单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
141	2024-08-09	Single-Cell Transcriptional Analyses Identify Lineage-Specific Epithelial Responses to Inflammation and Metaplastic Development in the Gastric Corpus 2020-12, Gastroenterology IF:25.7Q1 DOI:10.1053/j.gastro.2020.08.027 PMID:32835664	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析，探讨了慢性胃炎中胃体上皮细胞在炎症和化生发展中的谱系特异性反应。	本研究首次将Gkn3 mRNA作为小鼠胃体化生的特异性标记，并扩展了胃化生的定义，包括胃体中的GKN3阳性细胞。	NA	研究慢性萎缩性胃炎导致胃化生和胃腺癌风险增加的机制。	胃体上皮细胞，特别是粘液颈部细胞和主细胞在慢性胃炎中的转录程序。	数字病理学	胃腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	BALB/c小鼠（对照组）和TxA23小鼠的胃体上皮细胞，以及B6小鼠和人类患者的胃组织样本。
142	2024-08-09	Single-Nucleus RNA-Sequencing Profiling of Mouse Lung. Reduced Dissociation Bias and Improved Rare Cell-Type Detection Compared with Single-Cell RNA Sequencing 2020-12, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1 DOI:10.1165/rcmb.2020-0095MA PMID:32804550	研究论文	本文介绍了单核RNA测序（snRNASeq）在小鼠肺组织中的应用，并与单细胞RNA测序（scRNASeq）进行了比较	snRNASeq技术减少了分离偏差，提高了罕见细胞类型的检测，并且可以应用于存档的小鼠肺样本	NA	研究单核RNA测序在小鼠肺组织中的应用及其与单细胞RNA测序的比较	小鼠肺组织的细胞和核	数字病理学	NA	单核RNA测序（snRNASeq）	NA	转录组数据	16,110个单核转录组和11,934个单细胞转录组
143	2024-08-09	Autoimmunity in 2019 2020-Dec, Clinical reviews in allergy & immunology IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s12016-020-08808-3 PMID:32729069	综述	本文基于PubMed数据，对与自身免疫疾病和免疫学相关的出版物进行年度评估，以确定前者在科学文献中的相对权重	尽管有许多新的免疫相关机制途径，如癌症免疫疗法，但与自身免疫相关的免疫学手稿比例持续增加，2019年接近20%	NA	评估自身免疫疾病在科学文献中的相对重要性	系统性红斑狼疮（SLE）、类风湿关节炎（RA）、银屑病关节炎（PsA）、自身抗体（autoAbs）以及自身免疫疾病的新治疗途径和发病机制	免疫学	自身免疫疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、质谱流式细胞术、批量RNA测序（RNA-seq）、流式细胞术	NA	文本	NA
144	2024-08-09	Single-cell transcriptomics reveals multiple neuronal cell types in human midbrain-specific organoids 2020-Dec, Cell and tissue research IF:3.2Q3 DOI:10.1007/s00441-020-03249-y PMID:32737576	研究论文	本文通过单细胞RNA测序、成像和电生理学方法，分析了人中脑类器官中的多种神经细胞类型	首次揭示了人中脑类器官中存在多种神经细胞类型，包括多巴胺能、GABA能、谷氨酸能和血清素能神经元	NA	揭示人中脑类器官中的细胞异质性	人中脑类器官中的神经细胞类型	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
145	2024-08-09	Comparative analysis of cell lineage differentiation during hepatogenesis in humans and mice at the single-cell transcriptome level 2020-12, Cell research IF:28.1Q1 DOI:10.1038/s41422-020-0378-6 PMID:32690901	研究论文	本文通过单细胞转录组测序技术，比较了人类和小鼠胚胎发育过程中肝脏细胞谱系分化的差异	发现了人类和小鼠肝脏细胞谱系的新标记物，并验证了肝母细胞分化遵循“默认导向”模型	NA	揭示人类和小鼠胚胎肝脏发育的细胞动态景观，并比较两者之间的异同	人类和小鼠的胚胎肝脏细胞谱系	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组	人类和小鼠的整个胚胎肝脏
146	2024-08-09	Single-Cell Reconstruction of Human Basal Cell Diversity in Normal and Idiopathic Pulmonary Fibrosis Lungs 2020-12-01, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1 DOI:10.1164/rccm.201904-0792OC PMID:32692579	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了正常和特发性肺纤维化（IPF）肺组织中上皮细胞的转录组，以揭示基底干细胞在疾病中的变化	发现基底细胞包括多能性和分泌性基底细胞亚群，并且这些细胞在IPF中表现出特定的扩张	NA	旨在更好地理解基底细胞增生及其相关分泌功能障碍在特发性肺纤维化发展中的作用	正常和特发性肺纤维化肺组织中的上皮细胞	数字病理学	特发性肺纤维化	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	来自正常和IPF肺组织的孤立上皮细胞
147	2024-08-09	Efficiency and Target Derepression of Anti-miR-92a: Results of a First in Human Study 2020-12, Nucleic acid therapeutics IF:4.0Q2 DOI:10.1089/nat.2020.0871 PMID:32707001	研究论文	本研究评估了MRG-110（一种针对miR-92a-3p的锁核酸基反义寡核苷酸）在健康成人中的疗效和目标脱抑制作用	首次在人体中研究了anti-miR-92a的活性，并展示了其在周围血液隔室中有效抑制miR-92a并脱抑制miR-92a目标的能力	NA	探究anti-miR-92a在人体中的活性及其对目标miR-92a-3p的抑制效果	健康成人	NA	心血管疾病	锁核酸基反义寡核苷酸	NA	血液	多个剂量组的随机分配的健康成人
148	2024-08-09	Lessons from single cell sequencing in CNS cell specification and function 2020-12, Current opinion in genetics & development IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.gde.2020.05.043 PMID:32679535	review	本文综述了单细胞RNA测序技术在中枢神经系统（CNS）细胞特化和功能研究中的应用	单细胞RNA测序技术提高了对CNS细胞类型的分辨率，并揭示了它们的发展轨迹和物种间的多样性变化	NA	探讨单细胞基因组学时代的优势、创新和挑战，以及它如何影响我们对神经发育和神经功能的理解	中枢神经系统（CNS）中的神经元、星形胶质细胞和少突胶质细胞	digital pathology	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	NA
149	2024-08-09	Single-cell transcriptomics allows novel insights into aging and circadian processes 2020-12-04, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3 DOI:10.1093/bfgp/elaa014 PMID:32633783	综述	本文综述了单细胞转录组测序（scRNA-Seq）在衰老和昼夜节律领域的应用，并强调了从单细胞分析中涌现的新发现	scRNA-Seq方法提供了比传统基因表达分析方法更多的优势，有助于揭示衰老和昼夜节律之间的联系	NA	探讨衰老和昼夜节律之间的相互作用，并利用scRNA-Seq方法深入了解这些过程	衰老和昼夜节律的生物过程	基因组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	转录组数据	涉及人类和啮齿动物的单细胞样本
150	2024-08-09	Integrative molecular profiling of autoreactive CD4 T cells in autoimmune hepatitis 2020-12, Journal of hepatology IF:26.8Q1 DOI:10.1016/j.jhep.2020.05.053 PMID:32649971	研究论文	本研究深入分析了自身免疫性肝炎（AIH）患者中针对可溶性肝抗原（SLA）的自身反应性CD4 T细胞的分子特征	首次详细描述了AIH患者中SLA特异性CD4 T细胞的表型和功能特征，并识别了与疾病活动相关的特定T细胞表型	NA	深入表征AIH患者中罕见的循环自身反应性CD4 T细胞，并识别其在AIH中的外周储库	AIH患者中的SLA特异性CD4 T细胞	免疫学	自身免疫性肝炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	42名AIH患者和17名非酒精性脂肪性肝炎（NASH）对照组
151	2024-08-09	Simulation, power evaluation and sample size recommendation for single-cell RNA-seq 2020-12-08, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btaa607 PMID:32614380	研究论文	本文提出了一种基于模拟的方法POWSC，用于单细胞RNA测序差异表达分析的功率评估和样本量推荐	POWSC方法在捕捉真实数据集的关键特征方面优于其他两种先进的模拟器，并提供了多种功率评估，包括分层和边际功率分析	NA	确定高吞吐量实验设计阶段中检测统计显著性所需样本量的关键步骤	单细胞RNA测序中的样本量计算	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	表达数据	NA
152	2024-08-09	Single-cell sequencing reveals novel mechanisms of Aflatoxin B1-induced hepatotoxicity in S phase-arrested L02 cells 2020-12, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s10565-020-09547-z PMID:32607778	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序和单细胞简化代表性亚硫酸氢盐测序（RRBS）技术，探讨了黄曲霉素B1（AFB1）在S期停滞的L02细胞中诱导肝毒性的机制	本研究揭示了AFB1通过调节促性腺激素释放激素受体途径、Wnt信号通路和TGF-beta信号通路中的DNA甲基化作用，诱导S期停滞的L02细胞肝毒性的新机制	NA	研究AFB1在S期停滞的L02细胞中诱导肝毒性的机制	S期停滞的L02细胞	数字病理学	肝病	单细胞RNA测序，单细胞简化代表性亚硫酸氢盐测序（RRBS）	NA	RNA，DNA	NA
153	2024-08-09	Virus strain from a mild COVID-19 patient in Hangzhou represents a new trend in SARS-CoV-2 evolution potentially related to Furin cleavage site 2020-Dec, Emerging microbes & infections IF:8.4Q1 DOI:10.1080/22221751.2020.1781551 PMID:32543348	研究论文	研究分析了SARS-CoV-2病毒基因组在COVID-19传播过程中的突变情况，特别是从杭州一名轻症患者中分离出的ZJ01株，并探讨了Furin切割位点在病毒进化中的作用	发现了ZJ01株可能代表SARS-CoV-2的一个潜在进化分支，并首次详细分析了Furin切割位点在病毒进化中的重要性	NA	探索SARS-CoV-2病毒在COVID-19传播过程中的基因突变机制及其对病毒进化的影响	SARS-CoV-2病毒基因组突变及其进化	分子生物学	COVID-19	单细胞测序	NA	基因序列	788名COVID-19患者
154	2024-08-09	Single-cell RNA analysis on ACE2 expression provides insights into SARS-CoV-2 potential entry into the bloodstream and heart injury 2020-12, Journal of cellular physiology IF:4.5Q1 DOI:10.1002/jcp.29802 PMID:32510598	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序数据，分析了健康和纤维化肺部以及正常和衰竭成人心脏中ACE2的细胞类型特异性表达，探讨了SARS-CoV-2通过血液进入心脏的可能性及其对心脏损伤的影响。	首次揭示了纤维化肺部中ACE2主要在动脉血管细胞中表达，为SARS-CoV-2通过血液传播提供了可能途径，并发现衰竭心脏中ACE2表达的 cardiomyocytes 比例较高，提示SARS-CoV-2可能通过血液攻击心脏细胞。	NA	探讨SARS-CoV-2如何从肺部传播到其他器官，特别是通过血液进入心脏的可能性及其对心脏损伤的影响。	健康和纤维化肺部、正常和衰竭成人心脏中的ACE2表达。	数字病理学	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	健康和纤维化肺部、正常和衰竭成人心脏的细胞样本
155	2024-08-09	Dendritic cells in tumor microenvironment promoted the neuropathic pain via paracrine inflammatory and growth factors 2020-12, Bioengineered IF:4.2Q2 DOI:10.1080/21655979.2020.1771068 PMID:32434423	研究论文	本研究探讨了肿瘤微环境中受损的Wnt1浸润树突状细胞对与癌症相关的神经性疼痛的贡献	首次揭示了肿瘤微环境中浸润的树突状细胞通过旁分泌炎症和生长因子促进神经性疼痛的机制	研究未涉及旁分泌因子信号阻断对缓解癌症疼痛的具体效果	探索肿瘤微环境中树突状细胞对神经性疼痛的影响	肿瘤微环境中的树突状细胞及其对神经性疼痛的影响	NA	肺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	涉及肺癌和肿瘤旁组织的树突状细胞
156	2024-08-09	New avenues for systematically inferring cell-cell communication: through single-cell transcriptomics data 2020-12, Protein & cell IF:13.6Q1 DOI:10.1007/s13238-020-00727-5 PMID:32435978	研究论文	本文通过单细胞转录组数据探讨了细胞间通信的研究方法	利用单细胞RNA测序技术，提供了高分辨率的转录组数据，深化了对细胞表型异质性和复杂组织组成的理解	讨论了当前单细胞分辨率下细胞间通信研究的挑战	系统地推断细胞间通信	多细胞生物中的细胞间通信	生物信息学	NA	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	转录组数据	NA
157	2024-08-09	Characterization of Human iPSC-derived Spinal Motor Neurons by Single-cell RNA Sequencing 2020-12-01, Neuroscience IF:2.9Q2 DOI:10.1016/j.neuroscience.2020.04.041 PMID:32380268	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，研究了从人诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的脊髓运动神经元（MNs）的特性和亚型	本文首次详细描述了从人iPSCs衍生的MNs的亚型及其分子特征，为理解iPSC衍生的MNs的功能和功能障碍提供了新的见解	研究受限于来自单一供体的iPSC系之间的变异性和从iPSCs衍生的特定细胞类型的异质性	旨在深入表征不同iPSC衍生细胞类型，以促进该技术在人类疾病模型和新疗法开发中的应用	人诱导多能干细胞衍生的脊髓运动神经元及其亚型	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	约58%的iPSC衍生MNs显示侧运动柱MNs的分子特征，约19%类似轴下运动柱MNs，约6%具有中运动柱MNs的特征
158	2024-08-09	Transcriptional Dynamics of Hepatic Sinusoid-Associated Cells After Liver Injury 2020-12, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1002/hep.31215 PMID:32145072	研究论文	本研究利用单细胞转录组学技术，探索了肝脏损伤后肝窦相关细胞的异质性及其在纤维化过程中的转变和相互作用	首次在单细胞分辨率下解析了肝窦相关细胞在纤维化过程中的功能关系，并识别了关键基因PLVAP在调控微循环交换及其在慢性肝病中的破坏作用	NA	研究肝脏损伤后肝窦相关细胞的转录动力学及其在纤维化过程中的作用	肝窦相关细胞在肝脏损伤后的异质性和转变	数字病理学	肝脏疾病	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	NA