单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 709 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-08 |
Handling the Cellular Complex Systems in Alzheimer's Disease Through a Graph Mining Approach
2021, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-030-78775-2_16
PMID:34973018
|
研究论文 | 本文通过图挖掘方法处理阿尔茨海默病中的细胞复杂系统，开发了一种针对单细胞RNA-seq实验的子通路分析方法，以识别潜在的扰动生物过程。 | 本文提出了一种新的子通路分析方法，用于处理单细胞RNA-seq数据，以减少假发现并识别与神经退行性变相关的扰动生物过程。 | NA | 旨在通过图挖掘方法揭示复杂人类疾病的病理机制，并改进诊断和治疗方法。 | 阿尔茨海默病中的细胞系统及其生物过程。 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq | 图挖掘 | RNA-seq数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 262 | 2024-08-08 |
Low Expression of YTH Domain-Containing 1 Promotes Microglial M1 Polarization by Reducing the Stability of Sirtuin 1 mRNA
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.774305
PMID:34975410
|
研究论文 | 本文研究了m6A修饰在视网膜小胶质细胞激活中的作用，发现YTH域包含蛋白1（YTHDC1）的低表达通过降低Sirtuin 1 mRNA的稳定性促进小胶质细胞M1极化 | 首次揭示了YTHDC1在视网膜小胶质细胞炎症反应调节中的关键作用 | NA | 探讨m6A修饰在视网膜小胶质细胞激活中的作用 | 视网膜小胶质细胞在葡萄膜炎中的变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠视网膜细胞 |
| 263 | 2024-08-08 |
The Immune Barrier of Porcine Uterine Mucosa Differs Dramatically at Proliferative and Secretory Phases and Could Be Positively Modulated by Colonizing Microbiota
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.750808
PMID:34917075
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了猪子宫内膜在增殖期和分泌期的黏膜免疫差异，并探讨了定植微生物对其的正向调节作用 | 首次揭示了猪子宫内膜在不同生理阶段黏膜免疫的显著变化及其与定植微生物的相互作用 | NA | 探究猪子宫内膜在不同生理阶段的黏膜免疫变化及其分子调控机制 | 猪子宫内膜在增殖期和分泌期的黏膜免疫 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 264 | 2024-08-08 |
Imaging of Glioblastoma Tumor-Associated Myeloid Cells Using Nanobodies Targeting Signal Regulatory Protein Alpha
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.777524
PMID:34917090
|
研究论文 | 本研究使用针对信号调节蛋白α（SIRPα）的纳米抗体来成像胶质母细胞瘤（GBM）中的肿瘤相关髓系细胞 | 首次使用针对SIRPα的纳米抗体在无血脑屏障渗透的情况下，非侵入性地成像GBM肿瘤中的髓系细胞 | 纳米抗体在GL261脑肿瘤中的渗透性较低 | 探索使用SIRPα靶向纳米抗体非侵入性地成像GBM肿瘤中髓系细胞的可行性 | 胶质母细胞瘤中的肿瘤相关髓系细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | CITE-Seq | NA | 图像 | 包括人GBM样本和GL261肿瘤小鼠模型 |
| 265 | 2024-08-08 |
A Novel Single-Cell RNA Sequencing Data Feature Extraction Method Based on Gene Function Analysis and Its Applications in Glioma Study
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.797057
PMID:34917514
|
研究论文 | 本文提出了一种基于基因功能分析的单细胞RNA测序数据特征提取方法FEGFS，并应用于胶质瘤研究 | FEGFS方法利用已知的基因功能，通过基因本体论（GO）术语推导功能基因集，并通过语义相似性分析和基因重复率降低来减少冗余，然后应用核主成分分析在每个非冗余功能基因集上选择特征，并将这些特征组合用于后续的聚类分析 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序数据特征提取方法，并评估其在胶质瘤研究中的应用 | 单细胞RNA测序数据和胶质瘤细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 核主成分分析 | 基因数据 | 六个真实的单细胞RNA测序数据集，包括Pollen、Goolam、Klein和Zeisel等 |
| 266 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Heterogeneity in Gene Regulatory Networks in Colorectal Cancer
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.765578
PMID:34917613
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据全面分析了结直肠癌患者的共识分子亚型（CMS），并探讨了基因调控网络的异质性及其关键调控因子 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了结直肠癌中不同CMS的基因调控网络异质性，并识别了关键的转录因子 | NA | 阐明结直肠癌中基因调控网络的异质性并识别关键调控因子 | 结直肠癌患者的共识分子亚型（CMS）及其基因调控网络 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 267 | 2024-08-08 |
Microglia Impede Oligodendrocyte Generation in Aged Brain
2021, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S338242
PMID:34924766
|
研究论文 | 本文研究了衰老大脑中少突胶质细胞的异质性及其在髓鞘丢失中的作用机制 | 首次揭示了衰老大脑中活化的微胶质细胞通过释放炎症因子抑制少突胶质前体细胞分化的机制，并提出了Stat1作为潜在的治疗靶点 | NA | 全面描绘年轻和老年小鼠中少突胶质细胞的异质性，并揭示衰老过程中髓鞘丢失的潜在机制 | 年轻和老年小鼠及人类的少突胶质细胞及其前体细胞 | 神经科学 | NA | 扩散张量成像、免疫荧光染色、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因序列 | 年轻和老年小鼠及人类样本 |
| 268 | 2024-08-08 |
The Clinical Significance and Potential Molecular Mechanism of Upregulated CDC28 Protein Kinase Regulatory Subunit 1B in Osteosarcoma
2021, Journal of oncology
DOI:10.1155/2021/7228584
PMID:34925510
|
研究论文 | 本研究探讨了CDC28蛋白激酶调节亚基1B（CKS1B）在骨肉瘤（OS）中的临床意义和潜在分子机制 | 首次提供了CKS1B在骨肉瘤中上调的充分证据，并探讨了其在骨肉瘤进展中的作用 | 临床病理和预后分析未显示出显著意义 | 探讨CKS1B在骨肉瘤中的表达及其对患者临床病理特征和生存率的影响 | 骨肉瘤（OS）和非肿瘤组织样本 | NA | 骨肉瘤 | 免疫组织化学（IHC），组织微阵列，单细胞RNA测序 | NA | 组织样本，细胞系 | 197个骨肉瘤样本和83个非肿瘤样本 |
| 269 | 2024-08-08 |
A Deep-Learning Pipeline for TSS Coverage Imputation From Shallow Cell-Free DNA Sequencing
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.684238
PMID:34926480
|
research paper | 本文介绍了一种用于从浅层游离DNA测序中进行转录起始位点（TSS）覆盖率推算的深度学习流程 | 提出的Autoencoder of cfDNA TSS（AECT）覆盖率推算方法在TSS覆盖率准确性和捕捉潜在生物特征方面优于现有的单细胞测序推算算法 | NA | 开发一种高准确性且成本适中的非侵入性筛查方法 | 游离DNA（cfDNA）的转录起始位点（TSS）覆盖率 | machine learning | breast cancer, rectal cancer | NA | Autoencoder | DNA sequencing data | NA |
| 270 | 2024-08-08 |
MCC Regulator of WNT Signaling Pathway (MCC) Is a Podocyte Essential Gene
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.777563
PMID:34926519
|
research paper | 本研究通过单细胞RNA测序技术检测了小鼠足细胞中WNT信号通路调节因子MCC的表达，并证实了MCC对足细胞的重要性 | 首次证实MCC是足细胞的关键基因，并通过RNA测序和生物信息学分析揭示了MCC在足细胞中的作用机制 | 未发现MCC下调对细胞周期和β-catenin信号活性的显著影响，可能存在其他未检测到的机制 | 探讨MCC在足细胞中的作用及其对足细胞疾病的影响 | 小鼠和人类足细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类足细胞样本 |
| 271 | 2024-08-08 |
FaDA: A web application for regular laboratory data analyses
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0261083
PMID:34928943
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为FaDA的基于网络的应用程序，用于非计算科学家进行常规实验室数据分析 | FaDA提供了一个免费的、直观的界面，使没有生物信息学技能的生物学家能够轻松快速地进行常见的实验室数据分析 | NA | 开发一个通用的网络工具，用于非计算科学家进行常规实验室数据分析 | 常规实验室数据分析工具 | 生物信息学 | NA | R Shiny包 | NA | 实验室数据 | NA |
| 272 | 2024-08-08 |
Intra-Tumoral Expression of SLC7A11 Is Associated with Immune Microenvironment, Drug Resistance, and Prognosis in Cancers: A Pan-Cancer Analysis
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.770857
PMID:34938318
|
研究论文 | 本文通过泛癌分析研究了肿瘤内SLC7A11表达与免疫微环境、药物抗性和癌症预后的关系。 | 首次系统阐述了SLC7A11在多种癌症中的表达及其对患者生存和免疫治疗反应的影响。 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证。 | 探讨SLC7A11在癌症中的表达与患者生存和免疫治疗反应的关系。 | SLC7A11在多种癌症中的表达及其生物学功能。 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞测序, CRISPR, RNAi | NA | 基因表达数据 | 25/27种癌症类型，多种胰腺癌细胞系 |
| 273 | 2024-08-08 |
CREM Is Correlated With Immune-Suppressive Microenvironment and Predicts Poor Prognosis in Gastric Adenocarcinoma
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.697748
PMID:34938728
|
研究论文 | 本研究利用生物信息学方法探讨了转录抑制因子cAMP反应元件调节因子（CREM）在胃腺癌（GAC）中的作用 | 发现CREM的高表达与GAC中的T细胞耗竭和M2极化相关，表明CREM可能作为GAC的预后生物标志物 | NA | 探索CREM在胃腺癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 胃腺癌（GAC）中的CREM表达及其与免疫微环境的关系 | 数字病理学 | 胃癌 | 生物信息学方法，单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 274 | 2024-08-08 |
Inflammatory Cells Accelerated Carotid Artery Calcification via MMP9: Evidences From Single-Cell Analysis
2021, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2021.766613
PMID:34938784
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析，探讨了炎症细胞通过MMP9加速颈动脉钙化的机制 | 首次揭示了炎症巨噬细胞样VSMCs亚群的存在，并确定了MMP9在VSMCs表型转化中的重要作用 | NA | 研究血管平滑肌细胞在钙化早期的转化过程及其机制 | 颈动脉钙化核心及间质组织的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 275 | 2024-08-08 |
Reverse engineering of a mechanistic model of gene expression using metastability and temporal dynamics
2021, In silico biology
DOI:10.3233/ISB-210226
PMID:34897081
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CARDAMOM的新算法，用于从时间戳单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络（GRN），该算法利用了细胞分化的亚稳态和转录爆发的概念 | 首次描述了一种利用亚稳态概念进行GRN推断的方法 | NA | 开发一种新的算法来推断基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | CARDAMOM算法 | 时间戳单细胞RNA测序数据 | NA |
| 276 | 2024-08-08 |
Identifying Diagnostic and Prognostic Biomarkers and Candidate Therapeutic Drugs of Gastric Cancer Based on Transcriptomics and Single-Cell Sequencing
2021, Pathology oncology research : POR
DOI:10.3389/pore.2021.1609955
PMID:34899080
|
研究论文 | 本研究通过转录组学和单细胞测序技术，筛选并验证了胃癌的诊断和预后生物标志物以及潜在的治疗药物靶点 | 本研究通过整合GSE54129和TCGA STAD数据集，识别了胃癌中的关键基因，并通过单细胞RNA测序进一步验证了这些基因的表达 | 本研究主要依赖于公共数据库和单细胞测序数据，可能存在样本选择偏倚和数据集的局限性 | 探索胃癌的新诊断和预后指标以及潜在的治疗靶点 | 胃癌的诊断、预后以及治疗药物敏感性 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 222个重叠基因，17个关键基因 |
| 277 | 2024-08-08 |
MultiCapsNet: A General Framework for Data Integration and Interpretable Classification
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.767602
PMID:34899854
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MultiCapsNet的新型深度学习模型，该模型基于CapsNet和scCapsNet构建，具有数据集成简便和模型解释性高的优点 | MultiCapsNet模型能够处理模块化特征，这在生物学领域中常见，并且提供了数据源的重要性评分，无需额外的评分确定步骤 | NA | 展示MultiCapsNet作为可解释分类器处理模块化输入的能力 | MultiCapsNet模型在不同数据类型和应用场景下的性能 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CapsNet | 数据集 | 三个不同数据类型和应用场景的数据集 |
| 278 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Multiple Pathways and the Tumor Microenvironment Could Lead to Chemotherapy Resistance in Cervical Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.753386
PMID:34900703
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了宫颈癌组织中的细胞，揭示了化疗耐药性的分子机制及其与肿瘤微环境的关系 | 首次全面分析了预处理和化疗耐药的宫颈癌组织细胞，揭示了化疗耐药性的分子机制 | 研究样本仅包括宫颈鳞状细胞癌、宫颈腺癌和慢性宫颈炎，可能无法完全代表所有宫颈癌类型 | 旨在全面分析宫颈癌组织细胞，生成细胞群体的分子普查，并探讨化疗耐药性的分子机制 | 宫颈鳞状细胞癌、宫颈腺癌和慢性宫颈炎患者的活检组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 24,371个细胞 |
| 279 | 2024-08-08 |
Chromatin Accessibility Predetermines Odontoblast Terminal Differentiation
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.769193
PMID:34901015
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序，揭示了牙本质生成过程中染色质可及性与成牙本质细胞终末分化的关系 | 首次展示了染色质可及性在成牙本质细胞终末分化中的作用，并通过时间序列ATAC-seq实验验证了ATF5的正向作用 | NA | 探讨染色质可及性如何影响成牙本质细胞的终末分化 | 成牙本质细胞的分化过程及相关的染色质可及性变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, ATAC-seq, H3K27Ac CUT and Tag | NA | RNA序列, 染色质可及性数据 | 使用E18.5的牙乳头细胞进行研究 |
| 280 | 2024-08-08 |
Emerging Technologies to Study the Glomerular Filtration Barrier
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.772883
PMID:34901088
|
综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序、生物信息学空间转录组学以及肾脏类器官和芯片上的肾小球等技术，对肾小球滤过屏障病理生理学的理解 | 介绍了单细胞RNA测序和生物信息学空间转录组学等新技术在研究肾小球滤过屏障中的应用 | NA | 探讨新技术如何促进对肾小球病理生理学的理解，并推动个性化治疗策略的发展 | 肾小球滤过屏障的细胞和分子变化 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |