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当前共找到 142 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing of genomic DNA resolves sub-clonal heterogeneity in a melanoma cell line
2020-06-25, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-1044-8
PMID:32587328
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研究论文 | 本文通过浅层单细胞基因组DNA测序分析了COLO829细胞系中的亚克隆异质性 | 使用浅层单细胞测序技术揭示了COLO829细胞系中的亚克隆结构和染色体异常模式 | NA | 评估和解析COLO829细胞系中的体细胞变异和亚克隆复杂性 | COLO829细胞系中的1475个细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组DNA | 1475个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome and antigen-immunoglobin analysis reveals the diversity of B cells in non-small cell lung cancer
2020-06-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02064-6
PMID:32580738
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和抗原-免疫球蛋白分析，揭示了非小细胞肺癌中B细胞的多样性及其功能 | 首次详细描述了非小细胞肺癌中肿瘤浸润B细胞的亚型及其在疾病进展中的不同功能 | 研究仅基于两个独立队列的样本，可能需要更多样本以验证结果的普遍性 | 探讨非小细胞肺癌中B细胞的多样性及其在肿瘤微环境中的作用 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织样本中的B细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个独立队列的肿瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-09 |
Transcriptional output, cell-type densities, and normalization in spatial transcriptomics
2020-06-23, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjaa028
PMID:32573704
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-09 |
NeuroD1 Dictates Tumor Cell Differentiation in Medulloblastoma
2020-06-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107782
PMID:32579914
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了髓母细胞瘤（MB）细胞的分化能力，并探讨了NeuroD1在促进MB细胞分化中的作用及其分子机制。 | 首次揭示了NeuroD1在髓母细胞瘤细胞分化中的关键作用，并提出了通过抑制EZH2来增强NeuroD1表达以促进肿瘤细胞分化的治疗策略。 | NA | 探讨髓母细胞瘤细胞的分化机制及其在治疗中的应用。 | 髓母细胞瘤细胞及其分化能力。 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-09 |
Single-Cell Profiling and SCOPE-Seq Reveal Lineage Dynamics of Adult Ventricular-Subventricular Zone Neurogenesis and NOTUM as a Key Regulator
2020-06-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107805
PMID:32579931
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了成年室管膜下区神经发生的过程，并揭示了NOTUM作为关键调节因子的作用 | 首次使用SCOPE-Seq技术结合活细胞成像和单细胞RNA测序，揭示了细胞大小转换在神经干细胞分化中的作用，并发现了NOTUM在神经干细胞激活中的关键调节作用 | NA | 研究成年室管膜下区神经发生的动态过程及其分子机制 | 成年室管膜下区的神经干细胞及其产生的嗅球神经元和胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 超过56,000个室管膜下区和嗅球细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-09 |
An entropy-based metric for assessing the purity of single cell populations
2020-06-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-16904-3
PMID:32572028
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研究论文 | 本文介绍了一种基于熵的统计量ROGUE，用于准确量化单细胞RNA测序（scRNA-seq）中识别的细胞簇的纯度 | 提出了ROGUE指标，能够准确、敏感且稳健地评估细胞簇纯度，并应用于多种模拟和真实数据集 | NA | 开发一种新的方法来评估单细胞RNA测序数据中细胞簇的纯度 | 单细胞RNA测序数据中的细胞簇纯度 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 数据 | 多种模拟和真实数据集，包括成纤维细胞、B细胞和脑数据 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-09 |
Sequencing of RNA in single cells reveals a distinct transcriptome signature of hematopoiesis in GATA2 deficiency
2020-06-23, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2019001352
PMID:32556286
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了GATA2缺陷患者造血干细胞和祖细胞的独特转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细描述了GATA2缺陷患者造血干细胞和祖细胞的转录组特征，并揭示了其与正常细胞的差异 | 研究样本量较小，仅涉及8名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨GATA2缺陷患者造血干细胞和祖细胞的转录组特征及其与临床表型的关系 | GATA2缺陷患者的造血干细胞和祖细胞 | 数字病理学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 8名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-09 |
New Classification of Macrophages in Plaques: a Revolution
2020-06-18, Current atherosclerosis reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1007/s11883-020-00850-y
PMID:32556603
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）发现的动脉粥样硬化斑块中巨噬细胞的转录变异，以更好地理解它们对动脉粥样硬化的贡献 | scRNA-seq提供了更详细的动脉粥样硬化中巨噬细胞的转录图谱，挑战了传统观点 | NA | 通过分析巨噬细胞在动脉粥样硬化中的转录变异，理解其在疾病发展中的作用 | 巨噬细胞在动脉粥样硬化斑块中的转录变异 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用了GSE97310数据集中的LDLR-/-小鼠，喂食高脂饮食11和20周的巨噬细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-09 |
Disseminated Melanoma Cells Transdifferentiate into Endothelial Cells in Intravascular Niches at Metastatic Sites
2020-06-16, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107765
PMID:32553158
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研究论文 | 本文通过结合自发转移性黑色素瘤小鼠模型的谱系追踪、高级成像和单细胞RNA测序方法，研究了黑色素瘤细胞在转移部位血管内微环境中的表型变化 | 首次提供了黑色素瘤细胞在体内直接转化为内皮细胞的证据，并在多个模型和人类样本中验证了这一发现 | NA | 探索肿瘤细胞可塑性在治疗失败、肿瘤休眠和转移扩散中的作用 | 黑色素瘤细胞在转移部位的表型变化 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个小鼠模型和人类肺、脑、小肠的BRAF转移性活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-09 |
Establishment and transcriptomic analyses of a cattle rumen epithelial primary cells (REPC) culture by bulk and single-cell RNA sequencing to elucidate interactions of butyrate and rumen development
2020-Jun, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2020.e04112
PMID:32551379
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研究论文 | 本文通过批量和单细胞RNA测序技术，建立并分析了牛瘤胃上皮原代细胞（REPC）培养物，以阐明丁酸盐与瘤胃发育的相互作用 | 首次通过批量和单细胞RNA测序技术，详细分析了丁酸盐对瘤胃上皮细胞基因表达的影响及其在瘤胃发育中的作用机制 | NA | 研究丁酸盐在瘤胃上皮细胞发育中的作用及其分子机制 | 牛瘤胃上皮原代细胞（REPC）及丁酸盐对其基因表达的影响 | NA | NA | 批量和单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自两周龄荷斯坦公牛瘤胃上皮组织的REPC | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-09 |
Coexpression enrichment analysis at the single-cell level reveals convergent defects in neural progenitor cells and their cell-type transitions in neurodevelopmental disorders
2020-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.254987.119
PMID:32554779
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研究论文 | 本文通过整合神经发育障碍（NDD）遗传学与单细胞RNA测序数据，分析了不同NDD基因集的共表达富集模式，揭示了神经前体细胞及其细胞类型转换在神经发育障碍中的关键作用。 | 本文首次在单细胞水平上进行共表达富集分析，揭示了神经前体细胞发育过程中的关键点，为理解神经发育障碍的细胞类型特异性病理生理机制提供了新框架。 | NA | 研究神经发育障碍中基因在不同脑细胞类型中的作用，并探索其对NDD病理的贡献。 | 神经前体细胞及其在神经发育障碍中的细胞类型转换。 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-09 |
BATMAN: Fast and Accurate Integration of Single-Cell RNA-Seq Datasets via Minimum-Weight Matching
2020-Jun-26, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101185
PMID:32504875
|
研究论文 | 本文提出了一种名为BATMAN的新型单细胞RNA测序数据集整合方法，通过最小权重匹配实现快速准确的整合 | BATMAN方法在多个模拟和真实数据集上显著优于现有工具，能够有效校正批次效应并保持数据集的局部结构 | NA | 提高单细胞RNA测序实验的效率和准确性 | 单细胞RNA测序数据集的整合 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 最小权重匹配 | 基因表达数据 | 多个数据集中的大量单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-09 |
Hepatocyte-specific TAK1 deficiency drives RIPK1 kinase-dependent inflammation to promote liver fibrosis and hepatocellular carcinoma
2020-06-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2005353117
PMID:32513687
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研究论文 | 本文研究了肝细胞特异性TAK1缺乏通过RIPK1激酶依赖的炎症促进肝纤维化和肝细胞癌的作用及机制 | 首次报道了RIPK1激酶在肝细胞特异性TAK1缺乏引起的炎症中的作用，并提出了通过抑制RIPK1激酶来减少肝纤维化和肝细胞癌发展的治疗策略 | 研究仅在老鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨RIPK1激酶在肝纤维化和肝细胞癌发展中的作用及其机制 | 肝细胞特异性TAK1缺乏和RIPK1激酶在肝纤维化和肝细胞癌中的作用 | 生物医学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-09 |
A flexible network-based imputing-and-fusing approach towards the identification of cell types from single-cell RNA-seq data
2020-Jun-11, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-03547-w
PMID:32527285
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研究论文 | 本文提出了一种基于网络的插补与融合框架NetImpute，用于从单细胞RNA测序数据中识别细胞类型 | 该框架通过整合多种生物网络数据，利用统计方法检测噪声数据并开发新的插补模型，以估计真实数据值，并提出一种综合方法来识别细胞类型 | NA | 提高从单细胞RNA测序数据中识别细胞类型的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 插补模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-09 |
Selective Induction of Human Autonomic Neurons Enables Precise Control of Cardiomyocyte Beating
2020-06-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-66303-3
PMID:32528170
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研究论文 | 本研究开发了一种逐步化学诱导方法，用于诱导类似交感神经和副交感神经的自主神经系统（ANS）神经元 | 首次有效地从人多能干细胞（hPSCs）中诱导出副交感神经元，并实现了对心肌细胞搏动率的精确控制 | NA | 开发一种新的化学诱导方法，以诱导出具有特定功能的交感神经和副交感神经元 | 人多能干细胞（hPSCs）衍生的交感神经和副交感神经元 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-09 |
PRMT1-p53 Pathway Controls Epicardial EMT and Invasion
2020-06-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107739
PMID:32521264
|
研究论文 | 本研究揭示了蛋白精氨酸甲基转移酶1（PRMT1）在心外膜细胞侵袭和分化中的关键作用 | 首次阐明了PRMT1-p53通路在心外膜细胞命运转变中的分子机制 | NA | 探讨PRMT1-p53通路在心脏发育中的作用 | 心外膜细胞及其衍生的细胞系 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 特定的心外膜细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-09 |
The regulation and pharmacological modulation of immune complex induced type III IFN production by plasmacytoid dendritic cells
2020-06-05, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-020-02186-z
PMID:32503683
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研究论文 | 研究系统性红斑狼疮（SLE）患者中，免疫复合物诱导的浆细胞样树突状细胞（pDCs）产生III型干扰素（IFN）的调控及药物调节机制 | 首次探讨了RNA-IC在pDCs中诱导III型IFN产生的方式，并研究了NK细胞、B细胞及多种促炎细胞因子对此过程的增强作用 | NA | 探讨RNA-IC如何诱导pDCs产生III型IFN及其调控机制 | 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞（PBMCs）或免疫细胞亚群 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（ddSEQ技术） | NA | RNA | 健康献血者及SLE患者的PBMCs或免疫细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-09 |
Detecting differential alternative splicing events in scRNA-seq with or without Unique Molecular Identifiers
2020-06, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1007925
PMID:32502143
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SCATS的方法，用于在单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中进行差异剪接分析，该方法能够在低覆盖度下通过考虑技术噪声实现高灵敏度 | SCATS方法能够处理带有或不带有唯一分子标识符（UMIs）的scRNA-seq数据，并且通过分组来自同一异构体的'外显子'，即使在低测序深度下也能检测剪接事件 | NA | 研究单细胞RNA测序技术中的差异剪接事件 | 单细胞RNA测序数据中的差异剪接事件 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | SCATS | RNA测序数据 | 使用了模拟和真实的单细胞RNA测序数据集进行评估 | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-09 |
Epithelial barriers in allergy and asthma
2020-06, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.04.010
PMID:32507228
|
综述 | 本文综述了上皮屏障在过敏和哮喘中的作用及其在呼吸道炎症病理生理学中的重要性 | 利用单细胞转录组学揭示了可能与慢性呼吸道疾病相关的新的上皮细胞类型 | NA | 探讨上皮屏障缺陷在2型驱动慢性呼吸道炎症中的作用及当前临床诊断和治疗挑战 | 上皮屏障在过敏性鼻炎、慢性鼻窦炎和哮喘中的功能障碍 | NA | 过敏性鼻炎, 慢性鼻窦炎, 哮喘 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-09 |
Benchmarking single-cell RNA-sequencing protocols for cell atlas projects
2020-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0469-4
PMID:32518403
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研究论文 | 本研究通过多中心研究比较了13种常用的单细胞RNA测序和单核RNA测序协议，评估了它们在全面描述细胞类型和状态方面的能力 | 首次系统性地评估了不同单细胞RNA测序协议在构建细胞图谱项目中的性能差异 | 研究仅限于13种常用协议，未涵盖所有可能的单细胞RNA测序技术 | 评估不同单细胞RNA测序协议在细胞图谱项目中的适用性和性能 | 13种常用的单细胞RNA测序和单核RNA测序协议 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了异质性参考样本资源 | NA | NA | NA | NA |