间转录组学在揭示炎症性皮肤病潜在转化靶点中的应用 | NA | 阐明典型炎症性皮肤病的分子因素,并推动诊断和治疗策略的改进 | 炎症性皮肤病,如银屑病和特应性皮炎 | 转录组学 | 炎症性皮肤病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 334 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals Heterogeneity of Cultured Bovine Satellite Cells
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.742077
PMID:34777469
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了牛卫星细胞的组成,揭示了其异质性 | 首次使用单细胞RNA测序技术深入分析牛卫星细胞的基因表达谱,揭示了不同细胞群的转录状态和肌源性状态的差异 | 研究中仍有六个细胞群的身份无法确定 | 了解牛骨骼肌组成的遗传和生理机制,以提高牛骨骼肌生长效率或质量 | 牛卫星细胞及其在骨骼肌发育和生长中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 从2周龄雄性小牛中分离的卫星细胞,共19,096个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 335 | 2024-08-08 |
Comprehensive Analysis of N6-Methyladenosine RNA Methylation Regulators Expression Identify Distinct Molecular Subtypes of Myocardial Infarction
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.756483
PMID:34778266
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研究论文 | 本研究通过分析N6-甲基腺苷(m6A)修饰调控因子的表达水平,确定了心肌梗死(MI)的不同分子亚型,并探讨了这些亚型在基因表达和信号通路中的差异。 | 首次通过全面分析m6A调控因子的表达,揭示了心肌梗死的三种分子亚型,并发现了与这些亚型相关的关键基因和信号通路。 | 研究主要基于数据库和生物信息学分析,需要进一步的实验验证来确认这些发现。 | 探讨m6A修饰在心肌梗死中的作用,并识别可能的生物标志物用于心肌梗死的治疗和诊断。 | 心肌梗死患者的心脏组织和m6A调控因子的表达。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究数据分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE5406数据库中的数据,具体样本数量未详细说明。 | NA | NA | NA | NA |
| 336 | 2024-08-08 |
Immune infiltration and prognostic and diagnostic use of LGALS4 in colon adenocarcinoma and bladder urothelial carcinoma
2021, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:34786063
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研究论文 | 本研究分析了免疫相关基因在结肠腺癌(COAD)中的预后和诊断特征,并发现LGALS4基因在COAD和膀胱尿路上皮癌(BLCA)中的下调现象 | 识别了LGALS4作为多种癌症类型的预后和诊断标志物,并揭示了一系列新的候选药物靶点和分子标志物 | NA | 评估免疫相关基因在结肠腺癌中的预后和诊断价值 | 结肠腺癌(COAD)和膀胱尿路上皮癌(BLCA)中的免疫相关基因 | 数字病理学 | 结肠癌 | TIMER(肿瘤免疫评估资源)解卷积方法 | NA | 基因表达谱 | 17个COAD和健康样本的基因表达谱 | NA | NA | NA | NA |
| 337 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Ecosystems in Papillary Thyroid Carcinoma Progression
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.729565
PMID:34790166
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术分析了乳头状甲状腺癌(PTC)进展中的生态系统 | 首次详细描述了PTC生态系统中的细胞组成和相互作用,特别是在原发肿瘤和淋巴结转移中的差异 | 研究仅基于单一患者样本,可能限制了结果的普遍性 | 深入理解乳头状甲状腺癌的生物学特性,为个性化治疗提供依据 | 乳头状甲状腺癌的原发肿瘤、淋巴结转移和癌旁组织 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组测序(Sc-RNA seq) | NA | 转录组数据 | 11,805个细胞转录组 | NA | NA | NA | NA |
| 338 | 2024-08-08 |
Identification and Validation of a Malignant Cell Subset Marker-Based Polygenic Risk Score in Stomach Adenocarcinoma Through Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.720649
PMID:34733840
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研究论文 | 本研究旨在基于恶性细胞标记物的表达,构建胃腺癌(STAD)患者不良生存的多元风险评分(PRS) | 通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据,揭示了胃腺癌中有限的但显著的肿瘤内异质性,并提出了一种基于恶性细胞亚群标记物的PRS | NA | 构建并验证基于恶性细胞标记物的多元风险评分,以预测胃腺癌患者的预后 | 胃腺癌患者的恶性细胞标记物及其预后影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Cox回归分析 | RNA测序数据 | 涉及胃腺癌和正常胃组织的批量和单细胞RNA测序数据,以及两个独立的外部验证数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 339 | 2024-08-08 |
Integrated Single-Cell Bioinformatics Analysis Reveals Intrinsic and Extrinsic Biological Characteristics of Hematopoietic Stem Cell Aging
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.745786
PMID:34737765
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研究论文 | 本研究通过整合三个独立的造血干细胞(HSC)单细胞转录组数据集,揭示了HSC衰老的内在和外在生物学特征 | 首次识别出Stat3和Ifngr1作为偏向凋亡和炎症的衰老HSC的标志物,并发现Skp2诱导的信号通路在衰老HSC中加速G1期过渡 | NA | 阐明造血干细胞衰老的生物学特征及其潜在的标志物和治疗靶点 | 造血干细胞(HSC)的衰老机制 | 干细胞研究 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 三个独立的HSC单细胞转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 340 | 2024-08-08 |
Discussion of "Exponential-family Embedding with Application to Cell Developmental Trajectories for Single-cell RNA-seq Data"
2021, Journal of the American Statistical Association
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/01621459.2021.1880920
PMID:34744216
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comments | 本文讨论了指数族奇异值分解(eSVD)在单细胞RNA-seq数据中细胞发育轨迹应用的新方法及其面临的挑战 | eSVD提供了一个灵活的降维框架,能够处理单参数指数族分布并已证明其一致性 | 本文讨论了eSVD及其他类似方法在未来需要解决的多个开放问题和挑战 | 探讨eSVD及其类似方法的潜力和未来研究方向 | eSVD方法及其在数据分析中的应用 | NA | NA | 指数族奇异值分解(eSVD) | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |