单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 135 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-09 |
Mitochondria Define Intestinal Stem Cell Differentiation Downstream of a FOXO/Notch Axis
2020-11-03, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.10.005
PMID:33147486
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研究论文 | 本文研究了线粒体在FOXO/Notch信号通路下游对肠道干细胞分化的影响 | 揭示了FOXO转录因子和Notch信号在调控线粒体分裂及干细胞向杯状细胞和潘氏细胞分化中的新作用 | NA | 探讨线粒体在肠道干细胞分化中的作用及其与FOXO和Notch信号的相互关系 | 肠道干细胞及其分化过程 | NA | NA | scRNA-seq | NA | RNA | 小鼠肠道组织 |
| 82 | 2024-08-09 |
A network medicine approach to investigation and population-based validation of disease manifestations and drug repurposing for COVID-19
2020-11, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3000970
PMID:33156843
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研究论文 | 本研究采用网络医学方法，结合临床和多组学观察，旨在识别SARS-CoV-2的发病机制、疾病表现及COVID-19的治疗方法 | 研究揭示了COVID-19与炎症性肠病和哮喘之间的共同病理生物学，并发现褪黑素可能作为预防和治疗COVID-19的潜在药物 | 研究主要基于观察性研究和网络预测，需要进一步的临床试验验证 | 识别SARS-CoV-2的发病机制、疾病表现及COVID-19的治疗方法 | SARS-CoV-2的发病机制、疾病表现及COVID-19的治疗方法 | 网络医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、代谢组学、转录组学 | 网络模型 | 蛋白质相互作用、转录组、蛋白质组 | 26,779名个体 |
| 83 | 2024-08-09 |
Functional module detection through integration of single-cell RNA sequencing data with protein-protein interaction networks
2020-Nov-02, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07144-2
PMID:33138772
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为SCPPIN的方法，该方法通过整合单细胞RNA测序数据与蛋白质-蛋白质相互作用网络，来检测不同转录状态细胞中的活性模块 | SCPPIN方法能够识别出不仅限于差异表达基因的生物学信息，揭示了标准差异表达基因分析之外的生物学功能 | NA | 开发一种方法，通过整合单细胞RNA测序数据与蛋白质相互作用数据，系统分析差异表达基因 | 人类肝脏球体和人类脂肪组织的RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 两个RNA测序数据集 |
| 84 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis of copy-number alterations in serous ovarian cancer reveals substantial heterogeneity in both low- and high-grade tumors
2020-11, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2020.1836439
PMID:33121339
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了浆液性卵巢癌中的拷贝数变异，揭示了高低级别肿瘤中均存在显著的细胞间异质性 | 利用单细胞测序技术首次在单细胞水平上分析了浆液性卵巢癌的臂级非整倍体 | NA | 研究浆液性卵巢癌中单细胞水平的拷贝数变异 | 浆液性卵巢癌细胞的拷贝数变异 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 85 | 2024-08-09 |
Pan-cancer single-cell RNA-seq identifies recurring programs of cellular heterogeneity
2020-11, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-020-00726-6
PMID:33128048
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研究论文 | 本研究利用多重单细胞RNA测序技术，分析了来自22种癌症类型的198个癌细胞系，识别出在多个癌细胞系中反复出现的12种表达程序，这些程序与多种生物过程相关 | 首次通过大规模单细胞RNA测序揭示了癌细胞系中的异质性模式，并发现这些模式与人类肿瘤中的异质性相似 | NA | 探索癌细胞系中的异质性及其与肿瘤中异质性的关系 | 来自22种癌症类型的198个癌细胞系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 198个癌细胞系 |
| 86 | 2024-08-09 |
Age-related loss of gene-to-gene transcriptional coordination among single cells
2020-11, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-020-00304-4
PMID:33139959
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法来分析单细胞RNA测序数据中的转录调控，重点关注基因间的全局协调而非单个基因的变异性或基因对之间的相关性 | 本文创新地关注了衰老细胞中基因间转录协调的减少，并发现这种损失与特定的年龄相关突变负荷和辐射诱导的DNA损伤有关 | NA | 研究衰老过程中转录调控的随机异常现象 | 衰老细胞中的基因间转录协调 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种不同生物和细胞类型 |
| 87 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals that CD9 Is a Negative Marker of Glucose-Responsive Pancreatic β-like Cells Derived from Human Pluripotent Stem Cells
2020-11-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.09.009
PMID:33096048
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，发现CD9是人类多能干细胞衍生的葡萄糖反应性胰腺β样细胞的负标记物 | 首次确定CD9作为人类多能干细胞衍生的葡萄糖反应性胰腺β样细胞的负标记物 | NA | 寻找并验证人类多能干细胞衍生的葡萄糖反应性胰腺β样细胞的特定细胞表面标记物 | 人类多能干细胞衍生的葡萄糖反应性胰腺β样细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 88 | 2024-08-09 |
Visualizing HIF-1α mRNA in a Subpopulation of Bone Marrow-Derived Cells to Predict Retinal Neovascularization
2020-11-20, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.0c00662
PMID:33080135
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研究论文 | 本文描述了一种新的混合纳米颗粒的合成，用于在小鼠新生血管化模型中选择性地可视化微胶质细胞/巨噬细胞中的HIF-1α mRNA | 开发了一种新的混合纳米颗粒，能够选择性地在特定组织微胶质细胞/巨噬细胞中可视化HIF-1α mRNA，用于预测新生血管化的发生和进展 | NA | 研究微胶质细胞/巨噬细胞在新生血管化中的调控作用，并开发一种新的方法来预测新生血管化的发生和进展 | 微胶质细胞/巨噬细胞中的HIF-1α mRNA表达 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 89 | 2024-08-09 |
Leveraging Uncertainty in Machine Learning Accelerates Biological Discovery and Design
2020-11-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.09.007
PMID:33065027
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研究论文 | 本文展示了利用基于高斯过程的不确定性预测在生物发现中的广泛应用 | 通过量化预测不确定性，算法能够更好地处理超出训练数据分布的新现象 | NA | 加速生物发现和设计 | 化合物库中的化合物及其对不同激酶和结核分枝杆菌细胞生长的抑制作用 | 机器学习 | NA | 高斯过程 | NA | 化合物 | 72个化合物用于训练模型，10,833个化合物用于预测 |
| 90 | 2024-08-09 |
Cell-type-specific 3D epigenomes in the developing human cortex
2020-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2825-4
PMID:33057195
|
研究论文 | 研究了人类皮质发育过程中特定细胞类型的三维表观基因组特征 | 开发了CRISPRview技术，整合免疫染色、CRISPR干扰、RNAscope和图像分析，验证了细胞类型特异性的顺式调控元件 | NA | 揭示发育中人类皮质中细胞类型特异性的基因表达模式，并增进对基因调控和谱系特化的理解 | 放射状胶质细胞、中间前体细胞、兴奋性神经元和抑制性神经元 | 表观遗传学 | NA | CRISPR干扰、RNAscope、图像分析 | NA | 基因组数据 | 来自中孕期人类皮质样本的多种细胞类型 |
| 91 | 2024-08-09 |
PREIMPLANTATION GENETIC TESTING: Single-cell technologies at the forefront of PGT and embryo research
2020-11, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-20-0102
PMID:33065545
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研究论文 | 本文探讨了单细胞技术在胚胎植入前遗传测试（PGT）和胚胎研究中的应用 | 介绍了高吞吐量技术如DNA微阵列和大规模并行测序的发展，使得单细胞基因组研究从评估少数位点扩展到全面筛查所有24条染色体 | NA | 研究单细胞技术在胚胎发育和遗传疾病检测中的应用 | 胚胎的染色体镶嵌现象及其对胚胎发育的影响 | 遗传学 | 遗传性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 92 | 2024-08-09 |
Publisher Correction: A single-cell transcriptome atlas of marsupial embryogenesis and X inactivation
2020-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2840-5
PMID:33067604
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics uncover distinct innate and adaptive cell subsets during tissue homeostasis and regeneration
2020-11, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.6MR0720-131R
PMID:33070367
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在揭示组织稳态和再生过程中不同免疫细胞亚群中的应用 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）提供了一种前所未有的方法，无需依赖先验的细胞特异性标记即可揭示细胞多样性 | NA | 探讨scRNA-Seq如何促进免疫细胞的表征，包括巨噬细胞、固有淋巴细胞和T、B淋巴细胞，以及发现免疫细胞异质性、识别新亚群和追踪不同免疫细胞在组织稳态、修复和再生中的发育轨迹 | 免疫细胞在组织修复和再生中的作用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 94 | 2024-08-09 |
Microglia-organized scar-free spinal cord repair in neonatal mice
2020-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2795-6
PMID:33029008
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研究论文 | 本文研究了新生小鼠脊髓损伤后的无瘢痕修复过程，并探讨了小胶质细胞在此过程中的关键作用 | 首次揭示了新生小鼠脊髓损伤后无瘢痕修复的细胞和分子机制，并提出了促进成年哺乳动物神经系统无瘢痕愈合的策略 | NA | 探讨新生小鼠脊髓损伤后的无瘢痕修复机制及小胶质细胞的作用 | 新生小鼠的脊髓损伤及小胶质细胞的功能 | NA | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 新生小鼠及成年小鼠的脊髓组织 |
| 95 | 2024-08-09 |
Jointly defining cell types from multiple single-cell datasets using LIGER
2020-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-020-0391-8
PMID:33046898
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研究论文 | 本文提供了一个使用LIGER方法联合定义多个单细胞数据集中的细胞类型的详细协议 | 开发了LIGER方法，通过整合非负矩阵分解技术，解决了从多种协议、生物背景和数据模式中整合单细胞数据集的关键挑战 | NA | 实现通过基因表达和表观基因组状态无偏见地定义细胞类型 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核ATAC测序（snATAC-seq）数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 取决于数据集大小 |
| 96 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Diversity of the Immunological Landscape following Central Nervous System Infection by a Murine Coronavirus
2020-11-23, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/JVI.01295-20
PMID:32999036
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠冠状病毒JHMV感染中枢神经系统后免疫细胞的异质性 | 揭示了感染不同阶段免疫细胞的独特分子特征和参与有效抗病毒宿主防御的途径，并识别了可能参与脱髓鞘和再髓鞘化的基因 | NA | 旨在更好地理解JHMV感染中枢神经系统后先天和适应性免疫反应以及慢性脱髓鞘阶段的分子途径 | 小鼠中枢神经系统感染JHMV后的免疫细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从实验小鼠的大脑和脊髓中富集的CD45阳性细胞 |
| 97 | 2024-08-09 |
Affinity-Restricted Memory B Cells Dominate Recall Responses to Heterologous Flaviviruses
2020-11-17, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.09.001
PMID:33010224
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研究论文 | 研究探讨了记忆B细胞（MBCs）在应对异源黄病毒时的回忆反应机制，发现这些反应主要受限于预先存在的克隆多样性，而非通过次级生发中心（GCs）进行新的特异性塑造。 | 通过条件性删除激活诱导的胞苷脱氨酶（AID），研究了异源黄病毒挑战后的回忆反应，发现这些反应主要受限于预先存在的克隆多样性，而非通过次级生发中心进行新的特异性塑造。 | 研究主要集中在记忆B细胞的回忆反应机制，未涉及其他免疫细胞类型或更广泛的免疫反应。 | 区分黄病毒感染和免疫接种中记忆B细胞对异源抗原的反应机制。 | 记忆B细胞（MBCs）对异源黄病毒的回忆反应机制。 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，条件性基因删除 | NA | RNA | 涉及多种黄病毒（西尼罗河病毒、日本脑炎病毒、寨卡病毒和登革病毒）的挑战。 |
| 98 | 2024-08-09 |
Application of Single-Cell Sequencing to Immunotherapy
2020-Nov, The Urologic clinics of North America
DOI:10.1016/j.ucl.2020.07.005
PMID:33008498
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综述 | 本文通过单细胞视角探讨癌症免疫疗法，并讨论推动该领域发展的最先进技术 | 利用单细胞分析提高分辨率，有望发现并表征先前未被充分认识的细胞群，有助于理解癌症进展和治疗 | NA | 探讨单细胞分析在理解和开发针对泌尿系统和前列腺癌的免疫治疗策略中的潜力 | 泌尿系统和前列腺癌 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 99 | 2024-08-09 |
Single-Cell Genomics Reveals a Novel Cell State During Smooth Muscle Cell Phenotypic Switching and Potential Therapeutic Targets for Atherosclerosis in Mouse and Human
2020-11-24, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文通过结合平滑肌细胞（SMC）命运图谱和单细胞RNA测序技术，揭示了SMC在动脉粥样硬化中的转分化轨迹，并识别了潜在的治疗靶点。 | 发现了SMC在动脉粥样硬化中转变为一种新的中间细胞状态，并确定了视黄酸信号通路作为调控SMC向SEM细胞转变的关键因素。 | NA | 揭示SMC在动脉粥样硬化中的转分化轨迹，并识别分子治疗靶点。 | 小鼠和人类动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞（SMC）。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 小鼠和人类动脉粥样硬化斑块样本 |
| 100 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome profiling reveals the mechanism of abnormal proliferation of epithelial cells in congenital cystic adenomatoid malformation
2020-11-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2020.112299
PMID:32979365
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了先天性囊性腺瘤样畸形中上皮细胞异常增殖的机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了先天性囊性腺瘤样畸形的细胞景观，并揭示了与该疾病相关的细胞和分子事件 | 研究样本仅来自一名4.25岁的患者，可能存在样本量不足的问题 | 探索先天性囊性腺瘤样畸形的发病机制 | 先天性囊性腺瘤样畸形患者的病变和非病变区域细胞 | 数字病理学 | 先天性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共获取19,904个细胞 |