单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 140 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-09 |
Early cleavage of preimplantation embryos is regulated by tRNAGln-TTG-derived small RNAs present in mature spermatozoa
2020-08-07, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA120.013003
PMID:32487749
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研究论文 | 本研究探讨了精子中的tRNA衍生小RNA（tsRNAs）在早期胚胎发育中的作用，特别是在猪模型中，这些tsRNAs如何影响胚胎早期的分裂过程。 | 首次揭示了特定tsRNA组（Gln-TTGs）在猪早期胚胎分裂中的功能，这些tsRNAs可能通过调节细胞周期相关基因和逆转座子来影响胚胎发育。 | NA | 阐明精子中的tRNA衍生小RNA在早期胚胎发育中的具体作用。 | 猪的早期胚胎发育过程。 | 生殖生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-09 |
Cell population characterization and discovery using single-cell technologies in endocrine systems
2020-08, Journal of molecular endocrinology
IF:3.6Q2
DOI:10.1530/JME-19-0276
PMID:32485670
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研究论文 | 本文利用单细胞技术研究内分泌系统的细胞群体特征和发现 | 介绍了单细胞技术在多组学和空间转录组学方面的最新进展，特别是在内分泌系统中的应用 | 某些技术仍在优化中 | 探索内分泌器官的胚胎发育、稀有细胞类型的特征及疾病机制 | 内分泌器官，特别是下丘脑、垂体、胰腺和生殖器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 多个内分泌器官的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-09 |
Urethral luminal epithelia are castration-insensitive cells of the proximal prostate
2020-08, The Prostate
DOI:10.1002/pros.24020
PMID:32497356
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，全面分析了小鼠前列腺和尿道中所有上皮细胞的转录组特征，并验证了尿道上皮细胞群的存在及其在前列腺增生中的潜在作用。 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了小鼠前列腺和尿道的上皮细胞，并发现了尿道上皮细胞在前列腺增生中的重要作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现。 | 旨在通过单细胞RNA测序技术，客观识别前列腺和尿道上皮细胞的亚型，并探讨其在前列腺增生中的作用。 | 小鼠前列腺和尿道的上皮细胞。 | 数字病理学 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-09 |
Discovery of New Targets to Control Metastasis in Pancreatic Cancer by Single-cell Transcriptomics Analysis of Circulating Tumor Cells
2020-08, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-19-1166
PMID:32499301
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析循环肿瘤细胞，发现胰腺癌转移的新治疗靶点 | 开发了高度转移性的胰腺癌患者来源的异种移植（PDX）小鼠模型，并通过单细胞RNA测序识别了改变的信号传导和代谢途径以及潜在的治疗靶点 | NA | 研究胰腺癌转移的机制并寻找新的治疗靶点 | 胰腺癌的转移过程和循环肿瘤细胞的转录组 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | PDX小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-09 |
Single-cell profiling reveals sex diversity in human renal proximal tubules
2020-Aug-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2020.144790
PMID:32439376
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了人类肾脏近端小管中的性别多样性基因表达差异 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了人类肾脏近端小管中的性别偏倚基因表达，并发现了跨物种的共同和特异性基因表达差异 | NA | 旨在理解人类男性和女性肾脏近端小管中的基因表达差异 | 人类男性和女性肾脏近端小管的基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-09 |
Epithelial cell dysfunction, a major driver of asthma development
2020-08, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.14421
PMID:32460363
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综述 | 本文综述了气道上皮屏障功能障碍在哮喘发病机制中的作用及上皮细胞功能障碍的调控新见解 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）研究哮喘中的气道上皮细胞提供了新的见解 | 尚未明确上皮易感基因表达如何转化为对哮喘环境风险因素的功能性改变反应的机制 | 探讨气道上皮屏障异常在哮喘致敏和发病机制中的关键作用，并寻找哮喘干预的新靶点 | 气道上皮细胞及其在哮喘中的功能和调控机制 | NA | 哮喘 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-09 |
Nascent transcript and single-cell RNA-seq analysis defines the mechanism of action of the LSD1 inhibitor INCB059872 in myeloid leukemia
2020-Aug-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2020.144758
PMID:32422235
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研究论文 | 本文通过新兴转录组和单细胞RNA测序分析，揭示了LSD1抑制剂INCB059872在髓系白血病中的作用机制 | 首次使用精密核运行测序（PRO-seq）和ChIP-seq技术，结合单细胞RNA测序（scRNA-seq），详细解析了INCB059872在髓系白血病中的早期调控事件及其对基因表达的影响 | 文章未详细讨论INCB059872的剂量限制性毒性及其在临床应用中的具体挑战 | 探究LSD1抑制剂INCB059872在髓系白血病中的作用机制及其对患者的影响 | 髓系白血病细胞及患者骨髓样本 | 数字病理学 | 髓系白血病 | 精密核运行测序（PRO-seq）、ChIP-seq、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 包括AML细胞系、患者骨髓样本及小鼠骨髓细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-09 |
scVAE: variational auto-encoders for single-cell gene expression data
2020-08-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa293
PMID:32415966
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研究论文 | 本文提出了一种基于变分自编码器（VAE）的新方法scVAE，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析 | 该方法直接使用原始计数数据作为输入，避免了数据预处理步骤，并能稳健地估计每个细胞的预期基因表达水平和潜在表示 | NA | 开发一种新的方法来分析和从大量的复杂单细胞转录组数据中得出相关的生物学推断 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | VAE | 基因表达数据 | 多个scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-09 |
scTPA: a web tool for single-cell transcriptome analysis of pathway activation signatures
2020-08-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa532
PMID:32437538
|
研究论文 | 本文介绍了scTPA，一个基于网络的工具，用于分析人类和小鼠单细胞RNA测序数据中的通路激活特征 | scTPA整合了四种广泛使用的基因集富集方法，基于不同功能和分类的生物通路集合，评估单细胞的通路激活分数 | NA | 开发一个有效的网络工具，用于基于先前生物通路知识的单细胞转录组数据分析 | 单细胞RNA测序数据的功能解释和细胞簇注释 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 人类和小鼠的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analyses of Colon and Blood Reveal Distinct Immune Cell Signatures of Ulcerative Colitis and Crohn's Disease
2020-08, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.04.074
PMID:32428507
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研究论文 | 本文利用质谱流式细胞术（CyTOF）和单细胞RNA测序等技术，分析了溃疡性结肠炎（UC）和克罗恩病（CD）患者的结肠黏膜和血液中的免疫细胞特征 | 首次在单细胞水平上详细比较了UC和CD患者与对照组的免疫细胞差异，并利用随机森林模型识别了区分不同疾病状态的关键免疫细胞群 | NA | 旨在揭示炎症性肠病（IBD）患者黏膜失调的机制及UC与CD患者炎症反应的差异 | UC和CD患者的结肠黏膜和血液中的免疫细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 质谱流式细胞术（CyTOF），单细胞RNA测序 | 随机森林模型 | 细胞 | 结肠黏膜样本87份，外周血单个核细胞85份 | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-09 |
An organoid model to assay the role of CFTR in the human epididymis epithelium
2020-Aug, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-020-03208-7
PMID:32377875
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研究论文 | 本文利用人类附睾上皮细胞（HEE）类器官和极化的HEE细胞培养物，研究了囊性纤维化跨膜传导调节因子（CFTR）在人类附睾中的作用 | 首次使用3D HEE类器官和极化的2D HEE细胞培养物来评估CFTR在人类附睾中的功能，并通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了类器官中的细胞类型特异性基因表达 | NA | 研究CFTR在人类附睾上皮细胞中的作用及其对生育能力的影响 | 人类附睾上皮细胞（HEE）类器官和极化的HEE细胞培养物 | NA | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从人类附睾头部分离的HEE类器官和细胞培养物 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-09 |
An ultra-sensitive T-cell receptor detection method for TCR-Seq and RNA-Seq data
2020-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa432
PMID:32399561
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研究论文 | 提出了一种名为CATT的计算方法，用于超敏感和精确地检测TCR CDR3序列 | CATT整合了基于de Bruijn图的微组装算法、数据驱动的错误校正模型和贝叶斯推理算法，能够自适应地和高性能地表征CDR3库 | NA | 开发一种超敏感的T细胞受体检测方法，用于TCR-Seq和RNA-Seq数据 | T细胞受体（TCR）的CDR3区域 | 生物信息学 | NA | TCR-Seq, RNA-Seq | 贝叶斯推理算法 | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-09 |
scDoc: correcting drop-out events in single-cell RNA-seq data
2020-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa283
PMID:32365169
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scDoc的新方法，用于校正单细胞RNA测序数据中的'drop-out'事件 | scDoc是首个直接利用drop-out信息进行细胞间相似度估计的方法，这在单细胞RNA测序数据插补中至关重要 | NA | 解决单细胞RNA测序研究中的'drop-out'事件问题 | 单细胞RNA测序数据中的'drop-out'事件 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-09 |
Using Single-Cell and Spatial Transcriptomes to Understand Stem Cell Lineage Specification During Early Embryo Development
2020-08-31, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
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综述 | 本文综述了利用单细胞和空间转录组学技术在早期胚胎发育过程中理解干细胞谱系特化的分子调控和组织模式 | 介绍了单细胞RNA测序和空间转录组学等新兴技术在解析细胞组织、形态和分子特性差异以及谱系分配中的应用 | NA | 探讨胚胎发育和干细胞分化过程中的分子调控机制和组织结构 | 干细胞谱系特化及其在胚胎发育中的分子轨迹和基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-09 |
Between life and death: Epithelial cells in lung pathologies
2020-08, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2020.109652
PMID:32325184
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研究论文 | 本文通过最近的谱系追踪策略、单细胞RNA测序和超高分辨率成像技术，探讨了肺上皮细胞在健康和疾病中的结构和功能多样性 | 本文揭示了肺上皮细胞的显著异质性，并探讨了其在肺健康和疾病中的特定功能 | 尽管取得了显著进展，但仍远未达到能够训练/指导肺上皮细胞以促进肺修复和再生的目标 | 理解控制肺上皮细胞形态发生、分化以及与其他细胞类型和细胞外基质交流的分子机制，以改善呼吸系统疾病患者的治疗效果 | 肺上皮细胞在健康和疾病中的功能和结构多样性 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-09 |
Modeling glioblastoma invasion using human brain organoids and single-cell transcriptomics
2020-08-17, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaa091
PMID:32297954
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研究论文 | 本研究利用人脑类器官和单细胞转录组学来模拟胶质母细胞瘤的侵袭过程 | 首次使用人脑类器官作为支架来研究患者来源的胶质母细胞瘤细胞的侵袭行为 | NA | 研究胶质母细胞瘤的侵袭过程及其转录组异质性 | 胶质母细胞瘤细胞和人脑类器官 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-09 |
Regulation of adipocyte thermogenesis: mechanisms controlling obesity
2020-08, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.15331
PMID:32301220
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综述 | 本文综述了脂肪细胞生物学，特别是脂肪细胞产热调节机制及其在肥胖和肥胖相关疾病中的作用 | 揭示了脂肪细胞的三种类型（白色、米色和棕色）及其在不同解剖位置的功能差异，以及单细胞测序研究显示的脂肪细胞前体异质性 | NA | 探讨如何通过增加产热脂肪细胞的数量及其激活来阐明肥胖及其相关疾病的部分病理生理基础 | 脂肪细胞的生物学特性及其在能量平衡中的作用 | NA | 肥胖 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-09 |
Automatic identification of relevant genes from low-dimensional embeddings of single-cell RNA-seq data
2020-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa198
PMID:32207520
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研究论文 | 本文介绍了一种从单细胞RNA测序数据的低维嵌入中自动识别相关基因的方法 | 引入了局部和全局基因相关性的概念，计算非线性低维嵌入的主成分分析负载，以识别驱动整体嵌入和定义子区域的基因 | NA | 开发一种方法来识别驱动单细胞RNA测序数据低维嵌入的基因 | 单细胞RNA测序数据的低维嵌入 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非线性技术 | 单细胞RNA测序数据 | 不同实验协议和低维嵌入技术的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-09 |
Frontline Science: Cxxc5 expression alters cell cycle and myeloid differentiation of mouse hematopoietic stem and progenitor cells
2020-08, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.1HI0120-169R
PMID:32083332
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研究论文 | 本研究探讨了CXXC5在骨髓生成中的作用，通过在小鼠早期干细胞和祖细胞中使用过表达和短发夹RNA介导的敲低技术 | 首次证明了CXXC5在单核细胞发育中的作用 | NA | 研究CXXC5在骨髓生成中的生理功能 | 小鼠造血干细胞和祖细胞 | NA | NA | 短发夹RNA，流式细胞术，RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠早期干细胞和祖细胞（LSK细胞） | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-Seq: a next generation sequencing tool for a high-resolution view of the individual cell
2020-08, Journal of biomolecular structure & dynamics
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/07391102.2019.1659859
PMID:31524088
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研究论文 | 本文介绍了单细胞RNA测序（Single-cell RNA-Seq）作为一种下一代测序工具，用于获得单个细胞的高分辨率视图 | 单细胞RNA测序技术能够提供单个细胞的详细基因表达信息，这是传统测序技术无法实现的 | NA | 探索单细胞RNA测序技术在解析细胞异质性和基因表达方面的应用 | 单个细胞的基因表达 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（Single-cell RNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |