单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 134 篇文献，本页显示第 121 - 134 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Profiling of the Kidney Glomerulus Identifies Key Cell Types and Reactions to Injury
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020020220
PMID:32651223
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，全面分析了健康小鼠和四种疾病模型小鼠的肾小球细胞类型及其对损伤的反应 | 首次全面识别了肾小球中的所有细胞类型，并发现了新的标记基因和基因特征，以及疾病模型中细胞类型特异性和损伤类型特异性的反应 | NA | 旨在通过单细胞转录组测序技术，深入了解肾小球细胞类型及其对损伤的反应 | 健康小鼠和四种疾病模型小鼠的肾小球细胞 | 数字病理学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 健康小鼠和四种疾病模型小鼠的肾小球细胞 |
| 122 | 2024-08-09 |
LRSK: a low-rank self-representation K-means method for clustering single-cell RNA-sequencing data
2020-10-01, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1039/d0mo00034e
PMID:32572422
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研究论文 | 本文提出了一种新的自适应联合聚类框架，名为低秩自表示K均值方法（LRSK），用于从单细胞RNA测序数据中学习数据表示矩阵和聚类指示矩阵 | 本文创新性地使用低秩表示来反映细胞间的潜在关系，并采用增强拉格朗日乘子（ALM）优化算法来解决问题 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据聚类的有效性和准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 肝癌 | RNA-seq | K均值 | 测序数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 123 | 2024-08-09 |
IL22BP Mediates the Antitumor Effects of Lymphotoxin Against Colorectal Tumors in Mice and Humans
2020-10, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.06.033
PMID:32585307
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研究论文 | 研究IL22BP在调节淋巴毒素对结直肠肿瘤的抗肿瘤效应中的作用 | 首次探讨了IL22BP在人类和鼠类结直肠癌中的表达及其与淋巴毒素信号的关系 | NA | 研究IL22BP在结直肠癌发生中的作用及其与淋巴毒素信号的关系 | 人类和鼠类的结直肠肿瘤组织 | NA | 结直肠癌 | 定量聚合酶链反应, 流式细胞术, 免疫组织化学, 单细胞测序 | NA | 组织 | 1475个组织核心样本 |
| 124 | 2024-08-09 |
Molecular identification of Cryptococcus gattii from cerebrospinal fluid using single-cell sequencing: A case study
2020-10, The Journal of infection
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.jinf.2020.06.040
PMID:32590007
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术从脑脊液中鉴定出Cryptococcus gattii，为一名31岁男性隐球菌脑膜炎患者提供了病因诊断 | 这是首次使用单细胞测序技术在常规检测失败后检测并鉴定真菌病原体 | NA | 验证单细胞测序技术在临床样本中精确检测微观可见但无法培养的病原体的潜力 | Cryptococcus gattii真菌病原体 | NA | 隐球菌脑膜炎 | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | 一名患者 |
| 125 | 2024-08-09 |
Single-Cell Genomics and Epigenomics: Technologies and Applications in Plants
2020-10, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2020.04.016
PMID:32532595
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研究论文 | 本文综述了单细胞基因组学和表观基因组学技术及其在植物生物学中的应用 | 介绍了单细胞测序技术在基因组学和表观基因组学领域的最新进展，这些技术能够解析细胞异质性，为多生物过程提供新的研究途径 | 传统的批量分析方法通过提供平均信息来稀释细胞特异性信息，从而限制了基因组学和功能基因组学研究的分辨率 | 探讨单细胞基因组学和表观基因组学技术在植物生物学中的应用及其潜在意义和未来展望 | 植物生物学中的细胞异质性和多生物过程 | 基因组学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 基因组和表观基因组数据 | NA |
| 126 | 2024-08-09 |
Mapping developmental trajectories and subtype diversity of normal and glaucomatous human retinal ganglion cells by single-cell transcriptome analysis
2020-10-01, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3238
PMID:32557945
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析，研究了正常和青光眼患者视网膜神经节细胞（RGCs）的发育轨迹和亚型多样性 | 使用疾病模型干细胞研究RGCs对青光眼退化的发育易感性，并分析了SIX6风险等位基因对RGCs发育和亚型组成的影响 | 目前尚未提及 | 探讨RGCs对青光眼退化的发育易感性，为治疗策略的制定提供信息 | 正常和青光眼患者的视网膜神经节细胞（RGCs） | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 特定于SIX6风险等位基因的青光眼患者和对照组的hRGCs样本 |
| 127 | 2024-08-09 |
Distinct immune evasion in APOBEC-enriched, HPV-negative HNSCC
2020-10-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.33123
PMID:32468570
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研究论文 | 研究分析了APOBEC富集的HPV阴性头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的免疫逃避机制 | 识别了APOBEC富集的HPV阴性HNSCC亚组，该亚组显示出更高的T细胞炎症和免疫检查点表达，可能介导对免疫治疗的反应 | 研究样本量相对较小，需要进一步的大规模验证 | 探索头颈部鳞状细胞癌中免疫检查点抑制剂反应的生物标志物 | APOBEC富集的HPV阴性头颈部鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 全外显子测序和RNA测序 | NA | 基因表达数据 | TCGA数据集496例，验证集10例，单细胞基因表达数据17例HPV阴性HNSCC |
| 128 | 2024-08-09 |
Prokaryotic single-cell RNA sequencing by in situ combinatorial indexing
2020-10, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-020-0729-6
PMID:32451472
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PETRI-seq的低成本、高通量的原核单细胞RNA测序技术，该技术通过原位组合索引技术克服了原核细胞mRNA含量极低、缺乏mRNA多聚腺苷酸化和细胞壁厚等技术障碍 | PETRI-seq技术能够高效地捕获革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的单细胞转录组，具有高纯度和低偏差，为区分不同生长阶段的细胞状态提供了强有力的工具 | NA | 开发一种适用于原核细胞的单细胞RNA测序技术，以研究原核生物的转录异质性 | 革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的单细胞转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数万个细胞 |
| 129 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of Calvarial and Long-Bone Endocortical Cells
2020-10, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4052
PMID:32427356
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术（scRNA-Seq）研究了环境及药物扰动对成骨细胞的影响，并通过比较新鲜分离细胞与体外培养细胞的细胞类型丰度和转录组，揭示了体内外细胞异质性的显著差异。 | 本文首次使用scRNA-Seq技术检测了环境及药物扰动对成骨细胞的影响，并揭示了体内外细胞异质性的显著差异。 | 由于仅7%的测序内皮质细胞为成骨细胞，且仅采样了其转录组的一小部分，因此可能无法检测到基因表达的微小变化。 | 研究环境及药物扰动对成骨细胞的影响，并揭示体内外细胞异质性的差异。 | 新生鼠颅骨细胞和长骨内皮质细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组 | 新鲜分离的颅骨细胞和体外培养12天的细胞，以及接受载体或硬化素中和抗体治疗1周的小鼠新鲜回收的长骨内皮质细胞。 |
| 130 | 2024-08-09 |
Spatially Resolved Transcriptomes-Next Generation Tools for Tissue Exploration
2020-10, BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology
IF:3.2Q1
DOI:10.1002/bies.201900221
PMID:32363691
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综述 | 本文综述了空间分辨转录组学领域的最新进展及其在探索复杂多细胞生物系统中的应用 | 介绍了多种旨在结合基因表达数据与空间信息的新技术 | 目前尚无单一方法能解决所有关键参数，如敏感性、劳动强度、组织类型依赖性和获取详细单细胞信息的有限能力 | 探讨空间转录组学方法的应用及其优缺点，并展望该领域的未来发展 | 空间转录组学方法及其在生物系统研究中的应用 | 转录组学 | NA | 空间分辨转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 131 | 2024-08-09 |
The origin, fate and function of macrophages in the peripheral nervous system-an update
2020-10-20, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxaa030
PMID:32322888
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研究论文 | 本文综述了近年来巨噬细胞生物学领域的进展，特别是关于外周神经系统中巨噬细胞的起源、命运和功能 | 利用Cre/loxP为基础的转基因小鼠模型和高通量技术如bulk RNA测序和单细胞RNA测序，首次详细描述了特定巨噬细胞群体的发育和功能 | 外周神经系统中的巨噬细胞群体尚未得到详细研究 | 探讨外周神经系统中巨噬细胞的发育、异质性和基因表达特征 | 外周神经系统中的巨噬细胞 | NA | NA | Cre/loxP为基础的转基因小鼠模型、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 转基因小鼠模型 |
| 132 | 2024-08-09 |
Identification of differentially expressed genes in lung adenocarcinoma cells using single-cell RNA sequencing not detected using traditional RNA sequencing and microarray
2020-10, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1038/s41374-020-0428-1
PMID:32327726
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术在肺腺癌细胞中识别出传统RNA测序和微阵列技术未能检测到的差异表达基因 | 本研究首次使用10× genomics单细胞RNA测序技术在肺腺癌细胞中识别出传统技术未能检测到的差异表达基因，并探讨了这些基因与肺腺癌生存的关系 | 本研究仅限于肺腺癌细胞，且样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别肺腺癌细胞中的差异表达基因，并探讨其与癌症进展的关系 | 肺腺癌细胞和正常肺细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 159,219个细胞和594个样本 |
| 133 | 2024-08-09 |
Environmental Carcinogenesis at the Single-Cell Level
2020-10, Cancer epidemiology, biomarkers & prevention : a publication of the American Association for Cancer Research, cosponsored by the American Society of Preventive Oncology
DOI:10.1158/1055-9965.EPI-19-1364
PMID:32132147
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研究论文 | 本文探讨了环境化学物质如何导致癌症的机制，并提出使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）来更有效地捕捉这些化学物质的微妙和复杂影响 | 提出使用scRNA-seq技术来研究环境化学物质对基因表达的影响，以及这些化合物如何影响细胞间的信号传导和相互作用 | 传统的流行病学相关性分析、细胞实验和动物模型无法全面检查细胞异质性和组织选择性影响 | 阐明环境化学物质导致癌症的机制 | 环境化学物质对不同细胞类型的选择性作用及其对细胞微环境的影响 | 数字病理学 | 癌症 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 134 | 2024-08-09 |
Atherosclerosis: Insights into Vascular Pathobiology and Outlook to Novel Treatments
2020-10, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-020-09961-y
PMID:32072564
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研究论文 | 总结了动脉粥样硬化的病理生物学及其当前和潜在的未来治疗方法，特别关注了三种核心细胞类型：内皮细胞、巨噬细胞和血管平滑肌细胞 | 介绍了通过单细胞RNA测序技术对内皮细胞和巨噬细胞进行表征，以及未来治疗选项如疫苗接种、TRAF-STOPs、衰老分解或CD47阻断 | NA | 探讨动脉粥样硬化的病理生物学机制及未来治疗方法 | 内皮细胞、巨噬细胞和血管平滑肌细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |