单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 139 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-09 |
Finding a Needle in a Haystack: Identification of a Beige Fat Progenitor
2020-08-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.07.014
PMID:32763184
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研究论文 | Oguri等研究者利用单细胞RNA测序技术，在皮下脂肪组织中鉴定出一种棕色脂肪前体细胞，该细胞能分化为产热脂肪细胞 | 首次鉴定出标记为PDGFRα、Sca1和CD81的棕色脂肪前体细胞，并发现其在冷刺激和鸢尾素作用下通过FAK信号通路增殖 | NA | 鉴定棕色脂肪前体细胞及其调控机制 | 棕色脂肪前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 82 | 2024-08-09 |
scTyper: a comprehensive pipeline for the cell typing analysis of single-cell RNA-seq data
2020-Aug-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-03700-5
PMID:32753029
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scTyper的综合性R语言工具包，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型分析 | scTyper提供了一个包含213个细胞标记集的数据库scTyper.db，并实现了三种定制方法来估计细胞类型标记表达，以及改进的DNA拷贝数推断方法inferCNV用于恶性细胞类型分析 | NA | 开发一个综合且用户友好的工具包，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 包含213个细胞标记集的数据库 |
| 83 | 2024-08-09 |
Fusion transcript detection using spatial transcriptomics
2020-08-04, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-020-00738-5
PMID:32753032
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STfusion的新方法，利用空间转录组学技术推断融合转录本的存在 | 提出了一种新的C评分方法来测量观察到的和预期的多聚A尾数量的差异，从而推断融合转录本 | NA | 研究融合转录本在肿瘤发生中的作用及其在组织切片中的空间分辨率 | 融合转录本在肿瘤细胞系和临床组织数据中的检测 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 12个组织切片 |
| 84 | 2024-08-09 |
An interspecies translation model implicates integrin signaling in infliximab-resistant inflammatory bowel disease
2020-08-04, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.aay3258
PMID:32753478
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研究论文 | 本文开发了一种名为可翻译组件回归（TransComp-R）的方法，结合小鼠蛋白质组数据和患者治疗前转录组数据，以识别在小鼠数据中可预测患者治疗反应的分子特征，揭示了整合素信号通路在抗TNF治疗抵抗的克罗恩病和溃疡性结肠炎患者中的激活状态。 | TransComp-R方法的创新之处在于它能够克服小鼠模型与人类受试者之间的物种和跨组学差异，为解决模型系统与患者之间的物种、分子和表型差异提供了一个可推广的框架。 | NA | 旨在克服抗肿瘤坏死因子（anti-TNF）治疗抵抗的临床挑战，通过识别和验证与治疗反应相关的分子机制。 | 研究对象包括抗TNF治疗抵抗的克罗恩病和溃疡性结肠炎患者，以及小鼠模型中的蛋白质组数据。 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 可翻译组件回归（TransComp-R） | 蛋白质组数据，转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 85 | 2024-08-09 |
Nicotinamide Mononucleotide Supplementation Reverses the Declining Quality of Maternally Aged Oocytes
2020-08-04, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107987
PMID:32755581
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研究论文 | 本文研究了尼克酰胺单核苷酸（NMN）补充对自然衰老小鼠卵母细胞质量的改善效果 | 首次报道NMN补充能有效提高自然衰老小鼠卵母细胞的质量，通过恢复烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD）水平实现 | NA | 探索改善高龄产妇卵母细胞质量的有效方法 | 自然衰老小鼠的卵母细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 86 | 2024-08-09 |
Robust gene expression programs underlie recurrent cell states and phenotype switching in melanoma
2020-08, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-0547-3
PMID:32753671
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析了黑色素瘤细胞在不同状态下的基因表达程序，揭示了中间状态的存在及其调控网络 | 首次通过单细胞RNA测序和时间序列分析揭示了黑色素瘤细胞状态转换中的中间状态及其稳定的基因调控网络 | NA | 探索黑色素瘤细胞在黑色素细胞和间充质样状态之间的中间状态及其基因调控网络 | 黑色素瘤细胞的状态转换及其基因表达程序 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 10个黑色素瘤细胞培养物使用单细胞RNA测序，26个额外培养物使用批量RNA测序 |
| 87 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis revealed long-lasting adverse effects of tamoxifen on neurogenesis in prenatal and adult brains
2020-08-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1918883117
PMID:32727894
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了他莫昔芬对胚胎期和成年大脑神经发生的长久不良影响 | 首次通过单细胞RNA测序结合体内外实验，揭示他莫昔芬通过失调WntDmrta2信号通路对神经发生的影响 | NA | 探讨他莫昔芬对大脑神经发生的影响及其分子机制 | 胚胎期和成年大脑的神经发生 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 88 | 2024-08-09 |
Expression of Amyloidogenic Transthyretin Drives Hepatic Proteostasis Remodeling in an Induced Pluripotent Stem Cell Model of Systemic Amyloid Disease
2020-08-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.07.003
PMID:32735824
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研究论文 | 本文利用遗传性转甲状腺素蛋白淀粉样变性（ATTR淀粉样变性）诱导的多能干细胞（iPSCs）模型，研究了肝细胞样细胞（HLCs）对分泌的转甲状腺素蛋白（TTR）的蛋白质毒性的贡献。 | 通过生成表达淀粉样变性或野生型TTR的同源、患者特异性iPSCs，并结合单细胞RNA测序，识别了与iPSC衍生HLCs中不稳定TTR产生相关的肝脏蛋白质稳态因子。 | NA | 定义肝细胞样细胞对分泌的转甲状腺素蛋白的蛋白质毒性的贡献 | 遗传性转甲状腺素蛋白淀粉样变性诱导的多能干细胞模型 | 数字病理学 | 系统性淀粉样变性病 | 单细胞RNA测序 | iPSCs | RNA | 表达淀粉样变性或野生型TTR的同源、患者特异性iPSCs |
| 89 | 2024-08-09 |
Mapping a mammalian adult adrenal gland hierarchy across species by microwell-seq
2020-Aug-03, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-020-00042-8
PMID:32743779
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研究论文 | 本文通过结合Microwell-seq技术和BGI MGISEQ2000测序平台，对小鼠成年肾上腺细胞进行单细胞RNA测序，并进行了人与小鼠成年肾上腺的单细胞比较分析 | 首次使用Microwell-seq结合BGI MGISEQ2000平台进行单细胞RNA测序，揭示了哺乳动物肾上腺的保守遗传网络 | NA | 探索哺乳动物成年肾上腺的细胞层次结构 | 小鼠和人的成年肾上腺细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 11,883个小鼠成年肾上腺细胞 |
| 90 | 2024-08-09 |
Activation of a neural stem cell transcriptional program in parenchymal astrocytes
2020-08-03, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.59733
PMID:32744501
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了Notch信号减少后纹状体星形胶质细胞在体内的神经发生过程 | 发现实质性星形胶质细胞具有潜在的神经干细胞特性，并通过靶向干预促进其神经分化 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步在其他物种中验证 | 探究星形胶质细胞在Notch信号减少后的神经发生机制 | 纹状体和皮质星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 91 | 2024-08-09 |
Mechanisms of stretch-mediated skin expansion at single-cell resolution
2020-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2555-7
PMID:32728211
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研究论文 | 本文开发了一种小鼠模型，用于在单细胞分辨率下研究拉伸对皮肤表皮的影响，并结合多种方法揭示了拉伸诱导皮肤扩张的机制。 | 首次在单细胞分辨率下研究拉伸对皮肤表皮细胞行为的影响，并定义了拉伸介导组织扩张的详细机制。 | NA | 研究拉伸如何影响皮肤表皮细胞的行为及其分子机制。 | 皮肤表皮细胞在拉伸下的行为和分子机制。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型 |
| 92 | 2024-08-09 |
Epigenetic regulator function through mouse gastrulation
2020-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2552-x
PMID:32728215
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研究论文 | 本文通过结合合子扰动和单细胞RNA测序技术，研究了小鼠原肠胚形成期间多个关键调控因子的功能。 | 本文采用了一种新的实验框架，通过同时检测多个突变小鼠胚胎，获取了强有力的形态学和转录信息。 | 本文主要集中在原肠胚形成后的阶段，对于之前的发育阶段的研究较少。 | 研究小鼠原肠胚形成期间表观遗传调控因子的直接发育作用。 | 研究对象包括小鼠胚胎中的多个关键表观遗传调控因子。 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 研究涉及多个突变小鼠胚胎 |
| 93 | 2024-08-09 |
Microglia Require CD4 T Cells to Complete the Fetal-to-Adult Transition
2020-08-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.026
PMID:32702313
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研究论文 | 本文通过成像、单细胞和外科手术方法，研究了小鼠和人类大脑中CD69 CD4 T细胞的分布及其在脑发育中的作用 | 首次揭示了CD4 T细胞在大脑发育中的作用，以及它们如何影响微胶质细胞从胎儿到成人的转变 | NA | 探讨CD4 T细胞在脑发育中的功能及其与免疫和神经系统的相互作用 | 小鼠和人类大脑中的CD4 T细胞及其对微胶质细胞成熟的影响 | NA | NA | 成像技术、单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 小鼠和人类大脑样本 |
| 94 | 2024-08-09 |
Altered proximal tubular cell glucose metabolism during acute kidney injury is associated with mortality
2020-08, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-020-0238-1
PMID:32694833
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研究论文 | 研究探讨了急性肾损伤（AKI）期间近端小管细胞葡萄糖代谢的变化及其与死亡率的关联 | 首次揭示了AKI期间肾脏葡萄糖新生受损的情况，并探讨了其对全身代谢的影响 | 研究主要基于回顾性队列和动物模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨AKI期间肾脏葡萄糖和乳酸代谢的变化及其对死亡率的影响 | 急性肾损伤患者和实验动物的肾脏葡萄糖和乳酸代谢 | NA | 急性肾损伤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括人类患者和实验动物（小鼠和 rats） |
| 95 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing in breast cancer: Understanding tumor heterogeneity and paving roads to individualized therapy
2020-08, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12078
PMID:32654419
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在乳腺癌研究中的应用，探讨了其在解析肿瘤异质性和个性化治疗方面的潜力 | scRNA-seq技术通过提高灵敏度、准确性和效率，以及高吞吐量的单细胞分离方法，为解析细胞群体的异质性和探索与肿瘤发生和转移相关的稀有细胞类型提供了优势 | 当前scRNA-seq技术在乳腺癌治疗选择研究中应用有限，且存在一些技术问题需要克服 | 探讨scRNA-seq技术在乳腺癌研究中的应用，包括肿瘤异质性分析和个性化治疗 | 乳腺癌细胞群体和肿瘤微环境中的免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 96 | 2024-08-09 |
Complex Genetics in Pancreatitis: Insights Gained From a New Candidate Locus Panel
2020-08, Pancreas
IF:1.7Q3
DOI:10.1097/MPA.0000000000001612
PMID:32658084
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研究论文 | 本研究通过使用新的DNA测序面板评估100名胰腺炎患者，探索胰腺炎的复杂遗传机制 | 提出了一个新的非孟德尔遗传风险/病因范式，其中非致病性遗传风险变异在易感基因组和损伤/功能障碍反应基因中的组合导致获得性胰腺疾病 | NA | 探索胰腺炎的遗传因素及其在胰腺腺泡细胞和导管细胞中的作用 | 胰腺炎患者及其遗传变异 | 遗传学 | 胰腺炎 | DNA测序 | NA | 基因数据 | 100名胰腺炎患者 |
| 97 | 2024-08-09 |
Persistence of a regeneration-associated, transitional alveolar epithelial cell state in pulmonary fibrosis
2020-08, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-0542-8
PMID:32661339
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研究论文 | 本研究利用肺类器官、多种体内修复模型、单细胞转录组学和谱系追踪技术，发现肺泡II型上皮细胞在分化为I型细胞的过程中，会获得预肺泡I型过渡细胞状态（PATS），并在终末成熟过程中经历广泛的拉伸，使其易受DNA损伤。 | 本研究首次揭示了肺泡II型上皮细胞在分化过程中的过渡状态PATS，并发现其在肺纤维化中的异常积累。 | NA | 研究肺泡上皮细胞在损伤修复过程中的过渡状态及其在疾病中的作用。 | 肺泡II型上皮细胞的分化过程及其在肺纤维化中的表现。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | NA |
| 98 | 2024-08-09 |
Cell shape: effects on gene expression and signaling
2020-Aug, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-020-00722-4
PMID:32671813
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综述 | 本文综述了细胞形状对基因表达和信号传导的影响，特别是通过单细胞捕获和RNA测序技术在心肌细胞中的应用 | 介绍了新的单细胞捕获策略和单细胞RNA测序技术，用于分析不同几何形态的心肌细胞的转录组 | NA | 探讨细胞形状与基因表达之间的关系及其在生物学和疾病治疗中的潜在应用 | 心肌细胞的形状及其对基因表达的影响 | 生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 99 | 2024-08-09 |
New light on cortical neuropeptides and synaptic network plasticity
2020-08, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2020.04.002
PMID:32679509
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研究论文 | 本文探讨了皮质神经肽及其在皮质突触网络可塑性中的作用 | 利用单细胞RNA测序转录组学的新发现揭示了皮质神经肽信号基因表达的复杂模式，并介绍了新的工具以增强对皮质神经肽信号的分子访问 | NA | 探索神经肽和突触网络相互作用在皮质功能和可塑性中的作用 | 皮质神经肽及其在皮质突触网络中的功能 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 100 | 2024-08-09 |
Single-cell and spatial transcriptomics approaches of cardiovascular development and disease
2020-Aug, BMB reports
IF:2.9Q3
PMID:32684243
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综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在心血管发育和疾病研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学技术在识别罕见和新型细胞类型以及描述正常和病理条件下转录变异方面的进展 | NA | 探讨单细胞和空间转录组学技术如何促进我们对心血管发育和疾病的理解 | 心血管发育和疾病中的细胞异质性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |