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当前共找到 134 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals mRNA Splice Isoform Switching during Kidney Development
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019080770
PMID:32651222
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研究论文 | 本研究利用全长单细胞RNA测序技术，分析了小鼠胚胎肾脏中544个单细胞的转录组，揭示了肾脏发育过程中mRNA剪接异构体转换的现象 | 本研究首次通过全长单细胞RNA测序技术，全面分析了肾脏发育过程中细胞状态转换时的剪接异构体转换，并识别了几个潜在的剪接调控因子 | NA | 揭示胎儿肾脏间质向管状上皮分化过程中基因的替代剪接机制，以增进对肾脏发育分子机制的理解 | 小鼠胚胎肾脏中的单细胞 | 数字病理学 | NA | 全长单细胞RNA测序 | NA | RNA | 544个小鼠胚胎肾脏单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2024-08-07 |
Prospects for Use of Single-Cell Sequencing to Assess DNA Methylation in Asthma
2020-Oct-03, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research
IF:2.2Q3
DOI:10.12659/MSM.925514
PMID:33009362
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在评估哮喘中DNA甲基化作用的应用前景 | 单细胞测序技术能够揭示不同细胞群中基因的甲基化和表达情况，相较于传统的多组学测序，能更好地反映哮喘的发病机制 | 目前关于哮喘中DNA甲基化的研究较少，且主要使用单细胞测序技术的研究有限 | 研究单细胞测序技术在揭示哮喘中DNA甲基化功能和调控机制的作用 | 哮喘中的DNA甲基化 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-08-07 |
Heterogeneous expression of the SARS-Coronavirus-2 receptor ACE2 in the human respiratory tract
2020-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2020.102976
PMID:32971472
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和免疫组织化学技术，系统研究了人类呼吸道中SARS-CoV-2受体ACE2的表达情况及其与COVID-19严重程度风险因素的关系 | 首次详细描述了ACE2蛋白在人类呼吸道中的分布，并探讨了其与COVID-19易感性的关系 | NA | 研究SARS-CoV-2受体ACE2在人类呼吸道中的表达及其与COVID-19严重程度的关系 | 人类呼吸道中的ACE2蛋白表达 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-08-05 |
Functionally Diverse Inflammatory Responses in Peripheral and Liver Monocytes in Alcohol-Associated Hepatitis
2020-Oct, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.1563
PMID:33024916
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研究论文 | 本研究探讨了酒精相关肝炎中外周和肝脏单核细胞的功能多样性炎症反应 | 揭示了在酒精相关肝炎中不同单核细胞亚群对炎症反应的不同表达特征 | 研究可能未考虑其他慢性肝病与酒精相关肝炎的比较 | 研究酒精相关肝炎中单核细胞的炎症反应机制 | 酒精相关肝炎患者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 酒精相关肝炎患者和健康对照的外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-08-07 |
DNF: A differential network flow method to identify rewiring drivers for gene regulatory networks
2020-Oct-14, Neurocomputing
IF:5.5Q1
DOI:10.1016/j.neucom.2020.05.028
PMID:34025035
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研究论文 | 本文提出了一种差异网络流（DNF）方法，用于识别基因调控网络中的关键调节因子 | DNF方法通过量化网络流分布的差异，能够从局部到全局捕捉全面的拓扑差异，从而更准确地识别驱动基因 | NA | 旨在开发一种新方法，能够从随机变化和下游效应中分离出真正的调控元件的影响 | 基因调控网络中的关键调节因子 | 基因组学 | 神经退行性疾病 | NA | NA | 基因组数据 | 四个人类数据集来自癌症基因组图谱和三个小鼠神经和造血分化单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-08-07 |
STAT3-BDNF-TrkB signalling promotes alveolar epithelial regeneration after lung injury
2020-10, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-0569-x
PMID:32989251
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研究论文 | 本文通过全基因组染色质可及性和基因表达分析，研究了急性肺损伤后肺泡上皮再生的机制，特别是STAT3-BDNF-TrkB信号轴的作用。 | 首次揭示了STAT3-BDNF-TrkB信号轴在肺泡上皮再生中的生物学和治疗重要性。 | NA | 阐明肺损伤后肺泡上皮再生的机制。 | 肺泡上皮细胞（AT2和AT1细胞）及其再生过程。 | 数字病理学 | 肺疾病 | 全基因组染色质可及性分析，单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-07 |
Optimized design of single-cell RNA sequencing experiments for cell-type-specific eQTL analysis
2020-10-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19365-w
PMID:33127880
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研究论文 | 本文探讨了在相同预算下，通过低覆盖度的单细胞RNA测序增加样本数量而非高覆盖度测序少量样本，可以提高细胞类型特异性表达数量性状位点（eQTL）映射的统计能力 | 提出了一种优化设计单细胞RNA测序实验的方法，以提高细胞类型特异性eQTL分析的统计能力，并提供了相应的网络工具 | 文章未明确提及具体的局限性 | 优化单细胞RNA测序实验设计，以提高细胞类型特异性eQTL分析的效率和成本效益 | 单细胞RNA测序实验设计及其在细胞类型特异性eQTL分析中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA序列 | 120个个体 | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-07 |
A rank-based marker selection method for high throughput scRNA-seq data
2020-Oct-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-03641-z
PMID:33097004
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研究论文 | 本文介绍了一种基于排序的标记选择方法RANKCORR，用于高吞吐量的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | RANKCORR方法通过在少量基因中对mRNA计数数据进行排序和线性分离，提供了一种非参数方法来分析计数数据，并能以多类别方式进行标记选择 | 尽管RANKCORR在性能上表现优异，但大多数方法的总体表现相似，因此算法速度成为处理大型数据集时最重要的考虑因素 | 开发一种新的计算方法，用于从单细胞RNA测序数据中选择遗传标记，以识别特定的细胞群体 | 单细胞RNA测序数据中的遗传标记选择 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA计数数据 | 涉及的数据集大小从数千到一百万个细胞不等 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-07 |
Single Cell ADNP Predictive of Human Muscle Disorders: Mouse Knockdown Results in Muscle Wasting
2020-Oct-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells9102320
PMID:33086621
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析，探讨了ADNP蛋白在人类肌肉疾病中的作用及其治疗潜力 | 首次通过单细胞转录组学揭示ADNP在人类肌肉发育和疾病中的关键作用，并验证了ADNP片段NAP的治疗效果 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体试验验证 | 探究ADNP在肌肉疾病中的作用及开发个性化诊断和治疗方法 | ADNP蛋白及其在肌肉疾病中的作用 | NA | 肌肉疾病 | 单细胞转录组学 | CRISPR-Cas9 | 转录组数据 | 涉及小鼠模型和人类肌肉细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-07 |
Developmental scRNAseq Trajectories in Gene- and Cell-State Space-The Flatworm Example
2020-10-16, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes11101214
PMID:33081343
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，结合自组织映射机器学习方法，研究了扁形动物组织发育过程中的基因状态空间轨迹，并生成了RNA速度的发育“矢量场”，以预测表达景观中RNA丰度的变化。 | 本文创新性地将细胞状态空间的发展轨迹与基因状态空间的轨迹相结合，更清晰地揭示了细胞发育过程中转录程序的变化。 | NA | 研究细胞发育过程中转录程序的变化，并预测RNA丰度的变化。 | 扁形动物的组织发育。 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | 自组织映射 | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-07 |
Stem cells and lung regeneration
2020-10-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00036.2020
PMID:32783658
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综述 | 本文综述了干细胞在肺再生中的应用，讨论了已知的干细胞/祖细胞群体及其在慢性肺病中的作用和治疗前景 | 介绍了新的谱系追踪动物模型和单细胞RNA测序技术，这些技术提供了关于干细胞亚型、过渡状态、细胞标记物和复杂分化途径的关键信息 | 对人类肺发育机制、肺干细胞和祖细胞类型的精确身份和功能以及肺命运的遗传和表观遗传控制的理解仍有限 | 探讨干细胞在肺再生中的应用，以及如何利用内源性干细胞作为治疗肺疾病的方法 | 人类肺干细胞和祖细胞类型及其在肺再生和慢性肺病中的作用 | NA | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics identifies divergent developmental lineage trajectories during human pituitary development
2020-10-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19012-4
PMID:33077725
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人类胎儿垂体中的4113个单个细胞，揭示了五个激素产生细胞谱系的不同发育轨迹和过渡中间状态 | 发现了皮质激素细胞在完全分化前的早期中间状态，以及PIT-1谱系细胞从共同前体细胞分离的过程，还识别了一种表达灵长类特异性激素的胎儿促性腺激素细胞亚型 | NA | 研究人类垂体发育过程中的细胞分化和转录因子动态 | 人类胎儿垂体的单个细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 4113个单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
Identification of a distinct luminal subgroup diagnosing and stratifying early stage prostate cancer by tissue-based single-cell RNA sequencing
2020-10-08, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-020-01264-9
PMID:33032611
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研究论文 | 本研究通过基于组织的单细胞RNA测序技术，识别并分类早期前列腺癌中的一个独特的腔内亚群 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究前列腺癌的异质性，并发现了一个具有高拷贝数变异水平和前列腺癌相关代谢过程标记基因的恶性腔内集群 | 尚未在前列腺癌异质性研究中使用单细胞RNA测序技术 | 寻找更好的疾病诊断和分类的生物标志物 | 前列腺癌的异质性和细胞起源 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 15个细胞群，包括3个具有不同表达谱的腔内集群 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
PhyDOSE: Design of follow-up single-cell sequencing experiments of tumors
2020-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008240
PMID:33001973
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研究论文 | 本文介绍了PhyDOSE方法，该方法利用大量和单细胞DNA测序数据来优化后续单细胞测序实验的设计，以高效重建肿瘤的系统发育 | PhyDOSE方法通过识别区分不同候选树的少数克隆，并将其纳入概率模型中，以推断需要测序的细胞数量，从而自信地重建肿瘤的系统发育 | NA | 优化肿瘤单细胞测序实验的设计，以提高癌症基因组学中下游分析的准确性 | 肿瘤的单细胞测序实验设计 | 数字病理学 | 白血病，急性髓系白血病，肺癌 | 单细胞DNA测序 | 概率模型 | DNA测序数据 | 多个白血病和肺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
Modeling tissue-relevant Caenorhabditis elegans metabolism at network, pathway, reaction, and metabolite levels
2020-10, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20209649
PMID:33022146
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研究论文 | 本文介绍了MEtabolic models Reconciled with Gene Expression (MERGE)计算流程，用于基于单细胞RNA测序数据预测秀丽隐杆线虫组织相关代谢功能 | MERGE流程能够预测秀丽隐杆线虫的新陈代谢功能，并可应用于其他系统 | NA | 开发代谢网络模型，用于个体细胞的代谢功能预测 | 秀丽隐杆线虫的组织相关代谢功能 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 代谢网络模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-07 |
Analysis of the molecular nature associated with microsatellite status in colon cancer identifies clinical implications for immunotherapy
2020-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-001437
PMID:33028695
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研究论文 | 本研究通过分析结直肠癌中的微卫星稳定性（MSS）和微卫星不稳定性（MSI）的分子特性，探讨了其对免疫治疗临床结果的影响 | 构建了一个与微卫星状态相关的基因特征，用于预测结直肠癌患者的预后和免疫检查点抑制剂联合抗VEGF治疗的反应 | NA | 阐明微卫星不稳定性在结直肠癌中的分子本质，并探讨其对免疫治疗的影响 | 结直肠癌中的微卫星稳定性和不稳定性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 随机森林算法，神经网络 | 神经网络 | 转录组数据 | TCGA数据集及自建数据集（包括39例低肿瘤突变负荷MSS结直肠癌，10例高肿瘤突变负荷MSS结直肠癌，15例MSI结直肠癌） | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-07 |
A hybrid deep clustering approach for robust cell type profiling using single-cell RNA-seq data
2020-10, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.074427.119
PMID:32532794
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研究论文 | 本文开发了一种新的混合深度聚类方法DUSC，用于使用单细胞RNA测序数据进行稳健的细胞类型分析 | DUSC方法结合了基于深度学习架构的特征生成和模型基础的聚类算法，能够生成紧凑且信息丰富的单细胞转录组数据表示，并生成稳健的聚类 | NA | 解决现有方法在处理单细胞RNA测序数据中大量噪声和细胞类型差异变异时的不足 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚型和特定细胞状态 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 转录组数据 | 来自三阴性乳腺癌肿瘤的单细胞转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
A human circulating immune cell landscape in aging and COVID-19
2020-10, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-020-00762-2
PMID:32780218
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序、质谱流式细胞术和单细胞ATAC测序，比较了年轻和老年受试者以及COVID-19患者外周血中免疫细胞类型的变化 | 首次全面详细地描述了随着年龄增长，人类循环免疫细胞的变化情况，并揭示了COVID-19如何促进与年龄相关的免疫细胞极化和基因表达 | NA | 研究年龄和COVID-19对人类循环免疫细胞景观的影响 | 年轻和老年受试者以及COVID-19患者的外周血免疫细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、质谱流式细胞术、单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 细胞 | 年轻和老年受试者以及COVID-19患者的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
Integrative genomics approach identifies conserved transcriptomic networks in Alzheimer's disease
2020-10-10, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaa182
PMID:32803238
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研究论文 | 本研究采用系统生物学元分析方法，结合多尺度数据集，分析了阿尔茨海默病（AD）的遗传结构，并识别了AD相关的转录组网络。 | 本研究通过整合多种数据类型，包括DNA甲基化、组蛋白乙酰化、转录组和全基因组关联研究等，识别了AD中未在正常衰老中改变的稳健转录组失调。 | NA | 进一步阐明阿尔茨海默病的遗传结构 | 阿尔茨海默病 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | DNA甲基化、组蛋白乙酰化、转录组和全基因组关联研究 | 共表达网络分析 | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 超过1200个人脑样本，27,321个来自人类死后前额叶皮质组织的细胞核 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
Single-cell deconstruction of post-sepsis skeletal muscle and adipose tissue microenvironments
2020-10, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.12596
PMID:32643301
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研究论文 | 本研究全面评估了实验性脓毒症诱导后肌肉和脂肪在单细胞分辨率下的转录变化 | 首次从组织微环境的角度全面评估了脓毒症后肌肉和脂肪的单细胞转录变化 | NA | 研究脓毒症后肌肉和脂肪组织的微环境变化 | 小鼠的骨骼肌和内脏白色脂肪组织 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达 | 骨骼肌1438个单细胞，脂肪组织2281个单细胞 | NA | NA | NA | NA |