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当前共找到 142 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis of allergen-specific T cells in allergy and asthma
2020-06-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aba6087
PMID:32532832
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研究论文 | 该文章分析了在过敏和哮喘中对常见过敏原反应的CD4 T细胞和调节性T细胞的单细胞转录组。 | 首次实现了对特定过敏原反应的T细胞进行直接、无偏见的分子分析，揭示了这些细胞群体的多样性和功能差异。 | 样本主要集中于尘螨过敏的哮喘病人，可能无法完全代表所有类型的过敏反应。 | 更好地理解过敏和哮喘患者中这些T细胞亚群的多样性。 | 对约50,000个对尘螨过敏原反应的T细胞和调节性T细胞进行分析。 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 约50,000个T细胞和调节性T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2024-08-05 |
Site-1 protease ablation in the osterix-lineage in mice results in bone marrow neutrophilia and hematopoietic stem cell alterations
2020-06-23, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.052993
PMID:32576566
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研究论文 | 这篇文章探讨了小鼠中osterix谱系中Site-1蛋白酶的缺失对骨髓中中性粒细胞及造血干细胞的影响 | 本研究初步揭示了Site-1蛋白酶在维持骨髓造血微环境平衡中的重要作用 | 研究主要在小鼠模型中进行，结果能否推广到人类需进一步验证 | 研究Site-1蛋白酶缺失对骨髓细胞组成及造血干细胞功能的影响 | 小鼠，尤其是osterix谱系中Site-1蛋白酶缺失的小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和蛋白质质谱 | NA | NA | 涉及多种骨髓来源的细胞，具体样本量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-08-05 |
Interpretable factor models of single-cell RNA-seq via variational autoencoders
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa169
PMID:32176273
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研究论文 | 本文提出了一种基于变分自编码器的可解释单细胞RNA-seq因子模型 | 提出了一种修改过的变分自编码器框架，为大规模数据集中的基因程序识别提供可解释性 | 由于论文中未详细描述具体的限制，故此处为NA | 探索单细胞RNA-seq中基因表达变异和细胞类型依赖的统计推断方法 | 通过对大规模数据集的分析，识别基因程序 | 数字病理学 | NA | 变分自编码器 | 因子模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-08-07 |
Discovery of CD80 and CD86 as recent activation markers on regulatory T cells by protein-RNA single-cell analysis
2020-06-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-020-00756-z
PMID:32580776
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研究论文 | 本研究通过多组学方法，同时定量单细胞中的mRNA和蛋白质表达，以解析人类免疫细胞群体的异质性 | 首次使用多组学方法在单细胞水平上同时检测mRNA和蛋白质表达，并发现了CD80和CD86作为调节性T细胞的近期激活标志 | NA | 研究旨在通过多组学方法解析人类免疫细胞群体的异质性 | 人类初级CD4+ T细胞及其分化轨迹 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和抗体偶联的寡核苷酸（AbSeq） | NA | mRNA和蛋白质 | 43,656个初级CD4+ T细胞和31,907个CD45+细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-08-07 |
A single-cell transcriptomic and anatomic atlas of mouse dorsal raphe Pet1 neurons
2020-06-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.55523
PMID:32568072
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研究论文 | 本文通过高吞吐量和针对背侧中缝核（DR）亚域的单细胞转录组学以及交叉遗传工具，绘制了DR-Pet1神经元的分子和解剖多样性图谱 | 本文描述了多达十四种神经元亚型，其中许多显示出偏向于DR的细胞体分布，并展示了DR神经元的独特传出投射和电生理特性 | NA | 旨在通过分子异质性的表征及其与解剖结构的关联，理解背侧中缝核的功能组织，并为治疗情感障碍提供潜在的疗法信息 | 小鼠背侧中缝核中的Pet1神经元 | 数字病理学 | 情感障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确 | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-08-07 |
Deconvolution of bulk blood eQTL effects into immune cell subpopulations
2020-Jun-12, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-03576-5
PMID:32532224
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Decon2的新方法，用于从批量血液样本中估计细胞比例并解卷积细胞类型eQTL效应 | Decon2方法能够从批量血液eQTL中检测细胞类型交互效应，为确定特定复杂疾病最相关的细胞类型提供了有效手段 | NA | 开发一种新方法来解释疾病相关遗传风险因素的功能，并揭示eQTL调控效应的细胞类型背景 | 批量血液样本中的细胞类型eQTL效应 | 遗传学 | NA | eQTL分析 | Decon2 | 表达谱 | 3194个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-07 |
Dermal Adipocyte Lipolysis and Myofibroblast Conversion Are Required for Efficient Skin Repair
2020-06-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.03.013
PMID:32302523
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研究论文 | 本文探讨了皮肤中的脂肪细胞在损伤后炎症反应和修复过程中的关键作用 | 首次揭示了皮肤脂肪细胞通过脂解作用调节炎症和修复的机制，并发现脂肪细胞能转变为产生细胞外基质的肌成纤维细胞 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 研究脂肪细胞在皮肤组织稳态和修复中的作用 | 皮肤中的脂肪细胞及其在损伤后的功能 | NA | NA | 遗传学实验、组织学、超微结构分析、脂质组学、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-07 |
An atlas for hemocytes in an insect
2020-06-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.59113
PMID:32602836
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了果蝇幼虫中不同亚型的血细胞 | 利用单细胞RNA测序技术首次详细描述了果蝇幼虫血细胞的亚型 | NA | 探索果蝇幼虫血细胞的亚型及其特性 | 果蝇幼虫的血细胞 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-07 |
Temporal specificity and heterogeneity of Drosophila immune cells
2020-06-17, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020104486
PMID:32162708
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research paper | 本文通过批量RNA测序和单细胞RNA测序研究了果蝇免疫细胞（血细胞）在胚胎和幼虫阶段的异质性及其在不同生理过程中的作用 | 首次构建了果蝇血细胞的分子图谱，并发现了在黄蜂侵扰下血细胞群中出现的新型血细胞类型——片状细胞 | NA | 研究果蝇免疫细胞的异质性及其在不同生理过程中的作用 | 果蝇免疫细胞（血细胞）在胚胎和幼虫阶段的异质性及其在不同生理过程中的作用 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 涉及十四种血细胞群 | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-07 |
Cell Atlas of The Human Fovea and Peripheral Retina
2020-06-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-66092-9
PMID:32555229
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了来自人类成人供体的85,000个细胞的转录组，以深入了解视网膜疾病的病因 | 首次构建了人类中央凹和周边视网膜的细胞图谱，并比较了人类与猕猴的细胞类型表达模式 | NA | 深入理解导致失明的视网膜疾病的病因 | 人类中央凹和周边视网膜的细胞 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 85,000个细胞，来自7名成年人类供体 | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-07 |
A Multiplexed Barcodelet Single-Cell RNA-Seq Approach Elucidates Combinatorial Signaling Pathways that Drive ESC Differentiation
2020-06-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.04.020
PMID:32459995
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研究论文 | 本文介绍了一种名为barRNA-seq的单细胞RNA测序方法，通过使用RNA“条形码”标记单个细胞，系统地探索细胞扰动，并应用于同时操纵多达七种发育途径，研究其对胚胎干细胞（ESC）胚层分化和中胚层分化的影响。 | barRNA-seq方法的创新之处在于能够同时操纵多个发育途径，并通过RNA条形码标记细胞，从而系统地探索细胞扰动。 | NA | 研究目的是阐明驱动胚胎干细胞分化的组合信号通路，并开发一种数据驱动的框架来识别驱动细胞向特定命运的组合信号扰动。 | 研究对象包括胚胎干细胞（ESC）的胚层分化和中胚层分化，以及通过组合信号通路激活对基因表达的影响。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 涉及多达七个发育途径的细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
Unravelling the heterogeneity and dynamic relationships of tumor-infiltrating T cells by single-cell RNA sequencing analysis
2020-06, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.6MR0320-234R
PMID:32272497
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review | 本文综述了单细胞RNA测序技术在解析肿瘤浸润T细胞异质性和动态关系方面的最新进展 | 结合深度转录组信息与T细胞受体（TCR）基的谱系追踪，深入理解肿瘤内T细胞群体 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何揭示肿瘤浸润T细胞的异质性及功能意义 | 肿瘤浸润T细胞的异质性、克隆扩增、迁移及效应功能 | digital pathology | NA | single-cell RNA sequencing | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
Tissue-resident macrophages promote extracellular matrix homeostasis in the mammary gland stroma of nulliparous mice
2020-06-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.57438
PMID:32479261
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研究论文 | 本文研究了组织驻留巨噬细胞在未产雌鼠乳腺基质中促进细胞外基质稳态的作用 | 通过转录组分析和单细胞RNA测序，发现了在未产雌鼠乳腺中存在一种表达Lyve-1的特殊基质巨噬细胞亚群，该亚群与细胞外基质（ECM）重塑相关 | NA | 探讨巨噬细胞在未产雌鼠乳腺基质中的作用及其对细胞外基质稳态的影响 | 未产雌鼠乳腺中的组织驻留巨噬细胞及其在基质中的功能 | NA | NA | 转录组分析，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 未产雌鼠乳腺组织中的巨噬细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
Applications of single-cell sequencing for the field of otolaryngology: A contemporary review
2020-Jun, Laryngoscope investigative otolaryngology
IF:1.6Q2
DOI:10.1002/lio2.388
PMID:32596483
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-Seq）技术在耳鼻喉科学领域的应用 | scRNA-Seq技术能够揭示患者组织中的异质性和罕见细胞类型，有助于疾病发病机制的理解和新疾病生物标志物或药物靶点的发现 | scRNA-Seq技术在临床应用中存在一定的局限性 | 旨在激发scRNA-Seq在耳鼻喉科学中的应用，并通过实例展示其在临床医学中的应用潜力 | 主要研究对象包括小鼠听觉系统（包括内耳的毛细胞和支持细胞、螺旋神经节神经元和内耳类器官）以及人类初级细胞样本 | 数字病理学 | 耳鼻喉疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA数据 | 涉及小鼠听觉系统及人类初级细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
Molecular atlas of the adult mouse brain
2020-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abb3446
PMID:32637622
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research paper | 本文通过全脑空间转录组学技术，对成年小鼠大脑进行了系统的分子分类，揭示了大脑的复杂神经解剖结构。 | 本文通过无偏倚的空间定义特征识别，发现分子信息足以推导出大脑的复杂和详细的神经解剖组织结构，并揭示了新的区域和层次特异性亚区域。 | NA | 旨在基于空间定义特征的无偏倚识别，生成成年小鼠大脑的系统分类。 | 成年小鼠大脑的神经解剖结构和分子组织。 | digital pathology | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠大脑 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-07 |
Random Parametric Perturbations of Gene Regulatory Circuit Uncover State Transitions in Cell Cycle
2020-Jun-26, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101150
PMID:32450514
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研究论文 | 本文使用芽殖酵母细胞周期作为模型系统，研究基因调控电路如何编码细胞状态转换的关键信息 | 提出了一种通用的随机电路扰动方法，用于包含异质调控类型的电路，并分析了从随机动力学参数的电路模型集合中得到的稳态和振荡状态 | NA | 探索基因调控电路如何编码细胞状态转换的关键信息 | 芽殖酵母细胞周期 | 生物信息学 | NA | 随机电路扰动方法 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-07 |
CB2 improves power of cell detection in droplet-based single-cell RNA sequencing data
2020-06-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02054-8
PMID:32513247
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研究论文 | 本文介绍了一种基于聚类的方法CB2，用于区分单细胞RNA测序数据中的真实细胞与背景条码 | CB2利用了数据集中存在的强细胞间相关性，相较于现有方法，能更有效地识别真实细胞 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞检测的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的真实细胞与背景条码 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类方法 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
Systematic assessment of tissue dissociation and storage biases in single-cell and single-nucleus RNA-seq workflows
2020-06-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02048-6
PMID:32487174
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研究论文 | 本文系统比较了单细胞和单核RNA测序工作流程中组织解离和存储方法的相对偏差和优势 | 首次系统比较了不同组织解离和存储方法对单细胞和单核RNA测序结果的影响 | 研究仅限于成年小鼠肾脏组织，可能不适用于其他组织类型 | 旨在揭示不同组织解离和存储方法对单细胞和单核RNA测序结果的影响 | 成年小鼠肾脏组织的单细胞和单核RNA测序 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成年小鼠肾脏组织 | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
SingleCellSignalR: inference of intercellular networks from single-cell transcriptomics
2020-06-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa183
PMID:32196115
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研究论文 | 本文介绍了一种新的单细胞转录组数据分析工具SingleCellSignalR，用于推断细胞间的配体-受体相互作用网络 | 引入了一个新的、经过精心整理的配体-受体数据库和一个新颖的正则化评分方法，用于评估预测的配体-受体相互作用的置信度 | NA | 开发一种新的工具，用于从单细胞转录组数据中推断细胞间的相互作用网络 | 单细胞转录组数据中的配体-受体相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
Quantitative single-cell interactomes in normal and virus-infected mouse lungs
2020-06-26, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.044404
PMID:32461220
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研究论文 | 本文介绍了一种定量直观算法和优化实验方案，用于构建和比较正常与感染Sendai病毒的小鼠肺部细胞间的相互作用网络。 | 提出了一种新的定量直观算法，结合优化的实验协议，使不具有高级编程技能的实验室科学家也能适应。 | 算法和方法的通用性需要在其他器官和人类样本中进一步验证。 | 解析哺乳动物器官中通过配体-受体相互作用进行的细胞间信号传递，特别是在病毒感染情况下的变化。 | 正常和感染Sendai病毒的小鼠肺部细胞。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 定量直观算法 | RNA序列数据 | 每种细胞类型至少90个细胞 | NA | NA | NA | NA |