单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 134 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-07 |
Spatial cell type composition in normal and Alzheimers human brains is revealed using integrated mouse and human single cell RNA sequencing
2020-10-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-74917-w
PMID:33093481
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研究论文 | 本研究利用集成的小鼠和人类单细胞RNA测序数据，揭示了正常和阿尔茨海默病人类大脑的空间细胞类型组成 | 提出了一种利用小鼠单细胞RNA测序数据补充人类数据的方法，以解决人类大脑组织样本稀缺的问题 | NA | 探索正常和阿尔茨海默病人类大脑的细胞类型组成 | 人类大脑组织样本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 3702个人类大脑样本 | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-08-07 |
Targeting tumor-associated macrophages and granulocytic myeloid-derived suppressor cells augments PD-1 blockade in cholangiocarcinoma
2020-10-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI137110
PMID:32663198
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研究论文 | 本文研究了在胆管癌中，肿瘤相关巨噬细胞和粒细胞样骨髓来源的抑制细胞对PD-1阻断疗法的影响 | 发现了肿瘤相关巨噬细胞是人类和小鼠胆管癌中PD-L1的主要来源，并且双重抑制肿瘤相关巨噬细胞和粒细胞样骨髓来源的抑制细胞能增强免疫检查点阻断疗法的效果 | 文章未提及具体的局限性 | 探索在胆管癌中，免疫检查点阻断疗法与针对免疫抑制性骨髓细胞的免疫疗法结合的治疗潜力 | 肿瘤相关巨噬细胞和粒细胞样骨髓来源的抑制细胞在胆管癌中的作用 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 文章未提及具体的样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing highlights the role of inflammatory cancer-associated fibroblasts in bladder urothelial carcinoma
2020-10-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18916-5
PMID:33033240
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析膀胱尿路上皮癌样本，揭示了肿瘤微环境中细胞异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示膀胱尿路上皮癌中炎症相关成纤维细胞（iCAFs）在肿瘤进展中的作用及其与不良预后的关联 | NA | 探究膀胱尿路上皮癌中肿瘤微环境的作用及其对临床预后的影响 | 膀胱尿路上皮癌的肿瘤微环境及其中不同细胞类型的功能 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8个肿瘤样本和3个肿瘤旁样本 | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-09 |
Single-Cell Profiling Reveals Divergent, Globally Patterned Immune Responses in Murine Skin Inflammation
2020-Oct-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101582
PMID:33205009
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了在小鼠皮肤炎症模型中免疫细胞的异质性反应 | 首次揭示了不同炎症诱导剂在小鼠皮肤炎症中引起的全局分子模式差异 | NA | 探讨不同炎症诱导剂如何影响小鼠皮肤免疫细胞的转录反应 | 小鼠皮肤免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13种CD45亚群的免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-09 |
Laser Capture Microdissection-Based RNA Microsequencing Reveals Optic Nerve Crush-Related Early mRNA Alterations in Retinal Ganglion Cell Layer
2020-10, Translational vision science & technology
IF:2.6Q2
DOI:10.1167/tvst.9.11.30
PMID:33173609
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研究论文 | 本文通过激光捕获显微切割（LCM）和RNA微测序技术，研究了视神经挤压（ONC）相关的视网膜神经节细胞（RGC）层早期mRNA变化 | 首次使用LCM结合单细胞RNA测序技术，揭示了ONC相关早期mRNA变化的分子机制 | NA | 建立LCM和RNA微测序方法，探索视神经挤压相关的视网膜神经节细胞层早期mRNA变化 | 视网膜神经节细胞层的早期mRNA变化 | 数字病理学 | NA | 激光捕获显微切割（LCM），RNA微测序 | NA | RNA | 30微米厚的视网膜组织切片 | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis of Different Stages of Oral Cancer Carcinogenesis in a Mouse Model
2020-Oct-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21218171
PMID:33142921
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了在小鼠模型中口腔癌致癌过程中不同阶段的基因表达特征 | 首次在单细胞水平上分析了口腔癌致癌过程中的基因表达变化，并识别了与MYC_targets_v1通路相关的细胞亚型标记物 | 研究仅限于小鼠模型，结果的临床应用需要进一步验证 | 探究口腔癌致癌过程中不同阶段的基因表达特征，并寻找潜在的生物标志物 | 小鼠口腔癌致癌过程中的细胞亚型及其基因表达 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | Louvain算法 | 基因表达数据 | 使用了C57BL/6J雄性小鼠，分为对照组和治疗组，共进行了8、16、20和29周的实验 | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveals the heterogeneity of the decidual endothelial cells that participate in labor onset
2020-10, European review for medical and pharmacological sciences
DOI:10.26355/eurrev_202010_23385
PMID:33155267
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术探讨了分娩前后蜕膜内皮细胞的异质性及其功能变化 | 揭示了蜕膜内皮细胞在分娩过程中的异质性，并发现了可能在分娩中更活跃的特定亚型 | NA | 探究蜕膜内皮细胞的异质性及其在分娩过程中的变化 | 蜕膜内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 9748个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-09 |
Advances and challenges in single-cell RNA-seq of microbial communities
2020-10, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2020.10.001
PMID:33160164
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在微生物群落研究中的进展和挑战 | 探讨了如何将单细胞RNA测序技术扩展到高吞吐量，以研究数千种微生物 | 单细胞RNA测序技术在真菌、原生生物和细菌中的应用仍处于初级阶段 | 旨在整合哺乳动物和微生物的单细胞分析，以研究健康和疾病中的微生物群落 | 微生物群落的分子状态 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-09 |
Persistent STAT5 activation reprograms the epigenetic landscape in CD4+ T cells to drive polyfunctionality and antitumor immunity
2020-Oct-30, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aba5962
PMID:33127608
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研究论文 | 本文报道了持续激活信号转导子和转录激活子5（STAT5）在肿瘤特异性CD4 T细胞中驱动多功能T细胞发展的作用 | 首次揭示了STAT5持续激活在CD4 T细胞中诱导基因组范围的染色质重塑，并建立独特的表观遗传和转录景观，从而促进多功能T细胞的形成 | NA | 探讨STAT5在肿瘤特异性CD4 T细胞中的持续激活对多功能性和抗肿瘤免疫的影响 | 肿瘤特异性CD4 T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组和转录组数据 | 涉及小鼠和人类CD4 T细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-09 |
Cellular taxonomy and spatial organization of the murine ventral posterior hypothalamus
2020-10-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.58901
PMID:33119507
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术对小鼠腹后下丘脑的细胞类型和空间组织进行了系统分类 | 首次揭示了小鼠腹后下丘脑中20种神经元和18种非神经元细胞群体，并验证了这些细胞群体的差异表达基因 | NA | 旨在阐明腹后下丘脑中不同神经回路在生理和行为中的作用 | 小鼠腹后下丘脑的细胞类型和空间组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 超过16,000个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-09 |
Functional in vivo and in vitro effects of 20q11.21 genetic aberrations on hPSC differentiation
2020-10-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-75657-7
PMID:33122739
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研究论文 | 本研究探讨了20q11.21拷贝数变异（CNV）在人多能干细胞（hPSCs）早期分化过程中的体内外功能效应 | 本研究首次全面分析了20q11.21 CNV在hPSCs分化中的全转录组效应，并利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）揭示了转录异质性 | 研究主要集中在20q11.21 CNV的影响，未涉及其他基因区域的变异对hPSCs分化的影响 | 旨在检查20q11.21 CNV在hPSCs早期分化过程中的功能效应 | 人多能干细胞（hPSCs）及其分化过程中的20q11.21拷贝数变异（CNV） | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），RNA测序（RNA-seq） | NA | 转录组数据 | 22个畸胎瘤样本，两个不同同源系hPSCs的胚体 | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Early Emergence of Liver Parenchymal and Non-parenchymal Cell Lineages
2020-10-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.09.012
PMID:33125890
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研究论文 | 本研究通过分析从胚胎第7.5天到第10.5天的45,334个单细胞转录组，揭示了肝脏实质和非实质细胞谱系在器官发生早期的出现 | 本研究首次详细描述了血管和窦状内皮的差异，包括窦状内皮在第8.75天的独特转录特征，并揭示了早期肝星状细胞和两种不同间皮细胞类型的特征 | NA | 研究肝脏在器官发生早期的细胞复杂性和谱系建立 | 肝脏的实质和非实质细胞谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 45,334个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Highlights a Role for Neutrophils and Inflammatory Macrophages in the Pathogenesis of Severe COVID-19
2020-10-29, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells9112374
PMID:33138195
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研究论文 | 本研究利用迭代聚类和引导基因选择2（ICGS2）以及统一流形逼近和投影（UMAP）降维计算算法，分析了来自两名健康受试者和三名轻度及五名重度COVID-19患者的68,873个单细胞的公开数据集，揭示了中性粒细胞和巨噬细胞集群1在重度COVID-19发病机制中的作用 | 本研究首次详细描述了中性粒细胞和巨噬细胞集群1在重度COVID-19中的免疫细胞组成和基因特征，为诊断和治疗干预提供了新的可能性 | 研究主要基于公开数据集，样本量和数据来源可能限制了结果的普遍性 | 探讨免疫细胞亚群在COVID-19疾病严重程度中的作用 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液（BAL）中的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组分析 | ICGS2, UMAP | 单细胞转录组数据 | 68,873个单细胞，来自两名健康受试者、三名轻度COVID-19患者和五名重度COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-09 |
Nuclear gene proximity and protein interactions shape transcript covariations in mammalian single cells
2020-10-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19011-5
PMID:33116115
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研究论文 | 本文研究了哺乳动物单细胞中基因共表达模式的形成机制 | 首次提供了miRNAs自然诱导转录组广泛共变的证据，并比较了核组织、转录和转录后调控在定义共变中的相对重要性 | NA | 探讨基因共变在哺乳动物单细胞中的形成机制及其生物学意义 | 小鼠胚胎干细胞中的基因共变网络 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数千对内在共变基因 | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-09 |
Cell Dissociation from Butterfly Pupal Wing Tissues for Single-Cell RNA Sequencing
2020-Oct-28, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps3040072
PMID:33126499
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研究论文 | 本文提供了一种从蝴蝶蛹翅组织中分离细胞以进行单细胞RNA测序的详细方案 | 利用单细胞测序技术研究蝴蝶翅鳞片细胞的基因表达模式，以识别产生不同颜色和鳞片结构的细胞类型 | 讨论了当前技术在研究单细胞鳞片发育方面的一些挑战 | 理解蝴蝶翅鳞片的基因表达模式和识别不同鳞片细胞类型 | 蝴蝶蛹翅组织中的细胞 | 遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-09 |
Integrated Single-Cell Atlases Reveal an Oral SARS-CoV-2 Infection and Transmission Axis
2020-Oct-27, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.10.26.20219089
PMID:33140061
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研究论文 | 本文通过整合人类小唾液腺和牙龈的单细胞RNA测序数据集，揭示了口腔在COVID-19感染和传播中的作用 | 首次详细描述了口腔黏膜和唾液腺在SARS-CoV-2感染和传播中的具体机制 | NA | 探讨口腔在COVID-19感染和传播中的作用 | 人类小唾液腺和牙龈的细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括11种上皮细胞、7种间质细胞和15种免疫细胞集群 | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-09 |
Enzymatic Dissociation Induces Transcriptional and Proteotype Bias in Brain Cell Populations
2020-Oct-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21217944
PMID:33114694
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研究论文 | 本文系统研究了不同细胞分离协议对小鼠脑组织转录组和蛋白质组的影响 | 发现标准酶消化法在37°C下会引起神经元和胶质细胞转录组和蛋白质组的深刻且一致的改变 | 强调了使用基于酶消化分离方法进行脑细胞分析时引入技术偏差和生物假象的风险 | 探讨不同细胞分离技术对脑细胞转录组和蛋白质组的影响 | 小鼠脑组织的转录组和蛋白质组 | NA | NA | 单细胞转录组学、蛋白质组学、流式细胞术 | NA | 转录组、蛋白质组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-09 |
Highly Multiplexed Single-Cell In Situ RNA and DNA Analysis by Consecutive Hybridization
2020-Oct-23, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules25214900
PMID:33113917
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研究论文 | 本文报道了一种新的空间转录组学和基因组学分析方法，通过连续荧光原位杂交（C-FISH）技术，能够在单细胞水平上全面分析核酸分子 | 该方法通过连续的杂交、成像和光漂白循环，利用独特的颜色序列确定不同核酸的身份，实现了高度多重化的单细胞内核酸分析 | NA | 旨在提高对生物学和医学中单细胞内核酸分子的全面理解 | 单细胞内的转录本和基因组位点 | 基因组学 | NA | 连续荧光原位杂交（C-FISH） | NA | 荧光图像 | 使用2种荧光素和16个C-FISH循环或3种荧光素和9个C-FISH循环进行单细胞分析 | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals immune modulation and metabolic switch in tumor-draining lymph nodes
2020-10-19, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2020.1830513
PMID:33117603
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了肿瘤引流淋巴结中的免疫调节和代谢转换 | 首次在单细胞水平揭示了乳腺癌进展过程中肿瘤引流淋巴结的重新编程，并指出了免疫调节和代谢转换的关键变化 | 研究仅限于FVB/NJ和MMTV-PyMT小鼠模型，可能需要进一步在人类样本中验证 | 探讨乳腺癌细胞如何在肿瘤引流淋巴结中建立前转移生态位 | 从FVB/NJ小鼠的正常淋巴结和MMTV-PyMT小鼠的肿瘤引流淋巴结中分离的异质细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及FVB/NJ小鼠的正常淋巴结和MMTV-PyMT小鼠的肿瘤引流淋巴结中的多种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-09 |
Learning for single-cell assignment
2020-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abd0855
PMID:33127686
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scLearn的学习框架，用于自动推断定量测量和相似度阈值，以实现不同单细胞分配任务的泛化性能 | scLearn框架能够自动推断定量测量和相似度阈值，适用于不同的单细胞分配任务，并能识别参考数据集中不存在的新的细胞类型 | NA | 开发一种有效的单细胞分配方法，无需先验标记基因注释 | 单细胞测序数据中的细胞类型分配 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 学习框架 | 单细胞测序数据 | 使用了公开可用的综合基准数据集 | NA | NA | NA | NA |