单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 158 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-09 |
Conditional out-of-distribution generation for unpaired data using transfer VAE
2020-12-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa800
PMID:33381839
|
研究论文 | 本文提出了一种新的条件变分自编码器（trVAE），通过在解码器层使用最大均值差异来匹配不同条件下的分布，从而提高了模型在未配对数据上的泛化能力和准确性 | 引入最大均值差异在解码器层进行分布匹配，增强了模型在同一条件内重建样本和跨条件转换样本的能力 | NA | 克服条件变分自编码器在未配对数据上生成分布的局限性 | 高维图像和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 条件变分自编码器（CVAE） | 变分自编码器（VAE） | 高维数据 | NA |
| 62 | 2024-08-09 |
Comprehensive network modeling from single cell RNA sequencing of human and mouse reveals well conserved transcription regulation of hematopoiesis
2020-Dec-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07241-2
PMID:33372598
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人类和小鼠骨髓中的转录调控网络，揭示了血液生成过程中转录调控的保守性 | 设计了一种网络重建算法，用于比较人类和小鼠骨髓细胞中血液生成相关基因的共表达和转录调控 | NA | 研究血液生成过程中的转录调控网络的保守性 | 人类和小鼠的骨髓细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠的骨髓细胞 |
| 63 | 2024-08-09 |
Airway-Associated Macrophages in Homeostasis and Repair
2020-12-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108553
PMID:33378665
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫荧光技术，研究了小鼠气管在稳态和上皮损伤/修复过程中的髓系细胞特征 | 本文首次详细描述了与气道相关的亚粘膜巨噬细胞和上皮内巨噬细胞，并探讨了它们在损伤后的动态变化及其对修复过程的影响 | NA | 研究气道相关巨噬细胞在稳态和修复过程中的作用 | 小鼠气管的髓系细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光 | NA | 细胞 | 小鼠气管样本 |
| 64 | 2024-08-09 |
Aging-Associated Alterations in Mammary Epithelia and Stroma Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2020-12-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108566
PMID:33378681
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细分析了年轻和老年小鼠乳腺组织的转录组图谱，揭示了与年龄相关的乳腺上皮和基质细胞的改变 | 首次系统地研究了年龄诱导的乳腺上皮和基质细胞的改变，并揭示了潜在的促肿瘤发生机制 | NA | 探究年龄对乳腺生理的影响及其与乳腺癌风险的关系 | 年轻和老年小鼠的乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的乳腺组织样本 |
| 65 | 2024-08-09 |
Feature Selection for Topological Proximity Prediction of Single-Cell Transcriptomic Profiles in Drosophila Embryo Using Genetic Algorithm
2020-12-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12010028
PMID:33379262
|
研究论文 | 本文使用遗传算法（GA）和DistMap算法来预测果蝇胚胎中单细胞转录组特征的拓扑邻近性，并选择最重要的基因 | 本文详细讨论了遗传算法的实现及其在挑战后的参数化，旨在改进基于GA的基因集选择方法，以更有效地预测拓扑关联 | 由于复杂的聚合排名，该方法的详细信息未能在主要挑战出版物中发表 | 旨在改进基于遗传算法的基因集选择方法，以更有效地预测单细胞相似性 | 果蝇胚胎中的单细胞转录组特征 | 基因组学 | NA | 遗传算法（GA） | DistMap算法 | 转录组数据 | 从84个已知的原位基因模式中选择了60、40和20个基因的单细胞数据集 |
| 66 | 2024-08-09 |
Constitutive activation of cellular immunity underlies the evolution of resistance to infection in Drosophila
2020-12-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.59095
PMID:33357377
|
研究论文 | 本文研究了果蝇在高度寄生虫寄生下通过增强细胞免疫反应来发展抗性的机制 | 通过单细胞RNA测序发现，抗性果蝇的免疫诱导基因被持续上调，这是由于抗性幼虫分化出之前仅在感染后产生的特殊免疫细胞的前体细胞 | NA | 探讨果蝇在高度寄生环境下如何通过增强细胞免疫反应来发展抗性 | 果蝇及其对寄生虫的免疫反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 67 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveal Immune Mechanisms of the Onset and Progression of IgA Nephropathy
2020-12-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108525
PMID:33357427
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了IgA肾病和正常样本中的肾脏和CD14外周血单个核细胞，揭示了IgA肾病的免疫机制及其发病和进展过程 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了IgA肾病中免疫细胞和肾细胞的分子事件，特别是JCHAIN在系膜细胞中的上调机制 | NA | 揭示IgA肾病的发病和进展的免疫机制 | IgA肾病和正常样本中的肾脏和CD14外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | IgA肾病和正常样本 |
| 68 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals that the Switching of the Transcriptional Profiles of Cysteine-Related Genes Alters the Virulence of Entamoeba histolytica
2020-Dec-22, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.01095-20
PMID:33361325
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）研究了阿米巴原虫的转录组特征，揭示了硫代谢和蛋白酶体途径在病原性中的重要性，并探讨了在胱氨酸缺乏条件下，阿米巴原虫如何调节胱氨酸相关基因的表达以影响其毒力和吞噬作用。 | 使用单细胞RNA测序技术揭示了阿米巴原虫在胱氨酸缺乏条件下的转录组变化，以及这种变化如何影响其毒力和细胞毒性。 | 研究主要集中在单个阿米巴原虫的转录组分析，未涉及更广泛的细胞群体或其他相关病原体的比较研究。 | 探讨阿米巴原虫的转录组特征及其在胱氨酸缺乏条件下的调节机制，以理解其毒力变化的生物学特性。 | 阿米巴原虫的单个原虫及其后代 | 数字病理学 | 阿米巴病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 单个阿米巴原虫及其后代 |
| 69 | 2024-08-09 |
Modulation of Immune Checkpoints by Chemotherapy in Human Colorectal Liver Metastases
2020-12-22, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2020.100160
PMID:33377131
|
研究论文 | 本研究探讨了化疗对人类结直肠癌肝转移瘤免疫微环境的影响 | 发现了两种对化疗反应不同的细胞亚型，并揭示了化疗与免疫检查点抑制剂联合使用的潜在协同效应 | NA | 研究化疗对结直肠癌肝转移瘤免疫微环境的影响 | 人类结直肠癌肝转移瘤切片 | NA | 结直肠癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 8例 |
| 70 | 2024-08-09 |
[Research advances on application of single-cell RNA sequencing in islet cell biology]
2020-Dec-20, Zhonghua shao shang za zhi = Zhonghua shaoshang zazhi = Chinese journal of burns
|
研究论文 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在胰岛细胞生物学研究中的应用进展 | 单细胞RNA测序技术能够表征稀有类型的内分泌细胞，发现典型内分泌细胞的细胞异质性和新的细胞亚型，分析不同物种间内分泌细胞的差异，并更准确地描述各种类型胰岛细胞在发育过程和代谢疾病中的不同状态 | 目前单细胞RNA测序对低丰度转录本的检测效率相对较低 | 探讨单细胞RNA测序技术在胰岛细胞生物学中的应用 | 胰岛细胞 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及人类和鼠类的胰岛细胞 |
| 71 | 2024-08-09 |
Preparing Highly Viable Single-Cell Suspensions from Mouse Pancreatic Islets for Single-Cell RNA Sequencing
2020-12-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100144
PMID:33377038
|
研究论文 | 本文描述了一种从鼠胰腺胰岛中制备高存活率单细胞悬液的方法，用于单细胞RNA测序 | 提供了一种有效的鼠胰腺胰岛单细胞悬液制备协议，适用于单细胞RNA测序 | NA | 研究胰腺胰岛的细胞异质性和亚群 | 鼠胰腺胰岛的单细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 72 | 2024-08-09 |
Optimized workflow for single-cell transcriptomics on infectious diseases including COVID-19
2020-12-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100233
PMID:33377120
|
研究论文 | 本文介绍了一种针对包括COVID-19在内的传染病进行单细胞转录组学研究的完整且安全的实验流程 | 提出了一个针对新病原体SARS-CoV-2的安全实验流程，用于从细胞分离到数据分析的scRNA-seq实验 | NA | 开发一种安全的工作流程，用于研究包括COVID-19在内的传染病的单细胞转录组学 | 感染患者的血液样本 | 单细胞测序 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 感染患者的血液样本 |
| 73 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis of mouse preimplantation embryos by third-generation sequencing
2020-12, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001017
PMID:33378329
|
研究论文 | 本文开发了一种基于第三代测序平台的新型单细胞RNA测序技术SCAN-seq，并应用于小鼠植入前胚胎的分析 | SCAN-seq技术具有高灵敏度和准确性，能够捕获大量未注释的转录本，并展示出高验证率 | NA | 开发和验证一种新的单细胞RNA测序技术，并应用于小鼠植入前胚胎的转录组分析 | 小鼠植入前胚胎 | 基因组学 | NA | 第三代测序（TGS） | NA | RNA序列 | 9,338个基因中的27,250个未注释转录本 |
| 74 | 2024-08-09 |
Study on the clinical mechanism of Tong-Xie-An-Chang Decoction in the treatment of diarrheal irritable bowel syndrome based on single-cell sequencing technology
2020-Dec-24, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000023868
PMID:33350782
|
研究论文 | 本研究旨在评估通泻安肠汤治疗腹泻型肠易激综合征的临床疗效和安全性，并基于单细胞测序技术阐明其基因层面的治疗机制 | 利用单细胞测序技术探索腹泻型肠易激综合征患者外周血中T淋巴细胞的差异基因表达和细胞异质性 | NA | 评估通泻安肠汤在腹泻型肠易激综合征治疗中的临床疗效和安全性，并阐明其基因层面的治疗机制 | 腹泻型肠易激综合征患者 | NA | 肠易激综合征 | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | 72名符合条件的腹泻型肠易激综合征患者 |
| 75 | 2024-08-09 |
Lung megakaryocytes display distinct transcriptional and phenotypic properties
2020-12-22, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2020002843
PMID:33351116
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、组织学、倍性分析和流式细胞术研究了来自同源小鼠肺和造血组织的原始巨核细胞的转录组和表型特征 | 发现肺巨核细胞具有独特的转录特征，富集了成熟标志物，可能表明其具有更高效的血小板生产能力，并且表现出免疫和炎症相关的富集特征 | NA | 探讨肺巨核细胞的转录和表型特性 | 肺巨核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自同源小鼠肺和造血组织的原始巨核细胞 |
| 76 | 2024-08-09 |
Pulmonary neuroendocrine cells: physiology, tissue homeostasis and disease
2020-12-21, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.046920
PMID:33355253
|
综述 | 本文综述了肺神经内分泌细胞（PNECs）的生理功能、组织稳态及其在疾病中的作用 | 介绍了PNECs在肺通气动力学、机械感应和类型2免疫反应中的作用，以及单细胞RNA测序揭示的PNECs基因表达异质性和再生过程中的重编程 | NA | 深入理解PNECs的基本特性在肺生物学和病理学中的重要性 | 肺神经内分泌细胞（PNECs）及其在呼吸疾病中的作用 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 77 | 2024-08-09 |
Single-cell atlas of the first intra-mammalian developmental stage of the human parasite Schistosoma mansoni
2020-12-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20092-5
PMID:33339816
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对人类寄生虫曼氏血吸虫的早期哺乳动物内发育阶段进行了细胞图谱分析 | 首次为曼氏血吸虫的早期哺乳动物内发育阶段提供了全面的细胞类型图谱 | NA | 揭示驱动曼氏血吸虫在哺乳动物体内发育的机制 | 曼氏血吸虫的早期发育阶段，特别是称为血吸虫幼虫的阶段 | 数字病理学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两天的曼氏血吸虫幼虫样本 |
| 78 | 2024-08-09 |
Development of a sequencing system for spatial decoding of DNA barcode molecules at single-molecule resolution
2020-12-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01499-8
PMID:33339962
|
research paper | 本文开发了一种基于单分子测序系统HeliScope的测序系统，用于在单分子分辨率下解码DNA条形码分子的空间信息 | 开发了一种新的测序系统，能够在单分子分辨率下解码DNA条形码分子的空间信息，并提出了名为“分子足迹”的新方法 | NA | 开发一种能够在单分子分辨率下解码DNA条形码分子空间信息的测序系统 | DNA条形码分子及其在空间转录组学和空间蛋白质组学中的应用 | NA | NA | 单分子测序 | NA | DNA条形码分子 | 30种DNA条形码分子 |
| 79 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptional Profiling of Mouse Islets Following Short-Term Obesogenic Dietary Intervention
2020-Dec-18, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo10120513
PMID:33353164
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了在高脂饮食干预下小鼠胰岛中β细胞的早期转录变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了高脂饮食对小鼠胰岛β细胞转录组的影响，并识别了不同β细胞群的基因表达模式 | 研究仅限于一周的高脂饮食干预，可能无法完全反映长期饮食干预的影响 | 阐明肥胖环境下导致β细胞功能障碍的早期转录事件 | 小鼠胰岛中的β细胞及其他内分泌细胞类型 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自四只高脂饮食小鼠和三只对照饮食小鼠的胰岛样本 |
| 80 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis supports a luminal-neuroendocrine transdifferentiation in human prostate cancer
2020-12-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01476-1
PMID:33328604
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了6例去势抵抗性前列腺癌的21,292个细胞，揭示了神经内分泌肿瘤细胞具有腔型上皮表型，并提出神经内分泌分化主要来源于腔型恶性细胞而非基底细胞。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了神经内分泌前列腺癌中神经内分泌分化主要来源于腔型恶性细胞，并通过组织微阵列分析验证了这一发现。 | 研究样本仅限于6例去势抵抗性前列腺癌，可能影响结果的普遍性。 | 探究人类前列腺癌中神经内分泌分化的细胞起源。 | 去势抵抗性前列腺癌中的神经内分泌肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 21,292个细胞来自6例去势抵抗性前列腺癌的针刺活检样本 |