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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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141 | 2024-08-09 |
Pathway-Based Single-Cell RNA-Seq Classification, Clustering, and Construction of Gene-Gene Interactions Networks Using Random Forests
2020-06, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2019.2944865
PMID:31581101
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研究论文 | 本文提出了一种基于随机森林的通路分析框架,用于单细胞RNA测序数据的细胞群体分类和聚类,并构建基因-基因相互作用网络 | 首次利用机器学习技术研究功能通路在异质细胞群体分类中的应用,并提出了一种新的方法来构建基因-基因相互作用网络 | NA | 旨在通过通路分析更好地理解不同细胞群体的功能异质性,并识别驱动细胞功能异质性的重要基因 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体和基因相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | NA |
142 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptional analyses of spasmolytic polypeptide-expressing metaplasia arising from acute drug injury and chronic inflammation in the stomach
2020-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2019-318930
PMID:31481545
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研究论文 | 研究旨在定义由急性药物损伤和慢性炎症引起的胃黏膜中松弛素表达性化生(SPEM)在单细胞水平的转录变化 | 提出需要扩展SPEM的定义,包括不表达成熟主细胞转录本的Tff2+Muc6+细胞,并展示了SPEM通过高度保守的细胞程序独立于病因发展,并在慢性炎症环境中发展出免疫调节能力 | NA | 定义SPEM在单细胞水平的转录变化 | 胃黏膜中的SPEM | 数字病理学 | 胃病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组 | 从健康胃、药物诱导和炎症诱导SPEM病变的胃中分离的胃体上皮细胞 |