单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 142 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-09 |
NFI transcription factors provide chromatin access to maintain stem cell identity while preventing unintended lineage fate choices
2020-06, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-0513-0
PMID:32393888
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研究论文 | 本文通过在小鼠毛囊中进行时空基因敲除，揭示了转录因子NFIB和NFIX在维持干细胞身份中的关键作用 | 首次揭示NFIB和NFIX在维持干细胞身份和防止不希望的谱系命运选择中的重要作用 | NA | 探究NFIB和NFIX在维持干细胞身份和防止不希望的谱系命运选择中的作用 | 小鼠毛囊中的干细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组学, ATAC-Seq, ChIP-Seq | NA | 基因组数据 | NA |
| 102 | 2024-08-09 |
Single-cell landscape of bronchoalveolar immune cells in patients with COVID-19
2020-06, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-0901-9
PMID:32398875
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了不同严重程度的COVID-19患者和健康人的支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞特征 | 首次详细描述了COVID-19患者支气管肺泡灌洗液中免疫细胞的单细胞景观，揭示了不同疾病严重程度下的免疫特征 | NA | 探究COVID-19患者呼吸道免疫特征与疾病严重程度之间的关系 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 不同严重程度的COVID-19患者和健康人的支气管肺泡灌洗液样本 |
| 103 | 2024-08-09 |
UHRF1 Controls Thymocyte Fate Decisions through the Epigenetic Regulation of EGR1 Expression
2020-06-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.1901471
PMID:32358021
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研究论文 | 本研究探讨了UHRF1通过表观遗传调控EGR1表达影响胸腺细胞命运决定的作用 | 首次揭示了UHRF1在胸腺细胞分化中的关键作用，并通过单细胞RNA测序分析了其对T细胞谱系发展的影响 | NA | 研究UHRF1在胸腺细胞分化过程中的表观遗传调控作用 | 胸腺细胞的命运决定和T细胞谱系发展 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胸腺细胞 |
| 104 | 2024-08-09 |
Integrative analysis of in vivo recording with single-cell RNA-seq data reveals molecular properties of light-sensitive neurons in mouse V1
2020-06, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-020-00720-y
PMID:32350740
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研究论文 | 本研究通过整合体内记录与单细胞RNA测序数据，揭示了小鼠V1区光敏感神经元的分子特性 | 首次揭示了小鼠V1区单个光刺激神经元的转录组特征，并发现了与光反应相关的关键基因 | 研究仅限于小鼠V1区的第2/3层神经元，未涉及其他层次或其他脑区的神经元 | 探索小鼠V1区光敏感神经元的分子机制 | 小鼠V1区的光敏感神经元 | 数字病理学 | NA | 钙成像、全细胞膜片钳记录、mRNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 53个来自小鼠V1区第2/3层的单个神经元 |
| 105 | 2024-08-09 |
Differentiation of transplanted haematopoietic stem cells tracked by single-cell transcriptomic analysis
2020-06, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-0512-1
PMID:32367048
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，追踪了移植后的造血干细胞在预处理宿主体内的动态变化 | 首次通过单细胞转录组分析，揭示了移植后造血干细胞在早期阶段的命运选择和动力学 | 研究仅限于移植后第一周的观察，未涉及更长时间段的变化 | 探究移植后造血干细胞在预处理宿主体内的行为和命运 | 造血干细胞及其在移植后的分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 28种造血细胞类型 |
| 106 | 2024-08-09 |
alona: a web server for single-cell RNA-seq analysis
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa269
PMID:32324845
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研究论文 | 本文介绍了一个名为alona的网络服务器，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析 | 将多种流行的单细胞分析算法整合到一个灵活的管道中，提供了一个用户友好的数据分析平台 | NA | 开发一个用户友好的软件工具，用于单细胞RNA测序数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达矩阵 | NA |
| 107 | 2024-08-09 |
scHLAcount: allele-specific HLA expression from single-cell gene expression data
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa264
PMID:32330223
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scHLAcount的工作流程，用于从单细胞RNA测序数据中计算人类白细胞抗原（HLA）基因的等位基因特异性分子计数 | scHLAcount是首个能够在分子水平上进行等位基因特异性定量的方法 | NA | 开发一种新的方法来解析单细胞水平上的HLA基因表达模式 | HLA基因的等位基因特异性表达 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 108 | 2024-08-09 |
Immune outposts in the adventitia: One foot in sea and one on shore
2020-06, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2020.03.005
PMID:32339862
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研究论文 | 本文讨论了血管外膜作为多种免疫细胞的保守组织免疫前哨的作用，并描述了外膜区域的独特非免疫组成及其对局部组织免疫、器官适应和疾病的影响。 | 利用显微技术、基因改造小鼠和单细胞RNA测序技术，揭示了血管外膜作为组织免疫微环境的组成和功能。 | NA | 探讨血管外膜作为免疫细胞的保守组织免疫前哨的作用及其对局部组织免疫、器官适应和疾病的影响。 | 血管外膜中的免疫细胞和非免疫细胞组成及其相互作用。 | NA | NA | 显微技术、基因改造小鼠、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 基因改造小鼠 |
| 109 | 2024-08-09 |
Integrated scRNA-Seq Identifies Human Postnatal Thymus Seeding Progenitors and Regulatory Dynamics of Differentiating Immature Thymocytes
2020-06-16, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.03.019
PMID:32304633
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了人类青春期后胸腺细胞群体，并识别了两种可能的胸腺种子形成前体细胞 | 首次在人类中使用scRNA-seq技术详细描述了胸腺种子形成前体细胞及其在T细胞发育中的作用 | NA | 研究青春期后人类胸腺细胞的发育过程及其调控机制 | 人类青春期后胸腺细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 110 | 2024-08-09 |
Prostate cancer cell-intrinsic interferon signaling regulates dormancy and metastatic outgrowth in bone
2020-06-04, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202050162
PMID:32314873
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和体外分析，揭示了肿瘤内在免疫信号在维持前列腺癌细胞休眠状态中的关键作用 | 本文首次证明了肿瘤内在的I型IFN信号的丢失促进了前列腺癌在骨中的进展，并通过HDAC抑制恢复IFN信号，增强了肿瘤细胞的可见性，促进了长期的抗肿瘤免疫，并阻止了骨中的癌症生长 | NA | 探讨前列腺癌骨转移休眠状态的机制，并寻找新的治疗策略 | 前列腺癌细胞及其在骨中的休眠和转移生长 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括患者样本在内的多种样本 |
| 111 | 2024-08-09 |
CD39 Produced from Human GMSCs Regulates the Balance of Osteoclasts and Osteoblasts through the Wnt/β-Catenin Pathway in Osteoporosis
2020-06-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2020.04.003
PMID:32304668
|
研究论文 | 本研究探讨了人类牙龈来源的间充质干细胞（GMSCs）产生的CD39通过Wnt/β-Catenin通路调节骨质疏松症中破骨细胞和成骨细胞平衡的作用 | 首次揭示了GMSC通过CD39和Wnt/β-Catenin通路促进骨形成的新机制，为骨质疏松症和其他骨丢失疾病提供了潜在的治疗靶点 | NA | 研究GMSCs在骨质疏松症中的作用及其调节骨形成和保护的机制 | GMSCs、CD39、Wnt/β-Catenin通路 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | RNA测序（RNA-seq）、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了卵巢切除的鼠模型进行实验 |
| 112 | 2024-08-09 |
Megakaryocyte and Platelet Transcriptomics for Discoveries in Human Health and Disease
2020-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.119.313280
PMID:32295424
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综述 | 本文综述了巨核细胞和血小板转录组学在人类健康和疾病研究中的最新发现 | 介绍了新一代RNA测序技术和核糖体足迹分析在巨核细胞和血小板转录组研究中的应用 | NA | 探讨巨核细胞和血小板转录组分析在人类健康和疾病中的应用 | 巨核细胞和血小板的转录组 | NA | NA | 下一代RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 113 | 2024-08-09 |
Identification of calcium and integrin-binding protein 1 as a novel regulator of production of amyloid β peptide using CRISPR/Cas9-based screening system
2020-06, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201902966RR
PMID:32307772
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研究论文 | 本研究利用CRISPR/Cas9系统筛选方法，鉴定钙和整合素结合蛋白1（CIB1）作为β淀粉样肽（Aβ）生成的新型调控因子 | 首次发现CIB1通过调控γ-分泌酶的亚细胞定位来调节Aβ的生成，为阿尔茨海默病（AD）的发病机制提供了新的见解 | NA | 旨在揭示β淀粉样肽（Aβ）生成的新型分子调控机制 | 钙和整合素结合蛋白1（CIB1）及其对β淀粉样肽（Aβ）生成的影响 | NA | 阿尔茨海默病 | CRISPR/Cas9 | NA | RNA-seq | 单细胞RNA-seq数据 |
| 114 | 2024-08-09 |
Adverse effects of nicotine on cardiogenic differentiation from human embryonic stem cells detected by single-cell RNA sequencing
2020-06-04, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2020.03.149
PMID:32276728
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨尼古丁对人类胚胎干细胞H9心肌分化的影响及其机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示尼古丁对人类胚胎心肌发育的直接影响 | 研究仅限于特定的细胞系H9，可能需要进一步验证其他细胞系中的结果 | 探究尼古丁对人类胚胎心肌生成的影响及相关机制 | 人类胚胎干细胞H9及其心肌分化过程 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 特定浓度尼古丁处理的H9细胞 |
| 115 | 2024-08-09 |
Uncovering the key dimensions of high-throughput biomolecular data using deep learning
2020-06-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa191
PMID:32232416
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research paper | 本文提出了一种基于自编码器的深度学习框架DeepAE，用于解析高维单细胞RNA-seq数据的关键维度 | DeepAE在揭示单细胞RNA-seq数据的关键维度方面表现优于传统方法，并能在其他平台如质谱流式细胞术和代谢组学中展现全面性能 | NA | 解决高维单细胞RNA-seq数据的解析问题 | 单细胞RNA-seq数据的关键维度 | machine learning | NA | RNA-seq | auto-encoder | gene expression | 九个转录组学数据集 |
| 116 | 2024-08-09 |
Identification of a potential mechanism of acute kidney injury during the COVID-19 outbreak: a study based on single-cell transcriptome analysis
2020-06, Intensive care medicine
IF:27.1Q1
DOI:10.1007/s00134-020-06026-1
PMID:32236644
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-08-09 |
Joint learning dimension reduction and clustering of single-cell RNA-sequencing data
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa231
PMID:32246821
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研究论文 | 本文提出了一种联合学习单细胞RNA测序数据降维和聚类的新算法DRjCC | DRjCC算法通过联合学习降维和细胞聚类，改善了细胞类型发现的性能 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型发现的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 涉及11个单细胞RNA测序数据集，细胞数量从49到68,579不等，细胞类型从3到14种 |
| 118 | 2024-08-09 |
Genomic Analysis of Circulating Tumor Cells at the Single-Cell Level
2020-06, The Journal of molecular diagnostics : JMD
DOI:10.1016/j.jmoldx.2020.02.013
PMID:32247862
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研究论文 | 本文评估了四种全基因组扩增（WGA）/下一代测序工作流程在单个循环肿瘤细胞（CTC）基因组分析中的应用 | MALBAC与低通全基因组测序结合的工作流程在全基因组拷贝数变异（CNV）分析中表现出更好的覆盖广度、均匀性和重复性 | 所有评估的单细胞测序工作流程在突变检测方面均未达到临床应用所需的足够灵敏度和特异性 | 评估不同全基因组扩增方法在单个循环肿瘤细胞基因组分析中的性能 | 循环肿瘤细胞（CTC）的基因组分析 | 数字病理学 | 肺癌 | 下一代测序（NGS） | NA | 基因组数据 | 四个鳞状非小细胞肺癌患者的单个循环肿瘤细胞 |
| 119 | 2024-08-09 |
GAD-alum immunotherapy in type 1 diabetes expands bifunctional Th1/Th2 autoreactive CD4 T cells
2020-06, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-020-05130-7
PMID:32248243
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研究论文 | 本研究探讨了GAD-alum免疫疗法在1型糖尿病中的作用机制，特别是在调节Th1自身免疫和诱导Th2反应方面。 | 本研究发现GAD-alum免疫疗法能够激活并扩增具有双功能Th1/Th2表型的GAD特异性CD4 T细胞。 | NA | 研究GAD-alum免疫疗法在1型糖尿病中的作用机制，特别是其如何调节Th1自身免疫和诱导Th2反应。 | GAD-alum免疫疗法对GAD特异性CD4 T细胞的影响。 | 免疫学 | 1型糖尿病 | GAD-alum免疫疗法 | NA | 血液单个核细胞 | 参与者接受了20 μg GAD-alum（两次或三次）或alum单独免疫，并在基线和治疗后采集了外周血单个核细胞样本。 |
| 120 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of murine islets shows high cellular complexity at all stages of autoimmune diabetes
2020-06-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20192362
PMID:32251514
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对非肥胖糖尿病小鼠胰岛中的多种浸润细胞在自身免疫性糖尿病过程中的转录组异质性进行了无偏倚的检查 | 首次揭示了自身免疫性糖尿病过程中胰岛微环境的动态重塑，以及特定细胞亚群的转录组特征 | NA | 定义自身免疫性糖尿病的分期，并揭示驱动该疾病的转录组特异性细胞群体 | 非肥胖糖尿病小鼠胰岛中的浸润细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |