单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 709 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-08 |
Maximizing the Utility of Transcriptomics Data in Inflammatory Skin Diseases
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.761890
PMID:34777377
|
综述 | 本文综述了转录组学数据在炎症性皮肤病中的应用，并讨论了如何最大化这些数据以推动诊断生物标志物和治疗靶点的发展 | 介绍了单细胞RNA测序和空间转录组学在揭示炎症性皮肤病潜在转化靶点中的应用 | NA | 阐明典型炎症性皮肤病的分子因素，并推动诊断和治疗策略的改进 | 炎症性皮肤病，如银屑病和特应性皮炎 | 转录组学 | 炎症性皮肤病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 322 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals Heterogeneity of Cultured Bovine Satellite Cells
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.742077
PMID:34777469
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了牛卫星细胞的组成，揭示了其异质性 | 首次使用单细胞RNA测序技术深入分析牛卫星细胞的基因表达谱，揭示了不同细胞群的转录状态和肌源性状态的差异 | 研究中仍有六个细胞群的身份无法确定 | 了解牛骨骼肌组成的遗传和生理机制，以提高牛骨骼肌生长效率或质量 | 牛卫星细胞及其在骨骼肌发育和生长中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从2周龄雄性小牛中分离的卫星细胞，共19,096个单细胞 |
| 323 | 2024-08-08 |
Comprehensive Analysis of N6-Methyladenosine RNA Methylation Regulators Expression Identify Distinct Molecular Subtypes of Myocardial Infarction
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.756483
PMID:34778266
|
研究论文 | 本研究通过分析N6-甲基腺苷（m6A）修饰调控因子的表达水平，确定了心肌梗死（MI）的不同分子亚型，并探讨了这些亚型在基因表达和信号通路中的差异。 | 首次通过全面分析m6A调控因子的表达，揭示了心肌梗死的三种分子亚型，并发现了与这些亚型相关的关键基因和信号通路。 | 研究主要基于数据库和生物信息学分析，需要进一步的实验验证来确认这些发现。 | 探讨m6A修饰在心肌梗死中的作用，并识别可能的生物标志物用于心肌梗死的治疗和诊断。 | 心肌梗死患者的心脏组织和m6A调控因子的表达。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究数据分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE5406数据库中的数据，具体样本数量未详细说明。 |
| 324 | 2024-08-08 |
Kdm6a deficiency restricted to mouse hematopoietic cells causes an age- and sex-dependent myelodysplastic syndrome-like phenotype
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0255706
PMID:34780480
|
研究论文 | 研究Kdm6a基因在造血细胞中的缺失如何导致与年龄和性别相关的骨髓增生异常综合征样表型 | 首次展示了Kdm6a基因在造血干细胞和祖细胞中的缺失会导致性别特异性的骨髓增生异常综合征样表型，并随着年龄增长而出现 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未完全阐明KDM6A基因在人类急性髓系白血病中的作用 | 探讨Kdm6a基因在正常造血和急性髓系白血病发病机制中的作用 | Kdm6a基因缺失的小鼠造血干细胞和祖细胞 | 数字病理学 | 血液疾病 | ChIP-seq, ATAC-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | Kdm6a-WT和Kdm6a-KO小鼠 |
| 325 | 2024-08-08 |
Immune infiltration and prognostic and diagnostic use of LGALS4 in colon adenocarcinoma and bladder urothelial carcinoma
2021, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:34786063
|
研究论文 | 本研究分析了免疫相关基因在结肠腺癌（COAD）中的预后和诊断特征，并发现LGALS4基因在COAD和膀胱尿路上皮癌（BLCA）中的下调现象 | 识别了LGALS4作为多种癌症类型的预后和诊断标志物，并揭示了一系列新的候选药物靶点和分子标志物 | NA | 评估免疫相关基因在结肠腺癌中的预后和诊断价值 | 结肠腺癌（COAD）和膀胱尿路上皮癌（BLCA）中的免疫相关基因 | 数字病理学 | 结肠癌 | TIMER（肿瘤免疫评估资源）解卷积方法 | NA | 基因表达谱 | 17个COAD和健康样本的基因表达谱 |
| 326 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Ecosystems in Papillary Thyroid Carcinoma Progression
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.729565
PMID:34790166
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术分析了乳头状甲状腺癌（PTC）进展中的生态系统 | 首次详细描述了PTC生态系统中的细胞组成和相互作用，特别是在原发肿瘤和淋巴结转移中的差异 | 研究仅基于单一患者样本，可能限制了结果的普遍性 | 深入理解乳头状甲状腺癌的生物学特性，为个性化治疗提供依据 | 乳头状甲状腺癌的原发肿瘤、淋巴结转移和癌旁组织 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组测序（Sc-RNA seq） | NA | 转录组数据 | 11,805个细胞转录组 |
| 327 | 2024-08-08 |
Identification and Validation of a Malignant Cell Subset Marker-Based Polygenic Risk Score in Stomach Adenocarcinoma Through Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.720649
PMID:34733840
|
研究论文 | 本研究旨在基于恶性细胞标记物的表达，构建胃腺癌（STAD）患者不良生存的多元风险评分（PRS） | 通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据，揭示了胃腺癌中有限的但显著的肿瘤内异质性，并提出了一种基于恶性细胞亚群标记物的PRS | NA | 构建并验证基于恶性细胞标记物的多元风险评分，以预测胃腺癌患者的预后 | 胃腺癌患者的恶性细胞标记物及其预后影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox回归分析 | RNA测序数据 | 涉及胃腺癌和正常胃组织的批量和单细胞RNA测序数据，以及两个独立的外部验证数据集 |
| 328 | 2024-08-08 |
Integrated Single-Cell Bioinformatics Analysis Reveals Intrinsic and Extrinsic Biological Characteristics of Hematopoietic Stem Cell Aging
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.745786
PMID:34737765
|
研究论文 | 本研究通过整合三个独立的造血干细胞（HSC）单细胞转录组数据集，揭示了HSC衰老的内在和外在生物学特征 | 首次识别出Stat3和Ifngr1作为偏向凋亡和炎症的衰老HSC的标志物，并发现Skp2诱导的信号通路在衰老HSC中加速G1期过渡 | NA | 阐明造血干细胞衰老的生物学特征及其潜在的标志物和治疗靶点 | 造血干细胞（HSC）的衰老机制 | 干细胞研究 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 三个独立的HSC单细胞转录组数据集 |
| 329 | 2024-08-08 |
Discussion of "Exponential-family Embedding with Application to Cell Developmental Trajectories for Single-cell RNA-seq Data"
2021, Journal of the American Statistical Association
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/01621459.2021.1880920
PMID:34744216
|
comments | 本文讨论了指数族奇异值分解（eSVD）在单细胞RNA-seq数据中细胞发育轨迹应用的新方法及其面临的挑战 | eSVD提供了一个灵活的降维框架，能够处理单参数指数族分布并已证明其一致性 | 本文讨论了eSVD及其他类似方法在未来需要解决的多个开放问题和挑战 | 探讨eSVD及其类似方法的潜力和未来研究方向 | eSVD方法及其在数据分析中的应用 | NA | NA | 指数族奇异值分解（eSVD） | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 330 | 2024-08-08 |
Meta-Analysis Reveals Transcription Factor Upregulation in Cells of Injured Mouse Sciatic Nerve
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.688243
PMID:34744629
|
meta-analysis | 本研究通过分析四个微阵列数据集和一个批量mRNA测序数据集，识别并验证了在小鼠坐骨神经损伤后远端神经节中至少两倍上调的55个转录因子 | 首次系统地分析了小鼠坐骨神经损伤后远端神经节中转录因子的上调情况，并通过单细胞RNA测序数据进行了验证 | NA | 旨在理解关键转录因子在外周神经再生中的功能，并为未来研究设计提供实验依据 | 小鼠坐骨神经损伤后的转录因子上调情况 | NA | NA | 微阵列数据分析，mRNA测序，单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 涉及四个微阵列数据集和一个批量mRNA测序数据集，以及单细胞RNA测序数据集 |
| 331 | 2024-08-08 |
A Dynamic Transcriptome Map of Different Tissue Microenvironment Cells Identified During Gastric Cancer Development Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.728169
PMID:34745098
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，生成了胃癌发展过程中不同组织微环境细胞的动态转录图谱 | 本研究首次揭示了组织微环境细胞在胃癌发展过程中的关键转变标志物和动态致癌轨迹 | NA | 揭示胃癌发展过程中组织微环境细胞的关键病理机制 | 胃癌发展过程中的组织微环境细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 332 | 2024-08-08 |
Ductal Macrophages Predominate in the Immune Landscape of the Lactating Mammary Gland
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.754661
PMID:34745127
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序、流式细胞术和三维共聚焦显微镜技术，研究了哺乳期小鼠乳腺组织的免疫景观，发现巨噬细胞在免疫细胞中占主导地位，并可分为至少两种亚型：导管和基质巨噬细胞 | 首次精确描述了哺乳期乳腺组织的免疫组成，特别是导管巨噬细胞的高比例及其在乳腺免疫中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 研究哺乳期乳腺组织的免疫组成，以改进乳腺炎的预防和治疗策略 | 哺乳期小鼠乳腺组织的免疫细胞组成 | 数字病理学 | 乳腺炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、三维共聚焦显微镜 | NA | 细胞 | 未明确提及具体样本数量 |
| 333 | 2024-08-08 |
The Single-Cell Sequencing: A Dazzling Light Shining on the Dark Corner of Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.759894
PMID:34745998
|
研究论文 | 本文讨论了单细胞测序（SCS）在肿瘤研究中的应用及其对肿瘤内异质性（ITH）的理解 | SCS能够测量单个细胞中的基因组序列分布和肿瘤细胞间的遗传变异性，从而提高对ITH的理解 | NA | 探讨SCS的进展及其在肿瘤中的应用 | 肿瘤细胞及其遗传变异性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序（SCS） | NA | 基因组序列 | 单个细胞 |
| 334 | 2024-08-08 |
Data-Driven Modeling of Breast Cancer Tumors Using Boolean Networks
2021, Frontiers in big data
IF:2.4Q2
DOI:10.3389/fdata.2021.656395
PMID:34746770
|
研究论文 | 本文提出了一种基于布尔网络的数据驱动模型，用于模拟乳腺癌肿瘤 | 结合单细胞RNA测序和相互作用组数据，研究上调基因的恶性子网络动态 | NA | 开发一种方法来检测与恶性吸引子稳定性相关的关键基因，这些基因的抑制可能应用于癌症治疗 | 乳腺癌肿瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq | 布尔网络 | 基因表达数据 | 来自癌症基因组图谱的单细胞乳腺癌数据集 |
| 335 | 2024-08-08 |
Identification of Key eRNAs for Spinal Cord Injury by Integrated Multinomial Bioinformatics Analysis
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.728242
PMID:34708039
|
研究论文 | 本研究通过多组学生物信息学分析，探讨了脊髓损伤（SCI）中关键增强子RNA（eRNAs）、转录因子（TFs）、信号通路和小分子抑制剂的作用。 | 构建了13个差异表达转录因子、6个差异表达增强子RNA、7个差异表达目标基因的调控网络，并发现了与SCI相关的潜在药物Trichostatin A。 | NA | 研究脊髓损伤中关键增强子RNA的作用及其调控机制。 | 脊髓损伤中的关键增强子RNA、转录因子、信号通路和小分子抑制剂。 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 微阵列数据分析、CIBERSORT算法、基因集变异分析（GSVA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、转座酶可及染色质测序（ATAC-seq） | NA | 微阵列数据、scRNA-seq数据、ChIP-seq数据、ATAC-seq数据 | 27名健康志愿者和25名慢性期脊髓损伤患者的周围血单核细胞（PBMC）样本 |
| 336 | 2024-08-08 |
Blood Immune Cell Composition Associated with Obesity and Drug Repositioning Revealed by Epigenetic and Transcriptomic Conjoint Analysis
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.714643
PMID:34712134
|
研究论文 | 本研究通过表观遗传学和转录组联合分析，探讨了肥胖相关的血液免疫细胞组成，并识别了用于肥胖管理的新型潜在药物。 | 本研究首次通过表观遗传学和转录组联合分析，揭示了肥胖患者中CD8+ T细胞和NK细胞的显著降低，并发现了11种具有肥胖控制潜力的药物。 | 研究样本量较小，仅包括35个肥胖样本和37个对照样本，可能影响结果的普遍性。 | 分析肥胖中的免疫细胞组成，并识别新型有效药物用于肥胖管理。 | 肥胖患者和健康对照的血液免疫细胞组成及药物靶点表达。 | 表观遗传学 | 肥胖 | DNA甲基化分析，mRNA表达微阵列，单细胞RNA测序，qPCR | NA | DNA甲基化数据，mRNA表达数据 | 72个样本（35个肥胖样本和37个对照样本） |
| 337 | 2024-08-08 |
TNFSF13 Is a Novel Onco-Inflammatory Marker and Correlates With Immune Infiltration in Gliomas
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.713757
PMID:34712225
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了TNFSF13（APRIL）在胶质瘤中的表达及其与患者预后和靶向治疗的关系 | 首次证实TNFSF13与胶质瘤中的免疫浸润和炎症反应相关，并可能作为新的诊断标志物和免疫治疗靶点 | NA | 探索TNFSF13作为胶质瘤的新诊断标志物和治疗靶点的潜力 | TNFSF13在胶质瘤中的表达及其与免疫浸润和炎症反应的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 338 | 2024-08-08 |
Immune Response in Severe and Non-Severe Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Infection: A Mechanistic Landscape
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.738073
PMID:34721400
|
研究论文 | 本文通过综合分析单细胞RNA测序数据，探讨了COVID-19感染中免疫重塑和严重反应的机制 | 揭示了低密度中性粒细胞和巨核细胞在淋巴细胞和髓系细胞间对话中的关键作用，并提供了淋巴细胞和髓系细胞相互作用的详细机制见解 | NA | 阐明COVID-19感染中免疫重塑和严重反应的机制 | COVID-19患者的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自四个已发表研究的数据，包括轻度/中度和重度感染的患者 |
| 339 | 2024-08-08 |
Phased differentiation of γδ T and T CD8 tumor-infiltrating lymphocytes revealed by single-cell transcriptomics of human cancers
2021, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2021.1939518
PMID:34721945
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，首次揭示了人类癌症中γδ T细胞与T CD8细胞的分化差异 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析，展示了γδ T细胞在癌症中的分化情况，并发现其在肿瘤微环境中的分化与健康血液中的情况不同 | NA | 探讨γδ T细胞在人类癌症中的分化情况及其与免疫检查点疗法的关联 | γδ T细胞和T CD8细胞在人类癌症中的分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约150个已发表的单细胞RNA测序数据集及人类肿瘤和小鼠模型的表型验证数据 |
| 340 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing in Multiple Pathologic Types of Renal Cell Carcinoma Revealed Novel Potential Tumor-Specific Markers
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.719564
PMID:34722263
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在多种病理类型的肾细胞癌中发现了新的潜在肿瘤特异性标记物 | 本研究首次在不同病理类型的肾细胞癌中识别出多种新的肿瘤特异性标记物，并验证了其在肿瘤细胞中的高表达 | 研究样本量较小，仅包括三种病理类型的肾细胞癌 | 研究旨在通过单细胞RNA测序技术揭示肾细胞癌的潜在肿瘤特异性标记物，以指导临床治疗 | 研究对象包括三种病理类型的肾细胞癌及正常肾脏组织 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 共30,263个高质量单细胞转录组信息 |