单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 119 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 61 | 2024-08-09 |
Low-dose DNA demethylating therapy induces reprogramming of diverse cancer-related pathways at the single-cell level
2020-09-21, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-020-00937-y
PMID:32958049
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研究论文 | 本文探讨了低剂量DNA去甲基化药物在单细胞水平上对多种癌症相关通路的重新编程机制 | 研究揭示了低剂量DNA去甲基化治疗在单细胞水平上对特定癌症相关基因的完全去甲基化效果 | 研究主要集中在HCT116细胞系，可能需要进一步在其他细胞系或临床样本中验证 | 探索低剂量DNA去甲基化治疗在单细胞水平上的疗效机制 | HCT116细胞系在低剂量去甲基化药物处理后的表达谱和DNA甲基化状态 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了克隆的HCT116细胞进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-09 |
Transcriptome heterogeneity of porcine ear fibroblast and its potential influence on embryo development in nuclear transplantation
2020-Sep-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.20-190
PMID:32952124
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了来自同一来源的52个猪耳成纤维细胞的基因表达模式，探讨了供体细胞异质性对核移植效率的潜在影响。 | 首次在单细胞水平上分析了供体细胞异质性对核移植效率的潜在影响，并提供了分析精英供体细胞的有效方法。 | NA | 探讨供体细胞异质性对核移植胚胎发育效率的潜在影响。 | 猪耳成纤维细胞的基因表达模式及其对核移植效率的影响。 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 52个猪耳成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-09 |
EnClaSC: a novel ensemble approach for accurate and robust cell-type classification of single-cell transcriptomes
2020-Sep-17, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-03679-z
PMID:32938367
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研究论文 | 本文提出了一种名为EnClaSC的新型集成方法，用于单细胞转录组数据的准确和稳健的细胞类型分类 | EnClaSC不仅可以在特定数据集内部进行自投影和跨不同数据集的细胞类型分类，还能很好地适应不同的数据维度和数据稀疏性，并能进行跨物种分类 | NA | 开发一种新的计算方法，用于将新产生的单细胞RNA测序数据分类到已注释的标签上 | 单细胞转录组数据的细胞类型分类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 集成学习方法 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq identifies unique transcriptional landscapes of human nucleus pulposus and annulus fibrosus cells
2020-09-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-72261-7
PMID:32943704
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究了健康人椎间盘的转录组图谱，特别是核软骨（NP）和纤维环（AF）细胞的独特转录景观 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了人类NP和AF细胞的遗传结构和差异表达基因，并识别了关键的转录因子 | 研究仅限于非退行性腰椎间盘的NP和AF细胞，可能无法完全代表所有椎间盘疾病的情况 | 阐明健康人椎间盘NP和AF细胞的分子途径和转录网络 | 人类椎间盘的核软骨（NP）和纤维环（AF）细胞 | 数字病理学 | 椎间盘疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从非退行性腰椎间盘中分离出的NP和AF细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing techniques from individual to multiomics analyses
2020-09, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-020-00499-2
PMID:32929221
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在个体和多组学层面的应用 | 介绍了多种单细胞组学方法及其应用，并探讨了多层数据集的计算整合方法 | NA | 旨在深入理解每个细胞的基本分子特征及其与疾病相关的分子特征 | 单细胞的基因组、表观基因组和转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 基因组数据、表观基因组数据、转录组数据 | 大量单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics in cancer: computational challenges and opportunities
2020-09, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-020-0422-0
PMID:32929226
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在癌症研究中的计算挑战与机遇 | 探讨了单细胞转录组学数据在癌症研究中的新兴计算分析方法及其应用 | 讨论了未来计算方法学发展的挑战与机遇 | 旨在揭示驱动癌症发展、发病机制和临床结果的细胞类型和状态 | 单细胞转录组学数据及其在癌症研究中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-09 |
Malignant cell-specific CXCL14 promotes tumor lymphocyte infiltration in oral cavity squamous cell carcinoma
2020-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-001048
PMID:32958684
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研究论文 | 研究CXCL14在口腔鳞状细胞癌中通过促进淋巴细胞浸润抑制肿瘤生长的机制 | 发现CXCL14在恶性细胞中的表达与肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）的增加和肿瘤生长的抑制相关，表明CXCL14可能通过免疫介导的机制抑制肿瘤生长 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA测序数据，需要在人体中进一步验证 | 探讨CXCL14介导的口腔鳞状细胞癌肿瘤生长抑制的潜在机制 | 口腔鳞状细胞癌中的恶性细胞和淋巴细胞浸润 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了来自口腔鳞状细胞癌的单细胞RNA测序数据，以及C57BL/6小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-09 |
Oxidative Metabolism Drives Immortalization of Neural Stem Cells during Tumorigenesis
2020-09-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.07.039
PMID:32916131
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研究论文 | 本文研究了氧化代谢在肿瘤发生过程中对神经干细胞永生化的驱动作用 | 首次展示了线粒体融合诱导的代谢重编程对肿瘤起始细胞永生化的速率限制作用，并触发其不可逆的肿瘤发生倾向 | NA | 探讨代谢重编程在肿瘤发生中的作用及其机制 | 神经干细胞及其在肿瘤发生中的代谢变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学, 靶向代谢组学 | NA | 转录组数据 | 涉及果蝇大脑肿瘤中的快速分裂的干细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-09 |
Ontogeny of arterial macrophages defines their functions in homeostasis and inflammation
2020-09-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18287-x
PMID:32917889
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研究论文 | 本文通过结合巨噬细胞命运图谱分析和单细胞RNA测序，研究了动脉巨噬细胞在稳态和血管紧张素II诱导的动脉炎症中的细胞身份及其发育起源与成年期表型和功能的关系 | 首次揭示了卵黄囊红系髓系前体细胞对动脉外膜巨噬细胞的显著贡献，并阐明了这些细胞在稳态和炎症中的不同功能 | NA | 探讨动脉巨噬细胞的异质性及其在健康和疾病中的不同功能 | 动脉巨噬细胞的发育起源及其在成年期的表型和功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成年小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-09 |
Analysis of single-cell transcriptomes links enrichment of olfactory receptors with cancer cell differentiation status and prognosis
2020-09-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01232-5
PMID:32917933
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了嗅觉受体（ORs）在癌细胞分化状态和预后中的作用 | 首次全面描绘了肿瘤中单细胞水平嗅觉受体的表达动态，并构建了基于广泛嗅觉受体表达特征的表达签名 | NA | 研究嗅觉受体在癌细胞分化状态和癌症预后中的作用 | 嗅觉受体在肿瘤细胞中的表达及其与癌细胞分化和预后的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用了来自癌症基因组图谱（TCGA）的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-09 |
Bayesian gamma-negative binomial modeling of single-cell RNA sequencing data
2020-Sep-09, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-06938-8
PMID:32900358
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研究论文 | 本文提出了一种全生成层次伽马-负二项（hGNB）模型，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析，无需显式建模零膨胀 | 提出了一种新的层次伽马-负二项模型，能够自然地考虑基因和细胞水平的协变效应，无需预处理步骤如归一化 | NA | 旨在开发一种新的统计模型，用于更准确地分析单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 层次伽马-负二项（hGNB）模型 | RNA测序数据 | 涉及多个真实世界的scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomes of pancreatic preinvasive lesions and cancer reveal acinar metaplastic cells' heterogeneity
2020-09-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18207-z
PMID:32908137
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了从小鼠胰腺前侵袭阶段到肿瘤形成过程中的细胞异质性 | 首次定义了六种腺泡化生细胞类型和状态，并揭示了肿瘤相关基质、免疫、内皮和成纤维细胞的信号，这些信号可能支持肿瘤发展及免疫细胞的招募和教育 | NA | 研究胰腺癌前病变和癌症中单细胞转录组的异质性 | 小鼠胰腺中的腺泡化生细胞及其在肿瘤发展中的作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-09 |
Single Cell Technologies Define New Therapeutic Avenues for Huntington's Disease
2020-09-09, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2020.08.007
PMID:32910889
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研究论文 | 使用两种独立的单细胞转录组技术，Lee等人对亨廷顿病中受影响最严重的纹状体神经元的转录变化进行了分类 | 首次使用单细胞转录组技术详细描述了亨廷顿病中纹状体神经元的转录变化 | NA | 探索亨廷顿病的新治疗途径 | 亨廷顿病中受影响最严重的纹状体神经元 | 数字病理学 | 亨廷顿病 | 单细胞转录组技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome maps of myeloid blood cell lineages in Drosophila
2020-09-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18135-y
PMID:32900993
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了果蝇淋巴腺中发育中的血细胞的异质性，并发现了新的血细胞类型 | 发现了先前未描述的血细胞类型，包括脂肪血细胞、干细胞样前血细胞和中间前血细胞，并揭示了血细胞在正常发育中的发展轨迹及在受到黄蜂侵扰后扁平细胞谱系的形成 | NA | 深入了解果蝇淋巴腺中血细胞发育和细胞免疫反应的分子机制 | 果蝇淋巴腺中的血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-09 |
Tempora: Cell trajectory inference using time-series single-cell RNA sequencing data
2020-09, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008205
PMID:32903255
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Tempora的新型细胞轨迹推断方法，该方法利用时间序列单细胞RNA测序数据中的时间信息来排序细胞 | Tempora方法结合了时间和生物途径信息来指导基于scRNA-seq的轨迹推断，提高了基因表达信号的强度、处理速度和推断轨迹的可解释性 | NA | 开发一种新的细胞轨迹推断方法，以提高在时间序列scRNA-seq数据中细胞排序的准确性和速度 | 时间序列单细胞RNA测序数据中的细胞轨迹推断 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 时间序列数据 | 涉及三个不同组织发育时间序列数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-09 |
Changes in regeneration-responsive enhancers shape regenerative capacities in vertebrates
2020-09-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaz3090
PMID:32883834
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研究论文 | 本文通过比较表观基因组学和单细胞测序研究了两种相关硬骨鱼的再生能力差异及其遗传机制 | 发现了几个再生响应增强子（RREs），包括一个已知的脊椎动物再生效应子上游的元素，并揭示了其在再生中的作用 | 该增强子在哺乳动物中存在且响应损伤，但无法在鱼类中恢复再生能力 | 探讨脊椎动物再生能力差异的遗传机制 | 两种相关硬骨鱼的再生能力 | NA | NA | 比较表观基因组学，单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 两种相关硬骨鱼 | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-09 |
Epigenetic regulation of the PGE2 pathway modulates macrophage phenotype in normal and pathologic wound repair
2020-09-03, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.138443
PMID:32879137
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研究论文 | 本文研究了在正常和病理伤口修复过程中，表观遗传调控对PGE2通路的影响，以及其对巨噬细胞表型的调节作用 | 首次揭示了TGF-β诱导的miRNA29b通过抑制DNA甲基转移酶3b介导的Cox-2启动子超甲基化，增加COX-2/PGE2的产生，以及MLL1上调cPLA2表达并驱动COX-2/PGE2的过程 | NA | 探讨表观遗传调控在正常和病理伤口修复中对巨噬细胞表型和功能的影响 | 人类和小鼠的伤口巨噬细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠的伤口组织 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-09 |
Hematopoiesis in High Definition: Combining State and Fate Mapping
2020-09-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.08.010
PMID:32888423
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研究论文 | 本文结合谱系追踪和单细胞测序方法，同时分析克隆和转录轨迹，以深入了解造血过程中的组织和决策机制 | 本文通过同时考虑克隆和转录轨迹，提供了对造血组织和决策机制的关键新见解 | NA | 探索造血过程中的组织和决策机制 | 造血过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-09 |
Extensive and spatially variable within-cell-type heterogeneity across the basolateral amygdala
2020-09-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.59003
PMID:32869744
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和原位杂交技术，揭示了小鼠基底侧杏仁核复合体（BLA）内细胞类型特异性的转录组异质性和空间分布特征 | 首次详细描述了BLA中细胞类型的转录组异质性及其与空间分布的关系，并展示了这种异质性在局部形态和远程连接中的体现 | NA | 旨在理解基底侧杏仁核复合体的细胞类型特异性转录组景观及其在功能多样性中的作用 | 小鼠基底侧杏仁核复合体的细胞类型及其转录组异质性 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，原位杂交 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-09 |
Application of single-cell sequencing in autoimmune diseases
2020-Sep-01, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000001050
PMID:32889911
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |