单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 135 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals a Crucial Role for CTHRC1 (Collagen Triple Helix Repeat Containing 1) Cardiac Fibroblasts After Myocardial Infarction
2020-11-10, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，揭示了心肌梗死后心脏成纤维细胞中CTHRC1的关键作用 | 首次鉴定并表征了心肌梗死后出现的一种独特的心脏成纤维细胞亚群，并发现CTHRC1是其关键调节因子 | NA | 定义心肌梗死后心脏成纤维细胞的异质性及其在心室重塑过程中的作用机制 | 心脏成纤维细胞及其在心肌梗死后的反应 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括小鼠、猪和心肌梗死及扩张型心肌病患者的心脏组织样本 |
| 102 | 2024-08-09 |
Microanatomy of the Human Atherosclerotic Plaque by Single-Cell Transcriptomics
2020-11-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.316770
PMID:32981416
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和染色质可及性分析，深入探讨了人类动脉粥样硬化斑块的细胞异质性和分子复杂性 | 首次全面评估了人类动脉粥样硬化斑块中细胞的分子复杂性，并揭示了细胞间的相互转换和激活状态 | NA | 深入理解人类动脉粥样硬化的病理生理机制 | 人类颈动脉动脉粥样硬化斑块中的细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 | NA | 转录组数据和表观基因组数据 | 涉及14种不同的细胞群体，包括内皮细胞、平滑肌细胞、肥大细胞、B细胞、骨髓细胞和T细胞等 |
| 103 | 2024-08-09 |
Multilineage murine stem cells generate complex organoids to model distal lung development and disease
2020-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2019103476
PMID:32985719
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研究论文 | 本文建立了一种三维（3D）小鼠细支气管肺泡肺类器官（BALO）模型，该模型允许通过与肺驻留间充质细胞共培养来克隆扩展和自我组织流式细胞术分选的细支气管肺泡干细胞（BASCs）。 | BALO模型能够重建远端肺的表皮-间充质-髓样单位，为研究肺发育、感染和体外再生过程开辟了新的途径。 | NA | 研究肺发育和疾病 | 小鼠细支气管肺泡干细胞（BASCs）和肺驻留间充质细胞 | 数字病理学 | 肺疾病 | 流式细胞术（FACS），单细胞RNA测序 | 3D类器官模型 | 细胞 | NA |
| 104 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals different subsets of non-specific cytotoxic cells in teleost
2020-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2020.09.031
PMID:32971213
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对尼罗罗非鱼头肾来源的白细胞进行分析，揭示了非特异性细胞毒性细胞（NCC）的不同亚群 | 首次揭示了NCC群体中的四个亚群，包括记忆样NCC、成熟NCC、未成熟NCC和前NCC | NA | 阐明硬骨鱼免疫系统中非特异性细胞毒性细胞（NCC）的亚群及其调控网络 | 尼罗罗非鱼头肾来源的白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 约24,062个头肾来源的白细胞 |
| 105 | 2024-08-09 |
Agonist-induced functional analysis and cell sorting associated with single-cell transcriptomics characterizes cell subtypes in normal and pathological brain
2020-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.262717.120
PMID:32973039
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研究论文 | 本文开发了激动剂诱导的功能分析和细胞分选（aiFACS）技术，结合单细胞转录组学，用于分析正常和病理脑组织中的细胞亚型 | aiFACS技术允许实时记录和分选细胞，根据其对刺激的即时和个体反应，结合单细胞转录组学构建基于细胞特定药理反应的功能组织图谱 | NA | 深入了解细胞与其环境之间的动态相互作用 | 正常和病理脑组织中的细胞亚型 | 数字病理学 | NA | aiFACS | NA | 转录组 | 使用分离的小鼠脑组织，以及来自脆弱X综合征模型小鼠脑的中间神经元 |
| 106 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Unveils Unique Transcriptomic Signatures of Organ-Specific Endothelial Cells
2020-11-10, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了特定组织来源的小鼠内皮细胞的转录组特征 | 发现了特定组织内皮细胞的新标记物和可能参与维持其身份的信号通路，并揭示了性别对内皮细胞转录组的显著影响 | NA | 探究内皮细胞特异性的转录组基础 | 特定组织来源的小鼠内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图聚类算法 | 转录组数据 | 来自Tabula Muris联盟生成的小鼠特定组织内皮细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 107 | 2024-08-09 |
Single-Cell Characterization of Malignant Phenotypes and Developmental Trajectories of Adrenal Neuroblastoma
2020-11-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2020.08.014
PMID:32946775
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了16名肾上腺神经母细胞瘤患者的160,910个细胞和早期人类胚胎及胎儿肾上腺中12,103个潜在发育细胞的转录组 | 首次揭示了肾上腺神经母细胞瘤肿瘤细胞的转录特征与去甲肾上腺素能嗜铬细胞相似，并重现了嗜铬细胞在正常发育过程中的增殖/分化状态 | NA | 探究神经母细胞瘤的发育起源及其细胞状态 | 肾上腺神经母细胞瘤及其潜在发育细胞 | 数字病理学 | 儿童常见体腔外实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 16名患者和早期人类胚胎及胎儿肾上腺中的细胞，共计173,013个细胞 |
| 108 | 2024-08-09 |
Multi-layered Spatial Transcriptomics Identify Secretory Factors Promoting Human Hematopoietic Stem Cell Development
2020-11-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.08.004
PMID:32946788
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研究论文 | 本文通过结合空间转录组学分析和基因表达谱分析，研究了人类造血干细胞发育过程中的分泌因子 | 首次揭示了内皮素1作为人类造血干细胞发育的重要分泌调节因子 | NA | 识别促进人类造血干细胞发育的分泌因子 | 人类造血干细胞的发育机制 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及胚胎主动脉的多个细胞群和单细胞 |
| 109 | 2024-08-09 |
Generation of a p16 Reporter Mouse and Its Use to Characterize and Target p16high Cells In Vivo
2020-11-03, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.09.006
PMID:32949498
|
研究论文 | 本文生成了一个p16报告小鼠模型，用于在单细胞水平上分析p16细胞在体内的特征，并发现这些细胞在所有器官中随年龄增长而富集，且无法增殖，半衰期因组织而异。 | 本文创新性地使用p16-Cre-tdTomato小鼠模型，结合单细胞转录组学，揭示了p16细胞在体内的分布和功能，为研究细胞衰老提供了新的工具。 | NA | 研究细胞衰老在年龄相关器官功能障碍中的作用及其在体内的发病机制。 | p16细胞在体内的特征及其在不同器官中的分布和功能。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | p16-Cre-tdTomato小鼠模型 | 单细胞数据 | 涉及多个器官的p16细胞 |
| 110 | 2024-08-09 |
NPC1 silent variant induces skipping of exon 11 (p.V562V) and unfolded protein response was found in a specific Niemann-Pick type C patient
2020-11, Molecular genetics & genomic medicine
IF:1.5Q4
DOI:10.1002/mgg3.1451
PMID:32931663
|
研究论文 | 研究了Niemann-Pick病C型（NPC）患者中NPC1基因的静默变异对蛋白质功能的影响 | 首次证明了NPC1基因的静默多态性（p.V562V）是NPC的致病变异，并发现UPR在特定NPC患者中上调 | NA | 探究NPC1基因变异对NPC病的影响及其分子机制 | Niemann-Pick病C型患者及其NPC1基因变异 | 数字病理学 | 神经内脏疾病 | 下一代测序（NGS）、单细胞RNA测序（MARS-Seq） | NA | 基因组数据 | 两个无关家庭的NPC患者 |
| 111 | 2024-08-09 |
Detection of chemotherapy-resistant patient-derived acute lymphoblastic leukemia clones in murine xenografts using cellular barcodes
2020-11, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2020.09.188
PMID:32946982
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研究论文 | 本研究使用细胞条形码分析方法，追踪化疗介导选择压力下数百个患者来源的急性淋巴细胞白血病克隆的体内竞争动态 | 首次展示了化疗在药物依赖性方式下减少克隆多样性，并发现化疗介导的选择导致白血病克隆在解剖部位的分布更加不对称 | 研究主要集中在化疗对克隆动态的影响，未来需要结合单细胞测序技术进行更深入的分析 | 探索化疗对急性淋巴细胞白血病克隆动态的影响，并寻找预防复发的潜在目标 | 患者来源的急性淋巴细胞白血病细胞及其克隆 | NA | 急性淋巴细胞白血病 | 细胞条形码分析 | NA | 细胞 | 使用Nod/Scid/Il2Rγ (NSG)小鼠移植了条形码标记的患者来源或SupB15急性淋巴细胞白血病细胞，并在九个解剖位置进行纵向评估 |
| 112 | 2024-08-09 |
The Stress-Like Cancer Cell State Is a Consistent Component of Tumorigenesis
2020-11-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.08.018
PMID:32910905
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research paper | 本研究通过结合斑马鱼黑色素瘤模型、空间转录组学和人类样本，验证了肿瘤发生过程中存在一种应激样癌细胞状态 | 首次通过多种模型和方法验证了应激样癌细胞状态的存在，并发现其在肿瘤发生早期即已出现，且具有更高的肿瘤种植能力和药物抗性 | 研究主要集中在应激样癌细胞状态的验证和特性分析，未深入探讨其具体机制和治疗应用 | 验证肿瘤发生过程中应激样癌细胞状态的存在及其特性 | 应激样癌细胞状态及其在肿瘤发生中的作用 | digital pathology | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括斑马鱼模型和人类样本 |
| 113 | 2024-08-09 |
Spectacle: An interactive resource for ocular single-cell RNA sequencing data analysis
2020-11, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2020.108204
PMID:32910939
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研究论文 | 本文介绍了Spectacle，一个用于探索眼部单细胞RNA测序数据的交互式网络资源 | 开发了Spectacle系统，降低了非计算背景用户与丰富单细胞RNA测序研究交互的生物信息学门槛 | 分享单细胞RNA测序结果仍然是一个主要障碍，特别是对于没有计算背景的个人 | 解决分享单细胞RNA测序结果的难题，特别是为没有计算背景的用户提供便利 | 眼部单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Shiny框架 | 单细胞表达数据 | 五个预处理的眼部单细胞RNA测序数据集 |
| 114 | 2024-08-09 |
Duodenal chemosensory system: enterocytes, enteroendocrine cells, and tuft cells
2020-11, Current opinion in gastroenterology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/MOG.0000000000000685
PMID:32925177
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综述 | 本文综述了胃十二指肠上皮中由肠上皮细胞、肠内分泌细胞和绒毛细胞组成的腔内化学感应系统的最新进展，特别强调了化学感应如何影响黏膜保护反应和代谢综合征。 | 最近基于单细胞RNA测序的研究提供了详细的化学感应受体和其他生物活性分子的细胞类型特异性表达及细胞谱系信息，揭示了腔内化学感应不仅对肠道功能的局部或远程调节至关重要，还参与了代谢、能量平衡和食物摄入的系统性调节。 | NA | 总结腔内化学感应系统的最新理解，并探讨其在黏膜损伤、代谢障碍和异常内脏感觉治疗中的潜在分子靶点。 | 胃十二指肠上皮中的肠上皮细胞、肠内分泌细胞和绒毛细胞。 | NA | 代谢障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 细胞类型特异性 |
| 115 | 2024-08-09 |
Reading the heart at single-cell resolution
2020-11, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2020.08.010
PMID:32871159
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研究论文 | 本文重点介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在心脏研究中的应用，特别是心肌细胞的样本和数据处理步骤 | 单细胞转录组学领域的快速发展提高了我们对器官系统在空前分辨率下的研究能力 | 尽管通用的scRNA-seq流程协议已经建立，但心脏研究仍需要定制的样本准备、质量控制和数据解释 | 探讨scRNA-seq在心脏研究中的应用，提高数据质量 | 心肌细胞的样本和数据处理 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 116 | 2024-08-09 |
Monocyte recruitment and fate specification after myocardial infarction
2020-11-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00330.2020
PMID:32877204
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综述 | 本文综述了单核细胞在心肌梗死后炎症反应中的关键作用及其招募和命运调控的最新研究进展 | 利用单细胞转录组学和质谱流式细胞术识别了具有功能相关性的较小、转录上不同的簇，并探讨了单核细胞在缺血损伤后的时空动态及其与其他免疫细胞的相互作用 | NA | 旨在探讨单核细胞在心肌梗死后的功能异质性、招募和命运调控机制，以及针对单核细胞治疗缺血性心脏病的潜在疗法 | 单核细胞在心肌梗死后的功能和动态变化 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学, 质谱流式细胞术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 117 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies extensive heterogeneity in the cellular composition of mouse Achilles tendons
2020-11-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00372.2020
PMID:32877217
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠跟腱细胞组成的异质性 | 发现了11种不同类型的细胞，包括三种先前未描述的腱成纤维细胞，并提供了证据支持周细胞可能是成年腱成纤维细胞的前体细胞 | NA | 探索小鼠跟腱细胞组成的异质性及其在组织稳态和疾病中的生物学基础 | 小鼠跟腱细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 118 | 2024-08-09 |
Aging impairs alveolar epithelial type II cell function in acute lung injury
2020-11-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00093.2020
PMID:32877222
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研究论文 | 研究探讨了年龄对急性肺损伤中肺泡上皮II型细胞功能的影响 | 首次揭示了老年小鼠在急性肺损伤中肺泡上皮II型细胞的衰老迹象和功能障碍 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨年龄增长对急性肺损伤中肺泡上皮II型细胞功能的影响 | 肺泡上皮II型细胞在不同年龄小鼠中的功能 | NA | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 年轻（3个月）和老年（18个月）小鼠 |
| 119 | 2024-08-09 |
Epigenetic pathways and plasticity in brain tumors
2020-11, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2020.105060
PMID:32877743
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研究论文 | 本文总结了在三种主要脑肿瘤（胶质母细胞瘤、髓母细胞瘤和弥漫性内在脑桥胶质瘤）中活跃的表观遗传途径，并比较了这些肿瘤的单细胞RNA测序分析，以识别治疗这些肿瘤起源细胞的共同表观遗传途径。 | 探讨了通过靶向表观遗传途径与标准治疗方案结合来对抗脑肿瘤细胞的可塑性，并讨论了使用多组学方法治疗这些和其他脑肿瘤的可能组合疗法。 | 本文的焦点集中在三种肿瘤类型上，并未涵盖所有脑肿瘤，可能存在其他脑肿瘤具有类似的机制。 | 研究脑肿瘤的表观遗传途径和细胞可塑性，以开发更有效的治疗方法。 | 胶质母细胞瘤、髓母细胞瘤和弥漫性内在脑桥胶质瘤。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及三种主要脑肿瘤类型 |
| 120 | 2024-08-09 |
Got your mother in a whirl: The role of maternal T cells and myeloid cells in pregnancy
2020-11, HLA
IF:5.9Q1
DOI:10.1111/tan.14055
PMID:32841539
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综述 | 本文综述了母体T细胞和髓系细胞（巨噬细胞、树突状细胞）在妊娠中的作用及其与滋养层细胞的相互作用 | 讨论了单细胞测序实验在研究母体免疫细胞异质性和预测细胞间相互作用中的应用，以及长期培养初级滋养层细胞的新方法 | 需要在未来研究中解决这些细胞类型及其途径的未决问题 | 探讨母体免疫细胞在健康和复杂妊娠中的功能及其与滋养层细胞的相互作用 | 母体T细胞、髓系细胞（巨噬细胞、树突状细胞）和滋养层细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |