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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2024-08-09 |
Purification of Human CD34+CD90+ HSCs Reduces Target Cell Population and Improves Lentiviral Transduction for Gene Therapy
2020-Sep-11, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2020.07.010
PMID:32802914
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研究论文 | 本研究探讨了通过纯化人CD34+CD90+造血干细胞(HSC)来减少目标细胞群并提高慢病毒转导效率,以用于基因治疗。 | 研究首次展示了CD90细胞选择策略在减少目标细胞数量的同时,不损害其植入潜力,并显著提高了慢病毒转导效率。 | NA | 研究旨在探索一种新的HSC富集策略,以提高基因治疗的效率和安全性。 | 研究对象为人的CD34+CD90+造血干细胞及其在基因治疗中的应用。 | 基因治疗 | 遗传性疾病、恶性疾病和感染性疾病 | 流式细胞术 | NA | RNA测序 | 研究涉及了不同细胞亚群的比较,具体样本数量未详细说明。 |
82 | 2024-08-09 |
Systems biological assessment of immunity to mild versus severe COVID-19 infection in humans
2020-09-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abc6261
PMID:32788292
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研究论文 | 研究分析了76名COVID-19患者和69名健康个体的免疫反应,发现COVID-19患者外周血单个核细胞中HLA-DR和促炎细胞因子的表达减少,以及mTOR信号传导和IFN-α产生的受损 | 揭示了COVID-19患者免疫反应的机制,并提出了潜在的治疗靶点 | NA | 评估轻度和重度COVID-19感染的人类免疫反应 | COVID-19患者和健康个体的免疫反应 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 76名COVID-19患者和69名健康个体 |
83 | 2024-08-09 |
Resolving Fates and Single-Cell Transcriptomes of Hematopoietic Stem Cell Clones by PolyloxExpress Barcoding
2020-09-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.07.018
PMID:32783885
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研究论文 | 本文开发了PolyloxExpress等位基因,通过Cre重组酶依赖的RNA条形码技术,实现了同一细胞中造血干细胞(HSC)命运和单细胞转录组的关联研究 | 首次将HSC的细胞命运与其单细胞转录组信息相结合,揭示了HSC克隆在转录组景观中的分布及其命运特异性的基因特征 | NA | 旨在识别HSC命运的转录组特征,并探索其分子决定因素 | 造血干细胞(HSC)及其克隆的命运和转录组 | NA | NA | Cre重组酶依赖的RNA条形码技术 | NA | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
84 | 2024-08-09 |
Dynamic single-cell phenotyping of immune cells using the microfluidic platform DropMap
2020-09, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-020-0354-0
PMID:32788719
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DropMap的微流控平台,用于同时测量单个免疫细胞的分泌动力学和其他细胞特征 | DropMap平台能够对单个免疫细胞进行定量和动态表型分析,特别是分析分泌蛋白如细胞因子和抗体 | NA | 开发一种新的微流控平台,用于动态表征免疫细胞 | 单个免疫细胞的分泌动力学和其他细胞特征 | 生物技术 | NA | 微流控技术 | NA | 图像 | 数万个单个免疫细胞 |
85 | 2024-08-09 |
Single-cell landscape of immunological responses in patients with COVID-19
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0762-x
PMID:32788748
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了COVID-19患者外周血样本中的免疫细胞转录组特征 | 首次详细描述了COVID-19患者免疫细胞的转录组特征,特别是干扰素-α反应和急性炎症反应的强度 | 样本量相对较小,可能影响结果的普遍性 | 探究COVID-19疾病严重程度与宿主免疫反应之间的关系 | COVID-19患者的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 5名健康捐赠者和13名COVID-19患者 |
86 | 2024-08-09 |
Over 60 Years of Experimental Hematology (without a License)
2020-09, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2020.08.005
PMID:32798645
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research paper | 本文作者回顾了其在实验血液学领域超过60年的研究经历,特别是在红细胞发育和功能相关蛋白质和RNA的克隆与特性研究,以及近期利用单细胞转录组学技术在红细胞前体细胞平衡和药物治疗Epo抵抗性贫血方面的研究 | 作者及其团队开发并应用了多种新颖的实验技术,如单细胞转录组学技术,以解决红细胞发育中的复杂问题 | NA | 探讨红细胞发育的调控机制及开发治疗特定血液疾病的新药物 | 红细胞发育相关的蛋白质、RNA以及红细胞前体细胞 | 分子细胞生物学 | 血液疾病 | 单细胞转录组学(scRNAseq) | NA | RNA | NA |
87 | 2024-08-09 |
Distinct Regulatory Programs Control the Latent Regenerative Potential of Dermal Fibroblasts during Wound Healing
2020-09-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.07.008
PMID:32755548
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研究论文 | 本文研究了在伤口愈合过程中,皮肤成纤维细胞的潜在再生潜能及其调控程序 | 使用互补的命运图谱方法,揭示了毛囊间质前体细胞在伤口修复中的有限贡献,以及Hic1标记的毛囊外前体细胞在修复成纤维细胞中的主要作用,并通过单细胞RNA测序和scATAC-seq分析了再生相关的转录调控和染色质可及性变化 | NA | 定义修复性成纤维细胞的谱系起源和调控程序,以改善愈合结果 | 皮肤成纤维细胞在稳态和损伤响应中的异质性,以及其在伤口愈合中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序, scATAC-seq | NA | RNA, 染色质可及性 | NA |
88 | 2024-08-09 |
Mapping systemic lupus erythematosus heterogeneity at the single-cell level
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0743-0
PMID:32747814
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了33名不同疾病活动度的系统性红斑狼疮(SLE)儿童患者和11名匹配对照的外周血单个核细胞,揭示了SLE患者血液转录组的细胞来源及其异质性 | 首次在单细胞水平上详细解析了SLE患者的血液转录组异质性,并识别出与疾病活动度相关的特定细胞亚群 | 研究主要集中在儿童SLE患者,成人SLE患者的验证样本量较少 | 解析系统性红斑狼疮转录组特征的细胞来源及其疾病异质性,为精准医疗应用奠定基础 | 系统性红斑狼疮患者的血液转录组及其细胞来源 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约276,000个外周血单个核细胞来自33名儿童SLE患者和11名对照,以及约82,000个来自成人SLE患者的单个外周血单个核细胞 |
89 | 2024-08-09 |
Single-cell atlas of colonic CD8+ T cells in ulcerative colitis
2020-09, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-1003-4
PMID:32747828
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学、T细胞受体谱分析和质谱流式细胞术,构建了健康和溃疡性结肠炎(UC)中人结肠CD8 T细胞的无偏倚图谱 | 揭示了CD8 T细胞的广泛异质性,包括扩增的效应和终末分化的后效应CD8 T细胞,并发现UC相关的效应CD8 T细胞能触发组织破坏并产生肿瘤坏死因子(TNF)-α,而后效应细胞获得先天性特征以采取可能缓解过度炎症的调节功能 | NA | 研究结肠CD8 T细胞在健康和溃疡性结肠炎中的细胞表型及其驱动免疫调节和炎症的机制 | 人结肠CD8 T细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组学、T细胞受体谱分析、质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
90 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals the landscape of early female germ cell development
2020-09, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202001034RR
PMID:32716582
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术揭示了早期雌性生殖细胞发育的转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了从原始生殖细胞到减数分裂细胞的转录组变化,并确定了减数分裂起始的关键阶段 | 研究仅限于小鼠胚胎卵巢样本,可能需要进一步研究以验证在其他物种中的适用性 | 解析雌性生殖细胞从有丝分裂到减数分裂转变的分子机制 | 小鼠胚胎卵巢中的单个生殖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 19,363个单个生殖细胞从小鼠胚胎卵巢E12.5、E14.5和E16.5收集 |
91 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome profiling reveals neutrophil heterogeneity in homeostasis and infection
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0736-z
PMID:32719519
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,分析了超过25,000个分化和成熟的鼠中性粒细胞,揭示了中性粒细胞在稳态和细菌感染中的异质性和分化景观 | 本文首次全面描述了中性粒细胞在稳态和细菌感染中的转录组景观,定义了八个具有独特分子特征的中性粒细胞群体,并展示了细菌感染如何重新编程中性粒细胞的遗传结构 | NA | 研究中性粒细胞在稳态和细菌感染中的异质性和分化机制 | 分化和成熟的鼠中性粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过25,000个分化和成熟的鼠中性粒细胞 |
92 | 2024-08-09 |
Stimulation of Oncogene-Specific Tumor-Infiltrating T Cells through Combined Vaccine and αPD-1 Enable Sustained Antitumor Responses against Established HER2 Breast Cancer
2020-09-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-0389
PMID:32732224
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研究论文 | 本文探讨了通过结合疫苗和αPD-1刺激特定肿瘤浸润T细胞,以实现对已建立的HER2阳性乳腺癌的持续抗肿瘤反应 | 本文首次提出将针对致癌驱动因子的靶向疫苗与免疫检查点阻断(ICB)相结合,以增强T细胞浸润并实现对晚期癌症的抗肿瘤免疫 | NA | 旨在增强乳腺癌免疫疗法中的T细胞浸润,并探索靶向疫苗与免疫检查点阻断的联合应用效果 | HER2阳性乳腺癌模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小数量的新生抗原和升高的免疫抑制标志物 |
93 | 2024-08-09 |
Pathogenic Autoimmunity in Atherosclerosis Evolves From Initially Protective Apolipoprotein B100-Reactive CD4+ T-Regulatory Cells
2020-09-29, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文研究了动脉粥样硬化中由最初保护性的载脂蛋白B100反应性CD4+调节T细胞演变为致病性自身免疫反应的过程。 | 发现载脂蛋白B反应性Tregs在动脉粥样硬化中具有混合表型,并揭示了其从保护性到致病性的转变过程。 | NA | 探究动脉粥样硬化中自身反应性CD4+ T细胞的功能及其与致病性TH1细胞的关系。 | 载脂蛋白B反应性CD4+ T细胞及其在动脉粥样硬化中的作用。 | NA | 心血管疾病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠和人类样本 |
94 | 2024-08-09 |
Impact of Local Alloimmunity and Recipient Cells in Transplant Arteriosclerosis
2020-09-25, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.316470
PMID:32689904
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了移植动脉硬化的细胞异质性及其潜在机制 | 发现了先前未知的细胞亚群,并揭示了CCL21/CXCR3在调节免疫反应中的重要作用 | NA | 旨在阐明移植动脉硬化中的细胞异质性及其潜在机制 | 移植动脉硬化的细胞异质性和疾病进展机制 | NA | 移植动脉硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 11,868个细胞 |
95 | 2024-08-09 |
Different lineage contexts direct common pro-neural factors to specify distinct retinal cell subtypes
2020-09-07, The Journal of cell biology
IF:7.4Q1
DOI:10.1083/jcb.202003026
PMID:32699896
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研究论文 | 本文通过在体谱系追踪技术研究斑马鱼视网膜前体细胞,揭示了神经元多样性如何从不同细胞谱系中产生 | 发现了亚型特异性的刻板神经发生谱系,并揭示了单个促神经因子在谱系依赖方式下指定不同神经元类型/亚型的能力 | NA | 探讨神经元多样性如何从不同细胞谱系中产生 | 斑马鱼视网膜前体细胞及其神经元亚型 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序和ATAC测序 | NA | 细胞谱系数据 | 约1,000个单个斑马鱼视网膜前体细胞 |
96 | 2024-08-09 |
The activation trajectory of plasmacytoid dendritic cells in vivo during a viral infection
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0731-4
PMID:32690951
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研究论文 | 本研究通过结合Ifnb1报告小鼠、流式细胞术、单细胞RNA测序、共聚焦显微镜和CD4 T细胞激活测定,深入描述并关联了感染小鼠巨细胞病毒的动物中pDC的激活状态 | 提出了一个新的模型,解释了个体pDC如何在病毒感染期间在时间和空间上紧密协调地执行不同功能 | NA | 研究pDC在病毒感染期间的功能及其调控机制 | pDC在病毒感染中的激活轨迹及其功能 | NA | NA | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 共聚焦显微镜 | NA | 细胞 | 感染小鼠巨细胞病毒的动物 |
97 | 2024-08-09 |
Corneal epithelial biology: Lessons stemming from old to new
2020-09, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2020.108094
PMID:32697979
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综述 | 本文综述了角膜上皮细胞生物学的最新进展,特别关注了新型调控因子在干细胞稳态、伤口愈合、角膜/结膜边界维持中的作用以及单细胞RNA测序在视觉生物学研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序技术在视觉生物学研究中的应用 | NA | 探讨角膜上皮细胞生物学中的新型调控因子及其在干细胞稳态和伤口愈合中的作用 | 角膜上皮细胞、干细胞、伤口愈合机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
98 | 2024-08-09 |
TOX correlates with prognosis, immune infiltration, and T cells exhaustion in lung adenocarcinoma
2020-09, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.3324
PMID:32700817
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研究论文 | 本研究探讨了TOX在肺腺癌中的预后潜力及其与免疫浸润和T细胞功能的关系 | 发现TOX表达与肺腺癌中的免疫浸润水平和T细胞耗竭状态显著相关 | NA | 探索TOX作为多种癌症特别是肺腺癌的预后生物标志物的潜力 | TOX在不同癌症中的表达及其与免疫浸润和T细胞功能的关系 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
99 | 2024-08-09 |
Harnessing Expressed Single Nucleotide Variation and Single Cell RNA Sequencing To Define Immune Cell Chimerism in the Rejecting Kidney Transplant
2020-09, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020030326
PMID:32669324
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研究论文 | 本文利用单核苷酸变异和单细胞RNA测序技术,定义了移植肾脏中的免疫细胞嵌合现象 | 通过分析单细胞RNA测序数据中的表达单核苷酸变异,准确区分了供体和受体的免疫细胞来源,并能在单细胞分辨率下研究转录组特征 | NA | 探究移植肾脏中供体来源的免疫细胞是否持续存在及其在排斥反应中的作用 | 人类移植肾脏活检核心样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | DNA序列 | 81,139个细胞 |
100 | 2024-08-09 |
Variance-adjusted Mahalanobis (VAM): a fast and accurate method for cell-specific gene set scoring
2020-09-18, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa582
PMID:32633778
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Variance-adjusted Mahalanobis(VAM)的新基因集测试方法,该方法能够处理单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据中的技术噪声、稀疏性和大样本量问题 | VAM方法能够计算细胞特异性的通路评分,将细胞-基因矩阵转换为细胞-通路矩阵,并支持群体和细胞水平的推断 | NA | 开发一种适用于单细胞RNA测序数据的基因集测试方法,以提高分类准确性和降低计算成本 | 单细胞RNA测序数据中的技术噪声、稀疏性和大样本量问题 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 大样本量 |