单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 93 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-08-09 |
The Transcriptome of Hepatic Fibrosis Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2020-05, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31155
PMID:32017148
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
SARS-CoV-2 Receptor ACE2 Is an Interferon-Stimulated Gene in Human Airway Epithelial Cells and Is Detected in Specific Cell Subsets across Tissues
2020-05-28, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.04.035
PMID:32413319
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了ACE2作为干扰素刺激基因的特性及其在特定细胞亚群中的表达模式 | 首次发现ACE2是人类干扰素刺激基因，并确定其在肺II型肺泡细胞、回肠吸收性肠细胞和鼻杯状分泌细胞中与TMPRSS2共表达 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，需要进一步实验验证ACE2作为ISG的功能意义 | 阐明SARS-CoV-2在宿主组织中的靶向细胞亚群及ACE2表达的调控机制 | 人类、非人类灵长类和小鼠的组织驻留细胞亚群 | 单细胞基因组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多物种组织单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals a Dynamic Stromal Niche That Supports Tumor Growth
2020-05-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107628
PMID:32433953
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示支持肿瘤生长的动态基质微环境 | 首次在黑色素瘤发展过程中系统描述基质区室的动态变化，发现三个时间特异性基质群体并鉴定C3-C3aR轴在免疫调节中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究肿瘤微环境中基质细胞的动态变化及其对肿瘤生长的支持机制 | 小鼠黑色素瘤和引流淋巴结中的基质细胞 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠黑色素瘤和引流淋巴结在不同时间点的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Iterative Single-Cell Analyses Define the Transcriptome of the First Functional Hematopoietic Stem Cells
2020-05-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107627
PMID:32402290
|
研究论文 | 通过迭代单细胞分析确定小鼠胚胎中首批功能性造血干细胞的转录组特征 | 使用Gata2表达为基础的细胞分选方法，结合迭代单细胞转录组学分析，首次精确识别主动脉造血簇中仅含1-2个细胞的功能性造血干细胞 | 研究仅聚焦于小鼠胚胎模型，尚未在其它物种或发育阶段验证 | 解析功能性造血干细胞在胚胎发育过程中的分子特征和身份确立机制 | 小鼠胚胎主动脉造血簇细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞转录组测序，索引分选，功能分析 | NA | 单细胞基因表达数据 | 数百个小鼠胚胎主动脉细胞，最终定位到含1-2个细胞的主动脉簇 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analyses Reveal Megakaryocyte-Biased Hematopoiesis in Myelofibrosis and Identify Mutant Clone-Specific Targets
2020-05-07, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2020.04.008
PMID:32386542
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示骨髓纤维化中巨核细胞偏向的造血过程并识别突变克隆特异性靶点 | 首次在单细胞水平系统揭示骨髓纤维化中造血干细胞向巨核细胞分化的早期偏向性，并发现G6B作为潜在免疫治疗靶点 | 样本量相对有限，需要进一步功能验证和临床前研究 | 探究骨髓纤维化中异常巨核细胞生成的细胞和分子机制 | 135,929个CD34+谱系造血干细胞和祖细胞 | 单细胞生物学 | 骨髓纤维化 | 单细胞转录组测序, 单细胞蛋白质组学, 单细胞基因组学, 功能分析 | NA | 单细胞多组学数据 | 135,929个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Interstitial Cell Remodeling Promotes Aberrant Adipogenesis in Dystrophic Muscles
2020-05-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107597
PMID:32375047
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示间质细胞在肌肉营养不良症中促进异常脂肪形成的机制 | 首次识别出CD142阳性间质细胞群通过分泌GDF10抑制脂肪生成，并发现该细胞群在肌肉营养不良中几乎完全缺失 | NA | 探究肌肉营养不良中异常脂肪沉积的细胞机制 | 健康和营养不良骨骼肌中的间质细胞 | 单细胞生物学 | 肌肉营养不良症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类骨骼肌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Regenerative potential of prostate luminal cells revealed by single-cell analysis
2020-05-01, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aay0267
PMID:32355025
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示前列腺管腔细胞的再生潜力 | 发现前列腺再生主要由几乎所有存留的管腔细胞驱动，而非仅由罕见干细胞驱动 | 研究主要基于小鼠模型，人类组织验证相对有限 | 探究前列腺再生机制和细胞来源 | 小鼠和人类前列腺组织 | 单细胞分析 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Profiling peripheral nerve macrophages reveals two macrophage subsets with distinct localization, transcriptome and response to injury
2020-05, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-0618-6
PMID:32284604
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪、转录组学和空间定位分析揭示了坐骨神经巨噬细胞的两个不同亚群及其对神经损伤的差异反应 | 首次系统表征外周神经系统巨噬细胞，发现两个空间分离且转录组不同的巨噬细胞亚群，并证明其与中枢神经系统小胶质细胞在起源和特征上的显著差异 | 研究主要聚焦于坐骨神经，其他外周神经的巨噬细胞特征可能未被完全涵盖 | 探索外周神经系统巨噬细胞的起源、转录特征和空间分布 | 坐骨神经巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 神经损伤 | 单细胞转录组测序, 谱系追踪, 空间定位分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
CellCoal: Coalescent Simulation of Single-Cell Sequencing Samples
2020-05-01, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaa025
PMID:32027371
|
研究论文 | 介绍用于单细胞测序基因型溯祖模拟的软件工具CellCoal | 开发了首个专门用于单细胞测序数据的溯祖模拟工具，能够模拟多种突变模型、测序读长计数和基因型似然 | 未在实际数据集上进行验证，主要侧重于模拟方法的开发 | 开发用于单细胞测序数据模拟和分析基准测试的计算工具 | 体细胞群体的单细胞样本 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 溯祖模型 | 基因型数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 10 | 2024-10-14 |
A single-cell and single-nucleus RNA-Seq toolbox for fresh and frozen human tumors
2020-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-0844-1
PMID:32405060
|
研究论文 | 本文开发了一个用于新鲜和冷冻人类肿瘤的单细胞和单核RNA测序工具箱 | 本文首次系统地开发了一个工具箱，用于同时处理新鲜和冷冻临床肿瘤样本的单细胞和单核RNA测序 | 本文主要集中在工具箱的开发和初步验证，未涉及其在实际临床应用中的长期效果 | 开发和验证一个用于新鲜和冷冻人类肿瘤的单细胞和单核RNA测序的系统工具箱 | 新鲜和冷冻的人类肿瘤样本 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和单核RNA测序（snRNA-Seq） | NA | RNA | 216,490个细胞和核，来自40个样本，涵盖23个标本，涉及8种肿瘤类型 | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-10-01 |
A Single-Cell RNA Expression Map of Human Coronavirus Entry Factors
2020-May-27, SSRN
DOI:10.2139/ssrn.3611279
PMID:32714119
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序数据分析了人类冠状病毒进入因子在不同健康人体组织中的表达情况 | 首次构建了人类冠状病毒进入因子在多种健康人体组织中的单细胞RNA表达图谱，揭示了SARS-CoV-2在不同器官中的潜在感染路径 | 研究主要基于健康人体组织的单细胞RNA测序数据，未涉及疾病状态下的组织样本 | 预测人类冠状病毒的宿主嗜性，并分析其在不同人体组织中的潜在感染路径 | 人类冠状病毒进入因子在不同健康人体组织中的表达情况 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 28个SCARFs，涵盖多种健康人体组织 | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-09-15 |
Increased Tau Expression Correlates with Neuronal Maturation in the Developing Human Cerebral Cortex
2020 May/Jun, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0058-20.2020
PMID:32393582
|
研究论文 | 研究探讨了tau蛋白在人类大脑发育过程中的表达变化及其与神经元成熟的关系 | 首次在细胞水平上详细描述了tau mRNA和蛋白在发育中的人类大脑中的表达模式，并揭示了tau表达与神经元成熟之间的关联 | 研究主要基于现有数据和体外模型，缺乏直接的体内实验验证 | 探讨tau蛋白在人类大脑发育过程中的表达模式及其与神经元成熟的关系 | tau mRNA和蛋白在发育中的人类大脑中的表达 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（sc-RNAseq）、RNA原位杂交（RNAscope）、免疫组织化学（IHC） | NA | RNA | 包括发育中的人类大脑组织和诱导多能干细胞（iPSC）衍生的皮质类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-08-14 |
Aortic heterogeneity across segments and under high fat/salt/glucose conditions at the single-cell level
2020-May, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaa038
PMID:34692110
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了在正常和高血糖、高盐饮食或高脂肪摄入条件下，小鼠升主动脉、主动脉弓以及胸腹主动脉段的细胞异质性 | 首次揭示了主动脉不同段在单细胞水平上的异质性，并探讨了代谢病理条件对其的影响 | NA | 研究主动脉不同段在单细胞水平上的异质性及其在代谢病理条件下的变化 | 小鼠的升主动脉、主动脉弓、胸腹主动脉段细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 216,612个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis of Human Retina Identifies Evolutionarily Conserved and Species-Specific Mechanisms Controlling Development
2020-05-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.04.009
PMID:32386599
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人类视网膜发育过程中的细胞类型多样性和转录网络 | 发现了进化保守和物种特异性的基因表达模式，以及ATOH7在视网膜发育后期调控光感受器分化的意外作用 | NA | 识别控制人类视网膜发育的转录网络 | 人类视网膜发育过程中的细胞类型和转录网络 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 16个发育中的视网膜时间点和4个早期视网膜类器官分化阶段 | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-08-05 |
Novel insights into breast cancer copy number genetic heterogeneity revealed by single-cell genome sequencing
2020-05-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.51480
PMID:32401198
|
研究论文 | 本文使用单细胞基因组测序全面映射了乳腺癌肿瘤中拷贝数改变异质性的各个方面 | 提供了乳腺癌肿瘤内非肿瘤细胞的遗传异质性及其对肿瘤基因组的影响的新见解 | 对拷贝数改变异质性的了解仍然有限 | 探讨乳腺癌中拷贝数改变的遗传异质性及其临床意义 | 一组乳腺癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组数据 | 一组乳腺癌肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-05 |
Transcriptome Dynamics of Hematopoietic Stem Cell Formation Revealed Using a Combinatorial Runx1 and Ly6a Reporter System
2020-05-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.03.020
PMID:32302558
|
研究论文 | 该文章研究了造血干细胞(HSC)形成的转录组动态，利用组合的Runx1和Ly6a报告系统进行可视化 | 通过生成Tg(Runx1-mKO2; Ly6a-GFP)双重报告小鼠，首次识别并追踪造血干细胞的发育过程 | 由于造血干细胞及其前体细胞的稀缺性，可能导致研究样本的局限性 | 揭示前造血干细胞的出现和成熟过程 | 研究对象包括前造血干细胞及其相关细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用了双重报告小鼠的细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-05 |
A single-cell survey of Drosophila blood
2020-05-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.54818
PMID:32396065
|
研究论文 | 该论文利用单细胞RNA测序对果蝇血细胞进行了调查 | 发现了在不同炎症条件下果蝇血细胞的多样性，并首次揭示了FGF信号在血细胞之间的相互作用中的新角色 | 目前只集中于果蝇的血细胞种类，结果是否适用于其他物种尚未确定 | 旨在通过单细胞RNA测序深入理解果蝇血细胞的功能 | 果蝇幼虫中的血细胞（称为hemocytes） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-05 |
Efficient Generation and Transcriptomic Profiling of Human iPSC-Derived Pulmonary Neuroendocrine Cells
2020-May-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101083
PMID:32380423
|
研究论文 | 本研究展示了如何通过诱导性多能干细胞生成肺神经内分泌细胞，并进行了转录组特征分析 | 本研究首次利用诱导性多能干细胞生成并表征肺神经内分泌细胞，提供了全新的细胞模型 | 该研究未在临床样本中验证生成的细胞功能 | 研究肺神经内分泌细胞的发生和其在肺部疾病中的作用 | 诱导性多能干细胞衍生的肺神经内分泌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | iPNECs | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-05 |
Early precursors and molecular determinants of tissue-resident memory CD8+ T lymphocytes revealed by single-cell RNA sequencing
2020-05-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aaz6894
PMID:32414833
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究CD8 T细胞在对病毒感染反应中的基因表达模式 | 揭示了在病毒感染早期，组织中特定CD8 T细胞前体的转录异质性 | 研究可能未涵盖所有组织环境下的CD8 T细胞特征 | 探讨CD8 T细胞在病毒感染中的分化过程 | CD8 T细胞在脾脏和小肠内的特定亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在病毒感染过程中对不同分化阶段的个体CD8 T细胞进行了分析 | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-05 |
Identification of Repurposable Drugs and Adverse Drug Reactions for Various Courses of COVID-19 Based on Single-Cell RNA Sequencing Data
2020-May-16, ArXiv
PMID:33299905
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据筛选出可重新利用的抗COVID-19药物和不良药物反应 | 首次使用系统生物学方法结合FDA批准的药物和小分子化合物的数据来发现防治COVID-19的新药物 | 未详细探讨所有候选药物的临床适应性和潜在不良反应 | 寻找可重新利用的药物以治疗COVID-19 | 美国FDA批准的药物和前临床小分子化合物 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含轻症和重症COVID-19患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |