单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 94 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-09 |
Characterization of radioresistant epithelial stem cell heterogeneity in the damaged mouse intestine
2020-05-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-64987-1
PMID:32444673
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研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞qRT-PCR分析，揭示了在损伤小肠中Lgr5表达细胞衍生物中存在的放射抵抗性肠干细胞（ISCs）及其在肠上皮再生中的作用 | 首次发现Lgr5表达细胞衍生物中的放射抵抗性肠干细胞在损伤小肠上皮再生中的关键作用，并通过单细胞RNA测序揭示了CD81表达与ISC和增殖相关基因表达的相关性 | NA | 研究损伤小肠中放射抵抗性上皮干细胞的异质性及其在肠上皮再生中的作用 | 小鼠损伤小肠中的放射抵抗性上皮干细胞 | 数字病理学 | 胃肠道疾病 | 单细胞qRT-PCR分析，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA | NA |
| 42 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Tumor-Derived Fibroblasts and Normal Tissue-Resident Fibroblasts Reveals Fibroblast Heterogeneity in Breast Cancer
2020-May-21, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12051307
PMID:32455670
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了三阴性乳腺癌中的肿瘤相关成纤维细胞（CAFs）的异质性 | 首次详细描述了三阴性乳腺癌中CAFs的六个亚群，并发现这些亚群在不同肿瘤类型中普遍存在 | 研究仅限于使用BALB/c-derived 4T1乳腺肿瘤模型，可能需要进一步的人体组织验证 | 探究三阴性乳腺癌中肿瘤相关成纤维细胞的分子和表型异质性 | 三阴性乳腺癌中的肿瘤相关成纤维细胞及其亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及4T1肿瘤中的多个成纤维细胞亚群 |
| 43 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Cardiac Progenitor Differentiation
2020-05-19, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-020-01285-2
PMID:32430537
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综述 | 本文综述了利用单细胞转录组分析技术描绘胚胎心脏发育过程中心脏前体细胞（CP）分化的最新进展 | 首次详细描述了心脏前体细胞在时间和空间分辨率上的分化策略和转录调控，为识别心脏基因调控网络中的关键调节因子和信号分子提供了丰富的资源 | NA | 总结单细胞转录组分析在描绘胚胎心脏发育，特别是心脏前体细胞分化方面的最新进展 | 心脏前体细胞的分化过程及其分子调控机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从胚胎第6.5天到第9.5天的多个时间点样本 |
| 44 | 2024-08-09 |
Heterogenous Populations of Tissue-Resident CD8+ T Cells Are Generated in Response to Infection and Malignancy
2020-05-19, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.04.007
PMID:32433949
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和遗传报告小鼠研究，揭示了组织驻留记忆CD8 T细胞在感染和恶性肿瘤中的异质性。 | 首次详细描述了肠道抗原特异性CD8 T细胞的不同谱系，包括早期和晚期感染阶段的组织驻留效应细胞和记忆细胞，并探讨了它们在恶性组织中的存在。 | NA | 研究组织驻留记忆CD8 T细胞在感染和恶性肿瘤中的发展和功能异质性。 | 组织驻留记忆CD8 T细胞在感染和恶性肿瘤中的不同谱系和功能。 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 45 | 2024-08-09 |
Distinct Transcriptomic Cell Types and Neural Circuits of the Subiculum and Prosubiculum along the Dorsal-Ventral Axis
2020-05-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107648
PMID:32433957
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，识别了海马下托和前下托区域中的27种转录组细胞类型，并基于可靠的转录组标记物定义了这两个区域的精确边界，揭示了它们在分子和解剖结构上的不同神经回路。 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了海马下托和前下托区域的转录组细胞类型及其神经回路，为理解这两个区域在空间处理和认知功能中的作用提供了新的分子和解剖学基础。 | NA | 揭示海马下托和前下托区域的分子和解剖学特征，以及它们在空间处理和认知功能中的作用。 | 海马下托和前下托区域的转录组细胞类型及其神经回路。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 27种转录组细胞类型 |
| 46 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptomics identifies stem cell-derived graft composition in a model of Parkinson's disease
2020-05-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-16225-5
PMID:32415072
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）结合全面的组织学分析，研究了人胚胎干细胞（hESCs）和胎儿组织在功能成熟后，在帕金森病（PD）的临床前大鼠模型中的脑内移植组成。 | 本研究首次揭示了干细胞衍生的移植体中先前未知的细胞多样性，包括类似于最近鉴定的一类周围血管样细胞的细胞类型。 | NA | 研究细胞替代疗法在帕金森病治疗中的应用，特别是移植细胞的组成和特性。 | 人胚胎干细胞（hESCs）和胎儿组织的脑内移植组成及其在帕金森病模型中的功能成熟。 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 47 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells Treated with Gemcitabine and Carboplatin
2020-05-14, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes11050549
PMID:32422951
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了接受吉西他滨和卡铂治疗的人类造血干细胞和祖细胞的转录组变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术研究吉西他滨和卡铂对造血干细胞和祖细胞的转录组影响 | 研究样本仅来自一位慢性髓性白血病患者，可能限制了结果的普遍性 | 探索吉西他滨和卡铂治疗对人类骨髓转录水平的影响，以实现未来个性化治疗 | 慢性髓性白血病患者的造血干细胞和祖细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一位患者 |
| 48 | 2024-08-09 |
Exploring dimension-reduced embeddings with Sleepwalk
2020-05, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.251447.119
PMID:32430339
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Sleepwalk的工具，用于探索降维嵌入中的局部邻域的忠实度 | Sleepwalk工具允许用户通过颜色交互式地探索嵌入，揭示数据中的隐藏特征和降维方法的差异 | NA | 开发一种工具来评估和探索降维方法的忠实度 | 降维嵌入方法在处理高维数据时的准确性 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 矩阵数据 | 多个单细胞 |
| 49 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome reveals the novel role of T-bet in suppressing the immature NK gene signature
2020-05-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.51339
PMID:32406817
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了T-bet在抑制小鼠NK细胞发育过程中未成熟基因特征的新作用 | 首次揭示了T-bet通过mTORC2-Akt-FoxO1轴在抑制未成熟NK细胞转录特征中的新作用 | NA | 探讨NK细胞发育过程中的转录激活与抑制机制 | 小鼠NK细胞的发育过程及其相关基因表达 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习分类器 | 转录组数据 | 涉及五个不同的NK细胞集群 |
| 50 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptional landscapes reveal HIV-1-driven aberrant host gene transcription as a potential therapeutic target
2020-05-13, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aaz0802
PMID:32404504
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研究论文 | 本文通过开发HIV-1 SortSeq技术，从病毒抑制的HIV-1感染者中分离出罕见的HIV-1感染细胞，并进行单细胞转录组分析，揭示了HIV-1驱动宿主基因异常转录的现象，并探讨了其作为治疗靶点的潜力。 | 开发了HIV-1 SortSeq技术，用于分离和分析HIV-1感染细胞的单细胞转录组，揭示了HIV-1驱动宿主基因异常转录的新机制。 | NA | 研究HIV-1与宿主细胞相互作用，识别支持HIV-1再激活的细胞环境和机制，并探索潜在的治疗靶点。 | HIV-1感染细胞的单细胞转录组和HIV-1驱动宿主基因异常转录的机制。 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞转录组分析 | CRISPR-dCas9 | RNA | 从病毒抑制的HIV-1感染者中分离出的HIV-1感染细胞 |
| 51 | 2024-08-09 |
SCeQTL: an R package for identifying eQTL from single-cell parallel sequencing data
2020-May-11, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-3534-6
PMID:32393315
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研究论文 | 本文介绍了一个名为SCeQTL的R包，用于从单细胞并行测序数据中识别eQTL | SCeQTL使用零膨胀负二项回归方法进行单细胞数据eQTL分析，能够区分不同基因型组之间的两种类型的基因表达差异 | NA | 开发新的方法来分析单细胞测序数据中的eQTL | 单细胞测序数据中的基因型与基因表达表型之间的关联 | 生物信息学 | NA | 单细胞并行测序 | 零膨胀负二项回归 | 测序数据 | NA |
| 52 | 2024-08-09 |
Transcriptomics in Toxicogenomics, Part II: Preprocessing and Differential Expression Analysis for High Quality Data
2020-May-08, Nanomaterials (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/nano10050903
PMID:32397130
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综述 | 本文综述了毒理基因组学中转录组数据预处理和差异表达分析的方法 | 目前毒理基因组学领域缺乏数据预处理的标准指南，本文定义了最优工具和流程以生成同质且无偏的数据 | NA | 旨在提高毒理基因组学预测模型的可靠性、鲁棒性和准确性 | 转录组数据预处理方法及其在微阵列、批量RNA测序和单细胞RNA测序中的应用 | 毒理基因组学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 53 | 2024-08-09 |
Somatic mTOR mutation in clonally expanded T lymphocytes associated with chronic graft versus host disease
2020-05-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-16115-w
PMID:32382059
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研究论文 | 本文报道了一例慢性移植物抗宿主病（cGvHD）患者，其CD4 T细胞克隆扩增中携带体细胞mTOR、NFKB2和TLR2突变，并探讨了这些突变在cGvHD中的功能和治疗意义。 | 首次在cGvHD患者的T淋巴细胞中发现了mTOR P2229R突变，并揭示了该突变导致的mTORC1和mTORC2信号通路的激活及其对细胞增殖和凋亡的影响。 | 研究样本量较小，仅包括134名患者，可能影响结果的普遍性。 | 探讨慢性移植物抗宿主病中体细胞突变对T细胞异常增殖和持续免疫激活的影响，并为靶向治疗提供依据。 | 慢性移植物抗宿主病患者及其T淋巴细胞中的体细胞mTOR突变。 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序，实时阻抗测量 | NA | 基因组数据 | 134名患者 |
| 54 | 2024-08-09 |
Integrative Cluster Analysis of Whole Hearts Reveals Proliferative Cardiomyocytes in Adult Mice
2020-05-06, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells9051144
PMID:32384695
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研究论文 | 本文通过应用snRNA-seq技术于成年小鼠心脏，结合公开的scRNA-seq数据，揭示了心脏细胞组成的新见解，特别是发现了一小群具有增殖标记的心肌细胞。 | 本文首次在成年小鼠心脏中发现了一小群具有增殖标记的心肌细胞，支持了心肌细胞更新是由现有心肌细胞的有丝分裂驱动的观点。 | 研究使用的数据集在心肌细胞比例上存在显著差异，这可能是由于细胞捕获技术相关的偏差。 | 探讨心脏细胞的再生潜力及其机制。 | 成年小鼠的心脏细胞组成。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | snRNA-seq | NA | 单细胞数据 | 使用了来自两个不同品系（C57BL/6NRj和Fzt:DU）的成年小鼠心脏样本。 |
| 55 | 2024-08-09 |
MAPS-seq: magnetic bead-assisted parallel single-cell gene expression profiling
2020-05, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-020-0433-x
PMID:32404928
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研究论文 | 本文介绍了一种基于微孔板的新型单细胞基因表达测序方法——磁珠辅助并行单细胞基因表达测序（MAPS-seq），该方法通过在反转录步骤前混合样本，简化了样本准备过程并减少了试剂浪费 | MAPS-seq方法使用通用试剂和标准分子生物学实验室仪器，易于实施，即使在未进行过单细胞RNA测序的实验室也能操作 | NA | 验证MAPS-seq方法在单细胞水平生成基因表达数据的能力，并分析其在人类髓系白血病细胞中的应用 | 237个人类髓系白血病细胞，分别用三种不同药物或二甲基亚砜处理 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 237个细胞 |
| 56 | 2024-08-09 |
High systemic and tumor-associated IL-8 correlates with reduced clinical benefit of PD-L1 blockade
2020-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-0860-1
PMID:32405063
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研究论文 | 本文分析了循环中的IL-8和IL8基因在外周血单个核细胞和肿瘤中的表达，评估了其与atezolizumab（一种抗PD-L1单克隆抗体）治疗效果的关系。 | 首次在大规模随机研究中全面评估了IL-8水平与免疫检查点抑制剂疗效的关系，并揭示了IL-8在肿瘤微环境中的表达模式及其对免疫治疗效果的影响。 | 研究主要集中在转移性尿路上皮癌和转移性肾细胞癌患者，可能不适用于所有癌症类型。 | 探讨IL-8水平与PD-L1阻断剂临床疗效的关系。 | 转移性尿路上皮癌和转移性肾细胞癌患者。 | NA | 转移性尿路上皮癌，转移性肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1445名患者 |
| 57 | 2024-08-09 |
Single-cell resolution analysis of the human pancreatic ductal progenitor cell niche
2020-05-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1918314117
PMID:32354994
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了人胰腺主胰管中的多能祖细胞样细胞，揭示了其亚群结构及分化潜力 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了胰腺主胰管中祖细胞样细胞的多个亚群及其向腺泡组织过渡的表型，并展示了这些细胞在移植后的分化能力 | NA | 研究人胰腺主胰管中多能祖细胞样细胞的特性及其在糖尿病中的潜在应用 | 人胰腺主胰管中的多能祖细胞样细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多个胰腺样本及糖尿病患者样本 |
| 58 | 2024-08-09 |
Landscape of genomic imprinting and its functions in the mouse mammary gland
2020-05-05, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjaa020
PMID:32369566
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠乳腺中基因组印记及其功能 | 首次详细研究了小鼠乳腺中的基因组印记，并揭示了印记基因在乳腺发育和泌乳中的作用 | NA | 研究小鼠乳腺中基因组印记的作用及其对乳腺发育和泌乳的影响 | 小鼠乳腺中的印记基因及其表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 59 | 2024-08-09 |
Interstitial Cell Remodeling Promotes Aberrant Adipogenesis in Dystrophic Muscles
2020-05-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107597
PMID:32375047
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析健康与肌营养不良骨骼肌中的间质细胞群，揭示了CD142阳性细胞通过分泌GDF10抑制脂肪生成的作用，并发现肌营养不良中该细胞群的缺失与异常脂肪沉积有关。 | 首次通过单细胞RNA测序技术解析肌营养不良骨骼肌中间质细胞的特性，并发现CD142阳性细胞在抑制脂肪生成中的关键作用。 | 研究主要集中在小鼠和人类样本上，可能需要进一步验证在其他物种中的适用性。 | 探究肌营养不良中骨骼肌纤维化和脂肪替代的机制，为治疗提供新思路。 | 肌营养不良患者的骨骼肌中间质细胞及其在脂肪生成中的作用。 | 数字病理学 | 肌营养不良 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠和人类样本 |
| 60 | 2024-08-09 |
Defining the Homo- and Heterodimerization Propensities of Metabotropic Glutamate Receptors
2020-05-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107605
PMID:32375054
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研究论文 | 本文通过分析单细胞RNA测序数据和开发基于荧光的定量检测方法，研究了代谢型谷氨酸受体（mGluRs）的同型和异型二聚化倾向 | 首次详细定义了组I、II和III mGluRs的同型和异型二聚化倾向，并通过体内RNA杂交和共免疫沉淀实验验证了mGluR2与mGluR3的异型二聚化偏好 | NA | 阐明代谢型谷氨酸受体的同型和异型二聚化倾向及其在神经系统中的生物学意义 | 代谢型谷氨酸受体（mGluRs）及其在皮质锥体细胞中的表达和二聚化倾向 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 荧光检测, 体内RNA杂交, 共免疫沉淀 | NA | RNA序列 | 多个皮质锥体细胞样本 |