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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-07 |
Longitudinal Single-Cell Transcriptomics Reveals a Role for Serpina3n-Mediated Resolution of Inflammation in a Mouse Colitis Model
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.04.004
PMID:33862275
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研究论文 | 利用单细胞转录组学阐明小鼠结肠炎模型中炎症消退的动态机制，发现Serpina3n在基质细胞中特异性表达并促进炎症消退 | 首次通过单细胞转录组学揭示基质细胞在结肠炎症消退中的关键作用，并发现Serpina3n作为丝氨酸蛋白酶抑制剂能通过靶向弹性蛋白酶促进炎症消退，提供了新的治疗靶点 | 研究基于化学诱导小鼠模型，可能无法完全代表人类炎症性肠病的复杂性；仅验证了Serpina3n的短期作用，长期效果尚需进一步研究 | 阐明结肠炎症过程中不同细胞类型及其相互作用的动态变化，探索炎症消退的潜在机制 | 化学诱导结肠炎小鼠模型的结肠组织细胞（包括基质细胞、免疫细胞等） | 生物信息学, 单细胞基因组学 | 炎症性肠病（结肠炎） | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA表达数据 | 小鼠结肠炎模型样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-05-29 |
Loss of Claudin-3 Impairs Hepatic Metabolism, Biliary Barrier Function, and Cell Proliferation in the Murine Liver
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.04.003
PMID:33866021
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研究论文 | 研究Claudin-3缺失对小鼠肝脏代谢、胆道屏障功能及细胞增殖的影响 | 首次揭示紧密连接蛋白Claudin-3在肝脏代谢稳态、胆汁酸保留和肝再生中肝细胞增殖中的必要性 | 未明确Claudin-3缺失导致代谢途径下调的分子机制，且仅在小鼠模型中验证 | 探索Claudin-3在肝脏代谢、屏障功能和细胞增殖中的调控及功能重要性 | 小鼠肝脏组织及肝细胞、胆管细胞 | 机器学习 | 肝脏疾病 | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年Cldn3-/-与Cldn3+/+小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-05-27 |
Retinal Organoids Long-Term Functional Characterization Using Two-Photon Fluorescence Lifetime and Hyperspectral Microscopy
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.796903
PMID:34955757
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研究论文 | 采用双光子荧光寿命和超光谱显微技术对视网膜类器官进行长期功能表征 | 首次引入基于双光子显微镜的活体成像技术，结合荧光寿命成像（FLIM）和超光谱成像，无损监测和表征视网膜类器官的长期发育过程，发现代谢从糖酵解向氧化磷酸化的转变及光感受器基因表达的时序规律 | 研究未明确提及局限性，但可能包括样本量有限、技术依赖复杂设备、结果外推至临床需进一步验证 | 改进视网膜类器官的质量控制，通过活体成像技术无损监测其长期发育过程 | 人诱导多能干细胞来源的视网膜类器官 | 计算机视觉 | NA | 双光子荧光寿命成像, 超光谱成像, 定量PCR, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 定量PCR | NA | NA |
| 4 | 2026-05-25 |
Identification of Novel Population-Specific Cell Subsets in Chinese Ulcerative Colitis Patients Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.01.020
PMID:33545427
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序鉴定中国溃疡性结肠炎患者中新型人群特异性细胞亚群 | 首次在中文人群中通过单细胞RNA测序鉴定出两种新型浆细胞亚群，并揭示UC风险基因在免疫细胞中的表达改变具有人群中特异性 | 样本量较小，仅包括12个结肠活检样本，且主要关注成人患者，未涉及儿童或其他年龄段 | 明确中国成年溃疡性结肠炎患者结肠黏膜细胞中的关键基因、通路和细胞类型 | 中国汉族溃疡性结肠炎患者的结肠活检样本 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组测序数据 | 12个结肠活检样本（来自溃疡性结肠炎患者和健康对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-05-20 |
MYC Promotes Bone Marrow Stem Cell Dysfunction in Fanconi Anemia
2021-01-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.09.004
PMID:32997960
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研究论文 | 该文章通过对范可尼贫血患者原代造血干祖细胞进行单细胞转录组分析，发现MYC高表达促进骨髓衰竭，并探讨了其机制 | 首次通过单细胞转录组分析揭示范可尼贫血患者造血干祖细胞中MYC高表达与骨髓衰竭的关系，并发现MYC通过促进增殖和DNA损伤损害细胞功能 | 未提及具体局限性，但研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床相关性需进一步验证 | 探究范可尼贫血患者骨髓衰竭的分子机制 | 范可尼贫血患者的原代造血干祖细胞 | 自然语言处理 | 范可尼贫血 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 范可尼贫血患者样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序试剂盒 |
| 6 | 2026-05-16 |
Neurological Manifestations of COVID-19 Feature T Cell Exhaustion and Dedifferentiated Monocytes in Cerebrospinal Fluid
2021-01-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.12.011
PMID:33382973
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研究论文 | 通过单细胞测序分析COVID-19神经系统并发症患者脑脊液中的免疫细胞图谱，发现去分化单核细胞和耗竭CD4 T细胞的特征性变化 | 首次在脑脊液水平揭示COVID-19神经系统并发症患者存在T细胞耗竭和单核细胞去分化现象，并系统性比较不同类型神经系统疾病的免疫特征差异 | 样本量较小（具体数量未说明），且未阐明脑脊液免疫改变与临床预后的直接因果关系 | 探究COVID-19患者神经系统并发症的免疫学发病机制 | COVID-19神经系统并发症患者（Neuro-COVID）、非炎症性神经系统疾病、自身免疫性神经系统疾病及病毒性脑炎患者 | 单细胞免疫学、神经系统疾病 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 脑脊液免疫细胞单细胞转录组数据 | 多组患者脑脊液样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞5'基因表达与免疫谱分析 |
| 7 | 2026-05-16 |
High levels of soluble CD25 in COVID-19 severity suggest a divergence between anti-viral and pro-inflammatory T-cell responses
2021, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.1251
PMID:33614032
|
研究论文 | 本研究探讨COVID-19患者中可溶性CD25水平与疾病严重程度的关系，提示抗病毒与促炎T细胞反应之间的分歧 | 首次发现可溶性CD25是COVID-19严重程度的独立危险因素，并与病毒脱落时间正相关，揭示CD25+CD8+ T细胞扩增对促炎反应的贡献 | 基于单中心研究，小鼠模型与人类COVID-19的病理差异可能影响结论普适性，且未深入验证sCD25作为治疗靶点的可行性 | 解析COVID-19患者T细胞功能缺陷与过度激活并存现象背后的免疫机制 | COVID-19住院患者及淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒（LCMV）感染的小鼠模型 | 免疫学 | COVID-19 | 细胞因子检测、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 临床数据、小鼠模型实验数据、单细胞RNA测序数据 | 280例COVID-19住院患者及LCMV感染小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 支气管肺泡灌洗液（BALF）中免疫细胞的单细胞RNA测序 |
| 8 | 2026-05-16 |
Transcriptional profiling of pediatric cholestatic livers identifies three distinct macrophage populations
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0244743
PMID:33411796
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研究论文 | 对儿童胆汁淤积性肝脏进行转录组分析，识别出三种不同的巨噬细胞群体 | 首次对人类儿童胆汁淤积性肝脏进行单细胞RNA测序，识别出与健康肝脏巨噬细胞转录特征不同的三种巨噬细胞亚群 | 未完全确定这些巨噬细胞亚群在不同病因的胆汁淤积性肝病中的异同 | 进一步表征儿童胆汁淤积性肝病中巨噬细胞的转录谱 | 儿童胆汁淤积性肝病患者（胆道闭锁和Alagille综合征）的肝脏免疫细胞 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞荧光分选，免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 胆道闭锁患者6例，Alagille综合征患者6例 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 9 | 2026-05-11 |
Cell-Type-Specific Immune Dysregulation in Severely Ill COVID-19 Patients
2021-01-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108590
PMID:33357411
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序分析重症COVID-19患者外周血单核细胞的免疫失调特征 | 揭示了ARDS患者单核细胞中抗原呈递和干扰素反应缺陷，而淋巴细胞中干扰素信号反应增强，以及细胞毒性活性和B细胞激活抑制的免疫失衡状态 | NA | 探究重症COVID-19患者的细胞类型特异性免疫失调机制 | 健康志愿者、中度COVID-19患者、急性呼吸窘迫综合征患者以及从ARDS恢复的患者的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | COVID-19, 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名健康人、5名中度患者、6名ARDS患者、6名恢复期患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-04-12 |
From GWAS to Gene: Transcriptome-Wide Association Studies and Other Methods to Functionally Understand GWAS Discoveries
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.713230
PMID:34659337
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综述 | 本文综述了整合GWAS与功能基因组学数据以识别遗传调控基因的生物信息学方法，重点关注精细定位和基因优先排序方法，特别是转录组范围关联研究（TWAS） | 系统分类并比较了整合GWAS与功能基因组学的方法，深入讨论了TWAS方法的多样性、差异及面临的挑战 | 作为综述文章，未进行原始数据分析，主要基于现有文献总结，可能未涵盖所有最新方法 | 探讨如何通过数据整合方法理解GWAS发现的非编码区域功能，以揭示复杂疾病机制并促进临床应用 | 人类复杂疾病或性状相关的遗传变异及受调控的基因 | 生物信息学 | 复杂人类疾病 | GWAS, 高通量测序, 单细胞测序, 染色体构象捕获, 基因编辑技术, 多重报告基因检测 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 功能注释数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 11 | 2026-04-10 |
A Novel Single Cell RNA-seq Analysis of Non-Myeloid Circulating Cells in Late Sepsis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.696536
PMID:34484194
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了晚期脓毒症患者非髓系循环细胞的转录组特征 | 首次在晚期脓毒症中应用CITE-seq技术对非髓系免疫细胞进行单细胞转录组分析，揭示了细菌性与真菌性脓毒症之间的转录组差异 | 样本量较小（仅4例患者和5例健康对照），且仅关注晚期时间点（脓毒症后14-21天） | 通过单细胞转录组分析更好地理解晚期脓毒症的病理机制 | 晚期脓毒症患者和健康对照者的外周血非髓系免疫细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），CITE-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 4例晚期脓毒症患者和5例健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-04-09 |
Visual Genomics Analysis Studio as a Tool to Analyze Multiomic Data
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.642012
PMID:34220932
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综述 | 本文介绍了Visual Genomics Analysis Studio (VGAS)这一集成应用，用于分析和可视化多组学单细胞数据，旨在帮助研究者无需高级生物信息学技能即可进行数据分析 | VGAS是一个用户友好的Windows图形界面应用，无需用户编程或高性能计算机，整合了性能优化的隐藏代码，提供快速直观的数据分析工具和高分辨率图形输出 | 本文作为综述，主要介绍VGAS的功能和应用，未涉及具体实验验证或性能对比数据 | 开发并推广一个集成工具，以降低多组学单细胞数据分析的技术门槛，促进免疫介导药物不良反应的研究 | 多组学单细胞数据，特别是单细胞TCR-RNA-CITE-seq数据，用于分析免疫细胞群 | 生物信息学 | 药物不良反应 | 单细胞TCR测序, 单细胞RNA测序, CITE-seq | NA | 多组学单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-04-04 |
No detectable alloreactive transcriptional responses under standard sample preparation conditions during donor-multiplexed single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells
2021-01-20, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-020-00941-x
PMID:33472616
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研究论文 | 本研究评估了在标准单细胞RNA测序样本制备条件下，混合来自无关供体的外周血单个核细胞是否会引起同种异体反应性转录响应 | 首次系统评估了在标准scRNA-seq样本制备条件下混合无关供体PBMCs是否会引起同种异体反应性基因表达变化，并识别了与PBMC制备方法和样本多重标记技术相关的技术假象 | 研究仅评估了30分钟4°C共孵育条件，未测试更长时间或不同温度条件；主要关注CD4+ T细胞中的同种异体反应性标记 | 评估样本多重技术在单细胞RNA测序中混合无关供体PBMCs时是否引入同种异体反应性假象，为横向免疫学研究建立基准 | 外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 单个供体PBMCs与无关供体PBMCs混合实验，并分析了公开可用的scRNA-seq数据集 | 10x Genomics, BD Biosciences | 单细胞RNA-seq, 样本多重技术 | 10x Genomics scRNA-seq平台, BD单细胞多重试剂盒（SCMK） | 10x Genomics单细胞RNA测序平台结合MULTI-seq和/或BD SCMK标记技术 |
| 14 | 2026-04-04 |
CSEA-DB: an omnibus for human complex trait and cell type associations
2021-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa1064
PMID:33211888
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研究论文 | 本文介绍了CSEA-DB数据库，一个用于人类复杂性状与细胞类型关联的综合性资源库 | 整合了5120个GWAS汇总统计数据与超过90万个单细胞转录组数据，通过deTS算法进行了超过1000万次性状-细胞类型关联分析，首次构建了大规模的人类复杂性状与细胞类型特异性关联图谱 | 数据库依赖现有GWAS和单细胞数据的质量和覆盖范围，可能未涵盖所有组织或细胞类型 | 构建一个参考数据库，用于解析人类复杂性状与细胞类型特异性之间的遗传关联 | 人类复杂性状和疾病相关的遗传变异及细胞类型 | 生物信息学 | 复杂疾病 | GWAS, 单细胞转录组测序 | deTS算法 | GWAS汇总统计数据, 单细胞RNA-seq数据 | 超过900,000个细胞，涵盖71个成人和胎儿组织的752种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-03-02 |
SCDC: bulk gene expression deconvolution by multiple single-cell RNA sequencing references
2021-01-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbz166
PMID:31925417
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研究论文 | 本文提出了一种名为SCDC的批量基因表达去卷积方法，该方法利用多个单细胞RNA测序参考数据集中的细胞类型特异性基因表达谱，通过集成方法整合不同实验室和时间产生的数据，以解决批次效应问题，并在模拟和实验混合细胞系中验证了其优于现有方法的准确性 | SCDC采用集成方法整合多个scRNA-seq参考数据集，隐式处理批次效应混淆问题，提高了细胞类型分解的准确性 | NA | 开发一种基于多个单细胞RNA测序参考数据集的批量RNA测序去卷积方法，以更准确地分解细胞类型比例 | 批量RNA测序数据，包括模拟生成的伪批量样本和实验混合细胞系，以及人类胰岛和小鼠乳腺组织数据集 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 集成方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-03-02 |
A `one-two punch' therapy strategy to target chemoresistance in estrogen receptor positive breast cancer
2021-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2020.100946
PMID:33221681
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研究论文 | 本研究探讨了通过HDAC抑制剂靶向化疗诱导的癌症干细胞样细胞，以克服雌激素受体阳性乳腺癌的化疗耐药性 | 提出“一打二击”治疗策略，利用HDAC抑制剂阻断化疗诱导的癌症干细胞样细胞富集，并揭示IIa类和IIb类HDAC在逆转化疗耐药状态中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和患者样本分析，缺乏大规模临床试验验证，且对HDAC抑制剂的具体作用机制仍需进一步探索 | 开发针对雌激素受体阳性乳腺癌化疗耐药性的新型治疗策略 | 雌激素受体阳性转移性乳腺癌肿瘤细胞及患者来源的癌症细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-01-01 |
High-Throughput Monitoring of Bacterial Cell Density in Nanoliter Droplets: Label-Free Detection of Unmodified Gram-Positive and Gram-Negative Bacteria
2021-01-19, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c03408
PMID:33301291
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研究论文 | 本文介绍了一种基于纳米液滴散射光的高通量、无标记细菌检测方法，适用于革兰氏阳性和阴性细菌 | 开发了无需基因修饰或化学标记的高通量无标记细菌检测技术，利用纳米液滴散射光测量实现细菌增殖的可靠检测 | 未在摘要中明确说明具体局限性 | 开发适用于临床、研究和工业领域多种细菌菌株的高通量微液滴分析技术 | 未修饰的革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌 | 微生物分析技术 | NA | 液滴微流控技术、散射光测量 | NA | 光学信号数据（散射光、荧光） | NA | NA | 液滴微流控 | NA | 纳米液滴封装系统 |
| 18 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics analysis of mild cognitive impairment in World Trade Center disaster responders
2021, Alzheimer's & dementia (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1002/dad2.12154
PMID:33665344
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究世贸中心救援人员轻度认知障碍的分子机制 | 首次在世贸中心救援人员群体中应用单细胞分辨率CITE-Seq技术分析轻度认知障碍的血液转录组特征 | 样本量相对较小(40名男性)，仅包含男性受试者 | 探索轻度认知障碍的分子复杂性及其血液生物标志物 | 世贸中心灾难救援人员 | 单细胞组学 | 轻度认知障碍 | CITE-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 40名男性救援人员(发现队列:9名MCI和9名对照;验证队列:11名MCI和11名对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
MUC1-C integrates activation of the IFN-γ pathway with suppression of the tumor immune microenvironment in triple-negative breast cancer
2021-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-002115
PMID:33495298
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研究论文 | 本研究揭示MUC1-C通过激活IFN-γ通路诱导免疫抑制并导致三阴性乳腺癌肿瘤免疫微环境中CD8+ T细胞耗竭的机制 | 首次发现MUC1-C是TNBC转录组的主调控因子，通过STAT1和IRF1驱动基因表达，并整合免疫抑制性IFN-γ通路激活与肿瘤免疫微环境改变 | 机制研究主要基于细胞系和数据库分析，需要更多体内实验验证；人类TNBC样本的直接实验证据有限 | 探究MUC1-C在三阴性乳腺癌免疫逃避中的作用机制 | 三阴性乳腺癌细胞系、TCGA-BRCA和METABRIC数据库、TNBC单细胞RNA-seq数据集 | 癌症免疫学 | 三阴性乳腺癌 | shRNA基因沉默、转录组分析、基因集富集分析、qRT-PCR、免疫印迹、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | 多个TNBC细胞系、TCGA-BRCA和METABRIC数据库样本、单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
Kdm6a deficiency restricted to mouse hematopoietic cells causes an age- and sex-dependent myelodysplastic syndrome-like phenotype
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0255706
PMID:34780480
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研究论文 | 本研究揭示了Kdm6a基因缺陷在小鼠造血细胞中导致年龄和性别依赖的骨髓增生异常综合征样表型 | 首次证明Kdm6a缺陷在造血细胞中会导致年龄和性别依赖的MDS样表型，并利用单细胞RNA-seq技术揭示了其对造血细胞命运决定基因的调控机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，未在人类样本中验证；Kdm6a缺陷小鼠未发展为明显白血病 | 探究Kdm6a基因在正常造血过程中的功能及其在白血病发病机制中的作用 | 雌性Kdm6a条件性敲除小鼠的造血干细胞和祖细胞 | 表观遗传学 | 白血病 | ChIP-seq, ATAC-seq, scRNA-seq | 基因敲除小鼠模型 | 基因组学数据，表观基因组学数据，单细胞转录组数据 | Kdm6a-WT和Kdm6a-KO小鼠样本 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq | NA | NA |