单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 142 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-12 |
Cigarette Smoke Exposure and Inflammatory Signaling Increase the Expression of the SARS-CoV-2 Receptor ACE2 in the Respiratory Tract
2020-06-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.05.012
PMID:32425701
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研究论文 | 本研究揭示香烟暴露通过上调ACE2表达增加SARS-CoV-2感染风险，并发现ACE2是干扰素刺激基因 | 首次从单细胞水平阐明香烟暴露通过扩增分泌细胞群上调ACE2的机制，并证实ACE2作为干扰素刺激基因可能形成正反馈循环促进病毒传播 | 未明确说明 | 探究香烟暴露对SARS-CoV-2受体ACE2在呼吸道表达的影响及调控机制 | 啮齿动物和人类呼吸道组织样本 | 机器学习和数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 涉及啮齿动物和人类样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台 |
| 2 | 2026-04-27 |
Single-Cell Transcriptomics of Human Lymph Node Stroma
2020-06-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100021
PMID:33111075
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研究论文 | 提供用于表征人类淋巴结基质细胞异质性的单细胞RNA测序的细胞制备方案 | 利用单细胞技术无偏倚地全面表征基质细胞异质性 | 未提供与Takeda等人(2019)研究相关的完整实验操作细节 | 为研究人类淋巴结基质细胞的单细胞转录组提供标准化实验方案 | 人类淋巴结基质细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 3 | 2026-04-27 |
Protocol to Prepare Single-Cell Suspensions from Mouse Vagal Sensory Ganglia for Transcriptomic Studies
2020-06-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100030
PMID:33111081
|
protocol | 提供了一个从小鼠迷走感觉神经节制备单细胞悬浮液的详细方案，用于转录组研究 | 提供了从迷走神经节提取高质量单细胞悬浮液的标准化方案，可适用于其他外周和中枢神经元群体 | 文中未明确说明局限性 | 提供从小鼠迷走感觉神经节制备单细胞悬浮液用于转录组研究的详细方案 | 小鼠迷走感觉神经节 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞悬浮液 | 小鼠迷走感觉神经节样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-04-27 |
Protocol for Dissection and Dissociation of Zebrafish Telencephalon for Single-Cell Sequencing
2020-06-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100042
PMID:32835293
|
protocol | 展示如何解剖斑马鱼端脑并将其解离为单细胞悬浮液，随后通过流式细胞术分选富集神经祖干细胞 | 提供了一种详细的斑马鱼端脑解剖和解离方案，专门用于单细胞测序，能够从单个斑马鱼端脑中获取约70,000个活细胞 | 仅针对斑马鱼端脑组织，可能不适用于其他组织或物种；依赖流式细胞术分选，设备成本较高 | 提供一种从斑马鱼端脑制备高质量单细胞悬浮液的标准化实验方案 | 斑马鱼端脑及其中的神经祖干细胞 | machine learning | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 每个斑马鱼端脑样本约70,000个活细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-04-18 |
BREM-SC: a bayesian random effects mixture model for joint clustering single cell multi-omics data
2020-06-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa314
PMID:32379315
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为BREM-SC的贝叶斯随机效应混合模型，用于联合聚类单细胞转录组和蛋白质组数据 | 提出了一种新的统计方法，能够同时利用转录组和蛋白质组数据进行细胞聚类，并量化每个单细胞的聚类不确定性 | NA | 开发用于分析多模态CITE-Seq数据的统计方法和计算工具 | 单细胞转录组和蛋白质组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq），CITE-seq | 贝叶斯随机效应混合模型 | 转录组和蛋白质组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，单细胞多组学 | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium系统 |
| 6 | 2026-03-29 |
Simple Method to Quantify Protein Abundances from 1000 Cells
2020-Jun-30, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.0c01191
PMID:32637829
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研究论文 | 本文介绍了一种从1000个哺乳动物干细胞中量化蛋白质表达水平的简化蛋白质组学工作流程 | 整合并优化了多项近期技术进展，实现了从极少量细胞（低至1000个）中进行蛋白质定量，无需特殊设备，仅需细胞裂解工具 | 方法虽已验证于小鼠胚胎干细胞和体外分化运动神经元，但在其他细胞类型或更复杂组织中的适用性可能有限 | 开发一种从最小输入样本中获取蛋白质组学数据的简单准确方法 | 小鼠胚胎干细胞、体外分化运动神经元以及荧光激活细胞分选纯化的海鞘细胞 | 蛋白质组学 | NA | 化学肽标记 | NA | 蛋白质表达数据 | 低至1000个哺乳动物干细胞 | NA | 蛋白质组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-03-25 |
Selective Induction of Human Autonomic Neurons Enables Precise Control of Cardiomyocyte Beating
2020-06-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-66303-3
PMID:32528170
|
研究论文 | 本研究开发了一种逐步化学诱导方法，从人类多能干细胞中诱导出交感样和副交感样自主神经元，并展示了它们对心肌细胞搏动速率的拮抗性调控 | 首次有效从人类多能干细胞中诱导出胆碱能副交感神经元，并建立了选择性诱导交感样和副交感样神经元的方法，实现了对心肌细胞搏动的精确控制 | 研究主要基于体外诱导和共培养实验，尚未在体内模型中验证神经元的功能和长期效应 | 开发从人类多能干细胞中诱导自主神经系统神经元的方法，以研究其对靶器官（如心肌细胞）的调控 | 人类多能干细胞诱导的自主神经元和人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 | 干细胞生物学与神经科学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、药理学和电生理学功能分析 | NA | RNA表达数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-03-25 |
CD39 Produced from Human GMSCs Regulates the Balance of Osteoclasts and Osteoblasts through the Wnt/β-Catenin Pathway in Osteoporosis
2020-06-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2020.04.003
PMID:32304668
|
研究论文 | 本研究探讨了人牙龈来源间充质干细胞（GMSCs）通过CD39和Wnt/β-catenin通路调节骨质疏松中破骨细胞和成骨细胞平衡的作用 | 首次发现CD39+ GMSC亚群在促进骨形成中的关键作用，并揭示其通过Wnt/β-catenin通路发挥成骨能力的机制 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证，且具体临床应用潜力需进一步探索 | 探究GMSCs在骨质疏松中调节骨形成和保护的潜力 | 人牙龈来源间充质干细胞（GMSCs）和卵巢切除小鼠模型 | NA | 骨质疏松 | RNA测序（RNA-seq），单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-03-04 |
V-SVA: an R Shiny application for detecting and annotating hidden sources of variation in single-cell RNA-seq data
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa128
PMID:32119082
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为V-SVA的R Shiny应用，用于检测和注释单细胞RNA测序数据中的隐藏变异源 | 开发了一个交互式网络浏览器界面，结合了基因关联发现、公开数据库注释和数据可视化工具，以辅助解释单细胞RNA测序中的变异源 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 促进单细胞RNA测序数据中隐藏变异源的识别和注释，以区分技术变异和生物变异 | 单细胞RNA测序数据及其中的变异源 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | IA-SVA, SVA, ZINB-WaVE | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
scClassify: sample size estimation and multiscale classification of cells using single and multiple reference
2020-06, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20199389
PMID:32567229
|
研究论文 | 开发了一个基于集成学习和细胞类型层次结构的多尺度分类框架scClassify，用于单细胞RNA测序数据的自动细胞类型识别 | 提出了样本量估计方法和多参考数据集联合分类能力，在114对参考和测试数据上表现优于其他监督分类方法 | NA | 开发单细胞RNA测序数据的自动细胞类型识别方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习，多尺度分类框架 | 单细胞RNA测序数据 | 114对参考和测试数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
The liver as an immunological barrier redefined by single-cell analysis
2020-06, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13193
PMID:32176810
|
综述 | 通过单细胞分析技术重新定义肝脏作为免疫屏障的功能 | 应用单细胞RNA测序技术揭示肝脏免疫细胞网络的特殊适应性 | NA | 总结单细胞技术如何推进对肝脏免疫屏障功能的理解 | 小鼠和人类肝脏中的免疫细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
An efficient single-cell transcriptomics workflow for microbial eukaryotes benchmarked on Giardia intestinalis cells
2020-Jun-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-06858-7
PMID:32600266
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研究论文 | 本研究开发了一种用于微生物真核生物的高效单细胞转录组工作流程，并以贾第鞭毛虫细胞为基准进行测试 | 对Smart-seq2协议进行多种修改，建立了适用于原生生物的稳健且更具成本效益的工作流程，发现添加冻融循环可提高转录本回收率 | 减少反应体积导致检测到的基因显著减少，大多数修改未显著改变基因检测效果 | 建立适用于微生物真核生物的高效单细胞转录组测序工作流程 | 贾第鞭毛虫细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序，Smart-seq2协议 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq2 | 修改后的Smart-seq2单细胞RNA测序协议 |
| 13 | 2025-10-06 |
Rate of replenishment and microenvironment contribute to the sexually dimorphic phenotype and function of peritoneal macrophages
2020-06-19, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abc4466
PMID:32561560
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研究论文 | 本研究探讨性別和年龄对小鼠腹膜巨噬细胞分化、更新和功能的影响 | 发现腹膜巨噬细胞的性别二态性表型由骨髓补充速率和局部微环境共同驱动 | 研究仅限于小鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 理解腹膜巨噬细胞行为调控因素及其在疾病易感性中的作用 | 小鼠腹膜巨噬细胞 | 免疫学 | 腹膜炎 | 命运示踪技术、群体RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Synthetic Lethal and Resistance Interactions with BET Bromodomain Inhibitors in Triple-Negative Breast Cancer
2020-06-18, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2020.04.027
PMID:32416067
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研究论文 | 通过CRISPR和小分子抑制剂筛选结合分子谱分析，揭示三阴性乳腺癌中BET溴结构域抑制剂的合成致死与耐药机制 | 首次系统鉴定BBDIs的合成致死相互作用和耐药基因，发现BRD2与BRD7功能差异及TEAD-YAP染色质结合在耐药中的作用 | 研究主要基于细胞系模型，尚未进行临床验证 | 探索三阴性乳腺癌中BET溴结构域抑制剂的耐药机制和联合治疗策略 | 三阴性乳腺癌细胞系 | 癌症生物学 | 三阴性乳腺癌 | CRISPR筛选, 小分子抑制剂筛选, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 细胞条形码分析 | NA | 基因组数据, 表观基因组数据, 转录组数据 | 敏感和耐药细胞系样本 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Thermogenic adipocytes: lineage, function and therapeutic potential
2020-06-12, The Biochemical journal
DOI:10.1042/BCJ20200298
PMID:32539124
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综述 | 本文综述了产热脂肪细胞的谱系、功能及其治疗潜力 | 整合单细胞RNA测序与谱系追踪技术识别新型脂肪细胞祖细胞，揭示具有治疗潜能的特化脂肪细胞 | 基于初步研究结果，部分发现仍需进一步验证 | 探讨脂肪细胞在能量稳态中的功能及治疗应用前景 | 小鼠和人类脂肪组织 | 单细胞组学 | 代谢综合征 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 转录组学, 蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Targeted Perturb-seq enables genome-scale genetic screens in single cells
2020-06, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-0837-5
PMID:32483332
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研究论文 | 介绍了一种称为靶向Perturb-seq（TAP-seq）的新方法，用于提高单细胞遗传筛选的灵敏度和规模 | 开发了平台无关的靶向单细胞RNA测序方法，可将遗传筛选灵敏度提高数个数量级，测序需求降低高达50倍 | NA | 克服单细胞转录组学遗传筛选中的实验和统计限制 | 人类基因组增强子及其靶基因 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，CRISPR筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | 1,778个增强子，覆盖2.5%人类基因组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 靶向Perturb-seq（TAP-seq）方法 |
| 17 | 2025-10-06 |
Molecular design of hypothalamus development
2020-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2266-0
PMID:32499648
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术揭示了小鼠下丘脑发育的分子蓝图，鉴定出多种神经元和胶质细胞亚型及其调控网络 | 首次系统描绘下丘脑发育的分子架构，发现GABA和 dopamine神经元分化依赖准稳定中间状态，并揭示SLIT-ROBO信号在下丘脑神经元生成和定位中的新功能 | 研究仅基于小鼠模型，样本数量相对有限，且主要关注胚胎中期发育阶段 | 解析下丘脑发育过程中神经元和胶质细胞多样性的分子调控机制 | 小鼠下丘脑的神经元和胶质细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 基因调控网络分析, 全基因组关联研究, 遗传谱系重建 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据 | 51,199个小鼠外胚层来源细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
Souporcell: robust clustering of single-cell RNA-seq data by genotype without reference genotypes
2020-06, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-0820-1
PMID:32366989
|
研究论文 | 开发了一种名为souporcell的新方法，通过单细胞RNA测序数据中的基因型变异对细胞进行聚类分析 | 无需参考基因型即可通过scRNA-seq数据中的遗传变异对细胞进行稳健聚类，并能检测跨基因型双细胞和估计环境RNA | NA | 开发单细胞RNA测序数据的解卷积方法，用于混合基因型样本的分析 | 单细胞RNA测序数据 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
An in vitro model of early anteroposterior organization during human development
2020-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2383-9
PMID:32528178
|
研究论文 | 本研究利用人类胚胎干细胞开发了可模拟早期发育过程中前后轴组织的人类胃泌样体模型 | 首次使用人类胚胎干细胞创建三维胃泌样体，该模型可在无额外胚胎外组织的情况下形成具有时空组织性的三胚层衍生物 | 模型系统仍处于体外实验阶段，可能无法完全模拟体内真实发育环境 | 揭示和检验人类早期发育过程中轴向组织特有的调控过程 | 人类胚胎干细胞衍生的胃泌样体 | 发育生物学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
Notch signalling drives synovial fibroblast identity and arthritis pathology
2020-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2222-z
PMID:32499639
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研究论文 | 本研究揭示了NOTCH3信号在滑膜成纤维细胞分化和类风湿关节炎病理中的关键作用 | 首次发现NOTCH3信号通过从血管内皮细胞向外形成转录和空间梯度来调控滑膜成纤维细胞的位置身份 | NA | 探究滑膜成纤维细胞在类风湿关节炎中分化和扩张的分子机制 | 滑膜成纤维细胞、血管内皮细胞、小鼠关节炎模型 | 分子生物学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、滑膜组织类器官 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |