单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 158 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-09 |
Single-Cell Profiling of AKI in a Murine Model Reveals Novel Transcriptional Signatures, Profibrotic Phenotype, and Epithelial-to-Stromal Crosstalk
2020-12, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020010052
PMID:33115917
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，在AKI的小鼠模型中揭示了新的转录组特征、促纤维化表型和上皮-间质相互作用 | 发现了AKI中多个阶段和所有肾细胞类型的基因表达模式变化，以及新的基因和细胞身份混合现象 | NA | 深入理解AKI中的分子通路，以识别可能改善治疗的潜在靶点 | AKI的小鼠模型中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个时间点（1天、2天、4天、7天、11天和14天）的AKI小鼠模型 |
| 122 | 2024-08-09 |
Breast cancers, mammary stem cells, and cancer stem cells, characteristics, and hypotheses
2020-12, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2020.09.009
PMID:33142233
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研究论文 | 本文探讨了乳腺癌细胞异质性对治疗的影响，并提出了两种模型来解释乳腺癌的起源细胞 | 提出了两种模型来解释乳腺癌的起源细胞，并探讨了癌症干细胞在乳腺癌发展、转移和复发中的作用 | 目前针对这些特定癌细胞群体的临床试验较少 | 研究乳腺癌的细胞异质性及其对治疗的影响 | 乳腺癌、乳腺干细胞和癌症干细胞 | NA | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-09 |
Tumor Fibroblast-Derived FGF2 Regulates Expression of SPRY1 in Esophageal Tumor-Infiltrating T Cells and Plays a Role in T-cell Exhaustion
2020-12-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-1542
PMID:33093168
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现食管癌中的T细胞比以往认识的更为异质性，并揭示了肿瘤相关成纤维细胞衍生的FGF2通过调节SPRY1表达在CD8 T细胞功能障碍中的作用 | 首次报道了FGF2在食管癌中通过调节SPRY1表达影响CD8 T细胞功能障碍的分子机制 | NA | 探讨食管癌中T细胞功能障碍的分子机制 | 食管癌中的T细胞及肿瘤相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 124 | 2024-08-09 |
Cell-Type Transcriptome Atlas of Human Aortic Valves Reveal Cell Heterogeneity and Endothelial to Mesenchymal Transition Involved in Calcific Aortic Valve Disease
2020-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.314789
PMID:33086873
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了人类主动脉瓣的细胞类型转录组图谱，揭示了钙化性主动脉瓣疾病中的细胞异质性和内皮细胞向间充质细胞的转变 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了健康和钙化性主动脉瓣疾病中的细胞亚型，并发现了在疾病中特异表达的新型瓣膜衍生基质细胞 | 研究仅限于6个不同的人类主动脉瓣样本，样本量较小可能影响结果的普遍性 | 旨在构建健康和钙化性主动脉瓣疾病的人类主动脉瓣细胞图谱，以深入了解钙化性主动脉瓣疾病的细胞起源和复杂的细胞病理分化过程 | 人类主动脉瓣细胞在健康和钙化性主动脉瓣疾病中的异质性和分化过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 34,632个细胞来自6个不同的人类主动脉瓣叶 |
| 125 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis identified lung progenitor cells in COVID-19 patients
2020-Dec, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.12931
PMID:33094537
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液，揭示了肺祖细胞在严重SARS-CoV-2感染后肺修复中的作用 | 首次发现TM4SF1+和KRT5+肺祖细胞在严重COVID-19患者中的显著扩张，并证实这些祖细胞在肺泡细胞再生和上皮屏障重建中的关键作用 | NA | 旨在揭示严重SARS-CoV-2感染后肺修复的可能机制 | COVID-19患者的肺祖细胞及其在肺修复中的作用 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本 |
| 126 | 2024-08-09 |
The cellular basis of distinct thirst modalities
2020-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2821-8
PMID:33057193
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了大脑中终板旁器官在感知不同类型口渴刺激中的细胞基础 | 首次揭示了大脑中特定神经元类型在不同口渴状态中的作用 | NA | 探究大脑中不同口渴状态的细胞基础 | 大脑中的终板旁器官和神经元类型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多种兴奋性和抑制性神经元类型 |
| 127 | 2024-08-09 |
MARS: discovering novel cell types across heterogeneous single-cell experiments
2020-12, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-00979-3
PMID:33077966
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MARS的元学习方法，用于在异质单细胞RNA测序数据中识别和注释已知及新型细胞类型 | MARS通过跨多个数据集转移潜在细胞表示来克服细胞类型的异质性，并能发现以前未见过的细胞类型 | NA | 开发一种方法以在异质单细胞RNA测序数据中识别和注释新型细胞类型 | 异质单细胞RNA测序数据中的新型细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 数据集 | 大量小鼠细胞图谱 |
| 128 | 2024-08-09 |
A new lymphoid-primed progenitor marked by Dach1 downregulation identified with single cell multi-omics
2020-12, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0799-x
PMID:33077975
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，识别了Dach1及其相关基因在淋巴样前体细胞中的表达模式，并利用Dach1-GFP报告鼠模型，鉴定了一类具有淋巴样潜能的新型前体细胞——淋巴样前体细胞（LPPs）。 | 本文首次鉴定了一种新型淋巴样前体细胞（LPPs），并定义了淋巴样发育在造血过程中的早期分支点。 | NA | 研究淋巴样前体细胞的鉴定及其在造血过程中的作用。 | 淋巴样前体细胞（LPPs）及其在造血过程中的作用。 | 血液学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 129 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Abedinium Reveals a New Early-Branching Dinoflagellate Lineage
2020-12-06, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evaa196
PMID:33045041
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，研究了Abedinium属的两个细胞，揭示了其作为早期分支甲藻的一个新谱系 | 首次通过转录组分析将Abedinium定位为一个独立的谱系，并发现了其隐秘的质体和线粒体基因组的新特征 | 研究样本数量较少，且细胞采集自深海环境，可能影响分析结果的普遍性 | 解析甲藻的进化起源及其细胞特征的祖先状态和早期中间体 | Abedinium属的两个细胞及其转录组 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 两个细胞 |
| 130 | 2024-08-09 |
SIMPLEs: a single-cell RNA sequencing imputation strategy preserving gene modules and cell clusters variation
2020-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaa077
PMID:33029585
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研究论文 | 本文提出了一种名为SIMPLEs的单细胞RNA测序填补策略，该策略能够保留基因模块和细胞集群的变异 | SIMPLEs方法通过迭代识别相关基因模块和细胞集群，并为每个基因模块和细胞类型定制填补缺失值，同时量化填补和细胞聚类的置信度 | NA | 旨在减少单细胞RNA测序数据中的技术变异，同时保留细胞异质性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 统计模型 | 基因表达数据 | 多个真实数据集 |
| 131 | 2024-08-09 |
Downregulation of M Current Is Coupled to Membrane Excitability in Sympathetic Neurons Before the Onset of Hypertension
2020-12, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 研究了在高血压前期自发性高血压大鼠的星状神经节神经元中，M电流下调与膜兴奋性之间的关系，并探讨了其电生理表型和分子机制。 | 首次揭示了M电流抑制在星状神经节神经元异常兴奋性中的作用，并验证了关键离子通道转录本在人类星状神经节中的表达保守性。 | 文章未详细说明研究的局限性。 | 探讨星状神经节神经元在疾病早期阶段的异常活动及其生物物理特性。 | 自发性高血压大鼠的星状神经节神经元。 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、分子生物学、穿孔膜片钳技术 | NA | 电生理数据 | 未具体说明样本数量 |
| 132 | 2024-08-09 |
Transcriptome dynamics of CD4+ T cells during malaria maps gradual transit from effector to memory
2020-12, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0800-8
PMID:33046889
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和计算模型，研究了CD4+ T细胞在疟疾感染和治疗期间的记忆发展动态。 | 首次在全基因组尺度上探讨了CD4 T细胞记忆发展的动态过程，并揭示了抗疟药物对这一过程的调节作用。 | 研究主要集中在疟疾流行区域的CD4+ T细胞，可能不完全适用于其他疾病或非流行区域。 | 探讨CD4+ T细胞在疟疾感染和治疗期间的记忆发展动态及其与抗疟药物的关系。 | CD4+ T细胞在疟疾感染和治疗期间的记忆发展。 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | 计算模型 | 基因表达数据 | 多个CD4+ T细胞样本 |
| 133 | 2024-08-09 |
SLC7A11 as a biomarker and therapeutic target in HPV-positive head and neck Squamous Cell Carcinoma
2020-12-17, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2020.09.134
PMID:33019976
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研究论文 | 研究探讨了SLC7A11作为HPV阳性头颈部鳞状细胞癌的生物标志物和治疗靶点的潜力 | 首次报道了HPV阳性肿瘤中SLC7A11表达水平较低，并且E6-E7细胞对铁死亡的敏感性增加 | 研究主要基于体外细胞实验，需要进一步的临床试验验证 | 探索SLC7A11在HPV阳性头颈部鳞状细胞癌中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | HPV阳性头颈部鳞状细胞癌中的SLC7A11表达及铁死亡敏感性 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及两个HNSCC细胞系 |
| 134 | 2024-08-09 |
Transient Activation of the Hedgehog-Gli Pathway Rescues Radiotherapy-Induced Dry Mouth via Recovering Salivary Gland Resident Macrophages
2020-12-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-0503
PMID:32998998
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research paper | 本文研究了短暂激活 Hedgehog-Gli 通路通过恢复唾液腺驻留巨噬细胞来挽救放射治疗诱导的口干症 | 首次揭示了驻留巨噬细胞及其修复相关的旁分泌因子在短暂激活 Hedgehog 通路挽救放射治疗诱导的唾液功能障碍中的关键作用 | NA | 探讨短暂激活 Hedgehog-Gli 通路恢复放射治疗诱导的唾液腺功能障碍的机制 | 小鼠唾液腺中的巨噬细胞、上皮细胞和内皮细胞 | NA | head and neck cancer | single-cell RNA sequencing, qRT-PCR | NA | RNA | 小鼠唾液腺细胞 |
| 135 | 2024-08-09 |
Characteristics of anti-CD19 CAR T cell infusion products associated with efficacy and toxicity in patients with large B cell lymphomas
2020-12, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-1061-7
PMID:33020644
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基于捕获的细胞识别技术，分析了自体抗CD19 CAR T细胞输注产品在24名大B细胞淋巴瘤患者中的转录组特征，以识别与疗效和毒性相关的特征。 | 本研究首次揭示了CAR T细胞输注产品的细胞和分子特征异质性对axi-cel疗法疗效和毒性的影响，并提出第7天的分子反应可能作为CAR T细胞疗效的早期预测指标。 | 研究样本量较小，仅涉及24名患者，可能影响结果的普遍性。 | 旨在识别与大B细胞淋巴瘤患者接受抗CD19 CAR T细胞疗法的疗效和毒性相关的转录组特征。 | 自体抗CD19 CAR T细胞输注产品在大B细胞淋巴瘤患者中的转录组特征。 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 24名大B细胞淋巴瘤患者 |
| 136 | 2024-08-09 |
Kidney Single-Cell Atlas Reveals Myeloid Heterogeneity in Progression and Regression of Kidney Disease
2020-12, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020060806
PMID:32978267
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在肾脏疾病进展和恢复过程中揭示了髓系细胞的异质性。 | 通过单细胞转录组学技术，识别了12种髓系细胞亚群，这些亚群在传统流式细胞术标记中未被发现，为肾脏疾病的治疗提供了新的靶点。 | NA | 探索髓系细胞在肾脏损伤和修复中的作用，并识别新的髓系细胞亚型。 | 肾脏中的髓系细胞及其在肾脏疾病进展和恢复中的作用。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了小鼠单侧输尿管梗阻模型进行研究 |
| 137 | 2024-08-09 |
Mechanisms of cell specification and differentiation in vertebrate cranial sensory systems
2020-12, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2020.08.006
PMID:32950922
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研究论文 | 本文探讨了脊椎动物颅部感觉系统的细胞特化与分化机制 | 利用单细胞转录组学、高分辨率成像和系统生物学方法，以空前的分辨率研究这些过程 | NA | 揭示脊椎动物感觉器官中驱动细胞多样性的转录因子程序及其与组织形态发生的耦合 | 脊椎动物的感觉细胞特化和分化机制 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学、高分辨率成像、系统生物学 | NA | 转录组数据、成像数据 | NA |
| 138 | 2024-08-09 |
A single-cell view of spermatogonial stem cells
2020-12, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2020.07.005
PMID:32950921
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析探讨了精子发生干细胞（SSCs）及其前体细胞的特性和异质性 | 揭示了SSCs及其前体细胞的异质性，并提出了可能存在多个SSC亚群的新观点 | NA | 探讨单细胞RNA测序分析在精子发生干细胞研究中的应用及其揭示的生物学特性 | 精子发生干细胞（SSCs）及其前体细胞 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 人类、猕猴和小鼠的睾丸细胞 |
| 139 | 2024-08-09 |
L2,1-Extreme Learning Machine: An Efficient Robust Classifier for Tumor Classification
2020-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种基于L2,1范数的新型极端学习机方法，用于提高肿瘤分类的鲁棒性 | 引入L2,1范数在损失函数中以提高方法的鲁棒性，并减少噪声和异常值的影响 | NA | 提高极端学习机在肿瘤分类中的鲁棒性 | 癌症样本和单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 极端学习机（ELM） | 基因表达数据 | 五个UCI数据集以及TCGA数据集和scRNA-seq数据集 |
| 140 | 2024-08-09 |
Skin is a potential host of SARS-CoV-2: A clinical, single-cell transcriptome-profiling and histologic study
2020-Dec, Journal of the American Academy of Dermatology
IF:12.8Q1
DOI:10.1016/j.jaad.2020.08.057
PMID:32822795
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |