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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-09 |
Changes in regeneration-responsive enhancers shape regenerative capacities in vertebrates
2020-09-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaz3090
PMID:32883834
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研究论文 | 本文通过比较表观基因组学和单细胞测序研究了两种相关硬骨鱼的再生能力差异及其遗传机制 | 发现了几个再生响应增强子(RREs),包括一个已知的脊椎动物再生效应子上游的元素,并揭示了其在再生中的作用 | 该增强子在哺乳动物中存在且响应损伤,但无法在鱼类中恢复再生能力 | 探讨脊椎动物再生能力差异的遗传机制 | 两种相关硬骨鱼的再生能力 | NA | NA | 比较表观基因组学,单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 两种相关硬骨鱼 | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-09 |
Epigenetic regulation of the PGE2 pathway modulates macrophage phenotype in normal and pathologic wound repair
2020-09-03, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.138443
PMID:32879137
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研究论文 | 本文研究了在正常和病理伤口修复过程中,表观遗传调控对PGE2通路的影响,以及其对巨噬细胞表型的调节作用 | 首次揭示了TGF-β诱导的miRNA29b通过抑制DNA甲基转移酶3b介导的Cox-2启动子超甲基化,增加COX-2/PGE2的产生,以及MLL1上调cPLA2表达并驱动COX-2/PGE2的过程 | NA | 探讨表观遗传调控在正常和病理伤口修复中对巨噬细胞表型和功能的影响 | 人类和小鼠的伤口巨噬细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠的伤口组织 | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-09 |
Hematopoiesis in High Definition: Combining State and Fate Mapping
2020-09-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.08.010
PMID:32888423
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研究论文 | 本文结合谱系追踪和单细胞测序方法,同时分析克隆和转录轨迹,以深入了解造血过程中的组织和决策机制 | 本文通过同时考虑克隆和转录轨迹,提供了对造血组织和决策机制的关键新见解 | NA | 探索造血过程中的组织和决策机制 | 造血过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-09 |
Extensive and spatially variable within-cell-type heterogeneity across the basolateral amygdala
2020-09-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.59003
PMID:32869744
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和原位杂交技术,揭示了小鼠基底侧杏仁核复合体(BLA)内细胞类型特异性的转录组异质性和空间分布特征 | 首次详细描述了BLA中细胞类型的转录组异质性及其与空间分布的关系,并展示了这种异质性在局部形态和远程连接中的体现 | NA | 旨在理解基底侧杏仁核复合体的细胞类型特异性转录组景观及其在功能多样性中的作用 | 小鼠基底侧杏仁核复合体的细胞类型及其转录组异质性 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,原位杂交 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-09 |
Application of single-cell sequencing in autoimmune diseases
2020-Sep-01, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000001050
PMID:32889911
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-09 |
A pathogenic and clonally expanded B cell transcriptome in active multiple sclerosis
2020-09-15, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2008523117
PMID:32859762
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞免疫球蛋白测序,探讨了多发性硬化症中B细胞的致病作用及其分子机制 | 首次通过多种测序技术综合分析了多发性硬化症患者脑脊液和血液中B细胞的转录组特征,揭示了特定信号通路的激活与抑制 | 样本量相对较小,且未检测到病毒转录本,可能限制了对病毒在多发性硬化症中作用的理解 | 探究多发性硬化症中B细胞的致病作用及其分子机制 | 多发性硬化症患者的脑脊液和血液中的B细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、单细胞免疫球蛋白测序(scIg-Seq)、荧光激活细胞分选(FACS)、批量RNA测序(RNA-Seq) | NA | 转录组数据 | 12名复发缓解型多发性硬化症患者、1名其他神经系统疾病患者、3名健康对照者 | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics identifies a distinct luminal progenitor cell type in distal prostate invagination tips
2020-09, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-020-0642-1
PMID:32807988
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,鉴定并描述了一种独特的远端前列腺内陷尖端的管腔前体细胞类型 | 首次鉴定出一种名为Luminal-C的独特管腔细胞类型,并证实其在体外和体内具有较强的器官形成和上皮管道再生能力 | NA | 旨在识别前列腺干细胞/前体细胞并阐明前列腺上皮细胞谱系层次结构,以理解前列腺癌的起始机制 | 小鼠和人类的前列腺细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 35,129个小鼠前列腺细胞和11,374个人类前列腺细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-09 |
Disturbed nitric oxide signalling gives rise to congenital bicuspid aortic valve and aortopathy
2020-09-28, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.044990
PMID:32801116
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研究论文 | 本研究通过组织学检查和超声成像技术,结合细胞系分析和单细胞RNA测序,探讨了先天性二叶主动脉瓣(BAV)相关主动脉病变的发病机制。 | 首次揭示了内皮介导的一氧化氮(NO)信号通路紊乱在BAV相关主动脉病变中的作用,特别是抑制弹性纤维形成导致主动脉扩张和撕裂。 | 研究仅在特定的小鼠模型中进行,结果的普遍性和在人类中的适用性需要进一步验证。 | 探究先天性二叶主动脉瓣相关主动脉病变的发病机制。 | 先天性二叶主动脉瓣(BAV)及其相关主动脉病变。 | NA | 心血管疾病 | 组织学检查、超声成像、单细胞RNA测序 | NA | 组织、细胞 | 约13%的小鼠出现自发性主动脉撕裂,小鼠在成年早期易发生主动脉扩张。 | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-09 |
Systems biological assessment of immunity to mild versus severe COVID-19 infection in humans
2020-09-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abc6261
PMID:32788292
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研究论文 | 研究分析了76名COVID-19患者和69名健康个体的免疫反应,发现COVID-19患者外周血单个核细胞中HLA-DR和促炎细胞因子的表达减少,以及mTOR信号传导和IFN-α产生的受损 | 揭示了COVID-19患者免疫反应的机制,并提出了潜在的治疗靶点 | NA | 评估轻度和重度COVID-19感染的人类免疫反应 | COVID-19患者和健康个体的免疫反应 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 76名COVID-19患者和69名健康个体 | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-09 |
Resolving Fates and Single-Cell Transcriptomes of Hematopoietic Stem Cell Clones by PolyloxExpress Barcoding
2020-09-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.07.018
PMID:32783885
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研究论文 | 本文开发了PolyloxExpress等位基因,通过Cre重组酶依赖的RNA条形码技术,实现了同一细胞中造血干细胞(HSC)命运和单细胞转录组的关联研究 | 首次将HSC的细胞命运与其单细胞转录组信息相结合,揭示了HSC克隆在转录组景观中的分布及其命运特异性的基因特征 | NA | 旨在识别HSC命运的转录组特征,并探索其分子决定因素 | 造血干细胞(HSC)及其克隆的命运和转录组 | NA | NA | Cre重组酶依赖的RNA条形码技术 | NA | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-09 |
Dynamic single-cell phenotyping of immune cells using the microfluidic platform DropMap
2020-09, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-020-0354-0
PMID:32788719
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DropMap的微流控平台,用于同时测量单个免疫细胞的分泌动力学和其他细胞特征 | DropMap平台能够对单个免疫细胞进行定量和动态表型分析,特别是分析分泌蛋白如细胞因子和抗体 | NA | 开发一种新的微流控平台,用于动态表征免疫细胞 | 单个免疫细胞的分泌动力学和其他细胞特征 | 生物技术 | NA | 微流控技术 | NA | 图像 | 数万个单个免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-09 |
Single-cell landscape of immunological responses in patients with COVID-19
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0762-x
PMID:32788748
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了COVID-19患者外周血样本中的免疫细胞转录组特征 | 首次详细描述了COVID-19患者免疫细胞的转录组特征,特别是干扰素-α反应和急性炎症反应的强度 | 样本量相对较小,可能影响结果的普遍性 | 探究COVID-19疾病严重程度与宿主免疫反应之间的关系 | COVID-19患者的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 5名健康捐赠者和13名COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-09 |
Over 60 Years of Experimental Hematology (without a License)
2020-09, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2020.08.005
PMID:32798645
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research paper | 本文作者回顾了其在实验血液学领域超过60年的研究经历,特别是在红细胞发育和功能相关蛋白质和RNA的克隆与特性研究,以及近期利用单细胞转录组学技术在红细胞前体细胞平衡和药物治疗Epo抵抗性贫血方面的研究 | 作者及其团队开发并应用了多种新颖的实验技术,如单细胞转录组学技术,以解决红细胞发育中的复杂问题 | NA | 探讨红细胞发育的调控机制及开发治疗特定血液疾病的新药物 | 红细胞发育相关的蛋白质、RNA以及红细胞前体细胞 | 分子细胞生物学 | 血液疾病 | 单细胞转录组学(scRNAseq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-09 |
Distinct Regulatory Programs Control the Latent Regenerative Potential of Dermal Fibroblasts during Wound Healing
2020-09-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.07.008
PMID:32755548
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研究论文 | 本文研究了在伤口愈合过程中,皮肤成纤维细胞的潜在再生潜能及其调控程序 | 使用互补的命运图谱方法,揭示了毛囊间质前体细胞在伤口修复中的有限贡献,以及Hic1标记的毛囊外前体细胞在修复成纤维细胞中的主要作用,并通过单细胞RNA测序和scATAC-seq分析了再生相关的转录调控和染色质可及性变化 | NA | 定义修复性成纤维细胞的谱系起源和调控程序,以改善愈合结果 | 皮肤成纤维细胞在稳态和损伤响应中的异质性,以及其在伤口愈合中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序, scATAC-seq | NA | RNA, 染色质可及性 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-09 |
Mapping systemic lupus erythematosus heterogeneity at the single-cell level
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0743-0
PMID:32747814
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了33名不同疾病活动度的系统性红斑狼疮(SLE)儿童患者和11名匹配对照的外周血单个核细胞,揭示了SLE患者血液转录组的细胞来源及其异质性 | 首次在单细胞水平上详细解析了SLE患者的血液转录组异质性,并识别出与疾病活动度相关的特定细胞亚群 | 研究主要集中在儿童SLE患者,成人SLE患者的验证样本量较少 | 解析系统性红斑狼疮转录组特征的细胞来源及其疾病异质性,为精准医疗应用奠定基础 | 系统性红斑狼疮患者的血液转录组及其细胞来源 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约276,000个外周血单个核细胞来自33名儿童SLE患者和11名对照,以及约82,000个来自成人SLE患者的单个外周血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals the landscape of early female germ cell development
2020-09, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202001034RR
PMID:32716582
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术揭示了早期雌性生殖细胞发育的转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了从原始生殖细胞到减数分裂细胞的转录组变化,并确定了减数分裂起始的关键阶段 | 研究仅限于小鼠胚胎卵巢样本,可能需要进一步研究以验证在其他物种中的适用性 | 解析雌性生殖细胞从有丝分裂到减数分裂转变的分子机制 | 小鼠胚胎卵巢中的单个生殖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 19,363个单个生殖细胞从小鼠胚胎卵巢E12.5、E14.5和E16.5收集 | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome profiling reveals neutrophil heterogeneity in homeostasis and infection
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0736-z
PMID:32719519
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,分析了超过25,000个分化和成熟的鼠中性粒细胞,揭示了中性粒细胞在稳态和细菌感染中的异质性和分化景观 | 本文首次全面描述了中性粒细胞在稳态和细菌感染中的转录组景观,定义了八个具有独特分子特征的中性粒细胞群体,并展示了细菌感染如何重新编程中性粒细胞的遗传结构 | NA | 研究中性粒细胞在稳态和细菌感染中的异质性和分化机制 | 分化和成熟的鼠中性粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过25,000个分化和成熟的鼠中性粒细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-09 |
Stimulation of Oncogene-Specific Tumor-Infiltrating T Cells through Combined Vaccine and αPD-1 Enable Sustained Antitumor Responses against Established HER2 Breast Cancer
2020-09-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-0389
PMID:32732224
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研究论文 | 本文探讨了通过结合疫苗和αPD-1刺激特定肿瘤浸润T细胞,以实现对已建立的HER2阳性乳腺癌的持续抗肿瘤反应 | 本文首次提出将针对致癌驱动因子的靶向疫苗与免疫检查点阻断(ICB)相结合,以增强T细胞浸润并实现对晚期癌症的抗肿瘤免疫 | NA | 旨在增强乳腺癌免疫疗法中的T细胞浸润,并探索靶向疫苗与免疫检查点阻断的联合应用效果 | HER2阳性乳腺癌模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小数量的新生抗原和升高的免疫抑制标志物 | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-09 |
Pathogenic Autoimmunity in Atherosclerosis Evolves From Initially Protective Apolipoprotein B100-Reactive CD4+ T-Regulatory Cells
2020-09-29, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文研究了动脉粥样硬化中由最初保护性的载脂蛋白B100反应性CD4+调节T细胞演变为致病性自身免疫反应的过程。 | 发现载脂蛋白B反应性Tregs在动脉粥样硬化中具有混合表型,并揭示了其从保护性到致病性的转变过程。 | NA | 探究动脉粥样硬化中自身反应性CD4+ T细胞的功能及其与致病性TH1细胞的关系。 | 载脂蛋白B反应性CD4+ T细胞及其在动脉粥样硬化中的作用。 | NA | 心血管疾病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠和人类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-09 |
Different lineage contexts direct common pro-neural factors to specify distinct retinal cell subtypes
2020-09-07, The Journal of cell biology
IF:7.4Q1
DOI:10.1083/jcb.202003026
PMID:32699896
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研究论文 | 本文通过在体谱系追踪技术研究斑马鱼视网膜前体细胞,揭示了神经元多样性如何从不同细胞谱系中产生 | 发现了亚型特异性的刻板神经发生谱系,并揭示了单个促神经因子在谱系依赖方式下指定不同神经元类型/亚型的能力 | NA | 探讨神经元多样性如何从不同细胞谱系中产生 | 斑马鱼视网膜前体细胞及其神经元亚型 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序和ATAC测序 | NA | 细胞谱系数据 | 约1,000个单个斑马鱼视网膜前体细胞 | NA | NA | NA | NA |