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当前共找到 119 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-05 |
Complex Autoinflammatory Syndrome Unveils Fundamental Principles of JAK1 Kinase Transcriptional and Biochemical Function
2020-09-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.07.006
PMID:32750333
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研究论文 | 本文描述了一种患者的罕见自炎症综合症及其与JAK1激酶突变的关联 | 提出了突变'转录型'的概念，展示了S703I突变的独特功能 | 研究主要基于单个病例，缺乏更大样本的验证 | 探索JAK1在自炎症疾病中的转录和生化功能 | 一名因JAK1突变出现多脏器免疫失调的患者 | 数字病理学 | 自炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 1名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2024-08-05 |
A single-cell RNA-seq atlas of Schistosoma mansoni identifies a key regulator of blood feeding
2020-09-25, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abb7709
PMID:32973030
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了血吸虫，并识别出一个关键的血液摄取调节因子 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出68种不同的细胞群体以及维持血吸虫消化道的专门干细胞 | 尚未完全了解寄生虫不同组织在成功寄生中的功能 | 研究血吸虫的细胞特性和潜在治疗靶点 | 成人血吸虫的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 43,642个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-08-05 |
RNA-seq analysis of galaninergic neurons from ventrolateral preoptic nucleus identifies expression changes between sleep and wake
2020-Sep-14, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07050-7
PMID:32928100
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研究论文 | 本文研究了在睡眠和觉醒状态下，腹外侧前视核的加拉宁能神经元的转录调控。 | 本研究揭示了加拉宁能神经元在睡眠和缺觉中的转录响应变化，扩展了对这一特定神经元群体的重要知识。 | 研究可能未能充分考虑其他神经元类型及其在睡眠/觉醒中的作用。 | 探讨腹外侧前视核加拉宁能神经元的转录调控机制，特别是在睡眠状态下的变化。 | 研究对象为腹外侧前视核的加拉宁能神经元，比较其在睡眠与觉醒状态下的表达变化。 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从腹外侧前视核分离的eGFP(+)加拉宁神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-08-05 |
Diversification of reprogramming trajectories revealed by parallel single-cell transcriptome and chromatin accessibility sequencing
2020-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba1190
PMID:32917699
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研究论文 | 本文探讨了细胞重编程过程中的异质性及其机制 | 首次利用单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序揭示了重编程细胞的多样性和异步轨迹 | 未提及具体样本数量和实验限制 | 揭示重编程细胞的异质性及成功重编程的机制 | 重编程的人类细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-08-07 |
Human Cell Atlas and cell-type authentication for regenerative medicine
2020-09, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-020-0421-1
PMID:32929224
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综述 | 本文综述了细胞类型鉴定的当前进展，从人类细胞图谱项目到基于细胞数据指南的再生医学的分子标记数据库和其他来源 | 近年来单细胞RNA测序技术的进步为基于RNA特征的细胞个体和时空水平表征开辟了新途径，极大地改变了我们对细胞类型的理解 | NA | 探讨细胞类型鉴定的最新进展及其在再生医学中的应用 | 细胞类型的鉴定及其在组织器官发育研究和细胞疗法及疾病模型中的应用 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-08-07 |
Probe-Seq: Method for RNA Sequencing of Specific Cell Types from Animal Tissue
2020-Sep-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.3749
PMID:33659409
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Probe-Seq的新方法，用于从动物组织中对特定细胞类型进行RNA测序 | Probe-Seq方法通过使用基因特异性探针与RNA标记物杂交来分离特定类型的细胞，从而实现下游的FACS分离和批量RNA测序 | NA | 开发一种简单、通用的方法，用于对缺乏细胞类型特异性遗传标记或抗体的细胞类型进行批量转录组分析 | 特定细胞类型的RNA测序 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 小鼠视网膜、冷冻人视网膜、中肠和发育中的小鸡视网膜 | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-07 |
Untangling biological factors influencing trajectory inference from single cell data
2020-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaa053
PMID:33575604
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研究论文 | 本文研究了单细胞RNA测序数据中影响细胞分化轨迹推断的生物学因素 | 提出了一种通过分解单细胞数据来识别和过滤混杂变量（如细胞周期）的方法，以提高分化轨迹推断的准确性 | 未明确提及 | 探讨影响单细胞数据中细胞分化轨迹推断的关键生物学因素 | 单细胞RNA测序数据中的生物学变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-07 |
Cell-type-specific promoters for C. elegans glia
2020 Sep-Dec, Journal of neurogenetics
IF:1.8Q4
DOI:10.1080/01677063.2020.1781851
PMID:32696701
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研究论文 | 本文比较了C. elegans神经胶质细胞类型特异性启动子的特异性、亮度和一致性 | 本文识别了一组用于研究七种神经胶质细胞类型的启动子，并展示了一种利用现有单细胞测序数据前瞻性识别细胞类型特异性神经胶质启动子的方法 | 一些启动子的表达依赖于外部条件或生物体的内部状态，如发育阶段，这表明神经胶质的可塑性 | 旨在解码神经胶质功能 | C. elegans的神经胶质细胞类型特异性启动子 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 七种神经胶质细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-07 |
3D curvature-instructed endothelial flow response and tissue vascularization
2020-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abb3629
PMID:32938662
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研究论文 | 本文开发了一种螺旋微血管模型，能够精确控制曲率和扭转，并支持厘米尺度上的均匀组织灌注 | 首次展示了3D曲率诱导的旋转和混合在层流中的作用，以及对内皮细胞表型和转录变化的独特影响 | NA | 探讨异质性血管结构在不同发育和发病机制中的作用，并提供改进组织血管化和再生的工具 | 内皮细胞在螺旋微血管中的基因表达和表型变化 | 生物工程 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-07 |
Lef1 expression in fibroblasts maintains developmental potential in adult skin to regenerate wounds
2020-09-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.60066
PMID:32990218
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研究论文 | 本文通过scRNA-seq技术研究了新生小鼠皮肤中的再生因子，这些因子能够使成年皮肤转变为再生而非仅修复伤口，并探讨了Lef1转录因子在其中的作用。 | 首次发现新生乳头状成纤维细胞通过表达Lef1转录因子，促进年轻皮肤的健康再生，并能在成年皮肤中增强皮肤修复能力。 | NA | 探索新生皮肤中的再生因子，以开发促进成年组织再生的临床可行方案。 | 新生小鼠皮肤中的成纤维细胞及其在皮肤再生中的作用。 | NA | 烧伤及与伤口愈合相关的皮肤病 | scRNA-seq | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-07 |
Understanding human gut diseases at single-cell resolution
2020-09-30, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaa130
PMID:32588873
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在深入理解人类肠道功能和病理生理学中的应用 | scRNA-seq技术揭示了人类肠道中细胞多样性和转录变异的新领域，并识别了可能与多种肠道疾病相关的新型细胞类型 | NA | 深入理解人类肠道在健康和多种肠道疾病中的功能 | 人类肠道中的细胞类型及其在疾病中的作用 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
Latent Factor Modeling of scRNA-Seq Data Uncovers Dysregulated Pathways in Autoimmune Disease Patients
2020-Sep-25, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101451
PMID:32853994
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研究论文 | 本文通过比较四种先进的潜在因子建模方法，提出了一种将潜在因子分配给通路活性和特定细胞亚群的方法，并应用于类风湿关节炎和系统性红斑狼疮患者的scRNA-seq数据集 | 本文提出了一种新的框架，用于识别细胞亚型并发现与疾病相关的基因特征 | 需要进一步研究以确定最适合特定任务的方法以及如何解释潜在因子 | 探索潜在因子建模在scRNA-seq数据分析中的应用，并识别与自身免疫疾病相关的基因特征 | 类风湿关节炎和系统性红斑狼疮患者的scRNA-seq数据 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | scRNA-seq | 潜在因子建模 | 基因表达数据 | 来自类风湿关节炎和系统性红斑狼疮患者活检的scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
Single-Cell Sequencing of Mouse Thymocytes Reveals Mutational Landscape Shaped by Replication Errors, Mismatch Repair, and H3K36me3
2020-Sep-25, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101452
PMID:32858340
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研究论文 | 本文通过单细胞外显子测序研究了野生型和错配修复缺陷型小鼠胸腺细胞的突变景观，揭示了复制错误、错配修复和H3K36me3对突变分布的影响 | 发现H3K36me3标记在转录活跃区域可以增强错配修复效率，为每个细胞类型的关键基因提供优先保护 | NA | 解析由复制错误、错配修复和H3K36me3标记形成的突变景观 | 小鼠胸腺细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞外显子测序 | NA | 基因组数据 | 野生型和错配修复缺陷型小鼠的T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
SERGIO: A Single-Cell Expression Simulator Guided by Gene Regulatory Networks
2020-09-23, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.08.003
PMID:32871105
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研究论文 | 介绍了一种名为SERGIO的单细胞基因表达数据模拟器，该模拟器基于用户提供的基因调控网络，模拟了转录的随机性和多个转录因子对基因的调控 | SERGIO是首个结合转录因子-基因调控相互作用来模拟单细胞表达动态的模拟器 | NA | 开发和验证一种新的单细胞转录组学工具基准测试方法 | 单细胞基因表达数据及其在细胞分化中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | 基因调控网络模型 | 基因表达数据 | 模拟任意数量的细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
Single-Cell Sequencing of Peripheral Mononuclear Cells Reveals Distinct Immune Response Landscapes of COVID-19 and Influenza Patients
2020-09-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.07.009
PMID:32783921
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术分析了COVID-19和流感患者的周围单核细胞的转录组景观，揭示了两种疾病在免疫反应路径上的差异 | 首次报道了COVID-19和流感患者周围血单核细胞的单细胞转录组景观，并发现了特定的信号通路和关键因子的表达差异 | NA | 研究COVID-19和流感患者免疫反应的差异 | COVID-19和流感患者的周围血单核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | COVID-19和流感患者的周围血单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-07 |
Natural display of nuclear-encoded RNA on the cell surface and its impact on cell interaction
2020-09-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02145-6
PMID:32907628
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研究论文 | 本文开发了一系列技术来检测和验证细胞表面稳定的核编码RNA，并探讨了这些RNA在细胞相互作用中的作用 | 首次使用Surface-seq技术选择性测序细胞表面的maxRNAs，并验证了其在细胞相互作用中的功能 | NA | 研究细胞表面核编码RNA的功能及其在细胞相互作用中的作用 | 细胞表面的核编码RNA及其在细胞相互作用中的功能 | NA | NA | Surface-seq | NA | RNA | 人类外周血单个核细胞（PBMCs） | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-07 |
CSS: cluster similarity spectrum integration of single-cell genomics data
2020-09-01, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02147-4
PMID:32867824
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研究论文 | 本文提出了一种无监督的、无需参考的数据表示方法——聚类相似性谱（CSS），用于整合跨实验、条件、批次、时间点等的单细胞基因组数据 | CSS方法能够同时保留生物信息并整合样本，适用于评估细胞异质性和重建分化轨迹 | NA | 开发新的计算方法以整合单细胞测序数据并保留生物信息 | 单细胞基因组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 无监督学习 | 基因组数据 | 涉及大脑类器官和其他单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
Cancer-Specific Immune Prognostic Signature in Solid Tumors and Its Relation to Immune Checkpoint Therapies
2020-Sep-01, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12092476
PMID:32882873
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研究论文 | 本研究通过分析来自TCGA的单细胞和批量肿瘤RNA-Seq数据集中的免疫功能相关基因，揭示了免疫细胞浸润作为实体瘤预后标志物的角色，并探讨了其与免疫检查点疗法的关系 | 本研究首次识别出155个与不同肿瘤类型疾病无进展生存相关的基因，并构建了针对个体癌症类型的癌症特异性预后免疫评分模型 | NA | 阐明免疫细胞浸润作为实体瘤预后标志物的角色及其与免疫检查点疗法的关系 | 免疫功能相关基因在实体瘤中的作用及与免疫疗法的关联 | 数字病理学 | 实体瘤 | RNA-Seq | 弹性网模型 | 基因表达数据 | 四个公开的单细胞RNA-Seq数据集和二十个来自TCGA的批量肿瘤RNA-Seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of long noncoding RNAs and their cell lineage commitment roles via RNA-DNA-DNA triplex formation in mammary epithelium
2020-Sep-15, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3274
PMID:32930441
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研究论文 | 本研究利用高吞吐量的单细胞RNA测序数据，探讨了长非编码RNA（lncRNAs）在乳腺上皮细胞中的表达模式及其在细胞谱系承诺中的作用，通过lncRNA-DNA-DNA三链结构的形成进行功能验证。 | 首次通过单细胞RNA测序数据全面注释乳腺上皮细胞中的lncRNAs表达，并揭示了lncRNAs通过形成三链结构调控下游谱系特异性标记基因的机制。 | 研究仅以lncRNA-Carmn为例进行验证，可能需要进一步的研究来验证其他lncRNAs在细胞谱系承诺中的作用。 | 探讨lncRNAs在乳腺上皮细胞中的表达模式及其在细胞谱系承诺中的作用。 | 乳腺上皮细胞中的长非编码RNA（lncRNAs）及其在细胞谱系承诺中的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
EPISCORE: cell type deconvolution of bulk tissue DNA methylomes from single-cell RNA-Seq data
2020-09-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02126-9
PMID:32883324
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研究论文 | 本文介绍了一种名为EPISCORE的计算算法，用于从单细胞RNA测序数据中对大量组织DNA甲基化数据进行细胞类型反卷积 | EPISCORE算法通过应用概率性的表观遗传模型，利用单细胞RNA测序组织图谱生成组织特异性的DNA甲基化参考矩阵，从而实现对大量组织数据的细胞类型比例和细胞类型特异性差异甲基化信号的量化 | NA | 开发一种算法，用于解决细胞类型异质性对表观基因组数据解释的挑战 | 大量组织DNA甲基化数据和单细胞RNA测序数据 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率性表观遗传模型 | DNA甲基化数据 | 多个表观基因组研究和组织类型 | NA | NA | NA | NA |