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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-27 |
Single-Cell Isolation from Regenerating Murine Muscles for RNA-Sequencing Analysis
2020-09-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100051
PMID:33111097
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实验方案 | 提出一个用于再生小鼠骨骼肌单细胞RNA测序分析的完整方案,重点从肌肉中分离单核细胞 | 针对骨骼肌细胞组成独特(主要为多核肌纤维)的特点,优化了单核细胞分离方法 | 未提及 | 建立无偏的再生小鼠骨骼肌单细胞RNA测序分析方案 | 再生小鼠骨骼肌中的单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-04-20 |
TOX correlates with prognosis, immune infiltration, and T cells exhaustion in lung adenocarcinoma
2020-09, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.3324
PMID:32700817
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研究论文 | 本研究探讨了TOX基因在肺腺癌中的预后价值及其与免疫浸润和T细胞耗竭的相关性 | 首次全面分析TOX在多种癌症特别是肺腺癌中的表达、预后关联及其与免疫细胞浸润和T细胞耗竭的相互作用,并利用单细胞RNA-seq数据验证TOX在耗竭T细胞中的富集 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证,且样本来源和平台技术细节未明确说明 | 探索TOX基因的预后潜力,并分析其与免疫浸润和T细胞功能在癌症特别是肺腺癌中的相关性 | 多种癌症类型,重点关注肺腺癌(LUAD) | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-04-18 |
Elevated Calprotectin and Abnormal Myeloid Cell Subsets Discriminate Severe from Mild COVID-19
2020-09-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.08.002
PMID:32810439
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研究论文 | 本研究通过高维流式细胞术和单细胞RNA测序,揭示了严重COVID-19患者中非经典单核细胞消失、经典单核细胞积累及钙卫蛋白大量释放等先天免疫异常特征 | 首次结合高维流式细胞术和单细胞RNA测序,系统揭示了COVID-19严重程度与先天免疫细胞亚群及钙卫蛋白水平的关联,并提出了具有潜在预测价值的生物标志物组合 | 研究为观察性分析,需前瞻性研究验证预测价值;样本来源和规模可能限制结论的普适性 | 探究COVID-19严重程度与先天免疫反应差异的关系,并寻找可区分高风险患者的生物标志物 | COVID-19患者的外周血细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 高维流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据, 单细胞RNA测序数据 | COVID-19患者外周血细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-04-18 |
Complex Autoinflammatory Syndrome Unveils Fundamental Principles of JAK1 Kinase Transcriptional and Biochemical Function
2020-09-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.07.006
PMID:32750333
|
研究论文 | 本文描述了一位由JAK1基因镶嵌性功能获得性突变引起的早发性多器官免疫失调患者,通过单细胞RNA测序揭示突变转录型与基因型的差异,并探索JAK1激酶的功能机制 | 引入突变'转录型'概念,揭示JAK1 S703I突变不仅增强细胞因子信号传导,还赋予非经典信号传导能力,为个性化医疗提供新平台 | 研究基于单个患者案例,样本量有限,可能无法完全代表所有JAK1相关疾病 | 探究JAK1激酶在自身炎症性疾病中的转录和生化功能机制 | 携带JAK1 S703I镶嵌突变的自体炎症性疾病患者 | 自然语言处理 | 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 1位患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 定制单细胞RNA测序 |
| 5 | 2026-04-18 |
Purification of Human CD34+CD90+ HSCs Reduces Target Cell Population and Improves Lentiviral Transduction for Gene Therapy
2020-Sep-11, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2020.07.010
PMID:32802914
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研究论文 | 本研究探讨了通过纯化人类CD34+CD90+造血干细胞来优化慢病毒介导的基因治疗策略 | 首次在临床适用性GMP级流式分选协议中直接比较CD90+细胞选择与CD133+或CD38- CD34+细胞选择,证明CD90+富集能显著减少靶细胞数量并提高慢病毒转导效率 | 研究主要基于体外和动物模型,尚未在人类临床试验中全面验证其安全性和长期疗效 | 优化造血干细胞基因治疗的靶细胞纯化策略以提高治疗效率和安全性 | 人类造血干细胞(HSC),特别是CD34+CD90+细胞亚群 | 基因治疗 | 遗传性疾病、恶性肿瘤、感染性疾病 | 流式细胞分选、单细胞RNA测序、慢病毒转导 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 未明确指定样本数量,但涉及人类血液制品中的细胞分选比较 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-04-10 |
3D curvature-instructed endothelial flow response and tissue vascularization
2020-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abb3629
PMID:32938662
|
研究论文 | 本研究开发了一种螺旋微血管模型,用于研究三维曲率对血管内皮细胞表型和转录的影响,并展示了其在肿瘤进展模拟和工程化心脏组织血管化中的应用 | 开发了可精确控制曲率和扭转的螺旋微血管模型,首次在厘米尺度实现均匀组织灌注,并揭示了三维曲率诱导层流下旋转和混合的独特流体动力学效应及其对内皮细胞表型和转录组的特异性影响 | 模型仍处于原理验证阶段,需要进一步在更复杂的组织环境中验证其长期功能和稳定性,且单细胞RNA-seq的样本量可能有限 | 研究三维血管几何特征(特别是曲率和扭转)对血管内皮细胞行为和组织血管化的影响,以解决工程化复杂组织血管化的长期挑战 | 螺旋微血管模型中的内皮细胞,以及在该模型中模拟的肿瘤组织和工程化心脏组织 | 组织工程与血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 螺旋微血管模型(体外三维模型) | 转录组数据, 表型数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及批量RNA-seq和单细胞RNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-04-02 |
Tumor-on-a-chip platform to interrogate the role of macrophages in tumor progression
2020-09-30, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyaa017
PMID:32930334
|
研究论文 | 本研究利用微生理“肿瘤芯片”平台,探究了特定巨噬细胞亚群对肿瘤行为的影响 | 开发了一种新型的3D体外模型,能够高时空分辨率地捕捉细胞间动态,并首次在TOC设备中展示了M1和M2巨噬细胞对肿瘤生长、血管生成和迁移的不同作用机制 | 研究依赖于体外模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性,且样本类型和数量有限 | 探究肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在肿瘤微环境中的作用机制 | 人类胰腺癌和结直肠癌细胞,以及M1和M2极化巨噬细胞 | 数字病理 | 胰腺癌,结直肠癌 | 单细胞RNA测序,蛋白质分析,抗体中和研究 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-04-01 |
Variance-adjusted Mahalanobis (VAM): a fast and accurate method for cell-specific gene set scoring
2020-09-18, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa582
PMID:32633778
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Variance-adjusted Mahalanobis (VAM)的新方法,用于单细胞RNA测序数据中的基因集评分,以提高细胞特异性通路分析的准确性和计算效率 | VAM方法首次支持细胞水平的基因集推断,通过整合Seurat框架,能有效处理单细胞RNA测序数据中的技术噪声、稀疏性和大样本量,并提供快速的gamma近似分布用于统计推断 | 未在摘要中明确提及具体限制,但可能依赖于模拟和真实数据的验证范围 | 开发一种快速且准确的细胞特异性基因集评分方法,以改善单细胞RNA测序数据的统计分析和可视化 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵和通路水平聚合 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Variance-adjusted Mahalanobis (VAM) 方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-04-01 |
Single-cell RNA-seq identifies unique transcriptional landscapes of human nucleus pulposus and annulus fibrosus cells
2020-09-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-72261-7
PMID:32943704
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了健康人类椎间盘髓核和纤维环细胞的独特转录组景观,并鉴定了差异表达基因和关键转录因子 | 首次在单细胞水平上定义了健康人类椎间盘髓核和纤维环的转录组图谱,识别了2,196个差异表达基因,并确定了FOXM1和KDM4E作为各自细胞类型的特征转录因子 | 研究仅基于非退行性腰椎间盘样本,可能无法完全代表疾病状态或其他椎间盘区域 | 阐明健康人类椎间盘髓核和纤维环细胞的分子通路和转录网络,以理解椎间盘疾病的潜在机制 | 人类椎间盘髓核和纤维环细胞 | 数字病理学 | 椎间盘疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 非退行性腰椎间盘样本中的原代细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-04-01 |
scIGANs: single-cell RNA-seq imputation using generative adversarial networks
2020-09-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa506
PMID:32588900
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研究论文 | 本文提出了一种基于生成对抗网络(GANs)的单细胞RNA测序数据插补方法scIGANs,用于解决scRNA-seq数据中的dropout问题 | 使用生成细胞而非观察细胞进行插补,避免了传统方法的过平滑问题,并平衡了主要和稀有细胞群体的性能 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 开发一种有效的单细胞RNA测序数据插补方法,以增强下游分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成对抗网络(GANs) | RNA测序数据 | 超过100,000个细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-04-01 |
Harnessing Expressed Single Nucleotide Variation and Single Cell RNA Sequencing To Define Immune Cell Chimerism in the Rejecting Kidney Transplant
2020-09, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020030326
PMID:32669324
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和表达的单核苷酸变异,定义了肾移植排斥反应中免疫细胞的嵌合状态 | 开发了一种基于表达SNV和scRNA-seq的新方法,首次在单细胞水平上准确区分肾移植中供体和受体来源的免疫细胞,并揭示了它们在排斥反应中的不同转录特征 | 样本量较小(仅5个肾移植活检核心),且为观察性研究,无法确定因果关系 | 探究肾移植中供体来源免疫细胞的持久性及其在排斥反应中的作用 | 人类肾移植活检样本中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 肾移植排斥 | 全外显子组测序,单细胞RNA测序 | NA | DNA序列数据,单细胞RNA表达数据 | 5个人类肾移植活检核心,共81,139个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Biological insights from multi-omic analysis of 31 genomic risk loci for adult hearing difficulty
2020-09, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009025
PMID:32986727
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研究论文 | 通过多组学分析31个与成人听力困难相关的基因组风险位点,揭示新的风险基因和调控机制 | 首次通过整合GWAS元分析、表观基因组学和单细胞转录组学方法,识别了8个新的听力困难风险位点,并发现耳蜗上皮细胞在听力损伤中的重要作用 | 研究主要基于英国生物银行的自报听力数据,且动物实验使用小鼠模型,结果向人类转化需进一步验证 | 探索年龄相关性听力损伤的遗传基础和分子机制 | 成人听力困难相关的基因组风险位点和耳蜗细胞 | 基因组学 | 年龄相关性听力损伤 | GWAS元分析, mRNA-seq, ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | 最多330,759名英国生物银行参与者 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Impact of Local Alloimmunity and Recipient Cells in Transplant Arteriosclerosis
2020-09-25, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.316470
PMID:32689904
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示移植动脉粥样硬化的细胞异质性和潜在机制 | 首次在移植动脉粥样硬化小鼠模型中通过单细胞RNA测序鉴定出21个细胞亚群,发现三级淋巴组织局部形成现象,并揭示CCL21/CXCR3信号轴在免疫细胞趋化中的关键作用 | 研究仅基于小鼠模型,人类疾病中的验证尚需进一步研究 | 阐明移植动脉粥样硬化的细胞异质性和疾病进展机制 | 小鼠移植动脉粥样硬化模型中的细胞群体 | 单细胞基因组学 | 移植动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序,遗传谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 11,868个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Gene-Specific Linear Trends Constrain Transcriptional Variability of the Toll-like Receptor Signaling
2020-09-23, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.08.007
PMID:32918862
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单分子mRNA计数技术,揭示了Toll样受体信号通路中基因特异性线性趋势对转录变异性的约束机制 | 发现尽管不同基因采用不同调控模式,但其转录变异度均受到线性约束,且这种约束源于转录爆发的调控 | 研究主要关注Toll样受体信号通路,未验证是否适用于其他信号通路 | 探究单细胞基因表达变异性在刺激响应中的调控机制 | 免疫Toll样受体系统中的诱导基因表达 | 单细胞生物学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA-seq, 单分子mRNA计数(smFISH) | 标准随机开关模型 | 单细胞基因表达数据, mRNA计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单分子荧光原位杂交 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals clonal expansions of pro-inflammatory synovial CD8 T cells expressing tissue-homing receptors in psoriatic arthritis
2020-09-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18513-6
PMID:32958743
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示银屑病关节炎患者关节中促炎性滑膜CD8 T细胞的克隆扩增现象 | 首次结合质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术,在单细胞水平系统揭示银屑病关节炎关节中CD8 T细胞的克隆扩增特征及其组织归巢受体表达模式 | 样本来源仅限于银屑病关节炎患者,缺乏其他类型关节炎的对照比较 | 研究银屑病关节炎关节内免疫细胞的分子特征和克隆扩增机制 | 银屑病关节炎患者的关节滑膜组织和外周血中的白细胞 | 单细胞生物学 | 银屑病关节炎 | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 银屑病关节炎患者的配对关节滑膜组织和外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 液滴法和板式法单细胞RNA测序 |
| 16 | 2025-10-06 |
β2 Integrins differentially regulate γδ T cell subset thymic development and peripheral maintenance
2020-09-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1921930117
PMID:32848068
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研究论文 | 本研究揭示了β2整合素通过不同机制调控γδ T细胞亚群在胸腺发育和外周维持中的作用 | 首次发现β2整合素对γδ T细胞亚群具有双向调控作用:抑制IL-17产生型Vγ6Vδ1细胞的存活,同时促进IFNγ产生型Vγ4亚群的胸腺发育 | 研究主要基于小鼠模型,人类γδ T细胞中是否存在相同机制尚需验证 | 探究β2整合素在γδ T细胞稳态维持中的调控机制 | γδ T细胞亚群,特别是Vγ6Vδ1和Vγ4亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | β-整合素缺陷小鼠和野生型小鼠的γδ T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Inflammatory Signals Induce AT2 Cell-Derived Damage-Associated Transient Progenitors that Mediate Alveolar Regeneration
2020-09-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.06.020
PMID:32750316
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术揭示了肺泡再生过程中AT2细胞衍生的损伤相关短暂祖细胞(DATPs)的作用机制 | 首次发现并表征了肺泡再生过程中的新型AT2细胞亚群DATPs,揭示了IL-1β/HIF1α/糖酵解通路在调控干细胞命运中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类肺泡再生的机制可能有所不同 | 阐明肺泡组织再生过程中细胞命运转换的分子机制 | 肺泡谱系细胞,特别是AT2细胞及其衍生的DATP细胞 | 单细胞生物学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序,体内谱系追踪,类器官模型 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
Therapy-Induced Evolution of Human Lung Cancer Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2020-09-03, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.07.017
PMID:32822576
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示靶向治疗诱导的人类肺癌演化过程 | 首次在靶向治疗前后对转移性肺癌进行纵向单细胞RNA测序分析,揭示了治疗诱导的原始细胞状态转变和肿瘤微环境动态变化 | 样本量相对有限(30名患者),仅针对转移性肺癌 | 探究靶向治疗如何影响肺癌细胞和肿瘤微环境的演化 | 转移性肺癌患者治疗前后的肿瘤活检样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 30名患者的49个临床活检样本,包含超过20,000个癌细胞和肿瘤微环境细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling of Vascular Smooth Muscle Cell Phenotype Modulation in Marfan Syndrome Aortic Aneurysm
2020-09, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.314670
PMID:32698686
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究马凡综合征主动脉瘤中血管平滑肌细胞的表型调控动态 | 首次在马凡综合征主动脉瘤中鉴定出转录组调控的平滑肌细胞亚群,并揭示其特异性基因特征和TGF-β信号通路的作用机制 | 研究样本主要来自小鼠模型,人类样本验证有限 | 阐明马凡综合征主动脉瘤发展过程中血管平滑肌细胞表型调控的时空动态 | Fbn1C1041G/+马凡综合征模型小鼠和人类马凡综合征患者的主动脉组织 | 单细胞转录组学 | 马凡综合征主动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 马凡综合征模型小鼠和人类患者主动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
Adaptable haemodynamic endothelial cells for organogenesis and tumorigenesis
2020-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2712-z
PMID:32908310
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研究论文 | 本研究通过ETV2转录因子重编程成熟内皮细胞,创建了可适应器官发育和肿瘤形成的血管化平台 | 首次通过ETV2瞬时重激活将成熟内皮细胞重置为可塑性血管生成细胞,建立了无需合成半透膜的器官-血管网络模型 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在更复杂的生理环境中验证 | 开发能够模拟生理血管化的平台,用于器官修复和肿瘤靶向研究 | 人类内皮细胞、小鼠模型、人类胰腺胰岛、大鼠肠道和人结肠类器官 | 组织工程 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、表观遗传分析、三维培养 | 器官-血管网络模型 | 基因表达数据、表观遗传数据、影像数据 | 人类内皮细胞、小鼠模型、多种人类器官类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |