单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-08 |
Roseburia intestinalis: A Beneficial Gut Organism From the Discoveries in Genus and Species
2021, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2021.757718
PMID:34881193
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综述 | 本文综述了Roseburia intestinalis这一厌氧、革兰氏阳性、略弯曲的杆状鞭毛细菌在肠道中的作用及其在多种疾病治疗中的潜在价值 | 近期在初级培养技术、培养组学、单细胞测序和代谢组学技术上的进步提高了对Roseburia intestinalis的研究，揭示了其在人类健康和疾病治疗中的益处 | NA | 探讨Roseburia intestinalis在人类疾病治疗中的潜在作用 | Roseburia intestinalis及其在肠道炎症、能量稳态和多种疾病中的作用 | NA | 炎症性肠病, 2型糖尿病, 抗磷脂综合征, 动脉粥样硬化 | 初级培养技术, 培养组学, 单细胞测序, 代谢组学 | NA | NA | NA |
| 302 | 2024-08-08 |
Percutaneous Microwave Coagulation Therapy: A Promising Therapeutic Method for Breaking the Barrier of the Intertumor Heterogeneity
2021, Journal of healthcare engineering
DOI:10.1155/2021/7773163
PMID:34840703
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析四名肺癌患者的肿瘤微环境，并使用经皮微波凝固疗法治疗，结果显示该疗法能有效应对肿瘤间异质性 | 首次研究经皮微波凝固疗法解决肿瘤间异质性的能力 | 样本量较小，仅限于四名肺癌患者 | 探讨经皮微波凝固疗法在应对肿瘤间异质性方面的效果 | 四名肺癌患者的肿瘤微环境 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 四名肺癌患者 |
| 303 | 2024-08-08 |
Novel omics technology driving translational research in precision oncology
2021, Advances in genetics
DOI:10.1016/bs.adgen.2021.08.003
PMID:34844717
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综述 | 本文总结了癌症研究面临的当前挑战，并推动使用新型基因组学解决方案，全面概述了三种最近的基因组学技术：液体活检、单细胞RNA测序和空间转录组学 | 介绍了三种新型基因组学技术及其在精准肿瘤学中的应用 | NA | 推动精准肿瘤学的转化研究 | 癌症及其相关基因组学技术 | 数字病理学 | NA | 液体活检、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 304 | 2024-08-08 |
The Roles of IL-7 and IL-15 in Niches for Lymphocyte Progenitors and Immune Cells in Lymphoid Organs
2021, Current topics in microbiology and immunology
DOI:10.1007/978-3-030-86016-5_4
PMID:34850283
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研究论文 | 本文探讨了IL-7和IL-15在淋巴组织中对淋巴细胞前体和免疫细胞的作用 | 建立了IL-7和IL-15报告鼠系，成功检测到这两种细胞因子的表达，并利用单细胞RNA测序分析了淋巴组织中不同亚群的基质细胞 | 仍需进一步研究以阐明哪些基质细胞在骨髓中作为ILCs和NK细胞早期前体的niche | 研究IL-7和IL-15在淋巴组织中的作用及其对免疫细胞发育和维持的影响 | IL-7和IL-15在淋巴组织中的表达及其功能 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用特定细胞类型敲除鼠进行分析 |
| 305 | 2024-08-08 |
MapCell: Learning a Comparative Cell Type Distance Metric With Siamese Neural Nets With Applications Toward Cell-Type Identification Across Experimental Datasets
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.767897
PMID:34796179
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研究论文 | 本文介绍了一种使用孪生神经网络（SNN）学习比较细胞类型距离度量（MapCell）的方法，并展示了其在跨实验数据集的细胞类型识别中的应用 | 提出了一种基于深度度量学习的方法，使用孪生神经网络来捕捉细胞间的相似性，并促进不同实验间细胞类型注释的转移 | NA | 探索深度度量学习方法在跨实验数据集细胞类型识别中的应用 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集中的细胞类型 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 孪生神经网络（SNN） | 数据集 | 小规模训练集 |
| 306 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing deconvolutes the in vivo heterogeneity of human bone marrow-derived mesenchymal stem cells
2021, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.61950
PMID:34803492
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析了人骨髓来源间充质干细胞的细胞异质性 | 首次系统地剖析了人骨髓来源间充质干细胞的细胞亚型，揭示了其细胞异质性及其在维持骨骼稳态中的作用 | NA | 探究人骨髓来源间充质干细胞的转录多样性 | 人骨髓来源间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 来自两名人类受试者的CD271骨髓单个核细胞 |
| 307 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Heterogeneity of Tumor-Associated Macrophage in Non-Small Cell Lung Cancer and Differences Between Sexes
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.756722
PMID:34804043
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了非小细胞肺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在性别间的差异 | 首次在单细胞水平上详细分析了非小细胞肺癌中肿瘤相关巨噬细胞的亚型组成和功能异质性，并比较了性别对其的影响 | 研究仅限于早期吸烟的非小细胞肺癌患者，可能无法完全代表所有非小细胞肺癌患者的情况 | 阐明非小细胞肺癌中肿瘤相关巨噬细胞的亚型组成和功能异质性，并探讨性别对其的影响 | 非小细胞肺癌中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 早期吸烟的非小细胞肺癌患者 |
| 308 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals a Tumor-Reactive T Cell Signature Associated With Clinical Outcome and Immunotherapy Response In Melanoma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.758288
PMID:34804045
|
研究论文 | 本研究通过整合分析三个黑色素瘤中T细胞的单细胞RNA测序数据集，揭示了肿瘤微环境中T细胞的广泛异质性功能状态，并识别出表达肿瘤反应性标记和T细胞激活标志的肿瘤反应性T细胞亚群 | 本研究首次开发并验证了一个与临床结果和免疫治疗反应显著相关的肿瘤反应性T细胞相关标志（TRS），该标志在预测免疫治疗反应方面优于CD8+ T细胞浸润水平和先前发表的预后相关标志 | NA | 旨在识别肿瘤反应性T细胞并开发一个与临床结果和免疫治疗反应相关的标志 | 黑色素瘤中的T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 三个黑色素瘤T细胞数据集及四个外部独立队列 |
| 309 | 2024-08-08 |
Clinical Impact of Molecular Subtyping of Pancreatic Cancer
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.743908
PMID:34805152
|
研究论文 | 本文探讨了胰腺癌分子亚型对临床的影响及其潜在的临床意义 | 文章介绍了通过激光捕获显微切割和单细胞RNA测序技术揭示的胰腺癌细胞群体的基因组进化，以及不同亚型在化疗反应和生存率上的差异 | 文章未明确提及具体的局限性 | 研究胰腺癌分子亚型的临床相关性，以优化从实验室到临床的转化 | 胰腺癌的分子亚型及其对治疗反应和生存率的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 310 | 2024-08-08 |
Papillary Thyroid Carcinoma Landscape and Its Immunological Link With Hashimoto Thyroiditis at Single-Cell Resolution
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.758339
PMID:34805166
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了甲状腺乳头状癌（PTC）及其与桥本甲状腺炎（HT）的免疫学联系 | 首次在单细胞分辨率下揭示了PTC的肿瘤微环境异质性及其与HT的免疫学联系 | 样本量较小，仅包括八名PTC患者，其中三名同时患有HT | 深入理解PTC的肿瘤微环境及其与HT的免疫学联系 | 甲状腺乳头状癌（PTC）及其与桥本甲状腺炎（HT）的关系 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八名PTC患者，其中三名同时患有HT |
| 311 | 2024-08-08 |
Deciphering the Intercellular Communication Network of Peripartum Decidua that Orchestrates Delivery
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.770621
PMID:34805176
|
研究论文 | 本研究通过CellCall方法基于围产期蜕膜的scRNA-seq数据重建了蜕膜细胞间的通信网络，并分析了其在分娩和母胎免疫耐受中的作用 | 首次系统地解码了围产期蜕膜中的细胞间通信网络及其内部级联反应，并探讨了其在分娩中的作用 | NA | 旨在理解妊娠维持和分娩过渡中蜕膜细胞间通信的机制 | 围产期蜕膜中的细胞间通信网络及其在分娩和母胎免疫耐受中的作用 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | scRNA-seq, 单细胞BCR/TCR测序 | CellCall方法 | 单细胞RNA测序数据 | 围产期蜕膜样本 |
| 312 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Revealed a Critical Role of SPP1/CD44-Mediated Crosstalk Between Macrophages and Cancer Cells in Glioma
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.779319
PMID:34805184
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，揭示了高级别胶质瘤中SPP1/CD44介导的巨噬细胞与癌细胞间的交叉对话在肿瘤进展中的关键作用 | 本研究首次揭示了SPP1/CD44信号轴在高级别胶质瘤进展中的重要作用，并提出其作为潜在治疗靶点的可能性 | NA | 旨在识别驱动高级别胶质瘤肿瘤异质性的细胞和分子机制 | 高级别胶质瘤中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一个高级别胶质瘤样本 |
| 313 | 2024-08-08 |
Dissecting the heterogeneity and tumorigenesis of BRCA1 deficient mammary tumors via single cell RNA sequencing
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.63995
PMID:34815798
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了BRCA1缺陷型乳腺肿瘤的异质性及其肿瘤发生机制 | 本研究首次将BRCA1缺陷型乳腺肿瘤分为四个亚型，并揭示了肿瘤内异质性的主要原因，包括细胞增殖、DNA损伤反应/修复和上皮-间质转化（EMT）的活性差异 | NA | 全面阐明BRCA1缺陷型乳腺肿瘤的异质性及其肿瘤发生和进展的潜在机制 | BRCA1缺陷型乳腺肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 来自敲除小鼠的乳腺腺体细胞和乳腺肿瘤细胞 |
| 314 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of cell composition and origin identified by single-cell transcriptomics in renal cysts of patients with autosomal dominant polycystic kidney disease
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.57220
PMID:34815804
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了常染色体显性多囊肾病患者的肾囊肿细胞组成和来源 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了多囊肾囊肿可能来源于集合管或同时来源于近端小管和亨利环，并发现不同来源的囊肿上皮细胞具有不同的基因集激活 | 研究样本仅来自一名患者，可能影响结果的普遍性 | 探索常染色体显性多囊肾病肾囊肿的细胞组成和来源 | 常染色体显性多囊肾病患者的肾囊肿 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一名患者的正常肾组织和七个囊肿 |
| 315 | 2024-08-08 |
Characterization of Alzheimer's Disease-Associated Excitatory Neurons via Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2021, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2021.742176
PMID:34819847
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研究论文 | 本研究利用公开的单核RNA测序数据集，在5XFAD转基因模型和野生型小鼠中揭示了与阿尔茨海默病相关的兴奋性神经元群体（C3:Ex.Neuron）的特征 | 首次详细描述了阿尔茨海默病中神经元细胞群体的特征，并识别出一种先前未被发现的兴奋性神经元亚型（C3.1） | NA | 探索阿尔茨海默病中神经元细胞群体的特征 | 阿尔茨海默病中的兴奋性神经元群体 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 5XFAD转基因模型和野生型小鼠 |
| 316 | 2024-08-08 |
Development of an Autophagy-Based and Stemness-Correlated Prognostic Model for Hepatocellular Carcinoma Using Bulk and Single-Cell RNA-Sequencing
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.743910
PMID:34820373
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研究论文 | 本研究开发了一种基于自噬和干细胞相关性的肝细胞癌预后模型，使用批量和单细胞RNA测序数据 | 首次结合批量和单细胞RNA测序数据，构建了基于自噬相关基因的肝细胞癌预后模型，并验证了其预测效能 | 研究仅在ICGC和TCGA数据库中验证了预后模型的效能，未来需在更多独立数据集中进行验证 | 开发和验证一种新的肝细胞癌预后模型，以提高患者生存预测的准确性 | 肝细胞癌（HCC）及其自噬相关基因和干细胞特性 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | LASSO回归分析 | RNA测序数据 | 使用了ICGC和TCGA数据库中的数据，具体样本数量未在摘要中提及 |
| 317 | 2024-08-08 |
Prediction of Non-canonical Routes for SARS-CoV-2 Infection in Human Placenta Cells
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.614728
PMID:34820418
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研究论文 | 研究分析了SARS-CoV-2在人类胎盘细胞中的非经典感染途径 | 发现了胎盘细胞中可能作为SARS-CoV-2非经典感染途径的蛋白质 | NA | 探讨SARS-CoV-2在胎盘细胞中的感染和复制机制 | 人类胎盘细胞中的SARS-CoV-2感染途径 | NA | COVID-19 | 微阵列和单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 318 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Novel Role of Ezh2 in NK Cell Maturation and Function
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.724276
PMID:34764950
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索Ezh2在NK细胞成熟和功能中的新作用 | 发现Ezh2通过激活AP-1家族基因表达在NK细胞发育中起关键作用，并揭示了Ezh2-AP-1-Klrg1轴在改变NK细胞成熟轨迹和细胞毒性中的新角色 | NA | 探索Ezh2在NK细胞成熟过程中的作用 | NK细胞的成熟和功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及六个不同阶段的NK细胞 |
| 319 | 2024-08-08 |
GeneMarkeR: A Database and User Interface for scRNA-seq Marker Genes
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.763431
PMID:34764987
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research paper | 本文介绍了一个名为GeneMarkeR的数据库和用户界面，用于scRNA-seq标记基因的检索 | GeneMarkeR采用了一种新算法，能够跨物种、方法和样本类型检索显示细胞类型特异性的标记基因，并支持在线提交和更新 | NA | 开发一个标准化的数据库和用户界面，以支持scRNA-seq分析中的细胞类型识别 | scRNA-seq标记基因 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | text | 261,000行标准化标记基因结果，来自25项研究，涉及21,012个独特的基因组实体和99种独特的细胞类型 |
| 320 | 2024-08-08 |
6-Phosphogluconolactonase Promotes Hepatocellular Carcinogenesis by Activating Pentose Phosphate Pathway
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.753196
PMID:34765603
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研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌患者和健康个体的肝细胞单细胞测序数据，发现6-磷酸葡萄糖酸内酯酶（PGLS）与未分化型肝细胞癌亚型相关，并揭示了PGLS通过激活戊糖磷酸途径促进肝细胞癌发生发展的机制。 | 首次揭示PGLS在肝细胞癌中的作用及其通过调节戊糖磷酸途径影响癌细胞代谢的机制。 | NA | 探讨6-磷酸葡萄糖酸内酯酶在肝细胞癌中的作用及其机制。 | 肝细胞癌（HCC）细胞及其代谢途径。 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | 肝细胞癌患者和健康个体的肝细胞 |