单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 135 篇文献，本页显示第 121 - 135 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-09 |
Integrative analysis of scRNA-seq and GWAS data pinpoints periportal hepatocytes as the relevant liver cell types for blood lipids
2020-11-04, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaa188
PMID:32821946
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研究论文 | 本文通过整合脂质特征的全基因组关联研究（GWAS）和肝脏单细胞转录组数据，识别了对血液脂质水平最相关的肝脏细胞类型 | 本文创新地使用了分层连锁不平衡得分回归方法，结合细胞类型特异性表达基因集（CT-SEGS）来确定与复杂性状和疾病最相关的细胞类型 | NA | 旨在通过整合GWAS和单细胞转录组数据，识别与血液脂质水平最相关的肝脏细胞类型 | 人类和小鼠的肝脏细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），全基因组关联研究（GWAS） | NA | 基因表达数据 | 40种人类和小鼠的肝脏细胞类型 |
| 122 | 2024-08-09 |
Application of single-cell RNA sequencing in embryonic development
2020-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2020.08.007
PMID:32781204
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在胚胎发育研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术不仅反映了细胞间的异质性，还能揭示有限样本中不同细胞的基因表达特征 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在胚胎发育研究中的应用，并为相关疾病的治疗提供创新思路 | 胚胎发育过程中的细胞行为和基因调控 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 有限数量的早期胚胎细胞 |
| 123 | 2024-08-09 |
Clinical and genomic landscape of hepatocellular carcinoma subtypes with various proportions of nonleukocyte stromal cells
2020-Nov-30, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2020.145028
PMID:32763490
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研究论文 | 本文研究了肝细胞癌（HCC）中非白细胞基质细胞比例对肿瘤微环境的影响，并基于这些细胞相关基因表达的多样性对HCC进行了分类 | 首次详细探讨了非白细胞基质部分对肝细胞癌肿瘤微环境的影响，并基于此进行了HCC的分类 | NA | 研究肿瘤微环境中非白细胞基质细胞对肝细胞癌发展的影响，并探索基于此的个性化治疗策略 | 肝细胞癌及其肿瘤微环境中的非白细胞基质细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | 支持向量机（SVM） | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO的数据集，具体样本数量未在摘要中明确 |
| 124 | 2024-08-09 |
Developmental excitation-inhibition imbalance underlying psychoses revealed by single-cell analyses of discordant twins-derived cerebral organoids
2020-11, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-020-0844-z
PMID:32764691
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了来自精神分裂症和双相情感障碍患者的脑类器官，揭示了兴奋性和抑制性神经元失衡在精神疾病中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术分析来自精神疾病患者的脑类器官，揭示了神经元类型特异性的病理生理机制 | 研究仅限于少数病例，且依赖于脑类器官模型，可能与真实人脑存在差异 | 探究精神分裂症和双相情感障碍的细胞机制 | 精神分裂症和双相情感障碍患者的脑类器官 | NA | 精神分裂症, 双相情感障碍 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞 | 来自三对同卵双胞胎的脑类器官 |
| 125 | 2024-08-09 |
Spelunking in Sputum: Single-Cell RNA Sequencing Sheds New Insights into Cystic Fibrosis
2020-11-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202006-2456ED
PMID:32721178
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveals regulators underlying immune cell diversity and immune subtypes associated with prognosis in nasopharyngeal carcinoma
2020-11, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-020-0374-x
PMID:32686767
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，揭示了鼻咽癌肿瘤微环境中免疫细胞多样性及其与预后相关的亚型 | 首次在鼻咽癌中识别出新的免疫细胞亚型，如CLEC9A树突状细胞，并揭示了调控免疫细胞多样性的转录因子 | 研究样本仅包括十五个原发性鼻咽癌肿瘤和一个正常样本，可能影响结果的普遍性 | 深入理解鼻咽癌肿瘤微环境的复杂性，并探索潜在的治疗靶点和预后标志物 | 鼻咽癌肿瘤微环境中的恶性细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 7581个恶性细胞和40,285个免疫细胞来自十五个原发性鼻咽癌肿瘤和一个正常样本 |
| 127 | 2024-08-09 |
Cellular heterogeneity landscape in laryngeal squamous cell carcinoma
2020-11-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.33192
PMID:32638385
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组化染色技术，分析了喉鳞状细胞癌（LSCC）组织的细胞组成和分子特征，并探讨了细胞异质性与患者预后的关系 | 首次描绘了LSCC肿瘤内异质性的全景图 | NA | 旨在通过理解LSCC的细胞异质性来改善治疗效果 | 喉鳞状细胞癌（LSCC）组织 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | LSCC组织细胞被细分为多个集群，包括肿瘤细胞、免疫细胞、上皮细胞、成纤维细胞和内皮细胞 |
| 128 | 2024-08-09 |
Runx2 Regulates Mouse Tooth Root Development Via Activation of WNT Inhibitor NOTUM
2020-11, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4120
PMID:32569388
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研究论文 | 本研究揭示了Runx2在牙齿根部发育中的作用及其通过激活WNT抑制因子NOTUM调控根部祖细胞分化的机制 | 首次阐明了Runx2在牙齿根部发育中的功能，并揭示了其在调控根部祖细胞分化中的具体作用机制 | NA | 探究Runx2在牙齿根部发育中的作用及其调控机制 | 小鼠牙齿根部发育及Runx2在其中的作用 | NA | NA | bulk和单细胞RNA测序分析 | NA | RNA | NA |
| 129 | 2024-08-09 |
Single-cell genomics and spatial transcriptomics: Discovery of novel cell states and cellular interactions in liver physiology and disease biology
2020-11, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2020.06.004
PMID:32534107
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学和空间转录组学在肝脏生理和疾病生物学中的应用，强调了这些方法在揭示新的细胞状态和细胞间相互作用方面的最新发现和见解。 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学技术使得能够在单细胞或空间层面研究转录活性，揭示了正常和疾病肝脏中先前未知的细胞类型和亚型，并通过添加空间信息，深化了对组织功能组织和细胞间相互作用的理解。 | NA | 探讨单细胞RNA测序和空间转录组学在肝脏生理和疾病生物学中的应用，以及这些技术如何帮助发现新的细胞状态和细胞间相互作用。 | 肝脏生理和疾病生物学中的细胞类型、亚型及其相互作用。 | 基因组学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 130 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic architecture and intercellular crosstalk of human intrahepatic cholangiocarcinoma
2020-11, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2020.05.039
PMID:32505533
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了8个人类肝内胆管癌（ICC）及其邻近样本的细胞，揭示了ICC的转录组全景和细胞间通信网络。 | 研究首次详细描述了人类ICC的单细胞转录组结构和细胞间对话，特别是发现了肿瘤相关成纤维细胞（vCAFs）与ICC细胞之间的相互作用。 | 研究主要集中在细胞水平的分析，未来研究可能需要进一步的功能性实验来验证这些发现的生物学意义。 | 阐明驱动肝内胆管癌进展的机制，并开发治疗策略。 | 人类肝内胆管癌及其邻近组织的细胞。 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 56,871个单细胞 |
| 131 | 2024-08-09 |
Heterogeneity and chimerism of endothelial cells revealed by single-cell transcriptome in orthotopic liver tumors
2020-11, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-020-09727-9
PMID:32440964
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了原位肝肿瘤中内皮细胞的异质性和嵌合现象 | 首次详细描述了肝肿瘤内皮细胞的基因表达特征，并发现宿主器官而非肿瘤起源是内皮细胞表型的主要决定因素 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究肝肿瘤中肝间质细胞的变化及其对肿瘤内皮细胞的影响 | 肝肿瘤中的内皮细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型的肝肿瘤及邻近正常组织中的内皮细胞 |
| 132 | 2024-08-09 |
Systematic analysis of ACE2 and TMPRSS2 expression in salivary glands reveals underlying transmission mechanism caused by SARS-CoV-2
2020-11, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.26045
PMID:32441816
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研究论文 | 本研究通过公开数据库分析了唾液腺中ACE2和TMPRSS2的表达，探讨了SARS-CoV-2可能通过唾液腺传播的机制 | 首次系统分析了唾液腺中ACE2和TMPRSS2的表达，并推测SARS-CoV-2可能通过唾液腺进入人体 | 研究未涉及SARS-CoV-2在唾液腺中的具体感染过程和机制 | 评估唾液腺中ACE2/TMPRSS2的表达，探讨SARS-CoV-2的传播机制 | 唾液腺中的ACE2和TMPRSS2表达 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括小鼠的下颌下唾液腺和腮腺样本 |
| 133 | 2024-08-09 |
Defective Sec61α1 underlies a novel cause of autosomal dominant severe congenital neutropenia
2020-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.03.034
PMID:32325141
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研究论文 | 本文探讨了SEC61A1基因突变导致常染色体显性遗传性严重先天性中性粒细胞减少症的新机制 | 首次报道SEC61A1基因突变与常染色体显性遗传性严重先天性中性粒细胞减少症的关联 | NA | 扩展SEC61A1介导的疾病谱，包括常染色体显性遗传性严重先天性中性粒细胞减少症 | SEC61A1基因突变及其对中性粒细胞成熟的影响 | NA | 严重先天性中性粒细胞减少症 | 全外显子测序、Western blot、Ca2+通量测定、CD34+细胞体外分化、定量PCR、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质、RNA | 一个患有严重先天性中性粒细胞减少症的患者及其非近亲比利时父母 |
| 134 | 2024-08-09 |
Long noncoding RNA 2193 regulates meiosis through global epigenetic modification and cytoskeleton organization in pig oocytes
2020-11, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.29675
PMID:32239703
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序在猪卵母细胞中鉴定了一种新的长非编码RNA（lncRNA2193），并探讨了其在卵母细胞减数分裂中的功能 | 首次揭示了lncRNA2193在猪卵母细胞减数分裂中的作用，包括其对全局表观遗传修饰和细胞骨架组织的调控 | 研究主要集中在体外成熟过程中，未涉及体内环境下的影响 | 探讨长非编码RNA在哺乳动物生殖细胞中的生物学功能 | 猪卵母细胞中的lncRNA2193及其在减数分裂中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 猪卵母细胞 |
| 135 | 2024-08-09 |
A Synthesis Concerning Conservation and Divergence of Cell Types across Epithelia
2020-11-02, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a035733
PMID:32122885
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研究论文 | 本文通过比较两种发育相关的鼠类上皮组织——气道上皮和小肠上皮，探讨了细胞类型的共性和特异性及其在组织功能中的作用 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和计算分析方法，揭示了细胞类型在不同组织中的分布、起源和功能，以及细胞更新和分化的动态过程 | NA | 研究细胞类型在不同上皮组织中的保守性和差异性 | 鼠类气道上皮和小肠上皮组织 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及两种鼠类上皮组织 |