单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
101	2024-08-09	A single-cell transcriptome atlas of marsupial embryogenesis and X inactivation 2020-10, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-020-2629-6 PMID:32814901	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析了有袋类动物灰短尾负鼠的胚胎发育和X染色体失活过程	首次对有袋类动物进行单细胞RNA测序研究，揭示了早期X染色体失活和印迹X染色体失活的机制	NA	探索有袋类动物胚胎发育和X染色体失活的分子机制	有袋类动物灰短尾负鼠的胚胎	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
102	2024-08-09	Analysis of circulating breast cancer cell heterogeneity and interactions with peripheral blood mononuclear cells 2020-10, Molecular carcinogenesis IF:3.0Q2 DOI:10.1002/mc.23242 PMID:32822091	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序技术分析乳腺癌患者循环肿瘤细胞与外周血单个核细胞的相互作用	首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了循环肿瘤细胞的异质性及其与外周血单个核细胞的相互作用	研究样本仅来自乳腺癌患者，可能限制了结果的普遍性	揭示循环肿瘤细胞与外周血单个核细胞的相互作用，为预测疾病进展提供信息	乳腺癌患者的循环肿瘤细胞和外周血单个核细胞	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	来自乳腺癌患者的外周血样本
103	2024-08-09	Neuroinflammation at single cell level: What is new? 2020-10, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1002/JLB.3MR0620-035R PMID:32779279	综述	本文综述了多发性硬化症（MS）及其模型实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）在单细胞水平上的最新研究进展，特别是通过CyTOF和单细胞RNA测序技术揭示的神经炎症机制。	利用CyTOF和单细胞RNA测序等新技术，深入探讨了MS/EAE中特定细胞群和关键分子在疾病发展中的作用。	文章主要集中在单细胞分析的最新发现上，未涵盖所有可能的研究方法和结果。	旨在通过单细胞分析技术，深入理解多发性硬化症和实验性自身免疫性脑脊髓炎的细胞和分子机制。	研究对象包括多发性硬化症患者和实验性自身免疫性脑脊髓炎模型中的血液及中枢神经系统浸润细胞。	NA	多发性硬化症	CyTOF, 单细胞RNA测序	NA	细胞	具体样本数量未在摘要中提及
104	2024-08-09	Stromal cell diversity associated with immune evasion in human triple-negative breast cancer 2020-10-01, The EMBO journal DOI:10.15252/embj.2019104063 PMID:32790115	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了五种人类三阴性乳腺癌（TNBC）中的基质细胞多样性，揭示了与免疫逃避相关的不同基质细胞亚群	首次详细描述了TNBC中基质细胞的异质性，并展示了这些基质细胞亚群在调节细胞外基质和免疫反应中的独特功能	研究样本量较小，仅包括五种TNBC，可能影响结果的普遍性	探究三阴性乳腺癌中基质细胞的多样性及其与免疫逃避的关系	三阴性乳腺癌中的基质细胞	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	五种三阴性乳腺癌样本
105	2024-08-09	Multiomic Analysis of Subtype Evolution and Heterogeneity in High-Grade Serous Ovarian Carcinoma 2020-10-15, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-0521 PMID:32747365	研究论文	本研究通过综合分析绝对拷贝数和基因表达数据，结合单细胞分析，探讨了高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）亚型的演变和异质性	本研究采用了一种新颖的综合分析方法，结合单细胞测序技术，揭示了肿瘤细胞类型组成的广泛异质性	研究主要基于The Cancer Genome Atlas的数据和六个独立肿瘤的单细胞分析，可能存在样本选择的偏倚	探讨高级别浆液性卵巢癌亚型的演变和异质性，并评估基于转录组的肿瘤分组在治疗中的适用性	高级别浆液性卵巢癌的亚型演变和异质性	数字病理学	卵巢癌	单细胞测序	NA	基因表达数据	42,000个肿瘤细胞
106	2024-08-09	A Transgenic System for Rapid Magnetic Enrichment of Rare Embryonic Cells 2020-10, Zebrafish IF:1.4Q2 DOI:10.1089/zeb.2020.1904 PMID:32749922	研究论文	本研究介绍了一种新的转基因系统，用于快速从斑马鱼胚胎中富集稀有细胞，利用人表面抗原进行免疫结合和磁性排序	开发了一种新的转基因系统，通过人表面抗原进行免疫结合和磁性排序，实现了对斑马鱼胚胎中稀有细胞的快速富集	NA	解决在发育生物学中由于现有技术限制而导致的原始器官单细胞分析难题	斑马鱼胚胎中的稀有细胞，特别是新生造血干细胞/祖细胞和内皮细胞	发育生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	细胞	早期斑马鱼胚胎中的新生造血干细胞/祖细胞和内皮细胞
107	2024-08-09	TLR4 signals through islet macrophages to alter cytokine secretion during diabetes 2020-10, The Journal of endocrinology IF:3.4Q2 DOI:10.1530/JOE-20-0131 PMID:32755994	研究论文	本研究探讨了TLR4通过胰岛巨噬细胞影响糖尿病中细胞因子分泌的机制	发现胰岛巨噬细胞是TLR4介导信号传导的主要来源，尤其是在糖尿病胰岛中	对TLR信号在胰岛内的具体细胞来源仍了解不足	揭示TLR信号在胰岛内的具体细胞来源及其在糖尿病中的作用，以寻找新的治疗靶点	健康和肥胖糖尿病小鼠的胰腺胰岛	免疫学	糖尿病	免疫染色技术	NA	单细胞RNA测序数据	健康和肥胖糖尿病小鼠的胰岛，以及人类胰岛
108	2024-08-09	A Widespread Neurogenic Potential of Neocortical Astrocytes Is Induced by Injury 2020-10-01, Cell stem cell IF:19.8Q1 DOI:10.1016/j.stem.2020.07.006 PMID:32758425	研究论文	本研究探讨了损伤如何诱导非神经发生区域的星形胶质细胞产生新的神经元	首次展示了Notch信号缺失的星形胶质细胞在损伤后能够生成新的神经元，并揭示了星形胶质细胞向神经干细胞样状态转变的分子机制	NA	研究星形胶质细胞在损伤后的神经发生潜力及其分子调控机制	星形胶质细胞的神经发生潜力	神经科学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA序列	NA
109	2024-08-09	Integration of GWAS Summary Statistics and Gene Expression Reveals Target Cell Types Underlying Kidney Function Traits 2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1 DOI:10.1681/ASN.2020010051 PMID:32764137	研究论文	本文通过整合全基因组关联研究（GWAS）的总结数据和基因表达数据，揭示了与肾脏功能特征相关的目标细胞类型。	本文采用了一种新颖的计算方法，通过整合RNA-seq数据和GWAS总结数据，无偏差地识别与特征相关的组织和细胞类型。	NA	本文旨在通过整合GWAS统计数据和基因表达数据，识别与肾脏功能特征相关的组织和细胞类型，为进一步的机制研究提供基础。	研究对象包括eGFR、尿白蛋白肌酐比（UACR）、BUN和血清尿酸的GWAS总结数据，以及来自人类和鼠类的五个肾脏单细胞RNA-seq数据集和微切割的管状RNA-seq数据集。	基因组学	肾脏疾病	RNA-seq	NA	基因表达数据	涉及53个组织的RNA-seq数据，以及人类和鼠类的五个肾脏单细胞RNA-seq数据集和微切割的管状RNA-seq数据集。
110	2024-08-09	A committed tissue-resident memory T cell precursor within the circulating CD8+ effector T cell pool 2020-10-05, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20191711 PMID:32728699	研究论文	本文通过谱系追踪和单细胞转录组分析，研究了组织驻留记忆T细胞（TRM）的起源及其与其他CD8+ T细胞亚群的关系	首次证明了在循环TEFF细胞中存在具有形成TRM高度能力的T细胞克隆，并揭示了TRM命运决定的早期阶段	NA	探讨组织驻留记忆T细胞的起源及其与其他CD8+ T细胞亚群的关系	组织驻留记忆T细胞（TRM）及其前体细胞	免疫学	NA	谱系追踪、单细胞转录组分析	NA	转录组数据	NA
111	2024-08-09	Single-cell transcriptome analysis of the Akimba mouse retina reveals cell-type-specific insights into the pathobiology of diabetic retinopathy 2020-10, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-020-05218-0 PMID:32734440	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析Akimba小鼠视网膜，揭示了糖尿病视网膜病变的细胞类型特异性病理生物学机制	本研究首次通过单细胞RNA测序技术，系统地绘制了糖尿病小鼠视网膜中不同细胞区室的转录变化，揭示了炎症、代谢和氧化应激介导的分子途径	NA	深入了解糖尿病视网膜病变的分子和细胞变化网络	Akimba小鼠视网膜的细胞类型特异性转录变化	数字病理学	糖尿病视网膜病变	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	9474个视网膜细胞
112	2024-08-09	LIM-Nebulette Reinforces Podocyte Structural Integrity by Linking Actin and Vimentin Filaments 2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1 DOI:10.1681/ASN.2019121261 PMID:32737144	研究论文	本研究探讨了LIM-nebulette蛋白在维持足细胞结构完整性中的作用，通过连接肌动蛋白和波形蛋白纤维来强化足细胞的形态	首次揭示了LIM-nebulette蛋白在足细胞中的多功能作用，特别是在重塑粘着斑、肌动蛋白细胞骨架和中间丝中的关键作用	研究主要集中在动物模型和体外细胞实验，可能需要进一步的人体临床研究来验证其临床相关性	探究LIM-nebulette蛋白在维持足细胞结构完整性中的作用及其对肾病的影响	使用大鼠、小鼠和人类的细胞来研究足细胞的细胞骨架配置和LIM-nebulette蛋白的表达	NA	肾病	单细胞RNA测序、免疫金标记、高含量成像、超分辨率显微镜、原子力显微镜(AFM)、活细胞钙成像	NA	图像	涉及大鼠、小鼠和人类的多组细胞样本
113	2024-08-09	Single-cell RNA sequencing analysis of human kidney reveals the presence of ACE2 receptor: A potential pathway of COVID-19 infection 2020-10, Molecular genetics & genomic medicine IF:1.5Q4 DOI:10.1002/mgg3.1442 PMID:32744436	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析人类肾脏，揭示了ACE2受体的存在，这可能是COVID-19感染的一个潜在途径	首次通过单细胞RNA测序技术在人类肾脏中发现ACE2受体的主要表达细胞，并揭示了SARS-Cov-2通过ACE2相关途径入侵肾脏组织的细胞证据	NA	分析SARS-Cov-2进入肾脏的潜在途径和细胞水平机制	人类肾脏中的ACE2受体表达细胞	数字病理学	COVID-19	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	NA
114	2024-08-09	Notch activation in the mouse mammary luminal lineage leads to ductal hyperplasia and altered partitioning of luminal cell subtypes 2020-10-01, Experimental cell research IF:3.3Q2 DOI:10.1016/j.yexcr.2020.112156 PMID:32707133	研究论文	本研究通过在小鼠乳腺腔上皮细胞系中表达激活形式的Notch1，分析了其对肿瘤形成和腔上皮细胞系转录组景观的影响	首次展示了Notch1 ICD在腔上皮细胞系中的表达导致导管增生和分支频率增加，并伴随腔细胞亚型分布的改变	NA	探讨Notch信号通路在乳腺异常增生和肿瘤发生中的作用	小鼠乳腺腔上皮细胞系	NA	乳腺癌	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	涉及表达Notch1 ICD的小鼠和对照小鼠的乳腺细胞
115	2024-08-09	Tissue engineered corneal epithelium derived from clinical-grade human embryonic stem cells 2020-10, The ocular surface DOI:10.1016/j.jtos.2020.07.009 PMID:32710961	研究论文	本文通过逐步诱导临床级人胚胎干细胞（hESCs）分化，构建了组织工程角膜上皮，并研究了分化过程中的动态基因表达谱和表型转变	首次成功诱导临床级hESCs分化为角膜上皮细胞，并通过scRNA-seq分析揭示了分化过程中与眼表上皮细胞系相关的基因上调及信号通路的激活	NA	研究临床级hESCs分化为角膜上皮的生物学过程及其在治疗角膜缘干细胞缺乏症中的应用潜力	临床级人胚胎干细胞（hESCs）分化为角膜上皮细胞的过程及其生物安全性	NA	角膜疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	使用了临床级hESCs Q-CTS-hESC-1，并在兔角膜缘干细胞缺乏（LSCD）模型中进行了移植实验
116	2024-08-09	Status and Potential of Single-Cell Transcriptomics for Understanding Plant Development and Functional Biology 2020-10, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology DOI:10.1002/cyto.a.24196 PMID:32713117	综述	本文综述了单细胞转录组学在植物发育和功能生物学研究中的现状、挑战和潜力	单细胞转录组学技术能够以微观分辨率增强我们对基因表达复杂性的理解，并有望彻底改变我们表征复杂细胞集合体和研究其空间组织、动态、克隆分布、途径、功能和网络的方式	单细胞组学在植物研究中的应用才刚刚开始	探讨单细胞转录组学技术在植物发育和功能生物学中的应用潜力	植物的发育和功能生物学	转录组学	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
117	2024-08-09	Hemolysis transforms liver macrophages into antiinflammatory erythrophagocytes 2020-10-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI137282 PMID:32663195	研究论文	研究通过遗传性球形红细胞增多症的小鼠模型和单细胞RNA测序，发现溶血过程中肝脏巨噬细胞吞噬受损红细胞后转变为抗炎性红细胞吞噬细胞，从而减轻炎症性疾病的表现。	首次定义了MarcohiHmoxhiMHC class IIlo红细胞吞噬细胞的抗炎表型，并揭示了NFE2L2/NRF2转录因子在调控这一过程中的关键作用。	NA	探究溶血过程中肝脏巨噬细胞功能的变化及其在炎症性疾病中的作用。	肝脏巨噬细胞、红细胞吞噬细胞、炎症性疾病模型。	免疫学	肝脏疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠和人类巨噬细胞
118	2024-08-09	Association of Clonal Hematopoiesis of Indeterminate Potential With Inflammatory Gene Expression in Patients With Severe Degenerative Aortic Valve Stenosis or Chronic Postischemic Heart Failure 2020-10-01, JAMA cardiology IF:14.8Q1 DOI:10.1001/jamacardio.2020.2468 PMID:32639511	研究论文	本研究探讨了克隆性造血不确定潜能（CHIP）与严重退行性主动脉瓣狭窄或慢性缺血后心力衰竭患者炎症基因表达之间的关系。	首次研究了CHIP与心血管疾病患者单核细胞中炎症基因表达增加的关联。	样本量较小，需要进一步的大规模研究来验证结果。	确定CHIP是否与促进单核细胞加剧免疫反应的炎症基因表达有关。	严重退行性主动脉瓣狭窄或慢性缺血后心力衰竭患者及年龄匹配的健康对照者。	心血管疾病	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	8名严重退行性主动脉瓣狭窄患者，6名慢性缺血后心力衰竭患者，3名健康对照者。
119	2024-08-09	Pathway identification through transcriptome analysis 2020-10, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2020.109701 PMID:32649993	综述	本文综述了基于转录组学方法在多囊肾病（PKD）发病机制研究中的应用	介绍了最新的技术发展，如批量和单细胞RNA测序技术以及空间转录组学，为研究PKD提供了新的视角	目前对Pkd1失活后立即下游的转录级联反应了解较少	探讨转录组学方法在多囊肾病发病机制研究中的应用及未来机遇	多囊肾病（PKD）的发病机制	数字病理学	多囊肾病	RNA测序	NA	转录组数据	NA
120	2024-08-09	Quantitative planar array screen of 1000 proteins uncovers novel urinary protein biomarkers of lupus nephritis 2020-10, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1 DOI:10.1136/annrheumdis-2019-216312 PMID:32651195	研究论文	本研究通过定量平面蛋白质微阵列技术筛查1000种蛋白质，发现新的狼疮性肾炎尿液生物标志物。	采用定量平面蛋白质微阵列技术筛查大量蛋白质，发现新的尿液生物标志物，并验证其在独立队列中的有效性。	NA	发现新的狼疮性肾炎尿液生物标志物。	系统性红斑狼疮患者的尿液样本。	NA	自身免疫性疾病	定量平面蛋白质微阵列	NA	蛋白质	1000种蛋白质，多个独立队列的系统性红斑狼疮患者尿液样本。