单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 134 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 1 | 2025-10-06 |
Drosophila Voltage-Gated Sodium Channels Are Only Expressed in Active Neurons and Are Localized to Distal Axonal Initial Segment-like Domains
2020-10-14, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0142-20.2020
PMID:32928889
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研究论文 | 本研究通过标记果蝇中唯一的电压门控钠通道Para，揭示了其在神经元中的表达模式和亚细胞定位 | 首次发现果蝇钠通道仅表达于活跃神经元，并定位于轴突远端起始段样结构 | 研究主要聚焦果蝇模型，在其它无脊椎动物中的普适性需要进一步验证 | 探究无脊椎神经元中动作电位的起始位置和钠通道的表达特征 | 果蝇胚胎期、幼虫期和成年期中枢神经系统神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 全细胞膜片钳电生理记录, 基因标记技术 | NA | 基因表达数据, 电生理记录数据, 转录组数据 | 果蝇第三龄幼虫全脑单细胞转录组图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2024-08-09 |
Correction to: Prioritizing Candidates of Post-Myocardial Infarction Heart Failure Using Plasma Proteomics and Single-Cell Transcriptomics
2020-Oct-13, Circulation
IF:35.5Q1
DOI:10.1161/CIR.0000000000000926
PMID:33044854
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
Iterative transfer learning with neural network for clustering and cell type classification in single-cell RNA-seq analysis
2020-Oct, Nature machine intelligence
IF:18.8Q1
DOI:10.1038/s42256-020-00233-7
PMID:33817554
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研究论文 | 开发了一种用于单细胞RNA测序分析的迭代迁移学习算法ItClust，用于细胞聚类和细胞类型分类 | 结合了监督细胞类型分类算法的思想，同时利用目标数据信息确保对仅存在于目标数据中的细胞具有分类敏感性 | 性能可能仍受源数据质量影响，对新型细胞类型的分类能力未明确说明 | 提高单细胞RNA测序分析中细胞聚类和细胞类型分类的准确性 | 来自不同物种和组织的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 来自不同物种和组织的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Inflammatory Bowel Disease Through the Lens of Single-cell RNA-seq Technologies
2020-10-23, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izaa089
PMID:32386055
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在炎症性肠病研究中的应用进展 | 利用多模式单细胞技术重新定义肠道黏膜细胞群体，为精准医疗提供新见解 | NA | 总结单细胞技术在IBD研究中的进展并探讨其临床应用潜力 | 肠道黏膜中的上皮细胞、间充质细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
Second-Strand Synthesis-Based Massively Parallel scRNA-Seq Reveals Cellular States and Molecular Features of Human Inflammatory Skin Pathologies
2020-10-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.09.015
PMID:33053333
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研究论文 | 开发了一种名为Seq-Well S的大规模并行单细胞RNA测序方法，用于分析人类炎症性皮肤病的细胞状态和分子特征 | 采用随机引物第二链合成技术，显著提高了转录本捕获效率和基因检测能力，相比之前版本分别提升10倍和5倍 | NA | 开发高保真、高通量的单细胞RNA测序平台，以准确报告细胞关键表型特征的表达 | 人类炎症性皮肤病的细胞 | 单细胞测序 | 炎症性皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 五种人类炎症性皮肤病样本 | NA | 单细胞RNA-seq | Seq-Well S | 基于第二链合成的大规模并行单细胞RNA测序协议 |
| 6 | 2025-10-06 |
RUNX1 marks a luminal castration-resistant lineage established at the onset of prostate development
2020-10-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.60225
PMID:33025905
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研究论文 | 本研究揭示了RUNX1标记的前列腺近腔细胞亚群在发育早期形成并具有内在去势抵抗特性 | 发现RUNX1标记的特定近腔细胞亚群，不同于已知的NKX3.1阳性细胞，且具有独特的发育起源和去势抵抗特性 | 研究主要基于小鼠模型，人类前列腺中的相关性尚需验证 | 解析前列腺上皮细胞层次结构和谱系异质性 | 小鼠前列腺发育和成年期的近腔细胞亚群 | 发育生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪 | NA | 基因表达数据, 谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Circulating testican-2 is a podocyte-derived marker of kidney health
2020-10-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2009606117
PMID:32958645
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析发现testican-2是足细胞来源的肾脏健康生物标志物 | 首次发现testican-2在肾脏动脉-静脉梯度中显著增加，并证实其与肾功能正相关 | 研究样本量相对有限，需要更多人群验证 | 寻找能够反映肾脏健康的循环生物标志物 | 人类肾脏组织、循环蛋白质、足细胞 | 生物医学研究 | 肾脏疾病 | aptamer-based proteomics, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, 电子显微镜 | NA | 蛋白质组数据, 基因表达数据, 影像数据 | 22人（动脉-静脉采样）+ 1,928人（Jackson Heart Study）+ 1,621人（Framingham Heart Study） | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptome atlas of marsupial embryogenesis and X inactivation
2020-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2629-6
PMID:32814901
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了有袋类动物胚胎发育和X染色体失活过程 | 首次对有袋类哺乳动物胚胎进行单细胞转录组分析，揭示了X染色体失活的新机制和保守的谱系标记 | 研究仅针对单一有袋类物种（灰短尾负鼠），可能无法完全代表所有有袋类动物 | 探索哺乳动物胚胎发育和X染色体剂量补偿的进化机制 | 灰短尾负鼠（Monodelphis domestica）胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Pathway identification through transcriptome analysis
2020-10, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2020.109701
PMID:32649993
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综述 | 本文综述了通过转录组学方法研究多囊肾病发病机制的最新进展 | 系统回顾了转录组学技术在多囊肾病研究中的应用，重点关注Pkd1失活后的转录级联反应 | NA | 通过转录组学分析识别多囊肾病相关信号通路 | 多囊肾病发病机制 | 自然语言处理 | 多囊肾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-07 |
Quantitative planar array screen of 1000 proteins uncovers novel urinary protein biomarkers of lupus nephritis
2020-10, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2019-216312
PMID:32651195
|
研究论文 | 通过定量平面蛋白质微阵列筛选1000种蛋白质，发现狼疮性肾炎的新型尿液生物标志物 | 首次使用定量平面蛋白质微阵列技术对1000种尿液蛋白质进行无偏筛选，发现多个优于传统标志物的新型生物标志物 | 样本量有限，需要在更大队列中进一步验证 | 发现狼疮性肾炎的新型尿液生物标志物 | 系统性红斑狼疮患者的尿液样本 | 生物标志物研究 | 狼疮性肾炎 | 定量平面蛋白质微阵列, ELISA, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, RNA测序数据 | 多个独立SLE患者队列（包括非活动期、活动非肾脏期、活动肾脏期患者） | NA | 蛋白质微阵列, 单细胞RNA测序 | NA | 定量平面蛋白质微阵列 |
| 11 | 2024-11-18 |
Prediction of single-cell gene expression for transcription factor analysis
2020-10-30, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaa113
PMID:33124660
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法，利用顺式调控基序和表观遗传特征来预测单细胞水平的基因表达，并用于转录因子分析 | 本文提出了一种基于树引导的多任务学习框架，将每个细胞视为一个任务，用于解释单细胞基因表达值 | 该方法目前仅限于使用转录因子结合亲和力或特定基因组区域的转录因子ChIP-seq数据 | 预测单细胞RNA数据中的转录因子调控 | 单细胞基因表达和转录因子 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 树引导的多任务学习框架 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-11-18 |
A map of tumor-host interactions in glioma at single-cell resolution
2020-10-14, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaa109
PMID:33155039
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scTHI的新方法，用于识别单细胞RNA测序数据中跨细胞簇的显著激活的配体-受体相互作用，并应用于胶质瘤中揭示配体-受体相互作用 | 提出了scTHI方法，用于识别单细胞RNA测序数据中的配体-受体相互作用，并展示了其在胶质瘤中的应用 | NA | 理解免疫细胞与癌细胞之间的信号交流，以识别免疫肿瘤学治疗靶点 | 胶质瘤中的肿瘤-宿主相互作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达 | 71名患者的57,060个基因表达谱 | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-10-21 |
Single-Cell Analyses Identify Brain Mural Cells Expressing CD19 as Potential Off-Tumor Targets for CAR-T Immunotherapies
2020-10-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.08.022
PMID:32961131
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研究论文 | 研究报告了脑壁细胞表达CD19，可能成为CAR-T免疫疗法的非肿瘤靶点 | 首次发现脑壁细胞表达CD19，为CD19导向疗法的神经毒性提供了靶向机制解释 | 小鼠模型中脑壁细胞的CD19表达水平较低，限制了神经毒性的临床前动物模型 | 探讨CD19导向免疫疗法的神经毒性机制及潜在靶点 | 脑壁细胞及其CD19表达 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和鼠类脑组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-10-04 |
Delineation of a molecularly distinct terminally differentiated memory CD8 T cell population
2020-10-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2008571117
PMID:32978300
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研究论文 | 本文描述了一种分子上独特的终末分化记忆CD8 T细胞群体的特征 | 本文首次识别并描述了一种终末分化效应记忆CD8 T细胞群体（terminal-Tem），该群体在功能和转录上与传统的效应记忆细胞（Tem）不同 | 本文主要基于小鼠和健康人类个体的研究，未来需要在更多样本和不同疾病状态下验证terminal-Tem的存在和功能 | 研究目的是识别和描述一种新的终末分化记忆CD8 T细胞群体，并探讨其对免疫记忆和免疫治疗的影响 | 研究对象是终末分化效应记忆CD8 T细胞（terminal-Tem）及其与传统效应记忆细胞（Tem）的区别 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq）和质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 小鼠和健康人类个体的血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-09-06 |
Integrated Single-Cell Transcriptomics and Chromatin Accessibility Analysis Reveals Regulators of Mammary Epithelial Cell Identity
2020-10-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108273
PMID:33086071
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研究论文 | 本文通过整合单细胞转录组学和染色质可及性分析，揭示了乳腺上皮细胞身份的调控因子 | 本文首次通过整合单细胞转录组学和染色质可及性分析，无偏倚地重建了小鼠乳腺上皮细胞系统的细胞类型及其基因调控特征，并定义了分泌型腔细胞内的分化状态 | NA | 揭示乳腺上皮细胞身份及其分化的调控机制 | 小鼠乳腺上皮细胞系统及其基因调控特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学和染色质可及性分析 | NA | 转录组数据和染色质可及性数据 | 小鼠乳腺上皮细胞系统中的多个细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-09 |
Lineage analysis reveals an endodermal contribution to the vertebrate pituitary
2020-10-23, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aba4767
PMID:33093109
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研究论文 | 本文通过谱系追踪和时间流逝成像技术，在斑马鱼中发现了垂体前叶（腺垂体）的形成不仅依赖于已知的表皮来源，还涉及内皮细胞的贡献 | 首次揭示了内皮细胞对脊椎动物垂体的贡献，并通过单细胞RNA测序证实了内皮和表皮上皮在产生所有内分泌细胞类型方面的相似能力 | NA | 探讨脊椎动物垂体的形成过程中内皮细胞的贡献 | 斑马鱼的垂体前叶（腺垂体） | NA | NA | 谱系追踪、时间流逝成像、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-07 |
Integrated Skin Transcriptomics and Serum Multiplex Assays Reveal Novel Mechanisms of Wound Healing in Diabetic Foot Ulcers
2020-10, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db20-0188
PMID:32763913
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研究论文 | 本研究通过综合分析糖尿病足溃疡（DFU）患者的皮肤转录组和血清多重检测，揭示了伤口愈合的新机制。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析了糖尿病足溃疡患者的皮肤纤维母细胞群和炎症情况，并识别了可能影响伤口愈合的关键基因和通路。 | NA | 探讨糖尿病足溃疡伤口愈合的新机制。 | 糖尿病足溃疡患者的皮肤和血清。 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一组糖尿病足溃疡患者 | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-07 |
Identification of diverse cell populations in skeletal muscles and biomarkers for intramuscular fat of chicken by single-cell RNA sequencing
2020-Oct-31, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07136-2
PMID:33129271
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，首次描述了鸡骨骼肌在两个发育阶段的异质性，并鉴定了APOA1和COL1A1作为鸡肌内脂肪细胞的生物标志物。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了鸡骨骼肌在不同发育阶段的细胞亚群，并鉴定了新的肌内脂肪细胞生物标志物。 | NA | 研究鸡骨骼肌发育过程中的细胞异质性及其与肌内脂肪细胞的关系。 | 鸡骨骼肌在不同发育阶段的细胞亚群及其基因表达。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在孵化后第5天和第100天分别鉴定了10个和7个细胞集群。 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-07 |
Heterogeneity of Neuroinflammatory Responses in Amyotrophic Lateral Sclerosis: A Challenge or an Opportunity?
2020-Oct-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21217923
PMID:33113845
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综述 | 本文综述了肌萎缩侧索硬化症（ALS）中神经炎症反应的异质性，并探讨了其作为治疗挑战或机遇的可能性 | 介绍了单细胞和空间转录组学技术在发现新的治疗靶点和非侵入性诊断/预后标志物方面的潜力 | 异质性/多方面的微胶质细胞反应在不同中枢神经系统区域的发生为单一药物疗法的临床转化带来了障碍 | 总结过去十年中关于ALS中微胶质细胞反应复杂性的研究结果，并讨论新技术带来的新治疗途径 | 肌萎缩侧索硬化症（ALS）中的神经炎症反应及其微胶质细胞的作用 | NA | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞和空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
Genomic Analysis of Hematopoietic Stem Cell at the Single-Cell Level: Optimization of Cell Fixation and Whole Genome Amplification (WGA) Protocol
2020-Oct-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21197366
PMID:33036143
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研究论文 | 本文评估了不同的细胞免疫染色、固定和全基因组扩增方法对单细胞测序效率和产量的影响 | 优化了单细胞水平上造血干细胞的细胞固定和全基因组扩增协议 | NA | 深入理解肿瘤发病机制及肿瘤群体对治疗的反应 | 造血干细胞的单细胞基因组分析 | NA | 血液系统肿瘤 | 全基因组扩增 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |