单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 142 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-09 |
Host-Viral Infection Maps Reveal Signatures of Severe COVID-19 Patients
2020-06-25, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.05.006
PMID:32479746
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Viral-Track的计算方法，用于全局扫描未映射的单细胞RNA测序数据，以检测病毒RNA，并实现感染细胞与旁观细胞的转录细胞分类。 | Viral-Track方法能够系统地检测多种感染模型中的病毒，包括乙型肝炎病毒，并以无监督方式进行。 | NA | 揭示严重COVID-19患者与病毒相互作用的机制。 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗样本。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 严重和轻度COVID-19患者的支气管肺泡灌洗样本 | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-09 |
The Number of Transcription Factors at an Enhancer Determines Switch-like Gene Expression
2020-06-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107724
PMID:32492432
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研究论文 | 本文研究了转录因子NF-κB在超级增强子（SEs）和典型增强子（TEs）中的作用机制，以及它们如何影响基因表达的阈值和分级响应 | 首次展示了超级增强子的活性与染色质开放和丰富的NF-κB结合同时相关，导致B细胞受体（BCR）激活时基因表达的更高倍数变化和阈值表达 | NA | 探究NF-κB在超级增强子和典型增强子中的选择性参与机制及其对基因表达的影响 | 小鼠原代B淋巴细胞中的超级增强子和典型增强子 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-09 |
Acute Myeloid Leukemia iPSCs Reveal a Role for RUNX1 in the Maintenance of Human Leukemia Stem Cells
2020-06-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107688
PMID:32492433
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研究论文 | 本文报道了从急性髓系白血病（AML）患者中获得的遗传克隆诱导多能干细胞（iPSCs），这些细胞具有极高的移植潜力，并在造血分化后产生表型层次结构。通过命运追踪实验、异种移植和单细胞转录组学，研究人员鉴定出一种可通过体外粘附生长前瞻性分离的细胞亚群（iLSC），这些细胞位于该层次结构的顶端，并具有白血病干细胞（LSCs）的标志性特征。 | 本文通过整合iLSC转录组和染色质景观的研究，得出了一个预测患者生存的LSC基因特征，并揭示了跨AML基因型的LSCs对RUNX1转录因子的依赖性。 | NA | 研究旨在揭示白血病干细胞的特性和潜在的治疗靶点。 | 急性髓系白血病患者的诱导多能干细胞及其分化后的细胞亚群。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 从单个AML患者中获得的遗传克隆iPSCs | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-09 |
No evidence of severe acute respiratory syndrome-coronavirus 2 in semen of males recovering from coronavirus disease 2019
2020-06, Fertility and sterility
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.fertnstert.2020.04.024
PMID:32482249
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研究论文 | 研究描述了从COVID-19康复的男性患者精液中检测严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）的情况，并探讨了睾丸中血管紧张素转换酶2（ACE2）和跨膜丝氨酸蛋白酶2（TMPRSS2）的表达模式 | 首次在单细胞转录组数据集上分析了人类睾丸中ACE2和TMPRSS2的稀疏表达，几乎没有重叠的基因表达 | 未评估精液质量，且SARS-CoV-2对男性生殖功能的长期影响仍未知 | 研究COVID-19康复男性精液中SARS-CoV-2的存在及睾丸中ACE2和TMPRSS2的表达 | 34名通过咽拭子样本确诊COVID-19的中国成年男性 | NA | COVID-19 | qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据 | 34名成年男性 | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-09 |
Model-based analysis of sample index hopping reveals its widespread artifacts in multiplexed single-cell RNA-sequencing
2020-06-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-16522-z
PMID:32483174
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研究论文 | 本文介绍了一种统计模型，用于估计多重液滴单细胞RNA测序数据中的样本索引跳跃率，并进行概率推断以确定跳跃读取的真实样本来源 | 本文提出了一种新的统计模型，用于准确估计和校正多重单细胞RNA测序中的样本索引跳跃问题 | NA | 研究目的是分析多重单细胞RNA测序中的样本索引跳跃现象，并提出一种方法来校正由此产生的数据错误 | 多重液滴单细胞RNA测序数据中的样本索引跳跃现象 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | RNA测序数据 | 多个数据集，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-09 |
Hair-bearing human skin generated entirely from pluripotent stem cells
2020-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2352-3
PMID:32494013
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研究论文 | 本文报道了一种从人类多能干细胞生成复杂皮肤的类器官培养系统 | 首次成功从多能干细胞中生成了包含表皮、富含脂肪的真皮和带有皮脂腺的色素毛发 follicles 的类器官皮肤 | NA | 重建带有附属物的皮肤，用于未来的皮肤发育研究、疾病模型和重建手术 | 人类多能干细胞生成的皮肤类器官 | 生物工程 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-09 |
Deciphering human macrophage development at single-cell resolution
2020-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2316-7
PMID:32499656
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，解析了人类胚胎发育过程中巨噬细胞的起源和特化过程 | 首次在单细胞分辨率下详细描述了人类胚胎巨噬细胞的发育过程，包括不同解剖部位的巨噬细胞亚群及其特化轨迹 | 研究主要集中在胚胎阶段的巨噬细胞，对成年巨噬细胞的比较分析有限 | 揭示人类胚胎巨噬细胞的发育动态，为未来研究人类组织驻留巨噬细胞的发育和功能提供参考 | 人类胚胎中的CD45造血细胞，特别是卵黄囊来源的髓系偏向前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从卡内基阶段11到23的人类胚胎中分离的CD45造血细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-09 |
Unifying developmental programs for embryonic and postembryonic neurogenesis in the zebrafish retina
2020-06-19, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.185660
PMID:32467236
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了斑马鱼视网膜在四个不同发育阶段的约20,000个细胞，揭示了胚胎和胚后视网膜发生遵循相同的发育程序。 | 首次揭示了斑马鱼胚胎和胚后视网膜发生遵循相同的发育程序，并通过单细胞RNA测序技术详细描述了不同发育状态及其基因表达模式。 | 研究主要集中在斑马鱼视网膜的发育，可能不完全适用于其他物种或组织类型。 | 探讨斑马鱼视网膜胚胎和胚后发生的发育程序是否一致。 | 斑马鱼视网膜的胚胎和胚后发育过程及其基因表达模式。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约20,000个斑马鱼视网膜细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of Tumor-Infiltrating NK Cells Reveals that Inhibition of Transcription Factor HIF-1α Unleashes NK Cell Activity
2020-06-16, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.05.001
PMID:32445619
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究肿瘤浸润性NK细胞的转录组，发现抑制转录因子HIF-1α可以增强NK细胞的抗肿瘤活性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了HIF-1α抑制对NK细胞功能的激活作用，并发现IL-18在其中的关键作用 | NA | 探索增强肿瘤免疫疗法中免疫细胞功能的策略 | 肿瘤浸润性NK细胞及其在肿瘤微环境中的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类肿瘤浸润性NK细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-09 |
Molecular taxonomy of human ocular outflow tissues defined by single-cell transcriptomics
2020-06-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2001896117
PMID:32439707
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，生成了人类传统流出组织细胞图谱，并识别了12种不同的细胞类型 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了人类眼流出组织的分子分类，并识别了两种不同的表达模式（肌成纤维细胞样和成纤维细胞样） | NA | 研究旨在通过单细胞RNA测序技术揭示人类眼流出组织的细胞和分子分类 | 人类眼流出组织的细胞类型和基因表达模式 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8只人眼捐赠者的8,758个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-09 |
Forward genetic analysis using OCT screening identifies Sfxn3 mutations leading to progressive outer retinal degeneration in mice
2020-06-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1921224117
PMID:32457148
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研究论文 | 本文通过正向遗传分析结合光学相干断层扫描（OCT）筛选，在老鼠中发现了导致渐进性外视网膜退化的Sfxn3基因突变 | 首次揭示了Sfxn3基因在视网膜功能中的未知作用，并展示了其在多个视网膜细胞类型中的表达 | NA | 通过正向遗传学方法发现与视网膜疾病相关的基因 | 老鼠视网膜中的Sfxn3基因及其突变 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 光学相干断层扫描（OCT）、CRISPR/Cas9技术、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因序列 | 11个突变基因，多个老鼠品系 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-09 |
Putative regulators for the continuum of erythroid differentiation revealed by single-cell transcriptome of human BM and UCB cells
2020-06-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1915085117
PMID:32457162
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了从成人骨髓和脐带血中分离出的终末期红细胞的转录组，揭示了红细胞分化过程中的潜在调控因子 | 首次在单细胞分辨率下记录了人类终末期红细胞的转录组，区分了早期和晚期多染性红细胞以及不同发育阶段的正染性红细胞 | NA | 旨在理解伴随人类红细胞生成过程的动态发育变化 | 成人骨髓和脐带血中的终末期红细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 从成人骨髓和脐带血中分离出的CD34CD235a阳性细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-09 |
Sphetcher: Spherical Thresholding Improves Sketching of Single-Cell Transcriptomic Heterogeneity
2020-Jun-26, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101126
PMID:32438285
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研究论文 | 本文提出了一种名为Sphetcher的算法，利用阈值技术在球体内高效选择代表性细胞，以改善单细胞转录组数据的草图绘制 | Sphetcher算法采用球形阈值技术，与通常使用的等大小盒子相比，能更准确地表示原始转录组景观 | NA | 旨在改进单细胞转录组数据的计算分析方法，特别是细胞类型的检测 | 单细胞转录组数据的草图绘制和细胞类型检测 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-09 |
An Integrated Dielectrophoresis-Trapping and Nanowell Transfer Approach to Enable Double-Sub-Poisson Single-Cell RNA Sequencing
2020-06-23, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.0c02953
PMID:32437127
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研究论文 | 本文介绍了一种集成介电电泳（DEP）捕获和纳米孔转移（dTNT）方法，用于实现双亚泊松单细胞RNA测序 | 提出的dTNT-seq方法通过亚泊松方式进行细胞捕获和珠子加载，打破了泊松统计的限制，实现了双亚泊松分布 | 尽管提高了细胞和珠子的捕获效率，但仍需进一步优化以提高整体测序效率和准确性 | 开发一种新的技术方法，以提高单细胞RNA测序的效率和准确性 | 人类（HEK）和小鼠（3T3）细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了由3600个电活性DEP纳米孔单元组成的dTNT设备 | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-09 |
A Highly Sensitive, Accurate, and Automated Single-Cell RNA Sequencing Platform with Digital Microfluidics
2020-06-16, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c01613
PMID:32425041
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研究论文 | 本文介绍了一种基于数字微流控技术的单细胞RNA测序平台（digital-RNA-seq），该平台能够简化、高效且低成本地进行单细胞mRNA测量 | 提出了一种新的被动分配方法，利用亲水-疏水微特征快速生成单细胞子液滴，解决了单细胞分离中的效率、完整性、选择性和灵活性问题 | NA | 开发一种自动化、高灵敏度和高准确性的单细胞RNA测序平台 | 单细胞RNA测序技术及其在生物学应用中的性能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-09 |
Cigarette Smoke Exposure and Inflammatory Signaling Increase the Expression of the SARS-CoV-2 Receptor ACE2 in the Respiratory Tract
2020-06-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.05.012
PMID:32425701
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研究论文 | 研究揭示了香烟烟雾暴露和炎症信号如何增加呼吸道的SARS-CoV-2受体ACE2的表达 | 首次展示了香烟烟雾暴露通过剂量依赖性上调ACE2表达，并发现ACE2是肺细胞中的干扰素刺激基因 | NA | 探讨导致SARS-CoV-2致命感染的因素 | 香烟烟雾暴露对ACE2表达的影响及炎症信号的作用 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及啮齿动物和人类肺部样本 | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-09 |
Putative cell type discovery from single-cell gene expression data
2020-06, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-0825-9
PMID:32424270
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研究论文 | 本文介绍了一种单细胞聚类评估框架，用于从单细胞RNA测序数据中自动识别潜在的细胞类型 | 该方法通过迭代应用机器学习方法，同时识别不同的细胞群及其特征基因，提高了细胞类型识别的准确性 | NA | 开发一种自动识别单细胞RNA测序数据中潜在细胞类型的方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习方法 | 基因表达数据 | 一组细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-09 |
Shared proteomic effects of cerebral atherosclerosis and Alzheimer's disease on the human brain
2020-06, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-0635-5
PMID:32424284
|
研究论文 | 研究探讨了大脑中的脑动脉粥样硬化与阿尔茨海默病之间的共同蛋白质组效应 | 发现了脑动脉粥样硬化与阿尔茨海默病之间共享的蛋白质和模块，暗示了共同的病理机制 | NA | 探究脑动脉粥样硬化如何通过不明过程导致痴呆 | 大脑中的脑动脉粥样硬化与阿尔茨海默病 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 蛋白质组测序，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据，RNA数据 | 438名老年个体 | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing at isoform resolution
2020-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0553-9
PMID:32427983
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-09 |
T Cell Receptor Engineered Lymphocytes for Cancer Therapy
2020-06, Current protocols in immunology
DOI:10.1002/cpim.97
PMID:32432843
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研究论文 | 本文介绍了利用单细胞测序技术生成、分离和改造具有肿瘤反应性T细胞受体（TCR）的人类T细胞的方法，用于肿瘤治疗。 | 利用单细胞测序技术简化了肿瘤抗原特异性TCR的分离和表达过程。 | 该过程比使用嵌合抗原受体（CAR）的替代策略更为复杂。 | 开发一种新的方法来生成和改造具有肿瘤反应性TCR的人类T细胞，用于肿瘤治疗。 | 人类T细胞及其T细胞受体（TCR）。 | NA | 癌症 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |