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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis of small and large wounds reveals the distinct spatial organization of regenerative fibroblasts
2021-01, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14244
PMID:33237598
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研究论文 | 本文通过比较小疤痕伤口和大再生伤口的单细胞转录组数据,揭示了再生纤维母细胞在伤口诱导的毛囊新生中的不同空间组织。 | 发现了在再生伤口条件下过度表达Crabp1蛋白的新型上部伤口纤维母细胞,并提供了计算测试来映射这些细胞在大伤口中的空间位置。 | NA | 研究大伤口中更具再生能力的真皮细胞和分子成分,以及纤维母细胞系在伤口诱导的毛囊新生中的作用。 | 小疤痕伤口和大再生伤口的单细胞转录组数据。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 182 | 2024-08-07 |
Transcript assembly improves expression quantification of transposable elements in single-cell RNA-seq data
2021-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.265173.120
PMID:33355230
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研究论文 | 本文建立了一个适用于多种技术平台生成的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据的转座元件(TE)表达定量流程 | 首次开发了针对TE的scRNA-seq定量工具,提高了TE表达量测定的准确性 | NA | 解决目前缺乏针对TE的scRNA-seq定量工具的问题,以解析单细胞分辨率的TE表达动态 | 转座元件(TE)及其在单细胞RNA测序数据中的表达 | RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 包括小鼠胚胎干细胞和早期胚胎发育阶段的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 183 | 2024-08-07 |
Fibrinolysis influences SARS-CoV-2 infection in ciliated cells
2021-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.01.07.425801
PMID:33442688
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研究论文 | 研究分析了单细胞RNA测序数据,探讨了纤溶酶在SARS-CoV-2感染纤毛细胞中的作用及其与ENaC蛋白的相互作用 | 首次揭示了SARS-CoV-2通过与ENaC纤溶酶网络相互作用,加速病毒侵入易感细胞,并可能导致与ENaC相关的肺水肿呼吸状况 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染纤毛细胞的机制及其与ENaC蛋白的相互作用 | 纤溶酶、ENaC蛋白、SARS-CoV-2受体ACE2在不同细胞类型中的表达 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 涉及不同类型的上皮细胞和白细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 184 | 2024-08-07 |
Co-stimulation with opposing macrophage polarization cues leads to orthogonal secretion programs in individual cells
2021-01-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20540-2
PMID:33436596
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research paper | 本研究使用单细胞RNA测序探索在同时刺激炎症因子LPS和IFN-γ以及解决性细胞因子IL-4的情况下,单个巨噬细胞的响应机制 | 研究发现,负交叉调控导致单个共刺激巨噬细胞中T细胞极化细胞因子基因Il6和Il12b与IL-4相关因子Arg1和Chil3的互斥表达 | NA | 探讨巨噬细胞在同时接受不同刺激信号时的转录响应和功能多样性 | 巨噬细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个单个巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 185 | 2024-08-07 |
Cardiomyocytes stimulate angiogenesis after ischemic injury in a ZEB2-dependent manner
2021-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20361-3
PMID:33398012
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研究论文 | 本文研究了转录因子ZEB2在心肌细胞中的作用,特别是在缺血损伤后促进血管生成的能力 | 首次揭示了ZEB2在心肌细胞中的增加及其通过调节心肌细胞与内皮细胞间的对话来增强缺血后血管生成的机制 | NA | 探索增强心脏修复和恢复血管网络的因素 | 心肌细胞中的转录因子ZEB2及其在缺血损伤后的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 186 | 2024-08-07 |
Cholesterol-Induced Phenotypic Modulation of Smooth Muscle Cells to Macrophage/Fibroblast-like Cells Is Driven by an Unfolded Protein Response
2021-01, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.315164
PMID:33028096
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research paper | 研究胆固醇诱导的血管平滑肌细胞向巨噬细胞/成纤维细胞样细胞表型转变的分子途径 | 揭示了未折叠蛋白反应(UPR)在胆固醇诱导的血管平滑肌细胞表型转变中的必要性和充分性 | NA | 探究胆固醇诱导血管平滑肌细胞表型转变的分子机制 | 血管平滑肌细胞(SMCs)及其在胆固醇暴露下的表型变化 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | RNA sequencing | NA | NA | NA | NA | NA |
| 187 | 2024-08-07 |
Ndufs1 Deficiency Aggravates the Mitochondrial Membrane Potential Dysfunction in Pressure Overload-Induced Myocardial Hypertrophy
2021, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2021/5545261
PMID:33763166
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析scRNA-seq和微阵列数据,探讨了Ndufs1缺乏在压力超负荷诱导的心肌肥大中的作用及其机制。 | 首次揭示了Ndufs1在压力超负荷诱导的心肌肥大中的关键作用,并通过动物实验和细胞模型验证了其对线粒体功能的影响。 | 研究主要集中在细胞和动物模型上,尚未在人体中进行验证。 | 探讨Ndufs1缺乏在压力超负荷诱导的心肌肥大中的作用及其机制。 | Ndufs1在心肌肥大中的作用及其对线粒体功能的影响。 | NA | 心血管疾病 | scRNA-seq, 微阵列 | NA | 基因表达数据 | 使用TAC小鼠模型和Ang II诱导的心肌细胞模型进行研究。 | NA | NA | NA | NA |
| 188 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Immunological Profiles of Renal Allograft Rejection in Mice
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.693608
PMID:34367152
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了小鼠肾移植排斥模型中的免疫细胞特征 | 首次揭示了从小鼠急性排斥到慢性排斥过程中免疫细胞类型的变化及其对排斥过程的影响 | NA | 研究肾移植排斥过程中的免疫细胞特征及其变化 | 小鼠肾移植排斥模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10,921个白细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 189 | 2024-08-07 |
Integrated Systems Analysis of the Murine and Human Pancreatic Cancer Glycomes Reveals a Tumor-Promoting Role for ST6GAL1
2021, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2021.100160
PMID:34634466
|
研究论文 | 本文通过系统方法整合了KC小鼠和人类胰腺癌患者的糖组分析,识别了在癌症形成中可能起作用的糖类 | 创建了一种新型小鼠模型,通过胰腺特异性遗传删除ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 1酶,研究其对胰腺癌的影响 | 某些人类糖组变化在KC小鼠模型中未观察到 | 识别在胰腺癌形成中起作用的糖类,并开发针对这些糖类的治疗方法 | 小鼠和人类胰腺癌样本的糖组 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 糖组分析 | NA | 序列数据 | 包括KC小鼠模型和人类胰腺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 190 | 2024-08-07 |
Deep Parallel Characterization of AAV Tropism and AAV-Mediated Transcriptional Changes via Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.730825
PMID:34759919
|
研究论文 | 本文开发了一种实验和计算相结合的单细胞RNA测序(scRNA-seq)流程,用于高分辨率地表征编码rAAV池的趋向性和响应 | 首次采用scRNA-seq技术并行表征AAV的趋向性和转录变化,发现了未被识别的AAV衣壳靶向偏差和细胞类型特异性的短暂反应 | NA | 旨在开发安全且精确的基因递送载体,并展示在单细胞水平上理解基因疗法响应的重要性 | 重组腺相关病毒(rAAV)的趋向性和转录变化 | 基因疗法 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 涉及多种细胞和组织类型 | NA | NA | NA | NA |
| 191 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Identifies Phagocytosis-Related Dual-Feature Cells in A Model of Acute Otitis Media in Rats
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.760954
PMID:34759932
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,在急性中耳炎的大鼠模型中识别出与吞噬作用相关的双特征细胞 | 首次在急性中耳炎模型中发现具有吞噬作用相关双特征的稀有细胞群,并揭示了巨噬细胞在炎症反应中的关键作用 | NA | 探究急性中耳炎发展的分子机制及多细胞生态系统中的细胞间对话 | 大鼠急性中耳炎模型中的中耳黏膜细胞 | 数字病理学 | 耳部疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 共测序了来自炎症中耳黏膜的7023个细胞和健康中耳黏膜的5258个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 192 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals B Cells Are Important Regulators in Fracture Healing
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.666140
PMID:34819916
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术,揭示了B细胞在骨折愈合过程中的重要作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了骨折愈合过程中B细胞的数量变化及其对骨形成和吸收活动的影响 | 研究主要集中在小鼠模型上,对人类骨折愈合过程中B细胞的作用描述较少 | 探讨B细胞在骨折愈合中的作用及其机制 | 骨折组织中的免疫细胞,特别是B细胞 | 数字病理学 | 骨折 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括中性粒细胞、单核细胞、T细胞、B细胞和浆细胞等多种免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 193 | 2024-08-07 |
Cellinker: a platform of ligand-receptor interactions for intercellular communication analysis
2021-Jan-20, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab036
PMID:33471060
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研究论文 | 本文开发了Cellinker平台,一个用于细胞间通信分析的配体-受体相互作用资源 | Cellinker提供了超过3,700个人类和3,200个鼠类配体-受体蛋白-蛋白相互作用以及400多个内源性小分子相关的配体-受体相互作用,并特别收集了与冠状病毒感染相关的16个配体-受体相互作用信息 | NA | 提供一个全面的、高可信度的资源,用于检索配体-受体相互作用,以研究细胞间通信的功能效应 | 配体-受体相互作用及其在细胞间通信中的作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质-蛋白相互作用数据 | 超过3,700个人类和3,200个鼠类配体-受体相互作用,以及400多个内源性小分子相关的相互作用 | NA | NA | NA | NA |
| 194 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of Schistosoma mansoni identifies a conserved genetic program controlling germline stem cell fate
2021-01-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20794-w
PMID:33473133
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了血吸虫的生殖干细胞命运调控的遗传程序 | 首次揭示了血吸虫生殖干细胞增殖与分化的遗传调控机制,并发现该机制在扁形动物中具有保守性 | NA | 研究血吸虫生殖干细胞的分子调控机制 | 血吸虫的生殖干细胞 | 分子生物学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 195 | 2024-08-07 |
Machine learning identifies novel blood protein predictors of penetrating and stricturing complications in newly diagnosed paediatric Crohn's disease
2021-01, Alimentary pharmacology & therapeutics
IF:6.6Q1
DOI:10.1111/apt.16136
PMID:33131065
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法,识别出与新诊断的儿童克罗恩病穿透性和狭窄并发症相关的新型血液蛋白质预测因子。 | 本研究首次识别出与儿童克罗恩病进展相关的特定血液蛋白质标记物,这些标记物在肠道和血液中的细胞表达有显著差异。 | 研究样本量相对较小,且仅限于儿童克罗恩病患者,可能限制了结果的普遍性。 | 旨在识别与克罗恩病并发症相关的新型血液蛋白质生物标志物。 | 新诊断的儿童克罗恩病患者及其穿透性和狭窄并发症。 | 机器学习 | 克罗恩病 | 近端延伸分析(Olink Proteomics) | 随机生存森林(RSF) | 蛋白质 | 265名患者,平均年龄11.6岁,其中73名患者出现狭窄并发症,34名患者出现穿透并发症。 | NA | NA | NA | NA |
| 196 | 2024-08-07 |
Tumor-intrinsic and -extrinsic determinants of response to blinatumomab in adults with B-ALL
2021-01-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020006287
PMID:32881995
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研究论文 | 研究了44名复发或难治性B-ALL成年患者在接受blinatumomab治疗后的肿瘤内在和外在反应决定因素 | 发现了CD19 ex2part剪接变体作为预测blinatumomab治疗失败的新的生物标志物 | NA | 确定blinatumomab治疗B-ALL的肿瘤内在和外在反应决定因素 | 复发或难治性B-ALL成年患者 | NA | B-ALL | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 44名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 197 | 2024-08-07 |
A spatially resolved brain region- and cell type-specific isoform atlas of the postnatal mouse brain
2021-01-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20343-5
PMID:33469025
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研究论文 | 本文通过单细胞长读序技术研究了小鼠海马体和前额叶皮层在出生后第7天的45种细胞类型中不同脑区间差异性剪接变体的表达 | 本文首次在单细胞分辨率下展示了脑区间剪接变体的差异表达,并发现这些差异与功能上不同的蛋白质变体相对应 | NA | 研究脑区间和细胞类型特异性的剪接变体表达差异 | 小鼠海马体和前额叶皮层在出生后第7天的45种细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞长读序技术 | NA | 转录组数据 | 小鼠海马体和前额叶皮层的45种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 198 | 2024-08-07 |
scRNA-Seq Reveals New Enteric Nervous System Roles for GDNF, NRTN, and TBX3
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2020.12.014
PMID:33444816
|
研究论文 | 本研究通过单核和单细胞RNA测序技术,揭示了GDNF、NRTN和TBX3在肠神经系统中的新作用 | 首次通过单细胞分析定义了肠神经系统中不同神经元亚型的差异表达基因,并发现了TBX3、GDNF和NRTN的新作用 | NA | 旨在通过定义神经元亚型的基因表达,促进针对肠神经病变的新型治疗策略的开发,并深入了解肠神经系统功能 | 成年小鼠和人类结肠的肠神经元亚型 | 数字病理学 | 肠神经病变 | 单核RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 635个成年小鼠结肠肠神经元和707个E17.5小鼠肠神经元,以及48个人类结肠肠神经元和其他细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 199 | 2024-08-07 |
Single-Cell Sequencing of Brain Cell Transcriptomes and Epigenomes
2021-01-06, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2020.12.010
PMID:33412093
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research paper | 本文讨论了单细胞转录组和表观基因组测序的基本原理、数据的整合计算分析以及在神经科学中的关键应用 | 单细胞测序技术通过直接测量数千到数百万个单个细胞中的多种分子特征,全面表征了脑细胞类型的多样性,揭示了塑造细胞身份的基因调控机制 | NA | 深入理解神经回路的细胞构成,揭示脑细胞群体之间的发育和进化关系 | 脑细胞的转录组和表观基因组 | digital pathology | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 数千到数百万个单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 200 | 2024-08-07 |
Genomic Profiling of Virulence in the Soybean Cyst Nematode Using Single-Nematode Sequencing
2021-Jan, Phytopathology
IF:2.6Q2
DOI:10.1094/PHYTO-08-20-0348-FI
PMID:33100145
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研究论文 | 本研究使用单个线虫的单细胞RNA测序方法,分析了豆杆囊线虫(SCN)的基因组特征,以识别可能参与抗性基因突破的SCN基因 | 首次建立了单个SCN个体的完整转录组,并识别出一系列针对主要SCN抗性源的假定毒力基因 | NA | 旨在揭示豆杆囊线虫克服抗性基因的机制 | 豆杆囊线虫(SCN)及其在抗性大豆品种上的毒力基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个SCN个体 | NA | NA | NA | NA |