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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-03 |
Translocation of Viable Gut Microbiota to Mesenteric Adipose Drives Formation of Creeping Fat in Humans
2020-10-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.09.009
PMID:32991841
|
研究论文 | 本文探讨了克罗恩病中活的肠道微生物向肠系膜脂肪组织的易位如何驱动“爬行脂肪”的形成 | 首次发现肠道内特定菌群(如无害梭菌)能够存活并易位至肠系膜脂肪组织,进而诱导爬行脂肪的形成,揭示了微生物易位在CD肠外表现中的中心作用 | 未明确提及研究局限性 | 探究克罗恩病中微生物易位是否为爬行脂肪形成的关键信号 | 克罗恩病患者回肠手术切除标本中的黏膜相关肠道菌群及肠系膜脂肪组织 | 机器学习 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及克罗恩病患者回肠手术切除标本及无菌小鼠实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 2 | 2026-05-03 |
Mapping developmental trajectories and subtype diversity of normal and glaucomatous human retinal ganglion cells by single-cell transcriptome analysis
2020-10-01, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3238
PMID:32557945
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析描绘正常和青光眼人类视网膜神经节细胞的发育轨迹和亚型多样性 | 利用疾病在培养皿中的干细胞模型,结合单细胞转录组分析,揭示SIX6风险等位基因对RGC发育轨迹和亚型组成的影响,并确定mTOR和Notch信号通路的失调机制 | 未提及具体局限性 | 研究青光眼患者RGC对变性的发育易感性,为治疗策略提供依据 | SIX6风险等位基因原发性开角型青光眼患者特异性及对照人类视网膜神经节细胞(hRGCs) | 单细胞转录组学 | 青光眼 | 单细胞转录组分析 | 干细胞模型(疾病在培养皿中) | 单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-04-30 |
Stromal cell diversity associated with immune evasion in human triple-negative breast cancer
2020-10-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2019104063
PMID:32790115
|
research paper | 通过对五例三阴性乳腺癌进行单细胞RNA测序,揭示了肿瘤基质中成纤维细胞和血管周细胞的异质性及其与免疫逃逸的关联 | 首次描绘了三阴性乳腺癌中两种癌症相关成纤维细胞和两种血管周样细胞亚群,并揭示了它们与细胞毒性T细胞功能障碍和排斥的强相关性 | 未明确说明局限性 | 探究人类三阴性乳腺癌中肿瘤基质的细胞异质性及其与免疫逃逸的关系 | 五例三阴性乳腺癌患者的肿瘤组织样本 | machine learning | lung cancer | NA | NA | 文本和测序数据 | 5例三阴性乳腺癌患者肿瘤组织 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-04-30 |
A Widespread Neurogenic Potential of Neocortical Astrocytes Is Induced by Injury
2020-10-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.07.006
PMID:32758425
|
研究论文 | 研究发现,当Notch信号被阻断时,大脑皮层星形胶质细胞在损伤后能够产生新的神经元,并揭示了其分子调控机制 | 首次证明Notch信号缺陷的星形胶质细胞在损伤后可转变为神经干细胞样状态并启动神经发生程序,且成功将星形胶质细胞神经发生与反应性胶质增生在单细胞水平上解耦 | 仅在小鼠模型中验证,且神经发生效率较低,仅少数预激活的星形胶质细胞在损伤后启动神经发生程序 | 阐明非神经源性脑区星形胶质细胞在损伤后产生新神经元的分子调控机制 | 小鼠大脑皮层星形胶质细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠大脑皮层细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 5 | 2026-04-26 |
Hemolysis transforms liver macrophages into antiinflammatory erythrophagocytes
2020-10-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI137282
PMID:32663195
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现溶血过程中肝脏巨噬细胞转化为抗炎性红细胞吞噬细胞,并可缓解炎症性疾病 | 首次揭示溶血诱导的肝脏巨噬细胞转化为具有MarcohiHmoxhiMHC class IIlo特征的红细胞吞噬细胞,并证明这种表型转化可显著减轻由巨噬细胞驱动的无菌性炎症疾病 | NA | 研究溶血过程中肝脏巨噬细胞吞噬受损红细胞后功能的改变及其在炎症性疾病中的作用 | 小鼠和人类巨噬细胞 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪性肝炎, 高炎症综合征 | 单细胞RNA测序, 转座酶可及染色质单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 遗传性球形红细胞增多症小鼠模型和抗CD40诱导的高炎症综合征小鼠模型,以及非酒精性脂肪性肝炎小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 |
| 6 | 2026-04-03 |
Circulating testican-2 is a podocyte-derived marker of kidney health
2020-10-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2009606117
PMID:32958645
|
研究论文 | 本文通过蛋白质组学分析发现循环中的testican-2是一种足细胞来源的肾脏健康生物标志物 | 首次发现testican-2在肾脏健康中的关键作用,证明其可作为肾脏功能和预后的新型生物标志物 | 研究样本量相对有限,且主要基于观察性研究,需要进一步验证其因果关系 | 探索肾脏释放到循环中的分子是否能够反映肾脏健康状况 | 人类肾脏组织、循环蛋白质、足细胞 | 生物医学研究 | 肾脏疾病 | 适体蛋白质组学、单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、电子显微镜 | NA | 蛋白质组数据、基因表达数据、影像数据 | 22名接受侵入性采样的个体,Jackson心脏研究(1,928名非裔美国人),Framingham心脏研究(1,621名白人) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-03-02 |
A distinct GM-CSF+ T helper cell subset requires T-bet to adopt a TH1 phenotype and promote neuroinflammation
2020-Oct-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aba9953
PMID:33097590
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和高维单细胞质谱流式技术,识别了一种独特的GM-CSF+ T辅助细胞亚群(TGM),并探讨其在神经炎症中的作用 | 首次系统性地识别并表征了GM-CSF+ TGM细胞亚群,揭示了其缺乏经典T细胞谱系标志,但能在IL-12刺激下向TH1表型转化并促进神经炎症 | 研究主要基于小鼠模型和健康人血液样本,在人类自身免疫疾病中的直接验证尚需进一步研究 | 探究GM-CSF+ T辅助细胞的身份、特性及其在自身免疫神经炎症中的致病机制 | 健康人血液中的抗原经验性CD45RA- CD4+ T细胞,以及实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型中的外周和中枢神经系统细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序,高维单细胞质谱流式 | NA | 单细胞转录组数据,质谱流式数据 | 健康人血液样本及EAE小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-02-20 |
LIM-Nebulette Reinforces Podocyte Structural Integrity by Linking Actin and Vimentin Filaments
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019121261
PMID:32737144
|
研究论文 | LIM-nebulette通过连接肌动蛋白和波形蛋白丝来增强足细胞结构完整性 | 揭示了LIM-nebulette在足细胞中作为多功能细胞骨架蛋白的新作用,通过主动重组黏着斑、肌动蛋白细胞骨架和中间丝来维持结构完整性 | NA | 研究足细胞结构完整性的细胞骨架机制 | 大鼠、小鼠和人类的足细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、免疫金标记、高内涵成像、超分辨率显微镜、原子力显微镜、活细胞钙成像 | NA | 图像、文本、视频 | 大鼠、小鼠和人类细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2025-12-19 |
T-cell repertoire analysis and metrics of diversity and clonality
2020-10, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2020.07.010
PMID:32889231
|
综述 | 本文综述了T细胞受体(TCR)测序技术、计算工具及多样性指标,以解析免疫库在健康和疾病中的动态 | 整合了高通量测序技术与计算工具,用于TCR库的聚类、特异性预测及多样性分析,推动个性化免疫治疗 | NA | 综述T细胞受体测序技术、计算工具及多样性指标,以促进免疫库在疾病和治疗中的研究 | T细胞受体(TCR)库 | 自然语言处理 | NA | 高通量测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Drosophila Voltage-Gated Sodium Channels Are Only Expressed in Active Neurons and Are Localized to Distal Axonal Initial Segment-like Domains
2020-10-14, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0142-20.2020
PMID:32928889
|
研究论文 | 本研究通过标记果蝇中唯一的电压门控钠通道Para,揭示了其在神经元中的表达模式和亚细胞定位 | 首次发现果蝇钠通道仅表达于活跃神经元,并定位于轴突远端起始段样结构 | 研究主要聚焦果蝇模型,在其它无脊椎动物中的普适性需要进一步验证 | 探究无脊椎神经元中动作电位的起始位置和钠通道的表达特征 | 果蝇胚胎期、幼虫期和成年期中枢神经系统神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 全细胞膜片钳电生理记录, 基因标记技术 | NA | 基因表达数据, 电生理记录数据, 转录组数据 | 果蝇第三龄幼虫全脑单细胞转录组图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2024-08-09 |
Correction to: Prioritizing Candidates of Post-Myocardial Infarction Heart Failure Using Plasma Proteomics and Single-Cell Transcriptomics
2020-Oct-13, Circulation
IF:35.5Q1
DOI:10.1161/CIR.0000000000000926
PMID:33044854
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Iterative transfer learning with neural network for clustering and cell type classification in single-cell RNA-seq analysis
2020-Oct, Nature machine intelligence
IF:18.8Q1
DOI:10.1038/s42256-020-00233-7
PMID:33817554
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研究论文 | 开发了一种用于单细胞RNA测序分析的迭代迁移学习算法ItClust,用于细胞聚类和细胞类型分类 | 结合了监督细胞类型分类算法的思想,同时利用目标数据信息确保对仅存在于目标数据中的细胞具有分类敏感性 | 性能可能仍受源数据质量影响,对新型细胞类型的分类能力未明确说明 | 提高单细胞RNA测序分析中细胞聚类和细胞类型分类的准确性 | 来自不同物种和组织的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 来自不同物种和组织的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Inflammatory Bowel Disease Through the Lens of Single-cell RNA-seq Technologies
2020-10-23, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izaa089
PMID:32386055
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在炎症性肠病研究中的应用进展 | 利用多模式单细胞技术重新定义肠道黏膜细胞群体,为精准医疗提供新见解 | NA | 总结单细胞技术在IBD研究中的进展并探讨其临床应用潜力 | 肠道黏膜中的上皮细胞、间充质细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Second-Strand Synthesis-Based Massively Parallel scRNA-Seq Reveals Cellular States and Molecular Features of Human Inflammatory Skin Pathologies
2020-10-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.09.015
PMID:33053333
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研究论文 | 开发了一种名为Seq-Well S的大规模并行单细胞RNA测序方法,用于分析人类炎症性皮肤病的细胞状态和分子特征 | 采用随机引物第二链合成技术,显著提高了转录本捕获效率和基因检测能力,相比之前版本分别提升10倍和5倍 | NA | 开发高保真、高通量的单细胞RNA测序平台,以准确报告细胞关键表型特征的表达 | 人类炎症性皮肤病的细胞 | 单细胞测序 | 炎症性皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 五种人类炎症性皮肤病样本 | NA | 单细胞RNA-seq | Seq-Well S | 基于第二链合成的大规模并行单细胞RNA测序协议 |
| 15 | 2025-10-06 |
RUNX1 marks a luminal castration-resistant lineage established at the onset of prostate development
2020-10-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.60225
PMID:33025905
|
研究论文 | 本研究揭示了RUNX1标记的前列腺近腔细胞亚群在发育早期形成并具有内在去势抵抗特性 | 发现RUNX1标记的特定近腔细胞亚群,不同于已知的NKX3.1阳性细胞,且具有独特的发育起源和去势抵抗特性 | 研究主要基于小鼠模型,人类前列腺中的相关性尚需验证 | 解析前列腺上皮细胞层次结构和谱系异质性 | 小鼠前列腺发育和成年期的近腔细胞亚群 | 发育生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪 | NA | 基因表达数据, 谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptome atlas of marsupial embryogenesis and X inactivation
2020-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2629-6
PMID:32814901
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了有袋类动物胚胎发育和X染色体失活过程 | 首次对有袋类哺乳动物胚胎进行单细胞转录组分析,揭示了X染色体失活的新机制和保守的谱系标记 | 研究仅针对单一有袋类物种(灰短尾负鼠),可能无法完全代表所有有袋类动物 | 探索哺乳动物胚胎发育和X染色体剂量补偿的进化机制 | 灰短尾负鼠(Monodelphis domestica)胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Pathway identification through transcriptome analysis
2020-10, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2020.109701
PMID:32649993
|
综述 | 本文综述了通过转录组学方法研究多囊肾病发病机制的最新进展 | 系统回顾了转录组学技术在多囊肾病研究中的应用,重点关注Pkd1失活后的转录级联反应 | NA | 通过转录组学分析识别多囊肾病相关信号通路 | 多囊肾病发病机制 | 自然语言处理 | 多囊肾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-07 |
Quantitative planar array screen of 1000 proteins uncovers novel urinary protein biomarkers of lupus nephritis
2020-10, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2019-216312
PMID:32651195
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研究论文 | 通过定量平面蛋白质微阵列筛选1000种蛋白质,发现狼疮性肾炎的新型尿液生物标志物 | 首次使用定量平面蛋白质微阵列技术对1000种尿液蛋白质进行无偏筛选,发现多个优于传统标志物的新型生物标志物 | 样本量有限,需要在更大队列中进一步验证 | 发现狼疮性肾炎的新型尿液生物标志物 | 系统性红斑狼疮患者的尿液样本 | 生物标志物研究 | 狼疮性肾炎 | 定量平面蛋白质微阵列, ELISA, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, RNA测序数据 | 多个独立SLE患者队列(包括非活动期、活动非肾脏期、活动肾脏期患者) | NA | 蛋白质微阵列, 单细胞RNA测序 | NA | 定量平面蛋白质微阵列 |
| 19 | 2024-11-18 |
Prediction of single-cell gene expression for transcription factor analysis
2020-10-30, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaa113
PMID:33124660
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法,利用顺式调控基序和表观遗传特征来预测单细胞水平的基因表达,并用于转录因子分析 | 本文提出了一种基于树引导的多任务学习框架,将每个细胞视为一个任务,用于解释单细胞基因表达值 | 该方法目前仅限于使用转录因子结合亲和力或特定基因组区域的转录因子ChIP-seq数据 | 预测单细胞RNA数据中的转录因子调控 | 单细胞基因表达和转录因子 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 树引导的多任务学习框架 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-11-18 |
A map of tumor-host interactions in glioma at single-cell resolution
2020-10-14, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaa109
PMID:33155039
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scTHI的新方法,用于识别单细胞RNA测序数据中跨细胞簇的显著激活的配体-受体相互作用,并应用于胶质瘤中揭示配体-受体相互作用 | 提出了scTHI方法,用于识别单细胞RNA测序数据中的配体-受体相互作用,并展示了其在胶质瘤中的应用 | NA | 理解免疫细胞与癌细胞之间的信号交流,以识别免疫肿瘤学治疗靶点 | 胶质瘤中的肿瘤-宿主相互作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达 | 71名患者的57,060个基因表达谱 | NA | NA | NA | NA |