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当前共找到 134 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-09 |
The noncoding and coding transcriptional landscape of the peripheral immune response in patients with COVID-19
2020-Oct, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.200
PMID:33135345
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研究论文 | 研究分析了COVID-19患者外周免疫反应中的非编码和编码转录组景观 | 定义了四种不同表达趋势的microRNAs作为COVID-19进展的生物标志物，并识别了miR-146a-5p等可能参与疾病发病机制的microRNAs作为严重COVID-19的生物标志物和潜在治疗靶点 | NA | 深入理解COVID-19发病机制并提供新的见解 | COVID-19患者的非编码和编码转录组 | 数字病理学 | COVID-19 | 多转录组测序 | NA | RNA序列数据 | 来自中度和重度COVID-19患者的去红细胞全血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-09 |
RNA editing in cancer impacts mRNA abundance in immune response pathways
2020-10-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02171-4
PMID:33106178
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研究论文 | 本文通过综合分析上皮和间质肿瘤的RNA编辑特征，揭示了RNA编辑在癌症中的广泛差异及其对mRNA丰度的调控机制 | 发现了上皮和间质肿瘤间不同的编辑模式，并揭示了RNA编辑通过调控mRNA丰度影响免疫反应途径的新机制 | 主要集中在非编码区域的肿瘤相关位点的功能相关性仍未知 | 研究RNA编辑在癌症中的作用及其对免疫反应途径的影响 | 上皮和间质肿瘤的RNA编辑特征 | 数字病理学 | NA | TCGA数据分析, 单细胞RNA测序, ADAR扰动实验 | NA | RNA序列 | 涉及七种癌症类型的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-09 |
Spatial Transcriptomics Reveals Genes Associated with Dysregulated Mitochondrial Functions and Stress Signaling in Alzheimer Disease
2020-Oct-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101556
PMID:33083725
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，揭示了与阿尔茨海默病中失调的线粒体功能和应激信号相关的基因 | 首次在阿尔茨海默病的小鼠模型中，通过空间转录组学技术识别出在海马体和嗅球中空间下调的基因Bok，该基因与线粒体生理和细胞死亡相关 | NA | 旨在同时发现海马体和嗅球结构层中可能与阿尔茨海默病早期海马体突触缺陷和嗅觉功能障碍相关的新的和已知的分子靶点 | 阿尔茨海默病小鼠模型的海马体和嗅球 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类阿尔茨海默病脑组织 | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-09 |
Neural crest lineage analysis: from past to future trajectory
2020-10-23, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.193193
PMID:33097550
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综述 | 本文从历史角度回顾了神经嵴细胞谱系追踪的主要发现，并讨论了先进技术如何改进谱系追踪研究以及如何应用于多能性问题 | 结合新兴的分子和成像工具，如单细胞转录组学、单分子荧光杂交和高分辨率成像，扩展了神经嵴细胞谱系研究的范畴，超越了发育阶段，涵盖了再生和癌症起始 | NA | 回顾神经嵴细胞谱系追踪的历史发展，并探讨新技术如何推动该领域的研究 | 神经嵴细胞的谱系追踪及其在发育、再生和癌症起始中的应用 | NA | NA | 单细胞转录组学、单分子荧光杂交、高分辨率成像 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-09 |
A distinct GM-CSF+ T helper cell subset requires T-bet to adopt a TH1 phenotype and promote neuroinflammation
2020-Oct-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aba9953
PMID:33097590
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和高维单细胞质谱流式技术，鉴定了健康个体血液中包括GM-CSF产生细胞在内的八种抗原经验性CD45RACD4 T细胞群体，并研究了这些细胞在实验性自身免疫性脑脊髓炎模型中的作用。 | 首次详细研究了GM-CSF产生T细胞的身份，并发现这些细胞在自身免疫性脑脊髓炎模型中通过T-bet表达增强其致脑炎性。 | NA | 探讨GM-CSF产生T细胞在自身免疫性疾病中的作用及其分子机制。 | GM-CSF产生T细胞及其在实验性自身免疫性脑脊髓炎中的作用。 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序，高维单细胞质谱流式技术 | NA | 细胞数据 | 健康个体血液样本及实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-09 |
Gene expression and functional deficits underlie TREM2-knockout microglia responses in human models of Alzheimer's disease
2020-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19227-5
PMID:33097708
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研究论文 | 研究通过CRISPR-modified TREM2-knockout iPSC分化的人类小胶质细胞，探讨TREM2在阿尔茨海默病中的作用 | 首次结合转录组学和功能分析，以及在阿尔茨海默病小鼠模型中研究TREM2缺失对人类小胶质细胞的影响 | NA | 探究TREM2在人类小胶质细胞中的正常和疾病相关功能 | TREM2敲除的人类小胶质细胞及其在阿尔茨海默病中的作用 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | CRISPR, 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 使用CRISPR-modified TREM2-knockout iPSC分化的小胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-09 |
Characterization of rare spindle and root cell transcriptional profiles in the stria vascularis of the adult mouse cochlea
2020-10-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-75238-8
PMID:33093630
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序技术，分析了成年小鼠耳蜗血管纹中稀有细胞类型（如纺锤细胞和根细胞）的转录组特征 | 首次详细描述了成年小鼠耳蜗血管纹中稀有细胞类型的转录组特征，并鉴定了这些细胞的新型特异性标记物 | 研究主要集中在成年小鼠耳蜗血管纹的稀有细胞类型，未涉及其他细胞类型或不同发育阶段的细胞 | 探讨耳蜗血管纹稀有细胞类型的转录组特征及其在听力维持中的功能作用 | 成年小鼠耳蜗血管纹中的稀有细胞类型，包括纺锤细胞和根细胞 | 数字病理学 | 听力损失 | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年小鼠耳蜗血管纹样本 | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-09 |
Identification of a dysfunctional microglial population in human Alzheimer's disease cortex using novel single-cell histology image analysis
2020-10-20, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-020-01047-9
PMID:33081847
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research paper | 本研究通过新型单细胞组织学图像分析，鉴定了阿尔茨海默病（AD）患者大脑皮层中功能障碍的微胶质细胞群体 | 首次在人类脑组织中通过解剖学上下文验证了与AD病理相关的微胶质细胞群体，并使用高吞吐量的免疫组织化学数据支持了微胶质功能障碍假说 | NA | 鉴定和验证阿尔茨海默病中与病理相关的微胶质细胞群体 | 阿尔茨海默病患者的大脑皮层微胶质细胞 | digital pathology | 阿尔茨海默病 | 荧光免疫组织化学 | NA | image | 正常组和AD组各8个中间颞回样本 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-09 |
Deep immunophenotyping at the single-cell level identifies a combination of anti-IL-17 and checkpoint blockade as an effective treatment in a preclinical model of data-guided personalized immunotherapy
2020-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-001358
PMID:33093158
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研究论文 | 本文通过深度免疫表型分析，识别出在一种临床前模型中，抗IL-17和免疫检查点阻断联合治疗的有效性 | 开发了一种垂直流阵列芯片（VFAC）用于靶向单细胞RNA测序，以识别T细胞的独特亚型，并发现IL-17产生细胞在肿瘤微环境中的作用 | 研究仅限于临床前模型，需要进一步的临床试验验证 | 验证个性化免疫治疗策略的可行性，通过深度免疫表型分析指导治疗 | 胃癌细胞系YTN2和YTN16在C57BL/6小鼠中的免疫反应 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），流式细胞术 | NA | RNA | 使用YTN2和YTN16胃癌细胞系在C57BL/6小鼠中进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-09 |
Iterative point set registration for aligning scRNA-seq data
2020-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1007939
PMID:33108369
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研究论文 | 本文开发了一种名为Single Cell Iterative Point set Registration (SCIPR)的方法，用于对齐和整合来自不同技术和平台的单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据 | SCIPR方法能够使用原始表达空间进行对齐，并能推广到新的数据，这是现有方法所未能实现的 | NA | 开发一种新的方法来对齐和整合不同来源的scRNA-Seq数据 | scRNA-Seq数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 多个scRNA-Seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Engineered Cardiac Tissues From Patient-Specific Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes Reveals Abnormal Developmental Trajectory and Intrinsic Contractile Defects in Hypoplastic Right Heart Syndrome
2020-10-20, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.120.016528
PMID:33059525
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和表型分析，比较了来自患者和健康个体的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞及其工程化组织模型，揭示了肺动脉闭锁伴完整室间隔（PAIVS）中先天性心脏病的内在发育和功能异常 | 首次揭示了PAIVS中心肌细胞发育和功能的内在异常，排除了次要解剖缺陷的影响 | NA | 理解PAIVS中先天性心脏病的内在发育和功能异常 | 来自患者和健康个体的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞及其工程化组织模型 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 3名PAIVS患者和3名健康个体的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞及其工程化组织模型 | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Parkinson's Disease Human In Vitro Models Reveals Dopamine Neuron-Specific Stress Responses
2020-10-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108263
PMID:33053338
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了帕金森病人类体外模型中多巴胺神经元对细胞毒性和遗传应激的基因表达动态 | 首次进行了最大规模的单细胞转录组学研究，揭示了多巴胺神经元亚型的转录特征和应激敏感性差异 | NA | 阐明帕金森病中多巴胺神经元在细胞毒性和遗传应激下的基因表达动态 | 人类诱导多能干细胞（iPSC）衍生的多巴胺神经元 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个神经元亚型 | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-09 |
Identification of oncolytic vaccinia restriction factors in canine high-grade mammary tumor cells using single-cell transcriptomics
2020-10, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1008660
PMID:33075093
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法，分析了犬高级别乳腺肿瘤细胞中溶瘤痘病毒的限制因子，特别是DDIT4基因的作用 | 首次揭示了DDIT4基因在溶瘤痘病毒治疗中的潜在抗性标记作用，并展示了单细胞转录组学在识别影响病毒复制的细胞因子方面的应用 | NA | 探讨溶瘤痘病毒在犬乳腺肿瘤细胞中的效力和潜在的抗性因子 | 犬高级别乳腺肿瘤细胞，特别是三阴性乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个不同的三阴性乳腺癌细胞样本，分别感染或未感染痘病毒 | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-09 |
Assessment of long non-coding RNA expression reveals novel mediators of the lung tumour immune response
2020-10-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-73787-6
PMID:33037279
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研究论文 | 本文通过分析长非编码RNA（lncRNA）在肺腺癌（LUAD）肿瘤中的表达，揭示了lncRNA在肿瘤免疫微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 | 发现lncRNA表达模式与免疫相关蛋白质编码基因之间的调控关系，并提供了lncRNA在抗肿瘤免疫活性中的功能性证据 | NA | 探索肺肿瘤免疫微环境中lncRNA的作用，以指导免疫治疗方案并发现新的干预点 | 肺腺癌肿瘤中的lncRNA表达及其与免疫细胞的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 包括微切割和非微切割样本（BCCRC和TCGA）以及单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-09 |
Single-cell and spatial transcriptomics enables probabilistic inference of cell type topography
2020-10-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01247-y
PMID:33037292
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研究论文 | 本文介绍了一种基于模型的概率方法，利用单细胞数据解析空间转录组数据中的细胞混合物 | 提出了一种新的模型，能够利用单细胞转录组数据解析空间转录组数据中的细胞混合物 | NA | 将基因表达置于上下文中，并描绘组织内细胞类型的空间排列 | 小鼠大脑和发育心脏的细胞类型空间分布 | 空间转录组学 | NA | 单细胞和空间转录组学 | 概率模型 | 转录组数据 | 小鼠大脑和发育心脏的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-09 |
A gene expression signature of TREM2hi macrophages and γδ T cells predicts immunotherapy response
2020-10-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18546-x
PMID:33033253
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研究论文 | 本研究通过重新分析公开的黑色素瘤患者单细胞RNA测序数据，识别出TREM2高表达的巨噬细胞和γδ T细胞亚群，这些亚群在非响应肿瘤中过度表达，并开发了一种免疫细胞特征（ImmuneCells.Sig）来预测免疫疗法的反应 | 首次识别出TREM2高表达的巨噬细胞和γδ T细胞亚群在非响应肿瘤中的过度表达，并开发了一种新的免疫细胞特征来预测免疫疗法的反应 | 研究依赖于公开的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据，可能存在数据质量和样本多样性的限制 | 识别影响免疫检查点疗法抵抗的因素，并开发预测免疫疗法反应的生物标志物 | 黑色素瘤患者的免疫细胞亚群及其对免疫疗法的反应 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 公开的黑色素瘤患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-09 |
Impact of data preprocessing on cell-type clustering based on single-cell RNA-seq data
2020-Oct-07, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-03797-8
PMID:33028196
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研究论文 | 本文探讨了数据预处理方法对基于单细胞RNA测序数据的细胞类型聚类的影响，并设计了一种图基算法SC3-e来选择最佳的数据预处理方法，以提高SC3聚类算法的性能。 | 本文创新性地设计了SC3-e算法，用于为SC3聚类算法选择最佳的数据预处理方法，从而显著提高了聚类性能。 | NA | 研究不同数据预处理方法对单细胞RNA测序数据聚类算法的影响，并开发一种新的算法来优化这一过程。 | 单细胞RNA测序数据及其在细胞类型聚类中的应用。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图基算法 | 基因表达数据 | 八个常用的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-09 |
Mesenchymal stem cells alleviate LPS-induced acute lung injury by inhibiting the proinflammatory function of Ly6C+ CD8+ T cells
2020-10-06, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-020-03036-1
PMID:33024074
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研究论文 | 本研究探讨了间充质干细胞（MSCs）通过抑制Ly6C+ CD8+ T细胞的促炎功能，减轻脂多糖（LPS）诱导的小鼠急性肺损伤（ALI）的效果 | 首次揭示了MSCs通过抑制Ly6C+ CD8+ T细胞的浸润和促炎功能，减轻ALI的作用机制 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证 | 研究MSCs在治疗急性肺损伤中的作用及其机制 | 急性肺损伤小鼠模型及Ly6C+ CD8+ T细胞 | 免疫学 | 急性肺损伤 | 质谱细胞术，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞，蛋白质，细胞因子，趋化因子 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-09 |
Predicting cell-to-cell communication networks using NATMI
2020-10-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18873-z
PMID:33024107
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研究论文 | 本文开发了NATMI工具，用于从单细胞或批量表达数据中预测和可视化细胞间通信网络 | NATMI工具使用connectomeDB2020数据库，能够识别网络中最活跃或最特异的配体-受体对，以及潜在的高通信细胞群 | NA | 研究不同细胞类型如何协同工作 | 细胞间通信网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 表达数据 | 数千个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-09 |
Parallel Single-Cell RNA-Seq and Genetic Recording Reveals Lineage Decisions in Developing Embryoid Bodies
2020-10-06, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108222
PMID:33027665
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研究论文 | 本文结合单细胞转录组学和遗传记录技术，研究胚胎干细胞向胚胎体分化的过程，并揭示了细胞命运轨迹和分支点 | 提出了一种创新的诱导性遗传记录技术，利用重组在狭窄的时间窗口内生成细胞特异性的时间戳条形码 | NA | 研究胚胎干细胞向胚胎体分化的过程，并揭示细胞命运轨迹和分支点 | 胚胎干细胞向胚胎体的分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |