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当前共找到 142 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Differentiation of transplanted haematopoietic stem cells tracked by single-cell transcriptomic analysis
2020-06, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-0512-1
PMID:32367048
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术追踪移植后造血干细胞在受辐照宿主体内的早期分化行为 | 首次揭示移植后造血干细胞在宿主体内第一周内的动力学特征和命运选择，突破了以往技术限制 | 研究仅关注移植后第一周内的短期变化，未涉及长期追踪 | 探究移植后造血干细胞在预处置宿主体内的早期行为模式 | 造血干细胞及其分化产物 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 28种造血细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal somitogenesis in gastruloids
2020-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2024-3
PMID:32076263
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组技术揭示了类原肠胚中体节发生的机制 | 首次在类原肠胚中识别出多种未知的胚胎细胞类型，并证明体节发生关键调控因子的表达模式与胚胎相似 | 仅使用小鼠模型进行研究，未在其他物种中验证 | 探索类原肠胚作为胚胎发育模型的可行性和体节发生机制 | 小鼠类原肠胚和小鼠胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 活体成像 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 影像数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Data generation and network reconstruction strategies for single cell transcriptomic profiles of CRISPR-mediated gene perturbations
2020-06, Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms
DOI:10.1016/j.bbagrm.2019.194441
PMID:31756390
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综述 | 讨论单细胞RNA测序与CRISPR/Cas9技术结合进行大规模基因扰动研究的数据生成和网络重建策略 | 系统分析单细胞CRISPR扰动数据特有的技术挑战，并介绍网络重建新方法如嵌套效应模型 | 主要关注方法学讨论，缺乏实际数据验证 | 开发单细胞转录组基因扰动数据的生成和分析方法，以重建细胞网络模型 | 单细胞转录组CRISPR扰动数据 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9 | 共表达网络, 贝叶斯网络, 嵌套效应模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA-Seq Mapping of Human Thymopoiesis Reveals Lineage Specification Trajectories and a Commitment Spectrum in T Cell Development
2020-06-16, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.05.010
PMID:32553173
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序绘制人类胸腺生成图谱，揭示T细胞发育过程中的谱系特化轨迹和承诺谱系 | 首次在人类出生后胸腺中发现CD34祖细胞包含从多谱系启动到逐渐T细胞承诺的连续状态谱系，识别了胸腺内浆细胞样树突细胞特化途径 | 仅分析了人类出生后胸腺样本，未涵盖胚胎发育阶段或其他物种的比较研究 | 解析人类T细胞发育过程中的谱系特化和承诺机制 | 人类出生后胸腺中的CD34祖细胞和分化细胞群体 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 人类出生后胸腺中的稀有CD34祖细胞和分化CD34细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2024-12-01 |
Lineage dynamics of the endosymbiotic cell type in the soft coral Xenia
2020-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2385-7
PMID:32555454
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研究论文 | 研究了软珊瑚Xenia中内共生细胞类型的谱系动态 | 首次报道了Xenia物种的染色体水平基因组组装，并通过单细胞RNA测序揭示了内共生细胞类型的动态谱系进展 | NA | 探讨珊瑚与藻类内共生的分子途径 | 软珊瑚Xenia中的内共生细胞类型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 16个细胞集群 | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-09-06 |
Approaches for integrating heterogeneous RNA-seq data reveal cross-talk between microbes and genes in asthmatic patients
2020-06-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02033-z
PMID:32571363
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研究论文 | 研究开发了一种集成降维和统计建模的流程，用于解析哮喘患者痰液样本中复杂的RNA-seq数据，揭示微生物与基因之间的相互作用 | 提出了LDA-link方法，通过降维的LDA主题将微生物与基因连接起来，并验证了该方法的有效性 | NA | 研究哮喘患者痰液样本中微生物与基因之间的相互作用 | 哮喘患者的痰液样本 | 生物信息学 | 哮喘 | RNA-seq | LDA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-09 |
Contribution of Immune Cells to Glucocorticoid Receptor Expression in Breast Cancer
2020-Jun-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21134635
PMID:32629782
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研究论文 | 研究免疫细胞在乳腺癌中对糖皮质激素受体表达的贡献及其对预后的影响 | 首次探讨了肿瘤微环境中免疫细胞对糖皮质激素受体表达的贡献，并分析了其对乳腺癌预后的影响 | 研究依赖于现有数据库和公开的单细胞测序数据，可能存在样本选择偏倚 | 探讨免疫细胞在乳腺癌中对糖皮质激素受体表达的贡献及其对预后的影响 | 乳腺癌患者的免疫细胞和糖皮质激素受体表达 | NA | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | mRNA表达数据 | 使用了来自METABRIC和TCGA的数据，以及GSE75688和GSE114725的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of human embryos reveals diverse patterns of aneuploidy and mosaicism
2020-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.262774.120
PMID:32641298
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研究论文 | 本研究通过单细胞基因组数据分析人类胚胎中的非整倍体和镶嵌体的多样性模式 | 首次利用单细胞RNA测序数据对人类胚胎中的镶嵌非整倍体进行广泛量化分析 | 研究依赖于已发表的单细胞RNA测序数据，可能无法全面代表所有胚胎情况 | 量化人类胚胎中的非整倍体和镶嵌体现象 | 74个人类胚胎，从囊胚阶段到晚期筛选的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 74个人类胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-05 |
Machine Learning of Single-Cell Transcriptome Highly Identifies mRNA Signature by Comparing F-Score Selection with DGE Analysis
2020-Jun-05, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2020.02.004
PMID:32169803
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为EmPredictor的预测器，以识别人体植入前胚胎发育阶段 | 提出了使用F-score算法与差异基因表达分析相比较，以识别发育阶段特定标记的创新方法 | 需高实验成本和较长的实验周期 | 开发计算方法以识别发育标记的有效基因 | 人类植入前胚胎发育的关键基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 支持向量机(SVM) | 基因表达数据 | 1,881个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis of allergen-specific T cells in allergy and asthma
2020-06-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aba6087
PMID:32532832
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研究论文 | 该文章分析了在过敏和哮喘中对常见过敏原反应的CD4 T细胞和调节性T细胞的单细胞转录组。 | 首次实现了对特定过敏原反应的T细胞进行直接、无偏见的分子分析，揭示了这些细胞群体的多样性和功能差异。 | 样本主要集中于尘螨过敏的哮喘病人，可能无法完全代表所有类型的过敏反应。 | 更好地理解过敏和哮喘患者中这些T细胞亚群的多样性。 | 对约50,000个对尘螨过敏原反应的T细胞和调节性T细胞进行分析。 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 约50,000个T细胞和调节性T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-05 |
Site-1 protease ablation in the osterix-lineage in mice results in bone marrow neutrophilia and hematopoietic stem cell alterations
2020-06-23, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.052993
PMID:32576566
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研究论文 | 这篇文章探讨了小鼠中osterix谱系中Site-1蛋白酶的缺失对骨髓中中性粒细胞及造血干细胞的影响 | 本研究初步揭示了Site-1蛋白酶在维持骨髓造血微环境平衡中的重要作用 | 研究主要在小鼠模型中进行，结果能否推广到人类需进一步验证 | 研究Site-1蛋白酶缺失对骨髓细胞组成及造血干细胞功能的影响 | 小鼠，尤其是osterix谱系中Site-1蛋白酶缺失的小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和蛋白质质谱 | NA | NA | 涉及多种骨髓来源的细胞，具体样本量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-05 |
Interpretable factor models of single-cell RNA-seq via variational autoencoders
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa169
PMID:32176273
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研究论文 | 本文提出了一种基于变分自编码器的可解释单细胞RNA-seq因子模型 | 提出了一种修改过的变分自编码器框架，为大规模数据集中的基因程序识别提供可解释性 | 由于论文中未详细描述具体的限制，故此处为NA | 探索单细胞RNA-seq中基因表达变异和细胞类型依赖的统计推断方法 | 通过对大规模数据集的分析，识别基因程序 | 数字病理学 | NA | 变分自编码器 | 因子模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
Discovery of CD80 and CD86 as recent activation markers on regulatory T cells by protein-RNA single-cell analysis
2020-06-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-020-00756-z
PMID:32580776
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研究论文 | 本研究通过多组学方法，同时定量单细胞中的mRNA和蛋白质表达，以解析人类免疫细胞群体的异质性 | 首次使用多组学方法在单细胞水平上同时检测mRNA和蛋白质表达，并发现了CD80和CD86作为调节性T细胞的近期激活标志 | NA | 研究旨在通过多组学方法解析人类免疫细胞群体的异质性 | 人类初级CD4+ T细胞及其分化轨迹 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和抗体偶联的寡核苷酸（AbSeq） | NA | mRNA和蛋白质 | 43,656个初级CD4+ T细胞和31,907个CD45+细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
A single-cell transcriptomic and anatomic atlas of mouse dorsal raphe Pet1 neurons
2020-06-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.55523
PMID:32568072
|
研究论文 | 本文通过高吞吐量和针对背侧中缝核（DR）亚域的单细胞转录组学以及交叉遗传工具，绘制了DR-Pet1神经元的分子和解剖多样性图谱 | 本文描述了多达十四种神经元亚型，其中许多显示出偏向于DR的细胞体分布，并展示了DR神经元的独特传出投射和电生理特性 | NA | 旨在通过分子异质性的表征及其与解剖结构的关联，理解背侧中缝核的功能组织，并为治疗情感障碍提供潜在的疗法信息 | 小鼠背侧中缝核中的Pet1神经元 | 数字病理学 | 情感障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确 | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
Deconvolution of bulk blood eQTL effects into immune cell subpopulations
2020-Jun-12, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-03576-5
PMID:32532224
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Decon2的新方法，用于从批量血液样本中估计细胞比例并解卷积细胞类型eQTL效应 | Decon2方法能够从批量血液eQTL中检测细胞类型交互效应，为确定特定复杂疾病最相关的细胞类型提供了有效手段 | NA | 开发一种新方法来解释疾病相关遗传风险因素的功能，并揭示eQTL调控效应的细胞类型背景 | 批量血液样本中的细胞类型eQTL效应 | 遗传学 | NA | eQTL分析 | Decon2 | 表达谱 | 3194个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-07 |
Dermal Adipocyte Lipolysis and Myofibroblast Conversion Are Required for Efficient Skin Repair
2020-06-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.03.013
PMID:32302523
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研究论文 | 本文探讨了皮肤中的脂肪细胞在损伤后炎症反应和修复过程中的关键作用 | 首次揭示了皮肤脂肪细胞通过脂解作用调节炎症和修复的机制，并发现脂肪细胞能转变为产生细胞外基质的肌成纤维细胞 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 研究脂肪细胞在皮肤组织稳态和修复中的作用 | 皮肤中的脂肪细胞及其在损伤后的功能 | NA | NA | 遗传学实验、组织学、超微结构分析、脂质组学、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-07 |
An atlas for hemocytes in an insect
2020-06-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.59113
PMID:32602836
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了果蝇幼虫中不同亚型的血细胞 | 利用单细胞RNA测序技术首次详细描述了果蝇幼虫血细胞的亚型 | NA | 探索果蝇幼虫血细胞的亚型及其特性 | 果蝇幼虫的血细胞 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
Temporal specificity and heterogeneity of Drosophila immune cells
2020-06-17, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020104486
PMID:32162708
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research paper | 本文通过批量RNA测序和单细胞RNA测序研究了果蝇免疫细胞（血细胞）在胚胎和幼虫阶段的异质性及其在不同生理过程中的作用 | 首次构建了果蝇血细胞的分子图谱，并发现了在黄蜂侵扰下血细胞群中出现的新型血细胞类型——片状细胞 | NA | 研究果蝇免疫细胞的异质性及其在不同生理过程中的作用 | 果蝇免疫细胞（血细胞）在胚胎和幼虫阶段的异质性及其在不同生理过程中的作用 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 涉及十四种血细胞群 | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
Cell Atlas of The Human Fovea and Peripheral Retina
2020-06-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-66092-9
PMID:32555229
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了来自人类成人供体的85,000个细胞的转录组，以深入了解视网膜疾病的病因 | 首次构建了人类中央凹和周边视网膜的细胞图谱，并比较了人类与猕猴的细胞类型表达模式 | NA | 深入理解导致失明的视网膜疾病的病因 | 人类中央凹和周边视网膜的细胞 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 85,000个细胞，来自7名成年人类供体 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
A Multiplexed Barcodelet Single-Cell RNA-Seq Approach Elucidates Combinatorial Signaling Pathways that Drive ESC Differentiation
2020-06-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.04.020
PMID:32459995
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研究论文 | 本文介绍了一种名为barRNA-seq的单细胞RNA测序方法，通过使用RNA“条形码”标记单个细胞，系统地探索细胞扰动，并应用于同时操纵多达七种发育途径，研究其对胚胎干细胞（ESC）胚层分化和中胚层分化的影响。 | barRNA-seq方法的创新之处在于能够同时操纵多个发育途径，并通过RNA条形码标记细胞，从而系统地探索细胞扰动。 | NA | 研究目的是阐明驱动胚胎干细胞分化的组合信号通路，并开发一种数据驱动的框架来识别驱动细胞向特定命运的组合信号扰动。 | 研究对象包括胚胎干细胞（ESC）的胚层分化和中胚层分化，以及通过组合信号通路激活对基因表达的影响。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 涉及多达七个发育途径的细胞样本 | NA | NA | NA | NA |