单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 158 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-07 |
Circulating tumor cell characterization of lung cancer brain metastases in the cerebrospinal fluid through single-cell transcriptome analysis
2020-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.246
PMID:33377642
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，对肺癌脑转移的循环肿瘤细胞在脑脊液中的特征进行了深入研究 | 首次在分子和转录组水平上对脑脊液中的循环肿瘤细胞（CSF-CTCs）进行了全面定义 | 研究样本仅限于五名肺癌脑膜转移患者和三名对照组，样本量较小 | 旨在通过单细胞转录组分析，深入了解肺癌脑转移的循环肿瘤细胞特征 | 肺癌脑膜转移患者的脑脊液中的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 五名肺癌脑膜转移患者和三名对照组的脑脊液细胞，共3792个单细胞转录组 |
| 42 | 2024-08-07 |
Transcriptomic profiling across the nonalcoholic fatty liver disease spectrum reveals gene signatures for steatohepatitis and fibrosis
2020-12-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aba4448
PMID:33268509
|
研究论文 | 本研究通过大规模多中心研究，分析了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）进展至肝硬化过程中的转录组变化，以识别潜在的循环标志物 | 本研究首次识别了25个差异表达基因，这些基因在纤维化脂肪肝炎进展中具有一致性表达，并通过独立验证和整合分析进一步确认了这些基因的贡献 | NA | 揭示非酒精性脂肪肝病进展过程中的基因特征，并寻找潜在的疾病进展标志物 | 非酒精性脂肪肝病患者的肝脏组织 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 高通量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 206名NAFLD患者样本用于发现队列，175名患者样本用于验证队列 |
| 43 | 2024-08-07 |
ReactomeGSA - Efficient Multi-Omics Comparative Pathway Analysis
2020-12, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1074/mcp.TIR120.002155
PMID:32907876
|
研究论文 | 介绍了一种名为ReactomeGSA的新资源，用于多组学数据集的比较途径分析 | ReactomeGSA通过Reactome的现有网页界面和新的ReactomeGSA R Bioconductor包，支持scRNA-seq数据，并能自动将不同物种的数据映射到共同的途径空间，大大降低了多组学、跨物种比较途径分析的技术门槛 | NA | 探索多组学数据集的比较途径分析方法 | B细胞在抗肿瘤免疫中的作用 | 生物信息学 | 肺癌 | scRNA-seq | NA | 多组学数据 | 比较了来自Cancer Genome Atlas (TCGA)的五个转录组学研究和Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC)的两个蛋白质组学研究的B细胞丰富和贫乏的人类癌症样本 |
| 44 | 2024-08-07 |
Resolving the Instructions for αβ T Cell Development
2020-12-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.11.014
PMID:33326761
|
研究论文 | Chopp等人利用单细胞转录组学和表观基因组学在鼠和人类样本中描绘了αβ T细胞亚群的发育轨迹，并细化了CD4和CD8 T细胞谱系承诺的动力学选择模型 | 利用单细胞转录组学和表观基因组学技术，细化了CD4和CD8 T细胞谱系承诺的动力学选择模型 | NA | 描绘αβ T细胞亚群的发育轨迹并细化T细胞谱系承诺的模型 | αβ T细胞亚群的发育轨迹 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学和表观基因组学 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 鼠和人类样本 |
| 45 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics analysis showing functional heterogeneity in decidual stromal cells during labor
2020-Dec-28, Journal of investigative medicine : the official publication of the American Federation for Clinical Research
IF:2.5Q3
DOI:10.1136/jim-2020-001616
PMID:33372108
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了分娩前后基底层间质细胞的异质性及其功能变化 | 首次通过单细胞转录组学分析揭示了分娩过程中基底层间质细胞的功能异质性 | NA | 研究分娩过程中基底层间质细胞的异质性及其功能变化 | 基底层间质细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6382个细胞 |
| 46 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of equine mesenchymal stromal cells from primary donor-matched tissue sources reveals functional heterogeneity in immune modulation and cell motility
2020-12-04, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-020-02043-5
PMID:33276815
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了从马的三种不同组织来源（脂肪组织、骨髓和外周血）获得的间充质干细胞，揭示了这些细胞在免疫调节和细胞迁移功能上的异质性 | 首次在马的间充质干细胞中使用单细胞RNA测序技术，并结合功能实验验证了转录差异与细胞迁移和免疫调节功能的关系 | NA | 研究间充质干细胞的异质性及其对治疗潜力的影响 | 马的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从三种植入匹配的组织来源（脂肪组织、骨髓和外周血）收集的马间充质干细胞 |
| 47 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics of human islet ontogeny defines the molecular basis of β-cell dedifferentiation in T2D
2020-12, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2020.101057
PMID:32739450
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细描述了人类发育过程中α-和β-细胞的成熟过程，并比较了非糖尿病和2型糖尿病个体的胰岛细胞。 | 首次揭示了2型糖尿病患者胰岛β细胞的去分化现象及其分子基础。 | NA | 探讨2型糖尿病中胰岛β细胞去分化的分子机制。 | 人类胰岛细胞的成熟过程及2型糖尿病中的变化。 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及非糖尿病和2型糖尿病个体的胰岛细胞样本 |
| 48 | 2024-08-07 |
Sexually Dimorphic Crosstalk at the Maternal-Fetal Interface
2020-12-01, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgaa503
PMID:32772088
|
研究论文 | 研究胎儿性别如何影响母胎界面的受体配体相互作用，并探讨其在早期胎盘形成中的作用 | 首次定义了早期胎盘形成阶段的性别二态性信号 | NA | 探究胎儿性别对母胎界面相互作用的影响 | 母胎界面的受体配体相互作用及早期胎盘形成 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组 | 晚期第一孕期（约10-13周）的胎盘（胎儿）和蜕膜（母体）样本 |
| 49 | 2024-08-07 |
An atlas of immune cell exhaustion in HIV-infected individuals revealed by single-cell transcriptomics
2020-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2020.1826361
PMID:32954948
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，揭示了HIV感染者免疫细胞衰竭的图谱 | 首次在单细胞水平上详细描述了HIV感染者免疫细胞衰竭的多样性和特定亚群，并发现了KLRG1受体在HIV特异性衰竭CD8 T细胞中的作用 | 研究样本仅包括四名健康受试者和六名HIV感染者，样本量相对较小 | 探讨HIV感染对免疫细胞衰竭的影响及其分子机制 | 外周血单个核细胞中的免疫细胞 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 37,847个细胞来自四名健康受试者，28,610个细胞来自六名HIV感染者 |
| 50 | 2024-08-07 |
Expression of SARS-CoV-2 Entry Factors in the Pancreas of Normal Organ Donors and Individuals with COVID-19
2020-12-01, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.11.005
PMID:33207244
|
研究论文 | 研究分析了正常器官捐赠者和COVID-19患者胰腺中SARS-CoV-2进入因子ACE2的表达情况 | 首次详细分析了COVID-19患者胰腺中ACE2的表达及其与糖尿病的可能关联 | 研究主要基于公共数据集和有限的样本，可能需要更大规模的研究来验证结果 | 探讨SARS-CoV-2感染与糖尿病之间的关系 | 胰腺中ACE2的表达及COVID-19患者的胰腺病理变化 | NA | COVID-19 | scRNA-seq, 荧光原位杂交, 蛋白质印迹, 免疫定位 | NA | RNA, 蛋白质 | 五个公共scRNA-seq胰腺数据集及来自正常人和COVID-19患者的胰腺组织 |
| 51 | 2024-08-07 |
Group 2 Innate Lymphoid Cells Coordinate Damage Response in the Stomach
2020-12, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.08.051
PMID:32891625
|
研究论文 | 本文研究了2型先天淋巴细胞（ILC2s）在胃上皮修复中的作用 | 发现ILC2s在胃组织损伤后协调了metaplastic反应 | NA | 探讨ILC2s在胃上皮修复中的作用 | 2型先天淋巴细胞（ILC2s）在胃上皮修复中的作用 | NA | 胃癌 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，免疫染色 | NA | 组织 | C57BL/6J小鼠和胃腺癌患者组织样本 |
| 52 | 2024-08-07 |
Manipulating niche composition limits damage to haematopoietic stem cells during Plasmodium infection
2020-12, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-00601-w
PMID:33230302
|
研究论文 | 本文通过使用疟疾的小鼠模型，结合单细胞RNA测序、数学建模、移植实验和活体显微镜技术，研究了感染对造血干细胞（HSCs）功能的影响及其机制 | 首次展示了感染期间造血干细胞功能受影响的机制，并提出了通过调节骨髓微环境来恢复造血干细胞功能的方法 | NA | 探讨感染对造血干细胞功能的影响及其机制 | 造血干细胞及其骨髓微环境 | NA | 疟疾 | 单细胞RNA测序、数学建模、移植实验、活体显微镜技术 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 53 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics in dermatology
2020-Dec, JAAD international
DOI:10.1016/j.jdin.2020.08.001
PMID:34409338
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究皮肤细胞的转录组特征，揭示皮肤健康与疾病中的细胞异质性 | 利用单细胞RNA测序技术，能够以前所未有的高分辨率分析皮肤细胞的转录组，识别稀有细胞群和细胞间变异 | NA | 深入理解皮肤稳态生理及多种皮肤病的发病机制，并探索新的治疗靶点 | 皮肤细胞及其在健康和疾病状态下的转录组特征 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 大量组织样本 |
| 54 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing for engineering and studying human islets
2020-Dec, Current opinion in biomedical engineering
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.cobme.2020.06.003
PMID:33738370
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了人胰岛细胞在不同成熟和糖尿病状态下的转录特征 | 利用单细胞RNA测序技术，能够准确评估特定细胞类型和β细胞亚型，揭示胰岛发育和糖尿病病理的深入见解 | NA | 探讨胰岛细胞的成熟过程及其在糖尿病病理中的作用 | 干细胞衍生的和原代人胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及不同成熟和糖尿病状态的干细胞衍生的和原代人胰岛细胞 |
| 55 | 2024-08-09 |
Integration of single-cell datasets reveals novel transcriptomic signatures of β-cells in human type 2 diabetes
2020-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaa097
PMID:33575641
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据集，揭示了人类2型糖尿病中β细胞的新转录组特征 | 首次通过整合多个独立研究的单细胞RNA测序数据集，克服了变异源的干扰，更准确地识别了2型糖尿病β细胞的共同转录组特征 | 研究依赖于已有的单细胞RNA测序数据集，可能受到原始数据质量的影响 | 旨在通过单细胞RNA测序技术，识别与人类2型糖尿病相关的β细胞转录组变化 | 人类2型糖尿病中的胰腺β细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 3046个单细胞，表达27931个基因 |
| 56 | 2024-08-09 |
Discrepant mRNA and Protein Expression in Immune Cells
2020-Dec, Current genomics
IF:1.8Q3
|
研究论文 | 研究报道了免疫细胞中mRNA与蛋白质表达水平不一致的现象 | 提出将单细胞mRNA测序（scRNA-seq）与其他测序方法（如CITE-seq）结合使用，以提高结果的精确性和可信度 | 未提及具体限制 | 探讨免疫细胞中mRNA与蛋白质表达水平的差异 | 免疫细胞中的mRNA与蛋白质表达 | NA | NA | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | mRNA与蛋白质表达数据 | 未提及具体样本数量 |
| 57 | 2024-08-09 |
Single-cell Sequencing in the Field of Stem Cells
2020-Dec, Current genomics
IF:1.8Q3
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在干细胞领域的最新进展和未来展望 | 单细胞测序技术能够有效分析细胞异质性并识别少数细胞群体 | NA | 探讨单细胞测序技术在干细胞研究中的应用 | 多能干细胞、组织特异性干细胞和癌症干细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组 | 单个细胞 |
| 58 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA Sequencing: In-depth Decoding of Heart Biology and Cardiovascular Diseases
2020-Dec, Current genomics
IF:1.8Q3
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管系统研究中的最新进展，并总结了该技术在心脏发育科学、干细胞研究以及正常或疾病相关工作机制方面提供的新见解 | 单细胞RNA测序技术在解码细胞异质性、表型转变和发育动力学方面取得了突破 | NA | 综述单细胞RNA测序技术在心血管系统研究中的应用 | 心血管系统及其相关疾病 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 59 | 2024-08-09 |
The Comparison of Two Single-cell Sequencing Platforms: BD Rhapsody and 10x Genomics Chromium
2020-Dec, Current genomics
IF:1.8Q3
|
研究论文 | 本文比较了两种单细胞测序平台BD Rhapsody和10x Genomics Chromium的机制和scRNA-seq结果 | 本文提供了对两种常用单细胞测序平台的系统比较 | 目前对这些常用平台的系统比较较少 | 比较两种单细胞测序平台的优势和局限性 | BD Rhapsody和10x Genomics Chromium单细胞测序平台 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | NA |
| 60 | 2024-08-09 |
SCHNEL: scalable clustering of high dimensional single-cell data
2020-12-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa816
PMID:33381821
|
研究论文 | 本文介绍了SCHNEL，一种用于高维单细胞数据的可扩展、可靠且自动化的聚类工具 | SCHNEL通过将数据的层次表示与图聚类相结合，使图聚类可扩展到数百万个细胞 | NA | 开发一种可扩展的聚类工具，用于处理大规模的高维单细胞数据 | 单细胞数据，包括细胞计数数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 图聚类 | NA | 高维数据 | 涉及3.5百万和17.2百万个细胞的数据集 |