单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
101	2024-08-09	Single-Cell Multimodal Analytical Approach by Integrating Raman Optical Tweezers and RNA Sequencing 2020-08-04, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.0c00912 PMID:32643364	研究论文	本文通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和拉曼光学镊子（ROT），实现了一种单细胞多模态分析方法，并应用于研究药物敏感性	本文创新地将单细胞RNA测序与拉曼光学镊子技术结合，实现了对单个癌细胞的形态监测、拉曼识别和转录组分析的多模态分析	NA	研究单细胞多模态分析方法在药物敏感性研究中的应用	人BGC823胃癌细胞对不同药物（紫杉醇和二氯乙酸钠）的药物敏感性	数字病理学	胃癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），拉曼光学镊子（ROT）	NA	转录组数据	单个BGC823癌细胞
102	2024-08-09	Single-Cell Sequencing Reveals Heterogeneity Effects of Bisphenol A on Zebrafish Embryonic Development 2020-08-04, Environmental science & technology IF:10.8Q1 DOI:10.1021/acs.est.0c02428 PMID:32644799	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了双酚A（BPA）暴露对斑马鱼胚胎发育过程中细胞转录组异质性的影响	首次在单细胞水平上全面揭示了BPA对斑马鱼胚胎发育的异质性效应	NA	探讨BPA暴露对斑马鱼胚胎发育过程中细胞转录组异质性的影响	斑马鱼胚胎细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组	64,683个细胞
103	2024-08-09	CD81 Controls Beige Fat Progenitor Cell Growth and Energy Balance via FAK Signaling 2020-08-06, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2020.06.021 PMID:32615086	研究论文	研究通过单细胞RNA测序技术，发现并验证了CD81在调控米色脂肪祖细胞增殖和能量平衡中的关键作用	首次揭示了CD81作为米色脂肪祖细胞的标记物，并发现其在冷暴露后新生米色脂肪生物发生中的必要性	研究主要集中在CD81的功能验证上，对于其具体分子机制和调控网络的深入解析尚需进一步研究	探讨米色脂肪祖细胞的发育起源及其调控途径	米色脂肪祖细胞及其相关蛋白CD81	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	具体样本数量未在摘要中提及
104	2024-08-09	Global Dynamic Molecular Profiling of Stomatal Lineage Cell Development by Single-Cell RNA Sequencing 2020-08-03, Molecular plant IF:17.1Q1 DOI:10.1016/j.molp.2020.06.010 PMID:32592820	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术对5天龄拟南芥幼苗子叶中的12,844个单个细胞进行分析，全面描述了气孔系细胞发育的分子动态过程	首次基于单细胞转录组分析全面描述了气孔系细胞发育的生物学过程，并揭示了调控从分生组织母细胞到保卫细胞母细胞发育的转录网络	NA	理解气孔系细胞发育过程中新鉴定标记基因的调控作用	气孔系细胞发育	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	12,844个单个细胞
105	2024-08-09	Application of single-cell RNA sequencing on human skin: Technical evolution and challenges 2020-Aug, Journal of dermatological science IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.jdermsci.2020.06.002 PMID:32593488	研究论文	本文讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在人类皮肤研究中的应用及其技术进步和挑战	scRNA-seq技术能够以单细胞分辨率进行基因表达分析，并识别细胞异质性，从而深化了对皮肤生物学多个方面的理解	由于单个细胞中可检测到的mRNA数量较少以及样本准备过程中转录组的变化，scRNA-seq数据通常非常嘈杂，且样本准备和生物信息学分析方法的不标准化阻碍了可靠的跨研究比较	探讨scRNA-seq在皮肤学研究中的优势和技术挑战	人类皮肤细胞的基因表达和细胞异质性	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	NA
106	2024-08-09	The ACE2 expression in Sertoli cells and germ cells may cause male reproductive disorder after SARS-CoV-2 infection 2020-08, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.15541 PMID:32594644	研究论文	研究分析了单细胞RNA测序数据，探讨了SARS-CoV-2感染后ACE2在睾丸细胞中的表达及其对男性生殖障碍的可能影响	首次分析了ACE2在人类睾丸细胞中的表达，并探讨了其与男性生殖障碍的关系	NA	探讨SARS-CoV-2感染后ACE2在睾丸细胞中的表达及其对男性生殖功能的影响	人类睾丸细胞中的ACE2表达	NA	男性生殖障碍	单细胞RNA测序	NA	RNA	成年人类睾丸细胞
107	2024-08-09	Integrating spatial gene expression and breast tumour morphology via deep learning 2020-08, Nature biomedical engineering IF:26.8Q1 DOI:10.1038/s41551-020-0578-x PMID:32572199	研究论文	本文开发了一种深度学习算法，用于从苏木精-伊红染色的组织病理学图像预测局部基因表达	利用空间转录组学数据与组织病理学图像匹配，预测了100多种基因的表达，包括已知的乳腺癌生物标志物	NA	探索通过组织病理学图像预测空间解析的转录组的可能性	乳腺癌患者的组织病理学图像和空间解析的基因表达数据	机器学习	乳腺癌	深度学习	深度学习算法	图像	30,612个空间解析的基因表达数据与23名乳腺癌患者的组织病理学图像
108	2024-08-09	COVID-19 severity correlates with airway epithelium-immune cell interactions identified by single-cell analysis 2020-08, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-020-0602-4 PMID:32591762	研究论文	通过单细胞RNA测序分析鼻咽和支气管样本，研究COVID-19严重程度与气道上皮细胞-免疫细胞相互作用的关系	首次揭示了COVID-19患者中气道上皮细胞与免疫细胞之间相互作用的增强，并提出了可能的药物抑制途径	样本量相对较小，且仅包括中度和危重病例	探究COVID-19严重程度相关的免疫反应和机制	COVID-19患者的鼻咽和支气管样本	数字病理学	COVID-19	单细胞RNA测序	NA	RNA	19名中度或危重COVID-19患者及5名健康对照
109	2024-08-09	Discordance between GLP-1R gene and protein expression in mouse pancreatic islet cells 2020-08-14, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2 DOI:10.1074/jbc.RA120.014368 PMID:32554468	研究论文	研究探讨了小鼠胰岛β细胞中GLP-1R基因与蛋白表达的不一致性及其在代谢应激下的变化	首次揭示了GLP-1R在小鼠胰岛β细胞中的表达异质性，并发现代谢应激对GLP-1R阳性β细胞数量的影响	研究结果表明单细胞RNA测序数据在解释低丰度转录本如肠促胰岛素受体时需谨慎	探究GLP-1R在胰岛β细胞中的表达模式及其在代谢应激下的变化	小鼠胰岛α细胞、β细胞和δ细胞中的GLP-1R基因与蛋白表达	NA	糖尿病	单细胞RNA测序（scRNASeq）、流式细胞术（FACS）、定量RT-PCR、流式细胞仪	NA	RNA序列数据	涉及小鼠和人类的β细胞样本
110	2024-08-09	The Mincle/Syk/NF-κB Signaling Circuit Is Essential for Maintaining the Protumoral Activities of Tumor-Associated Macrophages 2020-08, Cancer immunology research IF:8.1Q1 DOI:10.1158/2326-6066.CIR-19-0782 PMID:32532809	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了模式识别受体Mincle在肿瘤相关巨噬细胞（TAM）中的高表达，并发现Mincle/Syk/NF-κB信号通路对维持TAM的促肿瘤活性至关重要。	发现了Mincle/Syk/NF-κB信号通路在TAM中的新机制，并证明了通过沉默Mincle可以抑制TAM驱动的癌症进展。	NA	探讨肿瘤相关巨噬细胞中的信号通路及其在癌症进展中的作用。	肿瘤相关巨噬细胞（TAM）及其在癌症中的作用。	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	涉及非小细胞肺癌患者和NOD/SCID小鼠模型。
111	2024-08-09	Single-Cell RNA Sequencing of Human, Macaque, and Mouse Testes Uncovers Conserved and Divergent Features of Mammalian Spermatogenesis 2020-08-24, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2020.05.010 PMID:32504559	研究论文	本文利用单细胞RNA测序技术，比较了人、猕猴和鼠的睾丸中主要生殖细胞和体细胞类型的转录特征，揭示了哺乳动物精子发生过程中的保守和差异特征	首次在人、猕猴和鼠中使用单细胞RNA测序技术，系统比较了精子发生过程中的转录特征，为理解灵长类生殖细胞发育和体外配子发生提供了丰富的数据基础	NA	探讨人、猕猴和鼠在精子发生过程中的分子标记和细胞状态的保守性和差异性	人、猕猴和鼠的睾丸中的生殖细胞和体细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	人、猕猴和鼠的睾丸样本
112	2024-08-09	Distinct iNKT Cell Populations Use IFNγ or ER Stress-Induced IL-10 to Control Adipose Tissue Homeostasis 2020-08-04, Cell metabolism IF:27.7Q1 DOI:10.1016/j.cmet.2020.05.017 PMID:32516575	研究论文	研究通过单细胞RNA测序发现脂肪组织中的iNKT细胞群，这些细胞群根据NK1.1表达分为两类功能性群体，分别产生IL-10和IFNγ，以维持代谢稳态	首次揭示了脂肪组织iNKT细胞通过产生IL-10和IFNγ来控制代谢稳态的机制，并发现了NK1.1 iNKT细胞在限制病理性巨噬细胞扩张中的新作用	NA	探究脂肪组织iNKT细胞如何通过不同途径维持代谢稳态	脂肪组织中的iNKT细胞及其在代谢稳态中的作用	免疫学	代谢疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	多个脂肪组织iNKT细胞群
113	2024-08-09	A novel recombinant cccDNA-based mouse model with long term maintenance of rcccDNA and antigenemia 2020-08, Antiviral research IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.antiviral.2020.104826 PMID:32502604	研究论文	本文通过结合Cre/loxP介导的重组和腺相关病毒（AAV）载体递送策略，建立了一种新型重组共价闭合环状DNA（rcccDNA）小鼠模型，用于研究HBV的cccDNA持久性。	该研究首次成功建立了能够长期维持肝内rcccDNA的小鼠模型，并通过多种检测方法验证了其持久性和稳定性。	尽管该模型能够模拟HBV感染的免疫耐受状态，但所测试的三种抗HBV药物均未能降低rcccDNA水平。	旨在开发一种适用于研究HBV cccDNA持久性和干预策略的小鼠模型。	研究对象为HBV的cccDNA及其在体内的持久性和免疫反应。	NA	肝炎	Cre/loxP介导的重组技术，腺相关病毒（AAV）载体递送	小鼠模型	DNA	实验涉及的小鼠数量未在摘要中明确提及
114	2024-08-09	Single-cell RNA-seq Analysis Reveals That Prenatal Arsenic Exposure Results in Long-term, Adverse Effects on Immune Gene Expression in Response to Influenza A Infection 2020-08-01, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology IF:3.4Q2 DOI:10.1093/toxsci/kfaa080 PMID:32514536	研究论文	本研究探讨了孕期砷暴露对成年后流感A病毒感染免疫反应的长期影响	首次直接证明孕期饮用水中砷暴露会导致成年小鼠对流感A病毒感染的超炎症反应，并伴随显著的肺损伤	NA	研究孕期砷暴露对成年后流感A病毒感染免疫反应的影响	C57BL/6J小鼠	数字病理学	呼吸系统疾病	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	孕期暴露于100 ppb 亚砷酸钠的小鼠，成年后感染流感A病毒(H1N1)
115	2024-08-09	Early cleavage of preimplantation embryos is regulated by tRNAGln-TTG-derived small RNAs present in mature spermatozoa 2020-08-07, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2 DOI:10.1074/jbc.RA120.013003 PMID:32487749	研究论文	本研究探讨了精子中的tRNA衍生小RNA（tsRNAs）在早期胚胎发育中的作用，特别是在猪模型中，这些tsRNAs如何影响胚胎早期的分裂过程。	首次揭示了特定tsRNA组（Gln-TTGs）在猪早期胚胎分裂中的功能，这些tsRNAs可能通过调节细胞周期相关基因和逆转座子来影响胚胎发育。	NA	阐明精子中的tRNA衍生小RNA在早期胚胎发育中的具体作用。	猪的早期胚胎发育过程。	生殖生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	具体样本数量未在摘要中明确提及
116	2024-08-09	Single-cell technologies in hepatology: new insights into liver biology and disease pathogenesis 2020-08, Nature reviews. Gastroenterology & hepatology DOI:10.1038/s41575-020-0304-x PMID:32483353	综述	本文综述了单细胞转录组技术在肝病学中的应用，探讨了这些技术如何增进我们对健康和疾病中细胞多样性和功能的理解	单细胞转录组技术提供了对肝细胞、内皮细胞和肝星状细胞的代谢区化以及肝脏再生机制的新见解，并揭示了肝纤维化等疾病状态下的关键病理生理变化	NA	探讨单细胞转录组技术在肝病学中的应用，以深入理解疾病发病机制并识别新的治疗靶点	肝病学中的细胞多样性和功能，特别是肝细胞、内皮细胞、肝星状细胞和肝癌中的细胞和分子功能	数字病理学	肝病	单细胞转录组技术	NA	转录组数据	涉及全球约8.44亿肝病患者
117	2024-08-09	Cell population characterization and discovery using single-cell technologies in endocrine systems 2020-08, Journal of molecular endocrinology IF:3.6Q2 DOI:10.1530/JME-19-0276 PMID:32485670	研究论文	本文利用单细胞技术研究内分泌系统的细胞群体特征和发现	介绍了单细胞技术在多组学和空间转录组学方面的最新进展，特别是在内分泌系统中的应用	某些技术仍在优化中	探索内分泌器官的胚胎发育、稀有细胞类型的特征及疾病机制	内分泌器官，特别是下丘脑、垂体、胰腺和生殖器官	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组	多个内分泌器官的细胞
118	2024-08-09	Urethral luminal epithelia are castration-insensitive cells of the proximal prostate 2020-08, The Prostate DOI:10.1002/pros.24020 PMID:32497356	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序技术，全面分析了小鼠前列腺和尿道中所有上皮细胞的转录组特征，并验证了尿道上皮细胞群的存在及其在前列腺增生中的潜在作用。	首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了小鼠前列腺和尿道的上皮细胞，并发现了尿道上皮细胞在前列腺增生中的重要作用。	研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现。	旨在通过单细胞RNA测序技术，客观识别前列腺和尿道上皮细胞的亚型，并探讨其在前列腺增生中的作用。	小鼠前列腺和尿道的上皮细胞。	数字病理学	前列腺疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	未具体说明样本数量
119	2024-08-09	Discovery of New Targets to Control Metastasis in Pancreatic Cancer by Single-cell Transcriptomics Analysis of Circulating Tumor Cells 2020-08, Molecular cancer therapeutics IF:5.3Q1 DOI:10.1158/1535-7163.MCT-19-1166 PMID:32499301	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析循环肿瘤细胞，发现胰腺癌转移的新治疗靶点	开发了高度转移性的胰腺癌患者来源的异种移植（PDX）小鼠模型，并通过单细胞RNA测序识别了改变的信号传导和代谢途径以及潜在的治疗靶点	NA	研究胰腺癌转移的机制并寻找新的治疗靶点	胰腺癌的转移过程和循环肿瘤细胞的转录组	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	PDX小鼠模型
120	2024-08-09	Single-cell profiling reveals sex diversity in human renal proximal tubules 2020-Aug-20, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2020.144790 PMID:32439376	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了人类肾脏近端小管中的性别多样性基因表达差异	首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了人类肾脏近端小管中的性别偏倚基因表达，并发现了跨物种的共同和特异性基因表达差异	NA	旨在理解人类男性和女性肾脏近端小管中的基因表达差异	人类男性和女性肾脏近端小管的基因表达	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA