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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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101 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of a Postmenopausal Normal Breast Tissue Identifies Multiple Cell Types That Contribute to Breast Cancer
2020-Dec-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12123639
PMID:33291647
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了来自绝经后正常乳腺组织的3193个单细胞,识别出多种与乳腺癌相关的细胞类型 | 首次全面分析了绝经后正常乳腺组织中的非上皮细胞类型,并探讨了这些细胞类型在乳腺癌中的潜在作用 | 研究样本仅来自单一的绝经后乳腺组织,可能无法代表所有乳腺组织的情况 | 探究绝经后正常乳腺组织中的细胞组成及其在乳腺癌中的作用 | 绝经后正常乳腺组织中的单细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3193个单细胞 |
102 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals CD16- monocytes as key regulators of human monocyte transcriptional response to Toxoplasma
2020-12-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-78250-0
PMID:33273621
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研究论文 | 本研究使用单细胞双RNA测序技术(scDual-Seq)首次全面定义了人类单核细胞与弓形虫相互作用中的转录反应 | 首次使用单细胞双RNA测序技术在单细胞水平上全面定义了人类单核细胞与弓形虫的相互作用 | NA | 深入理解人类单核细胞与弓形虫相互作用的分子机制,以加速开发新型人类弓形虫病控制策略 | 人类单核细胞与弓形虫的相互作用 | 数字病理学 | 弓形虫病 | 单细胞双RNA测序(scDual-Seq) | NA | 转录组数据 | 涉及单个单核细胞样本 |
103 | 2024-08-09 |
Tumor-promoting macrophages prevail in malignant ascites of advanced gastric cancer
2020-12, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-020-00538-y
PMID:33277616
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了胃癌恶性腹水中的肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞的细胞特征 | 首次揭示了胃癌恶性腹水中巨噬细胞的非炎症特性,并展示了这些特性与胃癌预后的关联 | 样本量较小,仅分析了四个恶性腹水样本和一个脑脊液样本 | 探索胃癌恶性腹水中细胞的特征,以优化治疗策略 | 胃癌恶性腹水中的肿瘤细胞、巨噬细胞和间皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 分析了180个细胞,包括肿瘤细胞、巨噬细胞和间皮细胞 |
104 | 2024-08-09 |
SARS-CoV-2 Receptors and Entry Genes Are Expressed in the Human Olfactory Neuroepithelium and Brain
2020-Dec-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101839
PMID:33251489
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研究论文 | 研究探讨了SARS-CoV-2受体和进入基因在人类嗅觉神经上皮和大脑中的表达 | 首次发现嗅觉神经上皮中的支持细胞表达SARS-CoV-2受体ACE2和TMPRSS2,可能是病毒进入神经系统的一个潜在入口 | NA | 验证嗅觉神经上皮是否为SARS-CoV-2的靶点,并探讨其在神经系统中的潜在作用 | 人类嗅觉神经上皮和支持细胞,以及特定脑细胞类型 | NA | COVID-19 | RNA-seq | NA | RNA | 人类和鼠类的嗅觉组织及脑细胞 |
105 | 2024-08-09 |
New perspectives of the cardiac cellular landscape: mapping cellular mediators of cardiac fibrosis using single-cell transcriptomics
2020-12-18, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20191255
PMID:33259583
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在理解心脏纤维化和心力衰竭发展中的应用 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)提供了一个新的平台,用于识别可能驱动心脏纤维化和心力衰竭发展的新的细胞和分子主角 | 讨论了在解释scRNA-seq数据时的一些关键考虑因素及其局限性 | 理解心脏纤维化和心力衰竭的发展 | 心脏细胞景观及其在心脏纤维化中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
106 | 2024-08-09 |
Single-Cell Immune Profiling in Coronary Artery Disease: The Role of State-of-the-Art Immunophenotyping With Mass Cytometry in the Diagnosis of Atherosclerosis
2020-12-15, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.120.017759
PMID:33251927
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综述 | 本文综述了心血管免疫学的重要进展,并总结了免疫系统与动脉粥样硬化之间的临床证据 | 介绍了质谱流式细胞术和单细胞RNA测序等高分辨率技术在早期动脉粥样硬化诊断中的应用 | 主要血清生物标志物的特异性较低 | 探讨新的诊断和治疗方法,以改善冠状动脉疾病的早期检测和干预 | 冠状动脉疾病及其相关免疫细胞亚型 | NA | 心血管疾病 | 质谱流式细胞术 | NA | 单细胞数据 | NA |
107 | 2024-08-09 |
Decoding the Heterogeneity of Human Dendritic Cell Subsets
2020-12, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2020.10.002
PMID:33250080
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析,探讨了人类树突状细胞(DCs)的新亚群及其在基于发育的分类中的位置 | 利用高吞吐量的单细胞方法,特别是在转录组水平上揭示了人类DCs的进一步异质性 | NA | 研究人类树突状细胞的新亚群及其特征 | 人类树突状细胞的亚群及其分类 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
108 | 2024-08-09 |
High-resolution mouse subventricular zone stem-cell niche transcriptome reveals features of lineage, anatomy, and aging
2020-12-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2014389117
PMID:33229571
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术,对从小鼠SVZ区域从小到老的干细胞进行了全面的转录组分析 | 首次对SVZ区域从小到老的干细胞进行了全面的单细胞RNA测序分析,揭示了不同年龄段干细胞的异质性和转录特征 | NA | 研究SVZ区域神经干细胞的异质性及其在不同年龄段的转录特征 | 小鼠SVZ区域的神经干细胞及其在不同年龄段的转录特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从小鼠SVZ区域从小到老的干细胞样本 |
109 | 2024-08-09 |
Single Cell RNA Sequencing of Human Milk-Derived Cells Reveals Sub-Populations of Mammary Epithelial Cells with Molecular Signatures of Progenitor and Mature States: a Novel, Non-invasive Framework for Investigating Human Lactation Physiology
2020-12, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-020-09466-z
PMID:33216249
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人乳来源的乳腺上皮细胞,揭示了其亚群及其转录特征,为研究人类哺乳生理提供了一种新颖的非侵入性框架 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析人乳来源的乳腺上皮细胞,并提供了一个计算框架供未来研究使用 | 目前使用乳汁来源细胞研究人类乳腺生理的临床潜力和局限性 | 研究人乳中的细胞作为非侵入性材料,用于探索哺乳生理 | 人乳来源的乳腺上皮细胞及其转录特征 | 数字病理学 | 妊娠糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 3740个细胞来自两名产后两周的母亲的乳汁样本 |
110 | 2024-08-09 |
Author Correction: Integrating microarray-based spatial transcriptomics and single-cell RNA-seq reveals tissue architecture in pancreatic ductal adenocarcinomas
2020-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00776-5
PMID:33230294
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
111 | 2024-08-09 |
Linking axon morphology to gene expression: a strategy for neuronal cell-type classification
2020-12, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2020.10.006
PMID:33181399
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研究论文 | 本文探讨了将轴突形态与基因表达联系起来,以进行神经细胞类型分类的策略 | 本文提出了一种将单细胞转录组学与轴突投影模式相结合的方法,以更好地描述细胞类型 | NA | 研究大脑如何驱动认知和行为,并理解其细胞组成 | 神经细胞类型的分类 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据,形态学数据 | 小鼠大脑 |
112 | 2024-08-09 |
BMP signaling: at the gate between activated melanocyte stem cells and differentiation
2020-12-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.340281.120
PMID:33184221
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和比较基因表达分析,研究了静止、激活和黑素细胞成熟过程中黑素细胞干细胞的转录动力学,并探讨了WNT和BMP信号通路在这一过程中的整合作用。 | 本文揭示了WNT和BMP信号通路在黑素细胞干细胞激活和分化过程中的协同作用,并强调了BMP信号在驱动完全分化中的关键作用。 | NA | 阐明黑素细胞干细胞在静止、激活和黑素细胞成熟过程中的转录动力学,并理解WNT和BMP信号通路的整合机制。 | 黑素细胞干细胞及其在毛发周期中的激活和分化过程。 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
113 | 2024-08-09 |
Guidelines for reporting single-cell RNA-seq experiments
2020-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00744-z
PMID:33188371
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
114 | 2024-08-09 |
Spatio-temporal regulation of gene expression defines subpopulations of epidermal stem cells
2020-12-18, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20200740
PMID:33170265
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研究论文 | 本文探讨了表皮干细胞的基因表达时空调控及其在再生医学中的应用 | 引入了单细胞转录组学、伪时间推断、RNA速度和细胞熵等技术,揭示了表皮干细胞的高度异质性和可塑性 | 分离表皮干细胞与其后代仍然是一个挑战 | 探索表皮干细胞的可塑性及其在再生医学中的应用 | 表皮干细胞及其亚群角质形成细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学、伪时间推断、RNA速度 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
115 | 2024-08-09 |
CaMKIIα-Positive Interneurons Identified via a microRNA-Based Viral Gene Targeting Strategy
2020-12-09, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2570-19.2020
PMID:33158963
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研究论文 | 本文介绍了一种基于microRNA的病毒基因靶向策略,用于识别表达CaMKIIα的阳性中间神经元 | 提出了一种新的病毒基因表达策略,使用microRNA引导的神经元标签(mAGNET)来靶向具有特定microRNA表达的细胞 | NA | 研究大脑细胞中基因表达的多样性,并探索基因表达与生理特性之间的关系 | 表达CaMKIIα的中间神经元及其生理特性 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 雄性和雌性小鼠 |
116 | 2024-08-09 |
Optimized Langendorff perfusion system for cardiomyocyte isolation in adult mouse heart
2020-12, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.15773
PMID:33147379
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research paper | 本文介绍了一种优化的Langendorff灌流系统,用于从成年小鼠心脏中分离心肌细胞 | 提出了一个简化和标准化的操作协议,利用重力作为灌流压力,并引入了新的去泡方法和消化终止标准 | NA | 改进Langendorff灌流系统,以提高心肌细胞的活性和纯度,满足单细胞测序技术的要求 | 成年小鼠心脏中的心肌细胞 | digital pathology | 心血管疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 细胞 | 多次自然重力沉降后获得稳定的心肌细胞 |
117 | 2024-08-09 |
Toward a Consensus View of Mammalian Adipocyte Stem and Progenitor Cell Heterogeneity
2020-12, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2020.09.007
PMID:33148396
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综述 | 本文综述了关于哺乳动物脂肪细胞干细胞和前体细胞异质性的当前知识 | 利用单细胞转录组学技术,提供了对不同哺乳动物脂肪库中ASPCs细胞复杂性的新见解 | ASPCs的分子异质性和功能多样性仍未完全理解 | 探讨哺乳动物脂肪细胞干细胞和前体细胞的异质性 | 脂肪干细胞和前体细胞(ASPCs)及其在脂肪组织中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明 |
118 | 2024-08-09 |
Transcriptional Programs of Circuit Assembly in the Drosophila Visual System
2020-12-23, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2020.10.006
PMID:33125872
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术,研究了果蝇视觉系统发育过程中多个阶段的神经元转录组,揭示了神经元间突触连接的遗传编码模式。 | 本文开发了一种高效策略,通过在单一池中对多个时间点的神经元进行测序,减少了批次效应并提高了时间序列数据的可靠性。 | NA | 研究果蝇视觉系统中神经元电路组装的转录程序。 | 果蝇视觉系统中多个发育阶段的神经元转录组。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过150种不同的神经元群体,其中88种神经元群体在突触形成过程中被追踪。 |
119 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis reveals thyrocyte diversity in the zebrafish thyroid gland
2020-12-03, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202050612
PMID:33140917
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,揭示了斑马鱼甲状腺腺泡细胞的异质性及其周围非腺泡细胞的分子特征 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了斑马鱼甲状腺腺泡细胞的异质性,并验证了转录因子pax2a在腺泡细胞中的双峰表达模式 | NA | 探索斑马鱼甲状腺腺泡细胞的异质性及其分子特征 | 斑马鱼甲状腺腺泡细胞及其周围细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 6249个细胞 |
120 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptome research in human placenta
2020-12, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-20-0231
PMID:33112783
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在人类胎盘研究中的应用,总结了不同妊娠阶段及妊娠并发症中的研究进展 | 介绍了单细胞RNA测序技术在胎盘细胞异质性研究中的应用 | 未提及具体的研究局限性 | 揭示正常和疾病胎盘中不同细胞类型的异质性及细胞间的分子相互作用 | 人类胎盘及其在妊娠并发症中的表现 | 基因组学 | 妊娠并发症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 未提及具体样本量 |