单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 134 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-09 |
Identification of putative master regulators in rheumatoid arthritis synovial fibroblasts using gene expression data and network inference
2020-10-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-73147-4
PMID:33004899
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研究论文 | 本研究利用基因表达数据和网络推断方法，识别类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞中的潜在主调控因子 | 本研究首次识别了类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞中的五个特定主调控因子，并评估了它们的转录因子活性 | NA | 旨在表征类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞中的主调控转录因子，这些因子可能解释其表型特征 | 类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞中的主调控转录因子 | NA | 类风湿性关节炎 | 微阵列和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自类风湿性关节炎和骨关节炎患者的滑膜组织 |
| 82 | 2024-08-09 |
Defining the First Part of the Oncogenic KRAS Journey
2020-10-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.09.009
PMID:33007229
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研究论文 | 本文通过分析类器官培养、患者样本和鼠模型结合单细胞RNA测序技术，探讨了致癌KRAS激活的早期事件 | 结合多种技术手段，如类器官培养、患者样本分析和单细胞RNA测序，以深入研究KRAS突变相关的早期致癌过程 | NA | 阐明致癌KRAS激活的早期事件 | KRAS突变在人类癌症中的早期致癌过程 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及类器官培养、患者样本和鼠模型 |
| 83 | 2024-08-09 |
Onco-fetal Reprogramming of Endothelial Cells Drives Immunosuppressive Macrophages in Hepatocellular Carcinoma
2020-10-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.08.040
PMID:32976798
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细描述了从发育到疾病的人类肝脏细胞图谱，并揭示了肝细胞癌中肿瘤微环境的胎儿样重编程现象 | 首次报道了肝细胞癌中存在与胎儿肝脏相似的免疫抑制性胎儿癌生态系统，并提供了新的治疗干预靶点 | NA | 探索肝细胞癌中肿瘤微环境的胎儿样重编程现象及其机制 | 人类胎儿、肝细胞癌及小鼠肝脏的细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 约212,000个细胞 |
| 84 | 2024-08-09 |
Genetic landscape and autoimmunity of monocytes in developing Vogt-Koyanagi-Harada disease
2020-10-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2002476117
PMID:32989127
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研究论文 | 本研究利用先进的单细胞RNA测序技术，系统分析了11,259个人类循环单核细胞，并对其亚群进行了遗传学定义，揭示了Vogt-Koyanagi-Harada疾病相关单核细胞的精确分类、分子标记和信号通路 | 本研究首次揭示了两个先前未知的单核细胞亚群：HLA和巨核细胞样单核细胞亚群，并发现了与疾病相关的促炎单核细胞亚群，其基因表达特征指示炎症、抗病毒活性和病理性激活状态 | NA | 研究Vogt-Koyanagi-Harada疾病中单核细胞的遗传图谱和自身免疫机制 | 人类循环单核细胞及其在Vogt-Koyanagi-Harada疾病中的作用 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,259个人类循环单核细胞 |
| 85 | 2024-08-09 |
SpaGE: Spatial Gene Enhancement using scRNA-seq
2020-10-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa740
PMID:32955565
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaGE的方法，该方法通过整合空间和单细胞RNA测序数据集，预测空间配置中的全转录组表达。 | SpaGE方法能够解决单细胞RNA测序缺乏空间定位的问题，并且能够预测新的空间基因模式。 | NA | 开发一种方法，将空间和单细胞RNA测序数据集整合，以预测空间配置中的全转录组表达。 | 单细胞RNA测序数据及其空间定位。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了五个数据集对进行验证。 |
| 86 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of Tocilizumab-treated peripheral blood mononuclear cells as an in vitro model of inflammation
2020-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2020.09.11.281782
PMID:32935096
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了托珠单抗治疗前后外周血单个核细胞的表达变化，以此构建体外炎症模型，探讨托珠单抗对COVID-19相关细胞因子风暴的影响 | 利用单细胞RNA测序技术，首次在单细胞水平上展示了托珠单抗治疗后炎症相关基因和生物途径的表达减少 | 研究仅限于体外模型和特定人群（肾移植受者），需要进一步的临床试验验证 | 探讨托珠单抗在治疗COVID-19中的作用及其对细胞因子风暴的影响 | 托珠单抗治疗前后的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 87 | 2024-08-09 |
Transcription factor expression defines subclasses of developing projection neurons highly similar to single-cell RNA-seq subtypes
2020-10-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2008013117
PMID:32948690
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研究论文 | 本文研究了在小鼠大脑发育过程中，从胚胎第13天到出生后第5天，两类具有不同形态和功能特征的投射神经元的基因表达和染色质可及性，以识别分化神经元细胞命运的转录网络 | 本文通过深度测序识别了具有密集亚类特异性调控和亚类富集转录因子结合基序的转录因子组，并描述了定义每个亚类的转录因子相邻长非编码RNA | NA | 旨在理解大脑皮层中细胞类型多样化的机制及其与功能的关系 | 小鼠大脑中两类投射神经元的基因表达和染色质可及性 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 从小鼠大脑中分离的单细胞 |
| 88 | 2024-08-09 |
Circulating testican-2 is a podocyte-derived marker of kidney health
2020-10-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2009606117
PMID:32958645
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研究论文 | 本研究通过基于适配体的蛋白质组学方法，分析了22名接受侵入性采样个体的动脉到肾静脉的蛋白质梯度，发现testican-2是一个由足细胞衍生的肾脏健康标志物 | 首次发现testican-2作为足细胞衍生的肾脏健康标志物，并展示了其在临床上的应用潜力 | NA | 探究肾脏健康相关的生物标志物 | testican-2在肾脏健康中的作用 | NA | NA | 基于适配体的蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据 | 22名个体，Jackson Heart Study中的1928名非洲裔美国人，Framingham Heart Study中的1621名白人 |
| 89 | 2024-08-09 |
Reprogramming roadmap reveals route to human induced trophoblast stem cells
2020-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2734-6
PMID:32939092
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学重建了人类皮肤成纤维细胞的重编程轨迹，揭示了从体细胞到诱导多能干细胞及诱导滋养层干细胞的重编程过程。 | 本文首次揭示了重编程过程中滋养层细胞特异性调控程序的作用，并成功诱导出与天然滋养层干细胞分子和功能相似的诱导滋养层干细胞。 | NA | 探讨人类体细胞重编程为多能干细胞及滋养层干细胞的分子机制。 | 人类皮肤成纤维细胞的重编程过程及诱导滋养层干细胞的生成。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 90 | 2024-08-09 |
Endosialin defines human stem Leydig cells with regenerative potential
2020-10-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaa174
PMID:32951040
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研究论文 | 本文研究了内皮素作为人类干细胞莱迪细胞（SLCs）的特异性标记物，并探讨了其在体外和体内分化为产生睾酮的莱迪细胞（LCs）的能力 | 内皮素被证明是人类SLCs的特异性标记物，相比于PDGFRα和NGFR，具有更高的特异性 | 由于人类睾丸组织收集困难，样本量有限。内皮素对SLCs的功能需要在未来的研究中进一步阐明 | 确定内皮素是否为人类SLCs的特异性标记物，并研究其在体外和体内分化为功能性LCs的潜力 | 人类干细胞莱迪细胞（SLCs）及其分化为产生睾酮的莱迪细胞（LCs）的能力 | NA | NA | 单细胞测序分析，免疫荧光和流式细胞术 | NA | 细胞 | 四个人类供体的睾丸组织 |
| 91 | 2024-08-09 |
A map of human breast cancer: new players in stromal-immune crosstalk
2020-10-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020106368
PMID:32909627
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了人乳腺癌中的间质细胞，并发现了新的间质间充质细胞亚群 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术揭示了乳腺癌中间质间充质细胞的新亚群及其独特的转录组特征、组织定位和相关的免疫微环境 | NA | 探索乳腺癌中间质-免疫相互作用的新参与者 | 人乳腺癌中的间质间充质细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 92 | 2024-08-09 |
Prioritizing Candidates of Post-Myocardial Infarction Heart Failure Using Plasma Proteomics and Single-Cell Transcriptomics
2020-10-13, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究利用血浆蛋白质组学和单细胞转录组学技术，优先筛选与心肌梗死后心力衰竭相关的候选蛋白 | 结合大规模人类血浆蛋白质组学与无偏倚心脏单细胞分辨率转录组学，优先筛选与心肌梗死后心力衰竭相关的蛋白候选物 | NA | 旨在通过分析血浆蛋白和基因表达，发现新的生物标志物和药物靶点候选物 | 心肌梗死后心力衰竭相关的血浆蛋白及其基因表达 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 基于适配体的亲和捕获血浆蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据 | 新西兰队列包括181名心肌梗死后患者和250名无事件患者，新加坡队列包括223名心肌梗死后患者 |
| 93 | 2024-08-09 |
Massively parallel and time-resolved RNA sequencing in single cells with scNT-seq
2020-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-0935-4
PMID:32868927
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scNT-seq的新方法，用于从单个细胞中大规模并行分析新转录和预存的mRNA | scNT-seq方法通过滴液微流控技术，高效地标记新转录的mRNA，并能同时分析新旧转录组 | NA | 揭示时间分辨的转录因子活性和细胞状态轨迹，以及在特定细胞状态下RNA生物合成和降解的速率 | 单个细胞中的新转录和预存mRNA | 基因组学 | NA | scNT-seq | NA | RNA序列 | 约55,000个单细胞 |
| 94 | 2024-08-09 |
Two Tales of Single-Cell RNA Sequencing: Gene Expression and Alternative Splicing in Mouse Kidney Development
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020081180
PMID:32883701
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-09 |
T-cell repertoire analysis and metrics of diversity and clonality
2020-10, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2020.07.010
PMID:32889231
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研究论文 | 本文介绍了T细胞受体（TCR）的批量和单细胞测序技术，讨论了基于共享结构基序的TCR谱系聚类和特异性预测的计算工具，并回顾了谱系多样性和收敛性分析的主要指数。 | 本文介绍了新的计算工具，用于分析T细胞受体的多样性和特异性，这些工具可能成为个性化免疫治疗的潜在生物标志物。 | NA | 探讨T细胞受体谱系的复杂性和多样性，以及这些特性在健康和疾病中的应用。 | T细胞受体的多样性和特异性。 | 生物信息学 | NA | 高通量批量和单细胞测序技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 96 | 2024-08-09 |
SARS-CoV-2 Entry Factors: ACE2 and TMPRSS2 Are Expressed in Peri-Implantation Embryos and the Maternal-Fetal Interface
2020-Oct, Engineering (Beijing, China)
DOI:10.1016/j.eng.2020.07.013
PMID:32837754
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研究论文 | 本文探讨了SARS-CoV-2进入因子ACE2和TMPRSS2在胚胎植入期和母胎界面中的表达模式 | 首次利用单细胞转录组数据分析了ACE2和TMPRSS2在不同发育阶段的胚胎和母胎界面细胞中的表达情况，揭示了SARS-CoV-2感染的潜在风险 | 研究依赖于已发表的单细胞转录组数据，可能存在样本选择偏差 | 研究SARS-CoV-2垂直传播的潜在风险 | 胚胎植入期的胚胎和母胎界面细胞 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 包括6天胚胎滋养层细胞、8周妊娠期的合体滋养层细胞和24周妊娠期的外胚层滋养层细胞 |
| 97 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals the regenerative potential of thyroid follicular epithelial cells in metastatic thyroid carcinoma
2020-10-22, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2020.06.050
PMID:32811644
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了甲状腺癌转移中甲状腺滤泡上皮细胞的再生潜能 | 发现了一组罕见的表达干细胞样基因的甲状腺滤泡上皮细胞，并证实这些细胞在甲状腺癌转移再生中起重要作用 | NA | 探讨甲状腺癌转移中甲状腺滤泡上皮细胞的再生机制 | 甲状腺癌转移中的甲状腺滤泡上皮细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及小鼠和人体样本 |
| 98 | 2024-08-09 |
Dynamics of Cardiac Neutrophil Diversity in Murine Myocardial Infarction
2020-10-09, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.317200
PMID:32811295
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研究论文 | 研究了小鼠心肌梗死后血液和心脏中中性粒细胞多样性的动态变化 | 首次在单细胞水平上详细描述了心肌梗死后中性粒细胞多样性和基因表达的动态变化，并揭示了缺血心脏中中性粒细胞局部组织特异性的过程 | NA | 描述心肌梗死后循环和心脏中性粒细胞多样性的动态变化 | 小鼠心肌梗死后血液和心脏中的中性粒细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学结合细胞表面表位检测 | NA | 转录组数据 | 在心肌梗死后第1天、第3天和第5天收集的样本 |
| 99 | 2024-08-09 |
A cell atlas of adult muscle precursors uncovers early events in fibre-type divergence in Drosophila
2020-10-05, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.201949555
PMID:32815271
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序实验构建了果蝇第三龄幼虫翅盘相关肌细胞前体的细胞图谱，揭示了间接飞行肌和直接飞行肌肌细胞前体在转录水平上的早期分化事件 | 首次揭示了果蝇间接飞行肌和直接飞行肌肌细胞前体的不同转录特征，并发现了新的肌细胞分化标记基因Amalgam | NA | 理解果蝇肌肉多样化的早期转录事件 | 果蝇的间接飞行肌和直接飞行肌肌细胞前体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 第三龄幼虫翅盘相关肌细胞前体 |
| 100 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-sequencing reports growth-condition-specific global transcriptomes of individual bacteria
2020-10, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-020-0774-1
PMID:32807892
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研究论文 | 本文利用改进的poly(A)-independent单细胞RNA测序技术，捕捉了Salmonella和Pseudomonas细菌在不同生长条件下的全基因组转录谱 | 首次成功应用单细胞RNA测序技术于原核生物，实现了对个体细菌在不同生长条件下的全基因组转录谱的准确捕捉 | 目前仅限于Salmonella和Pseudomonas两种细菌，对其他细菌种类的适用性有待验证 | 研究细菌在不同生长条件下的转录异质性，为理解细菌的表型多样性提供参考 | Salmonella和Pseudomonas细菌在不同生长条件下的转录谱 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 个体Salmonella和Pseudomonas细菌 |