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当前共找到 135 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-07 |
Inference of mutability landscapes of tumors from single cell sequencing data
2020-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008454
PMID:33253159
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MULAN的最大似然计算框架，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤细胞的突变率，从而构建肿瘤的突变景观 | 提出了MULAN框架，利用癌症突变树提供的部分突变事件顺序信息，推断肿瘤的完整进化历史和突变景观 | NA | 开发一种新的计算框架，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤的突变率和进化历史 | 肿瘤细胞的突变率和进化历史 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 最大似然法 | 单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2024-08-07 |
Stem Cell Pluripotency Genes Klf4 and Oct4 Regulate Complex SMC Phenotypic Changes Critical in Late-Stage Atherosclerotic Lesion Pathogenesis
2020-11-24, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀测序等技术，探讨了Klf4和Oct4基因在晚期动脉粥样硬化病变中对平滑肌细胞表型变化的影响。 | 研究发现平滑肌细胞在晚期动脉粥样硬化病变中表现出比普遍认为的更大的表型可塑性，并且Klf4基因调控了多种表型的转变，包括可能对晚期动脉粥样硬化病变有害的Lgals3+成骨细胞。 | NA | 探讨晚期动脉粥样硬化病变中平滑肌细胞的来源、身份和功能，以及它们如何控制斑块稳定性。 | 晚期动脉粥样硬化病变中的平滑肌细胞和内皮细胞。 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | RNA | 人类颈动脉内膜切除术样本和微切割的小鼠晚期动脉粥样硬化病变样本 | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-08-07 |
Research and application of single-cell sequencing in tumor heterogeneity and drug resistance of circulating tumor cells
2020-Nov-10, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-020-00240-1
PMID:33292625
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研究论文 | 本文研究了单细胞测序技术在肿瘤异质性和循环肿瘤细胞药物抗性中的应用 | 利用单细胞测序技术研究循环肿瘤细胞，避免了肿瘤异质性的干扰，为理解肿瘤药物抗性提供了新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在解决肿瘤异质性和药物抗性问题中的应用 | 肿瘤异质性和循环肿瘤细胞的药物抗性 | 数字病理学 | 恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome conservation in a comparative analysis of fresh and cryopreserved human skin tissue: pilot in localized scleroderma
2020-11-09, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-020-02343-4
PMID:33168063
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研究论文 | 本研究评估了使用CryoStor® CS10与RPMI在局部硬皮病患者皮肤组织中细胞组成和细胞特异性基因表达的变异性 | 首次比较了新鲜和冷冻保存的人类皮肤组织在单细胞转录组水平上的保守性 | 研究样本量较小，仅包括3名局部硬皮病患者 | 评估不同保存方法对局部硬皮病患者皮肤组织细胞组成和基因表达的影响 | 局部硬皮病患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3名局部硬皮病患者的皮肤活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-08-07 |
CD63+ Cancer-Associated Fibroblasts Confer Tamoxifen Resistance to Breast Cancer Cells through Exosomal miR-22
2020-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202002518
PMID:33173749
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序描绘了肿瘤微环境的整体景观，并发现了一种新的癌症相关成纤维细胞（CD63 CAFs），这种细胞通过分泌富含miR-22的胞外囊泡促进乳腺癌细胞对他莫昔芬的耐药性 | 首次揭示了CD63 CAFs通过分泌富含miR-22的胞外囊泡诱导乳腺癌细胞对他莫昔芬产生耐药性，并提出了CD63 CAFs作为增强他莫昔芬敏感性的新型治疗靶点 | NA | 旨在从肿瘤微环境的角度更好地理解他莫昔芬耐药性 | 乳腺癌细胞对他莫昔芬的耐药性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics inferred from pathology whole-slide images links tumor heterogeneity to survival in breast and lung cancer
2020-11-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-75708-z
PMID:33139755
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研究论文 | 本文介绍了一种利用数字病理全切片图像进行空间转录组分析的方法，以连接肿瘤异质性与乳腺癌和肺癌的生存率 | 提出了一种新的方法，通过深度学习模型在病理全切片图像上空间解析mRNA和miRNA表达水平，并构建异质性指数(HTI) | 现有分析方法需要大量训练样本和复杂的流程，而我们的模型在样本数量较少的情况下仍显示了良好的性能 | 研究肿瘤异质性及其对生存的影响，以改善癌症的诊断和治疗 | 研究了乳腺癌和肺癌样本中的肿瘤异质性 | 数字病理学 | 乳腺癌，肺癌 | 深度学习 | 深度学习模型 | 图像 | 使用了来自两个癌症队列的少量训练样本 | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-05 |
Semiochemical responsive olfactory sensory neurons are sexually dimorphic and plastic
2020-11-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.54501
PMID:33231170
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研究论文 | 本研究探讨了基因和经验如何共同作用生成表型变异性，特别是在小鼠的主要嗅觉上皮中 | 识别出了一群性别特异性的嗅觉感知神经元，并发现其在不同性别小鼠中的表现出性别差异，同时揭示了活动依赖基因表达的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不适用于其他物种 | 研究基因和经验在表现性状变异中的作用 | 主要嗅觉上皮中的嗅觉感知神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达 | 性别分离的小鼠和性别结合的小鼠的嗅觉神经元亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-05 |
Ocular macrophage origin and heterogeneity during steady state and experimental choroidal neovascularization
2020-Nov-13, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-020-02010-0
PMID:33187533
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠和人类眼部巨噬细胞在稳态和实验性脉络膜新生血管形成中的起源与异质性 | 首次揭示了小鼠和人类眼部巨噬细胞亚群的组成及其在疾病中的功能差异 | 尚未明确人类巨噬细胞亚群的所有功能特点和生物学意义 | 研究眼部巨噬细胞在稳态和病理状态下的异质性及其起源 | 小鼠模型及人类nAMD患者的巨噬细胞 | 数字病理学 | 与年龄相关的黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | Cx3cr1CreER/+ ; Rosa26zsGFP/+小鼠模型 | RNA数据 | 涉及的小鼠和人类样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-07 |
A curated database reveals trends in single-cell transcriptomics
2020-11-28, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaa073
PMID:33247933
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研究论文 | 本文构建了一个详尽的手动筛选单细胞转录组学研究数据库，包含关键信息如数据类型、技术使用及研究生物系统的描述 | 提供了对已发表单细胞转录组学数据的全面汇总，便于发现相关趋势和信息 | NA | 旨在促进对已发表单细胞转录组学数据的发现和利用 | 单细胞转录组学研究及其相关数据 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涵盖超过1000项研究 | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-07 |
mTORC1 activation in lung mesenchyme drives sex- and age-dependent pulmonary structure and function decline
2020-11-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18979-4
PMID:33159078
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了淋巴管平滑肌瘤病（LAM）肺与健康对照肺的细胞亚型，揭示了LAM特有的间质和过渡性肺泡上皮状态，并探讨了mTORC1激活在肺间质中的性别和年龄依赖性影响。 | 首次揭示了LAM肺特有的间质和过渡性肺泡上皮状态，并发现间质细胞在LAM疾病表型中的协调作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不完全适用于人类LAM的病理机制。 | 识别LAM肺特有的细胞亚型，并探讨mTORC1激活在肺间质中的性别和年龄依赖性影响。 | 淋巴管平滑肌瘤病（LAM）肺与健康对照肺的细胞亚型。 | 数字病理学 | 肺病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | LAM肺与年龄和性别匹配的健康对照肺 | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-07 |
Tumor Phylogeny Topology Inference via Deep Learning
2020-Nov-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101655
PMID:33117968
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研究论文 | 本文通过深度学习方法研究肿瘤谱系拓扑结构的推断问题 | 引入深度学习解决方案来推断肿瘤谱系树的线性或分支拓扑结构，并使用强化学习方法重建最可能的肿瘤谱系 | 目前仅限于推断基本拓扑特征和初步重建肿瘤谱系 | 开发快速深度学习方法以推断肿瘤谱系拓扑结构 | 肿瘤谱系拓扑结构 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习模型 | 基因型矩阵 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
scREAD: A Single-Cell RNA-Seq Database for Alzheimer's Disease
2020-Nov-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101769
PMID:33241205
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research paper | 本文开发了一个名为scREAD的数据库，专门用于管理阿尔茨海默病（AD）相关的单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和单核RNA测序（snRNA-Seq）数据集。 | scREAD是首个专门管理AD相关scRNA-Seq和snRNA-Seq数据集的数据库，提供了全面的分析结果，包括控制图谱构建、细胞类型预测、差异表达基因鉴定和细胞类型特异性调控元件鉴定。 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术深入解析阿尔茨海默病中高度异质性细胞的功能和功能障碍。 | 研究对象包括人类死后脑组织和带有AD病理的鼠模型中的scRNA-Seq和snRNA-Seq数据集。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和单核RNA测序（snRNA-Seq） | NA | RNA序列数据 | 73个数据集来自10个脑区 | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
High-resolution transcriptional and morphogenetic profiling of cells from micropatterned human ESC gastruloid cultures
2020-11-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.59445
PMID:33206048
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序和跨物种比较，分析了从微图案化的人类胚胎干细胞（ESC）gastruloid培养物中提取的细胞的转录组和形态发生特征 | 揭示了gastruloids包含与多种胚层和胚外细胞标记相似的细胞，并展示了gastruloid系统模拟灵长类特异性胚胎发生特征的能力 | NA | 研究人类胚胎干细胞在特定培养条件下分化为gastruloids的转录组和形态发生特征 | 人类胚胎干细胞gastruloids中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
Ensemble dimensionality reduction and feature gene extraction for single-cell RNA-seq data
2020-11-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19465-7
PMID:33203837
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研究论文 | 本文提出了一种集成方法，用于同时进行单细胞RNA测序数据的降维和特征基因提取（EDGE） | 该方法采用集成学习方案，利用大量弱学习者进行准确的相似性搜索，与现有降维技术不同 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据的计算效率和可视化 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
Qualitative Analysis of Tumor-Infiltrating Lymphocytes across Human Tumor Types Reveals a Higher Proportion of Bystander CD8+ T Cells in Non-Melanoma Cancers Compared to Melanoma
2020-Nov-12, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12113344
PMID:33198174
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研究论文 | 本研究通过复制个体患者的肿瘤-T细胞相互作用，比较了多种肿瘤类型中肿瘤浸润T细胞的定性特征 | 揭示了非黑色素瘤癌症中旁观者CD8+ T细胞的比例高于黑色素瘤，并发现肿瘤反应性T细胞的比例在体外显著较低 | 研究主要集中在体外和基于单细胞RNA测序的体内分析，未涉及所有可能的肿瘤类型 | 确定并比较多种肿瘤类型中肿瘤浸润T细胞的定性特征 | 肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）和自体肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 187对未选择的肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）和自体肿瘤细胞，以及来自93名黑色素瘤或上皮癌患者的合并队列的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-07 |
Review of Single-Cell RNA Sequencing in the Heart
2020-Nov-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21218345
PMID:33172208
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在心脏研究中的应用 | scRNA-seq技术为健康和病理性心脏提供了许多新颖的见解 | NA | 总结scRNA-seq平台并描述通过scRNA-seq分析揭示的心血管发育和疾病的分子机制 | 单细胞RNA测序技术及其在心血管疾病研究中的应用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-07 |
Mapping endothelial-cell diversity in cerebral cavernous malformations at single-cell resolution
2020-11-03, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.61413
PMID:33138917
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫组化技术，深入分析了脑内皮细胞在正常状态和CCM小鼠模型中的多样性 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面表征了脑内皮细胞在正常和CCM病变条件下的亚型 | NA | 旨在理解脑血管系统的可塑性及CCM疾病的分子基础 | 脑内皮细胞的多样性及其在CCM病变中的变化 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA profiling links ncRNAs to spatiotemporal gene expression during C. elegans embryogenesis
2020-11-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-75801-3
PMID:33139759
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了C. elegans胚胎发育过程中的非编码RNA（ncRNA）与基因时空表达的关系 | 首次使用无标记的全长高深度单细胞RNA测序技术，识别了94种未报道过的ncRNA，这些ncRNA与特定细胞类型和胚胎时间点的蛋白质编码基因共同表达 | NA | 探究ncRNA在C. elegans胚胎发育过程中对基因时空表达的调控作用 | C. elegans胚胎细胞中的ncRNA及其对基因表达的调控 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 1031个C. elegans胚胎细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
Increased Production of LIGHT by T Cells in Eosinophilic Esophagitis Promotes Differentiation of Esophageal Fibroblasts Toward an Inflammatory Phenotype
2020-11, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.07.035
PMID:32712105
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研究论文 | 本文研究了肿瘤坏死因子超家族成员14（TNFSF14，又称LIGHT）在嗜酸性食管炎（EoE）中对纤维母细胞的影响 | 首次揭示了LIGHT在EoE中通过诱导纤维母细胞向炎症表型分化的新机制 | NA | 探讨LIGHT在EoE中的作用及其对纤维母细胞分化的影响 | 嗜酸性食管炎患者的食管组织和纤维母细胞 | 免疫学 | 消化系统疾病 | 单细胞测序、免疫染色、RNA测序、流式细胞术、免疫印迹、免疫荧光、逆转录聚合酶链反应 | NA | 细胞数据 | 来自EoE患者和健康捐赠者的食管组织及纤维母细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
A single-cell analysis of the molecular lineage of chordate embryogenesis
2020-11, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abc4773
PMID:33148647
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了从受精到原肠作用开始期间，被囊动物胚胎细胞的完整和不变的细胞谱系 | 研究首次重建了野生型胚胎中跨越八个细胞周期的47种细胞类型的发育景观，并识别了在成纤维细胞生长因子（FGF）抑制下的八种命运转变 | NA | 理解脊索动物早期胚胎发育和细胞谱系分化 | 被囊动物的胚胎细胞谱系 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 跨越八个细胞周期的47种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |