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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-06 |
Defining the Teratoma as a Model for Multi-lineage Human Development
2020-11-25, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.10.018
PMID:33152263
|
研究论文 | 本研究将畸胎瘤确立为研究人类多谱系发育过程的模型平台 | 首次系统论证畸胎瘤作为多谱系发育模型的可行性,并展示了其在全组织功能遗传筛选和组织工程中的应用潜力 | 研究仅基于4个细胞系产生的23个畸胎瘤,样本来源相对有限 | 探索畸胎瘤作为研究人类发育过程的模型平台 | 畸胎瘤中的细胞类型和发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因敲除筛选, 微RNA调控 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 179,632个细胞,来自4个细胞系产生的23个畸胎瘤 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
Tau Pathology Drives Dementia Risk-Associated Gene Networks toward Chronic Inflammatory States and Immunosuppression
2020-11-17, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108398
PMID:33207193
|
研究论文 | 通过系统功能基因组学分析揭示了tau病理驱动痴呆风险基因网络向慢性炎症状态和免疫抑制发展的机制 | 发现了小胶质细胞免疫通路的复杂时间轨迹,识别了从小鼠到人类保守的基因共表达模块NAct和NSupp | 研究主要基于死后脑组织样本,可能无法完全反映疾病发展过程中的动态变化 | 理解神经免疫相关基因和通路在神经退行性疾病病理生理学中的作用 | 纯化的小胶质细胞和来自小鼠及人类AD、FTD、PSP疾病的脑组织 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 功能基因组学分析、化学遗传学、单细胞测序 | 基因共表达网络分析 | 基因组数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
Multimodal Mapping of the Tumor and Peripheral Blood Immune Landscape in Human Pancreatic Cancer
2020-11, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-020-00121-4
PMID:34296197
|
研究论文 | 通过多模态分析方法揭示人类胰腺癌中肿瘤和外周血的免疫景观特征 | 首次采用CyTOF、单细胞RNA测序和多重免疫组化相结合的多模态方法,系统解析胰腺癌免疫抑制微环境的细胞互作网络 | 样本量相对有限,需要在更大队列中验证发现的患者特异性免疫变化 | 阐明胰腺导管腺癌的免疫景观特征及其对免疫治疗的影响 | 胰腺癌患者肿瘤组织、匹配血液样本和非恶性组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | CyTOF, 单细胞RNA测序, 多重免疫组化 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 图像数据 | 患者肿瘤、匹配血液和非恶性样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 多重免疫组织化学 | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Long-term skin-resident memory T cells proliferate in situ and are involved in human graft-versus-host disease
2020-11-18, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abb7028
PMID:33208504
|
研究论文 | 本研究揭示了人类皮肤中长期驻留的记忆T细胞在异基因造血干细胞移植后持续存在并参与移植物抗宿主病的机制 | 首次证明人类皮肤中宿主来源的记忆T细胞可稳定存在10年以上,并发现RUNX3和galectin-3作为人类皮肤T细胞的新标记物 | 研究主要基于观察性数据,缺乏直接的机制验证实验 | 探究人类皮肤中长期驻留记忆T细胞的生物学特性及其在移植物抗宿主病中的作用 | 接受异基因造血干细胞移植患者的皮肤组织样本 | 免疫学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 异基因造血干细胞移植患者的皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
Characterisation of CD4+ T-cell subtypes using single cell RNA sequencing and the impact of cell number and sequencing depth
2020-11-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-76972-9
PMID:33188258
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析CD4+ T细胞亚型,并评估细胞数量和测序深度对细胞分类能力的影响 | 首次系统评估了细胞数量和测序深度对复杂细胞群体CD4+ T细胞亚型鉴定的影响,并比较了静息与刺激条件下T细胞特征的差异 | 研究仅基于单一个体样本,结果可能缺乏普适性 | 确定测序深度和细胞数量对准确识别CD4+ T细胞亚型能力的影响 | CD4+ T细胞 | 单细胞测序分析 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 一个个体样本(具体数量未明确说明) | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Multi-layered Spatial Transcriptomics Identify Secretory Factors Promoting Human Hematopoietic Stem Cell Development
2020-11-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.08.004
PMID:32946788
|
研究论文 | 通过多层空间转录组学技术识别促进人类造血干细胞发育的分泌因子 | 结合空间转录组学与单细胞分析,首次揭示人类主动脉背腹极化信号中内皮素1对造血干细胞发育的关键调控作用 | 研究主要基于基因表达数据,功能验证实验相对有限 | 探索人类造血干细胞发育过程中的分泌信号调控机制 | 人类胚胎主动脉-性腺-中肾区域细胞 | 空间转录组学 | 血液系统疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 细胞分选 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
The use and limitations of single-cell mass cytometry for studying human microglia function
2020-11, Brain pathology (Zurich, Switzerland)
DOI:10.1111/bpa.12909
PMID:33058349
|
综述 | 本文总结了利用单细胞质谱流式细胞术研究人类小胶质细胞功能的最新进展、局限性和未来方向 | 系统评估了质谱流式细胞术和成像质谱流式细胞术在人类小胶质细胞研究中的创新应用,包括单细胞蛋白质表达分析和空间细胞相互作用研究 | 讨论了这些技术在人类小胶质细胞研究中的局限性 | 评估单细胞质谱流式细胞技术在人类小胶质细胞研究中的应用价值 | 人类小胶质细胞 | 单细胞分析 | 神经炎症性疾病、神经退行性疾病、精神疾病 | 质谱流式细胞术、成像质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质表达数据、空间转录组数据 | NA | Fluidigm | 单细胞质谱流式细胞术、成像质谱流式细胞术 | CyTOF, IMC | 质谱流式细胞术可同时检测超过60种靶向分子,成像质谱流式细胞术可同时使用超过40种标记物 |
| 8 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics combined with interstitial fluid proteomics defines cell type-specific immune regulation in atopic dermatitis
2020-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.03.041
PMID:32344053
|
研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学和间质液体蛋白质组学分析,揭示了特应性皮炎中细胞类型特异性的免疫调节机制 | 首次将皮肤吸疱技术与单细胞RNA测序和蛋白质组学结合,提供了优于传统活检的转录组分辨率,并发现了新的炎症参与者 | 吸疱技术无法捕获肥大细胞和非迁移性CD163+巨噬细胞,这些细胞仅存在于活检样本中 | 在转录组和蛋白质组水平上表征人类特应性皮炎的病理机制 | 特应性皮炎患者和健康对照者的皮肤细胞及间质液体 | 单细胞组学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 特应性皮炎患者和健康对照者的皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Combinatorial expression of GPCR isoforms affects signalling and drug responses
2020-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2888-2
PMID:33149304
|
研究论文 | 本研究探讨了GPCR异构体组合表达如何影响信号传导和药物反应 | 揭示了单个GPCR基因可通过不同异构体组合在组织中形成独特信号状态,为组织选择性药物开发提供新靶点 | NA | 研究GPCR异构体组合表达对信号传导和药物反应的影响机制 | G蛋白偶联受体(GPCR)异构体 | 分子生物学 | NA | 转录组测序,蛋白质组学,单细胞转录组学,遗传关联研究,药理学实验 | NA | 序列数据,结构数据,转录组数据,蛋白质组数据,单细胞数据,遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Tumor-Infiltrating Regulatory T-cell Accumulation in the Tumor Microenvironment Is Mediated by IL33/ST2 Signaling
2020-11, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-19-0828
PMID:32878747
|
研究论文 | 本研究揭示了IL33/ST2信号轴通过促进调节性T细胞在肿瘤微环境中的优先增殖和积累来增强肿瘤进展的分子机制 | 首次证明IL33/ST2信号轴是驱动肿瘤浸润调节性T细胞在肿瘤微环境中特异性积累的关键通路 | 研究主要基于小鼠肿瘤模型,人类临床相关性仍需进一步验证 | 探究调节性T细胞在肿瘤微环境中积累的分子机制 | 肿瘤浸润调节性T细胞 | 免疫学 | 癌症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 多种肿瘤模型小鼠 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
A molecular cell atlas of the human lung from single-cell RNA sequencing
2020-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2922-4
PMID:33208946
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术构建了人类肺部的全面分子细胞图谱 | 首次系统性地识别和定位了人类肺部所有分子细胞类型,发现了14种新型细胞类型,并揭示了肺进化过程中的细胞类型可塑性 | NA | 创建人类肺部的全面分子细胞图谱 | 人类肺部所有组织区室和循环血液中的约75,000个细胞 | 单细胞生物学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约75,000个人类细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | 液滴式和板式单细胞RNA测序平台 | 结合液滴式和板式单细胞RNA测序技术 |
| 12 | 2025-10-06 |
Single-cell genomics and spatial transcriptomics: Discovery of novel cell states and cellular interactions in liver physiology and disease biology
2020-11, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2020.06.004
PMID:32534107
|
综述 | 综述单细胞基因组学与空间转录组学在肝脏生理和疾病生物学中揭示新细胞状态及细胞间相互作用的研究进展 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,首次系统揭示肝脏中未知细胞类型、罕见细胞群体及原位细胞互作网络 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于已有研究进行系统性综述 | 探讨单细胞和空间转录组技术在肝脏研究中的应用与发现 | 人类肝脏组织中的肝细胞、非实质细胞及肝脏前体细胞 | 空间转录组学 | 慢性肝病与肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Modeling neural tube development by differentiation of human embryonic stem cells in a microfluidic WNT gradient
2020-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0525-0
PMID:32451506
|
研究论文 | 通过微流体WNT梯度分化人类胚胎干细胞模拟神经管发育 | 开发了名为MiSTR的微流体控制干细胞区域化方法,首次在体外模拟人类神经管头尾轴向发育模式 | 研究仅限于早期神经管发育阶段,未验证长期发育结果和功能成熟 | 研究人类神经管早期发育的分子机制和模式形成过程 | 人类胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序,微流体技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-10-07 |
Single-Cell Profiling of Ebola Virus Disease In Vivo Reveals Viral and Host Dynamics
2020-11-25, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.10.002
PMID:33159858
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了埃博拉病毒感染期间宿主免疫细胞和病毒在体内的动态变化 | 首次在体内使用单细胞转录组学和质谱流式细胞技术全面表征埃博拉病毒感染期间的免疫反应,并量化细胞内病毒RNA以确定病毒嗜性 | 实验在高度防护环境下进行,样本获取困难,研究仅使用恒河猴模型 | 表征埃博拉病毒感染期间的宿主-病毒相互作用动态 | 恒河猴外周免疫细胞 | 单细胞生物学 | 埃博拉病毒病 | 单细胞转录组学, CyTOF质谱流式细胞技术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 100,000个转录组和15,000,000个蛋白质谱 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 15 | 2024-11-18 |
D-EE: Distributed software for visualizing intrinsic structure of large-scale single-cell data
2020-11-11, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaa126
PMID:33179041
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研究论文 | 本文介绍了一种名为D-EE的分布式优化实现方法,用于大规模单细胞数据的内在结构可视化 | 提出了分布式弹性嵌入(D-EE)算法,能够在大规模单细胞RNA测序数据中揭示低维度的内在结构,并具有高扩展性和高效性 | NA | 开发一种能够高效处理大规模单细胞RNA测序数据的可视化工具 | 大规模单细胞RNA测序数据 | 计算机视觉 | NA | 分布式计算 | 弹性嵌入(EE)算法 | 单细胞RNA测序数据 | 大规模数据 | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-11-17 |
Single-Cell Transcriptional Archetypes of Airway Inflammation in Cystic Fibrosis
2020-11-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202004-0991OC
PMID:32603604
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研究论文 | 本文首次对囊性纤维化患者的痰液进行了单细胞转录组分析,定义了气道免疫功能障碍的转录特征 | 首次对囊性纤维化患者的痰液进行单细胞转录组分析,并定义了基于表达的细胞功能和成熟度特征,称为转录原型 | 样本量较小,仅包括9名囊性纤维化患者和5名健康对照者 | 研究囊性纤维化患者气道免疫功能障碍的转录特征及其在疾病发病机制中的作用 | 囊性纤维化患者的痰液细胞 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 9名囊性纤维化患者和5名健康对照者的痰液细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-10-01 |
μCB-seq: microfluidic cell barcoding and sequencing for high-resolution imaging and sequencing of single cells
2020-11-07, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d0lc00169d
PMID:32931539
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研究论文 | 本文介绍了一种名为μCB-seq的微流控细胞条形码和测序平台,用于高分辨率成像和单细胞测序 | μCB-seq通过一种新的制造方法,在微流控设备的可寻址反应室中预加载带有已知条形码序列的引物,从而实现了单细胞的高分辨率成像和测序 | NA | 结合单细胞RNA测序和光学成像,提供全面的单细胞分析,整合基因表达谱和细胞状态表征 | 单细胞 | 数字病理学 | NA | 微流控技术 | NA | 图像和文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-16 |
Systematic evaluation of transcriptomic disease risk and diagnostic biomarker overlap between COVID-19 and tuberculosis: a patient-level meta-analysis
2020-Nov-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.11.25.20236646
PMID:33269371
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研究论文 | 本文通过患者层面的荟萃分析,评估了COVID-19和结核病之间转录组疾病风险和诊断生物标志物的重叠。 | 首次系统地分析了COVID-19和结核病在转录组层面的相互作用,并识别了共享的基因本体论扰动。 | 研究主要基于RNA测序数据,可能无法全面反映所有相关生物标志物。 | 旨在理解COVID-19和结核病之间的相互作用,并识别潜在的共享生物标志物。 | COVID-19和结核病患者的转录组数据。 | 数字病理学 | 肺结核 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 35个COVID-19基因签名来自9项研究,共98个样本;1181个结核病RNA测序数据样本来自853名个体。 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-07 |
WWOX Loss of Function in Neurodevelopmental and Neurodegenerative Disorders
2020-Nov-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21238922
PMID:33255508
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研究论文 | 本文探讨了WWOX基因功能丧失在神经发育和神经退行性疾病中的作用 | 首次全面描述了WWOX基因在多种中枢神经系统疾病中的表达模式及其与疾病的相关性 | 尚未完全阐明WWOX功能丧失导致神经退行性疾病的具体分子机制 | 研究WWOX基因在神经发育和神经退行性疾病中的作用及其分子机制 | WWOX基因及其在中枢神经系统中的表达 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | RNA原位杂交, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类和小鼠的多个脑区及特定神经元亚型 | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
TLR-9 agonist and CD40-targeting vaccination induces HIV-1 envelope-specific B cells with a diversified immunoglobulin repertoire in humanized mice
2020-11, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009025
PMID:33253297
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研究论文 | 本研究探讨了在人源化小鼠中,通过CD40靶向疫苗与CpG-B佐剂联合使用,诱导针对HIV-1 Env蛋白的B细胞反应及其免疫球蛋白谱系多样性 | 本研究首次展示了CD40靶向疫苗与CpG-B佐剂联合使用能在人源化小鼠中有效促进人B细胞从IgM向IgG的转变和成熟,并诱导出针对HIV-1 Env蛋白的特异性IgG转换记忆B细胞 | 研究主要在人源化小鼠模型中进行,其结果在人类中的直接应用尚需进一步验证 | 开发针对HIV-1的疫苗,特别是在人源化小鼠模型中诱导人B细胞和T细胞的反应 | 人源化小鼠中的B细胞和T细胞反应 | 疫苗学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | NA | NA | NA |