单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 135 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-07 |
Gene selection for optimal prediction of cell position in tissues from single-cell transcriptomics data
2020-11, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202000867
PMID:32972997
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研究论文 | 本文通过DREAM单细胞转录组学挑战赛，研究了从单细胞转录组数据中选择基因以预测细胞在组织中的位置的方法 | 首次对单细胞转录组数据与空间信息基因映射的方法进行了基准测试，并展示了这些方法在不同数据集上的通用性 | NA | 旨在填补单细胞转录组数据空间重建方法的基准测试空白 | 研究如何从单细胞转录组数据中选择基因以准确重建细胞在组织中的空间排列 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 34个参赛团队，使用斑马鱼胚胎数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-08-07 |
Integrating single-cell RNA-seq and imaging with SCOPE-seq2
2020-11-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-76599-w
PMID:33173156
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研究论文 | 本文介绍了一种升级版的单细胞光学表型和表达分析技术（SCOPE-seq2），用于结合单细胞成像和表达谱分析 | SCOPE-seq2在通量、分子捕获效率、链接准确性和与标准显微镜设备的兼容性方面有显著改进，引入了改进的光学可解码mRNA捕获珠和更可扩展、简化的光学解码过程 | NA | 旨在提高单细胞成像和RNA测序技术的结合效率和应用范围 | 人类胶质母细胞瘤（GBM）手术样本中的单个原代细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像和文本 | 单个原代细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-07 |
Targeted Single-Cell RNA and DNA Sequencing With Fluorescence-Activated Droplet Merger
2020-11-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c03059
PMID:33049138
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研究论文 | 本文介绍了一种利用荧光激活液滴合并技术进行靶向单细胞RNA和DNA测序的新方法 | 该方法通过选择性地合并细胞与试剂，实现酶促反应，无需物理隔离细胞，简化了单细胞工作流程 | NA | 旨在解决在分析异质性细胞群时，稀有细胞类型数据代表性不足的问题 | 特定细胞亚群的单细胞转录组和基因组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和DNA测序 | NA | RNA和DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-07 |
Single cell characterization of B-lymphoid differentiation and leukemic cell states during chemotherapy in ETV6-RUNX1-positive pediatric leukemia identifies drug-targetable transcription factor activities
2020-11-20, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-020-00799-2
PMID:33218352
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了ETV6-RUNX1阳性儿童白血病中B淋巴细胞分化和白血病细胞状态在化疗期间的变化，并确定了可作为药物靶点的转录因子活性。 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术揭示了ETV6-RUNX1阳性白血病中B淋巴细胞分化路径上的转录因子活性，并发现了与化疗耐药性相关的细胞周期状态和分化相关调控网络的变化。 | NA | 研究ETV6-RUNX1阳性儿童白血病中B淋巴细胞分化和白血病细胞状态在化疗期间的变化，并确定可作为药物靶点的转录因子活性。 | ETV6-RUNX1阳性儿童白血病中的B淋巴细胞分化和白血病细胞状态。 | 数字病理学 | 儿童白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-09 |
Evolving insights: how DNA repair pathways impact cancer evolution
2020-11-15, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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综述 | 本文综述了DNA修复途径如何影响癌症进化的最新发现 | 利用单细胞测序等新技术深入理解癌症进化及其与DNA修复的关系 | NA | 探讨DNA修复对癌症进化的影响及其在临床治疗中的应用 | 癌症进化及其与DNA修复的关系 | NA | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-09 |
Alternative Polyadenylation: a new frontier in post transcriptional regulation
2020-Nov-25, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-020-00249-6
PMID:33292571
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综述 | 本文综述了选择性多聚腺苷酸化（APA）这一重要的转录后调控机制，及其在RNA加工、细胞功能和疾病调控中的作用 | 介绍了现代高通量技术如下一代测序（NGS）和单细胞测序技术在APA研究中的应用 | APA的许多生物学过程仍未知，需要进一步研究 | 综述APA的当前知识及其调控机制，并探讨APA研究的未来方向 | 选择性多聚腺苷酸化及其调控因子 | NA | NA | 下一代测序（NGS） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-09 |
Osteopontin Links Myeloid Activation and Disease Progression in Systemic Sclerosis
2020-11-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2020.100140
PMID:33294861
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研究论文 | 本文探讨了骨桥蛋白（OPN）在系统性硬化症（SSc）患者中与髓系细胞激活和疾病进展的关系 | 首次证明了免疫复合物（ICs）通过激活人单核细胞并促进肺成纤维细胞迁移，部分通过OPN分泌，以及OPN与单核细胞集落刺激因子和白细胞介素-6的相互作用 | NA | 揭示系统性硬化症中肺纤维化的潜在机制 | 系统性硬化症患者的肺纤维化 | NA | 系统性硬化症 | bulk和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 系统性硬化症患者的肺组织和血清样本 | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-09 |
muscat detects subpopulation-specific state transitions from multi-sample multi-condition single-cell transcriptomics data
2020-11-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19894-4
PMID:33257685
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研究论文 | 本文探讨了在多样本多条件单细胞转录组数据中检测亚群特异性状态转换的方法 | 开发了一种灵活的模拟方法来评估跨条件差异状态分析的方法性能，并提供了muscat R包中的多条件分析工具 | NA | 评估和比较不同统计框架在跨条件差异状态分析中的表现 | 单细胞RNA测序数据中的亚群特异性响应 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 混合模型 | 转录组数据 | 涉及小鼠皮质细胞的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-09 |
Atherosclerosis in Different Vascular Locations Unbiasedly Approached with Mouse Genetics
2020-11-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes11121427
PMID:33260687
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研究论文 | 本文探讨了不同血管位置的动脉粥样硬化与遗传因素之间的关系，并利用小鼠模型进行无偏倚的遗传学研究 | 通过全基因组关联研究揭示了人类颈动脉斑块和冠状动脉疾病相关的遗传位点不重叠，表明不同位置可能涉及不同的遗传途径。此外，单细胞转录组分析揭示了一小群对炎症刺激“超响应”的血管平滑肌细胞 | 物种差异限制了小鼠模型的直接应用 | 研究不同血管位置动脉粥样硬化的遗传机制 | 不同血管位置的动脉粥样硬化及其遗传影响因素 | NA | 心血管疾病 | 全基因组关联研究、单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-09 |
An allosteric interleukin-1 receptor modulator mitigates inflammation and photoreceptor toxicity in a model of retinal degeneration
2020-Nov-27, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-020-02032-8
PMID:33246504
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研究论文 | 本文研究了一种变构白细胞介素-1受体调节剂在视网膜退化模型中减轻炎症和光感受器毒性的作用 | 首次验证了变构白细胞介素-1受体调节剂rytvela在抑制有害炎症反应和保护光感受器密度及功能方面的有效性 | NA | 验证白细胞介素-1β在神经视网膜退化中的重要性，并评估变构白细胞介素-1受体调节剂rytvela的疗效 | 小鼠视网膜在蓝光诱导下的退化 | NA | 视网膜退化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠样本，具体数量未详述 | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-09 |
Single cell profiling of capillary blood enables out of clinic human immunity studies
2020-11-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-77073-3
PMID:33239690
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研究论文 | 本文开发了一种利用多重单细胞测序和非临床毛细血管血液提取的平台，以简化、低成本地对人类免疫系统进行单细胞分辨率的跨时间和人群的分析 | 本文创新地利用了多重单细胞测序技术，结合非临床毛细血管血液提取，实现了对人类免疫系统的单细胞分辨率分析 | NA | 研究目的是更好地理解基因表达在不同免疫细胞类型中的时间性和个体间变异性 | 研究对象是人类免疫系统中的基因表达变异性 | 数字病理学 | NA | 多重单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多个受试者的毛细血管血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-09 |
Expression profiles revealed potential kidney injury caused by SARS-CoV-2: a systematic analysis of ACE2 and clinical lessons learned from this discovery
2020-11-21, Aging
DOI:10.18632/aging.202224
PMID:33234728
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研究论文 | 本研究通过系统分析ACE2表达和临床数据，揭示了COVID-19可能导致的肾脏损伤 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析，展示了冠状病毒可能直接结合ACE2阳性细胞并损伤肾脏组织 | 研究样本仅限于特定时间段内武汉市某医院的119名COVID-19阳性患者，可能存在地域和时间限制 | 全面理解COVID-19对肾脏损伤的影响 | COVID-19患者的肾脏功能及ACE2在肾脏组织中的分布 | NA | COVID-19 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 119名COVID-19阳性患者 | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-09 |
[Research frontiers in precision therapy for liver cancer]
2020-Nov-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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研究论文 | 本文综述了肝细胞癌（HCC）在精准治疗领域的最新进展，包括新型血清生物标志物的发现与应用、精准肝脏手术技术的改进以及分子靶向治疗和免疫治疗的结合 | 介绍了单细胞测序、基因组编辑和创新药物研发等技术革新对HCC生物学理解的加速作用，以及这些技术带来的新的治疗机会 | 肝细胞癌的高度异质性和治疗抵抗性仍然是未满足的医疗需求，需要更深入的疾病生物学研究和新型疗法 | 探讨肝细胞癌精准治疗的最新研究前沿，以提高患者生存率并寻找新的治疗突破 | 肝细胞癌（HCC）及其精准治疗策略 | NA | 肝癌 | 单细胞测序、基因组编辑 | NA | 血清生物标志物、影像数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-09 |
Single-cell network biology for resolving cellular heterogeneity in human diseases
2020-11, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-020-00528-0
PMID:33244151
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综述 | 本文综述了单细胞网络生物学在解析人类疾病中细胞异质性的应用和进展 | 介绍了利用单细胞转录组数据进行网络生物学研究的新方法，以及其在精准医学中的潜在应用 | NA | 加速对细胞异质性的理解 | 细胞类型特异性的基因网络及其在疾病相关细胞类型和状态中的调控程序 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-09 |
Deconvolution of cellular subsets in human tissue based on targeted DNA methylation analysis at individual CpG sites
2020-11-24, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-020-00910-4
PMID:33234153
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研究论文 | 本研究通过靶向DNA甲基化分析在单个CpG位点上对人类组织中的细胞亚群进行去卷积 | 本研究首次探讨了使用单个细胞类型特异性CpG位点进行靶向分析的可行性，并开发了基于这些位点的去卷积方法 | NA | 验证通过单个CpG位点的DNA甲基化分析来反映细胞混合物和不同组织中细胞组成的可行性 | 人类非恶性细胞类型及其在组织中的相对含量 | 数字病理学 | NA | DNA甲基化分析，pyrosequencing | NA | DNA甲基化数据 | 579个Illumina 450k BeadChip DNA甲基化数据集，涵盖14种不同的非恶性人类细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-09 |
Integrating transcriptomics and bulk time course data into a mathematical framework to describe and predict therapeutic resistance in cancer
2020-11-20, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/abb09c
PMID:33215611
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研究论文 | 本文提出了一种将机器学习模型的静态输出与治疗反应的动态模型相结合的框架，用于整合单细胞转录组数据和纵向的细胞群体数据，以描述和预测癌症治疗抵抗 | 首次明确地将单细胞克隆解析的转录组数据与批量时间序列数据结合，共同校准药物抵抗动力学的数学模型 | NA | 开发一种方法，将分散的数据集整合到全面的框架中，以生成最佳的临床决策 | 乳腺癌细胞 | 生物医学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-09 |
Functional compensation precedes recovery of tissue mass following acute liver injury
2020-11-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19558-3
PMID:33214549
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研究论文 | 本文研究了急性肝损伤后功能补偿在组织恢复前的作用机制 | 首次识别了急性肝损伤后功能补偿的新阶段，并揭示了依赖于巨噬细胞来源的WNT/β-catenin信号的适应性重编程机制 | NA | 探讨急性肝损伤后肝脏如何在组织恢复前维持重要生理功能 | 肝脏在急性损伤后的功能补偿机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两个独立的小鼠肝损伤模型 | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-09 |
Opportunities for Single-Cell Sequencing Technologies and Data Science
2020-Nov-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12113433
PMID:33227959
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研究论文 | 本特刊旨在强调单细胞测序技术和数据分析领域的最新进展 | NA | NA | 强调单细胞测序技术和数据分析领域的最新进展 | 单细胞测序技术和数据分析 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-09 |
Bivalent genes that undergo transcriptional switching identify networks of key regulators of embryonic stem cell differentiation
2020-Nov-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07009-8
PMID:33208095
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研究论文 | 本文开发了一种方法，通过检测单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的'双峰'基因表达模式，捕捉经历转录开关的基因，并结合染色质状态分析，识别出与细胞状态相关的双峰、双价基因模式。 | 本文提出了一种新的方法，通过分析接近活动边界（ON/OFF）的基因，从scRNA-seq数据中推断转录开关网络，这种方法补充了传统的scRNA-seq分析。 | NA | 研究胚胎干细胞分化过程中双价基因的转录开关及其调控网络。 | 胚胎干细胞中的双价基因及其在分化过程中的转录开关。 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 隐马尔可夫模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-09 |
I-Impute: a self-consistent method to impute single cell RNA sequencing data
2020-Nov-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07007-w
PMID:33208097
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研究论文 | 本文提出了一种名为I-Impute的自一致性方法，用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | I-Impute方法通过优化连续相似性和缺失概率，在迭代改进中达到自一致性，从而提高了填补效果 | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据分析中缺失值填补的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括三个湿实验数据集：小鼠膀胱细胞、胚胎干细胞和主动脉白细胞 | NA | NA | NA | NA |