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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Single-cell atlas of colonic CD8+ T cells in ulcerative colitis
2020-09, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-1003-4
PMID:32747828
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序和质谱流式技术构建了健康人群和溃疡性结肠炎患者结肠CD8+ T细胞的综合图谱 | 首次系统揭示结肠CD8+ T细胞的异质性,发现表达IL-26的终末分化功能障碍性CD8+ T细胞具有调节功能 | 研究样本量未明确说明,人类源化小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病 | 阐明健康状态和溃疡性结肠炎中结肠CD8+ T细胞的表型特征和功能机制 | 人类结肠CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组测序, T细胞受体谱分析, 质谱流式技术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
The activation trajectory of plasmacytoid dendritic cells in vivo during a viral infection
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0731-4
PMID:32690951
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研究论文 | 通过多技术联用揭示浆细胞样树突状细胞在病毒感染过程中的体内激活轨迹 | 首次证明同一pDC可顺序执行干扰素产生和T细胞激活功能,并发现其受时空精密调控的新机制 | 研究仅限于小鼠巨细胞病毒感染模型,未验证其他病毒或人类系统 | 解析浆细胞样树突状细胞在病毒感染过程中的体内功能分化机制 | 小鼠浆细胞样树突状细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,共聚焦显微镜,CD4 T细胞激活试验 | Ifnb1报告基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据,流式数据,显微图像 | 病毒感染动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
The transcription factor Hhex cooperates with the corepressor Tle3 to promote memory B cell development
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0713-6
PMID:32601467
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9筛选发现转录因子Hhex与共抑制因子Tle3协同调控记忆B细胞分化 | 首次发现Hhex-Tle3复合物在记忆B细胞分化中的关键作用,并揭示其通过调控Bcl-6/Bcl-2通路的新机制 | NA | 探索记忆B细胞分化过程中的关键转录调控因子 | 生发中心B细胞和记忆B细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Fgfr3 Is a Positive Regulator of Osteoblast Expansion and Differentiation During Zebrafish Skull Vault Development
2020-09, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4042
PMID:32379366
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研究论文 | 本研究通过构建fgfr3功能缺失斑马鱼模型,揭示了Fgfr3在颅骨发育过程中对成骨细胞扩增和分化的正向调控作用 | 首次构建了fgfr3功能缺失斑马鱼模型,并结合活体成像和单细胞RNA测序技术分析成骨细胞谱系 | 研究仅限于斑马鱼模型,在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探究FGFR3在颅骨穹隆发育中的具体作用机制 | 斑马鱼颅骨发育过程中的成骨细胞 | 发育生物学 | 颅骨发育缺陷 | 单细胞RNA测序,活体成像 | 斑马鱼基因敲除模型 | 基因表达数据,影像数据 | fgfr3突变斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-07 |
IL-7 receptor alpha defines heterogeneity and signature of human effector memory CD8+ T cells in high dimensional analysis
2020-09, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2020.104155
PMID:32619811
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研究论文 | 通过高维质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术,研究IL-7Rα在定义人类效应记忆CD8+ T细胞异质性中的作用 | 首次揭示IL-7Rα在人类效应记忆CD8+ T细胞中具有多样化但有序的表达模式,并定义了细胞亚群的异质性景观 | 未明确说明样本规模和研究人群特征 | 探究IL-7Rα是否可作为定义人类效应记忆CD8+ T细胞异质性的关键分子 | 人类效应记忆CD8+ T细胞 | 免疫学 | NA | 质谱流式细胞术(CyTOF), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 蛋白质表达数据, 基因表达数据 | NA | NA | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-07 |
Recent advances in sarcoidosis genomics: epigenetics, gene expression, and gene by environment (G × E) interaction studies
2020-09, Current opinion in pulmonary medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/MCP.0000000000000719
PMID:32701681
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综述 | 本文综述了结节病基因组学的最新研究进展,包括表观遗传学、基因表达和基因-环境相互作用研究 | 识别了新的风险基因位点,应用机器学习技术提出药物重定位建议,首次开展表观基因组学研究 | 缺乏大规模多样化队列研究,需要更多先进测序方法和分析技术的应用 | 总结结节病基因组学最新发现并指出该领域的研究空白 | 结节病及其亚型(如世贸中心相关病例和眼结节病) | 基因组学 | 结节病 | 全外显子组测序,表观基因组学,基因表达分析,机器学习 | 机器学习 | 基因组数据,表观遗传数据,基因表达数据 | NA | NA | 全基因组测序,单细胞RNA测序,表观基因组学 | NA | NA |
| 27 | 2024-11-09 |
Single-Cell Transcriptomics Analysis Identifies Nuclear Protein 1 as a Regulator of Docetaxel Resistance in Prostate Cancer Cells
2020-09, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-20-0051
PMID:32513898
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序分析,揭示了核蛋白1(NUPR1)在前列腺癌细胞对多西他赛耐药性中的调控作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出NUPR1作为前列腺癌多西他赛耐药性的关键调控因子 | 仅限于DU145和PC3两种前列腺癌细胞系的研究,结果的普适性有待进一步验证 | 探讨前列腺癌细胞对多西他赛耐药性的分子机制 | DU145和PC3前列腺癌细胞系的多西他赛敏感和耐药变异体 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | DU145和PC3前列腺癌细胞系的多西他赛敏感和耐药变异体 | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-10-02 |
Macrophage HIF-1α Is an Independent Prognostic Indicator in Kidney Cancer
2020-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-3890
PMID:32586940
|
研究论文 | 研究探讨了巨噬细胞中的HIF-1α在肾癌中的独立预后作用 | 首次全面评估了HAF/HIFs在透明细胞肾细胞癌中的临床相关性,并发现巨噬细胞中的HIF-1α与肿瘤进展和抗血管生成治疗的耐药性相关 | 研究样本量有限,且未涵盖所有可能的临床相关性 | 评估HAF/HIFs在透明细胞肾细胞癌中的临床相关性 | 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤组织 | NA | 肾癌 | 单细胞mRNA测序(scRNA-seq),RNA原位杂交(RNA-ISH),免疫组化(IHC) | NA | 组织 | 380名患者的肿瘤组织,72名患者的验证样本,57名接受抗血管生成治疗的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-08 |
A Single-Cell RNA Expression Map of Human Coronavirus Entry Factors
2020-09-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108175
PMID:32946807
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学方法,分析了28种SARS-CoV-2及相关冠状病毒受体和因子(SCARFs)在健康人体组织中的表达,以预测冠状病毒的趋向性 | 首次全面分析了SCARFs在多种健康人体组织中的表达,并预测了非经典的病毒感染路径和特定性别易感性 | NA | 预测人类冠状病毒的趋向性及其在人体组织中的表达模式 | SARS-CoV-2及相关冠状病毒的受体和因子(SCARFs) | 数字病理学 | 冠状病毒病 | 单细胞转录组学 | NA | RNA表达数据 | 多种健康人体组织 | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-05 |
Controlled Cycling and Quiescence Enables Efficient HDR in Engraftment-Enriched Adult Hematopoietic Stem and Progenitor Cells
2020-09-01, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108093
PMID:32877675
|
研究论文 | 本文研究了通过控制细胞周期和静止状态来提高成年造血干细胞和祖细胞中同源重组修复效率的方法 | 提出了一种控制循环和静止状态的策略,使得静息干细胞中HDR与NHEJ的比率增加了6倍 | 文章中未具体说明对所有类型细胞的影响,主要集中在特定亚群体 | 探讨并重新编程成年造血干细胞和祖细胞中的基因组编辑结果 | 成年造血干细胞和祖细胞的亚群体 | 数字病理学 | NA | 下一代测序、单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-05 |
A single-cell RNA-seq atlas of Schistosoma mansoni identifies a key regulator of blood feeding
2020-09-25, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abb7709
PMID:32973030
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了血吸虫,并识别出一个关键的血液摄取调节因子 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出68种不同的细胞群体以及维持血吸虫消化道的专门干细胞 | 尚未完全了解寄生虫不同组织在成功寄生中的功能 | 研究血吸虫的细胞特性和潜在治疗靶点 | 成人血吸虫的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 43,642个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-05 |
RNA-seq analysis of galaninergic neurons from ventrolateral preoptic nucleus identifies expression changes between sleep and wake
2020-Sep-14, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07050-7
PMID:32928100
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研究论文 | 本文研究了在睡眠和觉醒状态下,腹外侧前视核的加拉宁能神经元的转录调控。 | 本研究揭示了加拉宁能神经元在睡眠和缺觉中的转录响应变化,扩展了对这一特定神经元群体的重要知识。 | 研究可能未能充分考虑其他神经元类型及其在睡眠/觉醒中的作用。 | 探讨腹外侧前视核加拉宁能神经元的转录调控机制,特别是在睡眠状态下的变化。 | 研究对象为腹外侧前视核的加拉宁能神经元,比较其在睡眠与觉醒状态下的表达变化。 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从腹外侧前视核分离的eGFP(+)加拉宁神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-05 |
Diversification of reprogramming trajectories revealed by parallel single-cell transcriptome and chromatin accessibility sequencing
2020-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba1190
PMID:32917699
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研究论文 | 本文探讨了细胞重编程过程中的异质性及其机制 | 首次利用单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序揭示了重编程细胞的多样性和异步轨迹 | 未提及具体样本数量和实验限制 | 揭示重编程细胞的异质性及成功重编程的机制 | 重编程的人类细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
Human Cell Atlas and cell-type authentication for regenerative medicine
2020-09, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-020-0421-1
PMID:32929224
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综述 | 本文综述了细胞类型鉴定的当前进展,从人类细胞图谱项目到基于细胞数据指南的再生医学的分子标记数据库和其他来源 | 近年来单细胞RNA测序技术的进步为基于RNA特征的细胞个体和时空水平表征开辟了新途径,极大地改变了我们对细胞类型的理解 | NA | 探讨细胞类型鉴定的最新进展及其在再生医学中的应用 | 细胞类型的鉴定及其在组织器官发育研究和细胞疗法及疾病模型中的应用 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
Probe-Seq: Method for RNA Sequencing of Specific Cell Types from Animal Tissue
2020-Sep-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.3749
PMID:33659409
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Probe-Seq的新方法,用于从动物组织中对特定细胞类型进行RNA测序 | Probe-Seq方法通过使用基因特异性探针与RNA标记物杂交来分离特定类型的细胞,从而实现下游的FACS分离和批量RNA测序 | NA | 开发一种简单、通用的方法,用于对缺乏细胞类型特异性遗传标记或抗体的细胞类型进行批量转录组分析 | 特定细胞类型的RNA测序 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 小鼠视网膜、冷冻人视网膜、中肠和发育中的小鸡视网膜 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-07 |
Untangling biological factors influencing trajectory inference from single cell data
2020-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaa053
PMID:33575604
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研究论文 | 本文研究了单细胞RNA测序数据中影响细胞分化轨迹推断的生物学因素 | 提出了一种通过分解单细胞数据来识别和过滤混杂变量(如细胞周期)的方法,以提高分化轨迹推断的准确性 | 未明确提及 | 探讨影响单细胞数据中细胞分化轨迹推断的关键生物学因素 | 单细胞RNA测序数据中的生物学变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-07 |
Cell-type-specific promoters for C. elegans glia
2020 Sep-Dec, Journal of neurogenetics
IF:1.8Q4
DOI:10.1080/01677063.2020.1781851
PMID:32696701
|
研究论文 | 本文比较了C. elegans神经胶质细胞类型特异性启动子的特异性、亮度和一致性 | 本文识别了一组用于研究七种神经胶质细胞类型的启动子,并展示了一种利用现有单细胞测序数据前瞻性识别细胞类型特异性神经胶质启动子的方法 | 一些启动子的表达依赖于外部条件或生物体的内部状态,如发育阶段,这表明神经胶质的可塑性 | 旨在解码神经胶质功能 | C. elegans的神经胶质细胞类型特异性启动子 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 七种神经胶质细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
Lef1 expression in fibroblasts maintains developmental potential in adult skin to regenerate wounds
2020-09-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.60066
PMID:32990218
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研究论文 | 本文通过scRNA-seq技术研究了新生小鼠皮肤中的再生因子,这些因子能够使成年皮肤转变为再生而非仅修复伤口,并探讨了Lef1转录因子在其中的作用。 | 首次发现新生乳头状成纤维细胞通过表达Lef1转录因子,促进年轻皮肤的健康再生,并能在成年皮肤中增强皮肤修复能力。 | NA | 探索新生皮肤中的再生因子,以开发促进成年组织再生的临床可行方案。 | 新生小鼠皮肤中的成纤维细胞及其在皮肤再生中的作用。 | NA | 烧伤及与伤口愈合相关的皮肤病 | scRNA-seq | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
Understanding human gut diseases at single-cell resolution
2020-09-30, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaa130
PMID:32588873
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在深入理解人类肠道功能和病理生理学中的应用 | scRNA-seq技术揭示了人类肠道中细胞多样性和转录变异的新领域,并识别了可能与多种肠道疾病相关的新型细胞类型 | NA | 深入理解人类肠道在健康和多种肠道疾病中的功能 | 人类肠道中的细胞类型及其在疾病中的作用 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
Latent Factor Modeling of scRNA-Seq Data Uncovers Dysregulated Pathways in Autoimmune Disease Patients
2020-Sep-25, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101451
PMID:32853994
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研究论文 | 本文通过比较四种先进的潜在因子建模方法,提出了一种将潜在因子分配给通路活性和特定细胞亚群的方法,并应用于类风湿关节炎和系统性红斑狼疮患者的scRNA-seq数据集 | 本文提出了一种新的框架,用于识别细胞亚型并发现与疾病相关的基因特征 | 需要进一步研究以确定最适合特定任务的方法以及如何解释潜在因子 | 探索潜在因子建模在scRNA-seq数据分析中的应用,并识别与自身免疫疾病相关的基因特征 | 类风湿关节炎和系统性红斑狼疮患者的scRNA-seq数据 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | scRNA-seq | 潜在因子建模 | 基因表达数据 | 来自类风湿关节炎和系统性红斑狼疮患者活检的scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |