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当前共找到 134 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Highlights a Role for Neutrophils and Inflammatory Macrophages in the Pathogenesis of Severe COVID-19
2020-10-29, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells9112374
PMID:33138195
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研究论文 | 本研究利用迭代聚类和引导基因选择2（ICGS2）以及统一流形逼近和投影（UMAP）降维计算算法，分析了来自两名健康受试者和三名轻度及五名重度COVID-19患者的68,873个单细胞的公开数据集，揭示了中性粒细胞和巨噬细胞集群1在重度COVID-19发病机制中的作用 | 本研究首次详细描述了中性粒细胞和巨噬细胞集群1在重度COVID-19中的免疫细胞组成和基因特征，为诊断和治疗干预提供了新的可能性 | 研究主要基于公开数据集，样本量和数据来源可能限制了结果的普遍性 | 探讨免疫细胞亚群在COVID-19疾病严重程度中的作用 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液（BAL）中的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组分析 | ICGS2, UMAP | 单细胞转录组数据 | 68,873个单细胞，来自两名健康受试者、三名轻度COVID-19患者和五名重度COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-09 |
Nuclear gene proximity and protein interactions shape transcript covariations in mammalian single cells
2020-10-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19011-5
PMID:33116115
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研究论文 | 本文研究了哺乳动物单细胞中基因共表达模式的形成机制 | 首次提供了miRNAs自然诱导转录组广泛共变的证据，并比较了核组织、转录和转录后调控在定义共变中的相对重要性 | NA | 探讨基因共变在哺乳动物单细胞中的形成机制及其生物学意义 | 小鼠胚胎干细胞中的基因共变网络 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数千对内在共变基因 | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-09 |
Cell Dissociation from Butterfly Pupal Wing Tissues for Single-Cell RNA Sequencing
2020-Oct-28, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps3040072
PMID:33126499
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研究论文 | 本文提供了一种从蝴蝶蛹翅组织中分离细胞以进行单细胞RNA测序的详细方案 | 利用单细胞测序技术研究蝴蝶翅鳞片细胞的基因表达模式，以识别产生不同颜色和鳞片结构的细胞类型 | 讨论了当前技术在研究单细胞鳞片发育方面的一些挑战 | 理解蝴蝶翅鳞片的基因表达模式和识别不同鳞片细胞类型 | 蝴蝶蛹翅组织中的细胞 | 遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-09 |
Integrated Single-Cell Atlases Reveal an Oral SARS-CoV-2 Infection and Transmission Axis
2020-Oct-27, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.10.26.20219089
PMID:33140061
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研究论文 | 本文通过整合人类小唾液腺和牙龈的单细胞RNA测序数据集，揭示了口腔在COVID-19感染和传播中的作用 | 首次详细描述了口腔黏膜和唾液腺在SARS-CoV-2感染和传播中的具体机制 | NA | 探讨口腔在COVID-19感染和传播中的作用 | 人类小唾液腺和牙龈的细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括11种上皮细胞、7种间质细胞和15种免疫细胞集群 | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-09 |
Enzymatic Dissociation Induces Transcriptional and Proteotype Bias in Brain Cell Populations
2020-Oct-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21217944
PMID:33114694
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研究论文 | 本文系统研究了不同细胞分离协议对小鼠脑组织转录组和蛋白质组的影响 | 发现标准酶消化法在37°C下会引起神经元和胶质细胞转录组和蛋白质组的深刻且一致的改变 | 强调了使用基于酶消化分离方法进行脑细胞分析时引入技术偏差和生物假象的风险 | 探讨不同细胞分离技术对脑细胞转录组和蛋白质组的影响 | 小鼠脑组织的转录组和蛋白质组 | NA | NA | 单细胞转录组学、蛋白质组学、流式细胞术 | NA | 转录组、蛋白质组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-09 |
Highly Multiplexed Single-Cell In Situ RNA and DNA Analysis by Consecutive Hybridization
2020-Oct-23, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules25214900
PMID:33113917
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研究论文 | 本文报道了一种新的空间转录组学和基因组学分析方法，通过连续荧光原位杂交（C-FISH）技术，能够在单细胞水平上全面分析核酸分子 | 该方法通过连续的杂交、成像和光漂白循环，利用独特的颜色序列确定不同核酸的身份，实现了高度多重化的单细胞内核酸分析 | NA | 旨在提高对生物学和医学中单细胞内核酸分子的全面理解 | 单细胞内的转录本和基因组位点 | 基因组学 | NA | 连续荧光原位杂交（C-FISH） | NA | 荧光图像 | 使用2种荧光素和16个C-FISH循环或3种荧光素和9个C-FISH循环进行单细胞分析 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals immune modulation and metabolic switch in tumor-draining lymph nodes
2020-10-19, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2020.1830513
PMID:33117603
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了肿瘤引流淋巴结中的免疫调节和代谢转换 | 首次在单细胞水平揭示了乳腺癌进展过程中肿瘤引流淋巴结的重新编程，并指出了免疫调节和代谢转换的关键变化 | 研究仅限于FVB/NJ和MMTV-PyMT小鼠模型，可能需要进一步在人类样本中验证 | 探讨乳腺癌细胞如何在肿瘤引流淋巴结中建立前转移生态位 | 从FVB/NJ小鼠的正常淋巴结和MMTV-PyMT小鼠的肿瘤引流淋巴结中分离的异质细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及FVB/NJ小鼠的正常淋巴结和MMTV-PyMT小鼠的肿瘤引流淋巴结中的多种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-09 |
Learning for single-cell assignment
2020-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abd0855
PMID:33127686
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scLearn的学习框架，用于自动推断定量测量和相似度阈值，以实现不同单细胞分配任务的泛化性能 | scLearn框架能够自动推断定量测量和相似度阈值，适用于不同的单细胞分配任务，并能识别参考数据集中不存在的新的细胞类型 | NA | 开发一种有效的单细胞分配方法，无需先验标记基因注释 | 单细胞测序数据中的细胞类型分配 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 学习框架 | 单细胞测序数据 | 使用了公开可用的综合基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-09 |
The noncoding and coding transcriptional landscape of the peripheral immune response in patients with COVID-19
2020-Oct, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.200
PMID:33135345
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研究论文 | 研究分析了COVID-19患者外周免疫反应中的非编码和编码转录组景观 | 定义了四种不同表达趋势的microRNAs作为COVID-19进展的生物标志物，并识别了miR-146a-5p等可能参与疾病发病机制的microRNAs作为严重COVID-19的生物标志物和潜在治疗靶点 | NA | 深入理解COVID-19发病机制并提供新的见解 | COVID-19患者的非编码和编码转录组 | 数字病理学 | COVID-19 | 多转录组测序 | NA | RNA序列数据 | 来自中度和重度COVID-19患者的去红细胞全血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-09 |
RNA editing in cancer impacts mRNA abundance in immune response pathways
2020-10-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02171-4
PMID:33106178
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研究论文 | 本文通过综合分析上皮和间质肿瘤的RNA编辑特征，揭示了RNA编辑在癌症中的广泛差异及其对mRNA丰度的调控机制 | 发现了上皮和间质肿瘤间不同的编辑模式，并揭示了RNA编辑通过调控mRNA丰度影响免疫反应途径的新机制 | 主要集中在非编码区域的肿瘤相关位点的功能相关性仍未知 | 研究RNA编辑在癌症中的作用及其对免疫反应途径的影响 | 上皮和间质肿瘤的RNA编辑特征 | 数字病理学 | NA | TCGA数据分析, 单细胞RNA测序, ADAR扰动实验 | NA | RNA序列 | 涉及七种癌症类型的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-09 |
Spatial Transcriptomics Reveals Genes Associated with Dysregulated Mitochondrial Functions and Stress Signaling in Alzheimer Disease
2020-Oct-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101556
PMID:33083725
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，揭示了与阿尔茨海默病中失调的线粒体功能和应激信号相关的基因 | 首次在阿尔茨海默病的小鼠模型中，通过空间转录组学技术识别出在海马体和嗅球中空间下调的基因Bok，该基因与线粒体生理和细胞死亡相关 | NA | 旨在同时发现海马体和嗅球结构层中可能与阿尔茨海默病早期海马体突触缺陷和嗅觉功能障碍相关的新的和已知的分子靶点 | 阿尔茨海默病小鼠模型的海马体和嗅球 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类阿尔茨海默病脑组织 | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-09 |
Neural crest lineage analysis: from past to future trajectory
2020-10-23, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.193193
PMID:33097550
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综述 | 本文从历史角度回顾了神经嵴细胞谱系追踪的主要发现，并讨论了先进技术如何改进谱系追踪研究以及如何应用于多能性问题 | 结合新兴的分子和成像工具，如单细胞转录组学、单分子荧光杂交和高分辨率成像，扩展了神经嵴细胞谱系研究的范畴，超越了发育阶段，涵盖了再生和癌症起始 | NA | 回顾神经嵴细胞谱系追踪的历史发展，并探讨新技术如何推动该领域的研究 | 神经嵴细胞的谱系追踪及其在发育、再生和癌症起始中的应用 | NA | NA | 单细胞转录组学、单分子荧光杂交、高分辨率成像 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-09 |
Gene expression and functional deficits underlie TREM2-knockout microglia responses in human models of Alzheimer's disease
2020-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19227-5
PMID:33097708
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研究论文 | 研究通过CRISPR-modified TREM2-knockout iPSC分化的人类小胶质细胞，探讨TREM2在阿尔茨海默病中的作用 | 首次结合转录组学和功能分析，以及在阿尔茨海默病小鼠模型中研究TREM2缺失对人类小胶质细胞的影响 | NA | 探究TREM2在人类小胶质细胞中的正常和疾病相关功能 | TREM2敲除的人类小胶质细胞及其在阿尔茨海默病中的作用 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | CRISPR, 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 使用CRISPR-modified TREM2-knockout iPSC分化的小胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-09 |
Characterization of rare spindle and root cell transcriptional profiles in the stria vascularis of the adult mouse cochlea
2020-10-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-75238-8
PMID:33093630
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序技术，分析了成年小鼠耳蜗血管纹中稀有细胞类型（如纺锤细胞和根细胞）的转录组特征 | 首次详细描述了成年小鼠耳蜗血管纹中稀有细胞类型的转录组特征，并鉴定了这些细胞的新型特异性标记物 | 研究主要集中在成年小鼠耳蜗血管纹的稀有细胞类型，未涉及其他细胞类型或不同发育阶段的细胞 | 探讨耳蜗血管纹稀有细胞类型的转录组特征及其在听力维持中的功能作用 | 成年小鼠耳蜗血管纹中的稀有细胞类型，包括纺锤细胞和根细胞 | 数字病理学 | 听力损失 | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年小鼠耳蜗血管纹样本 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-09 |
Identification of a dysfunctional microglial population in human Alzheimer's disease cortex using novel single-cell histology image analysis
2020-10-20, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-020-01047-9
PMID:33081847
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research paper | 本研究通过新型单细胞组织学图像分析，鉴定了阿尔茨海默病（AD）患者大脑皮层中功能障碍的微胶质细胞群体 | 首次在人类脑组织中通过解剖学上下文验证了与AD病理相关的微胶质细胞群体，并使用高吞吐量的免疫组织化学数据支持了微胶质功能障碍假说 | NA | 鉴定和验证阿尔茨海默病中与病理相关的微胶质细胞群体 | 阿尔茨海默病患者的大脑皮层微胶质细胞 | digital pathology | 阿尔茨海默病 | 荧光免疫组织化学 | NA | image | 正常组和AD组各8个中间颞回样本 | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-09 |
Deep immunophenotyping at the single-cell level identifies a combination of anti-IL-17 and checkpoint blockade as an effective treatment in a preclinical model of data-guided personalized immunotherapy
2020-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-001358
PMID:33093158
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研究论文 | 本文通过深度免疫表型分析，识别出在一种临床前模型中，抗IL-17和免疫检查点阻断联合治疗的有效性 | 开发了一种垂直流阵列芯片（VFAC）用于靶向单细胞RNA测序，以识别T细胞的独特亚型，并发现IL-17产生细胞在肿瘤微环境中的作用 | 研究仅限于临床前模型，需要进一步的临床试验验证 | 验证个性化免疫治疗策略的可行性，通过深度免疫表型分析指导治疗 | 胃癌细胞系YTN2和YTN16在C57BL/6小鼠中的免疫反应 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），流式细胞术 | NA | RNA | 使用YTN2和YTN16胃癌细胞系在C57BL/6小鼠中进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-09 |
Iterative point set registration for aligning scRNA-seq data
2020-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1007939
PMID:33108369
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研究论文 | 本文开发了一种名为Single Cell Iterative Point set Registration (SCIPR)的方法，用于对齐和整合来自不同技术和平台的单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据 | SCIPR方法能够使用原始表达空间进行对齐，并能推广到新的数据，这是现有方法所未能实现的 | NA | 开发一种新的方法来对齐和整合不同来源的scRNA-Seq数据 | scRNA-Seq数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 多个scRNA-Seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Engineered Cardiac Tissues From Patient-Specific Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes Reveals Abnormal Developmental Trajectory and Intrinsic Contractile Defects in Hypoplastic Right Heart Syndrome
2020-10-20, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.120.016528
PMID:33059525
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和表型分析，比较了来自患者和健康个体的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞及其工程化组织模型，揭示了肺动脉闭锁伴完整室间隔（PAIVS）中先天性心脏病的内在发育和功能异常 | 首次揭示了PAIVS中心肌细胞发育和功能的内在异常，排除了次要解剖缺陷的影响 | NA | 理解PAIVS中先天性心脏病的内在发育和功能异常 | 来自患者和健康个体的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞及其工程化组织模型 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 3名PAIVS患者和3名健康个体的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞及其工程化组织模型 | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Parkinson's Disease Human In Vitro Models Reveals Dopamine Neuron-Specific Stress Responses
2020-10-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108263
PMID:33053338
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了帕金森病人类体外模型中多巴胺神经元对细胞毒性和遗传应激的基因表达动态 | 首次进行了最大规模的单细胞转录组学研究，揭示了多巴胺神经元亚型的转录特征和应激敏感性差异 | NA | 阐明帕金森病中多巴胺神经元在细胞毒性和遗传应激下的基因表达动态 | 人类诱导多能干细胞（iPSC）衍生的多巴胺神经元 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个神经元亚型 | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-09 |
Identification of oncolytic vaccinia restriction factors in canine high-grade mammary tumor cells using single-cell transcriptomics
2020-10, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1008660
PMID:33075093
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法，分析了犬高级别乳腺肿瘤细胞中溶瘤痘病毒的限制因子，特别是DDIT4基因的作用 | 首次揭示了DDIT4基因在溶瘤痘病毒治疗中的潜在抗性标记作用，并展示了单细胞转录组学在识别影响病毒复制的细胞因子方面的应用 | NA | 探讨溶瘤痘病毒在犬乳腺肿瘤细胞中的效力和潜在的抗性因子 | 犬高级别乳腺肿瘤细胞，特别是三阴性乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个不同的三阴性乳腺癌细胞样本，分别感染或未感染痘病毒 | NA | NA | NA | NA |