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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-06 |
Biological insights from multi-omic analysis of 31 genomic risk loci for adult hearing difficulty
2020-09, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009025
PMID:32986727
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研究论文 | 通过多组学分析31个与成人听力困难相关的基因组风险位点,揭示新的风险基因和调控机制 | 首次通过整合GWAS元分析、表观基因组学和单细胞转录组学方法,识别了8个新的听力困难风险位点,并发现耳蜗上皮细胞在听力损伤中的重要作用 | 研究主要基于英国生物银行的自报听力数据,且动物实验使用小鼠模型,结果向人类转化需进一步验证 | 探索年龄相关性听力损伤的遗传基础和分子机制 | 成人听力困难相关的基因组风险位点和耳蜗细胞 | 基因组学 | 年龄相关性听力损伤 | GWAS元分析, mRNA-seq, ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | 最多330,759名英国生物银行参与者 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
Impact of Local Alloimmunity and Recipient Cells in Transplant Arteriosclerosis
2020-09-25, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.316470
PMID:32689904
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示移植动脉粥样硬化的细胞异质性和潜在机制 | 首次在移植动脉粥样硬化小鼠模型中通过单细胞RNA测序鉴定出21个细胞亚群,发现三级淋巴组织局部形成现象,并揭示CCL21/CXCR3信号轴在免疫细胞趋化中的关键作用 | 研究仅基于小鼠模型,人类疾病中的验证尚需进一步研究 | 阐明移植动脉粥样硬化的细胞异质性和疾病进展机制 | 小鼠移植动脉粥样硬化模型中的细胞群体 | 单细胞基因组学 | 移植动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序,遗传谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 11,868个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
Gene-Specific Linear Trends Constrain Transcriptional Variability of the Toll-like Receptor Signaling
2020-09-23, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.08.007
PMID:32918862
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单分子mRNA计数技术,揭示了Toll样受体信号通路中基因特异性线性趋势对转录变异性的约束机制 | 发现尽管不同基因采用不同调控模式,但其转录变异度均受到线性约束,且这种约束源于转录爆发的调控 | 研究主要关注Toll样受体信号通路,未验证是否适用于其他信号通路 | 探究单细胞基因表达变异性在刺激响应中的调控机制 | 免疫Toll样受体系统中的诱导基因表达 | 单细胞生物学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA-seq, 单分子mRNA计数(smFISH) | 标准随机开关模型 | 单细胞基因表达数据, mRNA计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单分子荧光原位杂交 | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals clonal expansions of pro-inflammatory synovial CD8 T cells expressing tissue-homing receptors in psoriatic arthritis
2020-09-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18513-6
PMID:32958743
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示银屑病关节炎患者关节中促炎性滑膜CD8 T细胞的克隆扩增现象 | 首次结合质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术,在单细胞水平系统揭示银屑病关节炎关节中CD8 T细胞的克隆扩增特征及其组织归巢受体表达模式 | 样本来源仅限于银屑病关节炎患者,缺乏其他类型关节炎的对照比较 | 研究银屑病关节炎关节内免疫细胞的分子特征和克隆扩增机制 | 银屑病关节炎患者的关节滑膜组织和外周血中的白细胞 | 单细胞生物学 | 银屑病关节炎 | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 银屑病关节炎患者的配对关节滑膜组织和外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 液滴法和板式法单细胞RNA测序 |
| 5 | 2025-10-06 |
β2 Integrins differentially regulate γδ T cell subset thymic development and peripheral maintenance
2020-09-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1921930117
PMID:32848068
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研究论文 | 本研究揭示了β2整合素通过不同机制调控γδ T细胞亚群在胸腺发育和外周维持中的作用 | 首次发现β2整合素对γδ T细胞亚群具有双向调控作用:抑制IL-17产生型Vγ6Vδ1细胞的存活,同时促进IFNγ产生型Vγ4亚群的胸腺发育 | 研究主要基于小鼠模型,人类γδ T细胞中是否存在相同机制尚需验证 | 探究β2整合素在γδ T细胞稳态维持中的调控机制 | γδ T细胞亚群,特别是Vγ6Vδ1和Vγ4亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | β-整合素缺陷小鼠和野生型小鼠的γδ T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Inflammatory Signals Induce AT2 Cell-Derived Damage-Associated Transient Progenitors that Mediate Alveolar Regeneration
2020-09-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.06.020
PMID:32750316
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术揭示了肺泡再生过程中AT2细胞衍生的损伤相关短暂祖细胞(DATPs)的作用机制 | 首次发现并表征了肺泡再生过程中的新型AT2细胞亚群DATPs,揭示了IL-1β/HIF1α/糖酵解通路在调控干细胞命运中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类肺泡再生的机制可能有所不同 | 阐明肺泡组织再生过程中细胞命运转换的分子机制 | 肺泡谱系细胞,特别是AT2细胞及其衍生的DATP细胞 | 单细胞生物学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序,体内谱系追踪,类器官模型 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Therapy-Induced Evolution of Human Lung Cancer Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2020-09-03, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.07.017
PMID:32822576
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示靶向治疗诱导的人类肺癌演化过程 | 首次在靶向治疗前后对转移性肺癌进行纵向单细胞RNA测序分析,揭示了治疗诱导的原始细胞状态转变和肿瘤微环境动态变化 | 样本量相对有限(30名患者),仅针对转移性肺癌 | 探究靶向治疗如何影响肺癌细胞和肿瘤微环境的演化 | 转移性肺癌患者治疗前后的肿瘤活检样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 30名患者的49个临床活检样本,包含超过20,000个癌细胞和肿瘤微环境细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling of Vascular Smooth Muscle Cell Phenotype Modulation in Marfan Syndrome Aortic Aneurysm
2020-09, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.314670
PMID:32698686
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究马凡综合征主动脉瘤中血管平滑肌细胞的表型调控动态 | 首次在马凡综合征主动脉瘤中鉴定出转录组调控的平滑肌细胞亚群,并揭示其特异性基因特征和TGF-β信号通路的作用机制 | 研究样本主要来自小鼠模型,人类样本验证有限 | 阐明马凡综合征主动脉瘤发展过程中血管平滑肌细胞表型调控的时空动态 | Fbn1C1041G/+马凡综合征模型小鼠和人类马凡综合征患者的主动脉组织 | 单细胞转录组学 | 马凡综合征主动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 马凡综合征模型小鼠和人类患者主动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Adaptable haemodynamic endothelial cells for organogenesis and tumorigenesis
2020-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2712-z
PMID:32908310
|
研究论文 | 本研究通过ETV2转录因子重编程成熟内皮细胞,创建了可适应器官发育和肿瘤形成的血管化平台 | 首次通过ETV2瞬时重激活将成熟内皮细胞重置为可塑性血管生成细胞,建立了无需合成半透膜的器官-血管网络模型 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在更复杂的生理环境中验证 | 开发能够模拟生理血管化的平台,用于器官修复和肿瘤靶向研究 | 人类内皮细胞、小鼠模型、人类胰腺胰岛、大鼠肠道和人结肠类器官 | 组织工程 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、表观遗传分析、三维培养 | 器官-血管网络模型 | 基因表达数据、表观遗传数据、影像数据 | 人类内皮细胞、小鼠模型、多种人类器官类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Single-cell atlas of colonic CD8+ T cells in ulcerative colitis
2020-09, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-1003-4
PMID:32747828
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序和质谱流式技术构建了健康人群和溃疡性结肠炎患者结肠CD8+ T细胞的综合图谱 | 首次系统揭示结肠CD8+ T细胞的异质性,发现表达IL-26的终末分化功能障碍性CD8+ T细胞具有调节功能 | 研究样本量未明确说明,人类源化小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病 | 阐明健康状态和溃疡性结肠炎中结肠CD8+ T细胞的表型特征和功能机制 | 人类结肠CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组测序, T细胞受体谱分析, 质谱流式技术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
The activation trajectory of plasmacytoid dendritic cells in vivo during a viral infection
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0731-4
PMID:32690951
|
研究论文 | 通过多技术联用揭示浆细胞样树突状细胞在病毒感染过程中的体内激活轨迹 | 首次证明同一pDC可顺序执行干扰素产生和T细胞激活功能,并发现其受时空精密调控的新机制 | 研究仅限于小鼠巨细胞病毒感染模型,未验证其他病毒或人类系统 | 解析浆细胞样树突状细胞在病毒感染过程中的体内功能分化机制 | 小鼠浆细胞样树突状细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,共聚焦显微镜,CD4 T细胞激活试验 | Ifnb1报告基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据,流式数据,显微图像 | 病毒感染动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
The transcription factor Hhex cooperates with the corepressor Tle3 to promote memory B cell development
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0713-6
PMID:32601467
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9筛选发现转录因子Hhex与共抑制因子Tle3协同调控记忆B细胞分化 | 首次发现Hhex-Tle3复合物在记忆B细胞分化中的关键作用,并揭示其通过调控Bcl-6/Bcl-2通路的新机制 | NA | 探索记忆B细胞分化过程中的关键转录调控因子 | 生发中心B细胞和记忆B细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Fgfr3 Is a Positive Regulator of Osteoblast Expansion and Differentiation During Zebrafish Skull Vault Development
2020-09, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4042
PMID:32379366
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研究论文 | 本研究通过构建fgfr3功能缺失斑马鱼模型,揭示了Fgfr3在颅骨发育过程中对成骨细胞扩增和分化的正向调控作用 | 首次构建了fgfr3功能缺失斑马鱼模型,并结合活体成像和单细胞RNA测序技术分析成骨细胞谱系 | 研究仅限于斑马鱼模型,在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探究FGFR3在颅骨穹隆发育中的具体作用机制 | 斑马鱼颅骨发育过程中的成骨细胞 | 发育生物学 | 颅骨发育缺陷 | 单细胞RNA测序,活体成像 | 斑马鱼基因敲除模型 | 基因表达数据,影像数据 | fgfr3突变斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-07 |
IL-7 receptor alpha defines heterogeneity and signature of human effector memory CD8+ T cells in high dimensional analysis
2020-09, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2020.104155
PMID:32619811
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研究论文 | 通过高维质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术,研究IL-7Rα在定义人类效应记忆CD8+ T细胞异质性中的作用 | 首次揭示IL-7Rα在人类效应记忆CD8+ T细胞中具有多样化但有序的表达模式,并定义了细胞亚群的异质性景观 | 未明确说明样本规模和研究人群特征 | 探究IL-7Rα是否可作为定义人类效应记忆CD8+ T细胞异质性的关键分子 | 人类效应记忆CD8+ T细胞 | 免疫学 | NA | 质谱流式细胞术(CyTOF), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 蛋白质表达数据, 基因表达数据 | NA | NA | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-07 |
Recent advances in sarcoidosis genomics: epigenetics, gene expression, and gene by environment (G × E) interaction studies
2020-09, Current opinion in pulmonary medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/MCP.0000000000000719
PMID:32701681
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综述 | 本文综述了结节病基因组学的最新研究进展,包括表观遗传学、基因表达和基因-环境相互作用研究 | 识别了新的风险基因位点,应用机器学习技术提出药物重定位建议,首次开展表观基因组学研究 | 缺乏大规模多样化队列研究,需要更多先进测序方法和分析技术的应用 | 总结结节病基因组学最新发现并指出该领域的研究空白 | 结节病及其亚型(如世贸中心相关病例和眼结节病) | 基因组学 | 结节病 | 全外显子组测序,表观基因组学,基因表达分析,机器学习 | 机器学习 | 基因组数据,表观遗传数据,基因表达数据 | NA | NA | 全基因组测序,单细胞RNA测序,表观基因组学 | NA | NA |
| 16 | 2024-11-09 |
Single-Cell Transcriptomics Analysis Identifies Nuclear Protein 1 as a Regulator of Docetaxel Resistance in Prostate Cancer Cells
2020-09, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-20-0051
PMID:32513898
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序分析,揭示了核蛋白1(NUPR1)在前列腺癌细胞对多西他赛耐药性中的调控作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出NUPR1作为前列腺癌多西他赛耐药性的关键调控因子 | 仅限于DU145和PC3两种前列腺癌细胞系的研究,结果的普适性有待进一步验证 | 探讨前列腺癌细胞对多西他赛耐药性的分子机制 | DU145和PC3前列腺癌细胞系的多西他赛敏感和耐药变异体 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | DU145和PC3前列腺癌细胞系的多西他赛敏感和耐药变异体 | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-10-02 |
Macrophage HIF-1α Is an Independent Prognostic Indicator in Kidney Cancer
2020-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-3890
PMID:32586940
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研究论文 | 研究探讨了巨噬细胞中的HIF-1α在肾癌中的独立预后作用 | 首次全面评估了HAF/HIFs在透明细胞肾细胞癌中的临床相关性,并发现巨噬细胞中的HIF-1α与肿瘤进展和抗血管生成治疗的耐药性相关 | 研究样本量有限,且未涵盖所有可能的临床相关性 | 评估HAF/HIFs在透明细胞肾细胞癌中的临床相关性 | 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤组织 | NA | 肾癌 | 单细胞mRNA测序(scRNA-seq),RNA原位杂交(RNA-ISH),免疫组化(IHC) | NA | 组织 | 380名患者的肿瘤组织,72名患者的验证样本,57名接受抗血管生成治疗的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-29 |
scIGANs: single-cell RNA-seq imputation using generative adversarial networks
2020-09-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa506
PMID:32588900
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研究论文 | 本文提出了一种使用生成对抗网络(GANs)进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据插补的方法,称为scIGANs | scIGANs利用生成的细胞而非观察到的细胞来避免过度平滑和去除细胞间基因表达的自然随机性,并平衡主要和稀有细胞群之间的性能 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据的质量,通过插补技术减少技术噪声,如过多的假零值(dropouts) | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 生成对抗网络(GANs) | 基因表达数据 | 适用于包含超过100,000个细胞的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-08 |
A Single-Cell RNA Expression Map of Human Coronavirus Entry Factors
2020-09-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108175
PMID:32946807
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学方法,分析了28种SARS-CoV-2及相关冠状病毒受体和因子(SCARFs)在健康人体组织中的表达,以预测冠状病毒的趋向性 | 首次全面分析了SCARFs在多种健康人体组织中的表达,并预测了非经典的病毒感染路径和特定性别易感性 | NA | 预测人类冠状病毒的趋向性及其在人体组织中的表达模式 | SARS-CoV-2及相关冠状病毒的受体和因子(SCARFs) | 数字病理学 | 冠状病毒病 | 单细胞转录组学 | NA | RNA表达数据 | 多种健康人体组织 | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-05 |
Controlled Cycling and Quiescence Enables Efficient HDR in Engraftment-Enriched Adult Hematopoietic Stem and Progenitor Cells
2020-09-01, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108093
PMID:32877675
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研究论文 | 本文研究了通过控制细胞周期和静止状态来提高成年造血干细胞和祖细胞中同源重组修复效率的方法 | 提出了一种控制循环和静止状态的策略,使得静息干细胞中HDR与NHEJ的比率增加了6倍 | 文章中未具体说明对所有类型细胞的影响,主要集中在特定亚群体 | 探讨并重新编程成年造血干细胞和祖细胞中的基因组编辑结果 | 成年造血干细胞和祖细胞的亚群体 | 数字病理学 | NA | 下一代测序、单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | NA | NA | NA | NA | NA |