单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 135 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-10-01 |
μCB-seq: microfluidic cell barcoding and sequencing for high-resolution imaging and sequencing of single cells
2020-11-07, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d0lc00169d
PMID:32931539
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为μCB-seq的微流控细胞条形码和测序平台，用于高分辨率成像和单细胞测序 | μCB-seq通过一种新的制造方法，在微流控设备的可寻址反应室中预加载带有已知条形码序列的引物，从而实现了单细胞的高分辨率成像和测序 | NA | 结合单细胞RNA测序和光学成像，提供全面的单细胞分析，整合基因表达谱和细胞状态表征 | 单细胞 | 数字病理学 | NA | 微流控技术 | NA | 图像和文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2024-08-16 |
Systematic evaluation of transcriptomic disease risk and diagnostic biomarker overlap between COVID-19 and tuberculosis: a patient-level meta-analysis
2020-Nov-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.11.25.20236646
PMID:33269371
|
研究论文 | 本文通过患者层面的荟萃分析，评估了COVID-19和结核病之间转录组疾病风险和诊断生物标志物的重叠。 | 首次系统地分析了COVID-19和结核病在转录组层面的相互作用，并识别了共享的基因本体论扰动。 | 研究主要基于RNA测序数据，可能无法全面反映所有相关生物标志物。 | 旨在理解COVID-19和结核病之间的相互作用，并识别潜在的共享生物标志物。 | COVID-19和结核病患者的转录组数据。 | 数字病理学 | 肺结核 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 35个COVID-19基因签名来自9项研究，共98个样本；1181个结核病RNA测序数据样本来自853名个体。 | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-08-07 |
WWOX Loss of Function in Neurodevelopmental and Neurodegenerative Disorders
2020-Nov-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21238922
PMID:33255508
|
研究论文 | 本文探讨了WWOX基因功能丧失在神经发育和神经退行性疾病中的作用 | 首次全面描述了WWOX基因在多种中枢神经系统疾病中的表达模式及其与疾病的相关性 | 尚未完全阐明WWOX功能丧失导致神经退行性疾病的具体分子机制 | 研究WWOX基因在神经发育和神经退行性疾病中的作用及其分子机制 | WWOX基因及其在中枢神经系统中的表达 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | RNA原位杂交, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类和小鼠的多个脑区及特定神经元亚型 | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-08-07 |
TLR-9 agonist and CD40-targeting vaccination induces HIV-1 envelope-specific B cells with a diversified immunoglobulin repertoire in humanized mice
2020-11, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009025
PMID:33253297
|
研究论文 | 本研究探讨了在人源化小鼠中，通过CD40靶向疫苗与CpG-B佐剂联合使用，诱导针对HIV-1 Env蛋白的B细胞反应及其免疫球蛋白谱系多样性 | 本研究首次展示了CD40靶向疫苗与CpG-B佐剂联合使用能在人源化小鼠中有效促进人B细胞从IgM向IgG的转变和成熟，并诱导出针对HIV-1 Env蛋白的特异性IgG转换记忆B细胞 | 研究主要在人源化小鼠模型中进行，其结果在人类中的直接应用尚需进一步验证 | 开发针对HIV-1的疫苗，特别是在人源化小鼠模型中诱导人B细胞和T细胞的反应 | 人源化小鼠中的B细胞和T细胞反应 | 疫苗学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-08-07 |
Inference of mutability landscapes of tumors from single cell sequencing data
2020-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008454
PMID:33253159
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MULAN的最大似然计算框架，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤细胞的突变率，从而构建肿瘤的突变景观 | 提出了MULAN框架，利用癌症突变树提供的部分突变事件顺序信息，推断肿瘤的完整进化历史和突变景观 | NA | 开发一种新的计算框架，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤的突变率和进化历史 | 肿瘤细胞的突变率和进化历史 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 最大似然法 | 单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-08-07 |
Stem Cell Pluripotency Genes Klf4 and Oct4 Regulate Complex SMC Phenotypic Changes Critical in Late-Stage Atherosclerotic Lesion Pathogenesis
2020-11-24, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀测序等技术，探讨了Klf4和Oct4基因在晚期动脉粥样硬化病变中对平滑肌细胞表型变化的影响。 | 研究发现平滑肌细胞在晚期动脉粥样硬化病变中表现出比普遍认为的更大的表型可塑性，并且Klf4基因调控了多种表型的转变，包括可能对晚期动脉粥样硬化病变有害的Lgals3+成骨细胞。 | NA | 探讨晚期动脉粥样硬化病变中平滑肌细胞的来源、身份和功能，以及它们如何控制斑块稳定性。 | 晚期动脉粥样硬化病变中的平滑肌细胞和内皮细胞。 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | RNA | 人类颈动脉内膜切除术样本和微切割的小鼠晚期动脉粥样硬化病变样本 | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-07 |
Research and application of single-cell sequencing in tumor heterogeneity and drug resistance of circulating tumor cells
2020-Nov-10, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-020-00240-1
PMID:33292625
|
研究论文 | 本文研究了单细胞测序技术在肿瘤异质性和循环肿瘤细胞药物抗性中的应用 | 利用单细胞测序技术研究循环肿瘤细胞，避免了肿瘤异质性的干扰，为理解肿瘤药物抗性提供了新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在解决肿瘤异质性和药物抗性问题中的应用 | 肿瘤异质性和循环肿瘤细胞的药物抗性 | 数字病理学 | 恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome conservation in a comparative analysis of fresh and cryopreserved human skin tissue: pilot in localized scleroderma
2020-11-09, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-020-02343-4
PMID:33168063
|
研究论文 | 本研究评估了使用CryoStor® CS10与RPMI在局部硬皮病患者皮肤组织中细胞组成和细胞特异性基因表达的变异性 | 首次比较了新鲜和冷冻保存的人类皮肤组织在单细胞转录组水平上的保守性 | 研究样本量较小，仅包括3名局部硬皮病患者 | 评估不同保存方法对局部硬皮病患者皮肤组织细胞组成和基因表达的影响 | 局部硬皮病患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3名局部硬皮病患者的皮肤活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-07 |
CD63+ Cancer-Associated Fibroblasts Confer Tamoxifen Resistance to Breast Cancer Cells through Exosomal miR-22
2020-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202002518
PMID:33173749
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序描绘了肿瘤微环境的整体景观，并发现了一种新的癌症相关成纤维细胞（CD63 CAFs），这种细胞通过分泌富含miR-22的胞外囊泡促进乳腺癌细胞对他莫昔芬的耐药性 | 首次揭示了CD63 CAFs通过分泌富含miR-22的胞外囊泡诱导乳腺癌细胞对他莫昔芬产生耐药性，并提出了CD63 CAFs作为增强他莫昔芬敏感性的新型治疗靶点 | NA | 旨在从肿瘤微环境的角度更好地理解他莫昔芬耐药性 | 乳腺癌细胞对他莫昔芬的耐药性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics inferred from pathology whole-slide images links tumor heterogeneity to survival in breast and lung cancer
2020-11-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-75708-z
PMID:33139755
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用数字病理全切片图像进行空间转录组分析的方法，以连接肿瘤异质性与乳腺癌和肺癌的生存率 | 提出了一种新的方法，通过深度学习模型在病理全切片图像上空间解析mRNA和miRNA表达水平，并构建异质性指数(HTI) | 现有分析方法需要大量训练样本和复杂的流程，而我们的模型在样本数量较少的情况下仍显示了良好的性能 | 研究肿瘤异质性及其对生存的影响，以改善癌症的诊断和治疗 | 研究了乳腺癌和肺癌样本中的肿瘤异质性 | 数字病理学 | 乳腺癌，肺癌 | 深度学习 | 深度学习模型 | 图像 | 使用了来自两个癌症队列的少量训练样本 | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-05 |
Semiochemical responsive olfactory sensory neurons are sexually dimorphic and plastic
2020-11-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.54501
PMID:33231170
|
研究论文 | 本研究探讨了基因和经验如何共同作用生成表型变异性，特别是在小鼠的主要嗅觉上皮中 | 识别出了一群性别特异性的嗅觉感知神经元，并发现其在不同性别小鼠中的表现出性别差异，同时揭示了活动依赖基因表达的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不适用于其他物种 | 研究基因和经验在表现性状变异中的作用 | 主要嗅觉上皮中的嗅觉感知神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达 | 性别分离的小鼠和性别结合的小鼠的嗅觉神经元亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
A curated database reveals trends in single-cell transcriptomics
2020-11-28, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaa073
PMID:33247933
|
研究论文 | 本文构建了一个详尽的手动筛选单细胞转录组学研究数据库，包含关键信息如数据类型、技术使用及研究生物系统的描述 | 提供了对已发表单细胞转录组学数据的全面汇总，便于发现相关趋势和信息 | NA | 旨在促进对已发表单细胞转录组学数据的发现和利用 | 单细胞转录组学研究及其相关数据 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涵盖超过1000项研究 | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
mTORC1 activation in lung mesenchyme drives sex- and age-dependent pulmonary structure and function decline
2020-11-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18979-4
PMID:33159078
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了淋巴管平滑肌瘤病（LAM）肺与健康对照肺的细胞亚型，揭示了LAM特有的间质和过渡性肺泡上皮状态，并探讨了mTORC1激活在肺间质中的性别和年龄依赖性影响。 | 首次揭示了LAM肺特有的间质和过渡性肺泡上皮状态，并发现间质细胞在LAM疾病表型中的协调作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不完全适用于人类LAM的病理机制。 | 识别LAM肺特有的细胞亚型，并探讨mTORC1激活在肺间质中的性别和年龄依赖性影响。 | 淋巴管平滑肌瘤病（LAM）肺与健康对照肺的细胞亚型。 | 数字病理学 | 肺病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | LAM肺与年龄和性别匹配的健康对照肺 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
Tumor Phylogeny Topology Inference via Deep Learning
2020-Nov-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101655
PMID:33117968
|
研究论文 | 本文通过深度学习方法研究肿瘤谱系拓扑结构的推断问题 | 引入深度学习解决方案来推断肿瘤谱系树的线性或分支拓扑结构，并使用强化学习方法重建最可能的肿瘤谱系 | 目前仅限于推断基本拓扑特征和初步重建肿瘤谱系 | 开发快速深度学习方法以推断肿瘤谱系拓扑结构 | 肿瘤谱系拓扑结构 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习模型 | 基因型矩阵 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
scREAD: A Single-Cell RNA-Seq Database for Alzheimer's Disease
2020-Nov-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101769
PMID:33241205
|
research paper | 本文开发了一个名为scREAD的数据库，专门用于管理阿尔茨海默病（AD）相关的单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和单核RNA测序（snRNA-Seq）数据集。 | scREAD是首个专门管理AD相关scRNA-Seq和snRNA-Seq数据集的数据库，提供了全面的分析结果，包括控制图谱构建、细胞类型预测、差异表达基因鉴定和细胞类型特异性调控元件鉴定。 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术深入解析阿尔茨海默病中高度异质性细胞的功能和功能障碍。 | 研究对象包括人类死后脑组织和带有AD病理的鼠模型中的scRNA-Seq和snRNA-Seq数据集。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和单核RNA测序（snRNA-Seq） | NA | RNA序列数据 | 73个数据集来自10个脑区 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-07 |
High-resolution transcriptional and morphogenetic profiling of cells from micropatterned human ESC gastruloid cultures
2020-11-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.59445
PMID:33206048
|
研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序和跨物种比较，分析了从微图案化的人类胚胎干细胞（ESC）gastruloid培养物中提取的细胞的转录组和形态发生特征 | 揭示了gastruloids包含与多种胚层和胚外细胞标记相似的细胞，并展示了gastruloid系统模拟灵长类特异性胚胎发生特征的能力 | NA | 研究人类胚胎干细胞在特定培养条件下分化为gastruloids的转录组和形态发生特征 | 人类胚胎干细胞gastruloids中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-07 |
Ensemble dimensionality reduction and feature gene extraction for single-cell RNA-seq data
2020-11-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19465-7
PMID:33203837
|
研究论文 | 本文提出了一种集成方法，用于同时进行单细胞RNA测序数据的降维和特征基因提取（EDGE） | 该方法采用集成学习方案，利用大量弱学习者进行准确的相似性搜索，与现有降维技术不同 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据的计算效率和可视化 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
Qualitative Analysis of Tumor-Infiltrating Lymphocytes across Human Tumor Types Reveals a Higher Proportion of Bystander CD8+ T Cells in Non-Melanoma Cancers Compared to Melanoma
2020-Nov-12, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12113344
PMID:33198174
|
研究论文 | 本研究通过复制个体患者的肿瘤-T细胞相互作用，比较了多种肿瘤类型中肿瘤浸润T细胞的定性特征 | 揭示了非黑色素瘤癌症中旁观者CD8+ T细胞的比例高于黑色素瘤，并发现肿瘤反应性T细胞的比例在体外显著较低 | 研究主要集中在体外和基于单细胞RNA测序的体内分析，未涉及所有可能的肿瘤类型 | 确定并比较多种肿瘤类型中肿瘤浸润T细胞的定性特征 | 肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）和自体肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 187对未选择的肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）和自体肿瘤细胞，以及来自93名黑色素瘤或上皮癌患者的合并队列的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
Review of Single-Cell RNA Sequencing in the Heart
2020-Nov-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21218345
PMID:33172208
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在心脏研究中的应用 | scRNA-seq技术为健康和病理性心脏提供了许多新颖的见解 | NA | 总结scRNA-seq平台并描述通过scRNA-seq分析揭示的心血管发育和疾病的分子机制 | 单细胞RNA测序技术及其在心血管疾病研究中的应用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
Mapping endothelial-cell diversity in cerebral cavernous malformations at single-cell resolution
2020-11-03, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.61413
PMID:33138917
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫组化技术，深入分析了脑内皮细胞在正常状态和CCM小鼠模型中的多样性 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面表征了脑内皮细胞在正常和CCM病变条件下的亚型 | NA | 旨在理解脑血管系统的可塑性及CCM疾病的分子基础 | 脑内皮细胞的多样性及其在CCM病变中的变化 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |