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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-09 |
Prioritizing Candidates of Post-Myocardial Infarction Heart Failure Using Plasma Proteomics and Single-Cell Transcriptomics
2020-10-13, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究利用血浆蛋白质组学和单细胞转录组学技术,优先筛选与心肌梗死后心力衰竭相关的候选蛋白 | 结合大规模人类血浆蛋白质组学与无偏倚心脏单细胞分辨率转录组学,优先筛选与心肌梗死后心力衰竭相关的蛋白候选物 | NA | 旨在通过分析血浆蛋白和基因表达,发现新的生物标志物和药物靶点候选物 | 心肌梗死后心力衰竭相关的血浆蛋白及其基因表达 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 基于适配体的亲和捕获血浆蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据 | 新西兰队列包括181名心肌梗死后患者和250名无事件患者,新加坡队列包括223名心肌梗死后患者 | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2024-08-09 |
Massively parallel and time-resolved RNA sequencing in single cells with scNT-seq
2020-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-0935-4
PMID:32868927
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scNT-seq的新方法,用于从单个细胞中大规模并行分析新转录和预存的mRNA | scNT-seq方法通过滴液微流控技术,高效地标记新转录的mRNA,并能同时分析新旧转录组 | NA | 揭示时间分辨的转录因子活性和细胞状态轨迹,以及在特定细胞状态下RNA生物合成和降解的速率 | 单个细胞中的新转录和预存mRNA | 基因组学 | NA | scNT-seq | NA | RNA序列 | 约55,000个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 103 | 2024-08-09 |
Two Tales of Single-Cell RNA Sequencing: Gene Expression and Alternative Splicing in Mouse Kidney Development
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020081180
PMID:32883701
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2024-08-09 |
SARS-CoV-2 Entry Factors: ACE2 and TMPRSS2 Are Expressed in Peri-Implantation Embryos and the Maternal-Fetal Interface
2020-Oct, Engineering (Beijing, China)
DOI:10.1016/j.eng.2020.07.013
PMID:32837754
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研究论文 | 本文探讨了SARS-CoV-2进入因子ACE2和TMPRSS2在胚胎植入期和母胎界面中的表达模式 | 首次利用单细胞转录组数据分析了ACE2和TMPRSS2在不同发育阶段的胚胎和母胎界面细胞中的表达情况,揭示了SARS-CoV-2感染的潜在风险 | 研究依赖于已发表的单细胞转录组数据,可能存在样本选择偏差 | 研究SARS-CoV-2垂直传播的潜在风险 | 胚胎植入期的胚胎和母胎界面细胞 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 包括6天胚胎滋养层细胞、8周妊娠期的合体滋养层细胞和24周妊娠期的外胚层滋养层细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 105 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals the regenerative potential of thyroid follicular epithelial cells in metastatic thyroid carcinoma
2020-10-22, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2020.06.050
PMID:32811644
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了甲状腺癌转移中甲状腺滤泡上皮细胞的再生潜能 | 发现了一组罕见的表达干细胞样基因的甲状腺滤泡上皮细胞,并证实这些细胞在甲状腺癌转移再生中起重要作用 | NA | 探讨甲状腺癌转移中甲状腺滤泡上皮细胞的再生机制 | 甲状腺癌转移中的甲状腺滤泡上皮细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及小鼠和人体样本 | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-09 |
Dynamics of Cardiac Neutrophil Diversity in Murine Myocardial Infarction
2020-10-09, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.317200
PMID:32811295
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研究论文 | 研究了小鼠心肌梗死后血液和心脏中中性粒细胞多样性的动态变化 | 首次在单细胞水平上详细描述了心肌梗死后中性粒细胞多样性和基因表达的动态变化,并揭示了缺血心脏中中性粒细胞局部组织特异性的过程 | NA | 描述心肌梗死后循环和心脏中性粒细胞多样性的动态变化 | 小鼠心肌梗死后血液和心脏中的中性粒细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学结合细胞表面表位检测 | NA | 转录组数据 | 在心肌梗死后第1天、第3天和第5天收集的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 107 | 2024-08-09 |
A cell atlas of adult muscle precursors uncovers early events in fibre-type divergence in Drosophila
2020-10-05, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.201949555
PMID:32815271
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序实验构建了果蝇第三龄幼虫翅盘相关肌细胞前体的细胞图谱,揭示了间接飞行肌和直接飞行肌肌细胞前体在转录水平上的早期分化事件 | 首次揭示了果蝇间接飞行肌和直接飞行肌肌细胞前体的不同转录特征,并发现了新的肌细胞分化标记基因Amalgam | NA | 理解果蝇肌肉多样化的早期转录事件 | 果蝇的间接飞行肌和直接飞行肌肌细胞前体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 第三龄幼虫翅盘相关肌细胞前体 | NA | NA | NA | NA |
| 108 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-sequencing reports growth-condition-specific global transcriptomes of individual bacteria
2020-10, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-020-0774-1
PMID:32807892
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研究论文 | 本文利用改进的poly(A)-independent单细胞RNA测序技术,捕捉了Salmonella和Pseudomonas细菌在不同生长条件下的全基因组转录谱 | 首次成功应用单细胞RNA测序技术于原核生物,实现了对个体细菌在不同生长条件下的全基因组转录谱的准确捕捉 | 目前仅限于Salmonella和Pseudomonas两种细菌,对其他细菌种类的适用性有待验证 | 研究细菌在不同生长条件下的转录异质性,为理解细菌的表型多样性提供参考 | Salmonella和Pseudomonas细菌在不同生长条件下的转录谱 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 个体Salmonella和Pseudomonas细菌 | NA | NA | NA | NA |
| 109 | 2024-08-09 |
Analysis of circulating breast cancer cell heterogeneity and interactions with peripheral blood mononuclear cells
2020-10, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23242
PMID:32822091
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析乳腺癌患者循环肿瘤细胞与外周血单个核细胞的相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了循环肿瘤细胞的异质性及其与外周血单个核细胞的相互作用 | 研究样本仅来自乳腺癌患者,可能限制了结果的普遍性 | 揭示循环肿瘤细胞与外周血单个核细胞的相互作用,为预测疾病进展提供信息 | 乳腺癌患者的循环肿瘤细胞和外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自乳腺癌患者的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2024-08-09 |
Neuroinflammation at single cell level: What is new?
2020-10, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.3MR0620-035R
PMID:32779279
|
综述 | 本文综述了多发性硬化症(MS)及其模型实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)在单细胞水平上的最新研究进展,特别是通过CyTOF和单细胞RNA测序技术揭示的神经炎症机制。 | 利用CyTOF和单细胞RNA测序等新技术,深入探讨了MS/EAE中特定细胞群和关键分子在疾病发展中的作用。 | 文章主要集中在单细胞分析的最新发现上,未涵盖所有可能的研究方法和结果。 | 旨在通过单细胞分析技术,深入理解多发性硬化症和实验性自身免疫性脑脊髓炎的细胞和分子机制。 | 研究对象包括多发性硬化症患者和实验性自身免疫性脑脊髓炎模型中的血液及中枢神经系统浸润细胞。 | NA | 多发性硬化症 | CyTOF, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2024-08-09 |
Multiomic Analysis of Subtype Evolution and Heterogeneity in High-Grade Serous Ovarian Carcinoma
2020-10-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-0521
PMID:32747365
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研究论文 | 本研究通过综合分析绝对拷贝数和基因表达数据,结合单细胞分析,探讨了高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)亚型的演变和异质性 | 本研究采用了一种新颖的综合分析方法,结合单细胞测序技术,揭示了肿瘤细胞类型组成的广泛异质性 | 研究主要基于The Cancer Genome Atlas的数据和六个独立肿瘤的单细胞分析,可能存在样本选择的偏倚 | 探讨高级别浆液性卵巢癌亚型的演变和异质性,并评估基于转录组的肿瘤分组在治疗中的适用性 | 高级别浆液性卵巢癌的亚型演变和异质性 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 42,000个肿瘤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-09 |
A Transgenic System for Rapid Magnetic Enrichment of Rare Embryonic Cells
2020-10, Zebrafish
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/zeb.2020.1904
PMID:32749922
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研究论文 | 本研究介绍了一种新的转基因系统,用于快速从斑马鱼胚胎中富集稀有细胞,利用人表面抗原进行免疫结合和磁性排序 | 开发了一种新的转基因系统,通过人表面抗原进行免疫结合和磁性排序,实现了对斑马鱼胚胎中稀有细胞的快速富集 | NA | 解决在发育生物学中由于现有技术限制而导致的原始器官单细胞分析难题 | 斑马鱼胚胎中的稀有细胞,特别是新生造血干细胞/祖细胞和内皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 早期斑马鱼胚胎中的新生造血干细胞/祖细胞和内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2024-08-09 |
TLR4 signals through islet macrophages to alter cytokine secretion during diabetes
2020-10, The Journal of endocrinology
IF:3.4Q2
DOI:10.1530/JOE-20-0131
PMID:32755994
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研究论文 | 本研究探讨了TLR4通过胰岛巨噬细胞影响糖尿病中细胞因子分泌的机制 | 发现胰岛巨噬细胞是TLR4介导信号传导的主要来源,尤其是在糖尿病胰岛中 | 对TLR信号在胰岛内的具体细胞来源仍了解不足 | 揭示TLR信号在胰岛内的具体细胞来源及其在糖尿病中的作用,以寻找新的治疗靶点 | 健康和肥胖糖尿病小鼠的胰腺胰岛 | 免疫学 | 糖尿病 | 免疫染色技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 健康和肥胖糖尿病小鼠的胰岛,以及人类胰岛 | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2024-08-09 |
Integration of GWAS Summary Statistics and Gene Expression Reveals Target Cell Types Underlying Kidney Function Traits
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020010051
PMID:32764137
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研究论文 | 本文通过整合全基因组关联研究(GWAS)的总结数据和基因表达数据,揭示了与肾脏功能特征相关的目标细胞类型。 | 本文采用了一种新颖的计算方法,通过整合RNA-seq数据和GWAS总结数据,无偏差地识别与特征相关的组织和细胞类型。 | NA | 本文旨在通过整合GWAS统计数据和基因表达数据,识别与肾脏功能特征相关的组织和细胞类型,为进一步的机制研究提供基础。 | 研究对象包括eGFR、尿白蛋白肌酐比(UACR)、BUN和血清尿酸的GWAS总结数据,以及来自人类和鼠类的五个肾脏单细胞RNA-seq数据集和微切割的管状RNA-seq数据集。 | 基因组学 | 肾脏疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及53个组织的RNA-seq数据,以及人类和鼠类的五个肾脏单细胞RNA-seq数据集和微切割的管状RNA-seq数据集。 | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-08-09 |
A committed tissue-resident memory T cell precursor within the circulating CD8+ effector T cell pool
2020-10-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20191711
PMID:32728699
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研究论文 | 本文通过谱系追踪和单细胞转录组分析,研究了组织驻留记忆T细胞(TRM)的起源及其与其他CD8+ T细胞亚群的关系 | 首次证明了在循环TEFF细胞中存在具有形成TRM高度能力的T细胞克隆,并揭示了TRM命运决定的早期阶段 | NA | 探讨组织驻留记忆T细胞的起源及其与其他CD8+ T细胞亚群的关系 | 组织驻留记忆T细胞(TRM)及其前体细胞 | 免疫学 | NA | 谱系追踪、单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 116 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis of the Akimba mouse retina reveals cell-type-specific insights into the pathobiology of diabetic retinopathy
2020-10, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-020-05218-0
PMID:32734440
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析Akimba小鼠视网膜,揭示了糖尿病视网膜病变的细胞类型特异性病理生物学机制 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术,系统地绘制了糖尿病小鼠视网膜中不同细胞区室的转录变化,揭示了炎症、代谢和氧化应激介导的分子途径 | NA | 深入了解糖尿病视网膜病变的分子和细胞变化网络 | Akimba小鼠视网膜的细胞类型特异性转录变化 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 9474个视网膜细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing analysis of human kidney reveals the presence of ACE2 receptor: A potential pathway of COVID-19 infection
2020-10, Molecular genetics & genomic medicine
IF:1.5Q4
DOI:10.1002/mgg3.1442
PMID:32744436
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析人类肾脏,揭示了ACE2受体的存在,这可能是COVID-19感染的一个潜在途径 | 首次通过单细胞RNA测序技术在人类肾脏中发现ACE2受体的主要表达细胞,并揭示了SARS-Cov-2通过ACE2相关途径入侵肾脏组织的细胞证据 | NA | 分析SARS-Cov-2进入肾脏的潜在途径和细胞水平机制 | 人类肾脏中的ACE2受体表达细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2024-08-09 |
Notch activation in the mouse mammary luminal lineage leads to ductal hyperplasia and altered partitioning of luminal cell subtypes
2020-10-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2020.112156
PMID:32707133
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研究论文 | 本研究通过在小鼠乳腺腔上皮细胞系中表达激活形式的Notch1,分析了其对肿瘤形成和腔上皮细胞系转录组景观的影响 | 首次展示了Notch1 ICD在腔上皮细胞系中的表达导致导管增生和分支频率增加,并伴随腔细胞亚型分布的改变 | NA | 探讨Notch信号通路在乳腺异常增生和肿瘤发生中的作用 | 小鼠乳腺腔上皮细胞系 | NA | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及表达Notch1 ICD的小鼠和对照小鼠的乳腺细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2024-08-09 |
Tissue engineered corneal epithelium derived from clinical-grade human embryonic stem cells
2020-10, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2020.07.009
PMID:32710961
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研究论文 | 本文通过逐步诱导临床级人胚胎干细胞(hESCs)分化,构建了组织工程角膜上皮,并研究了分化过程中的动态基因表达谱和表型转变 | 首次成功诱导临床级hESCs分化为角膜上皮细胞,并通过scRNA-seq分析揭示了分化过程中与眼表上皮细胞系相关的基因上调及信号通路的激活 | NA | 研究临床级hESCs分化为角膜上皮的生物学过程及其在治疗角膜缘干细胞缺乏症中的应用潜力 | 临床级人胚胎干细胞(hESCs)分化为角膜上皮细胞的过程及其生物安全性 | NA | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用了临床级hESCs Q-CTS-hESC-1,并在兔角膜缘干细胞缺乏(LSCD)模型中进行了移植实验 | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2024-08-09 |
Status and Potential of Single-Cell Transcriptomics for Understanding Plant Development and Functional Biology
2020-10, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24196
PMID:32713117
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在植物发育和功能生物学研究中的现状、挑战和潜力 | 单细胞转录组学技术能够以微观分辨率增强我们对基因表达复杂性的理解,并有望彻底改变我们表征复杂细胞集合体和研究其空间组织、动态、克隆分布、途径、功能和网络的方式 | 单细胞组学在植物研究中的应用才刚刚开始 | 探讨单细胞转录组学技术在植物发育和功能生物学中的应用潜力 | 植物的发育和功能生物学 | 转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |